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1. PEPOP: new approaches to mimic non-continous epitopes

Author

Lionel Valera, Benedicte Jardin, Géraldine Lavigne, Alexandre G. de Brevern, Christophe Nguyen, Liza Felicori, Ricardo Andrez Machado De Ávila, Aurélien Lebreton, Violaine Moreau, Franck Molina, Vincent Demolombe, Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire d'Excellence du Globule Rouge, Villejuif, France, Departamento de Bioquimica, Alcediag, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Partenaires INRAE, Bio-Rad Laboratories, Department of Haematology, Service d'Hématologie Biologique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
Computer science, IPP, Peptide, Computational biology, immunogenicity, Epitope, Turn (biochemistry), 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, protein surface, Molecule, Peptide design, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, molecular mimicry, Binding site, Ag-Ab interaction, Antigenic peptide, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, biology, discontinuous and continuous epitope, A protein, structural bioinformatics, B-cell epitope, chemistry, antigenicity, biology.protein, Discontinuous epitope, Antibody, 030215 immunology
Abstract

Bioinformatics methods are helpful to identify new molecules for diagnostic or therapeutic applications. For example, the use of peptides capable of mimicking binding sites has several benefits as replacing a protein difficult to produce, or toxic. Using peptides is less expensive. Peptides are easier to manipulate, and can be used as drugs. Continuous epitope predicted by bioinformatics tools are commonly used and these sequential epitopes are used as such in further experiments. Numerous discontinuous epitope predictors have been developed but only two bioinformatics tools proposed so far to predict peptide sequences: Superficial and PEPOP. PEPOP can generate series of peptide sequences that can replace continuous or discontinuous epitopes in their interaction with their cognate antibody. We have developed an improved version of PEPOP dedicated to answer to the experimentalists’ need for a tool able to handle proteins and to turn them into peptides. The PEPOP web site has been reorganized by peptide prediction category and is therefore better formulated to experimental designs. Since the first version of PEPOP, 32 new methods of peptide design were developed. In total, PEPOP proposes 35 methods in which 34 deal specifically with discontinuous epitopes, the most represented epitope type in nature.We present the user-friendly, well-structured web-site of PEPOP and its validation through the use of predicted immunogenic or antigenic peptides mimicking discontinuous epitopes in different experimental ways. PEPOP proposes 35 methods of peptide design to guide experimentalists in using peptides potentially capable of replacing the cognate protein in its interaction with an Ab.

Published
2018

2. P53 activation inhibits all types of hematopoietic progenitors and all stages of megakaryopoiesis

Author

Jiajia Pan, Laurent Debussche, Philippe Rameau, Salem Abbes, Hana Raslova, Anita Roy, Najet Debili, Caroline Marty, William Vainchenker, Isabelle Plo, Emna Mahfoudhi, Larissa Lordier, Yunhua Chang, Lydia Roy, Hématopoïèse normale et pathologique (U1170 Inserm), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'hématologie moléculaire et cellulaire (LR11IPT07), Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Plateforme imagerie et cytométrie (PFIC), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sanofi Research & Development - Oncology, This work was supported by grants from ANR(ANR-blanc thrombocytosis and ANR-13-JSV1-0007-02)(IP, VW) and from the Ligue Nationale contre le Cancer(WV, HR équipe labellisée 2012, 2016). Labex GR-Ex (IP,WV) is funded by the program 'Investissements d’avenir'.EM was supported bygrants from Sanofi., ANR-11-BSV1-0001,Thrombocytosis,Mécanismes des thrombocytoses acquises et familiales(2011), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pasteur Tunis, Institut, BLANC - Mécanismes des thrombocytoses acquises et familiales - - Thrombocytosis2011 - ANR-11-BSV1-0001 - BLANC - VALID, Hématopoïèse normale et pathologique ( U1170 Inserm ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire d'hématologie moléculaire et cellulaire ( LR11IPT07 ), Institut Pasteur de Tunis-Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ), Plateforme imagerie et cytométrie ( PFIC ), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse ( AMMICa ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), ANR-11-BSV1-0001,Thrombocytosis,Mécanismes des thrombocytoses acquises et familiales ( 2011 ), Institut Pasteur de Tunis - Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Hématopoïèse normale et pathologique, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11) - Institut Gustave Roussy (IGR) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université de Bordeaux (UB), Institut de physiologie et biologie cellulaires (IPBC), Université de Poitiers - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Molecular and Cellular Hematology, Institut Pasteur de Tunis - Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP) - Institut Pasteur de Tunis - Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut Gustave Roussy (IGR), and Laboratoire d'Excellence du Globule Rouge, Villejuif, France

