Search

Full documentation for the GROMACS 2023.2 release version.

Upotreba informacijsko-komunikacijske tehnologije (skraćeno IKT) neizostavna je u suvremenim oblicima učenja i poučavanja te podrazumijeva transfer i upotrebu svih vrsta informacija i sva tehnička sredstva koja omogućavaju korisnicima da koriste informacije te komuniciraju. Nastava postaje zanimljiva, raznolika, dinamična, inovativna i kreativna kada nastavnik uz standardne metoda poučavanja koristi i IKT. U ovom radu prikazana je upotreba informacijsko-komunikacijske tehnologije (IKT) u nastavi matematike sa svrhom postizanja boljeg uspjeha i motivacije kod učenika. Prikazana je primjena alata Quizizz na odabranu nastavnu jedinicu iz matematike u srednjoj školi Ivan Švear u Ivanić-Gradu. Također prikazani su i rezultati ankete provedene nakon primjene kviza u nastavi matematike. Pokazalo se da je kviz odlična motivacijska metoda, a sam alat Quizizz vrlo jednostavan za korištenje kako nastavniku tako i učenicima.

U okviru EU projekta “Razvoj internacionalnog obrazovnog programa Veleri-OI IoT School”, kojeg je sufinancirala Europska unija iz Europskog socijalnog fonda, razvijen je novi internacionalni obrazovni program u području interneta stvari. Nastava novog obrazovnog programa se temelji na metodi “learning by doing” koja je implementirana kroz održavanje radnih sastanaka i definiranje radnih zadataka. Cjelokupan nastavnički i studentski rad je povezan s oglednim primjerom web aplikacije nad kojom studenti uče i čija rješenja analogijom primjenjuju na svoje projekte. Ogledni primjer web aplikacije izrađen je primjenom frontend Quasar frameworka i backend Google Firebase serverless platforme. Članak prikazuje dio procesa razvoja web aplikacije kojeg su nastavnici koristili u poučavanju studenata na radnim sastancima. Isti taj proces su kasnije studenti implementirali u svoje projekte.

Advances in AMDGPU LLVM backend and radeonsi Gallium compute stack for Radeon Graphics Core Next (GCN) GPUs have closed the feature gap between the open source and proprietary drivers. During 2016, we have collaborated with AMDGPU developers to make GROMACS, a popular open source OpenCL-accelerated scientific software package for simulating molecular dynamics, run on Radeon GPUs using Mesa graphics library, libclc, Clang OpenCL compiler, and AMDGPU LLVM backend. This is the first fully open source OpenCL stack that has ever ran GROMACS and possibly any similarly popular scientific software. Aside from GROMACS, there is a number of widely used applications and libraries for scientific computing that support OpenCL [1]. These applications and libraries can be used as a test for AMDGPU and other parts of the OpenCL stack on a real-world code. Supporting these applications and libraries would also give them a standards-compliant OpenCL stack as a test platform, which ensures that they do not depend on vendor-specific quirks present in other stacks. Supporting them would also expand the number of hardware and software options that users can choose from. The talk will present state of the art of Mesa and LLVM for running scientific software utilizing OpenCL on Radeon GPUs. For software packages that do run on Mesa and LLVM right now, benchmarks against the proprietary AMDGPU-PRO driver will be presented and analyzed. For others, there is an ongoing effort to track and fix issues discovered [2]. Scientific software packages that do work in time for the conference will have benchmarks presented and analyzed, and otherwise, the required bug fixes and missing features in AMDGPU discussed. The next generation of AMD hardware, codenamed Vega, based on the GCN architecture, and utilizing the same LLVM backend as the existing hardware, might offer competitive performance/price and performance/power ratios compared to the other vendors in the High Performance Computing space. Used by such hardware, LLVM/Clang could become the compiler of choice for GPU computing, while the open source drivers and libraries could become the norm on supercomputers and workstations alike. [1] https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_OpenCL_applications#Scientific_computing [2] https://bugs.freedesktop.org/show_bug.cgi?id=99553

Molecular dynamics is a simulation method for studying movements of atoms and molecules, usually applied in the study of biomolecules and materials. GROMACS open source molecular dynamics simulator supports GPU acceleration using both CUDA and OpenCL. While using CUDA is limited to NVIDIA GPUs and NVIDIA proprietary drivers, compilers and libraries, OpenCL in GROMACS targets both NVIDIA and AMD GPUs. Until this point, OpenCL in GROMACS was only tested on proprietary drivers from NVIDIA and AMD. Advances in AMDGPU LLVM backend and radeonsi Gallium compute stack for Radeon Graphics Core Next (GCN) GPUs are steadily closing the feature gap between the open source and proprietary drivers. Recent announcement from AMD regarding the plan to support the existing open source OpenCL driver and open source their (currently proprietary) OpenCL driver makes it feasible to run GPU accelerated molecular dynamics on fully open source OpenCL stack. Under the guidance and with help from AMD's developers working on LLVM, we are working on improving AMDGPU LLVM backend, radeonsi Gallium compute stack, and libclc to support the OpenCL features GROMACS requires to run. The lightning talk will present the challenges we encountered in the process.

