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Chromosomes of all species studied so far display a variety of higher-order organizational features such as domains, loops, or compartments. Many of these structures have been characterized from the genome-wide contact maps generated by chromosome conformation capture approaches (Hi-C, ChIA-PET,…). Indeed, DNA 3D structures translate as distinct patterns visible on these maps. We developed Chromosight, an algorithm based on computer vision approaches that automatically detect and quantify any type of pattern in contact data. Chromosight detects 3 times as many patterns as existing programs, while being faster and fit to any genome, including small, compact ones. Chromosight is user-friendly and can be extended to user-provided patterns. We validated the program by applying it to a variety of chromosomal structures found in mammals. Code and documentation: https://github.com/koszullab/chromosight

International audience; In 1984, the Met receptor and its ligand, the HGF/SF, were discovered thanks to their ability to induce cell transformation and proliferation. Thirty years of research highlighted their crucial role in the development and homeostasis of various structures, including many epithelial organs. This period also allowed unraveling the structural basis of their interaction and their complex signaling network. In parallel, Met was shown to be deregulated and associated with a poor prognosis in many cancers. Met involvement in resistance to current therapies is also being deciphered. Based on these data, pharmaceutical companies developed a variety of Met inhibitors, some of which are evaluated in phase III clinical trials. In this review, we trace the exemplary track record of research on Met receptor, which allowed moving from bench to bedside through the development of therapies targeting its activity. Many questions still remain unanswered such as the involvement of Met in several processes of development, the mechanisms involving Met in resistance to current therapies or the likely emergence of resistances to Met-targeted therapies.; En 1984, le récepteur à activité tyrosine kinase Met et son ligand l’HGF (hepatocyte growth factor)/SF (scatter factor) sont découverts grâce à leur aptitude à induire la transformation et la prolifération cellulaires. Trois décennies ont permis de mettre en évidence leur rôle fondamental dans le déve­loppement et l’homéostasie de nombreuses structures, notamment des organes épithéliaux. Cette même période a permis de décrypter les bases structurales de leur interaction, ainsi qu’un réseau de signalisation complexe. Parallèlement, l’implication de la dérégulation de Met dans la tumorigenèse, supposée dès sa découverte, a été démontrée ; elle est associée à un mauvais pronostic dans de nombreux cancers. Le rôle de cette dérégulation dans des phénomènes de résistance aux thérapies actuelles commence également à être déchiffré. Sur la base de ces données, des compagnies pharmaceutiques ont développé une grande diversité d’inhibiteurs ciblant l’HGF/SF ou le récepteur Met, dont certains sont actuellement évalués dans des essais cliniques de phase III. Nous proposons dans cette revue de retracer le parcours exemplaire des recherches sur le récepteur Met, qui auront permis en trente ans de passer de la découverte fondamentale d’un oncogène au développement de thérapies ciblant son action. Cependant, de nombreuses questions restent en suspens. Par exemple, l’implication de Met dans plusieurs étapes du développement reste à préciser, de même que les mécanismes faisant de ce récepteur un facteur de résistance aux traitements actuels ou le développement probable de résistances aux thérapies ciblant sa propre activité.