Subjects
0301 basic medicine, p53, Programmed cell death, Indoles, Time Factors, Tumor suppressor gene, Cell Survival, DNA repair, [SDV]Life Sciences [q-bio], Antigens, CD34, Transfection, Piperazines, Thrombopoiesis, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Humans, Spiro Compounds, Progenitor cell, Cells, Cultured, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Megakaryopoiesis, progenitors, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Dose-Response Relationship, Drug, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Imidazoles, apoptosis, Proto-Oncogene Proteins c-mdm2, Nutlin, Hematopoietic Stem Cells, Thrombocytopenia, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Haematopoiesis, 030104 developmental biology, Oncology, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, MDM2 inhibitors, Cancer research, biology.protein, Mdm2, RNA Interference, Tumor Suppressor Protein p53, megakaryopoiesis, Signal Transduction, Research Paper
Abstract

International audience; TP53 also known as p53 is a tumor suppressor gene mutated in a variety of cancers. P53 is involved in cell cycle, apoptosis and DNA repair mechanisms and is thus tightly controlled by many regulators. Recently, strategies to treat cancer have focused on the development of MDM2 antagonists to induce p53 stabilization and restore cell death in p53 non-mutated cancers. However, some of these molecules display adverse effects in patients including induction of thrombocytopenia. In the present study, we have explored the effect of SAR405838 not only on human megakaryopoiesis but also more generally on hematopoiesis. We compared its effect to MI-219 and Nutlin, which are less potent MDM2 antagonists than SAR405838. We found that all these compounds induce a deleterious effect on all types of hematopoietic progenitors, as well as on erythroid and megakaryocytic differentiation. Moreover, they inhibit both early and late stages of megakaryopoiesis including ploidization and proplatelet formation. In conclusion, MDM2 antagonists induced a major hematopoietic defect in vitro as well as an inhibition of all stages of megakaryopoiesis that may account for in vivo thrombocytopenia observed in treated patients.

Published
2016
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3. Presence of atypical thrombopoietin receptor (MPL) mutations in triple negative essential thrombocythemia patients

Author

William Vainchenker, Jean-Philippe Defour, Fabrizia Favale, Valérie Ugo, Stefan N. Constantinescu, Jean Christophe Ianotto, Olivier Bluteau, Nathalie Droin, Christine Bellanné-Chantelot, Kahia Messaoudi, Jean Pierre Le Couédic, Hana Raslova, Isabelle Plo, Nicole Casadevall, Florence Pasquier, M'Boyba Diop, Ilyas Chachoua, Xenia Cabagnols, Christophe Marzac, Rémi Favier, Najet Debili, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut Gustave Roussy (IGR), Hématopoïèse normale et pathologique, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), De Duve Institute, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Ludwig Institute for Cancer Research (LICR - BRUSSELS), Ludwig Institute for Cancer Research, Département d'Hématologie Clinique (BREST - Hémato Clinique), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale (GETBO), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Territoires, économie, enjeux sociétaux (LARHRA TEES), LAboratoire de Recherche Historique Rhône-Alpes - UMR5190 (LARHRA), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Nord]), Laboratoire d'Hématologie Biologique, Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire d'Excellence du Globule Rouge, Villejuif, France, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), UCL - (SLuc) Service de biologie hématologique, UCL - SSS/DDUV - Institut de Duve, UCL - SSS/DDUV/SIGN - Cell signalling, Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Subjects
0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], DNA Mutational Analysis, medicine.disease_cause, Biochemistry, Cohort Studies, 0302 clinical medicine, hemic and lymphatic diseases, Medicine, Exome, Mutation, Comparative Genomic Hybridization, Janus kinase 2, thrombopoietin receptor, biology, essential thrombocythemia, food and beverages, High-Throughput Nucleotide Sequencing, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Hematology, Protein Transport, 030220 oncology & carcinogenesis, NGS, Cytokines, Receptors, Thrombopoietin, Thrombocythemia, Essential, Genotype, Immunology, Cell Line, 03 medical and health sciences, Humans, Codon, Allele frequency, Thrombopoietin, Myeloproliferative neoplasm, Cell Proliferation, Thrombopoietin receptor, business.industry, Essential thrombocythemia, Whole exome sequencing, Cell Biology, Janus Kinase 2, medicine.disease, mutations, Molecular biology, 030104 developmental biology, Amino Acid Substitution, biology.protein, business, Calreticulin, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Granulocytes
Abstract