The work describes the design goals and methodology in creating a new model of optical telecommunication network used for studying network resilience. The model is implemented by discrete-event network simulator ns-3. The advantages of using the existing simulator core infrastructure provided by ns-3 are analyzed and compared to building own simulator from scratch, or selecting a tool among other existing simulators such as ns-2, OMNeT++, and commercial simulators. The requirements for feature functionality are outlined and high-level overview of the model architecture and its components are provided. The model is extended to support availability evaluation. Network availability is of paramount importance in optical telecommunication networks. Their rising connectivity and consequently their availability is compromised by link and node failures, usually due to physical force (e.g. digging, earthquake or fire). In optical networks a group of logically distinct links can unintentionally share a physical resource (e.g. a cable or a duct). Such a group, called shared risk link group (SRLG), introduces a situation where a single failure of common resource can cause multiple failures. Failure of common resource usually occurs due to physical force and causes failures of multiple links. Specifically, such a failure can cause both working and spare wavelength path of a logical connection between two edge nodes to fail at the same time, leaving them disconnected until a repair is done. The usual approach to solving this problem consists of introducing more spare capacity to the network and also using a routing algorithm that takes SRLGs into account when computing paths. Such a routing algorithm avoids creating working and spare path pairs that have links contained in the same SRLG, to minimize the negative impact of SRLG failure on logical connection availability. The number and length of SRLGs, as well as the characteristics of the underlying physical topology can significantly affect network availability. Especially, the physical topology can be represented by realistic synthetic graphs which are created by numerous geographic graph generators. The implementation and usage of six different physical topology models (Random Geometric, Gabriel, Relative Neighborhood, K-Nearest Neighbor, Waxman and Spatial Barabási-Albert) for investigation of the influence of the underlying topology on the optical telecommunication network availability is described. Network availability is estimated using Monte Carlo simulations based on a model of optical telecommunication network implemented by network simulator ns-3. Scenarios utilizing six topology models both in absence and presence of SRLGs are studied, and the optical network availability sensitivity to the underlying physical network topology is presented as the main result. Routing algorithms were proposed to ensure working and spare paths of a connection in a network are SRLG-disjoint to avoid such common cause failures. However, complete SRLG-disjointedness of working and spare path is not always possible due to limited number of links or limited capacity available in the network, so maximum SRLG-disjoint paths algorithm is taken instead. Maximum SRLG-disjoint path problem is in general NP-hard. In terms of solution quality greedy algorithms for maximum SRLG-disjoint path problem are as good as more complicated heuristics. To optimize maximum SRLG-disjoint path routing and wavelength assignment algorithm, a novel path weighting scheme was used. To improve the run-time performance of maximum SRLG-disjoint path greedy algorithm, it was implemented using NVIDIA CUDA heterogeneous parallel programming platform and executed on graphics processing unit. Brzi porast količine prenesenog prometa putem interneta, podržan isto tako brzim povećanjem kapaciteta optičke transportne mreže čini otpornost mreže na kvarove zahtjevom koji je potrebno uključiti u procesu dizajna mreže. Kvar mrežnog elementa (primjerice, vlakna u kabelu ili prospojnika u čvoru) može uzrokovati prekid mnogih svjetlosnih puteva, što vodi gubitku podataka i prihoda. U slučaju kvara komponente puta koji koristi logički kanal u mreži, alternativni put (koji zovemo rezervnim) mora se koristiti sve dok sepopravak komponente osnovnog puta ne dogodi. Grupa veza s dijeljenim rizikom (shared risk link group, SRLG) je grupa veza u mreži koje dijele fizičku lokaciju. To može biti kabel, cijev ili izlaz na čvoru. Sve veze koje se nalaze u SRLG-u imaju mogućnost biti oštećene u slučaju kvara jedne veze koja se nalazi u SRLG-u. Takvo fizičkog oštećenje rezultira situacijom u kojoj višestruki logički kvarovi u mreži nastaju zbog jednog fizičkog kvara. SRLG uvodi zavisnost između kvarova veza, obzirom da se radi o skupu veza koje dijele zajednički fizički resurs kao što je prijelaz mosta, kabel ili cijev. č esta je pretpostavka da je korelacija između kvarova deterministička, što implicira da kvar pojedine veze u SRLG-u uvijek uzrokuje kvar svih ostalih veza koje on sadrži. U stvarnosti to nije nužno slučaj, pa su izučavani vjerojatnosni modeli u kojima veze sadržane u SRLG-u doživljavaju oštećenje s određenom vjerojatnosti. Zaključeno je da je utjecaj koreliranih kvarova (uključujući SRLGove) na raspoloživost mreže značajan. Brojni pristupi pružanja resursa putevima, specifično usmjeravanja i dodjele valnih duljina (routing and wavelength assignment, RWA) u optičkim mrežama koje sadrže SRLG-ove su razmatrani sa zajedničkim ciljem izbjegavanja istovremenog kvara osnovnog i rezervnog puta. RWA problem se može iskazati kao cjelobrojni linearni program. Obzirom da je općenito NP-težak, često se za rješavanje koriste heuristike. Uvodno poglavlje