Aim Variation in the structure of shallow subtidal invertebrate assemblages was examined over three spatial scales; within reef, between reef and between continents. We sought to provide a context from which to examine and interpret ecological processes between continents. In addition, we predicted that variation in pattern would increase as the scale of examination increased. Location Reefs near Wollongong and within Jervis Bay in south-eastern Australia and Mediterranean reefs on the Costa Brava (Catalonia), north-eastern Spain. Methods We compared assemblages on vertical rock walls of two heights – short ( 3 m) in two temperate regions over the same depth range. Specifically we examined the diversity and cover of invertebrates, the cover and biomass of foliose and crustose algae, the size of invertebrate colonies and the biomass of urchins on short and tall walls (n = 3) at each of two locations in each country. Results Foliose algae dominated rock walls in Spain and although invertebrate cover was high, colonies were generally very small. Two urchin species were commonly encountered on rock walls in Spain, Arbacia lixula and Paracentrotus lividus; their biomass was relatively low and did not differ significantly between short and tall walls. These findings contrasted strongly with south-eastern Australia, where foliose algae were almost completely absent. A single urchin species, Centrostephanus rodgersii occurred with extremely high biomass on short walls, which were dominated by grazer-resistant crustose calcareous algae. In contrast, the biomass of this urchin was low on tall walls, which were dominated by invertebrates, usually exceeding 95% in cover. Invertebrate colonies were significantly larger on both short and tall walls in south-eastern Australia relative to the Mediterranean. Findings within a country were consistent between the replicate rock walls and between locations. In contrast to our prediction, however, there was significant variation among walls within a location, but not among locations within a continent. Temporal variation in the structure of these assemblages was not examined, but appears limited. Main conclusions We conclude that submarine topography, i.e. the presence of short or tall rock walls, as a function of rock type and structure, has a marked impact on community structure in south-eastern Australia, but made little difference to the structure of the assemblage in Mediterranean Spain. The differences in structure we observed between walls of different heights in Australia were correlated with differences in the biomass of urchins and they appear to be major determinants of assemblage structure. Interactions among species are often reported from disparate parts of the globe with little or no reference to the structure of the assemblage of which they are a part; we contend that this will hinder interpretation. Our data are consistent with the organisms in these two regions experiencing distinct selection pressures; for example high levels of urchin grazing activity in south-eastern Australia, and shading and whiplash associated with an algal canopy in the Mediterranean. It may not be appropriate to contrast processes operating at very large (intercontinental) scales unless context can be established with a clear understanding of ecological pattern. Objectivos En el presente trabajo hemos examinado la variacion en estructura de comunidades de invertebrados de aguas someras a tres escalas espaciales: dentro de arrecifes rocosos, entre arrecifes y entre continentes. Nuestro objetivo era proveer un contexto para examinar y interpretar procesos ecologicos entre continentes. Ademas, realizamos la prediccion de que el modelo de variacion aumentaria conforme aumentaba la escala de observacion. Localidad Arrecifes rocosos cerca de Wollongong y en Jarvis Bay en la zona sudeste de Australia y arrecifes rocosos mediterraneos en la Costa Brava (Cataluna), en el nordeste de Espana. Metodos Comparamos comunidades en paredes rocosas verticales de dos alturas – bajas ( 3 m) en dos regiones templadas y dentro del mismo rango de profundidades. Especificamente, examinamos la diversidad y el recubrimiento de invertebrados, el recubrimiento y la biomasa de algas foliosas e incrustantes, la medida de las colonias de invertebrados y la biomasa de erizos en paredes bajas y altas (n = 3) en dos localidades de cada pais. Resultados Las algas foliosas dominaban las paredes rocosas en Espana y, aunque el recubrimiento de invertebrados era alto, las colonias eran generalmente muy pequenas. Dos especies de erizos eran comunes en las paredes rocosas en Espana: Arbacia lixula y Paracentrotus lividus. Su biomasa total era relativamente pequena y no mostraba diferencias significativas entre paredes bajas y altas. Estos resultados contrastan con los hallados en el sudeste de Australia, donde las algas foliosas eran practicamente ausentes. Una unica especie de erizo, Centrostephanus rodgersii, se encontraba en las paredes bajas, donde presentaba elevadas biomasas. Estas paredes estaban dominadas por algas incrustantes y carbonatadas resistentes al ramoneo por erizos. En cambio, la biomasa de este erizo era baja en paredes altas, que estaban dominadas por invertebrados, con recubrimientos normalmente por encima del 95%. Las colonias de invertebrados eran significativamente mas grandes tanto en las paredes altas como bajas en el sudeste de Australia en comparacion con el Mediterraneo. Los resultados dentro de cada pais eran consistentes entre las replicas de paredes estudiadas y entre localidades. Contrariamente a nuestra prediccion, sin embargo, habia una variacion significativa entre paredes dentro de una localidad pero no entre localidades dentro de un continente. La variacion temporal en estructura en estas comunidades no fue estudiada, pero parece ser limitada. Conclusiones Principales Concluimos que la topografia submarina, esto es, la presencia de paredes bajas o altas en funcion del tipo de roca y estructura, tiene un efecto importante en la estructura de las comunidades en el sudeste de Australia. Este factor, sin embargo, tiene un efecto muy limitado en el Mediterraneo espanol. Las diferencias en estructura observadas entre paredes de diferentes alturas en Australia se correlacionan con diferencias en la biomasa de erizos, los cuales parecen ser determinantes en la estructura de las comunidades. Frecuentemente se estudian interacciones entre especies en zonas alejadas del globo con escasa o nula referencia a la estructura de la comunidad de la que forman parte. En nuestra opinion este hecho impide una correcta interpretacion. Nuestros datos son consistentes con la idea de que los organismos en las dos regiones estudiadas experimentan diversas presiones selectivas, por ejemplo, niveles altos de ramoneo por erizos en el sudeste de Australia, y oscurecimiento y disturbancia mecanica asociadas a la cobertura de algas en el Mediterraneo. No parece apropiado comparar procesos que operan a escalas muy amplias (intercontinentales) sin establecer antes un contexto con una comprension clara de los parametros ecologicos.