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A principal doença da cultura do arroz é a brusone, causada pelo fungo Pyricularia grisea (Cooke) Sacc., que pode apresentar variabilidade genética tanto entre cepas isoladas de diferentes locais ou lesões quanto entre cepas oriundas de uma mesma lesão, indicando o potencial mutativo desse fungo. Por meio de Rep-PCR, baseada no elemento repetitivo Pot-2, foi levantada a variabilidade genética de 64 isolados de P. griseaoriginados de lesões de seis panículas de arroz ‘Epagri 108’. Não houve diferenças genéticas intralesão, porém houve varia bilidade genética interlesão para isolados de uma das panículas, que apresentaram três padrões moleculares distintos, indicando a coexistência, em um mesmo genótipo de arroz, de várias cepas do fungo. Isto pode ter implicações em levantamentos de ocorrência de raças, bem como em trabalhos de melhoramento genético da cultura do arroz para resistência à brusone.