iznosi kontekst problema koji se u radu rješava, objašnjava motivaciju za istraživanjem i navodi sadržaj rada po poglavljima. Drugo poglavlje “Osnove optičkih telekomunikacijskih mreža” (Basics of Optical Telecommunication Networks) predstavlja temeljne pojmove područja optičkih mreža, počevši od optičkih kanala, preko čvorova u optičkoj mreži koji izvode obradu signala u električnoj domeni, sve do čvorova u mreži koji rade u sveoptičkoj domeni (tj. ne pretvaraju signal u električnu domenu). Poseban naglasak stavljen je na optičke prospojnike s mogućnošću rekonfiguracije, te s njima povezanu funkcionalnost za kontrolu i upravljanje mrežom. Treće poglavlje “Temelji simulacije mreža” (Fundamentals of Network Simulation) iznosi osnove područja simulacije mreža zasnovane na diskretnim događajima. Poseban naglasak stavljen je na simulaciju Monte Carlo koja je uzeta u razmatranje kao jedan od mogućih postupaka za rješavanje problema proračuna raspoloživosti optičke mreže. Navedeni su i opisani zahtjevi za model optičke mreže i simulator koji će ga koristiti. Zahtjevi uključuju podršku za kanale s većim brojem valnih duljina, model optičkog komutatora, granularnost komutacije, različite arhitekture komutatora, kontrolnu ravninu i mehanizme zaštite i obnavljanja u slučaju kvarova na komponentama mreže. Izneseni su razlozi zbog kojih nijedan od postojećih simulatora ne zadovoljava navedene zahtjeve. Zbog toga je u ovom poglavlju predložen i razvijen novi simulator zasnovan na mrežnom simulatoru ns-3. Četvrto poglavlje “Otpornost telekomunikacijskihmreža na kvarove” (Resilience of Telecommunication Networks) daje pregled područja otpornosti telekomunikacijskih mreža. Opravak nakon kvara u optičkoj telekomunikacijskoj mreži koji se koristi dalje u radu zasniva se na zaštiti puta i metodi zaštite s dodijeljenim kapacitetom. Također se definiraju metrike za proračun performansi raspoloživosti mreže, specifično raspoloživost. Peto poglavlje “Korelirani kvarovi veza u mreži” (Correlated Failures of Network Links) daje prikaz rezultata simulacije Monte Carlo zas mreže u prisustvu koreliranih kvarova na mrežnim vezama. Koristi se metoda zaštite puta s dodijeljenim kapacitetom. Opisani su modeli veza u mreži, modeli grupa veza s dijeljenim rizikom, modeli svjetlosnih putova i logičkih kanala. Svi opisani modeli implementirani su u u mrežnom simulatoru ns-3. U scenarijima gdje je to moguće izvesti, rezultati izračuna raspoloživost mreže dobiveni simulacijom Monte Carlo verificiraju se usporedbom s rezultatima dobivenim analitičkim putem. Rezultati izvođenja simulacije zasnovane na predloženom modelu pokazuju da fizička svojstva grupa veza s dijeljenim rizikom, specifično njihova duljina, značajno utječu na raspoloživost mreže. Šesto poglavlje “Utjecaj koreliranih kvarova na različite modele topologija” (Impact of Correlated Failures on Various Topology Models) analizira utjecaj grupa veza s dijeljenim izikom na raspoloživost mreže za šest različitih modela sintetičkih topologija (slučajni geometrijski, Gabrielov, model relativnog susjedstva, model k-najbližih susjeda, Waxmanov i Barabási-Albertov). Rezultati simulacije pokazuju da se utjecaji koreliranih kvarova grupe veza s dijeljenim rizikom znatno razlikuju među analiziranim modelima. Sedmo poglavlje “Optimizacija usmjeravanja i dodjele valnih duljina koja uzima u obzir grupe veza s dijeljenim rizikom” (Shared Risk Link Group-aware Optimization of Routing and Wavelength Assignmen) predstavlja postojeće pristupe usmjeravanju i dodjeli valnih duljina razvijene s ciljem maksimiziranja disjunktnosti grupa veza s dijeljenim rizikom. Predložen je i implementiran novi algoritam za rješavanje problema usmjeravanja i dodjele valnih duljijna. Predloženi algoritam koristi svojstva grupa veza s dijeljenim rizikom prilikom odabira rezervnih puteva. Cilj je poboljšati rezultirajuće raspoloživosti uspostavljenih svjetlosnih puteva. Verifikacija na studijskom primjeru mreže pokazuje da predloženi algoritam daje jednake ili bolje vrijednosti raspoloživosti mreže kod usporedbe rezultata s onima dobivenim izvođenjem postojećih algoritama. Predlažu se i raspravljaju, također, buduća poboljšanja predloženog algoritma. Osmo poglavlje “Optimizacija performansi korištenjem heterogenog paralelnog programiranja” (Performance Optimization Using Heterogeneous Parallel Programming) analizira vremensku složenost predloženog algoritama za usmjeravanje i dodjelu valnih duljina. Algoritam je implementiran korištenjem metoda heterogenog paralelnog programiranja i izvodi se na grafičkim procesorima NVIDIA s tehnologijom CUDA (Compute Unified Device Architecture). Rezultati pokazuju da paralelizacija korištenjem grafičkih procesora značajno smanjuje vrijeme izvođenja, čak do sedam puta. Dan je kratak pogled u budućnost računanja korištenjem grafičkih procesora te se navode smjerovi budućih istraživanja. Deveto, zaključno poglavlje rezimira iznesene rezultate i predlaže njihove primjene. Izvorni znanstveni doprinosi doktorskog rada sastoje se u sljedećem: * Model raspoloživosti optičke telekomunikacijske mreže koji uzima u obzir postojanje grupa veza s dijeljenim rizikom uz pretpostavku varijabilnih duljina koreliranih veza i proizvoljnih stupnjeva korelacije kvarova. * Metoda proračuna raspoloživosti primjenom simulacije Monte Carlo zasnovana na predloženom modelu raspoloživosti optičke telekomunikacijske mreže u prisustvu koreliranih kvarova. * Algoritam za usmjeravanje i dodjelu valnih duljina u optičkim mrežama s valnim multipleksiranjem koji optimira raspoloživost logičkih kanala obzirom na značajke grupa veza s dijeljenim rizikom, uz primjenu paralelizacije izvođenja korištenjem naprednih procesorskih arhitektura.

