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En Costa Rica el cultivo de fresa es importante debido a la generación de empleos en zonas rurales; sin embargo, se ha visto afectado por patógenos fúngicos que han provocado reducciones en el área sembrada. El hongo Fusarium oxysporum está asociado a la marchitez y colapso de plantas, por lo que se probó la eficacia biológica in vitro de los fungicidas benomil y folpet, en tres concentraciones, para determinar si es posible su uso como alternativa de combate. La investigación se realizó en el Laboratorio de Fitopatología de la Estación Experimental Agrícola Fabio Baudrit Moreno, Alajuela, Costa Rica en el año 2021. Por medio de la técnica de alimento envenenado, se compararon los diámetros de crecimiento del micelio de tres cepas del hongo, expuestos por quintuplicado, a la dosis comercial, la décima y centésima parte de esta; así como a un tratamiento sin fungicida. Luego se calculó el porcentaje de inhibición del crecimiento provocado por cada dosis. El benomil mostró 100% de inhibición en todas las dosis para las tres cepas; mientras que el folpet, alcanzó un máximo de 60% en la dosis comercial. De acuerdo con los resultados, las cepas de F. oxysporum aisladas de plantas de fresa con síntomas de marchitez, responden de forma diferencial al benomil y al folpet.

Aims The American leaf spot, caused by Mycena citricolor, is an important disease of coffee (Coffea arabica), mostly in Central America. Currently, there are limited pathogen control alternatives that are environment friendly and economically accessible. The use of fungi isolated from the plant endomycobiota in their native habitats is on the rise because studies show their great potential for biological control. To begin to generate a green alternative to control M. citricolor, the objectives of the present study were to (i) collect, identify, screen (in vitro and in planta), and select endophytic fungi from wild Rubiaceae collected in old-growth forests of Costa Rica; (ii) confirm endophytic colonization in coffee plantlets; (iii) evaluate the effects of the endophytes on plantlet development; and (iv) corroborate the antagonistic ability in planta. Methods and results Through in vitro and in planta antagonism assays, we found that out of the selected isolates (i.e. Daldinia eschscholzii GU11N, Nectria pseudotrichia GUHN1, Purpureocillium aff. lilacinum CT24, Sarocladium aff. kiliense CT25, Trichoderma rifaii CT5, T. aff. crassum G1C, T. aff. atroviride G7T, T. aff. strigosellum GU12, and Xylaria multiplex GU14T), Trichoderma spp. produced the highest growth inhibition percentages in vitro. Trichoderma isolates CT5 and G1C were then tested in planta using Coffea arabica cv. caturra plantlets. Endophytic colonization was verified, followed by in planta growth promotion and antagonism assays. Conclusions Results show that Trichoderma isolates CT5 and G1C have potential for plant growth promotion and antagonism against Mycena citricolor, reducing incidence and severity, and preventing plant mortality.

Preventive confinement against COVID-19 changed the teaching-learning process of the Phytopathology course at the Faculty of Agronomy of the UCR. Information and Communications Technologies (ICT) were integrated into a program called ‘Phytopathology 2020, at the distance but together’. Each student received at her home a box of materials, including culture media and a paper microscope, that allowed her to set up and carry out different phytopathological techniques. The result obtained exceeded expectations and previous results in 16 years of teaching experience. The integration of the family into the educational project was surprising, fostering values of mutual commitment in education and prevention of COVID-19.

