461 results on '"Johansson, Emil"'
Search Results
2. Aspects of Modeling Human Behavior in Agent-Based Social Simulation – What Can We Learn from the COVID-19 Pandemic?
- Author
-
Johansson, Emil, primary, Lorig, Fabian, additional, and Davidsson, Paul, additional
- Published
- 2024
- Full Text
- View/download PDF
3. HIV-2 mediated effects on target and bystander cells induce plasma proteome remodeling
- Author
-
Johansson, Emil, Nazziwa, Jamirah, Freyhult, Eva, Hong, Mun-Gwan, Lindman, Jacob, Neptin, Malin, Karlson, Sara, Rezeli, Melinda, Biague, Antonio J., Medstrand, Patrik, Månsson, Fredrik, Norrgren, Hans, Esbjörnsson, Joakim, and Jansson, Marianne
- Published
- 2024
- Full Text
- View/download PDF
4. An Analytical Toolbox for Research on Reflection.
- Author
-
Johansson, Emil
- Subjects
GAZE ,STUDENT teachers ,JUDGMENT (Psychology) ,RESEARCH personnel - Abstract
This article presents a theoretical approach and an analytical toolbox for researchers on reflections in PE and PETE. Its purpose is to provide an approach to analyzing how reflections are composed. Previous research mainly asks how teachers and student teachers (STs) reflect and use different theoretical concepts to describe the way in which they reflect. The use of the analytical toolbox, as described in this paper, examines how the reflections of teachers and STs have different parts that are influenced by the direction—within a given context—of their gaze and focus on teaching. Their experiences and reflections are affected by the contexts, which influence the forward-moving spiral of the development of their professional judgment. Using a recontextualized version of Wackerhausen's (2009) theory as an analytical toolbox in research, as proposed in this article, can contribute to more nuanced descriptions of teachers' and STs' reflections on teaching in PE. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2023
- Full Text
- View/download PDF
5. Use of 3D-printed mixers in laboratory reactor design for modelling of heterogeneous catalytic converters
- Author
-
Walander, Magnus, Nygren, Andreas, Sjöblom, Jonas, Johansson, Emil, Creaser, Derek, Edvardsson, Jonas, Tamm, Stefanie, and Lundberg, Björn
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF
6. Supervisors’ guidance of PETE students’ reflections at practicum: creating conditions for different learning journeys
- Author
-
Johansson, Emil and Johansson, Emil
- Abstract
Physical education teacher education (PETE) students’ reflections on their practicums are influenced by how their supervisors guide them. Supervisors often evaluate and discuss PETE students’ teaching by guiding their focus on essential aspects to consider. This exploratory case study focuses on how supervisors’ guiding styles in reflective conversations affect how PETE students make meaning of their teaching. Reflective practitioners, in this case PETE students, make sense of practical situations from their own perspectives as part of their teaching practice. Supervisors’ guidance is essential here, because it can change PETE students’ understanding by (re)directing their attention to meaningful aspects when framing their teaching and help them to examine it from new perspectives. However, the findings indicate that supervisors’ various guidance affect how PETE students experience their learning journeys during practicum. In this study, the participating PETE students’ experiences of practicum differed: either they experienced a controlled journey that restricted their teaching due to predefined rules and condemning attitude toward pupils, or they experienced an adventurous journey that enabled them to find their own paths as a teachers., Övergången från idrottslärarutbildning till lärarpraktik
- Published
- 2024
- Full Text
- View/download PDF
7. The role of UN investigative mechanism in anchoring fairness in the collaborative turn of international criminal investigations
- Author
-
Wistrand Johansson, Emil and Wistrand Johansson, Emil
- Abstract
Increased solidification of accountability norms in relation to international responses to conflict has led to a collaborative turn where new actors – across international and national, public and private divides – participate and collaborate in investigations of core international crimes. This decentralized and highly relational reality of contemporary investigations challenges established understandings of how fairness is to be safeguarded for suspects, victims and witnesses affected by the practices of investigative and prosecutorial actors. Safeguarding fairness in the collaborative turn is crucial because fairness is at the heart of the identity of international criminal law. It is argued that UN investigative mechanisms for Syria (IIIM), Myanmar (IIMM), Da’esh in Iraq (UNITAD) and other similar UN quasi-prosecutorial mandate-holders are well-placed to play a more active and coordinating role in safeguarding fairness in this collaborative turn, in particular vis-à-vis investigative civil society actors. Although lacking capacity to single-handedly foster fairness in investigative practices in conflict situations, UN investigative mechanisms and investigations have the capacity to anchor the collaborative turn in law and public authority, based on principles of impartiality, independence and fairness., Conference: European Society of International Law Annual Conference, Aix-en-Provence, September, 2023
- Published
- 2024
8. Classical Compton Amplitude for Scalar QED in Application of Worldline QFT : Computation by Solving Equations of Motion
- Author
-
Beiersdorf Johansson, Emil and Beiersdorf Johansson, Emil
- Abstract
The purpose of this study was to compute the classical Compton amplitude by solving the equations of motion through perturbative expansion for scalar QED. The interaction of interest was that of a massive charged relativistic point particle without spin scattering off of a photon. The tree-level classical Compton amplitude was then extracted by projection of the solved photon field onto the outgoing polarization vector, and the resulting amplitude was consistent with recent work and literature. The applied theory, being the framework of worldline QFT, applied to this simpler scalar QED case has in previous studies proven to provide insight into more complex gravitational problems where e.g. spin too is considered., Syftet med denna studie var att beräkna den klassiska Comptonamplituden genom att lösa rörelseekvationerna via perturbativ expansion inom skalär kvantelektrodynamik. Interaktionen av intresse var en massiv laddad relativistisk punktpartikel utan spinn som sprider sig mot en foton. Den klassiska loopfria Comptonamplituden extraherades sedan genom projektion av det lösta fotonfältet på den utgående polarisationsvektorn, och den resulterande amplituden stämde överens med tidigare arbete och litteratur. Den tillämpade teorin, vilket är ramverket av worldline QFT, för detta enklare kvantelektrodynamikfall har tidigare påvisats ge insikt i mer komplexa problem med gravitation där exempelvis även spinn beaktas.
