Search

Darbs ietver pētījumus par riska gēnu lokusos esošo biežo variantu saistību ar 2.tipa cukura diabētu (T2D) un aptaukošanos Latvijas populācijā. Pētījumu parādīja, ka potenciāli funkcionāls variants AGRP asociējas ar paaugstinātu ĶMI. Savukārt, adiponektīna gēna rajonā esošie varianti nav uzskatāmi par būtiskiem aptaukošanās un T2D riska faktoriem mūsu populācijā, bet iespējams ir iesaistīti kardiovaskulāro saslimšanu patoģenēzē. Varianti TCF7L2 ir nozīmīgi T2D riska faktori pacientiem ar normālu ķermeņa svaru. Iegūtie dati papildina informāciju par FTO un TMEM18 rajonos esošo adipozitātes riska variantu saistību ar T2D neatkarīgi no to ietekmes uz izmaiņām ĶMI. Varianti FTO ceturtajā intronā iespējams saistās ar citiem T2D patoģenēzes mehānismiem nekā pirmajā intronā esošie SNP., Doctoral thesis presents investigation of association between common variation in susceptibility loci with type 2 diabetes mellitus (T2D) and obesity in the population of Latvia. Our studies showed association with increased BMI for potentially functional variant within AGRP, whereas variants in adiponectin gene locus unlikely represent significant risk factors for T2D or obesity, although they may influence pathogenesis of cardiovascular diseases. Variants in TCF7L2 are risk factors for T2D in our population with more pronounced effects in non-obese. Our data support obesity independent impact of BMI associated variants in FTO and TMEM18 loci on T2D. Variation in the 4th intron of FTO may lead to higher T2D susceptibility through mechanisms other than those manifested by SNPs in the 1th intron.

Metformīns ir medikaments, kurš tiek plaši izmantots 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā un kura lietošanas laikā būtiski izmainās cilvēka zarnu mikrobioma baktēriju daudzveidība. Bakalaura darba mērķis bija raksturot ar metformīna īstermiņa terapiju asociētās taksonomiskās kompozīcijas izmaiņas zarnu mikrobiomā jaundiagnosticētiem T2D pacientiem. No 23 iesaistīto T2D pacientu fēču paraugiem tikai izdalīta mikrobiālā DNS, veikta mazās ribosomālās subvienības gēna (16S rRNS) V3 reģiona taksonomiskās kompozīcijas analīze ar lielapjoma paralēlo sekvenēšanu. Rezultātā novērota statistiski būtiskas atšķirības β-daudzveidībā un fenotipa specifiskas izmaiņu tendences baktēriju iekšējā daudzveidībā. Darbs tika veikts no 11.2016. līdz 05.2018. Latvijas Biomedicīnas un studiju centrā., Metformin is widely used drug for type 2 diabetes mellitus (T2D) treatment with significant impact on bacterial diversity in human gut microbiome. The aim of this work was to characterize changes of taxonomic composition associated with short term metformin treatment of newly diagnosed patients with T2D. Microbial DNA was extracted from stool samples provided by 23 patients and analysis of small ribosomal subunit gene (16S rRNA) V3 region through massive parallel sequencing was performed. Samples showed significant differences in β-diversity and fenotype specific changes in the inner diversity. Work was carried out in Latvian Biomedical Research and Study Centre during the period from 11.2016. to 05.2018.

MODY (Maturity Onset Diabetes of the Young) ir monogēnā cukura diabēta veids, kam raksturīga autosomāli dominanta pārmantošana un simptomu izpausme pirms 25 gadu vecuma. Mutācija kādā no trim gēniem – HNF1α, HNF4α un GCK, sastāda 70-80% MODY gadījumu, tomēr pastāv vēl vismaz 10 gēni, kuros radušās mutācijas spēj izraisīt MODY simptomus. Bakalaura darba mērķis ir detektēt MODY izraisošās mutācijas, izmantojot eksomu sekvenēšanu. Eksomu sekvenēšana tika veikta 11 pacientiem no trim ģimenēm. Vienā no ģimenēm tika atrasta jauna mutācija HNF1α, kas ir tikai ģimenes locekļiem ar MODY un noteikta kā slimību izraisoša, tādējādi apstiprinot diagnozi MODY3. Bakalaura darbs tika izstrādāts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā., MODY (Maturity Onset Diabetes of the Young) is a type of monogenic diabetes which is characterised by autosomal dominant inheritance and onset of diabetic simptoms before the age of 25. Mutations in one of three genes – HNF1α, HNF4α and GCK cause most of MODY cases, however there also exist at least 10 more genes which can contain MODY causing mutations. The aim of the bachelors thesis is to detect MODY causing mutations using exome sequencing. Exome sequencing was performed for 11 participants from three families. Novel mutation in HNF1α was described in one family, which showed cosegregation with MODY and was recognised as pathogenic, thus confirming diagnosis as MODY3. Bachelors thesis was developed in Latvian Biomedical Research and Study Center.

Metformīns ir plaši lietots medikaments 2. tipa cukura diabēta ārstēšanā. Pastāv hipotēze, ka metformīna ietekme uz organismu daļēji varētu tikt skaidrota ar tā mijiedarbību ar zarnu mikrobiomu. Bakalaura darba mērķis bija noskaidrot, kā metformīns ietekmē zarnu mikrobioma kompozīciju. Darba ietvaros tika izdalīta mikrobiālā DNS no astoņu cilvēku fēču paraugiem, kas bija ievākti dažādos laika posmos no metformīna lietošanas uzsākšanas, un, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvenēšanu, veikta 16S rRNS V3 reģiona analīze, lai salīdzinātu mikrobioma kompozīciju. Pēc nedēļu ilgas metformīna lietošanas tika novērotas būtiskas izmaiņas vairāku taksonomisko vienību īpatsvarā un mikrobioma iekšējās daudzveidības samazināšanās. Darbs veikts no 10.2014. līdz 05.2015. Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā., Metformin is widely used for treatment of type 2 diabetes. There is a hypothesis that the effects of metformin are partially explained by its interaction with the gut microbiome. The aim of this work was to investigate the effects of metformin on composition of gut microbiome. In the course of this study the microbial DNA was extracted from stool samples gained from eight individuals in three time points of metformin therapy. After the extraction the analysis of the 16S rRNA V3 region employing massive parallel sequencing was carried out to compare the composition of the microbiome. As the result significant changes in abundances of various taxonomic units and reduced species richness was found after a weeklong metformin therapy. The work was carried out in the Latvian Biomedical Research and Study Centre during the period from 10.2014 to 05.2015.