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Le projet CasDar AcID (acidose et indicateurs pour le diagnostic) a débuté en janvier 2014. Son objectif était d’utiliser le profil en acides gras (AG) du lait comme prédicteur des paramètres fermentaires du rumen et donc de l’acidose ruminale subaiguë (ARSA) chez la vache laitière et la chèvre laitière. La quantification de ces profils en routine par spectrométrie moyen infrarouge (MIR) devait permettre, via des enquêtes en élevage, d’estimer la fréquence de l’ARSA dans les troupeaux, d’identifier les animaux les plus sensibles et les pratiques alimentaires à risque, et d’évaluer les effets de l’acidose sur la santé des femelles et leurs performances de production. Chez la vache laitière, le projet a permis de mettre en évidence une relation curvilinéaire entre un ratio d’AG pairs/AG impairs du lait et le rapport acétate sur propionate (C2/C3) du jus de rumen. Une équation spécifique a été développée à partir des spectres MIR afin de pouvoir estimer ce rapport en routine, avec une précision satisfaisante (R² = 0.82). En chèvres laitière, aucune relation nette entre les AG du lait et les paramètres fermentaires du rumen n’a été mise en évidence, et l’estimation directe des paramètres fermentaires par spectrométrie MIR n’a pas été concluante. L’enquête en élevage a été de type cas / témoin en bovins où 60 troupeaux ont été recrutés sur la base du profil en AG du lait et du ratio TB/TP (Taux Butyreux/Taux Protéique). En caprins, 94 enquêtes ont été valorisées dans des élevages recrutés sur la base de leur conduite alimentaire. Les résultats de ces enquêtes convergent entre espèces : le faible nombre de cas d’ARSA observés ou suspectés dans les troupeaux enquêtés confirment les facteurs de risques déjà connus, et montrent que la stratégie de prévention de l’ARSA encouragée dans les élevages fonctionne., The AcID (acidosis and diagnosis indicators) project was funded by CasDar and began in January 2014. The aim of the project was to use milk fatty acids profile to predict ruminal fermentations and subacute ruminal acidosis (SARA). The estimation of milk fatty acids profiles in routine using mid infrared (MIR) spectroscopy coupled with field surveys were supposed to make it possible to calculate SARA [br/] frequency in dairy cows herds and dairy goats flocks. This method was also supposed to make it possible to identify sensitive animals and risky feeding practices, and to evaluate the effects of SARA on animal health and milk production. In dairy cows, a curvilinear relationship between even to odd fatty acids ratio in milk and ruminal acetate to propionate (C2/C3) ratio has been brought to light. Milk MIR spectra were used to build an equation to estimate C2/C3 ratio in routine with quite good precision (R² = 0.82). In dairy goats, no relationship between milk fatty acids and ruminal fermentation parameters has been highlighted, and the estimation of fermentation parameters directly from MIR spectra was not precise enough. A case-control survey was led in 60 dairy cows herds which were recruited on the basis of their milk fatty acids profile and fat to protein ratio. 94 field surveys were conducted in dairy goats flocks on the basis of their feeding practices. Results from the surveys are similar between species: very few SARA cases were observed or suspected, the feeding practises identified as risky were already known, and the strategy used to prevent SARA is working quite well.