- Published
- 2024
9. Re-injury anxiety inventory : Översättning och kultutrell anpassning till svenska idrottare
- Author
-
Johansson, Emil, Magnusson, Sebastian, Johansson, Emil, and Magnusson, Sebastian
- Abstract
Sammanfattning: Bakgrund: Främre korsbandsskada är en allvarlig men vanlig skada inom idrott som resulterar i psykologiska konsekvenser, en av dessa är oro för att skada sig igen och detta kan påverka deras återgång till idrott negativt. Oro och andra psykologiska konsekvenser mäts vanligtvis med det smärtcentrerade frågeformuläret Tampa scale of kinesiophobia (TSK), även fast idrottare med korsbandsskada sällan upplever smärta senare i rehabiliteringen. Re-injury anxiety inventory (RIAI) belyser ångest och andra psykologiska faktorer inom rehabilitering (RIAI-R) och återgång till tävlingssammanhang (RIAI-C) som idrottare kan uppleva. Detta frågeformulär finns dock inte på svenska, vilket gör att svenska fysioterapeuter saknar ett självskattningsformulär som mäter ångest för att skada sig igen. Syfte: Att översätta och tvärkulturellt anpassa RIAI från originalspråket engelska till svenska och testa den på en mindre målgrupp. Metod: Kvalitativ och kvantitativ studiedesign. Fem-steg: Steg 1: Översättning av enkät: Steg 2: sammanfogning av översättningarna från steg 1. Steg 3: Återöversättning till originalspråk. Två separata översättningar genomfördes vid steg: 1 och 3. Steg 4: en expertkommitté granskade den sammanfogade versionen. Steg 5: Prefinala versionen testades genom intervjuer med 13 personer som hade genomgått främre korsbandsrekonstruktion (ACLR) och slutliga korrigeringar gjordes i enlighet med detta för att skapa den slutliga versionen. En korrelationsanalys med 18 personer genomfördes även av RIAI-SE och TSK. Resultat: Den prefinala versionen bestod efter intervjuerna och en svensk version RIAI-SE skapades. RIAI-SE och TSK jämfördes, det visade ingen signifikant korrelation P>0,093. Slutsats: Översättningen och kulturella anpassningen av originalformuläret RIAI, resulterade i en svensk version, RIAI-SE. Inga korrelationer mellan RIAI-SE och TSK bekräftar att de mäter olika begrepp. RIAI-SE kan komma att användas av fysioterapeuter på svenska idrotta
- Published
- 2024
10. Tolvstegsprogrammets strategier, verktyg och effekter : En kvalitativ, socialpedagogisk studie
- Author
-
Adolfsson, Ophelia, Johansson, Emil, Adolfsson, Ophelia, and Johansson, Emil
- Abstract
Syftet med studien var att undersöka de professionellas uppfattningar om: a) de strategier och verktyg som deltagarna i ett tolvstegsprogram använder sig av och b) tolvstegsprogrammets effekter relaterat till målsättningen att deltagarna i behandlings-formen bibehåller ett nyktert och drogfritt liv. Den metodologiska utgångspunkten som användes i studien var fenomenologi med kvalitativa semistrukturerade intervjuer (Bryman, 2018 och Johansson, 2012). Vi höll intervjuer med sju olika informanter. Informanterna beskrev olika strategier och verktyg som deltagarna använder sig av under tolvstegsprogrammet samt vilka effekter dessa strategier och verktyg ger. De beskrev även vilka olika svårigheter som deltagarna stöter på under tolvstegs-programmet samt vilka framgångar som tolvstegsprogrammet ger. Informanterna beskrev att de använder sig av gruppsessioner, uppgifter samt undervisning som en del av behandlingen inom tolvstegsprogrammet. De beskrev även att tolvstegsprogrammet ger goda effekter som till exempel att deltagarna lär sig att bryta dåliga mönster och etablera en sundare livsstil. Det framkom att det religiösa i programmet är en svårighet som många deltagare upplever samt att en framgång som medföljer för de som arbetar i stegen är gemenskap och delaktighet, både i samhället och i gruppen. Vid analysen har vi använt oss av Jarvis (2010) teori om det livslånga lärandet, där faktorer som människan som social varelse, hur människors lärande sker via imitation samt omgivningens betydelse för människans utveckling har varit centrala i analysen. Studiens slutsats var att de socialpedagogiska begreppen gemenskap, delaktighet och meningsfullhet är viktiga komponenter både för att strategierna och verktygen ska ha önskad effekt och för att bibehålla och fortsätta arbeta på sin nykterhet och den förändring man gjort under tolvstegsprogrammet (Berglund och Cederlund, 2017). Det framkom även att det socialpedagogiska arbetssättets hörnstenar relation, struktur och föränd
- Published
- 2024
11. Rhythm and Routine : Hur musiklyssnande sätter rutiner i vardagen
- Author
-
Johansson, Emil, Neråfors, Samuel, Johansson, Emil, and Neråfors, Samuel
- Abstract
Denna uppsats utforskar musikens roll i människors vardagliga liv, hur den bidrar tillvälbefinnande och beteende. Genom att bygga vidare på tidigare forskning om musikens användning i vardagen, undersöker studien hur musik används i olika sociala sammanhang. Studien har tagit hjälp av tre teoretiska ramverk för att besvara forskningsfrågorna. Dessa var Uses and gratifications, medieetnografi samt mediegenerationer. Studien har använt sig av kvalitativa intervjuer. Resultaten visar att musikens betydelse sträcker sig bortom underhållning och kan vara en viktig resurs för att reglera känslor, skapa atmosfärer och förbättra produktiviteten. En central del av studien är att analysera musikanvändnings roll i människors vardag samt vilka motiv och belöningar som ligger bakom. Studien belyser hur musik kan användas medvetet för att skapa olika stämningar, vilket i sin tur har en inverkan på individens beteende och interaktioner i vardagen. Studien kommer även fokusera på hur musikkonsumtion skiljer sig åt mellan generationer. Detta för att se vad digitaliseringen har tillfört enligt olika generationer. För att utforska förändringar i musikkonsumtion digitaliseringen och vad för har inverkan på musikkonsumenters rutiner och behov. Genom att analysera motiv och belöningar bakom människors musiklyssnande via dessa plattformar, ger studien insikter i hur teknologiska framsteg formar musikkonsumtionen och individens relation till musik. Slutligen betonar studien vikten av fortsatt forskning inom området för att utforska hur teknologin kan skapa nya beteendemönster och rutiner. Även vad medierna och förändringar i musikkonsumtion över tid, samt för att studera förståelsen för musikens roll i människors liv och samhälle. Genom att dra slutsatser från sådana studier kan detta bidra till en ökad förståelse för musikens mångsidiga och komplexa roll i individens vardag och livskvalitet.
- Published
- 2024
12. Inkludering och exkludering på webbsidor : En kvantitativ studie om hur individer upplever en webbsida
- Author
-
Borg, Karoline, Johansson, Emil, Ström, Mathilda, Borg, Karoline, Johansson, Emil, and Ström, Mathilda
- Abstract
The purpose of this quantitative study is to investigate how and if gender is affected by different design elements on a web page. To investigate this, three different prototype pages were created based on real web pages. A digital survey was sent out where respondents had to answer questions about inclusion and exclusion regarding the various web pages choosen in this study. In the result, conclusions are presented that can be drawn from the female and male gender. Further studies are needed to be able to map individuals who do not identify as female or male in order to create an inclusive society.
