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42 results on '"Mach Casellas, Nuria"'

3. On the influence of host genetics on gut microbiota composition in pigs

Author

Estellé, Jordi, Mach Casellas, Nuria, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Levenez, Florence, Lemonnier, Gaetan, Denis, Catherine, Berri, El Mostafa, Mercat, Marie-José, Billon, Yvon, Dore, Joel, Larzul, Catherine, Lepage, Patricia, Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), MetaGenoPolis, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Santé Animale (DEPT SA), Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2018

4. Multivariate and network analysis identified microbial biomarkers linked to methane emission

Author

RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Bernard, Aurélien, Zingaretti, Laura M., Popova, Milka, Mach Casellas, Nuria, Estelle, Jordi, Munoz Tamayo, Rafael, Perez Enciso, Miguel, Morgavi, Diego, Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Federation of Animal Science, and Morgavi, Diego

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; The microbiota in the rumen fluid of 65 Holstein cows was characterized through the 16S rRNA (bacteria) targeted re-sequencing. Methane yields (CH4y = CH4/DMI) and dry matter intake (DMI) were individually measured during 3 weeks with the GreenFeed and Calan gate systems, respectively. Twenty of these cows were measured (CH4y) and rumen contents sampled twice in two successive months. A combination of multivariate, clustering and microbial co-abundance network analysis was implemented to identify a set of OTUs jointly associated with CH4y and the discrimination of samples according to the structure of ruminal microbial ecosystem. In addition, repeated measures were used to provide an estimation of the 16S ruminal stability within a month, which was R=0.64. Three ruminotype-like clusters (R1, R2 and R3) were identified; and R2 was associated with higher CH4y emission. Sparse partial least squares discriminant analysis (sPLS-DA) was done based on samples classification following two criteria: ruminotype-like cluster assignation and CH4y phenotype classification (low, high and intermediate). A sPLS regression model using the phenotype variation of CH4y emission was also implemented. Overall, 28 OTUs, which explain the 52% of the phenotype variation of CH4y, were identified by combining the approaches. The taxonomic classification of these OTUs included families linked to CH4 emission such as Christensenellaceae, Lachnospiraceae, and Ruminococcaceae. According to the interaction patterns, 83% (25/28) of these OTUs belong to the same sub-network module. In summary, our results suggest a relative stability of the rumen microbiota as well as a common set of interacting OTUs simultaneously linked to CH4y emission and microbial ruminal ecosystem structure.

Published
2018

5. Identification of microbial taxa linked to methane emission in Holstein and Charolais cattle by an integrative approach

Author

RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Bernard, Aurélien, Zingaretti, Laura, Popova, Milka, Mach Casellas, Nuria, Estelle Fabrellas, Jordi, Munoz Tamayo, Rafael, Perez Enciso, Miguel, Morgavi, Diego, Renand, Gilles, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), ProdInra, Migration, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SHS] Humanities and Social Sciences, [INFO] Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

International audience

Published
2018

6. Identification et caractérisation de marqueurs liés aux infestations par les petits strongles pour l'optimisation des shémas de vermifugation chez les équins

Author

Salle, Guillaume, Mach Casellas, Nuria, Cortet, Jacques, Koch, Christine, Reigner, Fabrice, Riou, Mickaël, Canlet, Cécile, Blanchard, Alexandra, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme d'Infectiologie Expérimentale (PFIE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), IFCE projet (STROMAEQ, AO2015), Institut Français du Cheval et de l'Equitation (IFCE). FRA., Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO), Plateforme d'Infectiologie Expérimentale (PFIE - INRA UE 1277), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Plateforme MetaToul, MetaboHUB, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
Parasitologie, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, targeted treatment, biomarker, traitement ciblé, strongyle, strongle, cyathostomins, cyathostome, biomarqueur, équin
Abstract

Remerciements :INRA, Plateforme MetaToul Centre de Toulouse; Identification et caractérisation de marqueurs liés aux infestations par les petits strongles pour l'optimisation des shémas de vermifugation chez les équins. 43. Journée de la Recherche Equine

Published
2017

7. Developing a 670k genotyping array to tag similar to 2M SNPs across 24 horse breeds

Author

Schaefer, Robert J, Schubert, Mikkel K, Bailey, Ernest K, Bannasch, Danika L, Barrey, Eric, Bar-Gal, Gila Kahila, Brem, Gottfried J, Brooks, Samantha A, Distl, Ottmar K, Fries, Ruedi K, Finno, Carrie J, Gerber, Vinzenz K, Haase, Bianca K, Jagannathan, Vidhya K, Kalbfleisch, Ted K, Leeb, Tosso K, Lindgren, Gabriella K, Lopes, Maria Susana, Mach Casellas, Nuria, Machado, Artur daCamara, MacLeod, James N, McCoy, Annette K, Metzger, Julia K, Penedo, Cecilia K, Polani, Sagi K, Rieder, Stefan K, Tammen, Imke K, Tetens, Jens K, Thaller, Georg P, Verini-Supplizi, Andrea P, Wade, Claire M, Wallner, Barbara T, Orlando, Ludovic, Mickelson, James R, and McCue, Molly E

