Search

Ülkemizde, moleküler mikrobiyoloji tanı laboratuvarlarında yapılan HBV DNA ve HCV RNA viral yük saptama testlerinin ulusal bir dış kalite kontrol programında değerlendirilmesi amacıyla MOTAKK (Moleküler Tanıda Kalite Kontrol) Ulusal Programı başlatılmıştır. ISO 17043:2010 (Uygunluk değerlendirmesi- Yeterlilik deneyi için genel şartlar) standartlarına uyularak hazırlanan bu program, ülkemizde yapılan moleküler tanı testlerinin, daha standart ve doğru yapılmasına katkıda bulunarak, yurt dışından sağlanan dış kalite kontrol (DKK) programlarının yerini almayı amaçlamaktadır. Bu çalışmada, MOTAKK DKK Programı kapsamındaki HBV DNA ve HCV RNA viral yük 2015 ve 2016 sonuçlarının değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yapılan çağrılar MOTAKK web sayfası (www.motakk.org) üzerinden ilan edilmiştir. Web sayfası üzerinden kayıt olan katılımcı laboratuvarlara, 2015 ve 2016 yıllarında birer kalite kontrol paneli gönderilmiştir. Çevrimlerde kullanılan paneller, HBV, HCV, HIV, HAV, Parvovirüs B19 ve CMV serolojik belirteçleri negatif olan plazma ile dilüsyon yapılan değişik viral yüklere sahip örnekler ile hazırlanmış, negatif örneklerle beraber soğuk zincirde katılımcı laboratuvarlara ulaştırılmıştır. Laboratuvarlar ilgili testleri 2-3 hafta içerisinde sonuçlandırarak, MOTAKK web sayfasına sonuçlarını girmiştir. MOTAKK tarafından geliştirilen bir yazılım ile katılımcı laboratuvarların sonuçları ISO 13528’e uygun olarak analiz edilerek sonuç raporları oluşturulmuş ve web sayfasına yüklenerek katılımcılara iletilmiştir. Katılımcılar, çalışma sonucunu diğer laboratuvar sonuçları ile karşılaştırmalı olarak değerlendirme imkanına sahip olmuş ve referans değerlere ve ortalama sonuçla ilgili farklılıkları görerek kullandıkları testleri tekrar değerlendirmiştir. HBV DNA ve HCV RNA DKK programına, 2015-2016 yıllarında 70-73 laboratuvar katılmıştır. Katılımcılar, program araçlarına yüksek uyum göstererek kayıt, sonuç girme ve sonuç raporlarının alınmasını aksaksız olarak gerçekleştirmişlerdir. HBV panelinde; 2015 yılında katılımcı laboratuvarların %72.6-89.1’inin, 2016 yılında ise %84.7-90.3’ünün 1 standart sapma (SS) aralığında yer aldığı görülmüştür. HCV panelinde ise; katılımcıların %70.8-89.1’i 1 SS’de, ikinci çağrının yapıldığı 2016 yılında ise, %84.7-90.3’ünün 1 SS’nin içerisinde yer aldığı görülmüştür. Bu proje ile Türkiye’de HBV DNA ve HCV RNA ile ilgili ilk kez ulusal bir DKK programı hazırlanmış ve başarıyla uygulanmıştır. MOTAKK, DKK programı sonuç raporlarında sağlanan bilgiler, yurt dışından sağlanan kalite kontrol programı sonuç raporlarının sağladığı tüm bilgileri karşılamakta; ek olarak kullanılan teknolojilerin ve ticari ürünlerin sağlıklı karşılaştırmalarına olanak sağlamaktadır. MOTAKK, as a national external quality control program has been launched to evaluate the molecular detection of viral infections including HBV DNA and HCV RNA in molecular microbiology diagnostic laboratories in Turkey. This program is prepared in compliance with ISO 17043:2010 (Conformity assessment general requirements for proficiency testing) standards, and aims to take the place of external quality control programs from abroad, contributing to standardization and accuracy of molecular diagnostic tests in our country. The aim of this study was to evaluate 2015 and 2016 results of the MOTAKK External Quality Control Program for HBV DNA and HCV RNA viral load . The calls were announced on the web page of MOTAKK (www.motakk.org). The quality control samples were sent to participating laboratories in 2015 and 2016. Main stocks were prepared from patients with chronic hepatitis B and C who had viral load detection with reference methods according to WHO reference materials for viral load studies to improve quality control sera. From these main stocks, samples with different viral loads were prepared from dilutions of plasma with HBV, HCV, HAV, HIV, Parvovirus B19 and CMV negative serologic markers. Quality control samples were sent to the participating laboratories along with the negative samples in the cold chain. The laboratories accomplished the related tests within 2-3 weeks and entered their results on the MOTAKK web page. These results were analysed according to ISO 13528 (Statistical methods for use in proficiency testing by interlaboratory comparison) and scoring reports were created by a software developed by MOTAKK and sent to participating labs. Each laboratory evaluated their own results in comparison with the other laboratory results, reassessed the tests via observing the distance from the mean result and the reference values. The number of laboratories participating in the HBV DNA and HCV RNA external quality control program was 70-73 in 2015-2016. Participants were able to comply with the program tools, registering, entering results and receiving the results reports without problem. In HBV panel, 72.6-89.1% and 84.7-90.3% of the participant laboratories were in 1 standard deviation (SD) in 2015-2016, respectively. In HCV panel, 70.8-89.1% and 84.7-90.3% of the participant laboratories were in 1 SD in 2015-2016, respectively. A national external quality control program for HBV DNA and HCV RNA in Turkey has been prepared for the first time with this project and implemented successfully. All the data provided in the MOTAKK external quality control program final report, compensate all the data provided by the quality control program final reports from abroad; additionally, the report allows comparison of used technologies and commercial products.

Echinococcus cinsleri, Taeniidae ailesine mensup küçük yapılı sestodlardır. Echinococcus granulosus erişkin halinde köpeklerin ve köpekgillerin ince barsağında, larva halinde ise koyun, sığır gibi otçullar başta olmak üzere çeşitli memelilerin ve insanın çeşitli organlarına yerleşerek kist hidatik denen hastalığa neden olmaktadır. Dış ortama atılan parazit yumurtalarının keçi, koyun, sığır ve insan tarafından solunum veya sindirim yolu ile alınmasıyla enfeksiyona sebep olmaktadır. Ekinokok tanısında indirekt hemaglütinasyon testi (İHA), Enzyme Linked İmmunosorbent Assay (ELİSA), İndirekt Floresan Antikor (IFA) ve immünokromatografik gibi testler kullanılmaktadır. Bizim çalışmamızda Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi'ne kist hidatik şüphesiyle başvuran hastalardan serolojik tanı yöntemlerinden indirekt hemaglütinasyon ve immünokromatografik yöntemlerinin değerlendirilmesi ve karşılaştırılması amaçlanmıştır. Çalışmamıza 01.11.2018-31.01.2019 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji laboratuvarı birimine ekinokok antikoru araştırmak amacıyla gönderilen örnekler dahil edilerek Ekinokok IHA yöntemi (Hydatidose fumoze Echinococcosis fumouze) ve Ekinokok İmmünokromatografik yöntemi (Vircell virapid hydatidosis) ile yapılmıştır. Çalışma kapsamına 75 hasta örneği alındı. Hastaların 48'i kadın (%64), 27'si erkek (%36) olup, yaş ortalamaları 42.0800 (±17.72672)'dir. Ekinokok IHA yöntemi ile hastaların 36'sı pozitif (%48), 39'u negatif (%52) olarak belirlenmiştir. Ekinokok immunokromatografik yöntem ile hastaların 34'ü pozitif (%45.3), 41'i (%54.7) negatif olarak belirlenmiştir. IHA yöntemi ile pozitif saptanan hastalardan iki olgu, İmmünkromatik yöntemle negatif bulunmuştur. Her iki yöntem de birbirine yakın sonuç vermiş olup İmmünkromatik yöntemin duyarlılığının daha düşük olduğu yapılan çalışmada görülmektedir. Ekinokok IHA yöntemiyle pozitif olarak tespit edilen 36 hastanın 34'ü (%94.4) immünokromatografik yöntemle de pozitif tespit edilmiş olup IHA yöntemiyle negatif tespit edilen 39 hastanın tamamı (%100) immünukromatografik yöntemle negatif olarak tespit edilmiştir. The genus Echinococcus are small-structured cestodes belonging to the Taeniidae family. Echinococcus granulosus causes hydatid cyst disease in the small intestine of dogs and canines in adult form and settling to the various organs of various mammals especially herbivores such as sheep and cattle and human in the form of larvae. By taking the respiratory or digestion by goat, sheep, cattle and human the parasite eggs thrown to the external environment cause infection. Tests such as indirect hemagglutination test (IHA), Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA), Indirect Fluorescent Antibody (IFA) and immunochromatographic tests are used in the diagnosis of echinococcus. In our study, we aimed to evaluate and compare the indirect hemagglutination and immunochromatographic methods among the patients who admitted to Gaziantep University Şahinbey Research and Application Hospital with suspicion of hydatid cyst. Samples sent to Gaziantep University Faculty of Medicine Serology Laboratory for the investigation of echinococcal antibody between 01.11.2018-31.01.2019 were included in our study. These samples were studied with Echinococcal IHA method (Hydatidose fumoze Echinococcosis fumouze) and echinococcal immunochromatographic method (Vircell virapid hydatidosis). 75 patients sample were included in the study. 48 of the patients (64%) were female, 27 were (36%) male and the mean age of the patients was 42.0800±17.72672). 36 of the patients (48%) determined as positive and 39 (52%) negative by echinococcus IHA method. 34 of the patients (45.3%) determined as positive, 41 (54.7%) negative by echinoccus immunochromatographic method. Two patients determined as positive by IHA method found as negative by immunochromatographic method. Both methods yielded similar results and sensitivity of the immunocrotographic method was lower in the study. While 34 (94.4%) of 36 patients who were detected positive by echinococcal IHA method were also detected as positive by immunochromatographic method, all the 39 (100%) patients were detected as negative by immunochromatographic method. 69

15-45 yaş arasındaki hamile kadınlarda Toxoplasma seroprevalansının indirekt hemaglutinasyon yöntemiyle tespit edilmesi amacıyla yapmış olduğumuz çalışma kapamında Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi Kadın Hastalıkları ve Doğum polikliniğine başvuran 100 kadından alınan kan örnekleri incelenmiştir. Toxoplasma pozitifliğinin tespit edilmesinde indirekt hemaglutinasyon yöntemi kullanılmıştır. Daha sonra gebelerin laboratuvar testleri araştırılmış, bulunan ELISA sonuçları ile de sonuçlarımız karşılaştırılmıştır. Çalışma sonucunda elde edilen veriler SPSS 18.0 paket programı ile analiz edilmiştir. Yapmış olduğumuz çalışmada Toxoplasma seropozitifliği indirekt hemaglutinasyon yöntemiyle %13 olarak saptanmıştır. Aynı kişilere ait dosyalar veri tabanından incelendiğinde ELISA yöntemiyle toxoplasma IgM pozitifliğinin %11 olduğu görülmüştür. Yani çalışmada İHA yöntemiyle pozitif olarak saptanan 13 hastanın 11'inin (%84.61) ELISA IgM sonuçlarının pozitif olduğu, 2 hastanın (%15.39) ise negatif olduğu görülmüştür. Yapılan istatistiksel analizler neticesinde hem indirekt hemaglutinasyon testi hem de ELISA sonuçlarının yaşa göre anlamlı farklılık arz etmediği, bununla birlikte yaştaki artışa bağlı olarak Toxoplasma pozitifliğinin arttığı görülmüştür. Çalışmadan elde edilen sonuçlar dikkate alındığında Toxoplasma seroprevalansının bölgemizde seroprevalansının yüksek olmadığı görülmüş, uygulanmasının kolay ve cihaz gerektirmemesi nedeniyle indirekt hemaglutinasyon yönteminin Toxoplasma tanısında her yerde rahatlıkla yapılabilir ve güvenilir bir test olduğu düşünülmüştür.Anahtar kelimeler: Toxoplasma, İndirekt Hemaglutinasyon, Seroprevalans In order to determine the seroprevalence of Toxoplasma in pregnant women aged 15-45 years by indirect hemagglutination method, blood samples taken from 100 women who applied to Gaziantep University Şahinbey Research and Application Hospital, Department of Obstetrics and Gynecology were examined. Indirect hemagglutination method was used to determine toxoplasma positivity. Then, laboratory tests of pregnant women were searched and ELISA results were compared with our results. The data obtained from the study were analyzed with SPSS 18.0 package program. In our study, Toxoplasma seropositivity was found to be 13% by indirect hemagglutination method. When the files belonging to the same people were examined from data, it was found that the ELISA method and the IgM positivity were 11%. As a result of our study, ELISA IgM results were positive in 11 (84.61%) of 13 patients who were found to be positive by IHA method and negative in 2 patients (15.39%). As a result of statistical analysis, it was observed that both indirect hemagglutination test and ELISA results did not show significant difference according to age, however, Toxoplasma positivity increased due to increase in age.When the results obtained from the study were taken into consideration, seroprevalence of Toxoplasma was not high in our region. Indirect hemagglutination method was thought to be a reliable and reliable test everywhere in Toxoplasma diagnosis because it is easy to apply and does not require device.Key words: Toxoplasma, Indirect Hemagglutination, Seroprevalence 60

