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From years ago, climate change effects are happening in different areas of the world, including Rwanda. Potato as one of main commodities grown mainly in the cooler and wetter highlands of Rwanda, its production could be facing the global warming. The purpose of this study is to carry out weather (temperature and rainfall) change dynamics in the potato growing zones of Rwanda over the last thirty years. Weather daily data from 1987 to 2016 were collected from three weather stations, at Kawangire for low elevation, at Gikongoro mid elevation, and at Kora high elevation, respectively. Farmers were interviewed to know their perceptions on weather conditions during past thirty years. Weather data were analyzed by ombrothermic diagram, Nickolson Index and graphing with generated trend equation methods. Interview data were analyzed with Chi-square test at P =.05. Results have shown as dry June, July and August months in low elevation; June, July and August in medium elevation and June and July in high elevation depending on decade. Rainfall was increasing in low and medium elevations, while it was decreasing in high elevation. Temperature was decreasing in low elevation area and it was increasing in medium and high elevation areas. All interviewed farmers confirmed long term-shift in temperature and precipitations. A total of 95%, 54% and 43% of farmers from respectively low, medium and high elevations reported that weather was becoming wetter during last years. As conclusion, potato growing cooler and wetter conditions of high elevation are shifting to low elevation in Rwanda. For climate change mitigation, Rwanda needs to promote potato in its Eastern part, the low elevation region, in order to increase the crop production in the future.

Study Design and Objectives: Sugar cane production is threatened by the devastating action of the larval populations of Eldana saccharina Walker. Faced with this situation, the search for sustainable control solutions is a major challenge for sugar producers. This study contributes to the control of the larval populations of the pest through the use of formulations based on essential oils of local aromatic plants. Methodology: Bioassays on the survival of the larvae were therefore conducted in the laboratory at the Sucrivoire site in Zuénoula. The larvae obtained from the eggs, incubated for 5 days were reared on a nutritional medium and then transferred to empty dishes after one week. Essential oils from the hydrodistillation of three aromatic plants (Cymbopogon citratus, Ocimum gratissimum and Zingiber officinale) were used. Five concentrations of these essential oils (1000, 2000, 4000, 8000 and 10000-ppm) were tested by direct contact on batches of 10 larvae for a total of 30 larvae/concentration. Dead larvae were counted daily and the mortality rate was calculated after 24, 48 and 72 hours of exposure. Results: As early as 24 hours, larval mortality was significant (P