Subjects
Equine genomics, Whole genome sequence, SNP-tagging, SNP chip, Variant recalibration, SNP discovery, SNP informativeness, SNP validation, Linkage disequilibrium
Abstract

Background: To date, genome-scale analyses in the domestic horse have been limited by suboptimal single nucleotide polymorphism (SNP) density and uneven genomic coverage of the current SNP genotyping arrays. The recent availability of whole genome sequences has created the opportunity to develop a next generation, high-density equine SNP array. Results: Using whole genome sequence from 153 individuals representing 24 distinct breeds collated by the equine genomics community, we cataloged over 23 million de novo discovered genetic variants. Leveraging genotype data from individuals with both whole genome sequence, and genotypes from lower-density, legacy SNP arrays, a subset of similar to 5 million high-quality, high-density array candidate SNPs were selected based on breed representation and uniform spacing across the genome. Considering probe design recommendations from a commercial vendor (Affymetrix, now Thermo Fisher Scientific) a set of similar to 2 million SNPs were selected for a next-generation high-density SNP chip (MNEc2M). Genotype data were generated using the MNEc2M array from a cohort of 332 horses from 20 breeds and a lower-density array, consisting of similar to 670 thousand SNPs (MNEc670k), was designed for genotype imputation. Conclusions: Here, we document the steps taken to design both the MNEc2M and MNEc670k arrays, report genomic and technical properties of these genotyping platforms, and demonstrate the imputation capabilities of these tools for the domestic horse.

Published
2017

10. El ácido alfa lipoico y su poder antioxidante frente al cáncer y las patologías de sensibilización central

Author

Durand, Marisa, Mach Casellas, Nuria, and Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC)

Subjects
Enfermedades de sensibilización central, lcsh:Nutritional diseases. Deficiency diseases, Radicales libres, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cáncer, lcsh:RC620-627, Ácido alfa lipoico
Abstract

Introducción: El ácido alfa lipoico (ALA) puede controlar y limitar la cantidad de radicales libres, influyendo el desarrollo de patologías como el cáncer o las enfermedades de sensibilización central, aunque los mecanismos moleculares implicados en este proceso aún están dilucidándose. Objetivo: Reunir y contrastar información sobre las propiedades antioxidantes del ALA en la prevención y desarrollo de las patologías relacionadas con el estrés oxidativo. Material y métodos: En este trabajo, se analizan más de 100 artículos publicados en los últimos 20 años que relacionan el consumo de ALA y la prevalencia y desarrollo de patologías relacionadas con el estrés oxidativo. Los artículos han sido obtenidos en diferentes bases de datos (PubMed central, Web of Science, Elsevier Journal, Science Direct), e incluyen experimentos en células, animales y humanos. Las palabras clave utilizadas fueron: cáncer, enfermedades de sensibilización central, radicales libres, y ALA. Resultados y discusión: Se han reunido resultados de trabajos realizados in vitro y en animales de laboratorio en los que se pone de manifiesto el efecto del ALA en el control de la apoptosis celular de diferentes tipos de cánceres mediante un aumento de las especies reactivas de oxígeno, así como también el retardo en el crecimiento de las mismas. Aparte, se ha demostrado que la capacidad antioxidante del ALA y su potencial para regenerar otros antioxidantes es de gran importancia para tratar las patologías de sensibilización central. Conclusiones: El ALA ha demostrado un papel significativo como antioxidante y prooxidante en el cáncer y las patologías de sensibilización central, aunque son necesarias más investigaciones en humanos.

Published
2013

11. Acylcarnitine profile in endurance horses with and without metabolic dysfunction

Author

Van der Kolk, J. H., Thomas, Selina, Mach Casellas, Nuria, Ramseyer, A, Burger, D., Gerber, Vincent, Nuoffer, J-M., Agroscope, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut Suisse de Médecine Equine (ISME), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], education, social sciences, health care economics and organizations
Abstract

Acylcarnitine profile in endurance horses with and without metabolic dysfunction. Congress of the European College of Equine Internal Medicine (ECEIM)

Published
2016

12. Mitochondrial genome variability of 205 Arabian endurance horses

Author

Hoede, Claire, Heurteau, Alexandre, Ricard, Anne, Esquerre, Diane, Morgenthaler, Caroline, Mach Casellas, Nuria, Robert, Céline, Barrey, Eric, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme BioInformatique, Genotoul, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Bio-Informatique - Génotoul, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and World Mitochondria Society. INT.