Servisit ve üretritli hastalarda cinsel yolla bulaşan etkenlerin multipleks PCR yöntemiyle araştırılması amacıyla gerçekleştirilen bu çalışmaya Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanası Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği ve Üroloji kliniğine başvuran servisit ve üretritli toplam 100 hasta dahil edilmiştir. Çalışma sonucunda C.trachomatis, N.gonorrhoeae, M.genitalium ve HSV-2 etkenleri saptanmıştır. Yapılan çalışma neticesinde erkek hastaların 7'sinde (%36.8), kadın hastaların ise 3'ünde (%3.7) etken tespit edilmiştir. Yine yapılan çalışmadan elde edilen verilerin analizi neticesinde etkenlerin çoğunlukla 15-24 ve 25-39 yaş arasındaki hastalarda tespit edildiği görülmüştür. Medeni duruma göre etkenlerin dağılımına bakıldığında ise evli olan 92 hastanın 7'sinde, bekar olan 8 hastanın da 5'inde etken tespit edilmiştir. Yine yapmış olduğumuz çalışmadan elde edilen verilerin analizi neticesinde yaşayan 1 çocuğu olan hastaların hiçbirinde etken saptanmamış iken 2 çocuğu olan 20 hastanın yalnızca birinde (%5), 3 ve daha fazla çocuğu olan 55 hastanın da 3'ünde (%5.5) etken tespit edilmiştir. Sigara kullanma durumuna göre etkenlerin dağılımları incelendiğinde sigara kullanan 20 hastanın 3'ünde, sigara kullanmayan 80 hastanın ise 7'sinde etken tespit edildiği görülmüştür. Semptomlara göre etkenlerin dağılımına bakıldığında kaşıntı olan 52 hastanın yalnızca 2'sinde, kaşıntı olmayan 48 hastanın 8'inde, akıntısı olan hastaların 3'ünde, dizürisi olan 59 hastanın 6'sında etken tespit edilmiştir. Abortus ve abdominal ağrı varlığına göre etkenlerin dağılımı incelendiğinde abortus yapan 24 hastanın hiçbirinde herhangi bir etken saptanmaış iken abortus yapmayan 57 hastanın 2'sinde C.trachomatis ve HSV-2 tespit edilmiştir. Abdomnal ağrısı olmayan 36 hastanın 2'sinde, abdominal ağrısı olan 45 hastanın ise yalnızca birinde etken tespit edilmiştir. CYBE'ların tanısında kullanılan konvansiyonel yöntemler uygulanması zor ve zaman alıcı olduğundan Multipleks PCR tanıda büyük önem arz etmektedir. Hastalara laboratuvar tanısı olmadan verilen ampirik tedavilerin etkene yönelik olmaması gereksiz ilaç kullanımını ve maliyet yükünü arttırmaktadır. Bu nedenle hızlı tanı önemli olduğundan maliyet etkinliği gözetilmeksizin Multipleks PCR yönteminin kullanılması avantajlı görünmektedir.Anahtar kelimeler: Servisit, Üretrit, Cinsel Yolla Bulaşan Etkenler, Multipleks PCR A total of 100 patients with cervicitis and urethritis who were admitted to Gaziantep University Medical Faculty, Obstetrics and Gynecology Clinic, and Urology Clinic were included in this study, which was performed to investigate the sexually transmitted agents in patients with cervicitis and urethritis by multiplex PCR method. C.trachomatis, N.gonorrhoeae, M.genitalium and HSV-2 agents were detected. As a result of the study, agents were detected in 7 (36.8%) of male patients and 3 (3.7%) of female patients. Again, as a result of the analysis of data obtained from the study it has seen that the agents mostly detected in patients between the ages of 15-24 and 25-34 years. When the distribution of the agents according to marital status is examined, agents were detected in 7 of the 92 patients who were married and in 5 of 8 patients who were single. As a result of the analysis of the data obtained from our study, none of the patients with 1 child were found to be have an agent, and only one (5%) of 20 patients with 2 children and 3 (5.5%) of 55 patients with 3 or more children were found to be have an agent. When the distribution of the factors according to the smoking status were examined, it was seen that agents were detected in 3 of 20 cigarette smoking patients and in 7 of 80 non-smoking patients. According to the symptoms, agents were detected in only 2 of 52 patients with pruritus, in 8 of 48 patients without pruritus, in 3 of the patients with discharge, in 6 of 59 patients with dysuria. When the distribution of the factors according to the presence of abortion and abdominal pain were investigated, agents were detected in none of the 24 patients who had abortus, C.trachomatis and HSV-2 were detected in 2 of 57 patients without abortus. While agent was detected in 2 of the 36 patients without abdominal pain, only in one of 45 patients with abdominal pain. Since conventional methods used in the diagnosis of STIs are difficult and time consuming, multiplex PCR is of great importance in diagnosis. The lack of empirical treatment for patients without laboratory diagnosis increases unnecessary drug use and cost burden. Therefore, because of the rapid diagnosis is important, it is advantageous to use multiplex PCR method without cost effectiveness.Keywords: Cervicitis, Urethritis, Sexually Transmitted Agents, Multiplex PCR 62

Herpesvirüsler primer enfeksiyondan sonra latent olarak ömür boyu kaldığından, kemik iliği transplantasyonu (KİT) nedeniyle alınan immünsupresif ilaçlar bu virüslerin reaktive olmasına olanak sağlamaktadır. Bu nedenle KİT hastalarında Herpesvirüslerin araştırılması hayati öneme sahiptir. Bu çalışmada Gaziantep Üniversitesi Hastanesi Hematoloji kliniğinde, kemik iliği transplantasyonu yapılan hastalarda Tip 1-7 Herpesvirüslerin moleküler yöntemlerden biri olan Multipleks Real Time PCR ile araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Ocak 2017-Ocak 2018 tarihleri arasında Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi Hematoloji kliniğine, kemik iliği nakli için gelen 60 hasta dahil edilmiştir. Her hastadan KİT öncesi ve KİT sonrası olmak üzere iki kez kan alınarak çalışılmıştır. Otolog transplantasyonlarda KİT sonrası 60. günde, Allojenik transplantasyonlarda ise 90. günde kan alınmıştır. Herpesvirüslerin tiplendirilmesi için, Multipleks Real Time PCR [EZ1/FTD Neuro9 (Fast Track Diagnostics, Luxembourg)] kiti kullanılmıştır. Çalışmada, nakil öncesinde 18 (%30), nakil sonrasında 10 (%16.7) hastada Herpesvirüs tespit edilmiştir. Nakil önceside hastaların; 11'inde (%18.3) CMV, ikisinde (%3.3) HHV-6, üçünde (%5) HHV-6 ve CMV, ikisinde (%3.3) EBV ve CMV saptanmıştır. Nakil sonrası hastaların; dördünde (%6.6) CMV, birinde (%1.6) HHV-6, birinde EBV (%1.6), birinde (%1.6) HHV-6 ve CMV, ikisinde (%3.3) EBV ve CMV, birinde (%1.6) EBV ve HHV-6 saptanmıştır. Nakil öncesi ve sonrasında 36 (%60) hasta negatif, dört (%6.66) hasta pozitif saptanmıştır. Nakil öncesinde negatif bulunan altı (%10) hasta nakil sonrasında pozitif saptanırken, 14 (%23.33) hasta nakil öncesinde pozitifken nakil sonrasında negatif bulunmuştur. Sonuç olarak, KİT sonrasında Herpesvirüslerin reaktivasyonu veya bulaşı, immünsupresyon nedeniyle önemli sonuçlar doğurabileceğinden takip edilmesi uygun bulunmaktadır. Because Herpesvirüses are latent in the human body after primary infection, immunosuppressive drugs taken for bone marrow transplantation (BMT) impair the immune system and allow these viruses to become reactive. Therefore, the search for Herpesvirüses in BMT patients is vital. In this study, it was aimed to investigate Herpesvirüses Type 1-7 by using Multiplex Real Time PCR which is one of the molecular methods in bone marrow transplantation patients in Gaziantep University Hospital Hematology clinic. 60 patients who received bone marrow transplantation from Gaziantep University Sahinbey Research and Practice Hospital Hematology Clinic between January 2017 and January 2018 were included in the study. Blood was taken from each patient twice before and after the BMT. In autologous transplantations; blood was taken at 60 days after the BMT and at 90 days after allogeneic transparencies. Typing of Herpesvirüses was performed using the multiplex real time PCR kit [EZ1 / FTD Neuro9 (Fast Track Diagnostics, Luxembourg)]. In the study, 18 (30%) patients were found to have Herpesvirüs in the hospital before transplantation and 10 (16.6%) patients after the transplantation. It has been found that 11 patients (18.3%) had CMV, 2 (3.3%) had HHV-6, 3 (5%) had HHV-6 and CMV, 2 (3.3%) had EBV and CMV before transplantation. EBV (1.6%) in 1, HHV-6 and CMV in 1 (1.6%), and EBV in 2 (3.3%) in one patient (6.6% and CMV, 1 (1.6%) EBV and HHV-6 were detected after transplantation. Before and after transplantation, 36 (60%) patients were negative and 4 (6.66%) patients were positive. While 6 (10%) patients determined as negative before the transplantation found as positive after transplantation, and 14 (23.33) patients that determined as positive before transplantation found as negative after transplantation. As a result, reactivation or transmission of Herpesvirüs in BMT patients should be monitored as they may have important consequences in immunosuppressed patients. 99

