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Aquatic ecosystems can exhibit seasonal variation in resource availability and animals have evolved to cope with the associated caloric restriction. During winter in the NW Mediterranean Sea, the European sardine Sardina pilchardus naturally experiences caloric restriction due to a decrease in diversity and quantity of plankton. Ongoing global warming has, however, had deleterious effects on plankton communities such that food shortages may occur throughout the year, especially under warm conditions in the summer. We investigated the interactive effects of temperature and food availability on sardine metabolism, by continuously monitoring whole-animal respiration of groups of control (fed) and food-deprived sardines over a 60-day experiment in winter (12°C) or summer (20°C) conditions under natural photoperiod. In addition, we measured mitochondrial respiration of red muscle fibres, biometric variables and energy reserves, of individuals sampled at 30 and 60 days. This revealed that winter food deprivation elicits energy saving mechanisms at whole animal and cellular levels by maintaining a low metabolism to preserve energy reserves, allowing high survival. By contrast, despite energy saving mechanisms at the mitochondrial level, whole animal metabolic rate was high during food deprivation in summer, causing increased consumption of energy reserves at the muscular level and high mortality after 60 days. Furthermore, a 5-day refeeding did not improve survival and mortalities actually continued, suggesting that long-term food deprivation at high temperatures caused profound stress in sardines that potentially impaired nutrient absorption.

Les difficultés autour de la mise en œuvre du plan de gestion WESTMED en 2020 ont accentué la demande d’acquisition de connaissances sur le fonctionnement global du Golfe du Lion (GoL). C’est en réponse à cette demande croissante de la part de divers acteurs, pêcheurs professionnels, scientifiques, gestionnaires, que le projet Goldys (DYnamique Saisonnière du Golfe du Lion) a vu le jour. Celui-ci a permis la mise en œuvre de campagnes écosystémiques d'observation à bord de chalutiers professionnels tout au long de l'année 2022-2023 dans le but de compléter la vision estivale du système assurée par les campagnes MEDITS et PELMED. De façon à combler un manque d’information important sur la dynamique des communautés planctoniques du GoL. Des prélèvements planctoniques (phyto-, zoo- et ichtyoplancton) et des mesures hydrologiques ont été entrepris. Ensuite, l’identification des communautés planctoniques récoltées (analyse de chémotaxonomie pour le phytoplancton, imagerie pour le zooplancton, microscopie et analyses moléculaires pour l’ichtyoplancton) a été indispensable afin d'acquérir une meilleure connaissance de la dynamique planctonique saisonnières. Ainsi, ces analyses ont permis de mettre en évidence les gradients spatio-temporels de ces communautés liés aux fluctuations de l’environnement. En particulier, l’été caractérisé par des eaux chaudes et stratifiées, est favorable au développement des Synechococcus, pélagophytes, branchiopodes, chaetognathes, appendiculaires ainsi qu’à la reproduction des anchois, rougets et Callionymidae. Les autres saisons sont caractérisées par une plus forte variabilité spatiale, des eaux généralement plus productives liées à des apports en eaux douces, avec une faible stratification favorisant les diatomées, Prochlorococcus, prasinophytes, la dominance des copépodes et la reproduction d’espèces à fort intérêt halieutique telles que les sardines et les merlus. Les communautés ichtyoplanctoniques, ont un gradient spatial plus marqué e

