Author: "Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB)" - Searchworks@Jio Institute Digital Library Search Results

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1. Modelling the spatial and temporal variability of the SW lagoon of New Caledonia II: Realistic 3D simulations compared with in situ data

Author: Vincent Faure, Jean-Pascal Torréton, Christel Pinazo, Pascal Douillet, OPLC, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie et de biogéochimie (LOB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PNEC Nouvelle-Calédonie, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'océanographie et de biogéochimie ( LOB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), and Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Geologic Sediments, Time Factors, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Irradiance, Oceanography, 01 natural sciences, BACTERIOPLANKTON GROWTH, media_common, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 3-DIMENSIONAL MODEL, geography.geographical_feature_category, GREAT-BARRIER-REEF, Physics, Coral reef, Lagoon, Biogeochemistry, Pollution, Seasons, PHYTOPLANKTON BIOMASS, Water Microbiology, CORAL-REEF LAGOON, SUSPENDED-SEDIMENT TRANSPORT, Coupled models, Biogeochemical cycle, media_common.quotation_subject, WATER RESIDENCE TIME, Aquatic Science, Bacterial Physiological Phenomena, HYDRODYNAMIC TIME PARAMETERS, New Caledonia, Computer Simulation, Seawater, Ecosystem, SENSITIVITY ANALYSIS, 14. Life underwater, 0105 earth and related environmental sciences, geography, 010604 marine biology & hydrobiology, Sediment, Models, Theoretical, 15. Life on land, 13. Climate action, Phytoplankton, Spatial variability, SOUTH-WEST LAGOON
Abstract: Coral reef lagoons are under the growing influence of anthropogenic activities, leading to increasing loads of nutrients and various contaminants. Modelling approaches are a useful tool for studying such a complex coastal environment. In this study, we carried out the development of a three-dimensional coupled hydrodynamical-biogeochemical model of the south-west lagoon of New Caledonia. The biogeochemical model presented in Faure et al. (2006, 2010) was dynamically coupled with a hydrodynamical model (MARS3D) in order to study the short-term variability of the ecosystem. Two simulations (in winter and summer) were then performed from measured initial conditions using realistic wind and irradiance conditions and river inputs. Examinations of the biogeochemical response to these transient meteorological conditions were presented and compared with temporal field data corresponding to the considered periods. Results highlighted the ecosystem functioning, based on the balance of hydrodynamical and biogeochemical processes. Influence of urban and terrigeneous inputs were limited to the coastal zone. The model accurately reproduced the measured Chl.a and bacterial production, highlighting the improvement made on the biogeochemical model. However, the underestimation of some variables in model outputs, in particular nutrients, led us to focus on different inputs, such as sediment inputs which were not taken into account or properly estimated. Moreover, the role of boundary waters appeared crucial and suggested a calibration effort. Last, the final aim of our modelling study will help the development of a useful tool for studying the key processes of the ecosystem of the south-west lagoon of New Caledonia, as well as the examination of the biogeochemical response under different scenarios. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Published: 2010
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2. The Management of Mediterranean Coastal Habitats: A Plea for a Socio-ecosystem-Based Approach

Author: Mireille Harmelin-Vivien, Daniel Faget, Thierry Thibaut, Thomas Changeux, Jean Blanchot, Richard Sempéré, Sandrine Ruitton, Vanina Pasqualini, Charles-François Boudouresque, Marc Pagano, Adrien Goujard, Aurelie Blanfuné, Francois Carlotti, Daniela Bănaru, Michèle Perret-Boudouresque, Elodie Rouanet, Delphine Thibault, Patrick Astruch, Laurence Le Direach, Diversité, évolution et écologie fonctionnelle marine (DIMAR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Institut Pythéas (OSU PYTHEAS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), UR CYROCO (IRD/ARVAM), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU), Sciences pour l'environnement (SPE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pascal Paoli (UPP), GIS Posidonie, Ecosystèmes Côtiers Marins et Réponses aux Stress (ECOMERS), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Ecologie Marine et BIOdiversité (EMBIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Temps, espaces, langages Europe méridionale-Méditerranée (TELEMME), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Réunion]), Université Pascal Paoli (UPP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ICEMASA, University of Cape Town, Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Hubert-Jean Ceccaldi, Yves Hénocque, Teruhisa Komatsu, Patrick Prouzet, Benoit Sautour, and Jiro Yoshida
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biodiversity, Mediterranean, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Marine ecosystem, Ecosystem, 14. Life underwater, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, biodiversity, Abiotic component, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Pelagic zone, 15. Life on land, environmentalist lobbies, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, Habitat, 13. Climate action, Benthic zone, [SDE]Environmental Sciences, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, socio-ecosystem, management, Global biodiversity
Abstract: International audience; Biodiversity is often defined erroneously as the number of species. The higher the number of species, the better the status or the health of a habitat is considered to be. Managers, stakeholders and environmentalists worldwide often prioritize the ‘species approach’. The protection of an iconic and endearing species is obviously easier than that of tiny zooplankton species, although the latter may play a far more important role than the former in the functioning of healthy ecosystems. The species approach has been widely favoured compared to the ecosystem approach. However, ‘species-by-species’ management is unrealistic. The problem is that the management of natural habitats is often driven by environmentalist lobbies on the basis of taxonomy (e.g. mammals, turtles, birds, iconic fish, flowering plants, etc.) and disciplinary lobbies (biology, benthos, pelagos, contaminants, currents, etc.). Ecosystems are units of biological and spatial organization that include all the organisms, their interactions, the functional compartments they belong to, along with the components of the abiotic environment. The concept of the socio-ecosystem is useful insofar as it emphasizes the fact that man is part of ecosystems. Here, the authors make use of four case studies, in the Mediterranean Sea, in an attempt to demonstrate the interest of a comprehensive, socio-ecosystem-based approach in the field of environmental management. They also highlight the importance of tackling the coupling between benthic and pelagic ecosystems and between terrestrial and marine ecosystems.
Published: 2020
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3. Spatial variability in Sediment Oxygen Consumption under winter conditions in a lagoonal system in New Caledonia (South Pacific)