Paraziter enfeksiyonlar az gelişmiş ve gelişmekte olan ülkelerde önemli bir halk sağlığı problemidir. Hijyen ve sanitasyon kurallarına yeterince uyulmayan toplumlarda bu tür hastalıkların sıklıkla görüldüğü, bunun toplumun sosyo-ekonomik düzeyi, eğitim durumu ve kültürel koşulları ile ilişkili olduğu bilinmektedir. Türkiye'de de toplumun yerel gelişmişlik düzeyi ve yaşam tarzlarına göre değişmekle birlikte paraziter hastalıkların oluşturduğu gastro-intestinal sistem hastalıklarının ön sıralarda yer aldığı görülmektedir. Bu çalışmada Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi ve Gaziantep Çocuk Hastanesine Haziran-Eylül 2016 tarihleri arasında ishal şikayeti ile başvuran 0-6 yaş grubu 99 kız, 99 erkek çocutan alınan dışkı örneklerinde direkt mikroskobi yöntemi ile paraziter etkenler araştırılmış ve demografik özelliklerle karşılaştırılmıştır. Hastaların 48'i (%24.24) Üniversite hastanesi, 150'si (%75.75) Çocuk hastanesinden toplanmıştır. Bu hastaların 14'ünde(%7.07) parazit saptanmıştır. Parazit saptanan hastaların 6'sında (%42.85) Entamoeba histolytica/dispar ve 8'inde (%57.14) Giardia intestinalis tespit edilmiştir. Cinsiyete göre dağılımına bakıldığında erkeklerin beşinde (%35.71), kız çocukların ise dokuzunda (%64.28) parazit saptanmıştır. Çocukların fizik muayene bulguları değerlendirildiğinde 39'unda (%19.69) ateş, 42'sinde (%21.21) kusma, 25'inde (%12.62) bulantı, 20'sinde (%10.1) ise karın ağrısı saptanmıştır. Gaita örneklerinin makroskopik incelemesinde örneklerin büyük çoğunluğunun sarı yeşil renkte ve sadece sulu kıvamlı ve mukuslu olduğu, mikroskobik olarak ise %33'ünde lökosit ve/veya eritrosit varlığı saptanmıştır. Sonuç olarak bu çalışmada Gaziantep'deki 0-6 yaş arası ishalli çocuklarda barsak parazitleri oranı ülkemiz verilerine göre düşük olsa da paraziter hastalıkların halen önemli sağlık sorunlarından biri olduğu görülmektedir. Sosyo-ekonomik düzeyin iyileştirilmesi yanında ailelerin bu konuda bilgilendirilmesi, kişisel ve çevre temizlik kurallarının öğretilmesi ile bu sorunun çözülebileceği düşünülmektedir. Parasitic infections remain importance as a public health problem in underdeveloped and developed countries. It is indicated that such diseases are more frequently seen in societies where hygiene and sanitation rules are not sufficiently enforced, which is related to the socio-economic level, educational status and cultural conditions of the society. In Turkey the diseases of gastro-intestinal system caused by parasitic diseases take place in the first place while changing according to the local development level and lifestyles of the society. In this study, parasitic factors were investigated with direct microscopy method in stool specimens taken from children aged 0-6 years admitted to Gaziantep University Şahinbey Research Hospital and Gaziantep Children's Hospital between June-September 2016 with complaints of diarrhea and compared with demographic characteristics. For this purpose, 99 female and 99 male patients between 0-6 years old who were admitted to University and Children's Hospital with complaints of diarrhea were included in the study. 48 patients (24.24%) were collected from the university hospital and 150 (75.75%) from the Children's Hospital.14 (7.07%) of 198 patients were found infected with intestinal parasites. Entamoeba histolytica/dispar was found in 6 (42.85%) and Giardia intestinalis in 8 (57.14%) of these patients. Parasites were found in 5 of the males (35.71%) and in 9 of the females (64.28%). When physical examination findings of the children were evaluated, it has been detected that 39 (19.69%) had fever, 42 (21.21%) vomiting, 25 (12.62%) nausea and 20 (10.1%) abdominal pain. When the macroscopic and microscopic characteristics of the gaita samples were examined, it was found that the vast majority of these samples were yellow-green, the majority of them were only juicy and mucous in quality, leukocyte or erythrocyte were found in 33% of the samples. In conclusion; in this study, the proportion of intestinal parasites in diarrheal children between 0-6 years in Gaziantep is one of the major health problems, even though parasitic diseases are lower compared to the national data. In addition to improving the socio-economic level, it is seen that this problem can be solved by educating the families in cooperation with the health personnel and teaching personal and environmental cleaning rules. 64

Ülkemizde ve Dünya'nın birçok yöresinde yaygın olarak görülen ve ekonomik anlamda ciddi kayıplara neden olan Bruselloz, önemli bir zoonotik hastalıktır. Çalışmada Çalışmada Çalışmada Çalışmada Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesinde Bruselloz ön tanısıyla laboratuvarımıza gönderilen 100 hasta serumu araştırılmıştır. Serum örneklerinde Wright ve Coombs aglütinasyon testleri çalışılmıştır. Wright testi ile negatif saptanan hastalarda Coombs testi ile Blokan antikor varlığı araştırılmıştır. Wright testi 1/20 titreden başlatılarak 1/2560 titreye kadar, Coombs testi ise 1/80 titreden başlatılarak 1/640 titreye kadar dilüsyonlar yapılarak çalışılmıştır. Çalışmada 100 hastanın 46'sında (%46) Wright testi ve Coombs testi negatif, 11'inde (%11) Wright testi pozitif, 43'ünde (%43) ise Wright testi negatif çıkarken Coombs testi pozitif bulunmuştur. Biyokimyasal parametrelerden WBC, RBC, HGB, HCT, CRP, Sedimantasyon, ALT ve AST ile gruplar karşılaştırıldığında, WBC için her iki tetkik de negatif olanlarla coombs pozitif hastalar arasında anlamlı bir farklılık görülmüştür (p=0.019). GGT ölçümlerinde ise Wright (-) Coombs (+) ile Wright (+) grupları arasında anlamlı bir farklılık vardır (p=0.038). Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Elde edilen veriler doğrultusunda Wright negatif, Coombs pozitif hasta sayısı oldukça yüksek bulunmuştur (%48.3). Çalışmada Brucella serolojisinde STA ile yalancı negatif sonuçlara yol açan blokan antikorların sıklığının ihmal edilemeyecek kadar yüksek oranda olduğu görülmektedir. Yapılan çalışmalarda bu yüksek oran nedeniyle STA sonuçlarının Coombs veya ELISA gibi diğer serolojik yöntemlerle doğrulanması önerilmektedir. Bu nedenle Brucella ön tanısı ile başvuran hastalarda mutlaka Coombs testinin de çalışılması ya da ekonomik kayıpları önlemek bakımından sadece Brucella Coombs testi çalışılması uygun olacaktır. In our country and in many areas of the world Brucellosis, which is widely seen among and causes serious economic loss, is the most common zoonotic disease in the world. Serum samples of the 100 patients, which sent to the laboratory with pre-diagnosis of Brucella were examined in Gaziantep University Medicine Faculty Şahinbey Research Application Hospital. Wright and Coombs agglutination tests were performed on serum samples. The Coombs test and Blocking antibodies were investigated in patients, which are detected negative by the Wright test. Dilutions were studied on the Wright test and started at 1/20 titer to 1/2560 titer and for Coombs test was started at 1/80 titer to 1/640 titer. In the study, Wright test and Coombs test were negative in 46 (%46) of 100 patients, 11 (%11) patients of the Wright test were found positive, the Wright test was negative and Coombs test was positive in 43 (%43) patients. When biochemical parameters of the WBC, RBC, HGB, HCT, CRP, ESR, ALT and AST were compared, a significant differences were observed (p=0.019) between the Coombs positive patients and negative for both of the investigations of WBC. There was a significant difference between the Wright (-) Coombs (+) and Wright (+) groups in GGT measurements (p=0.038). Toward of the obtained data the numbers of the Wright negative, Coombs positive patients were significantly higher (48.3%). In the serology of the Brucella also appears to have a high frequency of blocking antibodies that cause false negative results with STA. Due to this high rate of STA results is recommended for confirmation with other serological methods such as Coombs or ELISA. Therefore, in patients which admitted with the pre-diagnosis of the Brucella must be studied the Coombs test or studying only the Brucella Coombs test would be appropriate to avoid economic losses. 70

Tüberküloz (TB), insanlık tarihi boyunca, enfeksiyon hastalıklar içinde her zaman önemli bir yere sahip olup son yıllarda yeni TB olgularının sayısı hızla artmaktadır. Bu artışta Latent tüberküloz (LTB) olgularının da önemli bir yeri bulunmaktadır. LTB enfeksiyonu olan bireylerdeki en önemli risk, hayatlarının bir döneminde aktif TB enfeksiyonu gelişmesidir. TB enfeksiyonunun hastalığa ilerleme riski konağa ait risk faktörlerine göre değişmektedir. Bu risk normal popülasyonda %5-10 arasındır ve aktif hastalık ve gelişme riski enfeksiyonun edinilmesinden sonraki ilk 2 yıl içinde maksimum düzeydedir. Bu yüzden gelişmiş ülkelerde TB kontrol stratejilerinin en önemli basamaklarından biri de enfekte olan kişilerin belirlenmesi ve bunların tedavi edilmesidir. Bu da LTB enfeksiyonu olan bireylerin doğru tanı ve tedavisini önemli kılmaktadır. Enfekte olduktan sonra hastalanma riskini arttıran en önemli neden kişinin immünsüpresyonudur. Diabetes Mellitus (DM) hastalığı toplumda yaygın olarak bulunan ve immün sistemi baskılayan önemli hastalıklardan biridir. Bu nedenle çalışmada, diyabetli hastalarda latent Mycobacterium tuberculosis prevalansının Quantiferon- TB Gold yöntemiyle saptanması amaçlanmıştır.Çalışmada, endokrinoloji polikliniğinde tanısı konmuş veya tedavi alan Tip 1 ve Tip 2 DM hastaları ve toplumdan randomize olarak oluşturulan kontrol grubu olmak üzere üç grup kendi arasında karşılaştırılmıştır. Her gruptan 25 er kişi olmak üzere toplam 75 kişiden kan alınarak çalışılmıştır. Bu çalışma sonucunda, Tip 1 DM hastalarda 5 (%20), Tip 2 DM grubunda 10 (%40) ve kontrol grubunda 6 (%24) olmak üzere 75 kişinin 21'inde (%28) pozitiflik saptanmıştır. Gruplar arasında ve grupların kontrol grubu ile yapılan istatistiksel değerlendirmesinde anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. Cinsiyet olarak bakıldığında erkeklerde daha fazla görülmekle birlikte anlamlı farklılık bulunmamıştır. Yaş grupları arasında da anlamlı farklılık saptanmamıştır. Sonuç olarak LTB enfeksiyonunu,özellikle immünsüprese kişilerde daha sık saptandığı ve bu nedenle diyabetli kişilerde latent tüberkülozun araştırılması gerekliliği görülmektedir.Anahtar kelimeler: Diyabet, Latent tüberküloz, Quantiferon TB-Gold testi Tuberculosis (TB) has always been an important place within infectious diseases throughout human history and the number of new TB cases has increased rapidly in recent years. Latent tuberculosis (LTB) has an important role in this increase. The most important risk in individuals with LTB is the development of active TB infection at one period in their lives. The risk of progression to TB disease varies depends on the risk factors of the host. This risk is 5-10% in the normal population and active disease and development risk is at the maximal level within the first 2 years after the acquisition of infection. Therefore, one of the most important steps in TB control strategies in developed countries is the identification and treatment of infected individuals. This makes accurate diagnosis and treatment of individuals with LTB infection important. The most important reason that increases the risk of disease after infection is the immunosuppression of the individual. Diabetes Mellitus (DM) disease is one of the major diseases that are common in the society and suppress the immune system. For this reason, in the study, it was aimed to determine the prevalence of latent Mycobacterium tuberculosis in patients with diabetes by Quantiferon-TB Gold method.In the study, three groups were compared among themselves, including Type 1 and Type 2 DM patients who were diagnosed or treated in the endocrinology outpatient clinic and control group randomly selected from the community. Blood samples of a total of 75 individuals, 25 of whom were from each group were studied. As a result of this study, 21 (28%) of 75 patients were found to be positive, including 5 (20%) in Type 1 DM patients, 10 (40%) in Type 2 DM group and 6 (24%) in control group. No statistically significant difference was found between the groups. As for gender, however it was seen in men more, no significant difference was found. No statistically significant difference was found between age groups.In conclusion, the presence of LTB infection especially in immunosuppresive patients is likely to be a risk for infection, and therefore it is necessary to investigate latent tuberculosis in diabetic patients.Keywords: Diabetes, Latent Tuberculosis, Qantiferon TB-Gold Test 70

