Hizume, Masahiro, Shibata, Fukashi, Matsumoto, Ayako, Maruyama, Yukie, Hayashi, Eiji, Kondo, Teiji, Kondo, Katsuhiko, Zhang, Shozo, and Hong, Deyuan
Repetitive DNA was cloned from HindIII-digested genomic DNA of Larix leptolepis. The repetitive DNA was about 170 bp long, had an AT content of 67%, and was organized tandemly in the genome. Using fluorescence in situ hybridization and subsequent DAPI banding, the repetitive DNA was localized in DAPI bands at the proximal region of one arm of chromosomes in L. leptolepis and Larix chinensis. Southern blot hybridization to genomic DNA of seven species and five varieties probed with cloned repetitive DNA showed that the repetitive DNA family was present in a tandem organization in genomes of all Larix taxa examined. In addition to the 170-bp sequence, a 220-bp sequence belonging to the same DNA family was also present in 10 taxa. The 220-bp repeat unit was a partial duplication of the 170-bp repeat unit. The 220-bp repeat unit was more abundant in L. chinensis and Larix potaninii var. macrocarpa than in other taxa. The repetitive DNA composed 2.0–3.4% of the genome in most taxa and 0.3 and 0.5% of the genome in L. chinensis and L. potaninii var. macrocarpa, respectively. The unique distribution of the 220-bp repeat unit in Larix indicates the close relationship of these two species. In the family Pinaceae, the LPD (Larix proximal DAPI band specific repeat sequence family) family sequence is widely distributed, but their amount is very small except in the genus Larix. The abundant LPD family in Larix will occur after its speciation.Key words: AT-rich tandem repetitive DNA, fluorescence in situ hybridization, Larix, proximal DAPI band.Un ADN répétitif a été cloné suite à la digestion de l'ADN génomique du Larix leptolepis à l'aide de l'enzyme HindIII. Cet ADN répétitif mesure environ 170 pb, a un contenu en AT de 67 % et il est répété en tandem dans le génome. Par hybridation in situ en fluorescence et coloration subséquente au DAPI, cet ADN répétitif a été localisé dans les régions colorées au DAPI à l'extrémité proximale d'un bras des chromosomes chez le L. leptolepis et chez le Larix chinensis. Une analyse Southern sur l'ADN génomique de sept espèces et de cinq variétés avec l'ADN répétitif comme sonde a révélé que cette famille de séquences d'ADN était répétée en tandem chez toutes les espèces examinées au sein du genre Larix. En plus de cette séquence de 170 pb, une séquence de 220 pb appartenant à la même famille de séquences était présente chez dix taxons. Le monomère de 220 pb résulte d'une duplication partielle du monomère de 170 pb. L'ADN répété de 220 pb était plus abondant chez le L. chinensis et chez le Larix potaninii var. macrocarpa que chez les autres taxons. Cet ADN répétitif constituait 2,0 à 3,4 % du génome chez la plupart des taxons, mais seulement 0,3 à 0,5 % du génome chez le L. chinensis et le L. potaninii var. macrocarpa, respectivement. La distribution unique du monomère de 220 pb au sein du genre Larix indique une proche parenté entre ces deux espèces. Chez les pinacées, les séquences de la famille LPD sont largement distribuées, mais elles sont présentes en faible quantité sauf chez le genre Larix. La famille de séquences LPD, abondante chez le genre Larix, serait survenue après la spéciation chez le genre Larix.Mots clés : ADN répété en tandem et riche en AT, hybridation in situ en fluorescence, Larix, bande DAPI proximale.[Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]