International audience; Mutations in signaling molecules of the cytokine receptor axis play a central role in myeloproliferative neoplasm (MPN) pathogenesis. Polycythemia Vera is mainly related to JAK2 mutations, whereas a wider mutational spectrum is detected in Essential Thrombocythemia (ET) with mutations in JAK2, the thrombopoietin receptor (MPL) and the calreticulin (CALR) genes. Here, we studied the mutational profile of 17 ET patients negative for JAK2V617F, MPLW515K/L and CALR mutations, using Whole Exome Sequencing and Next Generation Sequencing (NGS) targeted on JAK2 and MPL. We found several signaling mutations including JAK2V617F at very low allele frequency, one homozygous SH2B3 mutation, one MPLS505N, one MPLW515R and two MPLS204P mutations. In the remaining patients, four presented a clonal and seven a polyclonal hematopoiesis, suggesting that certain triple negative ETs are not MPNs. NGS on 26 additional triple negative ETs detected only one MPLY591N mutation. Functional studies on MPLS204P and MPLY591N revealed that they are weak gain-of-function mutants increasing MPL signaling and conferring either TPO hypersensitivity or independence to expressing cells, but with a low efficiency. Further studies should be performed to precisely determine the frequency of MPLS204 and MPLY591 mutants in a bigger cohort of MPN.

Published
2015
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4. Differential association of calreticulin type 1 and type 2 mutations with myelofibrosis and essential thrombocytemia: relevance for disease evolution

Author

Xénia Cabagnols, J Mondet, Isabelle Plo, Pascale Saussoy, Florence Pasquier, Jean-Christophe Ianotto, Laurent Knoops, Nicole Casadevall, Olivier Mansier, Vincent Ribrag, C Marzac, Eric Solary, Marie-Christiane Vekemans, M J Mozziconacci, Eric Lippert, Anne Murati, Stefan N. Constantinescu, Jean-François Viallard, François Girodon, Jean-Philippe Defour, Olivier Bluteau, J H Alexandre, Valérie Ugo, P Mossuz, William Vainchenker, Laboratoire d'Hématologie Biologique, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Département d'hématologie, Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale (GETBO), Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), TheREx, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Laboratoire d'hématologie cellulaire et moléculaire (DBPC), CHU Grenoble-CHU Grenoble, Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) (LNC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Bordeaux (UB), Service de Médecine Interne et Maladies Infectieuses [Pessac], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Biothérapies des maladies génétiques et cancers, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Neurologie [Lille], Hôpital Roger Salengro [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Laboratoire de recherche translationnelle, Direction de la recherche [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut Gustave Roussy (IGR), Hématopoïèse normale et pathologique, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Excellence du Globule Rouge, Villejuif, France, Institut Gustave Roussy (IGR), UCL - SSS/DDUV - Institut de Duve, UCL - (SLuc) Service de biologie hématologique, UCL - SSS/IREC/SLUC - Pôle St.-Luc, Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire d'hématologie cellulaire et moléculaire (DBPC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon (ENSBANA), Département de neurologie [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale ( GETBO ), Université de Brest ( UBO ), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Laboratoire d'hématologie cellulaire et moléculaire ( DBPC ), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie ( UGA UFRP ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Lipides - Nutrition - Cancer (U866) ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Ecole Nationale Supérieure de Biologie Appliquée à la Nutrition et à l'Alimentation de Dijon ( ENSBANA ), Chimie Organique et Bioorganique : Reactivité et Analyse ( COBRA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Chimie Organique Fine ( IRCOF ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie ( INSA Rouen Normandie ), Normandie Université ( NU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille ( CRCM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Hôpital Roger Salengro-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Institut Gustave Roussy ( IGR ), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut Paoli-Calmettes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hopital Necker-Enfants Malades, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), and Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)