- Published
- 2024
13. Fluctuations in type IV pilus retraction
- Author
-
Linden, Martin, Johansson, Emil, Jonsson, Ann-Beth, and Wallin, Mats
- Subjects
Physics - Biological Physics ,Condensed Matter - Other Condensed Matter ,Quantitative Biology - Other Quantitative Biology ,Quantitative Biology - Subcellular Processes - Abstract
The type IV pilus retraction motor is found in many important bacterial pathogens. It is the strongest known linear motor protein and is required for bacterial infectivity. We characterize the dynamics of type IV pilus retraction in terms of a stochastic chemical reaction model. We find that a two state model can describe the experimental force velocity relation and qualitative dependence of ATP concentration. The results indicate that the dynamics is limited by an ATP-dependent step at low load and a force-dependent step at high load, and that at least one step is effectively irreversible in the measured range of forces. The irreversible nature of the sub-step(s) lead to interesting predictions for future experiments: We find different parameterizations with mathematically identical force velocity relations but different fluctuations (diffusion constant). We also find a longer elementary step compared to an earlier analysis, which agrees better with known facts about the structure of the pilus filament and energetic considerations. We conclude that more experimental data is needed, and that further retraction experiments are likely to resolve interesting details and give valuable insights into the PilT machinery. In light of our findings, the fluctuations of the retraction dynamics emerge as a key property to be studied in future experiments., Comment: 10 pages, 2 figures, 1 table
- Published
- 2005
14. Supervisors’ guidance of PETE-students at practicum: a matter of controlling- or adventurous journeys
- Author
-
Johansson, Emil and Johansson, Emil
- Abstract
Supervisors are key actors for physical education teacher education (PETE) students at practicum. Their guidance influence what PETE-students focus on when teaching and reflecting on their teaching. In addition to that, Russell (2013) states that reflective practice should be experienced in classrooms at schools, and not in the halls of the university. Therefore, my study focus on how supervisors’ guidance affects PETE-students experiences of teaching at schools by investigating their reflective conversations when planning and evaluating PETE-students teaching. Schön (1983) states that practitioners, e.g., teachers, conversate with teaching situations when they reflect. For that reason, supervisors are central figures, as they can (re)direct PETE-students’ attention by their guidance on meaningful aspects that PETE-students should consider in teaching situations. Supervisors’ guidance reduces the influences PETE-students should pay attention to. However, supervisors cannot foresee what PETE-students’ pay attention to, but supervisors can be committed to stimulate PETE-students development as professionals by (re)directing their focus. My results indicate that supervisors’ guidance can be more or less controlling, which affects how PETE-students experience their learning journeys at practicum. The PETE-students either, experienced controlled journeys where they had specified rules to follow, or they experienced more adventurous journeys where they had the opportunity to find their own path as teachers. Supervisors can stimulate PETE-students’ professional growth as autonomous and responsible teachers by being committed to encouraging them to consider their teaching thoroughly and allowing them to decide how to teach at practicum., Övergången från idrottslärarutbildning till lärarpraktik
- Published
- 2023
15. Debt level heterogeneity by municipality type : A study of the differences in households' debt level based on house- and condominium prices and municipality type in Sweden
- Author
-
Johansson, Emil, Engström, Jonathan, Johansson, Emil, and Engström, Jonathan
- Abstract
We investigate the effects of house- and condominium prices on a household's debt-to-income based on the type of municipality. With data from 2010-2017 for all of Sweden's municipalities we use a panel data regression and find that both house- and condominium price has a significant effect on debt-to-income with control variables of age, age! and education added to the model. The difference in effect on debt-to-income, depending on the type of the municipality is most significant between rural and metropolitan when we investigate condominium prices and between rural and urban when we investigate house prices meaning that there is a difference in effect depending on the type of the municipality. We determine that the effect of condominium price is highest for metropolitan, and the effect of house price is highest for urban.
- Published
- 2023
16. Valutafluktuationer på den svenska aktiemarknaden : Hur påverkar värdet på den svenska kronan den svenska aktiemarknaden?
- Author
-
Jadelind, Nils, Johansson, Emil, Jadelind, Nils, and Johansson, Emil
- Abstract
Magisteruppsats, civilekonomprogrammet Titel: Valutafluktuationer på den svenska aktiemarknaden Bakgrund: Aktiemarknaden och växelkurserna är två avgörande komponenter i världsekonomin. Aktiemarknaden kan påverkas av förändringar i valutakurser, vilket gör det viktigt att förstå hur den fungerar, för att sedan kunna göra smarta investeringsval. I denna studie, kommer vi under en tidsperiod mellan 2012-2021, undersöka hur valutakurserna, SEK/EUR, SEK/USD och KIX-index påverkar OMXS30. Syfte: Syftet med denna uppsats är att utforska sambandet mellan förändringar i den svenska växelkursen och den svenska aktiemarknaden. Metod: Denna studie har byggts på en kvantitativ metod med en deduktiv ansats, för att pröva dess syfte. Data har hämtats från Thomas Reuters Eikon Datastream och hypoteserna är framtagna för att finna lösningen på vår problemformulering. Slutsats: Denna studie visar att det finns ett samband mellan förändring i växelkurserna gemensamt och den svenska aktiemarknaden men det finns inte en specifik växelkurs som i sig självt har en signifikant påverkan på den svenska aktiemarknaden i helhet., Master Thesis in Business Administration Title: Currency fluctuations on the swedish stock market Background: The stock market and exchange rates are two crucial components of the world economy. The stock market can be affected by changes in exchange rates, which makes it important to understand how it works, in order to then make smart investment choices. In this study, during a period of time between 2012-2021, we will examine how the exchange rates, SEK/EUR, SEK/USD and the KIX index affects OMXS30. Purpose: The purpose of this essay is to explore the connection between changes in the Swedish exchange rate and the Swedish stock market. Method: This study has been based on a quantitative method with a deductive approach, in order to test its purpose. The data has been taken from the Thomas Reuters Eikon Datastream and the hypotheses have been developed to be able to find the solution to our problem. Conclusion: This study shows that there is a significant similarity between changes in exchange rates in general and the Swedish stock market, but there is not a specific exchange rate that in itself has a significant impact on the Swedish stock market as a whole
- Published
- 2023
17. ESG-markandens palats eller luftslott? : En kvantitativ studie om ESG och dess påverkan på aktieavkastning
- Author
-
Johansson, Emil, Söderberg, Hugo, Johansson, Emil, and Söderberg, Hugo
- Abstract