Author: Laurent Chauvaud, Lionel Denis, Christian Grenz, Olivier Pringault, Guy Boucher, Renaud Fichez, Jacques Clavier, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), and Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 0106 biological sciences, Biogeochemical cycle, mineralisation, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, MINERALISATION, Aquatic Science, Biology, SEDIMENT, 01 natural sciences, LAGON, Sediment–water interface, oxygen fluxes, 14. Life underwater, Transect, Reef, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, Total organic carbon, geography, geography.geographical_feature_category, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, MATIERE ORGANIQUE, Sediment, OXYGENE, RECIF CORALLIEN, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Oceanography, Benthic zone, Spatial variability, coral reefs
Abstract: Sediment Oxygen Consumption (SOC) was investigated during a winter (Southern Hemisphere) cruise in the southwest lagoon of New Caledonia. Oxygen fluxes were measured at 11 sampling stations distributed along two coast to reef transects. Three different methods of flux measurements were used: diver-operated benthic chambers, laboratory incubation of sediment cores and oxygen microprofiles determinations. SOC values varied between 450 and 2250 μmol O2 m−2 h−1. The level of agreement between the three techniques strongly varied as a function of sediment type. Most of the SOC values from the grey sand zone in the middle part of the lagoon and the muddy bottoms of the bays did not show significant differences. A central station presenting a dense seagrass bed gave lower SOC determined by oxygen microprofiles compared to the two other methods. In coarse carbonated sands from the back reef area, SOC measured by in situ benthic chambers were higher than SOC measured by incubation techniques. This discrepancy could be explained by physical disturbance of the sediments, macroscale variability in benthic communities or technical efficiency of the sediment sampling device and probably by a combination of all three processes. Nevertheless, for the other sediment types that represented 85% of the lagoon bottoms, the results from the three techniques used for SOC determination were strongly convergent. Based on this assumption, it could be stated that the oxygen fluxes were essentially driven by microbial activity compared to biologically mediated vertical transport of solutes. The SOC values determined during this study were in agreement with budgets previously calculated for the lagoon. Regardless of the back reef area, spatial variability in SOC can be explained by the organic matter content of sediments which clearly showed a coast to reef gradient with higher organic carbon and nitrogen contents in the coastal sediments. The C/N ratios demonstrate the higher rate of freshly deposited organic matter near the coast compared to more central stations in the lagoon.
Published: 2003
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4. Benthic biogeochemistry: state of the art technologies and guidelines for the future of in situ survey

Author: Christophe Rabouille, Steve G. Roberts, Anders Tengberg, Se Apitz, Martial Taillefert, Gwénaëlle Chaillou, Jl Morford, Eric Viollier, Per O. J. Hall, Christian Grenz, Ursula Witte, Felix Janssen, T Shimmield, E. Breuer, Frank Wenzhöfer, Karine Dedieu, Jean-Christophe Poggiale, Yoko Furukawa, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines ( LMGEM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Océan et Interfaces (OCEANIS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2
Subjects: 0106 biological sciences, Biogeochemical cycle, 010504 meteorology & atmospheric sciences, gel peepers, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Earth science, microelectrodes, Aquatic Science, Biology, 01 natural sciences, Lead (geology), biogeochemistry, Sediment–water interface, optodes, Environmental monitoring, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Seabed, 0105 earth and related environmental sciences, benthic chambers, Ecology, 010604 marine biology & hydrobiology, Biogeochemistry, Sediment, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, sediment, 13. Climate action, Benthic zone, in situ technologies
Abstract: Sediment and water can potentially be altered, chemically, physically and biologically as they are sampled at the seafloor, brought to the surface, processed and analysed. As a result, in situ observations of relatively undisturbed systems have become the goal of a growing body of scientists. Our understanding of sediment biogeochemistry and exchange fluxes was revolutionized by the introduction of benthic chambers and in situ micro-electrode profilers that allow for the direct measurement of chemical fluxes between sediment and water at the sea floor and for porewater composition. Since then, rapid progress in the technology of in situ sensors and benthic chambers (such as the introduction of gel probes, voltammetric electrodes or one- and two-dimensional optodes) have yielded major breakthroughs in the scientific understanding of benthic biogeochemistry. This paper is a synthesis of discussions held during the workshop on sediment biogeochemistry at the "Benthic Dynamics: in situ surveillance of the sediment-water interface" international conference (Aberdeen, UK--March 25-29, 2002). We present a review of existing in situ technologies for the study of benthic biogeochemistry dynamics and related scientific applications. Limitations and possible improvement (e.g., technology coupling) of these technologies and future development of new sensors are discussed. There are countless important scientific and technical issues that lend themselves to investigation using in situ benthic biogeochemical assessment. While the increasing availability of these tools will lead research in yet unanticipated directions, a few emerging issues include greater insight into the controls on organic matter (OM) mineralization, better models for the understanding of benthic fluxes to reconcile microelectrode and larger-scale chamber measurements, insight into the impacts of redox changes on trace metal behavior, new insights into geochemical reaction pathways in surface sediments, and a better understanding of contaminant fate in nearshore sediments.
Published: 2003
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5. Polar Front around the Kerguelen Islands: An up-to-date determination and associated circulation of surface/subsurface waters