Ce volume regroupe les textes issus du programme Casdar "Innovation et Partenariat" et "Recherche finalisée et innovation" de 2013. Le colloque de restitution s’est déroulé le 6 février 2019 sous l’égide du GIS Relance Agronomique; The AcID (acidosis and diagnosis indicators) project was funded by CasDar and began in January 2014.The aim of the project was to use milk fatty acids profile to predict ruminal fermentations and subacuteruminal acidosis (SARA). The estimation of milk fatty acids profiles in routine using mid infrared (MIR)spectroscopy coupled with field surveys were supposed to make it possible to calculate SARA frequency in dairy cows herds and dairy goats flocks. This method was also supposed to make itpossible to identify sensitive animals and risky feeding practices, and to evaluate the effects of SARA onanimal health and milk production. In dairy cows, a curvilinear relationship between even to odd fattyacids ratio in milk and ruminal acetate to propionate (C2/C3) ratio has been brought to light. Milk MIRspectra were used to build an equation to estimate C2/C3 ratio in routine with quite good precision (R² =0.82). In dairy goats, no relationship between milk fatty acids and ruminal fermentation parameters hasbeen highlighted, and the estimation of fermentation parameters directly from MIR spectra was notprecise enough. A case-control survey was led in 60 dairy cows herds which were recruited on the basisof their milk fatty acids profile and fat to protein ratio. 94 field surveys were conducted in dairy goatsflocks on the basis of their feeding practices. Results from the surveys are similar between species: veryfew SARA cases were observed or suspected, the feeding practises identified as risky were alreadyknown, and the strategy used to prevent SARA is working quite well.; Le projet CasDar AcID (acidose et indicateurs pour le diagnostic) a débuté en janvier 2014. Son objectifétait d’utiliser le profil en acides gras (AG) du lait comme prédicteur des paramètres fermentaires durumen et donc de l’acidose ruminale subaiguë (ARSA) chez la vache laitière et la chèvre laitière. Laquantification de ces profils en routine par spectrométrie moyen infrarouge (MIR) devait permettre, viades enquêtes en élevage, d’estimer la fréquence de l’ARSA dans les troupeaux, d’identifier les animauxles plus sensibles et les pratiques alimentaires à risque, et d’évaluer les effets de l’acidose sur la santédes femelles et leurs performances de production. Chez la vache laitière, le projet a permis de mettreen évidence une relation curvilinéaire entre un ratio d’AG pairs/AG impairs du lait et le rapport acétatesur propionate (C2/C3) du jus de rumen. Une équation spécifique a été développée à partir desspectres MIR afin de pouvoir estimer ce rapport en routine, avec une précision satisfaisante (R² = 0.82).En chèvres laitière, aucune relation nette entre les AG du lait et les paramètres fermentaires du rumenn’a été mise en évidence, et l’estimation directe des paramètres fermentaires par spectrométrie MIR n’apas été concluante. L’enquête en élevage a été de type cas / témoin en bovins où 60 troupeaux ont étérecrutés sur la base du profil en AG du lait et du ratio TB/TP (Taux Butyreux/Taux Protéique). Encaprins, 94 enquêtes ont été valorisées dans des élevages recrutés sur la base de leur conduitealimentaire. Les résultats de ces enquêtes convergent entre espèces : le faible nombre de cas d’ARSAobservés ou suspectés dans les troupeaux enquêtés confirment les facteurs de risques déjà connus, etmontrent que la stratégie de prévention de l’ARSA encouragée dans les élevages fonctionne.

Chez les petits ruminants, les outils d’intervention et corolairement de gestion en matière d’infections mammaires, doivent être repensés en tenant compte de leurs spécificités sur le plan animal (étiologie, réponse cellulaire, caractéristiques morphologiques et fonctionnelles) comme de conduite d’élevage, d’équipement ou d’organisation du travail. L’étude s’est attachée à intégrer les apports de l’observation en élevage, élément central du travail des éleveurs et des techniciens, et différentes solutions technologiques ou enregistrements automatisés, disponibles ou en développement, sur le plan diagnostique (bactériologie moléculaire, comptages cellulaires, spectres en moyen infra-rouge, examen clinique de la mamelle) et sur le plan de l’aptitude et des conditions de traite (recours aux enregistrements de cinétiques d’éjection du lait, de fluctuations de vide, de thermographie). Dans un contexte de réduction de l’usage des antibiotiques, des critères de sélection des animaux à traiter (ou réformer) ont été proposés. Des phénotypes ont été explorés en vue d’une meilleure appréhension des facteurs de risque associés à la traite. Enfin, après étude des caractères et simulations en termes de progrès génétique et d’impact économique, l’inclusion de nouveaux caractères dans les schémas de sélection a été réalisée (cellules) ou proposée en vue d’une amélioration de la résistance des animaux aux infections mammaires.