Subjects
Male, Adult, Cancer Research, Adolescent, Essential/*genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], Essential Thrombocytemia, Biology, medicine.disease_cause, 03 medical and health sciences, Young Adult, 0302 clinical medicine, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine, [ SDV.MHEP.HEM ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Protein Isoforms, Humans, Thrombocythemia, Myelofibrosis, Child, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Aged, Genetics, Aged, 80 and over, 0303 health sciences, Mutation, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Protein Isoforms/*genetics, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Hematology, Middle Aged, medicine.disease, Calreticulin/*genetics, Disease evolution, Oncology, Aged 80 and over, Primary Myelofibrosis, 030220 oncology & carcinogenesis, biology.protein, Female, Calreticulin, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Thrombocythemia, Essential, Primary Myelofibrosis/*genetics
Abstract

Differential association of calreticulin type 1 and type 2 mutations with myelofibrosis and essential thrombocytemia: relevance for disease evolution

Published
2014
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5. Emergence of a BCR-ABL translocation in a patient with the JAK2V617F mutation: evidence for secondary acquisition of BCR-ABL in the JAK2V617F clone

Author

William Vainchenker, Hisashi Yamada, Kohji Ozaki, Isabelle Plo, Mayuka Nakatake, Kiyotaka Kawauchi, Emna Mahfoudhi, Masaharu Akiyama, Osamu Yamada, Medical Research Institute, Tokyo Women's Medical University (TWMU), Laboratoire d'hématologie moléculaire et cellulaire (LR11IPT07), Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Hématopoïèse normale et pathologique, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Laboratoire d'Excellence du Globule Rouge, Villejuif, France, Institute of DNA Medicine, The Jikei University School of Medicine, Supported by grants from the Ligue Nationale Contre le Cancer (National League Against Cancer, and équipe labelisée 2010-2012), Agence Nationale de la Recherche Blanc 2010, INSERM, INSERM–Direction Générale de la Recherche Scientifique (Tunis), and by a Grant-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI) from the Japan Society for the Promotion of Science (grant No. 22501053).

Subjects
Male, Cancer Research, MESH: Mutation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clone (cell biology), Fusion Proteins, bcr-abl, Chromosomal translocation, MESH: Janus Kinase 2, MESH: Prognosis, Translocation, Genetic, medicine, Humans, Jak2v617f mutation, MESH: Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Genetics, MESH: Aged, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, MESH: Humans, business.industry, MESH: Fusion Proteins, bcr-abl, Janus Kinase 2, medicine.disease, Prognosis, Fusion protein, Virology, Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell, MESH: Male, MESH: Translocation, Genetic, Leukemia, Oncology, Mutation, business
Abstract

International audience

Published
2014
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6. Emergence of a BCR-ABL translocation in a patient with the JAK2V617F mutation: evidence for secondary acquisition of BCR-ABL in the JAK2V617F clone.

Author

Yamada O, Mahfoudhi E, Plo I, Ozaki K, Nakatake M, Akiyama M, Yamada H, Kawauchi K, and Vainchenker W

Subjects
Aged, Humans, Male, Prognosis, Fusion Proteins, bcr-abl genetics, Janus Kinase 2 genetics, Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell genetics, Mutation genetics, Translocation, Genetic genetics
Published
2014
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