Bu çalışmada Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama hastanesinde yatan hastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarının Diversilab rep-PCR (Biomerieux, Fransa) yöntemi ile DNA parmak izi analizinin yapılması ve böylelikle suşlar arasındaki yakınlık ve epidemiyolojik özelliklerin tespit edilmesi amaçlanmıştır. Rep-PCR ile yapılan klonal ilişki analizi sonucunda iki ana klon [A (7 izolat), B (5 izolat)], olmak üzere toplam 36 farklı klon tespit edilmiştir. 49 Klebsiella suşunun 7'sinin (%14) A klonunda; 5'inin (%10) B klonunda kümelendiği saptanmıştır. C, D ve E klonları ikişer suş şeklinde kümelenirken, örneklerin % 63'ü (n=31) tekli suştan oluşan kümeler şeklinde dağılım göstermiştir. A klonu pediatri ünitelerinden gönderilen örneklerden oluşmuş ve pediatri yoğun bakım ünitesi örneklerinin % 83'ü (5/6) A klonunda kümelenmiştir. B klonu erişkin hastalardan izole edilen suşlardan oluşmuştur; dahiliye yoğun bakım ünitesinden 3, genel cerrahi servisinden ve gastroenteroloji polikliniğinden birer suş B klonunda kümelenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada hastanemize ait Klebsiella suşlarının epidemiyolojik dağılımı değerlendirilmiştir. Çalışmadaki suşların % 63'ünün klonal ilişki göstermemesi hastanemizde yaygın bir Klebsiella epidemisi olmadığını göstermektedir.Anahtar Kelimeler. Klebsiella, Genotiplendirme, rep-PCR In this study, it was aimed to perform DNA fingerprinting analysis with Diversilab rep-PCR (Biomerieux, France) method and in this context the determination of proximity and epidemiological characteristics between Klebsiella pneumoniae strains obtained from variaus clinical samples in Gaziantep University Medical Faculty Sahinbey Hospital. As a result of the clonal relationship analysis with rep-PCR method, a total of 36 different clones was determined and 2 of them were main clones [A (7 isolates), B (5 isolates)]. It was found that 7 of the 49 Klebsiella strains (14%) were clustered in A clone, 5 were (10%) clustered in B clone. While C, D and E clones clustered in the form of two strains, 63% of the samples showed a single distributed clustering. A clone composed of the samples sent from pediatric units and 83% (5/6) of pediatric intensive care unites samples clustered in A clone. B clone consisted of strains isolated from adult patients; 3 from internal medicine, and one strain from each of general surgery and gastroenterology units. As a result, epidemiological distribution of Klebsiella strains belongs to our hospital was evaluated in this study. It was found that 63% of the strains have no clonal relationship that this show that Klebsiella epidemy is not common in our hospital. Keywords: Klebsiella, Genotyping, rep-PCR 84

Amaç: Epstein-Barr Virus (EBV) Herpesviridae ailesine ait olan, dünya genelinde yaygın olarak görülen, orofarinks salgıları ile yakın temas, kan ve kontamine eşyalarla bulaşabilen bir DNA virüsüdür. EBV enfeksiyonları genel itibariyle çocukluk döneminde gelişmekte ve asemptomatik olarak seyretmektedir. Tanısı klinik, hematolojik ve serolojik bulgulara dayanmaktadır. Cytomegalovirus (CMV), Rubella, Toxoplasma gondii enfeksiyonları ve bazı hematolojik malignensiler EBV enfeksiyonlarıyla benzer klinik tablolara yol açabilir. Aynı zamanda bağışıklık sistemi baskılanmış olan hastalarda primer enfeksiyon çoğunlukla şiddetlidir ve ölümcül olabilir. Bu sebeplerden ötürü EBV tanısı son derece önemlidir. Bu çalışmada EBV tanısında kullanılan testlerden Paul-Bunnell Testi (Monospot test-Heterofil Antikor Testi) ve ELISA testinden elde edilen sonuçların karşılaştırılması amaçlanmıştır.Yöntemler: Çalışmada 2015 yılında Gaziantep Üniversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi'inde EBV şüphesi olan 100 hastanın kan örneği incelemeye alınmıştır. Hastaların yaşları 1-76 arasında değişmekte olup bunlardan 54'ü erkek (%54), 46'sı (%46) ise kadındır. Çalışmada Paul-Bunnell testi ve ELISA testi kullanılmıştır. Çalışmadan elde edilen veriler SPSS programı ile analiz edilmiştir. Bulgular: Yapılan çalışmada monospot testi neticesinde 81 olgunun VCA IgG'si pozitif, 15 olgunun VCA IgM'si pozitif, 76 olgunun EBNA IgG'si pozitif, 26 olgunun ise Paul-Bunnell Heterofil Antikoru (PB-HA) pozitif saptanmıştır. Çalışmada kullanılan her iki test açısından cinsiyet ve yaşa göre gruplar arasında anlamlı farklılık saptanmamıştır. Monospot test sonucunda VCA IgM'i pozitif olan 15 hastanın tamamının ve VCA IgG'si pozitif tespit edilen 81 hastanın tamamı ELISA yöntemi ile de pozitif bulunmuştur. Yine aynı şekilde monospot test ile negatif saptanan hastaların tamamı ELISA yöntemiyle de negatif bulunmuştur. Sonuç: Çalışmadan elde edilen bulgular dikkate alındığında her iki testin sonuçlarının birbiriyle tamamen uyumlu olduğu ve EBV tanısındaki etkinliklerinin aynı olduğu görülmüştür. Objective: Epstein-Barr Virus (EBV) belongs to the Herpesviridae family is a DNA virus that widely seen throughout the world and it can be transmitted through close contact, oropharyngeal secretions, blood and contaminated belongings. EBV infections generally emerge in childhood and remain asymptomatic. The clinical diagnosis is based on haematological and serological findings. Cytomegalovirus (CMV), Rubella and Toxoplasma gondii infections and certain haematogical malignancies may cause similar clinical symptoms with EBV infections. In addition, primer infection mostly acute and may be fatal. For these reasons the clinical diagnosis of EBV is very important. In this study, the comparison of the results obtained from Paul-Bunnell Test (Monospot test-Heterofil Antibody Test) and ELISA test is aimed. Methods: In this study, 100 blood samples obtained from the patients with EBV suspicion at Gaziantep University, Şahinbey Research and Application Hospital in 2015 were investigated. The ages of the patients vary between 1 and 76 and 54 of (54%) cases were male and 46 of (46%) were female. Paul-Bunnell test and ELISA test were used in the study. The data obtained from the study was analyzed with SPSS package program. Findings: As a result of the monospot test, 81 cases found as VCA IgG positive, 15 cases found as VCA IgM positive, 76 cases found as EBNA IgG positive, 26 cases found as Paul-Bunnel Heterophil Antibody (PB-HA) positive. No statistically significant difference was found for the two test used in the study according to gender and age. All of the 15 cases found as VCA IgM positive with monospot test also found positive and all of the 81 cases found as VCA IgG positive with monospot test also found as VCA IgG positive with ELISA. In addition, all the patients determined as negative with monospot test also found as negative with ELISA. Conclusion: Considering the results obtained from the comparison of the two tests it has seen that the results of the two tests are coherent with each other and efficiency of these two test is same with each other. 61

Tüberküloz küresel bir halk sağlığı sorunudur. Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis sıklığındaki artış sorunu daha da kötü hale getirmiştir. Tedavi etkinliğinin artırılması ve dirençli tüberkülozun yayılmasının azaltılması, hızlı, etkili ve güvenilir tanı yöntemlerini gerektirmektedir. Moleküler yöntemler M.tuberculosis ilaç direncinin hızlı tespiti için umut vericidir. Çalışmamızda Ocak 2013-Nisan 2014 arasında Gaziantep Üniversitesi Mikobakteriyoloji Laboratuvarına çeşitli kliniklerden gönderilen ve MGIT 960 sistemi ile M.tuberculosis üremiş 49 izolatta rifampisin (RIF) ve izoniazid (INH) direncini `pyrosequencing` yöntemi ile araştırdık. Aynı zamanda yapılmış MGIT duyarlılık testi ile karşılaştırdık. MGIT 960 duyarlılık yöntemi ile 49 izolattın 37 si hem INH hem de RIF'e duyarlı, 11 izolat mono-dirençli (1 tanesi RIF'e ve 10 tanesi de INH'e dirençli) ve bir izolat da hem RIF hem de INH'e dirençli bulunmuştur. MGIT 960 ile dirençli bulunan iki izolat, Pyrosequencing yöntemi ile duyarlı (rpoB geninde Rifampicin Resistance Determining Region =PRDR bölgesinde herhangi bir mutasyon saptanmamıştır), öte yandan MGIT ile RIF duyarlı bulunan üç izolatta PRDR bölgesinde mutasyonlar saptanmıştır. MGIT 960 sistemi kullanılarak INH direnci saptanan 11 izolattan yalnızca birinde Pyrosequencing yöntemi ile katG geninde mutasyon tespit edilmiş diğerleri duyarlı bulunmuştur. MGIT 960 sistemi ile INH duyarlı saptanan 38 izoların birinde katG geninde mutasyon saptanmıştır. Pyrosequencing yöntemi, RIF ve INH dirençli M.tuberculosis izolatlarının sonuçlarını kısa bir sürede sağlama avantajına sahiptir. Ancak yöntemin henüz fenotipik yöntemlerle korele olduğu söylenemez. Öte yandan pahalı olması, bir direnç kararının verilebilmesi için, ilaç direnciyle ilişkili birkaç genin çalışılmasını gerektirmesi gibi dezavantajları vardır. Ancak, bu dezavantajlarına rağmen moleküler yöntemlerin hızlı tanıda gelecek vaat ettiği söylenebilir.Anahtar Kelimeler: Mycobacterium tuberculosis, Rifampisin, İzoniazid, Pyrosequencing Tuberculosis is a global public health problem. The development of drug-resistant tuberculosis had made the problem even worse. The increase in the frequency of drug resistant Mycobacterium tuberculosis requires an early, efficient and reliable detecting analysis to improve the treatment and reduce the spread of resistant tuberculosis. Molecular methods are promising for the rapid detection of Mycobacterium tuberculosis drug resistance. We investigated the role of pyrosequencing for the detection of rifampicin and isoniazid resistance in 49 Mycobacterium tuberculosis isolates in mycobacterial lab of Gaziantep University for the period between January 2013 and April 2014. MGIT system showed that 37 isolates were susceptible to both INH and RIF, 11 isolates were mono-resistant (one resistant to only RIF and 10 resistant to only INH), and one isolate was resistant to both RIF and INH. By pyrosequencing, 2 rifampicin resistant isolates by MGIT had no mutation in the rifampicin resistance determining gene (RRDR) of the rpoB gene, and 3 of the rifampicin-susceptible isolates had mutations at the RRDR. Regarding isoniazid, pyrosequencing had found that only one of the 11 isoniazid-resistant isolates by MGIT system had mutation in the katG gene, and one of the phenotypically isoniazid-susceptible isolate had mutation in the katG gene. Pyrosequencing technique has the advantage of providing the results of rifampicin and isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates within a short time, but on the other hand, it is expensive, and in order to give a resistance decision, several genes that are associated with the drug resistance must be studied.Key Words: Mycobacterium tuberculosis, rifampicin, isoniazid, pyrosequencing. 96

