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Introducción: Tener un mayor conocimiento del inicio de la carcinogénesis a nivel molecular es esencial para definir nuevos biomarcadores que mejoren el diagnóstico, tratamiento y pronóstico del paciente. Objetivos: Definir un protocolo bioinformático para evaluar el proceso mutacional asociado a la evolución carcinogénica del melanoma. Método: Se secuenciaron 46 genes clave en la carcinogénesis en 45 muestras cutáneas procedentes de 15 bloques tumorales de distintos pacientes. De cada bloque, se biopsiaron muestras de piel sana, nevus y melanoma. Tras procesar los datos de secuenciación filtrando las variantes germinales y los artefactos técnicos, se analizó el perfil mutacional y los signos de selección positiva en cada estadio. Los análisis bioinformáticos se realizaron con el software R. Resultados: El 73% de las lesiones precursoras se inician por la adquisición de una mutación oncogénica en BRAF (V600E). Esta alteración parece estar positivamente seleccionada en estadios tempranos de la carcinogénesis. Sin embargo, la inactivación del gen supresor tumoral CDKN2A parece ocurrir exclusivamente en melanomas, siendo una alteración genética seleccionada en la progresión maligna de las lesiones preneoplásicas. La firma mutacional procedente de la RUV (SBS7) es el principal causante de la acumulación de mutaciones somáticas en ambos estadios neoplásicos. Conclusiones: En el nevus y melanoma se observa la firma mutacional relacionada con la radiación ultravioleta demostrando así su efecto mutagénico ya en el estadio preneoplásico. Para la aparición de un melanoma, es necesaria la selección de clones portadores de mutaciones que favorezcan la proliferación celular y que permitan escapar al control del ciclo celular. Introduction: A greater knowledge of the onset of the molecular genetics in carcinogenesis is essential to define new biomarkers that improve the diagnosis, treatment and prognosis of the patient. Objectives: To define a bioinformatic protocol to evaluate the mutational process involved in the carcinogenic evolution of melanoma. Method: We sequenced 46 cancer-relevant genes in 45 skin samples from 15 tumor blocks from different patients. Samples of healthy skin, nevus and melanoma were biopsied from each block. After processing the sequencing data by filtering the germinal variants and technical artifacts, the mutation profile and signs of positive selection at each stage were analyzed. The bioinformatic analysis was performed using the software R. Results: 73% of precursor lesions are initiated by the acquisition of an oncogenic mutation in BRAF (V600E). This mutation appears to be positively selected in early stages of carcinogenesis. However, inactivation of the tumor-suppressor gene CDKN2A appears to emerge exclusively in melanomas as a result of cancer gene selection in the malignant progression of preneoplastic lesions. The mutational signature from ultraviolet radiation (SBS7) is the main cause of the accumulation of somatic mutations in both neoplastic stages. Conclusions: In nevus and melanoma, the mutational signature related to ultraviolet radiation is observed, thus demonstrating its mutagenic effect already in the preneoplastic stage. For the progression of a melanoma is necessary the selection of clones that carry mutations that favor cell proliferation and allow escaping the control of the cell cycle.

This contains Tables S1–S3 and Figures S1–S2. Table S1. List of 363 successfully genotyped SNPs, Minor allele frequencies for all samples, males and females, and HWE P value. Table S2. List of SNPs associated with pigmentation traits in females and males. Table S3. List of SNPs associated with sun response traits in females and males. Figure S1. Comparison of minor allele frequencies, female versus male individuals. Figure S2. A selection of genetic factors affecting pigmentation and sun sensitivity in humans. (PDF 417 kb)

Póster presentado al 18th Meeting of the European Society for Pigment Cell Research Lisbon, Portugal | 9–12 September 2013. Abstract publicado en: Pigment Cell & Melanoma Research 26(5): E1-E31, MC1R, the main genetic contributor to sporadic melanoma predisposition, is highly polymorphic in white populations. In this study, 41 MC1R variants detected in the Spanish population were mapped in a three-dimensional structure prediction model of the MC1R protein. Among these variants, 31 were rarely found, being Y298H described for the first time in our population. A total of 25 variants appeared to have structural implications including the functional traditionally-associated red and non red hair colour variants (RHC/NRHC) and a novel group of potentiallyfunctional rare variants. Evaluation of all changes according to the MC1R structure model, variant location and nature of the amino acid change, suggests three different putatively-functional MC1R regions: the GTPase signalling region, an alleged a-MSH-binding extracellular region, and a novel central core protein region. Firstly, the 3D model shows the GTPase signalling region which includes most of the well known functional RHC/NRHC variants, though with no apparent structural consequences. The second region shows an extracellular cluster of rare variants predicted to have no structural implications, although they may be potentially important for protein function due to their location in the putative a-MSH-binding site. Finally, an internal core with predicted lossof-function changes harvesting both some RHC/NHRC and rare variants is described for the first time. Furthermore, the ensuing outcomes of this MC1R variant modelling were highly consistent with data from previously published functional MC1R studies. Overall, we believe that this approach is more informative and could further evaluate the implication of different changes