In recent years, the world's leaders have placed an increasing focus on sustainability, this has resulted in an increased interest in sustainable investments. In this thesis, we have studied the relationship between companies' ESG ratings and their returns, as well as comparing whether ESG ́s three pillars Environmental, Social and Governance have different relationships to companies' returns. The focus on sustainability has greatly increased in society, which should result in an increased interest in ESG ratings. At the same time, the studies previously carried out in the area have generated fragmented results, where the results are positive, negative and no connection. The various studies have focused on different markets from different continents during various time periods. This study has chosen to collect daily data from the S&P 500 over a period of time spanning from 2010 to 2022. A quantitative study has been conducted where the relationship and possible causality between ESG and returns have been studied. This has been done through the use of an Ordinary least Squares (OLS) where the regression model is based on an in-house development of Fama and French´s five-factor model. The results of the study show that there is indeed a small positive causal relationship between the ESG score a company receives and their return. Admittedly, there is a positive correlation, but it is small enough to be seen as negligible. When it comes to breaking down the different pieces that make up ESG, the result is different. Here the results certainly still show negligibly small correlations, but at the same time only G indicates that this correlation is positive. For the individual variables E and S, we instead see a negative relationship between investments in the areas and the companies’ returns. These results both confirm and contradict previous research as the result confirms certain previous results when it comes to the influence of the individual variables while at, Under de senaste åren har världens ledare lagt ett allt större fokus på hållbarhet, detta har resulterat i ett ökat intresse för hållbara investeringar. I denna uppsats har vi studerat förhållandet mellan företags ESG betyg och deras avkastning, samt tittat på huruvida ESG:s tre delar E, S och G har olika förhållanden till företags avkastning. Detta då fokuset på hållbarhet kraftigt ökat i samhället vilket borde resultera i ett ökat intresse för ESG betyg. Samtidigt har de studier som tidigare genomförts på området genererat splittrade resultat, där resultaten pekat på positiva, negativa och inget samband. De olika studierna har fokuserat på olika marknader från olika kontinenter under diverse tidsperioder. Denna studie har valt att samla in dagliga data från S&P 500 under en tidsperiod som sträcker sig från 2010 till 2022. En kvantitativ studie har genomförts där samband och eventuell kausalitet mellan ESG och avkastningen har studerats. Detta har gjorts genom användandet av en Ordinary Least Squares (OLS) där regressionsmodellen bygger på en egenutveckling av Fama och Frenchs fem-faktormodell. Resultaten från studien visar att det visserligen finns ett litet positivt kausalt samband mellan ESG-poängen ett företag erhåller och deras avkastning. Visserligen är det ett positivt samband men det är litet nog för att ses som försumbart. När det sedan kommer till uppdelningen av de olika bitarna som ingår i ESG blir resultatet annorlunda. Här visar resultatet förvisso fortfarande på försumbart små samband men samtidigt pekar endast G på att detta samband är positivt. För de enskilda variablerna E och S ser vi istället ett negativt samband mellan satsningar inom dessa områden och företagens avkastning. Dessa resultat både bekräftar och dementerar tidigare forskning då resultatet styrker vissa tidigare resultat när det kommer till de enskilda variablernas påverkan samtidigt som de visar att komplexiteten är större än vad vissa resultat tidigare angett.
- Published
- 2023
18. Context-Aware Travel Support During Unplanned Public Transport Disturbances
- Author
-
Jevinger, Åse, Johansson, Emil, Persson, Jan A., Holmberg, Johan, Jevinger, Åse, Johansson, Emil, Persson, Jan A., and Holmberg, Johan
- Abstract
This paper explores the possibilities and challenges of realizing a context-aware travel planner with bidirectional information exchange between the actor and the traveller during unplanned traffic disturbances. A prototype app is implemented and tested to identify potential benefits. The app uses data from open APIs, and beacons to detect the traveller context (which train or train platform the traveller is currently on). Alternative travel paths are presented to the user, and each alternative is associated with a certainty factor reflecting the reliability of the travel time prognoses. The paper also presents an interview study that investigates PT actors’ views on the potential use for actors and travellers of new information about certainty factors and travellers’ contexts, during unplanned traffic disturbances. The results show that this type of travel planner can be realized and that it enables travellers to find ways to reach their destination, in situations where the public t ravel planner only suggests infeasible travel paths. The value for the traveller of the certainty factors are also illustrated. Additionally, the results show that providing actors with information about traveller context and certainty factors opens up for the possibility of more advanced support for both the PT actor and the traveller., Kontextmedvetet resestöd vid störningar i kollektivtrafiken
- Published
- 2023
- Full Text
- View/download PDF
19. The Gunnlod Dataset : Engineering a dataset for multi-modal music generation
- Author
-
Johansson, Emil, Lindgren, Joel, Johansson, Emil, and Lindgren, Joel
- Abstract
This report details the creation of a new dataset named the Gunnlod dataset (after the Norse giantess who guarded the mead of poetry) for use in research in the field of machine learning as applied to music creation, particularly multi-modal music in the MIDI format of symbolic music representation. The dataset is based on a subset of approximately four fifths of the Lakh MIDI dataset. Each of the selected files has been processed to create an array representation of the file intended for easy use with machine learning models, as well as a taggram - a matrix of values specifying the degree to which the music exhibits certain traits at different points in time. These traits include genres (such as ”rock”, ”pop” and ”country”), instrumentation (such as ”flute”, ”vocals” and ”guitar”) as well as other more general descriptors (such as ”catchy”, ”quiet” and ”weird”). The trait values are generated by a preexisting machine learning model, circumventing the need for intense human labour. The dataset is intended to enable future researchers to create tools to aid in h‘uman creative tasks, such as a virtual ”composer’s assistant” capable of offering suggestions for melodies or drum beats based on the user’s requests. The code used to create Gunnlod can be found at https://gits-15.sys.kth.se/joeli/midiPipe. The report also includes an ethical analysis of the dataset rooted in the seven guidelines for ethical AI outlined in the framework Ethics guidelines for trustworthy AI commissioned by the European Commission. It concludes that the creation of Gunnlod raises concerns regarding Privacy and data governance and Diversity, non-discrimination and fairness, which are to some degree alleviated by its Transparency, and suggests ways to perform future research in ethical ways., Denna rapport beskriver skapandet av ett nytt dataset namngivet Gunnlod (efter den jättinna som vaktade skaldemjödet) för bruk inom forskning inom maskininlärning applicerat på musikskapande, med särskilt fokus på multiinstrumental musik på MIDI-format. Datsetet är baserat på cirka fyra femtedelar av Lakh MIDI-datasetet. Varje utvald fil har använts för att skapa en matrisrepresentation därav avsett för enkelt bruk i maskinlärningsmodeller, samt ett taggram - en matris av värden på hur mycket musiken visar på specifika drag vid specifika tidpunkter. Dessa drag inkluderar genrer (såsom ”rock”, ”pop” och ”country”), instrumentation (såsom ”flute”, ”vocals” och ”guitar”) samt mer generellt beskrivande ord (såsom ”catchy”, ”quiet” och ”weird”). Dessa värden genereras av en förexisterande maskininlärningsmodell, vilket kringgår behovet av intensivt mänskligt arbete. Detta dataset är avsett att möjliggöra framtida forskare att skapa verktyg som hjälper människors kreativa processer, såsom en virtuell ”kompositörsassistent” som kan förse förslag på melodier eller trumkomp utifrån en användares förfrågan. Koden som användes för att skapa datasetet går att finna på https://gits-15.sys.kth.se/ joeli/midiPipe. Rapporten innehåller också en etisk analys av datasetet rotad i de sju riktlinjer som ges i ramverket Ethics guidelines for trustworthy AI, skapat på uppdrag av Europeiska kommissionen. Analysen visar på farhågor med Gunnlods skapelse inom områdena Privacy and data governance och Diversity, non-discrimination and fairness, som till viss grad avhjälps av dess höga grad av Transparency, och förslag framläggs på hur framtida forskning ska genomföras på ett etiskt sätt.