Na predavanju će biti predstavljeni alati otvorenog koda za računalnu kemiju. Ti se alati koriste u istraživanjima u domeni organske kemije, biokemije, dizajna lijekova i drugim granama kemije i fizike. Specifično će se govoriti o zahtjevima pojedinih alata za računalnim resursima i potencijalu za izvođenje na superračunalima.

Prezentiran je LibreOffice kao alternativa Microsoft Office alatima i Edubuntu kao operacijski sustav primarno namijenjen za škole. U okviru prezentacije Edubuntua navedena je i prikazana nekolicina alata koji mogu poslužiti kao zamjena za poznate alate za obradu rasterske i vektorske grafike te audio i video sadržaja.

DNA methylation is a fundamental mechanism in functional organization of the human genome. Accordingly, DNA methyltransferase 1, Dnmt1, has been unsuccessfully targeted in different drug-design efforts for the last 30 years. Most of those failures can be attributed to inadequate understanding of dynamic structural changes that regulate Dnmt1 activity and its interaction with other molecules. Using a combination of different QM/MM/MD methods we have identified several novel mechanism-based inhibitors by exploiting dynamic structural changes that control interactions between Dnmt1 and its substrates. Typical simulation used 500000 steps in total duration of 1 nsec on GPU-accelerated version of GROMACS software package on NVIDIA CUDA-enabled GPUs. The simulations identified substrate analogues that have preserved key interactions with the enzyme and showed that solvent molecules are crucial for interactions between Dnmt1 with its cofactor. Substrate is positioned in the active site by a dynamic active site loop that acts as substrate lock-and-press mechanism just as earlier indicated in the experimental studies. QM studies identified several substrate analogues that have the highest reactivity towards active site cysteine.

NVIDIA za sebe kaže da je vodeća svjetska kompanija u tehnologijama vizualnog računarstva, a statistika na Valveovom govori tome u prilog. Naime, više od pola Steam korisnika ima neki od NVIDIA grafičkih procesora, a slijede AMD i Intel.S druge strane, NVIDIA ima vrlo zanimljivu povijest (ne)suradnje sa zajednicom otvorenog koda koja uključuje otvoreni 2D-only nv driver, fantastični (i nažalost zatvoreni) nvidia driver, reverse-engineerani nouveau i priče oko podrške za NVIDIA Optimus koje kulminiraju Torvadsovim srednjim prstom i pripadajućim riječima. Epilog priče dogodio se ove godine s otvorenim driverima za Tegru K1.Predavanje će prezentirati stanje stvari u domeni računanja na grafičkim procesorima, u kojem još uvijek dobrano vodi NVIDIA s tehnologijom CUDA. Unatoč tome što je osnovni skup alata većim dijelom zatvoren, otvaranje pojedinih komponenata je pozitivna stvar. Pored toga, čitav ekosustav koji se razvio oko CUDA tehnologije ima u sebi velik broj projekata otvorenog koda kao i onih koji su dijelom otvorenog koda.