Subjects
stomatognathic system, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, eye diseases, health care economics and organizations, humanities
Abstract

The objectives of this study were to propose a new strategy to call genetic variants in mitochondrial genome, and determine whether some variants are associated to endurance performance. DNA was isolated from peripheral blood and mtDNA was amplified by 5 overlapping amplicons and then sequenced by Illumina Miseq. We chose a reference genome (GenBank ID : JN398380.1) that we « circularized » to improve terminals' alignments. After quality filt ering and alignment, GATK (v3.5) was used to detect SNPs, indels and heteroplasmy. Association between SNPs and performance in endurance was tested using mixed model with fixed SNP Effect and random additive genetic effect with relationship matrix. We got 590 variable positions of which 72% were known through studies of mitochondrial variability in horses (Li et al. , McKenna et al. ) . 80% of the protein coding variants are silent and the transition/transversion ratio is 22.5. We observed 1.5% of non - haploid genotype. We graphically described the variants and the observed heteroplasmy in terms of localization, diversity, potential effects along the mitochondrial genome. Our preliminary analysis do not allow to associate some of the variants to performance., Journal of World Mitochondria Society, Vol 2, No 2 (2016)

Published
2016

13. Recherche de marqueurs liés aux infestations par les petits strongles pour l'optimisation des schémas de vermifugation chez les équins : caractérisation du métabolome, des paramètres biochimiques et du microbiote fécal

Author

Salle, Guillaume, Mach Casellas, Nuria, Cortet, Jacques, Koch, Christine, Reigner, Fabrice, Blanchard, Alexandra, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Association Française des Sciences et Techniques de l'Animal de Laboratoire (AFSTAL). FRA., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), and Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO)

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, microbiote, parasite, interaction hôte pathogène, microbiote fécal, strongle gastro intestinal, vermifugation, infestation parasitaire, host pathogen systems, stratégie de traitement, Cheval, équin
Abstract

Session Posters; Recherche de marqueurs liés aux infestations par les petits strongles pour l'optimisation des schémas de vermifugation chez les équins : caractérisation du métabolome, des paramètres biochimiques et du microbiote fécal. 42. Colloque annuel de l'AFSTAL

Published
2016

14. Evolution of the Major Histocompatibility Complex class I in wild pigs and peccaries

Author

Lee, Carol, Moroldo, Marco, Perdomo, Alvaro, Mach Casellas, Nuria, Marthey, Sylvain, Lecardonnel, Jerôme, Wahlberg, Per, Chong, Amanda, Estelle Fabrellas, Jordi, Gaillard, Claire, GONGORA, Jaime, University of Sydney, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Chercheur indépendant, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Evolution of the Major Histocompatibility Complex class I in wild pigs and peccaries. Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE)

Published
2016

15. Effects of weaning-induced stress on the gut microbiota in horses

Author

Mach Casellas, Nuria, Reigner, Fabrice, Guego, Marine, Moroldo, Marco, Kittelmann, Sandra, Ballester, Maria, Esquerre, Diane, Salle, Guillaume, Gerard, Philippe, Lansade, Léa, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére - UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Agroscope, Institute of Research and Technology, Food and Agriculture (IRTA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Chercheur indépendant, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], education, digestive system
Abstract

Effects of weaning-induced stress on the gut microbiota in horses. . 3. European Workshop on Equine Nutrition (EWEN)

Published
2016

16. Microbiote intestinal chez le porc : paramètres génétiques de sa composition et liens avec des caractères immunitaires

Author

Estellé, Jordi, Larzul, Catherine, Mach Casellas, Nuria, Levenez, Florence, Ramayo-Caldas, Yuliaxis, MEURENS, François, Mercat, Marie-José, Lemonnier, Gaëtan, Denis, Catherine, Billon, Yvon, Oswald, Isabelle, Doré, Joël, Berri, El Mostafa, Lepage, Patricia, Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Infectiologie Animale et Santé Publique - IASP (Nouzilly, France), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Biosynthèse & Toxicité des Mycotoxines (ToxAlim-BioToMyc), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

Microbiote intestinal chez le porc : paramètres génétiques de sa composition et liens avec des caractères immunitaires. 48. Journées de la Recherche Porcine

Published
2016

17. Transcriptomic and phenotypic changes in young bull liver caused by low-impact and nutraceutical diets

Author

Pegolo, Sara, Mach Casellas, Nuria, Cecchinato, Alessio, Dadousis, Christos, Babucci, Massimiliano, Pauletto, Marianna, Bargelloni, Luca, Bittante, Giovanni, Universita degli Studi di Padova, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
nervous system, [SDV]Life Sciences [q-bio], education, sense organs, skin and connective tissue diseases
Abstract

Transcriptomic and phenotypic changes in young bull liver caused by low-impact and nutraceutical diets. International Plant and Animal Genome (PAG)

Published
2016

19. Novel equine tissue miRNAs and breed-related miRNA expressed in serum

Author

Mach Casellas, Nuria, Mata, Xavier, Vaiman, Anne, Schibler, Laurent, Pacholewska, Alicja, Barrey, Eric, and Gerber, Vincent