Objectifs : Les cercosporioses noire et jaune causées respectivement par les champignons ascomycètes Mycosphaerella fijiensis et Mycosphaerella musicola sont les maladies foliaires les plus dévastatrices en culture du bananier. La cercosporioses noire ou maladie des raies noires (MRN) est considérée comme la plus contraignante et se traduit par des pertes de rendement allant de 30 à 80 %. La présente étude se propose d’actualiser la carte de distribution géographique des cercosporioses noire et jaune en Côte d’Ivoire par l’évaluation sanitaire des bananeraies dans les principales zones de production et de caractériser la variabilité des isolats de Mycosphaerella spp. isolés.Méthodologie et résultats : Pour se faire, des prospections ont été effectuées pendant 3 années successives dans des zones préalablement sélectionnées de production de banane dessert ou de banane plantain sur la base de la diversité des conditions écologiques et la facilité d’accès. Les paramètres phytopathologiques observées pendant ces prospections ont été la plus jeune feuille touchée par la maladie (PJFT), la plus jeune feuille nécrosée (PJFN) et le nombre de feuilles vivantes (NFV) sur les bananiers. Les résultats ont montré que la cercosporiose noire est bien établie dans toutes les plantations prospectées soit 100 % et que la cercosporiose jaune est présente seulement dans 3 zones agro-écologiques (ZAE II, ZAE III et ZAE IV), soit 8,79 % des plantations prospectées. La sévérité des attaques dues à Mycosphaerella spp. a varié selon les cultivars de bananes et de bananes plantain rencontrés et également en fonction de l’agro-écologie des régions de production. Les pathogènes isolés et identifiés ont montré que les phénotypes diffèrent dans la quasi-totalité des sites visités. Les caractéristiques phénotypiques de l’aspect noir du revers des boîtes de Pétri et non jaune des cultures ont permis de suspecter Mycosphaerella fijiensis.Conclusion et application des résultats : Cette étude a permis de faire ressortir dans toutes les zones agro-écologiques, le caractère épidémique de la cercosporiose noire dans les conditions naturelles d’infestation de production. La cercosporiose jaune est présente uniquement dans les zones agro-écologiques II, III et V. Les résultats de cette étude ont montré une variabilité entre les isolats de Mycosphaerella spp. et aideront à envisager une méthode de lutte alternative à la lutte chimique contre la maladie des raies noires. Objective: Black and Yellow Sigatoka caused by the ascomycete fungi Mycosphaerella fijiensis and Mycosphaerella musicola, respectively, are the most devastating foliar diseases of banana. The Black Sigatoka or Black leaf streak disease (BLSD) is considered the most damaging and results in yield losses ranging from 30 to 80%. The present study aims at updating the geographical distribution map of black and yellow Sigatoka in Côte d’Ivoire by assessing the sanitary status of banana plantations in the main production areas and characterizing the variability of isolated Mycosphaerella spp.Methodology and results: To do so, surveys were carried out during 3 successive years in previously selected areas of dessert banana or plantain production based on the diversity of ecological conditions and ease of access. The phytopathological parameters observed during these surveys were the youngest leaf affected by the disease (YLA), the youngest necrotic leaf (YNL) and the number of living leaves (NLL) on banana plants. The results showed that black Sigatoka was well established in all the plantations surveyed, i.e. 100%, and that yellow Sigatoka was present only in 3 agro-ecological zones (ZAE II, ZAE III and ZAE IV), i.e. 8.79% of the plantations surveyed. The severity of attacks due to Mycosphaerella spp. varied according to the banana and plantain cultivars encountered and according to the agro-ecology of the production regions. The pathogens isolated and identified showed that the phenotypes differed in almost all the sites visited. The phenotypic characteristics of the black aspect of the reverse side of the Petri dishes and the non-yellow aspect of the crops allowed to suspect Mycosphaerella fijiensis.Conclusion and application of results : This study allowed to highlight in all the agro-ecological zones, the epidemic character of the Black Sigatoka in the natural conditions of infestation of production. Yellow Sigatoka is present only in agro-ecological zones II, III and V. The results of this study showed variability among isolates of Mycosphaerella spp. and will help to consider an alternative control method to chemical control of Black leaf streak disease.

From years ago, many climate change effects are happening in world different areas, including in Rwanda. The purpose of this study is to determine rainfall and temperature evolution trend for thirty years, in Rwandan zones growing potato. Temperature and rainfall daily data were collected from three weather stations which are Kawangire, Gikongoro and Kora recognized as respectively low, medium and high elevations. Farmers were interviewed to know their perceptions on weather conditions during past thirty years. Temperature and rainfall data were analyzed by ombrothermic diagram, Nickolson Index and graphing with generated trend equation methods. Interview data were analyzed with Chi-square test at P-Value significance

Objectifs : Le manioc occupe une place de choix dans l’alimentation humaine en Côte d’Ivoire. Cependant sa culture est confrontée à de nombreuses contraintes d’ordre parasitaires, dont l’une des plus redoutables est la bactériose vasculaire causée par Xanthomonas axonopodis pv. manihotis. A l’exception de sa confirmation en 2015 en Côte d’Ivoire, aucune information scientifique substantielle n’a été rapportée sur cette maladie ainsi que sur les méthodes de lutte appropriées. L’objectif de la présente étude est d’étudier la diversité pathogénique des souches bactériennes, la sensibilité des principaux cultivars de manioc et d’évaluer les propriétés bactéricides du biopesticide NECO. Méthodologie et résultats : Des plants de 45 jours ont été inoculés par des souches de Xam, puis traiter avec une gamme de cinq concentrations (v/v) du biopesticide NECO. Les résultats montrent l’apparition de taches nécrotiques caractéristiques des symptômes de la bactériose après 72-96 h d’incubation. Sur 121 souches de Xam testées, 109 ont provoqué des symptômes typiques de la bactériose, alors que 12 souches se sont montrées avirulentes. La variété ''Diarrassouba'' a été la plus attaquée, tandis que le plus faible niveau de sensibilité est obtenu par ''Yavo'' et ''Bocou 2''. En outre, l’application du biopesticide NECO à 5 ml/L, après deux traitements a favorisé une reprise de 92,59 % des plants infectés contre 14,81 % du produit de référence. Conclusion et application de résultats : Les variétés ''Yavo'' et ''Bocou 2'' peuvent être conseillées aux producteurs de manioc dans les zones où sévit la bactériose vasculaire. Egalement, le NECO à la dose de 5 ml/L peut être utilisé dans les programmes de lutte intégrée contre cette maladie. Mots clés : Manioc, bactériose vasculaire, Xanthomonas axonopodis pv. manihotis, pathogénicité, biopesticide NECO 13187 Affery et al., J. Appl. Biosci. Vol :130 2018 Diversité pathogénique des souches de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis en Côte d’Ivoire, sensibilité des variétés de manioc et approche de lutte.. ABSTRACT Objective: Cassava is an important staple food in Côte d'Ivoire; however, it is faced with many parasitic constraints. Among them, bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis (Xam) is one of the most dreadful. This work aimed to develop strategies to manage the cassava blight disease. Methodology and results: Forty five (45)-day-old plants of cassava were inoculated with Xam strains and then treated with a range of five concentrations (v/v) of biopesticide NECO and essential oil from Ocimum gratissimum. The results showed necrotic spots indicating the onset of symptoms following the infiltration and the incubation at 72 to 96 hours. Of the 121 tested strains, 109 caused typical symptoms of bacterial blight, and 12 of them proved avirulent. The variety ''Diarrassouba'' was the most attacked, while the lowest levels of sensitivity were obtained with ''Yavo'' and ''Bocou 2.’’ Moreover, application of biopesticide NECO at 5 ml/L after two treatments favored a recovery of the infected plants by 92.59 % against 14.81% for the reference product. Conclusion and application of results: '' Yavo '' and '' Bocou 2 '' varieties can be recommended for cassava growers in areas where bacterial blight is prevalent. In addition, NECO at a dose of 5 ml/L can be used in IPM programs Keywords: Cassava, Bacterial Blight, pathogenicity, Xanthomonas, pathogenicity, biopesticide NECO