PG-Strom je dodatak za sustav za upravljanje podataka PostgreSQL koji služi kao omotač stranih podataka (engl. foreign data wrapper). Cilj PG- Stroma je da iskoristi uređaje tipa GPU koji za ubrzanje sekvencijalnog pretraživanja tablice u bazi podataka u situaciji kada postoji velik broj unosa i kada pretraživanje koristi složene kvalifikatore. PG-Strom radi tako da CPU oslobodi numeričkih proračuna, kako bi se isti mogao orjentirati na sekvencijalni rad kao što je ulaz- izlaz na disku i memoriji. Zbog toga, numerički proračuni su prepušteni GPU-u, koji ih izvodi paralelno. Rad sa GPU-ima zasniva se na tehnologiji NVIDIA CUDA. Cilj rada je dati pregled općenitih pretpostavki tehnologije za paralelno programiranje NVIDIA CUDA koje omogućuju ubrzanje raznih algoritama, a zatim opisati specifične značajke iste tehnologije koje koristi PG-Strom.

Rad govori o tehničkim i formalnim izazovima na koje smo naišli u procesu migracije Linux infrastrukture na Debian GNU/Linux na Odjelu za informatiku.

Povećanjem brzine pristupa internetu dostupnog krajnjim korisnicima, te proširenjem spektra usluga koje se isporučuju putem interneta (IP TV, IP telefonija, igre za PC i konzole), raste i utjecaj kvarova telekomunikacijske mreže na dostupnost tih usluga. Iskopi kabela i kvarovi komponenata mogu se umanjiti, ali ne i u potpunosti izbjeći. Zbog toga svaka telekomunikacijska mreža ima u sebi određeni postotak rezervnih komponenata i kabela koji se koriste u slučaju kvara. Telekom operater se uvijek pita koliko je rezervne opreme potrebno da se spriječi prekid usluge korisniku u slučaju kvara, ali da ukupna investicija bude dovoljno niska da cijena usluge može ostati konkurentna na tržištu. Prezentacija će govoriti simulatoru kvarova telekomunikacijske mreže otvorenog koda koji razvijamo na Odjelu za informatiku Sveučilišta u Rijeci u suradnji s Fakultetom elektrotehnike i računarstva Sveučilišta u Zagrebu. Poseban naglasak bit će stavljen na mogućnosti primjene u praksi.

Rastuće brzine prijenosa optičke komunikacijske tehnologije postavljaju pitanje zaštite i oporavka mreže u slučaju pojave kvarova, obzirom da oni utječu na raspoloživost usluga koje mreža nudi. Povećanje broja čvorova i veza u mreži rezultira povećanjem učestalosti dvostrukih kvarova. Zbog činjenice da nije uvijek moguće osigurati prostornu razdvojenost kabela povećava se i broj zavisnih kvarova, kod kojih kvar jednog mrežnog elementa rezultira kvarom jednog ili više drugih. Rad započinje pregledom osnovnih termina optičke komunikacijske tehnologije i raspoloživosti mreže, zatim se analiziraju višestruki kvarovi i zavisni kvarovi, a naposlijetku govorimo o pristupima izračunu pouzdanosti mreže ; zbog složenosti analitičkog pristupa naglasak se stavlja na simulacijske metode i daje se pregled alata koji ih implementiraju.

U prezentaciji je dan kratak pregled projekta razvoja e-kolegija Računalne mreže 2 na Odjelu za informatiku Sveučilišta u Rijeci. U okviru navedenog projekta pod pokroviteljstvom Sveučilišta u Rijeci razvijene su laboratorijske vježbe za kolegij.

Rad govori o tehnikama kojima se može prepoznati i spriječiti prepisivanje na ispitima na računalu. Poseban fokus stavljen je na ispite kod kojih svi studenti rade na istom računalu putem LTSP-a.

Mrežni simulator ns-3 nasljednik je mrežnog simulatora ns-2 i pokušava riješiti probleme koji su tijekom godina razvoja zamijećeni u arhitekturi i dizajnu ns-2. Cilj predavanja je opisati ns-3 u ulozi softvera i projekta otvorenog koga te u ulozi alata koji se koristi u istraživanju i razvoju računalnih mreža.

Na radionici je prezentiran način rada s mrežnim simulatorom ns-3 na gotovim primjerima i zadacima za polaznike.

Rad prezentira sustav Moin koji je wiki web aplikacija napisana u programskom jeziku Python.

Rad prezentira mogućnosti mrežnog simulatora ns-3 iz perspektive korisnika.

