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Birds are important hosts for the development of the immature stages of several tick species that are vectors for disease-causing microorganisms in animals and humans. Colombia has the highest number of bird species worldwide; however, there is scarce data on the role of birds in the circulation of ticks and their associated pathogens, such as rickettsiae. The department of Arauca has a high diversity of resident and migratory (boreal and austral) birds and ticks associated with the transmission of Rickettsia. The objective of this research was to identify tick species parasitizing birds and to detect Rickettsia species in these ectoparasites. We conducted samplings in the municipalities of Arauca, Cravo Norte, and Tame between November of 2018 and August of 2019. Birds were captured using mist nets and examined for the presence of tick species. The collected ticks were morphologically and molecularly identified. Furthermore, we detected rickettsiae in ticks by amplifying fragments of the citrate synthase (gltA) and outer membrane protein (ompB) genes. We captured 606 birds belonging to 25 families and 115 species. Tick infestation rate was 3.3% (20/606) in the birds captured and eight new associations between wild birds and ticks are reported for the American continent. We identified four tick species: Amblyomma nodosum, Amblyomma longirostre, Amblyomma mixtum, and Amblyomma sp.. Moreover, we confirmed the presence of Rickettsia parkeri strain Atlantic rainforest in A. nodosum, a medically-relevant rickettsia due to cases of rickettsiosis in the American continent. This finding manifests the importance of wild birds as hosts and dispersal agents of ticks infected with pathogenic rickettsiae, as well as the need to monitor migratory birds in the Orinoquia and other regions of Colombia and America., Graphical abstract Image 1, Highlights • Wild birds are important hosts of ticks of the family Ixodidae that are infected by pathogen rickettsiae. • This study provides knowledge on the interactions between birds, ticks, and rickettsiae in Colombia. • We report new associations between wild birds and ticks in the American continent.

Los estudios sobre salud pública y biodiversidad de mamíferos silvestres incluyen un componente genético. Para las muestras de sangre, se debe tener condiciones óptimas de colección, ya que pueden afectar la preservación y la extracción del ADN. Este estudio evaluó el uso de métodos de preservación de ADN líquido y seco y métodos de extracción de ADN comerciales y no comerciales, en muestras de sangre, recolectadas en campo. Para ello, se recogieron 264 muestras de sangre totales de mamíferos salvajes. Se preservó un primer grupo de muestras en clorhidrato de guanidina (GuHCl) y se extrajo el ADN, utilizando seis kits comerciales: Bioline, Norgen, Invitrogen, Promega y Qiagen, además de dos protocolos no comerciales: fenol-cloroformo isoamil alcohol (PC) y guanidina tiocianato (GIT). Otro grupo de muestras, se preservó en tarjetas Whatman® FTA® y se extrajo el ADN, con PC y GIT. Las extracciones con GIT y PC mostraron los valores y variaciones más altas en la concentración de ADN (ng/µL), mientras que el kit comercial mostró una baja variación. La preservación de la muestra en tarjetas Whatman® FTA® proporcionó una baja variación y cantidad de ADN extraído, en comparación con el uso de GuHCl. En cuanto a la calidad del ADN, los kits comerciales produjeron una mayor pureza (A260/280), mientras que los protocolos basados en GIT y PC proporcionaron resultados muy variables. Además, el uso de GIT y PC originó una mayor cantidad de ADN, pero de calidad variable. En general, la extracción basada en kits comerciales y la conservación Whatman® FTA® permitió obtener calidades y cantidades de ADN más estandarizadas. Studies on public health and wild mammal biodiversity include a genetic component. For blood samples, there must be optimal sample collection conditions since these can affect DNA preservation and extraction. This study evaluated the use of liquid and dry DNA preservation methods and commercial and non-commercial DNA extraction methods on field-collected blood samples. For this, 264 total blood samples were collected from wild mammals. A first group of samples was preserved in guanidine hydrochloride (GuHCl) and DNA was extracted using six commercial kits: Bioline, Norgen, Invitrogen, Promega, and Qiagen, in addition to phenol-chloroform isoamyl alcohol (PC) and guanidine thiocyanate (GIT). Another group of samples was preserved in Whatman® FTA® cards and DNA was extracted with PC and GIT. The extractions with GIT and PC showed the highest values (ng/µL) and variation in DNA concentration, while the commercial kit showed low variation. Sample preservation in Whatman® FTA® cards provided low variation and quantity of the extracted DNA compared with the use of GuHCl. Concerning DNA quality, the commercial kits yielded higher purity, while GIT and PC-based protocols provided highly variable results. Furthermore, the use of GIT and PC yielded a higher amount of DNA, yet, of variable quality. Overall, extraction based on commercial kits and Whatman® FTA® preservation allowed obtaining more standardized DNA qualities and quantities Incluye referencias bibliográficas