Author: Isabelle Durand, Elodie Kestenare, Francesco d'Ovidio, Gilles Rougier, Cédric Cotté, Jae Hak Lee, Meng Zhou, Young-Hyang Park, Austral, Boréal et Carbone (ABC), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Processus de couplage à Petite Echelle, Ecosystèmes et Prédateurs Supérieurs (PEPS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB)
Subjects: 0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Escarpment, Oceanography, 01 natural sciences, Kerguelen, Latitude, Geochemistry and Petrology, Earth and Planetary Sciences (miscellaneous), 14. Life underwater, Southern Ocean, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Polar front, geography, geography.geographical_feature_category, Plateau, 010604 marine biology & hydrobiology, Spring bloom, Plume, Geophysics, Space and Planetary Science, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Polar Front, Bloom, Hydrography, Geology
Abstract: The circulation of iron-rich shelf waters around the Kerguelen Islands plays a crucial role for a climatically important, annually recurrent phytoplankton spring bloom over the sluggish shelf region and its downstream plume area along the Antarctic circumpolar flow. However, there is a long-standing confusion about the Polar Front (PF) in the Kerguelen region due to diverse suggestions in the literature for its geographical location with an extreme difference over 10 degrees of latitude. Based on abundant historical hydrographic data, the in situ hydrographic and current measurements during the 2011 KEOPS2 cruise, satellite chlorophyll images, and altimetry-derived surface velocity fields, we determine and validate an up-to-date location of the PF around the Kerguelen Islands. Artificial Lagrangian particle trajectories computed from altimetric velocity time series are analyzed for the possible pathways and sources of different surface/subsurface waters advected into the chlorophyll bloom area east off the islands studied during the KEOPS2 cruise. The PF location determined as the northernmost boundary of the Winter Water colder than 2 degrees C, which is also associated with a band of strong currents, appears to be primarily controlled by topography. The PF rounds the Kerguelen Islands from the south to deflect northward along the eastern escarpment up to the northeastern corner of the Kerguelen Plateau before making its southward retroflection. It is shown that the major surface/subsurface waters found within the deep basin east of the Kerguelen Islands originate from the shelf around the Heard Island, rather than from the shallow shelf north of the Kerguelen Islands.
Published: 2014
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6. Wicked Social-Ecological Problems Forcing Unprecedented Change on the Latitudinal Margins of Coral Reefs : the Case of Southwest Madagascar

Author: Martine Rodier, J. Henrich Bruggemann, Tim R. McClanahan, Joshua E. Cinner, Serge Andréfouët, Mireille Guillaume, Robert Arfi, Jens Zinke, Michel Pichon, Faravavy Rasoamanendrika, Frédéric Ramahatratra, Laboratoire d'Ecologie Marine (ECOMAR), Université de La Réunion (UR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Histoire naturelle de l'Homme préhistorique (HNHP), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)
Subjects: CONSERVATION DE LA NATURE, 0106 biological sciences, Marine conservation, 010504 meteorology & atmospheric sciences, QH301-705.5, Climate change, adaptation, Biology, migration, 01 natural sciences, EXPLOITATION DES RESSOURCES NATURELLES, FACTEUR ANTHROPIQUE, SYSTEME DE REPRESENTATIONS, POLITIQUE DE L'ENVIRONNEMENT, POLLUTION MARINE, GESTION DE L'ENVIRONNEMENT, Population growth, 14. Life underwater, Biology (General), SURPECHE, Reef, QH540-549.5, solutions, 0105 earth and related environmental sciences, PROTECTION DE L'ECOSYSTEME, geography, geography.geographical_feature_category, Ecology, Overfishing, business.industry, GESTION DES PECHES, 010604 marine biology & hydrobiology, Environmental resource management, Coral reef, 15. Life on land, RECIF CORALLIEN, marine resources, climate change, governance, 13. Climate action, Agriculture, FACTEUR CLIMATIQUE, CHANGEMENT CLIMATIQUE, ENQUETE, Fisheries management, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business, GESTION LOCALE
Abstract: High-latitude coral reefs may be a refuge and area of reef expansion under climate change. As these locations are expected to become dryer and as livestock and agricultural yields decline, coastal populations may become increasingly dependent on marine resources. To evaluate this social-ecological conundrum, we examined the Grand Récif of Toliara (GRT), southwest Madagascar, which was intensively studied in the 1960s and has been highly degraded since the 1980s. We analyzed the social and ecological published and unpublished literature on this region and provide new data to assess the magnitude of the changes and evaluate the causes of reef degradation. Top-down controls were identified as the major drivers: human population growth and migrations, overfishing, and climate change, specifically decreased rainfall and rising temperature. Water quality has not changed since originally studied, and bottom-up control was ruled out. The identified network of social-ecological processes acting at different scales implies that decision makers will face complex problems that are linked to broader social, economic, and policy issues. This characterizes wicked problems, which are often dealt with by partial solutions that are exploratory and include inputs from various stakeholders along with information sharing, knowledge synthesis, and trust building. A hybrid approach based on classical fishery management options and preferences, along with monitoring, feedback and forums for searching solutions, could move the process of adaptation forward once an adaptive and appropriately scaled governance system is functioning. This approach has broad implications for resources management given the emerging climate change and multiple social and environmental stresses.
Published: 2012
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7. Marine ecosystems’ responses to climatic and anthropogenic forcings in the Mediterranean