TeX i LaTeX izrazito se koriste u znanstvenoj zajednici kod pisanja radova za konferencije i časopise, izrade postera i druge aktivnosti. Česta je percepcija javnosti izvan akademske zajednice, ali i dijela akademske zajednice, da je TeX svijet statičan, odnosno da ne napreduje, što nije točno. Cilj predavanja je pokazati da TeX i dalje napreduje i slijedi svjetske trendove u digitalnoj tipografiji unutar projekata ConTeXt i LuaTeX.

Rad govori o društvenom utjecaju slobodnog softvera, otvorenog koda i otvorenih standarada. Kroz nekoliko primjera iz zajednice softvera otvorenog koda i lokalne zajednice potiče se diskusija na temu.

Rad prezentira LaTeX klasu Beamer koja služi za izradu prezentacija.

Rad govori o društvenom utjecaju slobodnog softvera, otvorenog koda i otvorenih standarada. Kroz nekoliko primjera iz zajednice softvera otvorenog koda i lokalne zajednice potiče se diskusija na temu.

Rombergov algoritam metoda je numeričke integracije koja koristi principe udvostručavanja segmenata produljene trapezne formule i eliminaciju člana greške dviju susjednih produljenih formula. Ponovljena procedura Rombergovog algoritma naziva se Richardsonova ekstrapolacija. Rombergov algoritam je metoda numeričke integracije specifična i po tome što se izvode omjeri grešaka i eksponenti omjera u Rombergovoj tablici, a cilj je izračun aproksimativne vrijednosti integrala s najvećim stupnjem točnosti, odnosno najmanjom greškom. Brzina i točnost izračuna Rombergovog algoritma razlikuje se ovisno o karakteristikama podintegralnih funkcija, a korektivnim mehanizmima dolazi se do najbolje aproksimativne vrijednosti integrala.

Umjetna inteligencija je znanstvena grana informatike koja je u zadnjih nekoliko godina vidjela intenzivno razvijanje i usavršavanje, posebno zahvaljujući probitku metoda strojnog učenja u brojne domene primjene. U ovom diplomskom radu, napravit će se kratki osvrt na primjene strojnog učenja uz tehnologije koje se trenutno koriste i dosadašnja istraživanja koja su pomogla njihovom razvoju. Rad daje primjer praktične primjene strojnog učenja u projektiranju građevina, specijalno stvaranju digitalnih tlocrta korištenjem grafičkih procesora.

Ovaj rad bavi se objašnjavanjem JavaScript Object Notationa (JSON-a), njegove povijesti, načinom na koji funkcionira, to jest kako JSON čita, sprema, obrađuje i šalje podatke unutar web aplikacija. Također će se opisati gdje se sve u web aplikacijama koristi JSON, razne baze podatka koje ga upotrebljavaju, njihove prednosti, mane i razlike. U ovom istraživanju JSON je iskorišten kako bismo podatke spremili i formatirali u željeni format, gdje baza podataka to može pročitati i pohraniti u željene tablice.

Rad ne sadrži sažetak.

Tema ovog rada je izrada aplikacije u virtualnoj stvarnosti. U ovom slučaju izrađena je igra imena Untapped Potential koja je zamišljena u obliku sci-fi shootera i sastoji se od raznih elemenata raspoređenih na dva glavna djela, svemirski brod i planet. Ključni dio igre je i objekt samog igrača koji sadrži razne postavke i mogućnosti kreiranja poza ruku za držanje različitih predmeta. Igra je razvijana u Unity Editoru i testirana na uređaju Oculus Quest 2, te je opisan postupak spajanja uređaja i korištenje raznih aplikacija potrebnih za razvoj i testiranje aplikacije. Također su opisani koncepti virtualne stvarnosti, njena povijest i razni uređaji koji je podržavaju, te primjene tehnologije virutalne stvarnosti u raznim područjima.

U radu su opisani pojmovi umjetne inteligencije, strojnog učenja i računalnog vida. Nadalje je opisano kako se umjetna inteligencija koristi ili planira u budućnosti koristiti u pomorstvu, budući da se rad bazira na razvoju metode za detekciju brodova. Veći fokus pridan je samoj detekciji objekata te je detaljno opisano što ta tehnika radi i kako funkcionira. Napravljena je i usporedba detekcije objekata na slici i klasifikacije slika budući da su to dva pojma koji se jako često spominju uz pojam računalnog vida. Kao praktični dio rada, opisan je razvoj metode za detekciju objekata na slikama u Pythonu koristeći OpenCV biblioteku, u programskom okruženju PyCharm i s prethodno treniranim modelom. Napravljena je detekcija objekata i na statičkim slikama i na slikama direktno iz web kamere.

