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Facultad de Ciencias Médicas y Biológicas. Ciencias en Farmacología Básica The filamentous fungi or mycelial represent to man a biological entity of great impact. These agencies include as major causes of diseases in humans, animals and plants, as well as a source of compounds of pharmacological importance. The study of fungi in general, has been mainly addressed through microscopy techniques, culture, immunoassays and molecular techniques; however, none of these techniques has satisfied all aspects of the need for knowledge and identification of these organisms. So continuing the search for alternative techniques which could provide breakthroughs in the study of mycelial fungi. Capillary electrophoresis is serving as an alternative tool in the analysis of microorganisms, but in general there are few studies regarding electrophoretic fungi. The vast majority of electrophoretic studies have focused primarily yeast and conidia. As this work contributes to the study of filamentous fungi by capillary electrophoresis. As study models Trichoderma atroviride fungi Neurospora crassa and both have in common that they are fast growing filamentous fungi and nonpathogenic were used. Also represents an important Trichoderma atroviride biocontrol agent and phytopathogenic filamentous fungus Neurospora is the model for the study of diverse biological problems. Los hongos filamentosos o miceliares representan para el hombre una entidad biológica de gran impacto. Estos organismos figuran como importantes causales de enfermedades en el hombre, los animales y las plantas, a la vez que constituyen una fuente de compuestos de importancia farmacológica. El estudio de los hongos en general, se ha abordado principalmente a través de técnicas microscopia, cultivo, inmunoensayos y técnicas moleculares; sin embargo, ninguna de estas técnicas ha satisfecho todos los aspectos de la necesidad del conocimiento e identificación de estos organismos. Por lo que continua la búsqueda de técnicas alternativas que puedan aportar avances en el estudio de los hongos miceliares. La electroforesis capilar está sirviendo como una herramienta alternativa en el análisis de microorganismos, pero en general son pocos los estudios electroforéticos que se refieren a los hongos. La gran mayoría de los estudios electroforéticos se han enfocado al primordialmente a hongos levaduriformes y conidias. Por lo que éste trabajo contribuye al estudio de hongos filamentosos por electroforesis capilar. Como modelos de estudio se utilizaron a los hongos Tricoderma atroviride y Neurospora crassa ambos tienen en común que son hongos filamentosos de crecimiento rápido y no patógenos.