- Published
- 2023
20. Virus-host interactions in HIV-1 and HIV-2 infections
- Author
-
Johansson, Emil and Johansson, Emil
- Published
- 2023
21. Context-Aware Travel Support During Unplanned Public Transport Disturbances
- Author
-
Jevinger, Åse, primary, Johansson, Emil, additional, Persson, Jan, additional, and Holmberg, Johan, additional
- Published
- 2023
- Full Text
- View/download PDF
22. Skuldnivåns heterogenitet per kommuntyp
- Author
-
Johansson, Emil and Engström, Jonathan
- Subjects
Economics ,Debt-to-income ,Municipality Type ,House Price ,Condominium Price ,Nationalekonomi ,Household debt ,indebtedness - Abstract
We investigate the effects of house- and condominium prices on a household's debt-to-income based on the type of municipality. With data from 2010-2017 for all of Sweden's municipalities we use a panel data regression and find that both house- and condominium price has a significant effect on debt-to-income with control variables of age, age! and education added to the model. The difference in effect on debt-to-income, depending on the type of the municipality is most significant between rural and metropolitan when we investigate condominium prices and between rural and urban when we investigate house prices meaning that there is a difference in effect depending on the type of the municipality. We determine that the effect of condominium price is highest for metropolitan, and the effect of house price is highest for urban.
- Published
- 2023
23. Mobile Inquiry Learning in Sweden: Development Insights on Interoperability, Extensibility and Sustainability of the LETS GO Software System
- Author
-
Vogel, Bahtijar, Kurti, Arianit, Milrad, Marcelo, Johansson, Emil, and Müller, Maximilian
- Abstract
This paper presents the overall lifecycle and evolution of a software system we have developed in relation to the "Learning Ecology through Science with Global Outcomes" (LETS GO) research project. One of the aims of the project is to support "open inquiry learning" using mobile science collaboratories that provide open software tools and resources, and participation frameworks for learner project collaboration, mobile data and media capture, publishing, analysis, and reflection. The primary focus of this paper is to report on our technical development, insights and knowledge gained during the past four years. Technical implementations and the prototypes developed in this project have been tested across several educational trials conduced in Sweden and abroad with more than 400 learners. Insights and knowledge gained from these activities verify that learners´ requirements were adequately addressed while satisfying their needs. The outcomes and results of our efforts provided us with a better understanding with regard to which software engineering processes and approaches can be used to address and support the complex requirements that emerge in novel mobile learning scenarios. Thus, the results discussed in this paper provide deeper insights into the importance of properly addressing issues related to interoperability and extensibility in order to develop software solutions to support mobile learning that are sustainable and endurable over time.
- Published
- 2014
24. Interferon Alpha-Inducible Protein 27 Expression Is Linked to Disease Severity in Chronic Infection of Both HIV-1 and HIV-2
- Author
-
Palm, Angelica A., Veerla, Srinivas, Lindman, Jacob, Isberg, Per-Erik, Johansson, Emil, Biague, Antonio, Månsson, Fredrik, Norrgren, Hans, Esbjörnsson, Joakim, Medstrand, Patrik, and Jansson, Marianne
- Subjects
General Medicine - Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
25. Kontextmedvetet resestöd vid störningar i kollektivtrafiken (juli 2021-oktober 2022) : Slutrapport forskningsprojekt TRV 2021/40633
- Author
-
Jevinger, Åse, Johansson, Emil, Persson, Jan A., Holmberg, Johan, Jevinger, Åse, Johansson, Emil, Persson, Jan A., and Holmberg, Johan
- Abstract
Smarta telefoner skapar nya förutsättningar inom kollektivtrafiken (KT) att både förse resenären med mer individanpassad information och ge resenären möjlighet att bidra med egen information, exv. om var resenären befinner sig (Stelzer et al. 2016). Om den här typen av dubbelriktad kommunikation används för överföring av information (inklusive realtidsinformation) under oplanerade trafikstörningar, kan såväl resenärens beslutsunderlag för den fortsatta resan, som aktörernas beslutsunderlag för störningshanteringen förbättras. Tidigare forskning visar att information om störningar och alternativa resrutter prioriteras högt av resenärerna (Currie och Muir 2017; Hörold et al. 2014). Dessutom föredrar resenärerna att få denna information på en individanpassad nivå, framför en aggregerad nivå (som exv. ger en översikt över all aktuell störningsinformation inom ett visst område) (Hörold et al. 2014). Tidigare forskning visar även att information från resenären har potential att förbättra operatörens beslut och åtgärder, framförallt i trafikledningen (Mayas et al. 2015). Det här projektet undersöker hur man kan realisera en dubbelriktad kommunikation mellan resenärer och aktörer för överföring av realtidsinformation under oplanerade trafikstörningar., Kontextmedvetet resestöd vid störningar i kollektivtrafiken
- Published
- 2022
26. Flygstridsledarutbildningen : Utvecklingsmöjlighter i en förändrad omvärld.
- Author
-
Lundgren, Daniel, Johansson, Emil, Lundgren, Daniel, and Johansson, Emil
- Abstract
Syftet med denna studie har varit att undersöka varför elever inte klarar av att genomförautbildningen till flygstridsledare i Försvarsmakten. En resurskrävande utbildning med testade elever, bra tekniska förutsättningar, och en hög lärartäthet. Trots detta avskiljs upp mot 38%av eleverna under olika skeden i utbildningen.Försvarsmakten och Flygvapnet står med hänsyn till det försämrade omvärldsläget inför en expansiv framtid där behovet av flygstridsledare bedöms öka. Framtiden kan betecknas,utifrån dagens allvarliga brister i numerär och oförmåga att reproducera funktionen, som bekymmersam. Brist på flygstridsledare riskerar Flygvapnets bibehållande och utveckling avseende både människor och materiel. Vi har intervjuat individer ur de yrkesgrupper som genomför urval och utbildning av flygstridsledare. Genom en kvalitativ studie med induktiv ansats, har vi sökt kunskap omvarför elever avskiljs från utbildningen.I vår analys har vi beskrivit relationer och beroenden mellan resurser i syfte att påvisa vad som skapar effektivitet utifrån tillgången på resurser för utbildningen. Resultatet visar att det föreligger resursbrister i hela kedjan rekrytering, urval och utbildning vilket påverkar utbildningen negativt. Utifrån ett resursbaserat perspektiv med effektivitetsfokus och utifrån framkomna brister, har vi analyserat och dragit slutsatsen att lärarkåren bör prioriteras för att öka effektiviteten i utbildningen i närtid.Utifrån vår analys tror vi oss kunna visa hur förändrade resurser utifrån dagens situation påverkar effektiviteten i utbildningen och utbildningsresultatet. Med ökade resurser inom rekrytering, urval och inom utbildningen så skulle med största sannolikhet den höga avskiljningsprocenten minska betydligt.