Author: Romaric Verney, William L. Miller, Lars-Eric Heimbürger, Pierre-Laurent Merle, Louis Marie Prieur, Sauveur Belviso, Scott W. Fowler, Frédéric Gazeau, Francois Carlotti, D. Ruiz Pino, Richard Sempéré, Bastien Mérigot, Jean-Christophe Poggiale, Lars Stemmann, Camila Fernandez, David Doxaran, Stéphane Gasparini, Patrice Francour, Marc Tedetti, Sabine Charmasson, Laure Mousseau, Marcel Babin, Jean-Claude Dutay, R. Lemé, Frédéric Diaz, Stéphan Jacquet, F. Van Wambeke, J. L. Gonzalez, Jean-François Ghiglione, Vincent Vantrepotte, P. Le Hir, Hervé Thébault, Christophe Lejeusne, Marc Mallet, X. Durrieu de Madron, Françoise Elbaz-Poulichet, Pulido-Villena, Benedicte Thouvenin, Malik Chami, Pascal Conan, Philippe Koubbi, Claude Estournel, Laurent Mortier, Christian Tamburini, Bruno Charrière, Dominique Lefèvre, Catherine Goyet, Jean-François Rontani, C. Mellon, B. Bonsang, Thierry Moutin, René Galzin, Nathaniel Bensoussan, Vincent Taillandier, Olivier Radakovitch, Jacek Tronczynski, Katell Guizien, Behzad Mostajir, F. Eyrolles, Daniel Cossa, Christophe Rabouille, Frédéric Mélin, Andrew P. Rees, Wade H. Jeffrey, Jordi Dachs, Chrystelle Bancon-Montigny, M. Eléaume, Sandrine Vaz, Laurence Méjanelle, Thierry Perez, Tsuneo Tanaka, Melika Baklouti, J. Para, Christophe Brunet, Ioanna Bouloubassi, Marie-Dominique Loÿe-Pilot, Mireille Pujo-Pay, Caroline Ulses, Anne Petrenko, Sophie Bonnet, Fabrizio D'Ortenzio, Fabien Joux, Franck Touratier, Lionel Guidi, Pierre Testor, Cécile Guieu, Patrick Raimbault, Jean-Francois Cadiou, Marie-Alexandrine Sicre, Christophe Migon, Jean-Claude Gaertner, Isabelle Taupier-Letage, Karine Leblanc, Céline Ridame, Centre de Formation et de Recherche sur les Environnements Méditérranéens (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Insulaire du Vivant et de l'Environnement (LIVE), Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Modélisation et d'Analyses en géo-environnement et santé - Espace Développement (IMAGES-Espace DEV), UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA), Sorbonne Université (SU), Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - 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Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Austral Boréal (AB), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), Image, Modélisation, Analyse, GEométrie, Synthèse (IMAGES), Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Télécom Paris-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Télécom Paris, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Atlantique (IFREMER Atlantique), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie des organismes marins et écosystèmes (BOME), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - 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Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université Montpellier 1 (UM1), Paléoclimats, proxies, processus ( PALEOPROXUS ), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques ( LOCEAN ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Couplage physique-biogéochimie-carbone ( PHYBIOCAR ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ipso Facto ScopARL, Association Arkaeos, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), CNRS UMR 7057 - Laboratoire Matières et Systèmes Complexes (MSC) (MSC), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)
Subjects: 0106 biological sciences, Mediterranean climate, Biogeochemical cycle, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Biodiversity, Climate change, [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Aquatic Science, 01 natural sciences, [ SDU.STU.GP ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], Mediterranean sea, [ PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH ] Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Marine ecosystem, Ecosystem, 14. Life underwater, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010604 marine biology & hydrobiology, Geology, Global change, 15. Life on land, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Oceanography, 13. Climate action, Climatology, Environmental science
Abstract: Corrigendum : https://doi.org/10.1016/j.pocean.2011.08.003; International audience; The semi-enclosed nature of the Mediterranean Sea, together with its smaller inertia due to the relative short residence time of its water masses, make it highly reactive to external forcings, in particular variations of water, energy and matter fluxes at the interfaces. This region, which has been identified as a “hotspot” for climate change, is therefore expected to experience environmental impacts that are considerably greater than those in many other places around the world. These natural pressures interact with the increasing demographic and economic developments occurring heterogeneously in the coastal zone, making the Mediterranean even more sensitive. This review paper aims to provide a review of the state of current functioning and responses of Mediterranean marine biogeochemical cycles and ecosystems with respect to key natural and anthropogenic drivers and to consider the ecosystems’ responses to likely changes in physical, chemical and socio-economical forcings induced by global change and by growing anthropogenic pressure at the regional scale. The current knowledge on and expected changes due to single forcing (hydrodynamics, solar radiation, temperature and acidification, chemical contaminants) and combined forcing (nutrient sources and stoichiometry, extreme events) affecting the biogeochemical fluxes and ecosystem functioning are explored. Expected changes in biodiversity resulting from the combined action of the different forcings are proposed. Finally, modeling capabilities and necessity for modeling are presented. A synthesis of our current knowledge of expected changes is proposed, highlighting relevant questions for the future of the Mediterranean ecosystems that are current research priorities for the scientific community. Finally, we discuss how these priorities can be approached by national and international multi-disciplinary research, which should be implemented on several levels, including observational studies and modeling at different temporal and spatial scales.
Published: 2011
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8. Gradients in intact polar diacylglycerolipids across the Mediterranean Sea are related to phosphate availability