Objective: The overall objective of this study is to develop methods of combatting the cocoa swollen shoot disease. Specifically, it aims to know the floristic composition of the infected cocoa farms in order to identify the host range of the cocoa swollen shoot disease virus (CSSDV) in these farms. Methodology and Results: The study consisted in floristic surveys conducted in Bouaflé and Sinfra districts, in the Marahoué region in the central west part of Côte d’Ivoire. In each district, infected localities were selected and two infected farms in each locality were chosen for the study. So, 48 infected farms were surveyed using the itinerant inventory method. Conclusions and application of findings: The surveys identified 253 plant species in the infected farms. These species were grouped into 191 genera and 67 botanical families. Among the 253 species, eight are known as CSSDV reservoirs according to the studies held in Ghana, Togo and Nigeria. These species are Bombax buonopozense P. Beauv. (Bombacaceae), Ceiba pentandra (L.) Gaertn. (Bombacaceae), Cola gigantea var glabrescens Brenan et Keay (Sterculiaceae), Commelina erecta L. (Commelinaceae), Corchorus olitorius L. (Tiliaceae), Pterygota macrocarpa K Schum. (Sterculiaceae), Spondias mombin L. (Anacardiaceae), Sterculia tragacantha Lindl. (Sterculiaceae) L. These species are probably the source of infection in cocoa plantations and must therefore be well known to farmers and other stakeholders. Based on our result an illustrated catalogue can be design for the virus reservoirs recognition. This catalogue can be used to strengthen farmers' knowledge of virus management. Several other weeds are ideal refuges for mealybugs. They must be identified and avoided when creating new farms.

With the depletion of forest reserves, coffee growing based on extensive and shifting cultivation mode is no more reproductive. Thus, soils of different coffee growing areas were studied in order to diagnose the fertility level, their potential for productivity of new varieties of coffee (Coffea canephora Pierre, var. Robusta) and their sustainable managements. In total, 156 soil samples were collected and analyzed in the laboratory using standard methods to determine their physicochemical statutes. The results obtained show a low nitrogen content of less than 0.27% in all soil mapping units, a base saturation percentage lower than 60% for the vast majority of soils and crucial presence of organic matter on distribution of physicochemical properties. Clustering of results identified two main components, which accounted for 88.69% of the variability of the data and the grouping into three communities by similarity of features. In view of these results, a sustainable production of the coffee trees requires a fertilization program for the improvement of soils under coffee trees.