Subjects
Horse, miRNA, microRNA, miRNome, Serum, sRNA-seq
Abstract

Background: MiRNAs regulate multiple genes at the post-transcriptional level and therefore play an important role in many biological processes. It has been suggested that miRNA exported outside the cells contribute to intercellular communication. Consequently, circulating miRNAs are of particular interest and are promising biomarkers for many diseases. The number of miRNAs annotated in the horse genome is much lower compared to model organisms like human and mouse. We therefore aimed to identify novel equine miRNAs for tissue types and breed in serum. [br/] Results: We analysed 71 small RNA-seq libraries derived from nine tissues (gluteus medius, platysma, masseter muscle, heart, liver, cartilage, bone, total blood and serum) using miRDeep2 and miRdentify tools. Known miRNAs represented between 2.3 and 62.9 % of the reads in 71 libraries. A total of 683 novel miRNAs were identified. Breed and tissue type affected the number of miRNAs detected and interestingly, affected its average intensity. A total of 50 miRNAs in serum proved to be potential biomarkers to differentiate specific breed types, of which miR-122, miR-200, miR-483 were over-expressed and miR-328 was under-expressed in ponies compared to Warmbloods. The different miRNAs profiles, as well as the differences in their expression levels provide a foundation for more hypotheses based on the novel miRNAs discovered. [br/] Conclusions: We identified 683 novel equine miRNAs expressed in seven solid tissues, blood and serum. Additionally, our approach evidenced that such data supported identification of specific miRNAs as markers of functions related to breeds or disease tissues.

Published
2016

20. Pig’s gut microbiota: composition, and links with host genetic parameters, immunity and production traits

Author

Estellé, Jordi, Mach Casellas, Nuria, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Pinard - Van Der Laan, Marie-Helene, INRA-Denmark-BGI Consortium, ., Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), and International Livestock Research Institute (ILRI).

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2015

21. Characterization of blood biomarkers in endurance horses by integrating miRNA and mRNA expression profiling

Author

Mach Casellas, Nuria, Plancade, Sandra, Moroldo, Marco, Lecardonnel, Jerôme, Robert, Celine, Barrey, Eric, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], education
Abstract

Characterization of blood biomarkers in endurance horses by integrating miRNA and mRNA expression profiling. 11. Dorothy Russel Havemeyer Foundation International Equine Genome Mapping Workshop

Published
2015

22. Gut microbiota in swine: composition, genetic parameters, and links with immunity and production traits

Author

Estelle Fabrellas, Jordi, Mach Casellas, Nuria, Larzul, Catherine, Berri, El Mostafa, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Billon, Yvon, Dore, Joel, Lepage, Patricia, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], microbiota, swine, genetics, immunity
Abstract

absent

Published
2015

23. Profiling of microRNAs coded by mitochondrion in different equine tissues

Author

Mach Casellas, Nuria, Mata, Xavier, beinat, Marine, Vaiman, Anne, Moroldo, Marco, Lecardonnel, Jerôme, Legendre, Rachel, Ruet, Alice, Kennedy, Sean, Schibler, Laurent, Barrey, Eric, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), US 1367 MetaGénoPolis, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Département Microbiologie et Chaîne Alimentaire (MICA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaGénoPolis (MGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, MetaGenoPolis, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2014

24. Gut microbiota composition in swine: genetic parameters and links with immunity traits

Author

Estelle Fabrellas, Jordi, Mach Casellas, Nuria, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Levenez, Florence, Lemonnier, Gaetan, Denis, Catherine, Dore, Joel, Billon, Yvon, Mercat, Marie-José, Larzul, Catherine, Lepage, Patricia, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle génétique, Institut du Porc (IFIP), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
pig, microbiote, gut microbiota, [SDV]Life Sciences [q-bio], immunity, genetic parameters, porcin, paramètre génétique, immunité
Abstract

absent

Published
2014

25. Exhaustive comparison of gene expression along pig small Intestine and in Peyer’s patches performed by RNA-Seq

Author

Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Chevaleyre, Claire, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle P., Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2014

27. Extensive comparison of genome wide transcription along pig small intestine and in Peyer’s patces by RNA-seq

Author

Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle, Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and ProdInra, Archive Ouverte

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2013

28. Gut microbiota and immunity interplay at the mucosal interface in swine, a data integration approach

Author

Mach Casellas , Nuria, Lepage , Patricia, Levenez , Florence, Lemonnier , Gaetan, Denis , Catherine, BAILLY , JEAN-DENIS, Leplat , Jean Jacques, Dore , Joel, Estelle Fabrellas , Jordi, Rogel-Gaillard , Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), MetaGenoPolis, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, US 1367 MetaGénoPolis, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Département Microbiologie et Chaîne Alimentaire (MICA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-MetaGénoPolis (MGP), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -MetaGénoPolis ( MGP ) -Microbiologie et Chaîne Alimentaire ( MICA ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2013

29. Mecanismos moleculares implicados en los posibles efectos de los compuestos fenólicos en la disminución del riesgo de enfermedades cardiovasculares

Author

Aubets-Fuster, M., Mach Casellas, Nuria, Estudis de Ciències de la Salut, Institut Internacional de Postgrau, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

The objective of the present review is to evaluate the possible association between phenolic compounds and cardiovascular disease, proposing that their regular consumption in Western diets could be beneficial for protecting patients against cardiovascular disease. An extensive research of scientific literature was performed in the following electronic specialized databases (PubMed central (PMC)-NBCI, Elsevier Journal, Scielo Spain, Scirus, Science Direct, Web of Science), including studies in animals, cells, and humans, to establish the effect of polyphenols in the prevention and development of cardiovascular disease was conducted. The in vitro , animal and human studies show the potential ability of polyphenols to act against cardiovascular disease as a result of their antioxidant effect and vasodilatation and their capacity to improve lipid profile while reducing the concentration of low-density lipoproteins. Polyphenols consumption in Western diets could be beneficial for protecting patients against cardiovascular disease.