Author: Thierry Moutin, Claude Courties, L. E. Sofen, Louise Oriol, B. A. S. Van Mooy, Anna Lagaria, Mireille Pujo-Pay, Kimberly J. Popendorf, Tsuneo Tanaka, Pascal Conan, Woods Hole Oceanographic Institution ( WHOI ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Microbienne ( LOMIC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hellenic Center for Marine Research ( HCMR ), Laboratoire d'océanographie biologique de Banyuls ( LOBB ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Marine Chemistry and Geochemistry ( WHOI ), Centre d'océanologie de Marseille ( COM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Woods Hole Oceanographic Institution (WHOI), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hellenic Centre for Marine Research (HCMR), Laboratoire d'océanographie biologique de Banyuls (LOBB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Marine Chemistry and Geochemistry (WHOI), Centre d'océanologie de Marseille (COM), Hellenic Center for Marine Research (HCMR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Mediterranean climate, 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Phospholipid, lcsh:Life, Biology, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Nutrient, Mediterranean sea, lcsh:QH540-549.5, Phytoplankton, Botany, Earth Science, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Earth-Surface Processes, 0105 earth and related environmental sciences, 010604 marine biology & hydrobiology, lcsh:QE1-996.5, fungi, Plankton, Phosphate, lcsh:Geology, lcsh:QH501-531, chemistry, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Environmental chemistry, lipids (amino acids, peptides, and proteins), lcsh:Ecology, Microcosm
Abstract: Intact polar membrane lipids compose a significant fraction of cellular material in plankton and their synthesis imposes a substantial constraint on planktonic nutrient requirements. As a part of the Biogeochemistry from the Oligotrophic to the Ultraoligtrophic Mediterranean (BOUM) cruise we examined the distribution of several classes of intact polar diacylglycerolipids (IP-DAGs) across the Mediterranean, and found that phospholipid concentration as a percent of total lipids correlated with phosphate concentration. In addition, the ratios of non-phosphorus lipids to phospholipids – sulfoquinovosyldiacylglycerol (SQDG) to phosphatidylglycerol (PG), and betaine lipids to phosphatidylcholine (PC) – were also found to increase from west to east across the Mediterranean. Additionally, microcosm incubations from across the Mediterranean were amended with phosphate and ammonium, and in the course of several days nutrient amendments elicited a shift in the ratios of IP-DAGs. These experiments were used to assess the relative contribution of community shifts and physiological response to the observed change in IP-DAGs across the Mediterranean. The ratio of SQDG to chlorophyll $a$ was also explored as an indicator of phytoplankton response to nitrogen availability. This study is the first to demonstrate the dynamic response of membrane lipid composition to changes in nutrients in a natural, mixed planktonic community.
Published: 2011
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9. New Caledonia surface lagoon chlorophyll modeling as coastal reef area health indicator

Author: Pascal Douillet, Rosalie Fuchs, Vincent Faure, Cécile Dupouy, Alain Mangin, Christel Pinazo, OPLC, Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CE, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Frouin, R. (ed.), Yoo, H.R. (ed.), Won, J.S. (ed.), Feng, A. (ed.), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN)
Subjects: DYNAMICS, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Biogeochemical cycle, Software_OPERATINGSYSTEMS, ComputerSystemsOrganization_COMPUTERSYSTEMIMPLEMENTATION, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, CIRCULATION, Physical oceanography, temperature profils, 01 natural sciences, CYCLE BIOGEOCHIMIQUE, MODELE, 010309 optics, LAGON, New Caledonia, OCEAN, biogeochemistry, TEMPORAL VARIABILITY, PHYTOPLANKTON, 0103 physical sciences, Phytoplankton, Bathymetry, ComputerSystemsOrganization_SPECIAL-PURPOSEANDAPPLICATION-BASEDSYSTEMS, SW LAGOON, 14. Life underwater, surface chlorophyll, TEMPERATURE, Reef, FORMULATIONS, ANALYSE DE DONNEES, hydrodynamic, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Hydrology, geography, geography.geographical_feature_category, Biogeochemistry, modeling, SURFACE MARINE, CHLOROPHYLLE, SIMULATIONS, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, SUSPENDED SEDIMENT TRANSPORT, Oceanography, 13. Climate action, 3D coupled model, Environmental science, SOUTH-WEST LAGOON, Eutrophication, Microbial loop
Abstract: The major part of the New Caledonia (NC) lagoon was classified as UNESCO Natural Site of Humanity Patrimony. Indeed, 22 175 km(2) of tropical coral lagoon area exhibit high biodiversity. The NC lagoon is semi enclosed and connected to the Coral Sea through a barrier reef segmented by narrow passes. The environment is oligotrophic, due to important flush during trade winds events, and bathymetry is highly variable. In order to predict eutrophication events, we used an extension of a 3D coupled physical-biogeochemical model recently developed on NC south western lagoon. The model is based on the Nitrogen and Carbon cycles, relating the variable stoechiometry of the elements in each biological compartment. The ecological model was developed to include an explicit description of the microbial loop. The resulting coupled model, forced by tide, wind, light, temperature and freshwater inputs, was used to calculate phytoplankton biomass, bacterial production, dissolved organic matter concentrations and nutrient recycling. Here we present results issued from the 3D coupled model ECO3M_LAGOON (biogeochemical, LOPB-IRD) and MARS3D (regional physical model, IFREMER-IRD) describing spatial and temporal interactions between water motion and biology, on larger domain including reef barrier and water exchanges through ocean-lagoon interface. To validate physical processes in the lagoon we used in situ data collected during field cruise (ValHyBio 2008, La Nina episode). Surface chlorophyll concentrations are compared with water color data from ValHyBio cruise and satellite date (MODIS/MERIS) corrected from bathymetry effects.
Published: 2010
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10. New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary investigations