Treball Final de Grau en Medicina. Codi: MD1158. Curs acadèmic: 2017/2018 Introduction: The expression of the PDZK1 gene has s een to be increased in melasma via t he action of estrogens, causing an increase in the activity of tyrosinase and the synthesis of melanin. The aim of this study is to determine the expression and genetic variability of the PDZK1 gene in normal skin and its role in human pigmentation. Metho dology: We analyzed the expression of the PDZK1 gene and the genotype of 8 genetic variants of PDZK1 in 90 skin biopsies. Information on pigmentation traits and solar sensitivity was coll ected through a questionnaire in 90 volunteers. Results: The results show that there are differences in the level of expression of PDZK1 according to the zone of the skin analyzed, a chronically or intermittently photoexposed zone (p - value = 0.0023), and according to the sex of the individuals (p - value = 0.021). The varian t rs11576685 * C of PDZK1 seems to increase the basal expression of the gene (p - value = 0.03), a nd shows an association with dark skin colo u r (p - value = 0.02). Conclusion: The results of this study show that there are differences in expression of the PDZK 1 gene that are influenced by sun exposure and by genetic factors, and not only by hormonal factors as seen previously. Introducción: La expresión del gen PDZK1 se ha visto aumentada en melasma vía la acción de los estrógenos, provocando un incremento de la actividad de la tirosinasa y la síntesis de m elanina. En este estudio se pretende conocer la expresión y variabilidad genética del gen PDZK1 en piel normal y su papel en la pigmentación humana. Metodología: Se analizó la expresión del gen PDZK1 y el genotipo de 8 variantes genéticas de PDZK1 en 90 biopsias cutáneas. Se recogió información sobre los rasgos de pigmentación y sensibilidad solar mediante un cuest ionario en los 90 voluntarios . Resultados: Los resultados muestran que existen diferencias en el nivel de expresión de PDZK1 dependiendo de si la muestra procedía de una zona crónicamente o intermitentemente fotoexpu esta (p - valor = 0.0023), y dependiendo d el sexo de los individuos (p - valor = 0.021). La variante rs11576685*C de PDZK1 parece incrementar la expresión basal del gen (p - valor = 0.03 ), y muestra una asociación con el color de piel oscuro (p - valor = 0.02). Conclusión: Los resultados de este estudio evidencian que existen diferencias de expresión del gen PDZK1 que están influenciadas por la exposición solar y por factores genéticos, y no solo por factores hormonales como se había visto anteriormente.

Treball Final de Grau en Medicina. Codi: MD1158. Curs acadèmic: 2017/2018 INTRODUCTION: P redisposition to skin cancer is influenced by genet ic and environmental factors. Ultraviolet radiation damages the DNA of epidermal cells. The progressive accumulation of somatic mutations can lead to cancer. Understanding how somatic mutations are accumulated in normal cells is essential to know the early stages of skin cancer development. OBJECTIVES: To analyze the accumul ated somatic mutations in normal skin according to photoexposure pattern, history of sun exposure, phototype, age and genotype of the MC1R gene . METHODS: DNA from 25 normal skin biopsies was obtained. By means of target ed sequencing, accumulated somatic mutations in 47 key genes in the tumoral proce ss were detected. T he coding region of MC1R was sequenced. All phenotypic data of pigmentation and solar sensitivity were collected through a standardized questionnaire. T he c umulative mutational rate between samples was compared using the SPSS v25 program. RESULTS: There is a positive correlation between age and cumulative sun exposure and the frequency of somat ic mutations in normal epidermis . Individuals with deleterious va riants of MC1R do not seem to accumulate more mutations. CONCLUSIONS: P hotoexposure history and MC1R genotype could increase the p redisposition to skin cancer through a greater accumulation of somatic mutations in pre neoplastic states. INTRODUCCIÓN: La predisposición a cáncer de piel está influenciada por factores genéticos y ambientales. La radia ción ultravioleta daña el ADN de las células epidérmicas. La acumulación progresiva de mutaciones somáticas puede llevar al cáncer. Entender có mo las mutaciones somáticas se acum ulan en células normales es fundamental para conocer las etapas inicia les del desarrollo del cáncer cutáneo. OBJETIVOS: Analizar las mutaciones somáticas acumuladas en piel normal se gún patrón de fotoexposición, historia de exposición solar, fototipo, edad y genotipo de MC1R . MÉTODOS: Se obtuvo ADN de 25 biopsias de piel normal . Mediante secuenciación dirigida, se detectaron las mutaciones somáticas acumuladas en 47 genes clave en el proceso tumoral. S e secuenció la regi ón codificante de MC1R . Los datos fenotípicos de pigmentación y sensibilidad solar se recogieron mediante un cuestionario estandarizado. La tasa muta cional acumulada entre muestras se comparó utilizando el programa SPSS v25. RESULTADOS: Existe una correlación positiva entre la edad y la exposición solar acumulada con la frecuencia de mu taciones somáticas en epid ermis normal. Los individuos con variantes deletéreas de MC1R no parecen acumular más mutaciones . CONCLUSIONES: La historia de fotoexposición y el genotipo de MC1R podría n incrementar la predisposición a cáncer cutáneo mediante una mayor acumulación de mutaciones somáticas en estados pre neoplásicos.