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Submitted by Paula Guerreiro (passarinho@reitoria.ulisboa.pt) on 2020-12-21T14:50:50Z No. of bitstreams: 1 ULSD898985_td_Maria_Carvalho.pdf: 1965956 bytes, checksum: 1b3bc41a99f698205878fae0de7cc049 (MD5) Made available in DSpace on 2020-12-30T11:15:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ULSD898985_td_Maria_Carvalho.pdf: 1965956 bytes, checksum: 1b3bc41a99f698205878fae0de7cc049 (MD5) Previous issue date: 2020-07

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar (Ecologia Marinha), 31 de março de 2022, Universidade dos Açores. As baleias comum (Balaenoptera physalus), azul (B. musculus) e sardinheira (B. borealis) produzem vocalizações de baixa frequência e grande amplitude que podem ser repetidas num padrão regular, formando canções, ou produzidas de forma irregular, como vocalizações individuais ou em grupo. As canções são produzidas por machos, sobretudo na época de acasalamento, e acredita-se serem usadas como exibições reprodutivas, enquanto as vocalizações irregulares podem ter varias funções associadas a contextos sociais e de alimentação. As técnicas de acústica passiva permitem monitorizar áreas remotas por longos períodos de tempo, possibilitando o estudo dos padrões temporais e espaciais das vocalizações, assim com as suas funções, e elucidando aspetos essenciais da biologia e ecologia destas espécies com elevada mobilidade e elusivas, que de outra maneira seria difícil ou impossível obter. O objetivo principal desta tese é investigar o comportamento vocal das baleias comum, azul e sardinheira (com um foco especial na baleia comum), para adquirir um melhor conhecimento da sua ecologia e comportamento durante a migração, a fase menos conhecida do seu ciclo de vida. Este estudo também investiga os níveis de ruído produzido pelo tráfego marinho em relação ao comportamento vocal destas três espécies, e discute as implicações potenciais para o seu comportamento migratório. […]. ABSTRACT: Fin (Balaenoptera physalus), blue (B. musculus) and sei whales (B. borealis) produce very low frequency and high amplitude vocalisations that can be regularly repeated as songs or irregularly produced as single or grouped calls. While songs are produced by males, peak during the mating season and are believed to act as reproductive displays, calls may have multiple functions associated to feeding and social contexts. By using passive acoustic techniques, that allow long-term continuous monitoring of remote areas, the study of temporal and spatial patterns of vocalisations as well as their functions can elucidate important aspects of the biology and ecology of these highly mobile and elusive species that would otherwise be difficult or impossible to obtain. The main goal of this dissertation is to investigate the vocal behaviour of fin, blue and sei whales (with a special focus on the fin whale), to contribute to a better understanding of their ecology and behaviour during migration, the least known phase of their annual life cycle. This study also investigates shipping noise levels in relation to the vocal behaviour of these three species and discusses potential implications for their migratory behaviour. […]. This thesis was supported by the doctoral grant M3.1.a/F/028/2015 from the Fundo Regional da Ciência e Tecnologia (FRCT). The research stay was funded by the grant FC/FLAD/FMF/CND1/2017/002 of the “Programa Fundo de Mobilidade FLAD-UAc - Crossing the Atlantic”. And co-funded by the following research projects and institutions: TRACE (PTDC/MAR/74071/2006) MAPCET (M2.1.2/F/012/2011) AWARENESS (PTDC/BIA-BMA/30514/2017) MOVE-ON (IF/00943/2013/CP1199/CT0001).

Mestrado em Ecologia Aplicada Submitted by Patrícia Correia (patriciacorreia@ua.pt) on 2015-12-04T15:57:13Z No. of bitstreams: 1 Red and roe deer densities and distribution in northeastern Portugal.pdf: 1222634 bytes, checksum: dc618a07413306ab19f853fb3a3d80b2 (MD5) Made available in DSpace on 2015-12-04T15:57:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Red and roe deer densities and distribution in northeastern Portugal.pdf: 1222634 bytes, checksum: dc618a07413306ab19f853fb3a3d80b2 (MD5) Previous issue date: 2014