Introducción. El frijol común (Phaseolus vulgaris L.) es una leguminosa consumida ampliamente en países en vías de desarrollo. En Costa Rica su consumo es alto (10,54 kg.persona-1.año-1) y su producción se localiza principalmente en regiones al sur y al norte del país. Los granos de esta leguminosa podrían estar contaminados con Fusarium, un hongo micotoxigénico que coloniza diferentes cultivos. Objetivo. Identificar las especies de Fusarium que colonizan los granos de frijol negro en Costa Rica. Materiales y métodos. Se recolectaron 49 muestras de granos de frijol negro durante 2017, 2018 y 2019 en regiones donde se produce este grano en Costa Rica. Estas se utilizaron para aislar e identificar las especies de Fusarium basado en secuencias parciales de los genes TEF1α (factor de elongación de la traducción 1-alfa) y RPB2 (subunidad de la ARN polimerasa II). Resultados. Se obtuvieron 28 aislamientos de Fusarium, de los cuales 82% pertenecen al com[1]plejo de especies Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC). La presencia de especies de Fusarium varió según el año de recolección; en el 2018 se encontró la menor prevalencia (43%) y el 2019 la mayor (76%). El 71% de las especies de Fusarium se aislaron de muestras recolectadas en la región sur del país. F. equisetti se aisló solo de una muestra procedente de la región Atlántica, mientras que F. incarnatum, F. oxysporum y F. verticillioides se encontraron distribuidos en muestras colectadas en diferentes regiones del país. Conclusión. El presente estudio demostró la diversidad de especies de Fusarium que colonizan los granos de frijol negro en Costa Rica según la ubicación geográfica y el año de recolección de la muestra. La mayoría de las especies aisladas resultaron productoras de micotoxinas que causan efectos adversos en la salud humana. Introduction. The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a legume that is widely consumed in developing countries. In Costa Rica, its consumption is still high (10.54 kg.person-1. year), and its production is mainly located in the southern and the northern regions of the country. The grains of this legume could be contaminated with Fusarium, a mycotoxigenic fungus that colonizes different crops. Objective. Identify Fusarium species that colonize the grains of Costa Rican black beans. Materials and methods. Forty-nine samples of black bean grains were collected during 2017, 2018 and 2019 in different regions where this grain is produced in Costa Rica. Those were used to isolate and identify the Fusarium species based on the partial sequences of TEF-1α (translation elongation factor 1-alpha) and RPB2 genes (RNA polymerase II subunit). Results. A total of 28 Fusarium isolates were obtained, of which 82% belong to the Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FIESC). The presence of Fusarium species was high and varied according to the year of sample collection; thus 2018 was the year in which the lowest prevalence was found (43%) and 2019 the highest (76%). Seventy-one percent of the Fusarium species were isolated from samples collected in the Brunca region in southern Costa Rica. F. equisetti was isolated only from one sample obtained from the Huetar Atlántica region, while F. incarnatum, F. oxysporum and F. verticillioides were found distributed in samples collected in different regions of the country. Conclusion. The present study demonstrates the diversity of Fusarium species colonizing black bean grains in Costa Rica according to the geographical location and the year of collection of the samples. Most of the isolated species are well known producers of mycotoxins that cause adverse effects on human health. Universidad de Costa Rica/[734-B9-038]/UCR/Costa Rica UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Centro para Investigaciones en Granos y Semillas (CIGRAS) UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Centro de Investigación en Protección de Cultivos (CIPROC)

Las pudriciones radicales limitan el rendimiento del frijol (Phaseolus vulgaris), y aunque en Costa Rica son frecuentes, la identidad de los hongos asociados a ellas es incierta. El objetivo de esta investigación fue identificar molecularmente los hongos asociados a las pudriciones radicales y marchitez del frijol en las dos principales zonas productoras del país. Entre 2017 y 2020, se recolectaron 120 plantas en 20 fincas de las regiones Huetar Norte y Brunca. Se muestrearon líneas experimentales (IBC 302-29 y ALS 0536-6) y variedades comerciales (Brunca, Cabécar, Chánguena, Guaymí, Nambí y Tayní). Se describieron los síntomas observados en campo y se efectuaron aislamientos en agar agua rosa de bengala cloranfenicol, luego cultivos puros de punta de hifa en agar agua, que se trasfirieron a papa dextrosa agar para determinar morfotipos con el uso de claves taxonómicas. Los hongos aislados también se identificaron mediante secuenciación de la región ITS del ADN nuclear ribosomal. Se calculó el porcentaje de frecuencia relativa de morfotipos. Los más frecuentes fueron Macrophomina phaseolina (26.7%), Fusarium oxysporum (13.6%) y Athelia rolfsii (5.6%). A partir de los síntomas de marchitez observados en campo se aislaron los hongos comúnmente descritos en frijol para esas patologías. Es necesario realizar pruebas de patogenicidad para confirmar que son los agentes causales.