Amaç: Bu çalışmada, koroner arter hastalığı nedeni ile kardiyovasküler cerrahi uygulanan hastalarda gelişen enfeksiyonların bölgelere göre dağılımı, alınan mikrobiyolojik kültürde üreyen mikroorganizmaların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılık testlerinin yapılması ve gelişen enfeksiyon etkenlerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, Temmuz 2014 – Şubat 2015 tarihleri arasında Sağlık Bakanlığı Adıyaman Üniversitesi Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıp Fakültesi kampüsünde koroner arter hastalığı nedeni ile kardiyovasküler cerrahi uygulanan ve koroner bypass operasyonu yapılan 22'si kadın ve 48'i erkek olmak üzere toplam 70 hasta dâhil edilmiştir. Hastaların kan, trakeal aspirat, mediasten – toraks dren sıvısı ve idrar örnekleri alınarak kültürü yapılmıştır. İzole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu, klasik bakteriyolojik yöntemler ve BD Phoenix tm 100 identifikasyon kitleri kullanılarak yapılmıştır.Bulgular: 70 hastanın 6'sında (%8,6) toplam 7 enfeksiyon atağı gelişmiştir. Görülen enfeksiyonlar; solunum yolu enfeksiyonu 2 (%2,8), üriner sistem enfeksiyonu 4 (%5,7), organ/boşluk enfeksiyonu 1(%1,4) olarak tespit edildi. Görülen enfeksiyonlarda en sık karşılaşılan mikroorganizma Escherichia coli olurken, tüm enfeksiyonlarda en dirençli seyreden patojenler ise E. coli ile Klebsiella pneumoniae olarak belirlendi. Sonuç: Bu sonuçlar ışığında, hastanemizde enfeksiyonların önlenmesi ya da azaltılması amacıyla yeni önlemlerin alınması ve hizmet içi eğitimlerin uygulanmasına ağırlık verilmesinin önemi vurgulanmıştır.Anahtar kelimeler: Kardiyovasküler cerrahi, enfeksiyon ve bypass Purpose: The aim of this study is to evaluate the distribution of postoperative infections to the regions and to make microorganisms identification and antibiotic sensitivity tests of culture materials' of patients who undervent cardiovascular surgery because of coronary artery disease. Methods: Seventy patients (22 females, 48 males) who referred to Adiyaman University School of Medicine Educational and Research Hospital (between July 2014-February 2015) for cardiovascular surgery because of coronary artery disease were performed. From patients cultivation of blood, tracheal aspirate, mediastinal/thoracal drainage material and urine samples performed. Identification of isolated microorganisms made by classical bacteriologic techniques with Bd Phoenix™ 100.Findings: From 70 patients, in 6 (%8,6) patients total 7 developed an attack of infection. Common infections; respiratory tract infection 2(%2,8), urinary tract infection 4 (5.7%), and organ/space infection 1 (1.4%) was seen as. The most common microorganisms were Escherichia coli. The most resistant microorganisms were E. Coli and Klebsiella pneumoniae infections.Result: In consideration of these results, new prevention plans must be developed to prevent and decrease the rate of infections and in-service (in-house) training programs emphasised.Key Words: Cardiovascular surgery, infection and bypass 57

Amaç: Hepatit A dünyada akut viral hepatitin en sık görülen şeklidir. Hepatit A görülme sıklığı başlıca coğrafi farklılıklar, hijyen ve diğer sağlık koşulları ve sosyoekonomik gelişmişlik düzeyi göstergeleri ile yakından ilişkilidir. HAV enfeksiyonu çoğunlukla asemptomatik geçirilmekle birlikte, hastalık önemli morbidite ve mortaliteye neden olabilir. Bu çalışmada Gaziantep-Üniversite hastanesine başvuran erişkin ve pediatrik hastalarda Hepatit A enfeksiyonu seroprevalansının saptanması ve çeşitli sosyo-demografik verilerle olan ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Gaziantep Üniversitesi Şahinbey hastanesine çeşitli hastalıklarla başvuran erişkin ve pediatrik kişilerden (Şubat 2014- Haziran 2014 arasında) serum toplanarak ELISA yöntemiyle anti-HAV IgG ve IgM araştırılmıştır. Ayrıca kişilerin sosyo-demografik bilgileri anket ile saptanmıştır. Bulgular: Çalışmaya 47'si kadın ve 55'i erkek olmak üzere toplam 102 kişi dahil edilmiştir. Bunların 87'si (%85.3) anti HAV IgG, 2'si (2.0%) anti-HAV IgM pozitif tespit edilmiştir. Cinsiyet ile HAV IgG arasında anlamlı farklılık saptanmamıştır. Yaş gruplarına göre değerlendirildiğinde Anti-HAV IgG seropozitifliğinin yaşlanma ile arttığı saptanmıştır. Anti-HAV IgG seropozitifliği, 0-5 yaş kişilerde %50 iken, 65 yaş ve üzerindekilerde %90 oranında pozitif bulunmuştur. Anti-HAV IgG seropozitifliği ile içme suyu çeşitleri arasında analmlı farklılık bulunmamakla birlikte ticari su kullananlarda seropozitiflik daha düşük saptanmıştır. Aşılandığını belirten 6 kişinin HAV IgG değerleri negatif bulunmuştur.Sonuç: Türkiye'de hepatit A ile karşılaşmanın ileri yaşlara kaydığı soylenebilir. Bu hastalık ilerlemiş yaşlarda gençlerden daha komplike geçirilmektedir. Adölesanlar ve risk grubundaki kişilerin HAV enfeksiyonu için değerlendirilmesini ve duyarlı bireylerin HAV enfeksiyonuna karşı aşılanması önerilmektedir Objective Aims: Hepatitis A is the most common form of acute viral hepatitis in the world.Major geographical differences in endemicity of hepatitis A are closely related to hygienic and sanitary conditions and other indicators of the level of socioeconomic development.Although most patients are asymptomatic,the disease can produce significant morbidity and mortality.In this study we aimed to investigate the seroprevalence of hepatitis A for adults and pediatric in university hospital- Gaziantep, and to demonstrate the relationship between various socio-demographic data and seropositivity. Method: Serum samples, were taken from individuals who were admitted to Sahinbey hospital in Gaziantep with various diseases between February 2014 and June 2014, Anti HAV IgG and Anti HAV IgM, were investigated by ELISA method. Also individual's socio-demographic data was determined by a questionnaire. Result: A total of 102 individuals, 55 male and 47 female, were included in the study.Anti HAV IgG positivity was detected in 87(85.3%), anti HAV IgM positivity was detected in 2 (2.0%). There weren't any significant gender differences in HAV IgG. By analysis according to the age, Anti-HAV IgG seropositivity increased with aging.Anti-HAV IgG seropositivity was (50%) in children who are up to 5 and (90 %) in the adults (65 years old and over).Although there was no significant difference in HAV IgG seropositivity according to the types of drinking water supply, HAV IgG seropositivity was detected in a less percentage in individuals who drink the commercial water.The values of Anti-HAV IgG were negative in 6 individuals who reported that they received the HAV vaccine. Conclusion: In Turkey HAV infection has been shifted to older ages than younger age.The disease is more complicated in advanced age than younger people. We recommend that subjects who are susceptible against to HAV infections might be included in the routine immunization schedule. 71

Hepatit B virüs (HBV) enfeksiyonları tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de önemli bir halk sağlığı sorunudur. Dünya üzerinde HBV ile karşılaşmış iki milyar kişi olup, bunların 400 milyonu HBV taşıyıcısıdır. HBV enfeksiyonu klinik olarak akut, fulminant, kronik hepatit veya kronik taşıyıcılık olarak görülebildiği gibi karaciğer sirozu ve hepatoselüler karsinomaya (HCC) da yol açabilmektedir. Her yıl yaklaşık bir milyon kişi siroz ve HCC gibi HBV ilişkili nedenlerle ölmektedir. Dünyadaki HCC olgularının %60-80?i HBV ile ilişkilidir.HBV?li hastalarda tedavinin düzenlenmesi ve antiviral cevabın değerlendirilmesi açısından DNA düzeyi önemli bir kriterdir. Tedavi uygulanan hastalarda son zamanlarda nüleotid anologlarına karşı artan oranlarda direnç gelişimi izlenmekte ve maliyeti oldukça yüksek olan tedavinin sonuçsuz kaldığı görülebilmektedir. Antiviral ajanlara karşı oluşan direnç gelişiminin ana sebebi, HBV polimeraz enziminin hata yapma oranının yüksek olması ve direçli mutant suşların uzun süreli ilaç kullanımı ile birlikte seleksiyona uğrayarak baskın hale gelmesidir. Bu çalışmada Hepatit B?li olgularda HBV DNA düzeyi ile birlikte serolojik ve biyokimyasal test sonuçları değerlendirilmiş, DNA polimeraz gen bölgesinde meydana gelmesi muhtemel antiviral dirence neden olan mutasyonlar araştırılmıştır.Çalışma, Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesinde Mart 2012- Ocak 2013 tarihleri arasında yapıldı. Örnekler çeşitli polikliniklerden HBV enfeksiyonu ön tanısıyla gönderilen ve yapılan rutin testler sonucunda serum HBsAg ve HBV DNA?sı pozitif olan hastalardan seçildi. Çalışmaya 64?ü (%64.6) erkek, 35?i (%35.4) kadın 99 hasta dahil edildi. Hastaların %79.8?i erişkin, %20.2?si çocuktu. Bu hastaların biyokimyasal parametreleri (ALT, AST) ve hepatit belirteçleri (HBsAg, HBeAg) ile HBV DNA düzeyleri aralarındaki ilişki karşılaştırıldı. Serum HBsAg, HBeAg ve transaminazlar (ALT, AST) ile HBV DNA düzeyleri arasındaki ilişki istatiksel olarak anlamlı bulundu. Ayrıca antiviral ilaçlara karşı direnç gelişimini belirleyen HBV DNA polimeraz gen mutasyonları pyrosekans DNA dizi analizi yöntemiyle (PyroMark Q24, QIAGEN, Almanya) araştırıldı. Bu amaçla 169, 173, 180, 181, 184, 194, 202, 204, 236 ve 250 numaralı kodonlar sekanslanarak ilaç direnci mutasyon analizi yapıldı. Yalnız bir hastada 204 numaralı kodonda meydana gelen mutasyon ile metiyonin aminoasidinin valin?e dönüşmesi sonucu lamivudin direnci saptandı.Tedavinin planlanmasında HBV-DNA düzeylerinin saptanması kadar, antivirallere karşı gelişen direncin araştırılması da önemli hale gelmektedir. Bu nedenle çalışmamızın bölgemizdeki ilaç direnci saptanması açısından önemi vardır.Anahtar Kelimeler: Hepatit B, HBV DNA, HBsAg, HBeAg, ALT, AST, pyrosekans dizi analizi, ilaç direnci Hepatitis B virus (HBV) infections, are important public health problem in our country as well as all over the world. Two billion people on earth have encountered with HBV, 400 million of them are HBV carriers. Althought HBV infection is clinically seen as acute, fulminant, chronic hepatitis or chronic carrier, it may also cause liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC). One million people die from the reasons like cirrhosis and HCC associated with HBV each year. 60-80% of HCC cases are associated with HBV in the world. DNA level is an important criterion for evaluation of the regulation of treatment and consideration of antiviral response in patients with HBV. Recently, increased resistance development monitored against nucleotide analogues in treated patients and high cost treatment can be failed. The main reason for the development of the resistance against antiviral agents is the high error rate of HBV polymerase enzyme and becoming dominant of mutant strains as a result of long term drug use and undergoing selection. At this study, HBV DNA level, serological and biochemical test results were evaluated in patients with chronic Hepatitis B and mutations cause to antiviral resistance likely to occur in DNA polymerase gene were researched.This study was carried out in Şahinbey Hospital of Gaziantep University, between Marc 2012- January 2013. Samples were selected among the patients with serum positive HBsAg and HBV DNA as a result of routine tests sent from various polyclinics with HBV pre-diagnosis. A Toplam of 99 patients included in the study that 64 (64.6%) of them were male and 35 (35.4%) of them were female. From the patients, 79.8% were adults and 20.2% were children. The relationship between biochemical parameters (ALT, AST), hepatitis markers (HBsAg, HBeAg) and the levels of HBV DNA were compared. As a result of the study, statistically significant relationship was found between serum HBsAg, HBeAg, transaminases (ALT, AST) and the levels of HBV DNA. In addition, DNA polymerase gene mutations which determine the development of resistance against antiviral drugs were investigated by pyrosequence DNA sequencing method (Pyromark Q24, QIAGEN, Germany). For this purpose, drug resistance mutation analyze was made by sequencing of codons numbered 169, 173, 180, 181, 184, 194, 202, 204, 236 and 250. In only one patient, Lamivudine resistance was detected as a result of mutation occurred in codon 204 and turning of methionine into valine.For the planning of treatment, as well as the detection of levels of HBV DNA, the investigation of resistance developed against antivirals also become important. Therefore, this study is important in terms of the detection of drug resistance in our region.Key words: Hepatitis B, HBV DNA, HBsAg, HBeAg, ALT, AST, pyrosequence analysis, drug resistance 111