Author: R. Le Borgne, Christian Grenz, Renaud Fichez, Jean-Pascal Torréton, Grenz, Christian (ed.), Le Borgne, Robert (ed.), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), PNEC, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), and Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Conservation of Natural Resources, 010504 meteorology & atmospheric sciences, PRODUCTION PRIMAIRE, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Pilot Projects, PROGRAMME DE RECHERCHE, 010501 environmental sciences, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, CYCLE BIOGEOCHIMIQUE, New Caledonia, LAGON, Multidisciplinary approach, Environmental protection, Animals, RECHERCHE PLURIDISCIPLINAIRE, 14. Life underwater, Ecosystem, 0105 earth and related environmental sciences, Tropical Climate, business.industry, Environmental resource management, Biodiversity, Pollution, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, CIRCULATION OCEANIQUE, Environmental science, Interdisciplinary Communication, business, PLANCTON
Abstract: International audience; résumé
Published: 2010
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11. Biogeochemical typology and temporal variability of lagoon waters in a coral reef ecosystem subject to terrigeneous and anthropogenic inputs (New Caledonia)

Author: Philippe Gérard, Renaud Fichez, F. Gutierrez, Sylvain Ouillon, Aymeric Jouon, Sandrine Chifflet, Christian Grenz, Pascal Douillet, Grenz, Christian (ed.), Le Borgne, Robert (ed.), Caractérisation et modélisation des échanges dans des lagons soumis aux influences terrigènes et anthropiques (CAMELIA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Guyane]), Centre d'océanologie de Marseille (COM), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IRD, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa (IRD), Universidad Autonoma Metropolitana - Iztapalapa, OPLC, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa (DCBS), DCBS, Echanges Côte-Large (ECOLA), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Caractérisation et modélisation des échanges dans des lagons soumis aux influences terrigènes et anthropiques ( CAMELIA ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [Nouvelle-Calédonie] ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [Guyanne] ), Centre d'océanologie de Marseille ( COM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, IRD, Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa ( IRD ), Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [Nouvelle-Calédonie] ), Universidad Autonoma Metropolitana Iztapalapa ( DCBS ), ECOLA LEGOS, Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales ( LEGOS ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National d'Etudes Spatiales ( CNES ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National d'Etudes Spatiales ( CNES ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Chlorophyll, 0106 biological sciences, SALINITE, Time Factors, 010504 meteorology & atmospheric sciences, SEL NUTRITIF, Oceanography, 01 natural sciences, Trophic status, CYCLE BIOGEOCHIMIQUE, VARIATION TEMPORELLE, LAGON, Cluster Analysis, Water pollution, TEMPERATURE, Trophic level, geography.geographical_feature_category, [ SDU.STU.OC ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, Ecology, IMPACT DE L'ENVIRONNEMENT, NIVEAU TROPHIQUE, Coral reef, Anthozoa, Pollution, Seasons, Environmental Monitoring, Biogeochemical cycle, Aquatic Science, Coral reef lagoon, New Caledonia, Animals, Seawater, Ecosystem, 14. Life underwater, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, geography, Chlorophyll A, 010604 marine biology & hydrobiology, Biogeochemistry, Temporal variability, Nutrients, 15. Life on land, RECIF CORALLIEN, Typology, 13. Climate action, Environmental science, Spatial variability, Hydrology, Eutrophication, Water Pollutants, Chemical
Abstract: International audience; Considering the growing concern about the impact of anthropogenic inputs on coral reefs and coral reef lagoons, surprisingly little attention has been given to the relationship between those inputs and the trophic status of lagoon waters. The present paper describes the distribution of biogeochemical parameters in the coral reef lagoon of New Caledonia where environmental conditions allegedly range from pristine oligotrophic to anthropogenically influenced. The study objectives were to: (i) identify terrigeneous and anthropogenic inputs and propose a typology of lagoon waters, (ii) determine temporal variability of water biogeochemical parameters at time-scales ranging from hours to seasons. Combined ACP-cluster analyses revealed that over the 2000 km2 lagoon area around the city of Nouméa, "natural" terrigeneous versus oceanic influences affecting all stations only accounted for less than 20% of the spatial variability whereas 60% of that spatial variability could be attributed to significant eutrophication of a limited number of inshore stations. ACP analysis allowed to unambiguously discriminating between the natural trophic enrichment along the offshore-inshore gradient and anthropogenically induced eutrophication. High temporal variability in dissolved inorganic nutrients concentrations strongly hindered their use as indicators of environmental status. Due to longer turn over time, particulate organic material and more specifically chlorophyll a appeared as more reliable nonconservative tracer of trophic status. Results further provided evidence that ENSO occurrences might temporarily lower the trophic status of the New Caledonia lagoon. It is concluded that, due to such high frequency temporal variability, the use of biogeochemical parameters in environmental surveys require adapted sampling strategies, data management and environmental alert methods.
Published: 2010
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12. New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary investigations