Suite à la mise en œuvre du plan de gestion WESTMED en 2020, le besoin accru de connaissances sur le fonctionnement du Golfe du Lion a été souligné par l'ensemble des acteurs, pêcheurs professionnels, scientifiques et gestionnaires. Le projet Goldys (Dynamique Saisonnière du Golfe du Lion), est un projet porté par Ifremer en partenariat avec le CRPMEM-Occitanie, et cofinancé par les fonds FEAMP, France Filière Pêche et la région Occitanie jusqu'en Juin 2023. Il ambitionne de répondre à certaines questions sur le fonctionnement écologique du Golfe du Lion et la dynamique saisonnière des espèces exploitées par les flottilles chalutières. En particulier, via la mise en œuvre de campagnes d'observation tout au long de l'année, il vise à compléter la vision estivale du système obtenue par le biais des campagnes scientifiques déployées en Juin et Juillet par Ifremer (campagnes MEDITS et PELMED). En s'appuyant sur les même protocoles et engins d'observation que sur ces campagnes (pour permettre la comparaison entre les saisons) mais en les déployant sur un chalutier méditerranéen, il vise à observer : Ø L'évolution saisonnière de l'ensemble des espèces pêchées au chalut de fond vivant proches ou sur le fond ; Ø Les cycles reproductifs d'un grand nombre d'entre elles (définir les périodes de pontes); Ø Les zones de pontes et de nourriceries ; Ø L'évolution saisonnière de la productivité du milieu (hydrologie, communautés phyto- et zooplanctoniques). Les trois campagnes saisonnières GOLDYS (printemps, automne, hiver) visent donc à couvrir une partie représentative du Golfe du Lion en reprenant pour partie les points observés lors des campagnes MEDITS et en les complétant par des traînes professionnelles. Pour ce faire, 40 opérations par saison, s'étalant sur 75 jours de mer, ont été réalisées entre Avril 2022 et Mars 2023. Le présent rapport vise à décrire les stratégies et protocoles d’échantillonnages ainsi que la mise en œuvre des campagnes en mer au terme des quatre

De façon à obtenir une meilleure compréhension des cycles de vie, répartitions spatiales et dynamiques des populations exploitées, des campagnes scientifiques (reprenant le protocole des campagnes MEDITS) ont été déployées en 2022-2023. Elles visaient à d’obtenir un suivi saisonnier de la ressource (en particulier, répartitions spatiales des juvéniles et des reproducteurs). Les objectifs visés étaient : 1) une évaluation de la biodiversité (inventaire, structure et répartition spatiale des assemblages) et des successions saisonnières des communautés d’invertébrés benthiques et ichtyologiques observées sur un an ; 2) pour un certain nombre d’espèces, obtenir des informations détaillées sur leur cycle de vie dans la zone d’étude ; 3) produire des cartes saisonnières des principales espèces rencontrées par stade de vie (juvéniles et adultes) de façon à obtenir un premier aperçu de leurs dynamiques saisonnières sur un an. Le suivi de la distribution des principales espèces rencontrées a permis d’obtenir un premier aperçu de leurs dynamiques saisonnières sur un an. Les résultats obtenus ici indiquent que les assemblages sont fortement structurés par le gradient bathymétrique et pour beaucoup d’espèces, les distributions sont assez stables sur l’ensemble de l’année. Il est probable que les observations estivales obtenues lors de la campagne récurrente MEDITS soient suffisamment représentatives dans un grand nombre de cas. La définition de la taille médiane à première maturité a permis de distinguer plus précisément les juvéniles des adultes et de comparer leurs distributions saisonnières.

Le projet INPOLAG (2019-2023) s’inscrit dans le contexte réglementaire de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) et vise à développer un indicateur "poissons DCE-compatible" adapté au contexte français. Basé sur un échantillonnage à deux saisons (printemps et automne) de 122 stations réparties sur un panel de 8 lagunes, ce travail a permis de décrire les peuplements de poissons, principalement les juvéniles ou les espèces peu mobiles, en parallèle des conditions environnementales. Les données collectées mettent en évidence les variabilités spatiale (entre habitats) et saisonnière (printemps vs. automne) de la densité et de la composition des peuplements. L’analyse spatio-temporelle des communautés bentho-démersales a montré néanmoins une influence relativement limitée de la saison dans nos données (2% de l’effet temporelle pour 18% de l’effet spatial de la lagune) avec cependant des différences marquées dans les captures au printemps avec l’arrivée d’espèces marines migrantes telles que Sparus aurata, Liza ramada et Solea solea. L'occurrence et la diversité des poissons dans les habitats lagunaires seraient donc fortement influencée par la saisonnalité du recrutement, la dynamique des populations et les schémas de migration comme cela a pu être démontré dans des études antérieures. Au terme de ce travail, de nombreuses métriques de diversité ont été calculées mais aujourd'hui il n'est pas possible de définir un indicateur "poissons DCE-compatible" en raison du faible nombre de couple de données Métrique-Pression. Ce travail a permis néanmoins de valider une stratégie d'acquisition et de traitement des données qui pourra être appliquée à large échelle dans les lagunes méditerranéennes françaises.