Legionella pneumophila doğal su kaynakları ve özellikle okul, hastane, otel gibi büyük binaların su sistemlerinde yerleşerek, sistemin dışarı açılan musluk, duş başlığı gibi uç noktalarından etrafa yayılan kontamine su damlacıklarının solunması ile insanlara bulaşan bir bakteridir. Özellikle yaşlı, günde bir paketi geçen sigara kullanımı ve alkol bağımlılığı olan ya da bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda önemli bir akciğer infeksiyonu olan lejyoner hastalığına neden olurlar. Lejyoner hastalığı grip ve zatürre gibi geliştiğinden, hastalığın tanısında meydana gelen gecikmeler nedeniyle tedavide başarı ancak etkili bir antibiyotiğin uygulanması ile elde edilmektedir.Bu çalışmada Ocak 2013 tarihinde Şehitkamil Devlet Hastanesinde çalışan 92 kişi infeksiyon yönünden değerlendirmeye alındı. Çalışmaya alınan kişilerin yaş, cinsiyet, eğitim düzeyi, çalıştığı servisler kaydedildi. Legionella pneumopila antikor tespitinde ELISA yönemi kullanıldı. Sonuç olarak hastanenin yeni açılması hastanede çalışanların genç olması ve hastanede hijyen kurallarına uyulması nedeniyle legionella infeksiyonu hastane çalışanlarının hiçbirinde gözlenmedi.Anahtar kelimeler: Legionella, ELISA Legionella pneumophila is a bacteria that settles on the plumbing systems of the large buildings such as school, hospital, hotel and spreads to humans by the respiration of the contamined water drops that goes out from the outsources of the plumbing system such as taps and shower heads. They cause legionnaires? disease which is an important lung infection on old patients that smoke more than a pack of cigarettes a day and are addicted to alcohol or those whose immunity system have been pressurized. As legionnaires? disease develops like flu and pneumonia, success of the cure can only be obtained by the use of a strong antibiotic because of the delays with the diagnosis of thedisease. In this study, 92 people working in January 2013 Şehitkamil Devlet Hastanesi were evaluated in terms of infection. Individuals included in the study of age, gender, level of education, work services were recorded. Legionella pneumophila antibody investigated by ELISA. As a result, the opening of a new hospital, the hospital complied with the rules of hygiene in the hospital due to the employees to be younger and legionella infection was observed in any of the hospital staff. Keywords: Legionella, ELISA 51

Kabakulak hastalığı, etkeni Rubulavirüs olan akut gidişli ve bulaşıcı viral bir enfeksiyondur. Genellikle okul çağındaki çocuklarda görülmesine rağmen, aşılanmayan veya hastalığı geçirmeyen kişilerde ileri yaşlarda da görülebilir. Virüsün ileri yaşlardaki enfeksiyonu ağır komplikasyonlara yol açabilmektedir. Özellikle erkeklerde testisleri tutup orşit yapması, sterilite oluşturması açısından çekinilen bir komplikasyondur. Kabakulak geçirmemiş ve aşılanmamış sağlık personeli bulundukları ortam nedeniyle yüksek risk altındadırlar.Bu çalışmada Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde görevli, Kabakulak geçirmediğini ve aşılanmadığını bildiren 76 sağlık personelinin serum örneklerinde ELFA yöntemi ile kabakulak IgG antikoru araştırılmıştır. Serumlar Merkez ELISA laboratuarında Mumps IgG (VIDAS MPG, Biomerieux, France) kiti ile çalışılmıştır. Kabakulak IgG seropozitifliği kadınlarda %93.11, erkeklerde %93.62 idi. Kabakulak IgG seronegatifliği kadınlarda %6.89, erkeklerde %6.38 idi. Seronegatiflik en fazla kadınlarda 26-30 yaş grubunda, erkeklerde ise 31-35 yaş grubunda görülmüştür. Yine kabakulak IgG seronegatifliği yardımcı sağlık personeli (YSP) meslek grubunda en fazladır. Seronegatif olduğu tespit edilen sağlık personelleri bilgilendirildi ve aşılanmaları için gerekli önerilerde bulunuldu. Mumps is a acute trending viral infection whose infectious agents is Rubulavirüs. although usually seen in children of school age, the disease may also occur in unvaccinated or uninfected adults. Infection of the virus may cause serious complications in older age. Especially occurance of orchitis which keeps testis in men is undesired complication because of causing sterility. Uninfected and unvaccinated health care workers (HCW) are at high risk because of their workplace conditions.In this study, mumps IgG antibody using ELFA method in serum samples of 76 health care workers (HCW) who stated that they were uninfected and unvaccinated was examined. Serums were analysed in Central ELISA laboratory with Mumps IgG (MPG VIDAS, Biomerieux, France) kit. Mumps IgG seropositivity was found 93.11% in women and 93.62% in men. Mumps IgG seronegativity in women was 6.89% and in men 6.38%. Seronegativity was the highest at women in 26-30 age group and at men in 31-35 age group. Also mumps IgG seronegativity was found higher in medical assistant group. Health care providers who are seronegative were informed about mumps disease and recommendations were made for vaccination. 50

Tüberküloz infeksiyonunun laboratuvar tanısında, mikroskopik boyama yöntemleri ve bakteri kültürü gibi klasik yöntemlerin yanısıra serolojik ve moleküler tanı yöntemlerinden de faydalanılmaktadır. Antijen veya antikor tespitine dayanan serolojik testlerin yanında interferon gama üretiminin ölçülmesi, son yıllarda önemli tetkikler arasına girmeye başlamıştır. İn vivo deri testlerinden TDT'ye alternatif olarak early secretory antijen target (ESAT-6) (erken salınan tüberküloz antijeni) ve culture filtrate protein (CFP-10) (koloni oluşturan protein) gibi antijenler interferon gama indüksiyonu amacıyla kullanılmıştır. Çalışmada Mycobacterium tuberculosis tanısında kullanılan TDT ve Quantiferon yöntemlerinin duyarlılıkları ve özgüllükleri karşılaştırıldı. Çeşitli kliniklerden immunsupresif tedavi alan hastalar ve sağlıklı kontrol grubu latent tüberküloz infeksiyonu araştırılmak üzere değerlendirmeye alındı. Hasta ve kontrol grubuna Quantiferon testi (Quantiferon ?TB Gold In Tube, Cellestis Limited Australya) ve TDT çalışıldı, akciğer grafileri değerlendirildi. . Hasta grubunda Kappa değeri 0.345, p=0.002 saptandı. Kontrol grubunda ise Kappa=0.256 (p=0,040) bulundu. Quantiferon TB-Gold in tube testi için: Sensivite: 24.14 (Güven aralığı 13.87-37.17), spesifite: 53.97 (Güven aralığı 40,94-66,61). TDT için: Sensivite 49.23 (Güven aralığı 36,60-61,93), spesifite: 61,54 (Güven aralığı 48,64-73,35)Quantiferon yöntemi özellikle klinik bulgu vermeyen latent tüberküloz infeksiyonunun araştırılmasında kullanılan uygun bir yöntem olarak kabul edilmektedir. Halen rutinde kullanılan TDT `ye bir alternatif olabilir.Anahtar kelimeler: Kontrol grubu, İmmunsuprese hasta, Latent tüberküloz infeksiyonu, TDT, Quantiferon TB-Gold in tube. Besides classical diagnostic methods such as microscopic staining and bacterial culture, serological and molecular methods are being utilized in the diagnosis of tuberculosis. Along with the serological methods which depend on antigen and antibody detection, measurement of interferon gamma production has been important in last years. Antigens such as early secretory antigen (ESAT-6) and culture filtrate protein (CFP-10) are used to induce interferone gamma as an alternative to tuberculin skin test (TCT). This study aimed the determination of Mycobacterium tuberculosis infection in immuncompromised patients and in control group by Quantiferon and TCT methods. A futher aim was to compare their specificity and sensivity. In this study latent tuberculosis was investigated in immuncompromised patients from various clinics and in control group. Interferon gamma was detected and TCT was applied to both groups. Pulmoner radiographies of patients and control groups? were investigated. Quantiferon test was performed by a commercial kit (QuantiFERON-TB gold IT Cellestis Limited, Australia ). In immuncompromised group kappa value was 0.345, p=0.002. In control group kappa was 0.256, p=0.040. For Quantiferon TB-Gold in tube test, sensivity was 24.14% (Confidence interval: 13.87-37.17) and specificity was 53.97% (Confidence interval: 40.94-66.61). For TDT, sensivity was 49.23% (Confidence interval: 36.60-61.93) and specificity was 61.54% (Confidence interval: 48.64-73.35).Quantiferon?TB Gold test is an effective method especially in determination of latent tuberculosis infection. It may be an alternative to TCT that is utilized currently in routine.Key words: Control group, Immuncompromised patients, Latent tuberculosis, TCT, Quantiferon ?TB Gold. 89

Epstein Barr Virus (EBV) infection often causes a triad of fever, sore throat and adenopathy, referred to as Infectious M ononucleosis. Gastrointestinal manifestations are frequently present but often unrecognized. The aim of this study is to present cases who admitted emergency service with acute cholestatic hepatitis and acute abdomen pain in the course of Ebstein-Barr Virus (EBV) infection. The five cases, two of whom were male and three female were between 14 and 51 years of age. In each of the cases, cholestatic hepatitis, mesenteric lymphadenomegaly and severe abdominal pain were observed. Also two of five patients showed thickening in the wall of the gallbladder (acalculosus hydropical gallbladder), ascites and multiple lymphadenomegaly in porta hepatis, paraaortocaval and mesenteric areas by abdominal ultrasonography. These clinical cases of acute cholestatic hepatitis resolves spontaneously in EBV infections with symptomatic treatment. Therefore these cases presented in order to draw attention to the fact that there may be different presentations in EBV infections. On the other hand, clinicians should be aware of co-occurence of acute cholestatic hepatitis during EBV infections. In such cases, radiology seriously helps to diagnosis, efficient radiological consultation and ultrasonic detection prevent drug overuse and invasive procedures. © Medwell Journals, 2010. http://docsdrive.com/pdfs/medwelljournals/rjmsci/2010/136-141.pdf http://docsdrive.com/pdfs/medwelljournals/rjmsci/2010/136-141.pdf