- Published
- 2022
27. Exploring divalent conjugates of 5-N-acetyl-neuraminic acid as inhibitors of coxsackievirus A24 variant (CVA24v) transduction
- Author
-
Johansson, Emil, Caraballo, Remi, Zocher, Georg, Mistry, Nitesh, Arnberg, Niklas, Stehle, Thilo, Elofsson, Mikael, Johansson, Emil, Caraballo, Remi, Zocher, Georg, Mistry, Nitesh, Arnberg, Niklas, Stehle, Thilo, and Elofsson, Mikael
- Abstract
Coxsackievirus A24 variant (CVA24v) is responsible for several outbreaks and two pandemics of the highly contagious eye infection acute hemorrhagic conjunctivitis (AHC). Currently, neither prevention (vaccines) nor treatments (antivirals) are available for combating this disease. CVA24v attaches to cells by binding Neu5Ac-containing glycans on the surface of cells which facilitates entry. Previously, we have demonstrated that pentavalent Neu5Ac conjugates attenuate CVA24v infection of human corneal epithelial (HCE) cells. In this study, we report on the structure-based design of three classes of divalent Neu5Ac conjugates, with varying spacer lengths, and their effect on CVA24v transduction in HCE cells. In relative terms, the most efficient class of divalent Neu5Ac conjugates are more efficient than the pentavalent Neu5Ac conjugates previously reported.
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
28. Hanteringen av svenska IS-resenärer i Syrien ur folkrättsligt perspektiv
- Author
-
Holm, Fanny, Wistrand Johansson, Emil, Holm, Fanny, and Wistrand Johansson, Emil
- Abstract
Så många som 40 000 personer tros ha rest från andra länder för att ansluta sig till IS i Syrien och Irak. Många av dessa s.k. terroristresenärer hålls idag internerade i det kurdiska självstyrets läger i Syrien och bland dem finns män, kvinnor och barn från Sverige. Situationen i lägren väcker en rad folkrättsliga frågor. Artikeln belyser den svenska regeringens agerande utifrån de folkrättsliga ramarna för frihetsberövande, straffrättsligt ansvarsutkrävande och repatriering av medborgare. Den visar att den svenska hanteringen av lägren präglats av ambivalens, och diskuterar om detta kan förklaras utifrån de folkrättsliga normernas vaghet och motstridighet, sambandet med internationell terrorism och den aktuella inrikespolitiska debatten
- Published
- 2022
29. Släta eller räta ljudvågor? : Varierar den hörbara skillnaden mellan en analog och en digital enhet beroende på vad för ljudmaterial som processeras?
- Author
-
Lindell Johansson, Emil and Lindell Johansson, Emil
- Abstract
I denna uppsats så undersöks det hur den hörbara skillnaden mellan en analog SSL busskompressor och SSL:s egna digitala emulering av denna påverkas beroende på vad för typ av ljudmaterial som processeras. Detta undersöks via ett dubbelblint och helt randomiserat lyssningstest. De olika typerna av ljud som används är två filer med akustisk gitarr, tre filer med olika typer av sång, två olika typer av trumset, en metallåt, en jazzlåt, en hiphop/rocklåt och en synthpoplåt.Det visar sig att lyssnarna i undersökningen upplever skillnaderna som störst när det som processeras är sången, och generellt sett så hör de en större skillnad ju glesare arrangemanget är och mindre processerade ljudfilerna är, med några undantag. Det blir också uppenbart att lyssnarna är starkt präglade av sin kulturella bakgrund – ifall de anser att digitalt eller analogt låter bäst. Detta märks i hur de använder typiska termer och uttryck för de båda.
- Published
- 2022
30. Tekniskt eller undersökande arbere. : Vilket har sjöingenjören störst användning av inom sitt framtida yrke?
- Author
-
Johansson, Emil and Johansson, Emil
- Abstract
Tekniskt eller undersökande arbete, vilket har sjöingenjören störst användning av inom sitt framtida yrke? För att uppnå studiens syfte har denna undersökning genom en kvalitativ intervjumetod uppbyggd på ett struktuerat sätt, med frågor som stickats ut via e-mail försökt att ge en inblick i yrkesaktiva sjöingenjörers erfarenheter över att använda sina självständiga arbeten i det dagliga arbetet ombord. För att uppnå detta har man delat in de tidigadre skrivna examensarbetena i tekniska eller undersökande ämnen. Där det tekniska ämnet bygger på om studenten har fått ett uppdrag från ett fartyg, rederi eller annat företag att till exempel göra en kalylering om energibesparingar, om en ny teknisk lösning, en nyinsallation eller uppgradering av komponent. Var det undersökande arbetets utförande grundar sig på intervjuer eller enkäter för att ta reda på hur något ligger till över lag inom sjöfartsbranchen. Där resultatet från intervjuerna i denna undersökning visar att kunskapen som införskaffas under insamling av information och vid det arbete som läggs ner till att skriva det självständiga arbetet enbart används vid specifika tillfällen där sjöingenjörens undersökta ämne eller vid liknande situationer uppkommer ombord., Technical or investigative thesis, which one does the marine engineer have the most use for in thie future profession? To achieve the porpose of this study, it has through a qualitative interview study method constructed in a structed way with questions sent out via e-mail tried to provide an insight into the marine enginerres' expiriences of useing thier examination thesis in the daily work on borad. To achive this, it has devided the previously writen thesis into technical or investigative subjects. Where the technichal subject is based on whether the student has beed commissioned by a ship, shipping compant or other company to, ofr example, make a calculation about energey savnings, a new technical solution, a new installation or upgrade of a component on board. Where the execution of the investigative thesis is based on interviews or questionnaires to find out how something is in general in the shipping industry. Where thr results from the interviews in this study show that the knowledge acquired during the collection of information and the work that goes into wingting the examination thesis is only used on specific occations where the engineers investigated topic or in similar situatuions arise on board.
- Published
- 2022
31. The Magic Formula och Canslim på Mid- och Large Cap : Vilken investeringsstrategi ger högst avkastning på stockholmsbörsen
- Author
-
Johansson, Emil, Jadelind, Nils, Johansson, Emil, and Jadelind, Nils
- Abstract
Swedish people tend to save their money in saving accounts instead of investing it. This study will examine how the investment strategies Magic Formula and Canslim perform on the different subgroups Mid Cap and Large Cap on the Swedish stock market. The purpose of this study is to test which strategy yields the highest return. The strategies were tested between the years of 2012-2021 and the study showed that the Magic Formula is to be preferred on Mid Cap and Canslim is to be preferred on Large Cap on the Swedish stock market. The results that are presented according to the calculations in this study shows that there are questions to be made whether the efficient market hypothesis is correct or not.