Introducción: Los esfuerzos terapéuticos orientados a atender las micosis por Candida spp. se han enfocado en el empleo de azoles; sin embargo, en la literatura científica se discute su beneficio, por los amplios y descritos mecanismos de resistencia. Objetivo: Describir los mecanismos de resistencia al fluconazol expresados por la especie Candida glabrata, con la intención de que sean considerados dentro de las variables de elegibilidad para la intervención. Método: Se realizó una revisión integrativa utilizando la pregunta orientadora: ¿cuáles son los mecanismos de resistencia al fluconazol expresados por la especie Candida glabrata? Veintinueve estudios obtenidos de la base de datos PubMed cumplieron los criterios del análisis crítico propuesto por el instrumento PRISMA, utilizado para la selección de los artículos incluidos para su revisión en este manuscrito. Las categorías bajo las cuales se organizaron los elementos de análisis fueron: sobrexpresión de bombas de eflujo y modificaciones en la enzima lanosterol 14-alfa-desmetilasa. Resultados: Los mecanismos de resistencia al fluconazol expresados por Candida glabrata están determinados principalmente por la regulación a la alza de bombas de adenosina-trifosfato Binding Cassette (ABC) y por la modificación del punto de unión con su blanco farmacológico: la enzima lanosterol 14-alfa-desmetilasa. Conclusión: Los mecanismos de resistencia expresados por Candida glabrata se asocian con la modificación estructural de la diana farmacológica y la sobreexpresión de bombas de eflujo de manera diferencial a otras especies. Se sugiere que Candida glabrata es intrínsecamente menos susceptible al fluconazol.

Introduction: Rickettsioses are zoonotic diseases caused by pathogenic bacteria of the genus Rickettsia and transmitted to man by means of arthropod vectors such as ticks, fleas, mites and lice. Historically, Caldas Department has reported a significant number of cases of murine typhus to the Colombian national health surveillance system, and consequent studies of flea-borne rickettsiosis identified the circulation of Rickettsia typhi and Rickettsia felis in multiple municipalities. Our aim was to genotype species of Rickettsia detected in fleas collected from domestic and wild mammals in Caldas. Methodology: Flea samples were taken by convenience sampling from dogs, cats and wild mammals (rodents and marsupials) in 26 municipalities. Specimens were classified by current taxonomic keys and pooled for DNA extraction and molecular screening for Rickettsia spp. by PCR amplification of gltA, htrA and sca5 genes. Positive samples were genotyped by enzyme digestion (htrA) and sequencing. Results: A total of 1388 flea samples were collected. Rickettsia DNA was amplified in 818 (gltA), 883 (htrA) and 424 (sca5) flea pools. Alignment analysis with available Rickettsia DNA sequences showed greater similarity with R. asembonensis (gltA) and with R. felis (sca5 and htrA). Restriction pattern was compatible with R. felis. R. typhi was not identified. Conclusion: The present study confirms the presence and high prevalence of R. asembonensis and R. felis in fleas from domestic and wild animals in different municipalities from Caldas Department.