Published
2013

30. Influencia de la dieta sobre las citoquinas antiinflamatorias en la enfermedad de Crohn

Author

González Isabel, Concepción, Mach Casellas, Nuria, Àrea de Ciències de la Salut, Institut Internacional de Postgrau, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

[b]Background:[/b] Crohn’s disease is a digestive illness that causes inflammation in genetically susceptible pa- tients. Given the relationship between Crohn’s disease, microbiota and diet, theintake of functional foods to promote the modification of microbiota profile and /or the synthesis of antiinflammatory cytokines and thus decrease the effects of inflammation has been evaluated, under de assumption that a proper diet could be used as a means to improve the health of this population group. [br/][b]Methods:[/b] An extensive research in scientific publications was performed in the following electronic spe- cialized databases: PubMed central (PMC)-NBCI, Elsevier Journal, Scielo Spain, Scirus, and Science Direct.[br/][b]Results:[/b] Several studies have shown that probiotics are not as effective as expected because of intestinal bacteria population in compromised. However, it has been observed that enteral nutrition and the adminis- tration of certain nutraceuticals components such as fish bioactive peptides, colostrum and bovine serum, as well as Boswella serrata, calcium, curcuma and multivitamins can be the first therapy in Crohn’s disease since they induce mucosal reparation and reduce inflammation. [br/][b]Conclusions:[/b] More clinical studies in humans are required to clarify the possible effect of functional foods on the control and development of Crohn’s disease.

Published
2013

31. Genetics and genomics of immune traits in swine

Author

Gaillard, Claire, Gao, Yu, Mach Casellas, Nuria, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Nutritional Sciences, University of Wisconsin-Madison, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2012

32. Diversity studies of SLA haplotypes by targeted high-throughput resequencing of the whole locus

Author

Mach Casellas, Nuria, Moroldo, Marco, Marthey, Sylvain, Ando, Asako, Lee, Jun-Heon, Ho, Chak-Sum, Lunney, Joan, Estelle Fabrellas, Jordi, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Molecular Life Science, Division of Basic Medical Science and Molecular Medicine, Tokai University School of Medicine, Department of Animal Science and Biotechnology, College of Agriculture and Life Sciences, Chungnam National University (CNU), Histocompatibility Laboratory, Gift of Life Michigan, Animal Parasitic Diseases Laboratory, BARC, USDA, USDA-ARS : Agricultural Research Service, Agricultural Research Service, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2012

34. The peripheral blood transcriptome dynamically reflects immunocompetence in swine

Author

Mach Casellas, Nuria, Gao, Yu, Lemonnier, Gaetan, Lecardonnel, Jerôme, Estelle Fabrellas, Jordi, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Nutritional Sciences, University of Wisconsin-Madison, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2012

35. Blood transcriptome as an emerging molecular phenotype to study immunocompetence in swine

Author

Mach Casellas, Nuria, Gao, Yu, Lemonnier, Gaetan, Lecardonnel, Jerôme, Estelle Fabrellas, Jordi, Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Nutritional Sciences, University of Wisconsin-Madison, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UMR1313, Biological Resources Centre for livestock genomics, CRB GADIE, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2012

36. Efecto del consumo de astaxantina en la salud

Author

López Roldán, Patricia, Mach Casellas, Nuria, Àrea de Ciències de la Salut. Institut Internacional de Postgrau, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

This work aims to make a compilation of the most relevant articles published about the astaxanthin and the improvement or prevention of diseases, leaving evident the power of astaxanthin as an antioxidant and anti-inflammatory agent. Extensive search of scientific publications was performed (studies in animal models, cellular, clinical trials and reviews) in the following specialized electronic databases: PubMed Cen- tral (PMC)-NBCI, Elsevier Journal, Scielo Spain, Scirus, Science Direct, to establish the current state of the potential effect of astaxanthin on the control of certain diseases. It has shown its effect (in cellular lines and animals) against cancer, chronic inflammatory diseases, metabolic syndromes, cardiovascular diseases, gastrointestinal and liver diseases, neurodegenerative diseases, eye diseases, skin diseases and kidney failure. Astaxanthin was tested in humans showing better antioxidant and antiinflammatory parameters, decrease in reactive oxygen species and improve in ratio of blood lipids. Also, improved visual acuity and macular degeneration, increased exercise endurance, and improved male fertility. Clinical studies performed so far have not shown adverse effects, and it was found that its bioavailability is satisfactory, so astaxanthin could be used as preventive therapy for the prevention of diseases. We have a polymedicated society and the use of active principles derivated from food, such as the astaxanthin may be a good alternative or compleme