- Published
- 2022
32. Sjuksköterskans relevans som larmoperatör
- Author
-
Johansson, Emil, Waldestål, Jesper, Johansson, Emil, and Waldestål, Jesper
- Abstract
Under flertalet år har såväl alarmeringscentralen som ambulanssjukvården observerat en ökning av inkommande anrop från hjälpsökande till alarmeringscentralerna som genererar ambulansuppdrag. Det medför en trend med höga antal prioritet 1-uppdrag som kan leda till brist på ambulansresurser. Efter ambulanssjuksköterskans bedömning inger flera ambulansuppdrag inget behov av ambulanssjukvård. Därtill ökar riskerna för allvarlig vårdskada för livshotande sjuka och skadade patienter. Sedan början av 2000-talet har allt fler regioner, som sluter avtal med SOS Alarm för att bedöma och prioritera vårdärenden, börjat ställa krav om tillgång till legitimerad sjuksköterskekompetens för att öka kvaliteten på larmbehandlingen. Huruvida legitimerad sjuksköterskekompetens innebär gynnsam effekt för larmkedjan och patientsäkerheten är dock omdebatterad med begränsad forskning som inte är enig om slutsatserna. Syftet är att identifiera skillnader i hänvisningsgrad och prioriteringar mellan internutbildade respektive sjuksköterskeutbildade larmoperatörer vid alarmeringscentraler. Data från regionerna Sörmland och Halland analyserades i en deskriptiv retrospektiv kvantitativ studie där 2393 respektive 1542 ambulansärenden erhölls från regionerna. I Hallands län, som ingår avtal med SOS Alarm, där majoriteten av larmoperatörerna ej innehar sjuksköterskelegitimation, bedömdes 59,4 % av vårdärendena som prioritet 1-uppdrag i kontrast mot Sörmlands län där larmoperatörer, på Sjukvårdens alarmeringscentral innehar sjuksköterskelegitimation, bedömde 35,6 % som prioritet 1- uppdrag. Den högre andelen prioritet 1-uppdrag speglades inte i att ambulansen bedömde fler patienter som kritiskt sjuka. Ingen snedfördelning mellan de båda regionerna gällande ambulanssjuksköterskans bedömning av patienter observerades, vilket varken kan påvisa överprioritering i den icke sjuksköterskeutbildades bedömning eller gynnsamheten av legitimerad sjuksköterskekompetens som larmoperatör. Således är vidare forskni
- Published
- 2022
33. Hierarchical Clustering and Trajectory Analyses Reveal Viremia-Independent B-Cell Perturbations in HIV-2 Infection
- Author
-
Johansson, Emil, Kerkman, Priscilla, Scharf, Lydia, Lindman, Jacob, Szojka, Zsófia I., Månsson, Fredrik, Biague, Antonio, Medstrand, Patrik, Norrgren, Hans, Buggert, Marcus, Karlsson, Annika C., Forsell, Mattias N. E., Esbjörnsson, Joakim, Jansson, Marianne, Johansson, Emil, Kerkman, Priscilla, Scharf, Lydia, Lindman, Jacob, Szojka, Zsófia I., Månsson, Fredrik, Biague, Antonio, Medstrand, Patrik, Norrgren, Hans, Buggert, Marcus, Karlsson, Annika C., Forsell, Mattias N. E., Esbjörnsson, Joakim, and Jansson, Marianne
- Abstract
Time to AIDS in HIV-2 infection is approximately twice as long compared to in HIV-1 infection. Despite reduced viremia, HIV-2-infected individuals display signs of chronic immune activation. In HIV-1-infected individuals, B-cell hyperactivation is driven by continuous antigen exposure. However, the contribution of viremia to B-cell perturbations in HIV-2-infected individuals remains largely unexplored. Here, we used polychromatic flow cytometry, consensus hierarchical clustering and pseudotime trajectory inference to characterize B-cells in HIV-1- or HIV-2-infected and in HIV seronegative individuals. We observed increased frequencies of clusters containing hyperactivated T-bethighCD95highCD27int and proliferating T-bet+CD95highCD27+CD71+ memory B-cells in viremic HIV-1 (p < 0.001 and p < 0.001, respectively), viremic HIV-2 (p < 0.001 and p = 0.014, respectively) and in treatment-naïve aviremic HIV-2 (p = 0.004 and p = 0.020, respectively)-infected individuals, compared to seronegative individuals. In contrast, these expansions were not observed in successfully treated HIV-1-infected individuals. Finally, pseudotime trajectory inference showed that T-bet-expressing hyperactivated and proliferating memory B-cell populations were located at the terminal end of two trajectories, in both HIV-1 and HIV-2 infections. As the treatment-naïve aviremic HIV-2-infected individuals, but not the successfully ART-treated HIV-1-infected individuals, showed B-cell perturbations, our data suggest that aviremic HIV-2-infected individuals would also benefit from antiretroviral treatment.
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
34. HIV-2 Neutralization Sensitivity in Relation to Co-Receptor Entry Pathways and Env Motifs
- Author
-
Szojka, Zsófia Ilona, primary, Karlson, Sara, additional, Johansson, Emil, additional, Şahin, Gülşen Özkaya, additional, and Jansson, Marianne, additional
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
35. Large-Scale Robot-Based Polymer and Composite Additive Manufacturing: Failure Modes and Thermal Simulation
- Author
-
Akbari, Saeed, primary, Johansson, Jan, additional, Johansson, Emil, additional, Tönnäng, Lenny, additional, and Hosseini, Seyed, additional
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
36. Fluorescent Molecularly Imprinted Polymer Layers against Sialic Acid on Silica-Coated Polystyrene Cores—Assessment of the Binding Behavior to Cancer Cells
- Author
-
Beyer, Sarah, primary, Kimani, Martha, additional, Zhang, Yuecheng, additional, Verhassel, Alejandra, additional, Sternbæk, Louise, additional, Wang, Tianyan, additional, Persson, Jenny L., additional, Härkönen, Pirkko, additional, Johansson, Emil, additional, Caraballo, Remi, additional, Elofsson, Mikael, additional, Gawlitza, Kornelia, additional, Rurack, Knut, additional, Ohlsson, Lars, additional, El-Schich, Zahra, additional, Wingren, Anette Gjörloff, additional, and Stollenwerk, Maria M., additional
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
37. Fluorescent Molecularly Imprinted Polymer Layers against Sialic Acid on Silica-Coated Polystyrene Cores — Assessment of the Binding Behavior to Cancer Cells
- Author
-
Beyer, Sarah, Kimani, Martha, Zhang, Yuecheng, Verhassel, Alejandra, Sternbæk, Louise, Wang, Tianyan, Persson, Jenny L., Härkönen, Pirkko, Johansson, Emil, Caraballo, Remi, Elofsson, Mikael, Gawlitza, Kornelia, Rurack, Knut, Ohlsson, Lars, El-Schich, Zahra, Wingren, Anette Gjörloff, and Stollenwerk, Maria M.