The Colombian Tropical Andes are one of the regions with highest bird diversity on Earth. However, information on bird morphology, reproductive phenology, and molt is particularly scarce in this region. Also, this region is heavily impacted by deforestation, and it is vulnerable to climate change. Hence, providing baseline information on life history and morphological traits will be essential to support future research on functional diversity, climate change effects, conservation, evolution, and phenology. To fill this gap, we have compiled information on bird distribution, morphology, molt, and reproductive phenology at 52 localities of the Department of Caldas, covering an elevation range between 148 and 3845 m. This compilation comprises a wide range of habitats, including native forests, forestry plantations, croplands, and paramo. Our database presents information for 3,398 records belonging to 379 bird species (representing 23 orders, 53 families, and 258 genera). From those records, 2,843 correspond to information collected in the field between 2008 and 2019, and the remaining 555 records correspond to specimens deposited in the Natural History Museum of the Caldas University, collected between 1969 and 2014. We measured nine morphological traits from all specimens: total culmen, gape, bill width, bill depth, tarsus, wing length, tail length, total length, and mass. We also have reproductive condition information for 257 species and molt information available for 378 species. The information contained in this data set represents ~20% of the Colombian avifauna and ~11% of the bird species richness in South America. This data set is released for non-commercial use only. Credits should be given to this paper (i.e., proper citation), and the products generated with this database should be shared under the same license terms (CC BY-NC-SA).

Several bacteria belonging to the genus Rickettsia are recognized as causal agents of diseases in domestic and wild animals and humans. These bacteria are considered emerging or reemerging and are transmitted by ticks, fleas, and lice vectors. In recent decades, there have been reports of rickettsias in ticks of the genus Amblyomma, Ixodes, and Haemaphysalis collected from wild birds. Accordingly, birds play a plausible role in the transport and spread of ticks infected by Rickettsia spp. In this study, we performed molecular detection of Rickettsia species in ticks collected from wild birds in the department of Caldas, Colombia. We detected and identified Rickettsia amblyommatis, 'Candidatus Rickettsia colombianensi' and a Rickettsia sp. closely related to 'Candidatus Rickettsia tarasevichiae' and Rickettsia canadensis. This study contributes to the knowledge on infection by Rickettsia in ticks collected from wild birds in Colombia. We also provide the first reports of infection by R. amblyommatis in the genus Ixodes collected from wild birds in South America and the presence of Rickettsia at elevations above 3000 m a.s.l.

Ticks of the family Ixodidae are vectors of important pathogens in human and animal health. Birds are involved in long-distance transport and dispersion of hard ticks. Tick infestations on wild birds mostly involve species within the genera Amblyomma, Ixodes, and Haemaphysalis. In Colombia, tick research is scarce and there are no studies to date about the associations between wild birds and ticks. We aimed to contribute to the knowledge of the associations between wild birds and hard ticks based on the collection of 2314 wild birds belonging to 29 families in Caldas – Colombia between 2015 and 2019. In total, we collected 133 hard ticks that were found parasitizing 78 birds representing 45 species and 14 wild bird families. We report at least seven tick species on birds confirmed by morphological and molecular methods: Amblyomma longirostre, Amblyomma varium, Amblyomma dissimile, Amblyomma ovale, Amblyomma nodosum, Amblyomma calcaratum and Haemaphysalis leporispalustris. In addition, we recorded three Ixodes species, which yielded DNA sequences that did not have high identity (≤ 95 %) to any species in GenBank. Ticks were found infesting resident and migratory boreal birds. This is the first study addressing the associations between wild birds and hard ticks in Colombia. We describe new associations between birds and ticks in the Americas.

