Search

Obesity adversely affects health and is associated with subclinical systemic inflammation and features of accelerated aging, including the T-cell immune system. The presence of metabolic syndrome (MetS) may accelerate, while bariatric surgery might reverse these phenomena. To examine the effects of MetS and bariatric surgery on T-cell aging, we measured relative telomere length (RTL) and T-cell differentiation status in obese patients before and after bariatric surgery. WHO II/III classified obese patients scheduled for bariatric surgery were included: 41 without MetS and 67 with MetS. RTL and T-cell differentiation status were measured in circulating CD4 Thymic output, represented by numbers of CD31-expressing naive T cells, showed an age-related decline in patients with MetS. MetS significantly enhanced CD8 In obese patients, MetS results in attrition of RTL and accelerated T-cell differentiation. Bariatric surgery temporarily reverses these effects. These data suggest that MetS is a risk factor for accelerated aging of T cells and that MetS should be a more prominent factor in the decision making for eligibility for bariatric surgery.

The histone-like DNA-binding proteins (HU) serve as model molecules for protein thermostability studies, as they function in different bacteria that grow in a wide range of temperatures and show sequence diversity under a common fold. In this work, we report the cloning of the hutth gene from Thermus thermophilus, the purification and crystallization of the recombinant HUTth protein, as well as its X-ray structure determination at 1.7 Å. Detailed structural and thermodynamic analyses were performed towards the understanding of the thermostability mechanism. The interaction of HUTth protein with plasmid DNA in solution has been determined for the first time with MST. Sequence conservation of an exclusively thermophilic order like Thermales, when compared to a predominantly mesophilic order (Deinococcales), should be subject, to some extent, to thermostability-related evolutionary pressure. This hypothesis was used to guide our bioinformatics and evolutionary studies. We discuss the impact of thermostability adaptation on the structure of HU proteins, based on the detailed evolutionary analysis of the Deinococcus–Thermus phylum, where HUTth belongs. Furthermore, we propose a novel method of engineering thermostable proteins, by combining consensus-based design with ancestral sequence reconstruction. Finally, through the structure of HUTth, we are able to examine the validity of these predictions. Our approach represents a significant advancement, as it explores for the first time the potential of ancestral sequence reconstruction in the divergence between a thermophilic and a mainly mesophilic taxon, combined with consensus-based engineering. © 2016, Springer Japan.

Als onderdeel van het integrale milieu-model EXPECT is een module ontwikkeld voor berekeningen van veranderingen in grondwaterstand en kwel, die het gevolg zijn van wijzigingen in grondwateronttrekking. Deze module is opgebouwd uit lineaire ingreep-effect relaties tussen het onttrekkingsdebiet van een pompput en de effecten op de grondwaterstand en kwelflux. De relaties zijn afgeleid uit berekeningsresultaten van het Landelijk Grondwater Model (LGM). De ingreep-effect relaties zijn afgeleid voor alle 1*1 km gridcellen waarop een onttrekking van invloed is. Effecten van verschillende onttrekkingen op een gridcel worden gesommeerd. Omdat in het LGM de relatie tussen stijghoogte in de bovenste aquifer en flux naar het oppervlakte water niet-lineair gemodelleerd is, zullen lineaire ingreep-effect relaties slechts een benadering zijn van de resultaten van LGM. Om een indruk te krijgen van de nauwkeurigheid van de voorspellingen op grond van de lineaire regressiefuncties is per gridcell de ratio berekend tussen de door het model verklaarde variantie en de totale variantie. Om een indruk te krijgen van de verschillen in uitkomst tussen de grondwatermodule en LGM zijn verscheidene onttrekkings-scenario's zowel met LGM als met de EXPECT-grondwatermodule doorgerekend en zijn de resultaten vergeleken.De conclusie is dat zolang geen onttrekkings-scenarios worden gekozen met onttrekkingsdebieten groter dan de scenarios gepresenteerd in hoofdstuk 4, de grondwatermodule een goede benadering van LGM resultaten levert.

