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National audience

National audience; This study aimed to assess the feasibility of using demographic data (calving dates and reproductive data (dates of artificial insemination AI) to implement a syndromic surveillance system for bovine abortions. Such a system could replace or complement the current clinical surveillance system, which has been recognised as having limited sensitivity. Three indicators of bovine abortions have been designed: a Mid-term abortion incidence rate (MAIR) and a Late-term abortion incidence rate (LAIR) using AI data (collected from about 76 % of French dairy cattle herds), and a calving incidence rate (CIR) using calving data (collected from every dairy or beef cattle herd). As bluetongue serotype 8 (BT8) has been reported to cause abortions, we assessed the ability of each indicator to identify a BT8-related increase in abortion rates. Following the BT8 epizootic in 2007 and 2008, an abnormal increase in the MAIR and LAIR was identified in 60 to 76 % of départements included in the study, and there was an abnormal decrease in the CIR in 45 % to 86 % of départements included in the study. In comparison, statistical alerts were less frequently identified prior to the BT8 epizootic. These results suggest that these indicators are good candidates for the implementation of a syndromic surveillance system for bovine abortions, as a complement to the current surveillance system; L’objectif de cette étude était d’évaluer la faisabilité d’utiliser les données démographiques (dates de vêlage) et de reproduction (dates d’insémination artificielle, IA) à des fins de surveillance syndromique des avortements chez les bovins, comme complément au dispositif actuel de déclaration des avortements, connu pour être peu sensible. Trois indicateurs de survenue d’avortements ont été élaborés : les taux d’avortements précoces (TAP) et tardifs (TAT) à partir des données d’IA, et le taux de vêlages de veaux viables (TVV) à partir des dates de vêlages. Le TAP et le TAT, disponibles pour une partie de la population contrairement au TVV (les dates d’IA sont disponibles auprès de 76 % environ des élevages laitiers, alors que les dates de vêlages sont disponibles pour l’ensemble des femelles, laitières et allaitantes), présentent l’intérêt d’être plus spécifiques que le TVV pour détecter la survenue d’avortements. Compte tenu du caractère abortif de la fièvre catarrhale ovine due au sérotype 8 (FCO-8), son influence sur chacun de ces indicateurs a été étudiée. Suite à l’épizootie de FCO-8 en 2007 et 2008, entre 60 et 76 % des départements concernés par l’épizootie ont présenté une augmentation anormale du TAP ou du TAT, et 45 à 86 % des départements une diminution anormale du TVV. En période « sans circulation de FCO-8 », ces alertes étaient significativement moins nombreuses. D’après ces résultats, il apparaît envisageable d’utiliser les données démographiques et de reproduction à des fins de surveillance syndromique en complément du dispositif actuel

National audience

Le puceron vert du pêcher (Myzus persicae) est un insecte polyphage, capable de coloniser plus de 400 espèces végétales sauvages ou cultivées dont le pêcher, le colza, la pomme de terre et la betterave. Il occasionne des dégâts directs qui peuvent diminuer les récoltes et les rendre impropres à la commercialisation.Mais, surtout, il peut transmettre de nombreux virus sur diverses cultures agricoles. Des phénomènes de résistance aux insecticides ont été clairement identifiés. Un enjeu important pour contrôler le puceron vert du pêcher (Myzus persicae) de manière plus efficace et plus respectueuse de l’environnement est de comprendre comment les résistances peuvent se propager.

International audience

International audience

The impact on cattle mortality of the Bluetongue epizootic in Northern Europe (BTV8) since 2006 has not been precisely estimated. We analyzed this impact at the population level, based on data gathered in the French National Cattle Register. We modeled the weekly fluctuations of mortality incidence rate in cattle from each French department from 2003 through 2006. Thanks to the fitted models, we computed the expected mortality from 2007 through 2009 by week, department, age group and production type. We compared the expected to the observed mortality and identified about 125 000 extra cattle deaths in France in 2008. Their spatio-temporal distribution suggests that most of them may be related to the Bluetongue epizootic, L’impact sur la mortalité des bovins de l’épizootie de fièvre catarrhale ovine (BTV8) qu’a vécu l’Europe depuis 2006 est mal documenté. Afin d’estimer cet impact, nous avons utilisé une approche populationnelle à partir de la base de données nationale d’identification bovine (BDNI). La démarche en trois étapes a consisté à i) modéliser les fluctuations hebdomadaires des taux d’incidence de la mortalité bovine dans chaque département français de 2003 à 2006, à partir des données collectées dans la BDNI, ii) utiliser ces modèles pour estimer la mortalité attendue de 2007 à 2009, par semaine, département, catégorie d’âge et type de production, iii) comparer le nombre de morts réellement observées avec les prédictions émises. Cette méthode nous a permis d’identifier plus de 125 000 morts excédentaires en 2008 en France, dont la distribution spatio-temporelle suggère fortement qu’elles pourraient être liées à l’épizootie de fièvre catarrhale ovine.