Sous les tropiques les cultures sont attaquées par de nombreux ravageurs dont l'intensité des infestations varie suivant les plantes, le système de culture, le lieu et le régime pluviométrique. Les ravageurs sont principalement des insectes et des acariens. En Côte d'Ivoire la lutte chimique est la principale si ce n'est l'unique méthode utilisée pour protéger les cultures maraichères. Mais en raison d'un manque de formation des agriculteurs, de la pression des ravageurs et de la forte valeur ajoutée des fruits et légumes, les pesticides chimiques ne sont pas utilisés suivant de bonnes pratiques, trop souvent et en trop grande quantité mettant en péril notre santé et notre environnement. Pour éviter ces risques de contamination une nouvelle méthode de protection contre les ravageurs des cultures de tomate et de chou a été évaluée en station de recherche. Cette méthode est basée sur l'association d'une lutte physique avec des tunnels couverts de filets anti insectes et d'une lutte biologique avec des biopesticides. Pour renforcer leurs défenses naturelles, les plantes ont bénéficié d'une irrigation goutte à goutte et d'une fertilisation organique à base de composte. Les résultats montrent de façon significative une protection supérieure contre les ravageurs et un meilleur rendement ? des plantes cultivées sous filets anti insectes combinés à la lutte biologique comparés à la lutte biologique utilisée seule, qui reste supérieure elle-même au témoin non traité. Ces résultats s'expliquent par la protection quasi complète que procure le filet contre les papillons et les mouches dont les larves attaquent directement la production. La lutte biologique appliquée de façon préventive réduit le risque d'installation des piqueurs suceurs sur les cultures. Ces résultats encourageants confirment ceux obtenus dans des études réalisées dans d'autres pays d'Afrique mais doivent encore être confirmées sous les différentes conditions climatiques de Côte d'Ivoire. S'ils se confirment des études d'analyses cout/bénéfices seront réalisées pour évaluer la rentabilité et le retour sur investissement de ces technologies.

Table S1. Vernacular nomenclature of the reported useful wild mushrooms in Côte d’Ivoire. (DOCX 41 kb)

Sous les tropiques, les fruits et les légumes sont attaqués en toute saison par une grande diversité de ravageurs qui peuvent avoir un impact considérable sur la production. Les pullulations de ravageurs sont variables selon les régions, les facteurs climatiques et les espèces cultivées, qu'elles soient locales ou exotiques. Les plantes locales sont généralement plus résistantes aux maladies et ravageurs locaux. Cependant des espèces étrangères invasives venues, sans leur cortège d'ennemis naturels telles que la mouche des fruits, l'acarien rouge ou la teigne de la tomate ne font qu'accroître les problèmes phytosanitaires des maraichers. Les résultats des enquêtes sur les pratiques phytosanitaires des maraichers en Afrique sub-Saharienne sont les mêmes partout : une utilisation systématique et croissante de pesticides chimiques inadaptés aux ravageurs ciblés voire non homologués sur les cultures traitées, le non-respect des doses et des dates d'épandages avant récolte, des conditions d'utilisation et de stockage à risque pour la santé de l'agriculteur, des consommateurs et de l'environnement. L'arrivée de nouveaux ravageurs et la sélection de ravageurs résistants aux mêmes pesticides chimiques utilisés depuis plus de 30 ans n'arrangent pas la situation. Dans les périmètres horticoles, un système de cultures diversifié sera toujours moins attractif qu'une monoculture. Des variétés adaptées aux conditions locales et des plantes bien alimentées et non stressées seront toujours plus résistantes aux bio-agresseurs. La rotation des espèces cultivées et leurs associations sont des techniques primordiales pour réduire les risques de maladies. Enfin des plantes compagnes aromatiques ou à usage médicinal peuvent avoir leur intérêt pour assainir les sols, repousser les ravageurs ou attirer les insectes utiles (prédateurs, parasitoïdes ou pollinisateurs). De même, faut-il attirer et préserver leurs ennemis naturels que sont les oiseux, les prédateurs et les parasitoïdes. La combinaison de la lutte physique avec différentes techniques de lutte biologique peut être une alternative à la lutte chimique pour protéger les fruits et légumes à forte valeur ajoutée qui sont souvent les plus traitées (tomate, aubergine, piment, chou, haricot,…). Les recherches conduites au Benin et au Kenya sur l'usage des filets anti-insectes ont montré qu'on pouvait réduire de 70% l'usage des pesticides chimiques sur chou voire de 100% sur tomate et haricot au Kenya. Les extraits de plantes et des micro-organismes entomopathogènes produits localement peuvent être utilisés en préventif en plus des pièges à insectes classiques visuels ou impliquant des phéromones. Si les techniques alternatives aux pesticides chimiques ne manquent pas, de nouveaux systèmes de production sont donc à co-concevoir avec les producteurs.