Kistik ekinokokoz, Echinococcus granulosus'un metasestod formunun sebep olduğu bir helminto-zoonozdur. Kistik ekinokokoz'da klinik özelliklere dayanarak tanı koymak zor olmakta; tanı, görüntüleme yöntemleri ve spesifik antikor yanıtının saptanmasını amaçlayan serolojik yöntemlerle desteklenmektedir. Bu çalışmada, Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi Merkez Laboratuvarı'na Mayıs 2007-Temmuz 2008 tarihleri arasında kist hidatik ön tanısıyla gönderilen 163 hasta serolojik yönden değerlendirildi.Hastalara ait serum örneklerinde ticari indirekt hemaglütinasyon (IHA), indirekt floresan antikor (IFA) ve enzim immuno assay kitleri ile E. granulosus'a karşı oluşan Ig G tipi antikorlar araştırıldı. Sonuçlar Western blot yöntemiyle doğrulandı. Buna göre toplam 163 hastanın 83'ünde (%51) IHA testi ile, 80'inde (%53) IFA testi ile, 70'inde (%42.95) ELISA testi ile pozitiflik tespit edildi. Western blot doğrulama testine göre IHA testinin duyarlılığı %88.76, özgüllüğü %94.59, IFA testinin duyarlılığı %89.89, özgüllüğü %93.24, ELISA testinin duyarlılığı %78.65, özgüllüğü %100 olarak saptandı. Western blot yöntemiyle antijenik bantlara karşı oluşan antikorlar saptanarak, bunun kistin lokalizasyonu ve biyokimyasal değerlerle ilişkisi araştırıldı.Western blot yöntemiyle 163 serum örneği araştırıldığında, serolojik yöntemlerle (IHA, IFA, ELISA) negatif saptanan 69 örnekte herhangi bir bant saptanmazken pozitif saptanan 94 serum örneğinde ise olguların 66'sı p7 kDa bandının varlığı nedeniyle pozitif, 23'ü p7 kDa bandı olmayıp, p16/18, p24/26 ve p39 kDa bantların varlığı nedeniyle şüpheli/sınırda ve 5'i de sadece p39 kDa bandının varlığı nedeniyle negatif olarak değerlendirildi. Negatif bulunan 5 örneğin dördü IHA ile beşi ise IFA yöntemi ile pozitifdi. Pozitif olarak değerlendirilen 71 olguda kist hidatik olduğu operasyonla doğrulandı. Ancak operasyonla kist hidatik saptanan 17 karaciğer ve 6 akciğer olgusunda p7 ve p16-18 kDa bantları saptanamazken diğer bantlar bulunmaktaydı. Bu olgular şüpheli pozitif olarak değerlendirildi. Oluşan bantlarla kistin lokalizasyonu ve biyokimyasal değerler arasında belirgin bir ilişki saptanamadı.Sonuç olarak kistik ekinokokozun serolojik tanısında IFA ve IHA yöntemlerinin benzer şekilde duyarlı ve özgül olduğu, ancak ELISA yönteminin bu iki yönteme göre daha yüksek özgüllüğe sahip olduğu (%100) saptandı. Bununla birlikte IHA yönteminin kullanım kolaylığı ve ucuzluğu açısından uygulanabilir olduğu kanısına varıldı. Cystic echinococcosis is a helmintho-zoonosis caused by metacestode form of Echinococcus granulosus. The diagnosis of cystic echinococcosis is difficult by clinical features; it is supported by imaging techniques combined with serological methods that aim the determination of specific antibody response. In this study, 163 patients who referred with the suspicion of cystic echinococcosis to the Central Laboratory at Gaziantep University Şahinbey Research Hospital between May 2007 and July 2008 were evaluated serologically.Type Ig G antibodies against E. granulosus in serum samples of patients were investigated by a commercial indirect hemagglutination (IHA) test, by an indirect fluorescence antibody (IFA) test, and by an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Results were comfirmed by Western blot method. Out of 163 patients, 83 (51%) were positive with IHA, 85 (53%) were positive with IFA, and 70 (43%) were positive with ELISA. According to Western blot test, sensitivity and specifity of IHA test were 88.76% and 94.59%, respectively, for IFA sensitivity was 89.89% and specificity was 93.24%, and for ELISA sensitivity was 78.65% and specificity was 100%. Using Western blot technique, presence of antibodies against antigenic bands were determined, and their relationship to cyctic localization and biochemical parameters were investigated.As 94 out of 163 serum samples, which were positive with serological methods (IHA, IFA, ELISA) were studied with Western blot method; 66 of the cases were positive due to the presence of p7 kDa band, 23 were suspicious/intermediate due to the absence of p7 kDa band, but the presence of p16/18, p24/26 and p39 kDa bands, and 5 were negative due to the presence of p39 kDa band only. Four of these five negative cases were positive by IHA, and all of them was positive by IFA technique. Sixtynine cases which were negative with serological methods (IHA, IFA, ELISA), were negative with Western blot also. In 71 positive cases cystic echinococcosis was confirmed with surgery. However, although in 17 hepatic and six pulmonary cases, which were surgically proven, p7 and p16-18 kDa bands were not determined, other bands were found. These cases were evaluated suspiciously positive. No relationship between the bands and cyctic localization and biochemical parameters was found.As result, IFA and IHA methods were found equally sensitive and specific in the serological diagnosis of cystic hydatidosis, but ELISA method was found more spesific (100%) when compared to these two methods. In addition to that, due to its application facility and low cost, IHA method was found suitable to use. 79

Dnya nfusunun yarıdan fazlasında infeksiyon yapan, byk oranda işgc vemaliyet kaybına yol aan Helicobacter pylori, gastrointestinal sistemin inflamatuvarinfeksiyonlarından kalp damar hastalıklarına, otoimmun hastalıklardan kansere kadaretken patojen olduğu ispatlanan veya sulanan nemli bir bakteridir. Bu bakteri ilelkemizde ve yurtdışında eşitli prevalans, patojenite ve aşı araştırmaları iin alışmalaryapılmaktadır. Biz de blgemizdeki suşlarla yaptığımız alışmada hem epidemiyolojikzelliği, hem de st gastrointestinal sistem H. pylori infeksiyonlarında bakterininpatojenliğinden sorumlu olan genlerden vacA ve cagA varlığını araştırarak,organizmanın buna verdiği immun yanıtı değerlendirdik. Burada varolan patojeniteninzellikle bu bakterinin eradikasyonu iin yapılan aşı alışmalarına ne oranda etkidebulunabileceğini araştırdık.Gaziantep niversitesi Şahinbey Araştırma ve Uygulama Hastanesi, Gastroentero-loji Bilim Dalına st GIS şikayetleriyle başvuran ve endoskopiyle non lser dispepsi,gastrit, gastrozefajial refl, mide lseri, duodenal lser ve gastrik karsinoma n tanısıkonan 154 hasta alışmaya alındı. Hastaların epidemiyolojik zellikleri anket formu iledeğerlendirildi. Hastalardan endoskopi ile biyopsi rnekleri ve periferik venz kanalındı. re nefes testi ile H. pylori pozitifliği araştırıldı. re nefes testi pozitif 96hastada polimeraz zincir reaksiyonu ile 16S rRNA, vacA ve cagA gen blgelerivaraştırıldı. Aynı zamanda bu hastaların serumlarından spesifik H. pylori IgA'nınseviyeleri ELISA yntemiyle araştırıldı.Elde edilen sonular H. pylori infeksiyonunda yaş, cinsiyet, hastalık ilişkileri, ilakullanımı ile ilişki, aile ii geiş hakkında istatistiki bilgiler sağlamış, blgemizdeinfeksiyonun prevalansı hakkında bilgi vermiştir. H. pylori infeksiyonundapatojeniteden sorumlu ok sayıda faktr olduğu, bunlardan zellikle vacA genininvarlığının nemli bir infeksiyz faktr olduğu gsterilmiş, vacA ve cagA genlerininbirlikteliğinin IgA retimini daha iyi tetiklediği saptanmıştır. H. pylori which is an important pathogen, is the cause of more than half of worldpopulation and it is also the reason of great loss of work, labor force and cost and it isproved to be or accused of being the efficient pathogenic of diseases fromgasrointestinal system inflammatory infectious to cardiological diseases, fromautoimmune diseases to cancer. There are many investigations about this pathogen onthe prevalence, pathogenity and vaccine in our country and in the world. In our study,we analyzed the immune response of organism by searching the existence of vacA andcagA genes that are the cause of pathogenic character of H. pylori in the infection ofupper gastrointestinal tract and of its epidemiological characteristics. We researchedthat how the existence of patogenicity affects the vaccine studies that developed for theeradication of this bacterium.One hundred fifty four patients were included taken from Gaziantep University,Medical Faculty Hospital, Department of Gastroenterology and whom they were pre-diagnosed as non-ulcer dyspepsia, gastro-esophageal reflux, ulcer, duodenal ulcer andgastric carcinoma by endoscopy. The epidemiological characteristics of patients wereevaluated by questionnaire. Biopsy materials and peripheral venous blood samples frompatients were collected. Being positive or not samples of H. pylori was determined byviiurea-breath test. In the 96 patients who had positive for urea-breath test, 16 s rRNA,vacA and cagA genes were researched using the PCR. In the meantime, level of H.pylori specific IgA was researched in the serum by ELISA method. The results wereprovide information about age, sex, relation with chronic diseases and drug using andstatistical information about domestic transition and give information about theprevalence of infectious in our region. It was determined that there are many factors thatare the cause of patogenity of H. pylori infectious and especially the existence of vacAgene is an important infectious factor and IgA production is triggered by thetogetherness of vacA and cagA genes. 100

Hepatit C virüsü (HCV) kronik karaciğer hastalığı, karaciğer sirozu vehepatoselüler karsinomun önemli bir nedenidir. Farklı genotipteki virüslerin biyolojikdavranışları, tedaviye cevapları ve coğrafik dağılımları farklılık gösterir. Bu çalışmadaHCV pozitif hastalarda genotip dağılımının araştırılması, HCV genomunda mutasyonanalizi ve hastalarda klinik gidişin ve tedaviye yanıtın genotiple ve mutasyonlarlailişkisinin belirlenmesi amaclandı.Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Gastroenteroloji Bilim Dalı'nda kronik HCVinfeksiyonu tanısı almış 51 hasta çalışmaya dahil edildi. Hastaların 26 'sı erkek, 25 'sıkadındı. Yaş ortalaması 50,0±8,6 idi. Toplam 45 hastada (%88.2) genotip 1, baskın olantip olarak saptandı. Bunların 40 `ında (%78.4) genotip 1b olarak saptandı. Hastaların5'i (%9.8) genotip 1a, 4'ü (%7.8) genotip 2a, 1'i (%2) genotip 3a, 1'i (%2) genotip 4colarak bulundu. Hastalarda virüsün 5'UTR bölgesinin nükleotid ve aminoasit sekansdizileri belirlenerek araştırılan mutasyonlarda 20 insersiyon, 16 delesyon, 14transversiyon, 17 transisyon mutasyon bulundu.Hastaların 33 `ünde (%64.7) kalıcı viral cevap elde edilirken 18 hastada (%35.3)tedaviye cevap alınamadı. Genotip 1 ve Genotip non-1 hastalar olarak tedaviye cevababakıldığında Genotip 1 hastalarda tedavi başarısı %64.4 iken non-1 hastalardaki tedavibaşarısı %66.6 idi. Gruplar arasında istatiksel olarak anlamlı fark yoktu. Mutasyonlaragöre tedavi cevapları ve laboratuar bulgularına etkisi karşılaştırıldığında gruplararasında istatiksel olarak anlamlı fark saptanmadı.Sonuç olarak bölgemizde HCV genotiplerinden en sık genotip 1b görülmektedir.Tedaviye cevap açısından genotip ve mutasyonların etkisi bizim hasta grubumuzdaanlamlı olarak saptanmamıştır. Hepatitis C Virus (HCV) is an important cause of chronic liver disease, livercirrhosis and hepatocellular carcinoma. Different viral genotypes may differ in terms ofbiologic behaviour, treatment response and geographic distribution. In this study, weaimed to detect genotype distribution in our region, analysis of mutations in viralgenome, effect of genotype and mutations on clinical course of the disease and treatmentresponse.Fiftyone(51) patients who were diagnosed as having chronic HCV infection atGaziantep University, Faculty of Medicine, Department of Gastroenterology wereincluded into the study. Patients composed of 26 males and 25 females with a mean ageof 50,0±8,6. years .Genotype 1 is determined as predominant genotype in 45 (88.2%) out of 51patients. Of these, 40 (78.4%) patients were diagnosed as genotype 1b, 5 (9.8%) asgenotype 1a, 4 (7.8%) as genotyp 2a, 1 (2%) as genotyp 3a, 1 (2%) as genotyp 4c.According to mutations analysis on nucleotide and aminoacid sequences, 20 insertion, 16deletion, 14 transvertion, 17 transition mutations were detected.Sustained virologic response was detected in 33 (64.7%) patients. 18 patients(35.3%) were non-responders to treatment. Treatment response in genotype 1 patientswas 64.4% and %66.6 in genotype non-1 patients. No statistically significant differencein treatment response and laboratory data according to the mutations was detected.In conclusion, the most frequent genotype in our region is genoype 1b. Effect ofviral genotype and mutations on treatment response was not detected in our patientpopulation. 91