Određeni softver moguće je ponovno izgraditi, to jest reproducirati ukoliko je od početka dostupan izvorni kod softvera, okruženje za izgradnju te uputstva za tu istu izgradnju te je softver predviđen za reprodukciju izgradnje. Imajući sve nužne podatke, svi specificirani artefakti se mogu rekreirati bajt po bajt. Relevantni atributi okruženja za izgradnju, upute za izgradnju i izvorni kod, kao i očekivani reproducirani artefakti definirani su od strane autora ili distributora. Artefakti gradnje dijelovi su rezultata izgradnje koji su željeni primarni rezultat. Izvorni kôd je najčešće se navodi kao specifična revizija u nekom repozitoriju ili arhivirani izvorni kod. Relevantni atributi okruženja za izgradnju obično uključuju zavisnosti (dependencies) i njihove verzije, zastavice konfiguracije konstrukcije i varijable okruženja koliko ih koristi sam sustav izgradnje (npr. lokalne i regionalne postavke operacijskog sustava). Skup atributa poželjno je imati sveden na manju brojku. Artefakti koji nastaju prilikom izgradnje bi uključivali izvršne datoteke (executables), distribucijske pakete ili slike datotečnog sustava. Obično ne uključuju zapisnike izgradnje ili slične pomoćne izlaze koji se mogu razlikovati kod reprodukcije izgradnje. Ponovljivost artefakata provjerava se usporedbom bajt po bajt. To se obično izvodi pomoću kriptografski sigurnih hash funkcija. Autori ili distributeri označavaju stranke koje tvrde da se ponovno može izgraditi skup artefakata. To mogu biti originalni autori, održavači distribucije ili bilo koji drugi distributeri.

Usporedno s razvojem softvera nastali su novi pristupi arhitekture i održavanja softvera. Pristupačnost internetske veze i hardvera omogućuju krajnjem korisniku da neprekidno koriste softver, a razvojni timovi moraju omogućiti visoku dostupnost. Mikroservisna arhitektura je odgovor kako prilagoditi softverski kod radu u redundancijama, a tehnološki mikroservise podupiru kontejnerizacija i orkestracija kontejnera. Kubernetes je vodeći orkestrator kontejneriziranih okolina i omogućuje nesmetan, visoko dostupan rad mehanizmima stvaranja redundancije. Kao dodatna mjera sigurnosti, softver se može nadzirati alatima, a poželjno ga je konfigurirati tako da su promjene u trendovima očite.

U ovom završnom radu opisano je kako instalirati i koristiti programski okvir Django i njegovu biblioteku htmx, te kako uz pomoć njihove tehnologije izraditi dinamičku web aplikaciju. Django je besplatan, web programski okvir otvorenog izvora baziran na programskom jeziku Python i koristi strukturu Model-Pogled-Predložak za obradu podataka i komunikaciju između klijenta i servera. Model nam predstavlja našu bazu podataka, svaki model je kao jedna tablica sa svojim atributima. U pogledu se nalazi sva logika koja povezuje model i predložak i kojom upravljamo kako će podatci biti obrađeni i prikazani. Na posljetku predložak služi za generiranje korisničkog sučelja i prikaz podataka. Iz njega šaljemo zahtjeve i na njega primamo odgovore. Biblioteka htmx je veoma jednostavna za korištenje. Potrebno je samo uključiti ga u projekt pomoću jedne linije unutar oznake. Htmx nam omogućuje korištenje AJAX-a, CSS tranzicija i WebSocketsa bez korištenja JavaScripta. Korištenjem htmx-a na jednostavan način možemo obrađivati podatke i slati zahtjeve i primati odgovore navedenih tehnologija, sve unutar predloška bez ponovnog učitavanja web stranice. Korištenjem Djanga i htmx-a sam bez previše nepotrebnog koda kreirao dinamičku web aplikaciju koja sadrži sve moderne značajke poput registracije i prijave, kreiranje, uređivanje i brisanje objava i njihovo filtriraje i pretraživanje te detaljni pogledi svake od tih objava i profila svakog korisnika.

U ovom završnom radu obrađena je tema AWS serverless servisi s primjerima. U prvom poglavlju, napravljen je kratak uvod u temu. Sljedeće poglavlje sadržava opis Amazon Web Services platforme, uz opće informacije i princip rada platforme. U trećem poglavlju, opisana je podjela Amazon Web Services platforme. Kratko su opisane usluge Amazon Simple Notification Service, Amazon Simple Storage Service, AWS Lambda, Amazon DynamoDB i AWS Identity and Access Management. Sljedeće poglavlje čini usporedbu računarstva u oblaku i poslužitelja na licu mjesta. Definirani su pojmovi računarstva u oblaku i poslužitelja na licu mjesta te napravljena njihova usporedba. U petom poglavlju, opisan je primjer Amazon Web Services usluga i za njega implementiran kod. Posljednje poglavlje je zaključak o temi.