Het doel van deze studie was de kartering van de grasbedekking in Nederlandse heideterreinen, gebruik makend van Landsat-TM satellietbeelden. Deze grasbedekkingsgegevens dienen voor de initialisatie van het HEATHSOL-model. Dit model voorspelt de biomassa van heide- en grassoorten in heideterreinen onder invloed van stikstofdepositie vanuit de atmosfeer. Er is gebruik gemaakt van twee satellietbeelden van 7 september 1993. Om de beelden te kunnen ijken is veldwerk verricht in de Dwingelose heide en Strabrechtse heide. Hierbij zijn bedekkingen door heide en gras in het veld gemeten. De ijking en de daarop volgende voorspelling van bedekkingspercentages is uitgevoerd met de MICROFIND software, onderdeel van het HEIMON heidemonitoringsysteem dat door K&M geexploiteerd wordt. MICROFIND voorspelt met behulp van multivariate lineaire regressietechnieken bedekkingen van heide, gras en kale bodem voor oppervlakten ter grootte van het Landsat pixel: 30x30 m. Om heideterreinen uit deze beelden te kunnen isoleren is het thema Heide van de gedigitaliseerde topografische kaart 1:50.000 gebruikt. Binnen deze selectie zijn niet-relevante bedekkingstypen (bossen, vennen, wegen en paden, e.d.) verwijderd. Duinheide en hele kleine terreintjes zijn buiten beschouwing gelaten. Bovendien werden een aantal terreinen in het oosten van het land niet door de satelietbeelden bedekt. Uiteindelijk is over zo'n 24.000 ha een uitspraak gedaan. Uit de analyse bleek 45% van het onderzochte gebied bedekt te zijn met gras, waarbij de hogere bedekkingen meer naar het zuiden toe voorkwamen. Deze kartering, de derde na eerdere karteringen in 1986 en 1989, werd bemoeilijkt door de aanwezigheid van sluierbewolking in het zuidelijke beeld. Als gevolg hiervan kunnen de voorspellingen voor een deel van het zuidelijke beeld minder betrouwbaar zijn. De gemiddelde voorspellingsnauwkeuringheid van de grasbedekking van een individueel pixel bleek in overeenstemming te zijn met die van eerdere karteringen:+- 10% wanneer de modellen worden toegepast op het terrein waarin de veldgegevens zijn verzameld, tot +- 30% als er wordt geextrapoleerd naar andere terreinen.

niet beschikbaar

niet beschikbaar

niet beschikbaar

Het doel van het onderzoek was het effect te berekenen van een verandering van de ruimtelijke ligging van de EHS en de landbouwgebieden in Noord Nederland op de ammoniakemissies uit de landbouw en de kwaliteit van de natuur. De analyse heeft plaatsgevonden door gebruik te maken van (vereenvoudigde) modellen als de Source Receptor Matrix (SRM; een matrix vermenigvuldiging om vanuit emissies deposities te berekenen) en de Natuurplanner en door GIS-bewerkingen. De emissies en de daaruit berekende ammoniakdeposities zijn ten opzichte van de overige provincies laag. De drie scenario's zoals die hier zijn doorgerekend, voldoen aan de doelstelling van 1400 mol zuurdepositie/ha.jr in het jaar 2010 en zitten daar op sommige plaatsen zelfs ruim onder. Dit betekent dat alle drie scenario's in principe goede mogelijkheden bieden voor de realisatie van hoge natuurwaarden, op locaties waar op dit moment verzuring of vermesting het belangrijkste probleem is. In het algemeen geldt dat de natuurwaarden in de drie noordelijke provincies hoog zijn, onafhankelijk van het gewenste scenario. Op detailniveau blijkt het ruimtelijk beeld Raamwerk (grootschalige scheiding van natuur en landbouw) in het algemeen iets hogere natuurwaarden te behalen dan Weefwerk en Marktwerk. In Weefwerk (natuur als nevenfunctie van menselijk gebruik) wordt dit vooral veroorzaakt door de ruime inzet van licht-bemeste graslanden waar, door de bemesting , geen hoge natuurwaarden behaald kunnen worden. Bij Marktwerk zijn, als gevolg van de centrale rol van de marktwerking, de iets hogere deposities en de sterk versnipperde ligging van natuurgebieden de belangrijkste oorzaken van een wat lager gerealiseerde natuurwaarde.

niet beschikbaar

International audience