Enagnon Kazali Alidjinou, Karine Faure, Isabelle Top, Alain Duhamel, Jacques Trauet, Emmanuelle Jeanpierre, Julien Poissy, Bertrand Meresse, Benoit Gachet, Fanny Vuotto, Pauline Varlet, Guillaume Lefèvre, Sarah Stabler, Jules Bauer, C. Yelnik, François Maggiotto, Vincent Elsermans, Arnaud Dendooven, Julien Labreuche, Sophie Susen, Mohamed Bou Saleh, David Launay, Thierry Brousseau, Sylvain Dubucquoi, Brigitte Prevost, Eloise Woitrain, Laurence Bocket, Marc Lambert, Julie Demaret, David Montaigne, Annabelle Dupont, Myriam Labalette, Laurent Dubuquoy, Institut d'Immunologie [CHRU Lille], Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 (INFINITE (Ex-Liric)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Pathogenèse virale du diabète de type 1 - ULR 3610 (Laboratoire de Virologie), Centre de référence des maladies auto-immunes systémiques rares du Nord et Nord Ouest [CHRU Lille], Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille-CHU Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 (RID-AGE), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Récepteurs Nucléaires, Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (RNMCD - U1011), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), I-SITE ULNE. Grant Number: ANR-16-IDEX-0004 ULNE, ANR-16-IDEX-0004,ULNE,ULNE(2016), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille, LillOA, ULNE - - ULNE2016 - ANR-16-IDEX-0004 - IDEX - VALID, Université de Lille, CNRS, Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 [INFINITE (Ex-Liric)], Institut de Recherche Translationnelle sur l'Inflammation (INFINITE) - U1286, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] [CHRU Lille], METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694, Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL], Pathogenèse virale du diabète de type 1 - ULR 3610, Facteurs de risque et déterminants moléculaires des maladies liées au vieillissement (RID-AGE) - U1167, Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE], Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (EGID) - U1011, Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD], Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576, Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 9017, and Récepteurs Nucléaires, Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires - U1011 (RNMCD)
Objectives Assessment of the adaptive immune response against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS‐CoV‐2) is crucial for studying long‐term immunity and vaccine strategies. We quantified IFNγ‐secreting T cells reactive against the main viral SARS‐CoV‐2 antigens using a standardised enzyme‐linked immunospot assay (ELISpot). Methods Overlapping peptide pools built from the sequences of M, N and S viral proteins and a mix (MNS) were used as antigens. Using IFNγ T‐CoV‐Spot assay, we assessed T‐cell and antibody responses in mild, moderate and severe SARS‐CoV‐2 patients and in control samples collected before the outbreak. Results Specific T cells were assessed in 60 consecutive patients (mild, n = 26; moderate, n = 10; and severe patients, n = 24) during their follow‐up (median time from symptom onset [interquartile range]: 36 days [28;53]). T cells against M, N and S peptide pools were detected in n = 60 (100%), n = 56 (93.3%), n = 55 patients (91.7%), respectively. Using the MNS mix, IFNγ T‐CoV‐Spot assay showed a specificity of 96.7% (95% CI, 88.5–99.6%) and a specificity of 90.3% (75.2–98.0%). The frequency of reactive T cells observed with M, S and MNS mix pools correlated with severity and with levels of anti‐S1 and anti‐RBD serum antibodies. Conclusion IFNγ T‐CoV‐Spot assay is a reliable method to explore specific T cells in large cohorts of patients. This test may become a useful tool to assess the long‐lived memory T‐cell response after vaccination. Our study demonstrates that SARS‐CoV‐2 patients developing a severe disease achieve a higher adaptive immune response., We quantified IFNg‐secreting T cells reactive against the M, N and S viral SARS‐CoV‐2 proteins using a standardized enzyme‐linked immunospot assay in 60 patients. The frequency of reactive T cells correlated with severity, and with levels of anti‐S1 and anti‐RBD (receptor binding domain) serum antibodies, demonstrating a higher adaptive immune response after developing a more severe disease. IFNg T‐CoV‐Spot assay may also become a useful tool to assess the long‐lived memory T cell response after vaccination.