Published
2012

37. Risk of malnutrition in people older than 75 years

Author

Valls, Teresa, Mach Casellas, Nuria, Inst Int Postgrau, Area Ciencies Salut, UOC, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Malnutrition risk, Elderly people, Mini Nutritional Assessment test
Abstract

Background and objetives: Population aging has emerged as a major demographic trend worldwide. The objective of the present research was to study the risk of malnutrition in elderly patients older than 75 years that lived without relatives younger than them, and also to understand the effect of sex and age on nutritional status, as well as the anthropometric resulting values. Subjects and methods: A total of 63 patients older than 75 years were studied. The nutritional status was evaluated using the Mini Nutritional Assessment test. Results: Overall, 22% of the studied population presented a high risk of malnutrition. Although the sex did not affect the nutritional status of studied patients, the age significantly influenced it. Conclusions: Patients older than 81 years demonstrated a greater risk of malnutrition, suggesting the necessity of personalized nutrition strategies to improve their quality of life and reduce the prevalence of related-diseases. (C) 2011 Elsevier Espana, S.L. All rights reserved.

Published
2012

38. Flavonoides como agentes quimiopreventivos y terapéuticos contra el cáncer de pulmón

Author

Cabrera, Albert, Mach Casellas, Nuria, Àrea de Ciències de la Salut, Institut Internacional de Postgrau, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

The objective of the present review is to study the relationship between flavonoids and lung cancer, proposing that their regular consumption in Western diets could be beneficial for protecting patients against lung cancer.An extensive search of the scientific literature was performed in the following electronic specialized databases (PubMed central (PMC)-NBCI, Elsevier Journal, SciELO Spain, Scirus, Science Direct), including studies in animals, cells, and humans, in order to establish the effect of flavonoids in the prevention and development of lung cancer.Although in vitro and animal studies show the potential ability of flavonoids to act against different types of cancers, especially against lung cancers, the diverse results reported within epidemiological studies, together with the lack of experiments in humans, are the major factors in limiting making dietary recommendations based on scientific evidence for the management of patients with lung cancer. Therefore, the authors of the present study recommend following the dietary health practice guidelines which promotes the consumption of food enriched in flavonoids and reflects the current state of knowledge of an effective and appropriate diet in lung cancer patients.

Published
2012

39. Efecto de los probióticos en el control de la obesidaden humanos: hipótesis no demostradas

Author

Arias, Amparo, Mach Casellas, Nuria, Àrea de Ciències de la Salut, Institut Internacional de Postgrau, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

The objective of the present study is to review the different publications associated with probiotics and obesity, as well as to get some new insights regarding the role of the microbiome in diseases such as obesity.An extensive search for scientific publications (studies in animal models, cells, clinical trials and reviews) was performed in the following specialist computer databases (PubMed central (PMC)-NBCI, Elsevier Journal, Scielo Spain, Scirus, Science Direct) to establish the current status of the potential effect of probiotics in the control of obesity in humans, as well as the relationship between intestinal microbiota and obesity. The intestinal microbiota and oral probiotics have a positive effect on human health, as they can regulate the immune functions and protect from infections and chronic inflammatory processes. Although divergent results have recently been reported, it has been shown but not confirmed that intestinal microbiota might play a role as a new factor associated with the regulation of body weight and obesity-related diseases. The international MetaHIT project has shown that human microbiome populations can be grouped into three different enterotypes. Two of these enterotypes (Bacteroides and Ruminococcus) seem to encode functions related to obesity. Although the relationship between intestinal microbiota and obesity are not yet well established, the attempt to manipulate intestinal microbiota through diet is suggested as a new plausible approach to prevent, or modify the risk of, obesity and its related diseases. More clinical studies in humans are required to clarify the possible effect of probiotics on obesity.

Published
2012

40. Blood transcriptome as an emerging molecular phenotype to refine immune traits in pig

Author

Mach Casellas, Nuria, Gao, Yu, Lemonnier, Gaetan, Lecardonnel, Jerôme, Estelle Fabrellas, Jordi, Gaillard, Claire, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

