A participação do sistema de histocompatibilidade humano (HLA: human leukocyte antigens) na patogênese das doenças auto-imunes é bem conhecida. Situado no braço curto do cromossomo 6, o sistema HLA se destaca por seu polimorfismo e por sua capacidade de conferir susceptibilidade ou proteção a diferentes enfermidades. Em Dermatologia, esse sistema desempenha papel importante na patogenia e história natural de várias doenças. A força e o tipo de associação variam com a dermatose e, algumas vezes, com o grupo étnico-racial estudado. O surgimento de métodos moleculares para tipificação dos alelos HLA e as recentes atualizações de sua nomenclatura têm contribuído para o melhor entendimento desse sistema. Infelizmente, essas informações não têm sido veiculadas de maneira adequada na literatura clínica, o que dificulta o entendimento da associação do HLA com as doenças cutâneas. Nesta revisão, são discutidos alguns aspectos do sistema HLA, métodos de detecção, nomenclatura e sua associação com vitiligo, pênfigo, psoríase, lúpus eritematoso, escabiose, leishmaniose cutânea, hanseníase, paracoccidioidomicose e dermatite atópica. The participation of the human histocompatibility system (HLA: human leukocyte antigens) in the pathogenesis of autoimmune diseases is well known. Situated on the short arm of chromosome 6, the HLA system is very polymorphic and has the capacity to confer susceptibility or resistance to different diseases. In Dermatology, this system has an important participation in the pathogenesis and natural course of various diseases. The strength and type of association differ with conditions and sometimes with the ethnic-racial group studied. The discovery of molecular methods to typify HLA alleles and recent updates in its nomenclature has contributed to a better understanding of this system. Unfortunately, this information has not been adequately transmitted in the literature, hindering identification of the association of the HLA with skin diseases. In this review, some aspects of the HLA system are discussed, such as methods of detection, nomenclature and association with vitiligo, pemphigus, psoriasis, lupus erythematosus, scabies, cutaneous Leishmaniasis, leprosy, paracoccidiodomycosis and atopic dermatitis.