Resumen Introducción. El ojo de gallo causado por Mycena citricolor está entre las principales enfermedades del cafeto en Costa Rica. Se presentan ataques cíclicos, aproximadamente cada catorce años, relacionados con el aumento de las precipitaciones y el inóculo. Objetivo. Determinar el impacto de la hojarasca y del inóculo primario sobre la epidemiología de esta enfermedad. Materiales y métodos. En cafetales ubicados en la región cafetalera de Tarrazú, Costa Rica, se valoró el efecto de la eliminación manual de las hojas enfermas adheridas a la planta y de la capa de hojas caídas, sobre la epidemia de ojo de gallo en los años 2013 y 2014. Se evaluaron 1200 bandolas en un experimento de parcelas divididas, donde los cuatro tratamientos se obtuvieron por la combinación de los niveles “con y sin” para cada factor. Se describió la enfermedad mediante la cuantificación del número de hojas enfermas, lesiones y geminíferos. Se construyeron las curvas de desarrollo de la enfermedad y se calculó el área bajo la curva para cada variable. Se calculó el crecimiento y defoliación de las plantas de café. Resultados. Con base en la curva de incidencia de la enfermedad para cada tratamiento en cada año, se determinó que el crecimiento logístico de las epidemias es el modelo de mejor ajuste. Las tasas de infección aparente (r) fueron cercanas a 0,04 unidades por día en 2013 y no hubo diferencia estadística significativa en las epidemias desarrolladas; pero sí para el 2014, donde variaron entre 0,03 y 0,05. Se observó un efecto principal del factor inóculo inicial sobre la presencia o ausencia de hojarasca. Conclusión. La hojarasca no tuvo efecto significativo en el desarrollo de la epidemia de ojo de gallo. Esta es la primera investigación que determina el impacto de posibles fuentes de inóculo distintas a las lesiones presentes en hojas de café. Abstract Introduction. The American leaf spot caused by Mycena citricolor is among the main coffee diseases in Costa Rica. Cyclic attacks occur approximately every fourteen years, related to increased rainfall and inoculum. Objective. Determine the impact of litterfall and primary inoculum on the epidemiology of this disease. Materials and methods. In coffee plantations located in the coffee region of Tarrazú, Costa Rica, the effect of the manual elimination of diseased leaves attached to the plant and the layer of fallen leaves on the American leaf spot epidemic in 2013 and 2014 was assessed. 1200 branches were evaluated in an experiment of divided plots, where the four treatments were obtained by combining the “with and without” levels for each factor. The disease was described by quantifying the number of diseased leaves, lesions, and geminifers. The disease development curves were constructed and the area under the curve was calculated for each variable. The growth and defoliation of coffee plants was calculated. Results. Based on the disease incidence curve for each treatment in each year, it was determined that the logistic growth of epidemics is the best fit model. The rates of apparent infection (r) were close to 0.04 units per day in 2013 and there was no significant statistical difference in the developed epidemics; but for 2014, where they varied between 0.03 and 0.05. A main effect of the initial inoculum factor was observed on the presence or absence of litterfall. Conclusion. Litterfall had no significant effect on the development of the American leaf spot epidemic. This is the first investigation that determines the impact of possible sources of inoculum other than the lesions present in coffee leaves.