In tropical regions, the contributions and limitations of agroecosystems have been identified with respect to bird diversity conservation. It has been suggested that agroecosystems can have different conservation values, according to the structural complexity of the vegetation (e.g., higher number of vegetation strata, cultivated species diversity, among others). Therefore, agroecosystems, especially those with a smaller area (e.g., small-holdings), could be crucial for developing bird conservation strategies. In order to establish the contribution of different agroecosystem types to bird conservation in the department of Caldas (Colombia), we compared bird richness, abundance, and similarity associated to three types of habitats: (1) type I agroecosystems (mono-cropping with bare soil), (2) type II agroecosystems (mixed-cropping, grazing pastures with weeds and dispersed trees, and plantations with understory), and (3) secondary forests. Type II agroecosystems did not differ in bird richness and similarity compared to secondary forests, and species with high sensitivity to disturbance were registered (Zentrygon frenata, Phaetornis guy, Phaetornis syrmatophorus, Lepidocolaptes lacrymiger and Sphenopsis frontalis). Additionally, we registered a species of global conservation interest (Chloropipo flavicapilla) and four migratory species (Catharus ustulatus, Parkesia noveboracensis, Setophaga fusca and Setophaga striata) in this type of agroecosystem. Thus, type II agroecosystem habitats are not completely negative on avifauna, and they could serve an important role within conservation strategies in rural landscapes. En las regiones tropicales se han identificado los aportes y limitaciones de los agroecosistemas en el contexto de la conservación de la diversidad de las aves. Se ha sugerido que los agroecosistemas pueden presentar un valor diferente para la conservación, de acuerdo con la complejidad estructural de la vegetación (e.g., mayor número de estratos de la vegetación, diversidad de las especies cultivadas, entre otros). En este sentido, los agroecosistemas de una menor área (e.g., minifundios), pueden ser claves en el desarrollo de estrategias encaminadas a la conservación de la avifauna. Con el objetivo de establecer el aporte de diferentes tipos de agroecosistemas a la conservación de las aves en el departamento de Caldas (Colombia), se comparó la riqueza, abundancia y similitud de las aves asociadas a tres tipos de hábitats: (1) agroecosistemas tipo I (monocultivos con suelo limpio), (2) agroecosistemas tipo II (cultivos mixtos, potreros enmalezados con árboles dispersos y plantaciones con sotobosque) y (3) bosques secundarios. Los agroecosistemas tipo II no difirieron en la riqueza y en la similitud de las aves con respecto a los bosques secundarios, además se registraron especies con alta sensibilidad a la perturbación (Zentrygon frenata, Phaetornis guy, Phaetornis syrmatophorus, Lepidocolaptes lacrymiger y Sphenopsis frontalis). Adicionalmente en este tipo de agroecosistemas se registró una especie de interés para la conservación global (Chloropipo flavicapilla) y cuatro especies migratorias (Catharus ustulatus, Parkesia noveboracensis, Setophaga fusca y Setophaga striata). Los agroecosistemas tipo II no son hábitats completamente negativos para la avifauna y podrían desempeñar un rol importante dentro de las estrategias para la conservación en paisajes rurales.

Desde la promulgación de la Ley 100 del año 1993, existen en Colombia unas entidades de intermediación de la salud que en su momento se denominaron Empresas Promotoras de Salud (EPS), y que de acuerdo a la norma deberían de cumplir con las siguientes funciones: promoción de la afiliación de grupos no afiliados al sistema, captación de los aportes de los afiliados al sistema de seguridad social en salud, definir los mecanismos de acceso al sistema de salud por parte de los afiliados y sus familias, definir los protocolos que garanticen el libre acceso de los afiliados y sus familias a las instituciones prestadoras de salud, remitir al fondo de solidaridad y compensación la información relativa a la afiliación del trabajador y su familia, a las novedades laborales, a los recaudos por cotizaciones y a los desembolsos por el pago de prestación de servicios, y establecer los procedimientos para garantizar una atención oportuna, integral, eficiente y de calidad. Since the enactment of Law 100 in 1993, there have been some health intermediation entities in Colombia that at the time were called Health Promoting Companies (EPS), and that according to the norm should fulfill the following functions: promoting the affiliation of groups not affiliated with the system, capturing the contributions of affiliates to the social security health system, defining the mechanisms for access to the health system by affiliates and their families, defining the protocols that guarantee the Free access of the affiliates and their families to the health-providing institutions, to send to the solidarity and compensation fund the information regarding the affiliation of the worker and his family, to the labor news, to the collections for contributions and the disbursements for the payment provision of services, and establish procedures to guarantee timely, comprehensive, efficient and quality care.