Since 2008, there has been a major decrease in the numbers of old and large sardines in the Gulf of Lions, which has had a major effect on regional fisheries. A bottom-up process involving a shift in diet towards smaller planktonic prey has been suggested as the main driver of this development. Yet, the reproductive capacities of the sardines have not changed, suggesting potential modifications in energy allocation trade-offs. Whether this could also affect maintenance, in particular at the end of the winter reproductive period, and explain the lower adult survival and the disappearance of older individuals remains unclear. We therefore experimentally investigated the consequences of seasonal food availability (summer vs. winter) on life-history traits and energy allocation trade-offs at the individual and population levels. Our results indicate that food resources during summer had a major effect on energy reserves and growth, limiting the maximum size and body condition reached at the end of reproduction. In addition, food restrictions during growth and/or reproduction periods led to physiological costs mediated by increased oxidative damage. Mediterranean sardines did not show any ability for compensatory growth and did not appear to be capital breeders. Instead, they displayed individual differences in coping with physiological constraints and displayed various life-history strategies regardless of food availability. We highlighted 3 main individual energy allocation strategies: (1) preferential allocation to body condition or (2) to growth, or (3) simultaneous allocation to reproduction and growth. These issues are key, as climate change is expected to favour smaller phytoplankton, which might amplify the deterioration in the condition of pelagic fish.

Studies of the diet, feeding habits and trophic activity of top marine predators are essential for understanding their trophodynamics. The main direct method used for such studies thus far has been morphological inventories of stomach contents. This approach presents limitations such as missing gelatinous prey, which are usually digested too quickly to be detectable. Here, we analysed the stomachs of 48 Atlantic bluefin tuna (Thunnus thynnus, approximately 15 to 60 kg, including juveniles and adult fishes) collected from the Mediterranean Sea through the metabarcoding of two gene regions (cytochrome c oxidase subunit I (COI) and the ribosomal 18S-V1V2 region). The identified prey taxa and their relative read abundances (RRAs) estimated using COI results were in line with the findings of morphologically based inventories simultaneously performed on the same set of tuna samples. In both cases (and with the same rankings), the prey taxa included anchovy (Engraulis encrasicolus, here detected in more than 80% of samples, RRA D 43%), sardine (Sardina pilchardus, also approximately 80%, RRA D 30%), sprat (Sprattus sprattus, approximately 66%, RRA D 8%), mackerel (Scomber colias, approximately 44%, RRA D 7%) and cephalopods (approximately 15%, RRAD1.4%). Another striking result was the detection, based on 18S (with which vertebrates were detected as the most abundant group, RRAD61.6%), of a high prevalence and diversity of gelatinous organisms (RRA D 27.1%), including cnidarians (6.7%), salps (11.7%), and ctenophores (8.7%), the latter increasing with the size of the predator. These results thus support the hypothesis of the role of gelatinous prey in the diet of Atlantic bluefin tuna, suggesting that this species is even more generalist and opportunistic than previously thought. This study further confirms that DNA metabarcoding can be a powerful tool for assessing the diet and trophodynamics of top marine predators