Heliocephala vietnamensis sp. nov., a hyphomycetous fungus collected on decaying leaves of an unidentified plant, is described and illustrated. It is distinguished by determinate apical cluster of conidiogenous cells and obclavate to sub-navicular, 3-septate, pale brown conidia. UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Agroalimentarias::Facultad de Ciencias Agroalimentarias::Escuela de Agronomía UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Agroalimentarias::Centro de Investigación en Protección de Cultivos (CIPROC)

A checklist of recorded asexual fungi from Costa Rica is presented. This study compiles information from 1927 to 2018 based on scientific papers, theses, reviews of hyphomycetous and coelomycetous fungi, dermatophyte clinical studies, clinical samples from phytopathological laboratory services and specimens collected during the expedition to Costa Rica carried out in 2012 in collaboration with the International Society for Fungal Conservation. All taxa included in this checklist are binomials and it includes 682 species belonging to 301 genera. Half of them have been reported as fungal pathogens, the remaining ones are saprobes, endophytes or asociated with insect, human and other fungal hosts. Forty six taxa are reported for the first time from Costa Rica. UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Agroalimentarias::Facultad de Ciencias Agroalimentarias::Escuela de Agronomía

La vena roja del helecho hoja de cuero (Rumorah adiantiformis) se cataloga como una enfermedad de etiología desconocida, ya que no se conoce cuál es su agente o factor causal. Ésta alteración, al igual que el síndrome de Sterloff (SS), se ha venido presentando desde hace varios años en Costa Rica, lo que ha producido situaciones económicas desfavorables, reduciendo el área sembrada en 60% y provocando una disminución en los puestos de trabajo 70%. Se registra muy poca investigación a nivel mundial que caracterice ambas patologías, por lo que es imposible realizar una estrategia de manejo apropiada, lo que conlleva al aumento del costo económico, social y ambiental del cultivo. Con el fin de describir ultraestructuralmente los síntomas de la enfermedad, se colectó tejido foliar por un período de dos años (2007 y 2008) en Poás de Alajuela, Costa Rica, y se realizaron observaciones mediante microscopia electrónica de barrido y transmisión. Los tejidos con síntomas revelaron la presencia de cristales laminados en las células del mesófilo esponjoso y acumulaciones cristalinas amorfas en el parénquima del haz vascular, así como gran cantidad de cristales en las vacuolas del mesófilo esponjoso. Éstos cristales, aparentemente, están compuestos por oxalato de calcio, no se evidenció presencia de cristales en tejidos asintomáticos. Este artículo describe los hallazgos ultraestructurales en follaje con y sin síntomas de vena roja en plantas de helecho y menciona como una posibilidad de la causa condiciones de estrés por desbalances nutricionales. The red vein leather leaf fern (Rumorah adiantiformis) is classified as a disease of unknown etiology, and it is not known what his agent or causal factor. This alteration, like Sterloff syndrome (SS) has been presenting for several years in Costa Rica, which has produced unfavorable economic conditions, reducing the area planted in 60% and causing a decrease in jobs 70%. Very little is recorded worldwide research that characterizes both conditions, so it is impossible to make an appropriate management strategy, which leads to increased economic costs, social and environmental dimensions of culture. In order to describe ultrastructural symptoms of the disease, leaf tissue was collected for a period of two years (2007 and 2008) in Poas, Alajuela, Costa Rica, and observations were made by scanning electron microscopy and transmission. Tissues with symptoms revealed the presence of laminated glass in spongy mesophyll cells and amorphous crystalline accumulations in the parenchyma of the vascular bundle, as well as lots of crystals in the spongy mesophyll vacuoles. These crystals are apparently calcium oxalate compounds, no evidence of crystals in the presence of asymptomatic tissues. This article describes the ultrastructural findings foliage with and without symptoms of red vein fern plants and mentioned as a possible cause stress conditions nutritional imbalances. Universidad de Costa Rica/[810-A7-006 ]/UCR/Costa Rica UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Estructuras Microscópicas (CIEMIC) UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Agroalimentarias::Facultad de Ciencias Agroalimentarias::Escuela de Agronomía