absent

Published
2011

41. Microbial spoilage and quality of marinated dark, firm, dry meat

Author

Mach Casellas, Nuria and Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca

Subjects
Carn – Microbiologia, Carn – Conservació
Abstract

Estudi elaborat a partir d’una estada al Royal Veterinary and Agricultural University of Denmark entre els mesos de Març a Juny del 2006. S’ha investigat l’efecte dels envasats amb atmosferes modificades (MAP), així com la marinació amb vi tint, sobre l’evolució de la contaminació bacteriològica de carns fosques, dures i seques (DFD). Les carns DFD es troben a les canals d’animals que, abans del sacrifici, han estat exposades a activitats musculars prolongades o estrès. Les carns DFD impliquen importants pèrdues econòmiques degut a la contaminació bacteriològica i als problemes tecnològics relacionats amb la alta capacitat de retenció d’aigua. A més a més, és crític per la indústria investigar la diversitat de la contaminació bacteriana, identificar les espècies bacterianes i controlar-les. Però és difícil degut a la inhabilitat per detectar algunes bactèries en medis coneguts, les interaccions entre elles, la complexitat dels tipus de contaminació com són aigua, terra, femtes i l’ambient. La Polymerasa chain reaction- Denaturating Electrophoresis Gel (PCR-DGEE ) pot sobrepassar aquests problemes reflectint la diversitat microbial i les espècies bacterianes. Els resultants han indicat que la varietat bacteriana de la carn incrementava amb els dies d’envasat independentment del mètode d’envasat, però decreixia significativament amb el tractament de marinació amb vi tint. La DGEE ha mostrat diferències en les espècies trobades, indicant canvis en la contaminació bacteriana i les seves característiques en la carn DFD sota els diferents tractaments. Tot i que la marinació és una bona alternativa i solució a la comercialització de carn DFD , estudis de seqüenciació són necessaris per identificar les diferents tipus de bactèries. Report for the scientific sojourn at the Royal Veterinary and Agricultural University of Denmark from March until June 2006. The effects of modified atmosphere packaging (MAP), as well as red wine marination on evolution of bacteriological spoilage in dark, firm and dry beef meat (DFD) have been investigated. The DFD meat is found in carcasses from animals which, before slaughter, have undergone prolonged muscular activity or stress. The DFD implicates important economic losses due to the bacteriological spoilage and technological problems related to high water-holding capacity. Moreover, it is critical for meat industry to investigate contaminating bacteria diversity and identify the bacterium species and then control them. But it is very difficult to do this due to inability to detect some bacteria on the know media, the interactions between bacterium species, the complexity of sources contamination such as water, soil, feces and environment. The Polymerasa chain reaction- Denaturating Electrophoresis Gel (PCR- DGEE ) can overcome these problems by reflecting the microbial diversity and bacteria species. The results indicated that the bacterial diversity of meat increased with storage time regardless of packaging method, but decreased significantly with red wine marination treatment. The DGEE technique indicated differences in the species found, indicating changes of the contaminating bacteria and their characteristics in DFD meat under different treatment. Although marination is a good alternative and solution for DFD meat commercialization, sequence studies are necessary to identify the different types of bacteria.

Published
2007

42. Exercise-induced stress behavior, gut-microbiota-brain axis and diet: a systematic review for athletes

Author

Núria Mach, Allison Clark, Health Science Department, Universitat Oberta de Catalunya (UOC), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Universitat Oberta de Catalunya [Barcelona] (UOC), and Mach Casellas, Nuria

Subjects
0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Review, Gut flora, Esportistes -- Alimentació, atleta, stress, Ruminococcus gnavus, ejercicio, Gastrointestinal tract, Nutrition and Dietetics, exercise, biology, dieta, estrés, Microbiota, Gastrointestinal Microbiome, Brain, Neurotransmitters, neurotransmissors, exercici, athlete, estrès, Athletes -- Nutrition, Deportistas -- Alimentación, Athletic Performance, Stress, neurotransmitters, comportamiento, comportament, 03 medical and health sciences, Immune system, Athlete, microbiota, Humans, Endocrine system, Behaviour, Exercise, Diet, Athletes, Probiotics, biology.organism_classification, Hormones, Sports Nutritional Physiological Phenomena, behaviour, Gastrointestinal Tract, 030104 developmental biology, Food, Immunology, neurotransmisores, diet, Stress, Psychological, Food Science, Hormone
Abstract