U ovom završnom radu biti će objašnjen i demonstriran rad senzora u mobilnim aplikacijama. Senzori su podijeljeni u tri glavne vrste: senzore pokreta, senzore okoliša te senzore položaja. Za svaki senzor je objašnjena njegova funkcionalnost, način rada te su također dani primjer primjene svakih od senzora u aplikacijma. Naposlijetku, napravljeni su prototipi jednostavnih aplikacija koje pokazuje rad tri glavnih vrsta senzora., In this final paper, the operation of sensors in mobile applications will be explained and demonstrated. Sensors are divided into three main types: motion sensors, environmental sensors and position sensors. For each sensor, its functionality and mode of operation are explained, and examples of the use of each sensor in applications are also given. Finally, prototypes of simple applications were made that demonstrate the operation of the three main types of sensors.

This paper aims to explain what cryptocurrencies are, how they work, and what security challenges exist in them. In doing so, it explains how blockchain together with smart contracts and liquidity pools are the fundamental parts of the cryptocurrency world. Paper describes two attacks on the blockchain in cryptocurrency trading called „Spoofing“ and „Momentum ignition strategy“. These problems are explained textual and graphically based on real-world events. The practical part of the paper gives pseudo-code solution proposals for those problems and shows graphically how they could work in real situations. The thesis was written with the support of the Juice d.o.o.

Nowadays, data is considered to be one of the most valuable resources in the world. Some data is viewed as strictly confidential, so it needs to be protected and secured. Therefore, data masking is becoming increasingly popular. Data anonymization is a concern for many global businesses, including the Libelle company, which provides numerous optimal algorithms for data anonymization in its Libelle DataMasking product. Due to the fact that the aforementioned solution is implemented on-premise, the idea is to utilise current algorithms and transfer the masking functionality to the cloud. The main goal here is to enable serverless data anonymization, while the ultimate objective is to develop a simple-to-use solution that allows users to enter certain data, send it, and receive anonymized data back. This was accomplished through the use of a serverless architecture and the Function-as-a-Service (FaaS) model. According to the serverless concept, the architecture is handled by a third party, leaving developers to focus solely on the product's functionality and logic. FaaS is primarily concerned with event-driven computing paradigms in which the entire application code is only run in response to requests – in this case, sending data for anonymization. As a result, the organization's energy and resources are conserved, allowing management and developers to concentrate on the product and profit strategy. There are several technologies for implementing FaaS solutions, with AWS Lambda serving as the primary technology in this ‘serverless-data-masking’ scenario.

S razvitkom računalnih mreža razvio se i novi oblik kriminala, a to je računalni kriminal. Računalne mreže postaju ranjivije i nesigurnije zbog sve većeg broja korisnika. Sredstva napada mogu se sastojati od zlonamjernih web stranica usmjerenih na ranjivosti web preglednika, zlonamjernih privitaka e-pošte ili izravnih, ručnih pokušaja pojedinca da iskoristi poznate ranjivosti. Kada napadač pristupi udaljenom Windows sustavu elementi napadačevog sustava postaju vidljivi na žrtvinom sustavu. Kako bi se otkrio računalni kriminal potrebna je računalna forenzika kako bi dala dokaze o kriminalnim aktivnostima. Računalna forenzika je znanost koja se bavi sakupljanjem, pretraživanjem, analizom i prezentacijom podataka. Ovaj završni rad podijeljen je u 4 poglavlja. U prvom poglavlju opisuju se i navode vrste računalnog kriminala, te se navode primjeri prethodno nastalih kriminalnih događaja. Drugo poglavlje opisuje incidente i kako oni nastaju, te koji su elementi posljedično vidljivi nakon što je došlo do incidenta. U trećem poglavlju navode se i opisuju tipovi računalne forenzike i alati pomoću kojih bi se otkrile neželjene aktivnosti, dok se u četvrtom poglavlju prikazuje utjecaj malware-a na sustav, način istrage i tehnike rada forenzike.

Digitalna transformacija mijenja svijet oko nas i održavanje računalne infrastrukture pritom nije iznimka. Početkom 1990-ih za održavanje jednog poslužitelja bio je dovoljan jedan sistem administrator. Već sredinom 2000-ih virtualizacijska tehnologija mijenja omjer jer se pojavljuje mogućnost pokretanja praktički neograničenog broja virtualnih poslužitelja koji posljedično zahtijevaju velik broj sistem administratora. Time nastaje potreba za automatizacijom održavanja računalnih sustava kako bi se smanjila količina posla koju svaki novi pokrenuti poslužitelj nosi administratoru. Iz tog razloga razvijeni su alati za automatizaciju poput Chefa, Puppeta, SaltStacka i Ansiblea koji omogućuju automatizaciju postavljanja i konfiguracije računalne infrastrukture. Ovaj rad opisuje postupak održavanja tipičnog poslužitelja, baziranog na operacijskom sustavu Linux, mogućnosti automatizacije putem Ansiblea te primjenu te automatizacijske platforme za instalaciju i konfiguraciju sustava za e-učenje Moodle