Se hizo una revisión bibliográfica sobre la pudrición blanca o torbó de la cebolla, enfermedad causada por el hongo Sclerotium cepivorum Berk. Se tomaron en cuenta aspectos como la distribución de la enfermedad a escala mundial, la sintomatología típica, el agente causal y los hospederos, así como el ciclo de vida del patógeno y la epidemiología de la enfermedad, además de las principales estrategias de combate. Se menciona brevemente la importancia del cultivo de la cebolla en el país, las zonas de siembra y el impacto de la enfermedad. A literature review on onion white rot or “torbó”, caused by the fungus Sclerotium cepivorum Berk. was performed. This review includes its world distribution, typical symptoms, causal agent, hosts, pathogen life cycle, epidemiology and disease control strategies. A brief description of the importance of onion crop in Costa Rica, areas where it is produced and the main disease impact were also included. UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Agroalimentarias::Facultad de Ciencias Agroalimentarias::Escuela de Agronomía

Para evaluar el efecto de Trichoderma spp., Clonostachys spp. y Beauveria bassiana sobre la incidencia de la pudrición blanca de la cebolla (Sclerotium cepivorum), se realizó un experimento de invernadero. Los aislamientos fueron recuperados de esclerocios colectados en fincas productoras de cebolla de la zona alta de Cartago, Costa Rica. Plántulas de cebolla fueron sembradas en suelo inoculado con el patógeno (0,06 esclerocios.g-1 de suelo) y se les realizó 3 aplicaciones con los biocontroladores, individualmente o en mezcla. La primera aplicación se realizó a la siembra (230 g.maceta-1 de 3,5 kg). A las 4 y 8 semanas se realizó la segunda y tercera aplicación (500 ml de sustrato.maceta-1, con 5x106 ufc.ml-1). A las 18 semanas, se evaluó la incidencia de la enfermedad. Los resultados indicaron una diferencia (p=0,0117) entre el testigo (sin biocontroladores) y los demás tratamientos. La incidencia de pudrición blanca mostró el siguiente patrón: testigo 46%; Beauveria bassiana 17%; Clonostachys spp. 8,3% y 7,1%, respectivamente; Trichoderma spp. O%. El análisis de varianza no mostró diferencias (p=0,5883) entre las medias para la longitud foliar. Estos resultados indican que todos los biocontroladores evaluados ejercen algún grado de control sobre la enfermedad, en particular Trichoderma spp.

Se aislaron e identificaron hongos asociados a esclerocios de Sclerotium cepivorum, causante de la pudrición blanca de la cebolla, con el fin de determinar la existencia de hongos con potencial antagónico nativos en la zona alta de Cartago. Se estudiaron 10 fincas durante febrero-mayo de 2002. Cada una se dividió en 3 áreas de acuerdo al nivel de incidencia histórica de la enfermedad (bajo, intermedio, alto). En cada área se realizó un trampeo de hongos mediante la técnica de entierro de esclerocios; además se hizo muestreo de plantas enfermas, se colectó suelo para cuantificar densidad de inóculo y para realizar análisis microbiológicos, químico sencillo, de textura y determinación de materia orgánica. Los géneros encontrados en el trampeo fueron Alternaria spp., Fusarium spp., Gliocladium sp., Mucor sp., Penicillium spp., Rhizoctonia sp., Rhizopus sp. y Trichoderma spp.; en bulbos enfermos se aislaron Fusarium spp., Monilia sp., Mucor sp., Penicillium spp., Pythium sp., Rhizopus sp., y Trichoderma spp. Los géneros Gliocladium sp., Penicillium spp. y Trichoderma spp. también se hallaron en el análisis microbiológico de suelo. Las poblaciones más altas de microorganismos se recuperaron en el área intermedia de todas las fincas. Este trabajo comprueba que es posible aislar hongos con potencial antagónico, como Trichoderma spp., Gliocladium sp. y Paecilomyces sp., en suelos a los que por muchos años se les ha aplicado una gran cantidad de fungicidas.