Uncommon fish records may reflect local or global changes of fish composition resulting from environmental changes or anthropogenic activities. Significant records of uncommon marine fishes, including migrant, non-native, cryptic, rare and threatened species, collected in French waters or by French vessels in European waters, observed by scuba divers or beachgoers, are reported for the year 2019. They include first, new, rare and unusual records for the following 33 species: Tetronarce nobiliana, Gymnothorax unicolor, Maulisia mauli, Salmo trutta, Grammonus ater, Photostomias guernei, Ijimaia loppei, Echiodon drummondii, Holocen- trus adscensionis, Nerophis lumbriciformis, Scorpaena scrofa, Lepidotrigla dieuzeidei, Eutelichthys leptochirus, Liparis montagui, Mycteroperca rubra, Serranus cabrilla, Remora remora, Caranx crysos, Naucrates ductor, Trachurus picturatus, Seriola rivoliana, Argyrosomus regius, Parablennius pilicornis, Pseudoscopelus astro- nesthidens, Deltentosteus collonianus, Didogobius schlieweni, Didogobius splechtnai, Gobius couchi, Gobius gasteveni, Lebetus guilleti, Synapturichthys kleinii, Lagocephalus lagocephalus and Mola mola, among which I. loppei, H. adscensionis and P. astronesthidens represent first records for the French waters and additions to the Checklist of the marine fishes from metropolitan France. Photostomias guernei is a first record for the Bay of Biscay, found close the French EEZ., Les signalements inhabituels de poissons peuvent témoigner de changements locaux ou globaux résultants de modifications environnementales ou d’activités anthropiques. Des signalements remarquables de poissons marins, comprenant des espèces migrantes, non natives, cryptiques, rares et menacées, collectés dans les eaux françaises ou bien par des navires français dans les eaux européennes, observées par des plongeurs sous-marins ou des promeneurs, sont mentionnés pour l’année 2019. Ils comprennent des premiers et nouveaux signalements ainsi que des signalements rares et inhabituels pour les 33 espèces suivantes : Tetronarce nobiliana, Gymnothorax unicolor, Maulisia mauli, Salmo trutta, Grammonus ater, Photostomias guernei, Ijimaia loppei, Echiodon drummondii, Holocentrus adscensionis, Nerophis lumbriciformis, Scorpaena scrofa, Lepidotrigla dieuzeidei, Eutelichthys leptochirus, Liparis montagui, Mycteroperca rubra, Serranus cabrilla, Remora remora, Caranx crysos, Naucrates ductor, Trachurus picturatus, Seriola rivoliana, Argyrosomus regius, Parablennius pilicornis, Pseudoscopelus astronesthidens, Deltentosteus collonianus, Didogobius schlieweni, Didogobius splechtnai, Gobius couchi, Gobius gasteveni, Lebetus guilleti, Synapturichthys kleinii, Lagocephalus lagocephalus et Mola mola, parmi lesquelles I. loppei, H. adscensionis et P. astronesthidens représentent des premiers signalements pour les eaux françaises et des additions à la Liste des poissons marins de France métropolitaine. Photostomias guernei est un premier signalement pour le golfe de Gascogne, trouvé proche de la ZEE française.

Ces fiches sur des espèces marines de Méditerranée occidentale sont des documents de terrain d’aide à l'identification. Elles sont principalement établies pour favoriser la qualité et la rapidité d’identification des espèces capturées lors des campagnes halieutiques en Méditerranée. Ces fiches sont donc destinées à des opérateurs avertis. Sans être exhaustif, le domaine couvert par ces fiches correspond à plus de 300 espèces (version 4) de Poissons, Céphalopodes et Crustacés. Ces espèces sont soit pêchées lors des campagnes de chalutages du Golfe du Lion et de l’Est-Corse (à des profondeurs comprises entre 20 à 800 m), soit susceptibles de l’être car référencées/signalées dans la zone. Une fiche regroupe des espèces similaires, leurs principales caractéristiques, et lorsque qu’il existe des possibilités de confusion, présentent les principaux critères discriminants. Ces fiches ne constituent donc pas un manuel d’identification faunistique. L’expérience et le savoir-faire de nombreux intervenants ont permis la constitution de ces fiches, quel que soit leur niveau de contribution, nous les en remercions tous.

Growth of European hake was estimated from the results of a conventional tagging study in the Gulf of Lions, the first tagging experiment to have been undertaken on the species in Mediterranean waters. In all, 4277 hake 15–40 cm long were tagged and released on the inshore fishing grounds during spring 2006. The overall recapture rate was 6.5% and times-at-liberty ranged from 1 to 717 d. Growth rate in hake varied with size and sex. The estimated growth parameter (von Bertalanffy k) was estimated as double previously published values based on size frequency distribution in the area. Compared with recent growth parameters derived from the tagging experiments in the Bay of Biscay, k was estimated to be slightly lower in the Gulf of Lions. With this faster growth, hake would mature earlier than previously thought: at age 2 for both sexes, instead of at age 3 or 4 as currently accepted for the Mediterranean. Growth rate by sex decreased to a similar level once fish had attained sexual maturity.

This document presents all the techniques used in routine by Ifremer to estimate the age of fish from the calcified piece. The procedure for estimating age describes each technical stage from the taking of the calcified piece through to the supplying of key sizes/ages to the European work groups. This procedure is specific to each species and even each population of fish., Ce document présente toutes les techniques utilisées en routine par l'Ifremer pour estimer l'âge des poissons à partir des pièces calcifiées. La procédure d'estimation de l'âge décrit toutes les étapes techniques du prélèvement des pièces calcifiées jusqu'à la fourniture de clé tailles/âges aux groupes de travail européens. Celle-ci est spécifique à chaque espèce voire à chaque population de poissons.