Mestrado em Ecologia Aplicada Monitoring ungulates is a major challenge to perform management strategies, either back in the 70’s to enable their conservation that lead to their great recovery, as to manage their actual expansion. Their current wide range distribution and high den-sities across Europe promotes damages in ecosystems that need to be handled based on scientific knowledge. In Portugal ungulate monitoring and ecology is still in an early stage, however efforts have been made to gather valid information on north-eastern ungulate populations. In this work density of red and roe deer were estimated coupling line transects to perform pellet group counts with a distance sampling ap-proach. The density of red deer estimated for Montesinho Natural Park (MNP) was 3.05 ind./100 ha (95% CI: 2.05 – 4.54), splitted in two sub-areas: Serra de Mon-tesinho (SM) with 1.23 ind./100 ha and Lombada National Hunting Area (LNHA) with 5.23 ind./100 ha. Roe deer densities were estimated with recourse to a spatial methodology recently developed, the Density Surface Models (DSMs – with a dis-tance sampling framework), which enables the assessment of the relationships be-tween animal’s density and spatial variables selected according to species ecological requirements. As well roe deer densities were estimated for MNP and Serra da Nogueira (SN) with a global density of 3.01 ind./100 ha (95% CI: 2.34 – 3.87): SM with 3.74 ind./100 ha, LNHA with 1.59 ind./100 ha and SN with 3.62 ind./100ha. Furthermore this approach enables the drawing of an abundance distribution map across the study area, especially useful when communicating results to wildlife man-agers. Roe deer densities showed to increase as distance to roads increased, while surprisingly shown an increase as distance to human populations decreased. As ex-pected, cover areas shown its importance for roe deer, a prey species for Iberian wolf. The spatial analysis confirmed that DSMs represent a good approach to estimate ungulate densities, and should be encouraged in future works. Future studies are mandatory to assess red and roe deer ecological requirements and evaluate trends over the years, in order to stablish management plans to handle the damages caused by these species. A monitorização de ungulados constitui um passo essencial no desenvolvimento de estratégias de gestão. Desde os anos 70, quando os esforços para a conservação e gestão destas espécies permitiram a sua expansão, até aos dias de hoje, a gestão de habitats e espécies tem tido um papel central na ecologia. A ampla distribuição atual dos ungulados selvagens e as suas elevadas abundâncias na Europa provocam danos nos ecossistemas, que têm que ser geridos com base em conhecimento científico. Em Portugal a monitorização das populações de ungulados, bem como o estudo da sua ecologia encontra-se ainda numa fase inicial, no entanto têm sido desenvolvidos avanços significativos no conhecimento das populações de ungulados no nordeste transmontano. Neste trabalho foram estimadas densidades de veado e corço através do distance sampling aplicado a transectos lineares com contagem de excrementos. A densidade de veado no Parque Natural de Montesinho (PNM) foi de 3.05 ind./100 ha (IC a 95%: 2.05 – 4.54) dividido em duas sub-áreas: Serra de Montesinho (SM) com 1.23 ind./100 ha e Lombada National Hunting Area (LNHA) com 5.23 ind./100 ha. As densidades de corço foram estimadas com recurso a uma metodologia espa-cial desenvolvida recentemente, os Density Surface Models (DSMs – baseados no distance sampling) que permitem relacionar as densidades populacionais com as va-riáveis espaciais escolhidas de acordo com a ecologia da espécie. As densidades de corço foram estimadas para o PNM e para a Serra da Nogueira (SN) apresentando uma densidade global de 3.01 ind./100 ha (IC a 95%: 2.34 – 3.87): SM com 3.74 ind./100 ha, LNHA com 1.59 ind./100 ha e SN com 3.62 ind./100 ha. Adicional-mente este método permite construir um mapa de distribuição de abundâncias ao longo da área de estudo, o que é particularmente útil ao comunicar os resultados aos responsáveis pela gestão das áreas protegidas. Do ponto de vista ecológico, as den-sidades de corço aumentaram à medida que a distância às estradas aumentou, mos-trando, surpreendentemente, uma redução na densidade à medida que a distância às populações humanas aumentou. Tratando-se de uma espécie-presa do lobo-ibérico, as áreas de abrigo revelaram-se importantes para o corço. A análise espacial confir-mou que os DSMs são um método robusto para estimar densidades de ungulados e analisar a sua ecologia. Estudos futuros são essenciais para identificar as necessida-des ecológicas do veado e do corço, bem como para avaliar oscilações nas densida-des ao longo dos anos, para que seja possível estabelecer planos de gestão que per-mitam mitigar os danos causados por estas espécies.