Author: Christian Grenz, Renaud Fichez, Olivier Pringault, Lionel Denis, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Grenz, Christian (ed.), Le Borgne, Robert (ed.), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 ( LOG ), Université du Littoral Côte d'Opale-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord])
Subjects: 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Geologic Sediments, CALCIUM-CARBONATE, VARIATION SAISONNIERE, SEL NUTRITIF, 010501 environmental sciences, Oceanography, SEDIMENT, 01 natural sciences, TROPICAL LAGOON, SOLUTE EXCHANGE, Water column, LAGON, BENTHIC NUTRIENT, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, [ SDU.STU.OC ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, GREAT-BARRIER-REEF, MICROBIAL ACTIVITY, OXYGENE, Pollution, ORGANIC-MATTER, Benthic zone, Seasons, Biogeochemical cycle, Nitrogen, Benthic fluxes, Aquatic Science, Phosphates, New Caledonia, Sediment–water interface, Seawater, 14. Life underwater, DEEP-SEA, Ecosystem, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, Hydrology, Pacific Ocean, SULFATE REDUCTION, Silicates, 010604 marine biology & hydrobiology, Biogeochemistry, Sediment, Pelagic zone, Nutrients, 15. Life on land, Oxygen, VARIATION SPATIALE, Environmental science, Spatial variability, SOUTH-WEST LAGOON
Abstract: In order to quantify the spatial and seasonal variations of sediment oxygen consumption and nutrient fluxes, we performed a spatial survey in the south west lagoon of New Caledonia during the two major seasons (dry and wet) based on a network of 11 sampling stations. Stations were selected along two barrier reef to land transects representing most types of sediments encountered in the lagoon. Fluxes were measured using ex-situ sediment incubations and compared to sediment characteristics. Sediment oxygen consumption (SOC) varied between 500 and 2000 mu mol m(-2). depending on season and stations. Nutrient effluxes from sediment were highly variable with highest fluxes measured in muddy sediments near the coast. Inter-sample variability was as high as seasonal differences so that no seasonally driven temperature effect could be observed on benthic nutrient fluxes in our temperature range. Nutrient fluxes, generally directed from the sediment to the water column, varied between -5.0 and 70.0 mu mol m(-2) h(-1) for ammonia and between 2.5 and +12.5 mu mol m(-2) h(-1) for PO4 and NO2+3. SOC and nutrient fluxes were compared to pelagic primary production rates in order to highlight the tight coupling existing between the benthic and pelagic compartments in this shallow tropical lagoon. Under specific occasions of low pelagic productivity, oxygen sediment consumption and related carbon and nutrient fluxes could balance nearly all net primary production in the lagoon. These biogeochemical estimates point to the functional importance of sediment biogeochemistry in the lagoon of New Caledonia. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Published: 2010
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13. Impact of wind and freshwater inputs on phytoplankton biomass in the coral reef lagoon of New Caledonia during the summer cyclonic period: a coupled three-dimensional biogeochemical modeling approach

Author: André Maurin, Stéphane Bujan, Christian Grenz, Christel Pinazo, Renaud Fichez, Pascal Douillet, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Station Marine d'Endoume, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, UR Camelia, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), and Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, PHYTOPLANCTON, 010504 meteorology & atmospheric sciences, FONCTIONNEMENT DE L'ECOSYSTEME, 01 natural sciences, LAGON, biogeochemistry, coupled physical-biological three-dimensional, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Biomass (ecology), geography.geographical_feature_category, [ SDU.STU.OC ] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, GREAT-BARRIER-REEF, Plankton, CHLOROPHYLLE, CARBONE, lagoon, Oceanography, GEOCHIMIE, HYDRODYNAMIQUE, NITROGEN-LIMITED GROWTH, COURANT PROFOND, MARINE PHYTOPLANKTON, Biogeochemical cycle, PACIFIC, CIRCULATION, Aquatic Science, ATOLL LAGOON, AZOTE, New Caledonia, Phytoplankton, SENSITIVITY ANALYSIS, 14. Life underwater, Reef, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, ecosystem, geography, BIOMASSE, 010604 marine biology & hydrobiology, Biogeochemistry, Pelagic zone, modeling, AMMONIUM, 15. Life on land, MODELISATION, RECIF CORALLIEN, 13. Climate action, TENSION DU VENT, phytoplankton, Environmental science, SOUTH-WEST LAGOON, Eutrophication, ADRIATIC SEA
Abstract: International audience; A coupled three-dimensional physical-biological model was developed in order to simulate the ecological functioning and potential impacts of land-derived inputs in the southwest lagoon of New Caledonia. This model considered pelagic biogeochemical cycling of organic matter, taking into account advection and diffusion processes driven mainly by local wind fields and freshwater discharges. Modeled phytoplankton dynamics were strongly correlated with both freshwater nutrient inputs and wind-driven hydrodynamic processes, the latter resulting in a large input of oceanic water from the southeast part of the lagoon under trade wind conditions. In situ data obtained during the summer (January 1998) under trade wind conditions supported predicted concentration gradients along several coast to reef transects and provided a validation of the coupled physical-biogeochemical model. An additional sensitivity analysis showed that the alteration of the biogeochemical parameters did not strongly affect the results of the model. Freshwater inputs of nutrients were simulated using a realistic scenario corresponding to the summer rainy season of 1997-1998 in New Caledonia. Despite occasional flooding events from the main rivers considered in these simulations, no significant meso-scale phytoplankton bloom was identified. Hydrodynamically driven dispersion and rapid uptake of nutrients by phytoplankton were sufficient to spatially constrain the impact of river inputs and maintain oligotrophic conditions. The fine spatial grid of our three-dimensional model demonstrated that eutrophication in the southwest lagoon of New Caledonia is confined to the most restricted coastal embayments, while most of the lagoon experiences sustained oligotrophic conditions.
Published: 2004
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14. Does competition for nanomolar phosphate supply explain the predominance of the cyanobacterium Synechococcus ?