YÜKSEK LİSANS TEZİ 0-12 YAŞ ÇOCUKLARDA FARKLI YÖNTEMLERLE Giardia intestinalis SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI ÇAPAN, Ali Osman Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı Tez Yöneticisi: Yrd. Doç. Dr. Tekin KARSLIGİL OCAK 2004, 53 Sayfa ÖZET Bu çalışmada; iki farklı yöntem kullanılarak giardia enfeksiyonunun toplumdaki yaygınlığı araştırılmıştır. Bu amaçla dışkı örneklerinde Giardia intestinalis antijeni aramaya dayanan Enzyme Linked immunosorbent Assay (ELISA) ve rutin mikroskopik yöntem kullanılmış, bu iki yöntemin karşılaştırılması ve rutin tanıdaki yerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmada, Gaziantep Çocuk Hastanesi'ne akut, kronik veya tekrarlayıcı ishal yakınmalarıyla başvuran ve yaşları 0-12 arasında değişen toplam 200 hasta ve başka şikayetlerden (boğaz enfeksiyonu gibi) dolayı laboratuvara başvuruda bulunan 16 kişilik kontrol grubu çalışmaya alındı. Alınan dışkı örnekleri direkt mikroskopik yöntemle incelendi. Araştırmaya alınan 200 dışkı örneğinden direkt bakı yöntemi ile 47 örnekte (%23,5) G. intestinalis saptandı. Mikroskopide Giardia rastlanmayan ishalli hastalardan (153 kişi), görünüm, renk, akışkanlık ve koku özelliğine göre seçilen 40 örnekte ELISA yöntemiyle antijen araştırıldı. Bu örneklerin dördünde ELISA ile G. intestinalis saptandı. Direkt mikroskopi ile Giardia pozitif 40 örneğin tümünde ELISA ile de pozitiflik saptandı. Kontrol grubu olarak aynı yaş grubundan 16 kişilik bir örnek grup alındı. Bu grupta ELISA ile giardia pozitifliği saptanamadı. Dışkı örneklerinin mikroskopik incelemeleri `altın standart` olarak kabul edildiğinde ELİSA'nın duyarlılığı %100, özgüllüğü %90 olarak bulundu. 111Rutin mikroskopik yöntemlerin, maliyet açısından ekonomik olması ve dışkıda bulunabilecek diğer parazitlerin de tespit edilebilmesi nedeniyle, ELISA testine göre avantajı bulunmaktadır. Ancak, klinik olarak parazitoz düşünüldüğü halde, rutin yöntemlerle parazit saptanamayan durumlarda ve giardiyosisli hastaların takipleri ve tedavi sonuçlarının değerlendirilmesinde, dışkıda G.intestinalis antijeni aramaya dayanan ELISA testi alternatif bir yöntem olarak kullanılabilir. Ayrıca iş yükü fazla olan laboratuvarlarda veya çok sayıda örneğin kısa sürede incelenmesi istenen epidemiyolojik çalışmalarda bu yöntemin tercih edilebileceğini düşünmekteyiz. Anahtar Kelimeler: Giardia, ELISA iv M.S. THESIS THE INVESTIGATION OF FREQUENCY OF Giardia intestinalis INFECTION IN CHILDREN BETWEEN 0-12 YEARS OF AGE WITH DIFFERENT METHODS ÇAPAN, Ali Osman, Graduate School of Health Sciences Department of Microbiology Supervisor : Asist. Prof. Dr. Tekin KARSLIGİL January 2004, 53 pages ABSTRACT This thesis investigates the use of ELISA test for diagnosis of giardiosis, and compares the test results of ELISA and fecal sample based microscopic method. The study is applied to a population of 200 patients with acute, chronic and intermittent diarrhea complaints, aged between 0-12 years, at the Children's Hospital of Gaziantep. The fecal samples obtained from the patients were examined microscopically by direct methods. 47 (23.5%) were positive for giardia. In addition, G. intestinalis antigens were investigated by ELISA method using the same fecal samples. In general, both of the methods provide the same test results yet, for certain number of patients (doubtful cases by the doctor's check-up), the diagnosis using the ELISA method outperforms that of using the direct microscopic method. The low cost of routine microscopic method and the possibility of identification of other parasites are the major advantages against the ELISA method. However, in the cases that parasites may not be determined in spite of the presence of giardiosis signs, the ELISA method can be used as an alternative method in follow-up of patients with giardiosis and assessment of treatment results. In addition, this method may be preferred in busy laboratories or in epidemiological studies that aim to examine a significant number of samples in a short time period. Keywords: Giardia, ELISA 49

ÖZET Doktora Tezi GENİTAL CHLAMYDIA TRACHOMATIS İNFEKSİYONLARINDA ANTİJEN VE ANTİKOR ARAMANIN YERİ Dr. Oktay UYGUR Gaziantep Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Danışman: Yrd Doç.Dr. Tekin KARSLIGİL Prof. Dr. İclal BALCI Eylül 2004 Chlamydia trachomatis cinsel temasla bulaşan hastalıklar içerisinde en sık görülen patojenlerden birisidir (1,2). Bu çalışmada; Chlamydia trachomatis'in asemptomatik gebelerde görülme sıklığı, plasental geçişin olup olmadığı farklı numunelerde araştırılmıştır. Çalışmamıza Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniğine başvuran ve sezeryan ile doğum yapacak anne adayları dahil edilmiştir. Çalışmada, anne adaylarının herhangi bir fiziksel rahatsızlığının olmaması, doğum eyleminin 34 ila 39 haftalar arasında gerçekleşecek olması, hamilelik sırasında rahatsızlık geçirmemiş olması ve amnion zarının ameliyat esnasına kadar bütünlüğünün korunmuş olması şartları aranmıştır. Çalışmaya toplam 45 anne adayı dahil edildi. Bu kişilerin yaşları 19 ila 36 arasında olup, eğitim düzeyleri sadece okur yazar ile lisans üstü eğitim yelpazesindeyer almaktadır. Sezeryan yapılma nedenleri arasında baş pelvis uygunsuzluğu, plasenta yerleşimi, bebeğin pozisyonu, aileye bağlı nedenler ve mükerrer sezeryan yer almaktadır. Tüm anne adaylarından periferik kan, amnion sıvısı, plasenta parçası ve kordon kanı örnekleri alınmıştır. Bu örneklerden herhangi biri alınamayan anne adayı çalışmaya dahil edilmemiştir. ELISA ile yapılan çalışmada, anne kanında Chlamydia trachomatis antijeni %8.89 oranında, IgM ise % 4,44 oranında pozitif olarak bulunmuştur. ELISA ile kordon kanında yapılan incelemede IgM % 2,22 oranında pozitif tespit edilmiştir. Antijen pozitif saptanan annelerin plasenta ve amnion sıvısında Chlamydia antijeni PCR ile araştırılmış ve 1 er olguda pozitiflik saptanmıştır. Anahtar kelimeler: Chlamydia trachomatis, antijen, antikor, hamilelik, plasenta, amnion sıvısı, kordon kanı. vı ABSTRACT PH. D. Thesis IDENTIFICATION OF ANTIGENS AND ANTIBODIES IN GENITAL CHLAMYDIA TRACHOMATIS INFECTIONS Oktay UYGUR, M.D. University of Gaziantep Graduate School of Health Sciences Departmen of Microbiology Supervisors: Tekin KARSLIGİL, M.D.,Asist. Professor Iclal BALCI, M. D., Professor September 2004 Chlamydia trachomatis is one of the most common pathogens among sexually transmitted diseases (1,2). The aim of this study is to analyse the occurrence of chlamydia trachomatis in asymptomatic pregnancies and whether or not plasental transmission is possible. The study covers pregnant women who were admitted to Gaziantep University Medical Faculty Hospital Gynaecology and Obstectrics department for a caesarean section. The prerequisites for the pregnant women to be included in the study were as follows; no physical ailment or significant disease during pregnancy, expected gestation between 34th and 40th week and the amniotic membrane should be intact until the caesarean section. 45 pregnant women aged between 19 and 36, whose education level varied from literate to postgraduate were included in the study. Gestations occurred between 34th and 39th week. The reason for a caesarean section were the inappropriateness of head pelvic position, location of the placenta, fetus position or private reasons or a previous caesarean section. VllPeripheral blood, amniotic fluid, placental specimen and cord blood were taken from all patients. Patients who were unable to submit any of the above mentioned samples were not included in the study. 8,89% Chlamydia trachomatis antigens and 4,44% IgM were identified positively in mother's blood samples by ELISA. In cord blood IgM was 2,22% positive using ELISA. Chlamydia antigens were investigated using PCR in the placenta and amniotic fluids of mothers with positive antigen and identified in one(1) case ( 2,22%). Key words: Chlamydia trachomatis, antigen, antibody, pregnancy, placenta, amniotic fluid, cord blood. Vlll 56

0-6 YAŞ GRUBU ÇOCUKLARDA ROTAVIRUS SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI VE BU ENFEKSİYONUN LAKTOZ İNTOLERANSI ÜZERİNE ETKİLERİNİN İNCELENMESİ KILIÇ, İbrahim Halil Yüksek Lisans Tezi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Tez Yöneticisi : Yrd.Doç.Dr.Tekin KARSLIGİL Haziran 2000, 38 Sayfa ÖZET Çocuklarda görülen ishallerin Rotavirus etkenli olanları ve bu etkene bağlı olarak gelişen laktoz intoleransı araştırmak amacıyla yapılan bu çalışmada 0-6 yaş arası çocuklar incelendi. Dışkıda Rotavirus antijeni, Rotavirus Stat-Pak (Chembıo Diagnostic Systems USA) yöntemi ile araştırıldı. Laktoz intoleransının tespiti için dışkı asiditesi ve kan şekeri seviyeleri ölçüldü. Yapılan analizler sonucunda çalışılan 112 ishalli çocuktan 29'unda (%25.89) rotavirus pozitif olarak saptandı. Pozitif grupta kızlarla erkekler arasında istatiksel olarak anlamlı bir farklılık saptanmadı. Rotavirus pozitif bulunanların %82'sinde dışkının pH değeri asidikti. Rotavirus pozitiflerin kan glikoz seviyeleri normalden daha düşük bulundu. Kontrol grubu olarak yine 0-6 yaş arasında ishal şikayeti olmayan 28 sağlıklı çocuk alındı. Bunların %10.7'sinde (3/28) rotavirus pozitif saptandı. Kontrol grubunda dışkı pH ortalama 7 civarında bulundu. Kontrol grubunun kan glikoz seviyeleri normal değerlerde saptandı. Sonuç olarak bölgemizde diğer etkenlerle birlikte Rotavirus nedenli ishallerin de araştırılmasının uygun olacağı, bu ishallerde laktoz intoleransı bulunabileceğinin bilinerek tedbirli davranılması gerektiği düşünüldü. INVESTIGATION OF FREQUENCY OF ROTAVIRUS INFECTION IN CHILDREN BETWEEN 0-6 YEARS OF AGE AND IT'S IMPACT ON LACTOSE INTOLERANCE KILIÇ, İbrahim Halil, M.S.Thesis Graduate School of Health Sciences Department of Microbiology and Clinical Microbiology Supervisor: Assist. Prof. Dr. Tekin KARSLIGİL July 2000, 38 pages ABSTRACT In this study, childhood diarrheas resulted from Rotavirus infection and related lactose intolerance was investigated in children between 0-6 years of age. Rotavirus antigens in fecal samples were searched with Rotavirus Stat- Pack (Chembio Diagnostic Systems) method. In order to determine the lactose intolerance, acidity of feces and blood glucose levels were measured. Among 112 children with diarrhea 29 (25.89%) were positive for Rotavirus infection. There wasn't any difference in positivity between male/female children. In the positive group the pH values of feces were acidic in 82% of cases and their blood glucose levels were lower than normal. The control group consisted of 28 healthy children between 0-6 years of age without any complaints of diarrhea. Rotavirus infection was positive in 10.71% (3/28) of them. In this group the pH values of fecal samples were usually around 7 and their blood glucose levels were in normal ranges. We conclude that diarrhea caused by Rotavirus infection should also be investigated as with other etiological agents in our region and one should be cautious that lactose intolerance may be present along with these diarrheas. 38