La fasciolosis es una parasitosis que afecta rumiantes, equinos, porcinos, entre otras especies y es causante de grandes pérdidas económicas y puede parasitar humanos. En la presente investigación, se evaluó la frecuencia de la enfermedad por tres métodos de detección, en veintiséis predios, localizados en los municipios del departamento de Caldas, con mayor prevalencia, según reportes de la Central de beneficio de Manizales. Se utilizaron los métodos de coprología, PCR y ELISA, en heces y en suero de bovinos seleccionados aleatoriamente en predios, con el sistema de producción de leche bovina, localizados en los Andes colombianos, entre 1.980-3.721 msnm. Se obtuvieron 414 muestras de materia fecal, procesadas con la técnica Dennis modificada. El ADN fue extraído de las heces usando un kit comercial y fue amplificado con cebadores específicos, por PCR convencional. En las muestras de suero, se detectó la presencia de inmunoglobulina G (IgG) contra Fasciola hepatica, a través del uso de un Kit comercial, específico para este fin. La región estudiada, se dividió en cuatro zonas, para efectos del estudio. La prevalencia de la fasciolosis por coprología fue 12,3%; por Elisa, 19,1% y por PCR, 67,2%. La zona tres presentó la mayor proporción de animales positivos, por los tres métodos, con odds ratio elevados y alta significancia estadística; fueron hallados caracoles Limneidos en ambientes acuáticos, aptos para su desarrollo, que permiten perpetuar el inóculo. Se confirma la presencia de fasciolosis bovina en la región estudiada y se requieren hacer estudios adicionales, para validar la PCR, como método para la detección de fasciolosis. Fasciolosis is a parasitic disease that affects ruminants, horses, pigs and other species; it is the cause of significant economic losses and can also parasitize humans. In this research, the frequency of the disease using three detection methods in twenty-six farms, located in the municipalities most prevalent according to reports from the Slaughtering Central of Manizales-Caldas in the department of Caldas was evaluated. The coproscopic, PCR and ELISA methods in feces and serum of randomly selected cattle farms with a system of dairy production, located in the Colombian Andes, between 1980 3721m, were used. 414 stool samples were obtained and processed with the Dennis modified technique. DNA was extracted from stool using a commercial kit and was amplified with specific primers for standard PCR. In serum samples, the presence of immunoglobulin G (IgG) against Fasciola hepatica was detected through the use of a specific commercial kit for this purpose. The study area was divided into four zones for the study purposes. The prevalence of fascioliasis by the coproscopic test was 12.3%, by ELISA of 19.1%, and 67.2% by PCR. Zone three displayed the highest proportion of positive animals by the three methods, with high odds ratio and high statistical significance; lymnaeid snails were found in aquatic environments suitable for development, allowing perpetuate the inoculum. The presence of bovine fasciolosis in the studied region was confirmed; additional studies to validate PCR as a method by the fasciolosis detection are required. Incluye referencias bibliográficas

A principios de este año se reportó por diferentes medios de comunicación una alerta naranja por la calidad del aire en Medellín. Este suceso hizo que el alcalde de la ciudad decretara unas medidas que evitaran que los niveles de contaminación ambiental siguieran empeorando y que los grupos de personas en mayor riesgo fueran afectados por esta contaminación. La calidad del aire es un problema que no se circunscribe a una región determinada, sino que es un problema mundial ya que el aire no tiene límites geográficos y dichos contaminantes pueden ser dispersados por la acción de los vientos, de modo que los desplazamientos de dichos contaminantes pueden afectar zonas menos contaminadas y de esta manera producir efectos dañinos no solo en las personas, sino también en las plantas y en los animales. A principios de este año se reportó por diferentes medios de comunicación una alerta naranja por la calidad del aire en Medellín. Este suceso hizo que el alcalde de la ciudad decretara unas medidas que evitaran que los niveles de contaminación ambiental siguieran empeorando y que los grupos de personas en mayor riesgo fueran afectados por esta contaminación. La calidad del aire es un problema que no se circunscribe a una región determinada, sino que es un problema mundial ya que el aire no tiene límites geográficos y dichos contaminantes pueden ser dispersados por la acción de los vientos, de modo que los desplazamientos de dichos contaminantes pueden afectar zonas menos contaminadas y de esta manera producir efectos dañinos no solo en las personas, sino también en las plantas y en los animales.