Impact de la FCO-8 sur la mortalité des bovins en France en 2007

L'objectif du modèle Age-Période-Cohorte (APC) est d'attribuer à l'âge des individus, la cohorte de naissance et la période d'observation, leurs effets respectifs sur l'évolution temporelle d'une mesure ou d'un phénomène. Cependant, du fait de la relation linéaire qui lie la période, l'âge et la cohorte, l'ajustement du modèle pose problème dès lors que les trois variables sont présentes simultanément dans le modèle. En l'absence d'hypothèse quant aux effets spécifiques des variables, le modèle s'avère incapable de distinguer les effets propres de chaque facteur. Dans le cadre de notre étude, l'utilisation des données issues de la surveillance exhaustive de l'encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) permet de formuler les contraintes nécessaires à l'identification du modèle APC. L'approche Age-Période-Cohorte se révèle alors une méthode pertinente pour étudier l'évolution de la prévalence de l'ESB en France. De plus, elle permet d'aborder l'évolution de la maladie dans son contexte réglementaire et est une ouverture à l'étude d'autres variables après ajustement sur les trois principaux facteurs affectant la prévalence de l'ESB, que sont l'âge des animaux au moment du dépistage, leur cohorte de naissance et la période d'observation dans laquelle on se place.

La législation de l'E.S.B. , profondément remaniée fin 2000 devrait être l'objet d'une nouvelle évolution dans les mois à venir. Les résultats des recherches et études épidémiologiques permettent d'estimer rétrospectivement l'effet des mesures prises depuis 1990.

Special Issue: The Future of BSE Assessments; International audience; Clinical surveillance was the only way to detect bovine spongiform encephalopathy (BSE) until July 2000 in France. From the 103 cases identified as such between 1991 and June 2000, we used a back-calculation method to reconstruct the longitudinal trend of BSE infections. Between July 1987 and June 1997, an estimated 51,300 (CI =[24,300-84,700]) cattle were infected in France. The comprehensive surveillance of BSE with rapid tests, set up in France since 2001 at the abattoir and fallen plant, allowed study of the relative exposure of the successive birth cohorts with nonconditional logistic regression models adjusted for possible confounding variables. The results were in agreement with those of the back-calculation model, estimating a decrease of the BSE exposure from the birth cohort July 1995-June 1996 that matched with the decrease of the infection after June 1996. In view of the long incubation period of BSE, it is not possible to precisely assess the impact of any control measure before several years. Modeling was therefore used to estimate prospectively the efficiency of the ban of meat and bone meal extended to all farm species in November 2000. Using parameters about age at infection and incubation time estimated earlier, we assessed the minimum time to first detection if infections still occurred. We have waited up to June 2007 to know if less than 100 infections occurred among French cattle during the 6 months following January 2001.

International audience

Depuis le début de l’épizootie d’encéphalopathie spongiforme bovine (ESB), l’alimentation a été considérée comme la principale source de contamination des bovins, via le recyclage de l’agent dans les farines de viande et d’os (FVO). En dépit de l’interdiction des FVO dans les aliments pour bovins en France en juillet 1990, des cas d’ESB Nés Après l’Interdiction des Farines (NAIF) ont été détectés. Une étude cas-témoins a été mise en œuvre afin d’évaluer trois hypothèses : 1/ les contaminations croisées des aliments pour bovins par des FVO au cours de leur fabrication ou pendant leur transport ; 2/ les contaminations croisées dans les élevages, par la distribution aux bovins d’aliments destinés à d’autres espèces pour lesquelles les FVO étaient encore autorisées ; 3/ le rôle de dérivés d’origine animale (graisses et phosphates) encore autorisés dans l’alimentation des bovins et non sécurisés au regard du risque ESB.

A case/control study [Jarrige and al., submitted] on Bovine Spongiform Encephalopathy (BSE), showed that feeding cattle with proprietary concentrates before the age of two was the main risk factor to explain infection of born after the ban of meat-and-bone meal, in force since 1990 in France. At a lesser extent, comsumption of milk replacers by bovines, and poultry proprietary concentrates purchase was also identified as a risk factor. Using the same data, two complementary studies were carried out, one taking into account the possible infection periods for cattle, the other restricting the sample to the farms where poultry was present. A conditional logistic regression model was used, adjusting for herd size and cattle production type. That study showed that cattle consumption of proprietary concentrates before the age of two or before and after the age of two were significant risk factors (OR=7.8 [1.4-45.3] and OR=6.8 [1.2-37.9], respectively). On the other hand, consumption of bovine proprietary concentrates only after the age of two did not appear significant. In addition, in farms having poultry, feedstuff purchase for these species was also significantly associated with BSE occurrence (OR=3.9 [1.1-13.7])., Une étude cas/témoins [Jarrige et al., soumis] a mis en évidence la consommation d'aliments concentrés par les bovins pendant leurs deux premières années de vie, comme principale source de contamination des cas d'encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) nés après l'interdiction des farines animales en France en 1990 (cas dits NAIF). Dans une moindre mesure la consommation de lactoremplaceur par les bovins et l'achat d'aliments du commerce pour volailles dans ces exploitations étaient aussi associés à l'ESB. En utilisant les mêmes données d'enquête, deux études complémentaires ont été menées, l'une prenant en compte les différentes périodes possibles de contamination des bovins, l'autre restreignant l'échantillon d'étude aux exploitations où des volailles étaient présentes. Un modèle de régression logistique conditionnelle a été utilisé, prenant en compte la taille de l'atelier bovin et le type de production des bovins. Cette étude montre que la consommation d'aliments composés par les bovins est significativement à risque s'ils sont consommés avant l'âge de deux ans (OR=7,8 [1,4-45,3]) ou s'ils sont consommés à la fois avant et après deux ans (OR=6,8 [1,2-37,9]). En revanche, la consommation d'aliments composés uniquement après l'âge de deux ans n'apparaît pas significativement à risque. Par ailleurs, dans les exploitations ayant des volailles, l'achat d'aliments du commerce pour ces espèces est aussi significativement associé à l'occurrence de l'ESB (OR=3,9 [1,1-13,7]).