Author: Thierry Moutin, Tron F. Thingstad, France Van Wambeke, Dominique Marie, Gerd Slawyk, Patrick Raimbault, Herveé Claustre, Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Department of Microbiology University of Bergen Jahnebakken 5 5020 Bergen, Norway, Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines ( LMGEM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Station biologique de Roscoff [Roscoff] ( SBR ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'océanographie de Villefranche ( LOV ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Bergen (UiB), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Cyanobacteria, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Biogeochemical cycle, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Microorganism, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, [ SDE ] Environmental Sciences, chemistry.chemical_compound, Mediterranean sea, Algae, Botany, Photic zone, 14. Life underwater, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 010604 marine biology & hydrobiology, fungi, biology.organism_classification, Phosphate, Synechococcus, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, chemistry
Abstract: International audience; Experimental work during a cruise along a W‐E transect in the Mediterranean Sea suggests that (1) orthophosphate concentrations in the upper photic zone show a decreasing trend from the west to the east reaching levels well below 1 nM and (2) microorganisms in the 0.6–2ߝµm size fraction, probably Synechococcus, have, in addition to high affinity for orthophosphate, significantly higher maximum uptake rates than heterotrophic bacteria or eukaryotic algae. These specific advantages concerning orthophosphate uptake at low (
Published: 2002
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15. Small-scale variability in the coupling/uncoupling of bacteria, phytoplankton and organic carbon fluxes along the continental margin of the Gulf of Lions, Northwestern Mediterranean Sea

Author: F. Van Wambeke, Patrick Raimbault, Pascal Conan, Serge Heussner, Frédéric Diaz, Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines (LMGEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin (CEFREM), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biogéochimique (LOPB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie Microbienne (LOMIC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de MicrobiologiE de Géochimie et d'Ecologie Marines ( LMGEM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Centre de formation et de recherche sur l'environnement marin ( CEFREM ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique ( LOPB ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Océanographie Microbienne ( LOMIC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, [ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Short term variability, chemistry.chemical_element, Aquatic Science, Oceanography, 01 natural sciences, Particulate detritus, [ SDE ] Environmental Sciences, Mediterranean sea, Water column, Carbon budget, Phytoplankton, Dissolved organic carbon, 14. Life underwater, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, Total organic carbon, Bacterial production, geography, geography.geographical_feature_category, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Continental shelf, 010604 marine biology & hydrobiology, Biological pump, Phytoplankton export, Organic carbon flux, Northwestern Mediterranean, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, chemistry, [SDE]Environmental Sciences, Environmental science, Carbon
Abstract: International audience; A High Frequency Flux (HFF) experiment was conducted during spring 1997 on the continental slope of the Gulf of Lions (Northwestern Mediterranean Sea) with the aim of examining the dynamical and biological processes controlling particle transfer in this margin environment. Within this general framework, a special attention was paid to short temporal and small spatial variations of phytoplankton and bacterial production through six hydrological and biological surveys performed during a 7-week period at nine sampling stations located on a 10 Â 20-mile grid. Downward fluxes of particulate organic carbon at each station were measured by traps deployed at 240 m depth. The f-ratio and the ratio of integrated bacterial to primary production (IBP/IPP ratio), computed as indexes of biological export for each survey and station, did not provide a clear, unambiguous understanding of the importance of biological processes in the cycling of carbon in the upper water column. However, the data collected allowed to draw up carbon budgets for the different phases of the experiment. The comparison of primary production with measured and estimated organic carbon removal terms (sinking, cycling through the microbial food web, grazing by ciliates and metazoans) showed that a balance was never reached between fluxes of production and removal of organic carbon during the course of the experiment. The system shifted from an initial situation of 'missing' carbon (removal > production) to one of 'excess' carbon (removal < production). Factors such as horizontal advection of carbon into and out of the experimental area and accumulation of dissolved organic carbon (dissolved biological pump) are invoked to explain the observed imbalances. A sensitivity test of the budget to the variations of the different parameters involved showed that bacterial growth efficiency was the most important factor affecting the budget. D
Published: 2002
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15 results on '"Laboratoire d'Océanographie Physique et Biologique (LOPB)"'

1. Modelling the spatial and temporal variability of the SW lagoon of New Caledonia II: Realistic 3D simulations compared with in situ data

2. The Management of Mediterranean Coastal Habitats: A Plea for a Socio-ecosystem-Based Approach

3. Spatial variability in Sediment Oxygen Consumption under winter conditions in a lagoonal system in New Caledonia (South Pacific)

4. Benthic biogeochemistry: state of the art technologies and guidelines for the future of in situ survey

5. Polar Front around the Kerguelen Islands: An up-to-date determination and associated circulation of surface/subsurface waters

6. Wicked Social-Ecological Problems Forcing Unprecedented Change on the Latitudinal Margins of Coral Reefs : the Case of Southwest Madagascar

7. Marine ecosystems’ responses to climatic and anthropogenic forcings in the Mediterranean

8. Gradients in intact polar diacylglycerolipids across the Mediterranean Sea are related to phosphate availability

9. New Caledonia surface lagoon chlorophyll modeling as coastal reef area health indicator

10. New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary investigations

11. Biogeochemical typology and temporal variability of lagoon waters in a coral reef ecosystem subject to terrigeneous and anthropogenic inputs (New Caledonia)

12. New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary investigations

13. Impact of wind and freshwater inputs on phytoplankton biomass in the coral reef lagoon of New Caledonia during the summer cyclonic period: a coupled three-dimensional biogeochemical modeling approach

14. Does competition for nanomolar phosphate supply explain the predominance of the cyanobacterium Synechococcus ?

15. Small-scale variability in the coupling/uncoupling of bacteria, phytoplankton and organic carbon fluxes along the continental margin of the Gulf of Lions, Northwestern Mediterranean Sea

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