Fatigue, mood disturbances, under performance and gastrointestinal distress are common among athletes during training and competition. The psychosocial and physical demands during intense exercise can initiate a stress response activating the sympathetic-adrenomedullary and hypothalamus-pituitary-adrenal (HPA) axes, resulting in the release of stress and catabolic hormones, inflammatory cytokines and microbial molecules. The gut is home to trillions of microorganisms that have fundamental roles in many aspects of human biology, including metabolism, endocrine, neuronal and immune function. The gut microbiome and its influence on host behavior, intestinal barrier and immune function are believed to be a critical aspect of the brain-gut axis. Recent evidence in murine models shows that there is a high correlation between physical and emotional stress during exercise and changes in gastrointestinal microbiota composition. For instance, induced exercise-stress decreased cecal levels of Turicibacter spp and increased Ruminococcus gnavus, which have well defined roles in intestinal mucus degradation and immune function. Diet is known to dramatically modulate the composition of the gut microbiota. Due to the considerable complexity of stress responses in elite athletes (from leaky gut to increased catabolism and depression), defining standard diet regimes is difficult. However, some preliminary experimental data obtained from studies using probiotics and prebiotics studies show some interesting results, indicating that the microbiota acts like an endocrine organ (e.g. secreting serotonin, dopamine or other neurotransmitters) and may control the HPA axis in athletes. What is troubling is that dietary recommendations for elite athletes are primarily based on a low consumption of plant polysaccharides, which is associated with reduced microbiota diversity and functionality (e.g. less synthesis of byproducts such as short chain fatty acids and neurotransmitters). As more elite athletes suffer from psychological and gastrointestinal conditions that can be linked to the gut, targeting the microbiota therapeutically may need to be incorporated in athletes' diets that take into consideration dietary fiber as well as microbial taxa not currently present in athlete's gut. La fatiga, las alteraciones del estado de ánimo, el bajo rendimiento y el malestar gastrointestinal son comunes entre los atletas durante el entrenamiento y la competición. Las demandas psicosociales y físicas durante el ejercicio intenso pueden iniciar una respuesta al estrés activando los ejes simpático-adreno-medular e hipotálamo-hipófiso-suprarrenal (HPA), lo que resulta en la liberación de estrés y hormonas catabólicas, citoquinas inflamatorias y moléculas microbianas. El intestino es el hogar de trillones de microorganismos que tienen un papel fundamental en muchos aspectos de la biología humana, incluyendo el metabolismo, la función endocrina, neuronal e inmune. Se cree que el microbioma intestinal y su influencia en el comportamiento del huésped, la barrera intestinal y la función inmune son un aspecto crítico del eje cerebro-intestino. La evidencia reciente en modelos murinos muestra que existe una alta correlación entre el estrés físico y emocional durante el ejercicio y los cambios en la composición de la microbiota gastrointestinal. Por ejemplo, el estrés inducido por el ejercicio disminuyó los niveles cecales de Turicibacter spp y aumentó Ruminococcus gnavus, que tienen papeles bien definidos en la degradación del moco intestinal y la función inmune. Se sabe que la dieta modula drásticamente la composición de la microbiota intestinal. Debido a la considerable complejidad de las respuestas de estrés en los atletas de élite (desde el intestino permeable hasta el aumento del catabolismo y la depresión), la definición de regímenes de dieta estándar es difícil. Sin embargo, algunos datos experimentales preliminares obtenidos de estudios que usan probióticos y estudios prebióticos muestran algunos resultados interesantes, que indican que la microbiota actúa como un órgano endocrino (por ejemplo, secretando serotonina, dopamina u otros neurotransmisores) y pueden controlar el eje HPA en atletas. Lo que es preocupante es que las recomendaciones dietéticas para atletas de élite se basan principalmente en un bajo consumo de polisacáridos de plantas, lo que está asociado con una diversidad y funcionalidad de microbiota reducida (por ejemplo, menos síntesis de subproductos como ácidos grasos de cadena corta y neurotransmisores). A medida que más atletas de élite sufren condiciones psicológicas y gastrointestinales que pueden vincularse con el intestino, es posible que sea necesario incorporar terapéuticamente la microbiota terapéuticamente en las dietas de los atletas que toman en consideración la fibra dietética y los taxones microbianos que actualmente no están presentes en el intestino del atleta.c La fatiga, les alteracions de l'estat d'ànim, el baix rendiment i el malestar gastrointestinal són comuns entre els atletes durant l'entrenament i la competició. Les demandes psicosocials i físiques durant l'exercici intens poden iniciar una resposta a l'estrès activant els eixos simpàtic-adreno-medul·lar i hipotàlem-hipòfiso-adrenal (HPA), el que resulta en l'alliberament d'estrès i hormones catabòliques, citoquines inflamatòries i molècules microbianes . L'intestí és la llar de trilions de microorganismes que tenen un paper fonamental en molts aspectes de la biologia humana, incloent el metabolisme, la funció endocrina, neuronal i immune. Es creu que el microbioma intestinal i la seva influència en el comportament de l'hoste, la barrera intestinal i la funció immune són un aspecte crític de l'eix cervell-intestí. L'evidència recent en models murins mostra que hi ha una alta correlació entre l'estrès físic i emocional durant l'exercici i els canvis en la composició de la microbiota gastrointestinal. Per exemple, l'estrès induït per l'exercici va disminuir els nivells cecals de Turicibacter spp i va augmentar Ruminococcus gnavus, que tenen papers ben definits en la degradació del moc intestinal i la funció immune. Se sap que la dieta modula dràsticament la composició de la microbiota intestinal. A causa de la considerable complexitat de les respostes d'estrès en els atletes d'elit (des de l'intestí permeable fins a l'augment del catabolisme i la depressió), la definició de règims de dieta estàndard és difícil. No obstant això, algunes dades experimentals preliminars obtingudes d'estudis que fan servir probiòtics i estudis prebiòtics mostren alguns resultats interessants, que indiquen que la microbiota actua com un òrgan endocrí (per exemple, secretant serotonina, dopamina o altres neurotransmissors) i poden controlar l'eix HPA en atletes. El que és preocupant és que les recomanacions dietètiques per a atletes d'elit es basen principalment en un baix consum de polisacàrids de plantes, el que està associat amb una diversitat i funcionalitat de microbiota reduïda (per exemple, menys síntesi de subproductes com a àcids grassos de cadena curta i neurotransmissors). A mesura que més atletes d'elit pateixen condicions psicològiques i gastrointestinals que poden vincular-se amb l'intestí, és possible que sigui necessari incorporar terapèuticament la microbiota terapèuticament en les dietes dels atletes que prenen en consideració la fibra dietètica i els taxons microbians que actualment no estan presents en l'intestí de l'atleta.

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2016

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