- Subjects
sialic acid ,Cell- och molekylärbiologi ,Biochemistry and Molecular Biology ,SA conjugates ,cancer ,molecularly imprinted polymers ,imprinting ,Biokemi och molekylärbiologi ,Cell and Molecular Biology - Abstract
Sialic acid (SA) is a monosaccharide usually linked to the terminus of glycan chains on the cell surface. It plays a crucial role in many biological processes, and hypersialylation is a common feature in cancer. Lectins are widely used to analyze the cell surface expression of SA. However, these protein molecules are usually expensive and easily denatured, which calls for the development of alternative glycan-specific receptors and cell imaging technologies. In this study, SA-imprinted fluorescent core-shell molecularly imprinted polymer particles (SA-MIPs) were employed to recognize SA on the cell surface of cancer cell lines. The SA-MIPs improved suspensibility and scattering properties compared with previously used core-shell SA-MIPs. Although SA-imprinting was performed using SA without preference for the α2,3- and α2,6-SA forms, we screened the cancer cell lines analyzed using the lectins Maackia Amurensis Lectin I (MAL I, α2,3-SA) and Sambucus Nigra Lectin (SNA, α2,6-SA). Our results show that the selected cancer cell lines in this study presented a varied binding behavior with the SA-MIPs. The binding pattern of the lectins was also demonstrated. Moreover, two different pentavalent SA conjugates were used to inhibit the binding of the SA-MIPs to breast, skin, and lung cancer cell lines, demonstrating the specificity of the SA-MIPs in both flow cytometry and confocal fluorescence microscopy. We concluded that the synthesized SA-MIPs might be a powerful future tool in the diagnostic analysis of various cancer cells.
- Published
- 2022
38. The Potential of Integrating Wind Power with Offshore Oil and Gas Platforms
- Author
-
He, Wei, Jacobsen, Gunnar, Anderson, Tiit, Olsen, Freydar, Hanson, Tor D., Korpås, Magnus, Toftevaag, Trond, Eek, Jarle, Uhlen, Kjetil, and Johansson, Emil
- Published
- 2010
39. A Simulation Study on Electric Last Mile Delivery with Mobile Smart Cargo Boxes
- Author
-
Lorig, Fabian, primary, Johansson, Emil, additional, Davidsson, Pauk, additional, and Persson, Jan A., additional
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
40. Exploring divalent conjugates of 5-N-acetyl-neuraminic acid as inhibitors of coxsackievirus A24 variant (CVA24v) transduction
- Author
-
Johansson, Emil, primary, Caraballo, Rémi, additional, Zocher, Georg, additional, Mistry, Nitesh, additional, Arnberg, Niklas, additional, Stehle, Thilo, additional, and Elofsson, Mikael, additional
- Published
- 2022
- Full Text
- View/download PDF
41. Sialic Acid as a Biomarker Studied in Breast Cancer Cell Lines In Vitro Using Fluorescent Molecularly Imprinted Polymers
- Author
-
El-Schich, Zahra, Zhang, Yuecheng, Göransson, Tommy, Dizeyi, Nishtman, Persson, Jenny L., Johansson, Emil, Caraballo, Remi, Elofsson, Mikael, Shinde, Sudhirkumar, Sellergren, Börje, and Wingren, Anette Gjörloff
- Subjects
lcsh:T ,Cell- och molekylärbiologi ,lcsh:Technology ,Sialic acid ,lcsh:QC1-999 ,Analytical Chemistry ,lcsh:Chemistry ,Breast cancer ,breast cancer ,Epithelial cell adhesion molecule ,lcsh:Biology (General) ,lcsh:QD1-999 ,sialic acid ,lcsh:TA1-2040 ,Molecularly imprinted polymers ,Analytisk kemi ,Nanoparticles ,molecularly imprinted polymers ,nanoparticles ,epithelial cell adhesion molecule ,lcsh:Engineering (General). Civil engineering (General) ,lcsh:QH301-705.5 ,Cell and Molecular Biology ,lcsh:Physics - Abstract
Sialylations are post-translational modifications of proteins and lipids that play important roles in many cellular events, including cell-cell interactions, proliferation, and migration. Tumor cells express high levels of sialic acid (SA), which are often associated with the increased invasive potential in clinical tumors, correlating with poor prognosis. To overcome the lack of natural SA-receptors, such as antibodies and lectins with high enough specificity and sensitivity, we have used molecularly imprinted polymers (MIPs), or “plastic antibodies”, as nanoprobes. Because high expression of epithelial cell adhesion molecule (EpCAM) in primary tumors is often associated with proliferation and a more aggressive phenotype, the expression of EpCAM and CD44 was initially analyzed. The SA-MIPs were used for the detection of SA on the cell surface of breast cancer cells. Lectins that specifically bind to the a-2,3 SA and a-2,6 SA variants were used for analysis of SA expression, with both flow cytometry and confocal microscopy. Here we show a correlation of EpCAM and SA expression when using the SA-MIPs for detection of SA. We also demonstrate the binding pattern of the SA-MIPs on the breast cancer cell lines using confocal microscopy. Pre-incubation of the SA-MIPs with SA-derivatives as inhibitors could reduce the binding of the SA-MIPs to the tumor cells, indicating the specificity of the SA-MIPs. In conclusion, the SA-MIPs may be a new powerful tool in the diagnostic analysis of breast cancer cells.
- Published
- 2021
42. Exploring the Effect of Structure-Based Scaffold Hopping on the Inhibition of Coxsackievirus A24v Transduction by Pentavalent N-Acetylneuraminic Acid Conjugates
- Author
-
Johansson, Emil, primary, Caraballo, Rémi, additional, Hurdiss, Daniel L., additional, Mistry, Nitesh, additional, Andersson, C. David, additional, Thompson, Rebecca F., additional, Ranson, Neil A., additional, Zocher, Georg, additional, Stehle, Thilo, additional, Arnberg, Niklas, additional, and Elofsson, Mikael, additional
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF
43. Synthesis of 4-O-Alkylated N-Acetylneuraminic Acid Derivatives
- Author
-
Johansson, Emil, primary, Caraballo, Rémi, additional, and Elofsson, Mikael, additional
- Published
- 2021
- Full Text
- View/download PDF
44. Numerical calculation of creep settlements in deep cement mixing
- Author
-
Johansson, Emil and Granlund Hedén, Victor
- Subjects
Annan samhällsbyggnadsteknik ,DCM ,Concrete Model ,Contrete Model ,Kalkcementpelare ,Multicementpelare ,Other Civil Engineering ,Deep cement mixing ,Soft Soil Creep ,Creep settlement ,Kryp ,Sättningar ,CKD ,Plaxis ,Plaxis 2D - Abstract
I detta examensarbete har en utredning gjorts med syftet att undersöka lämpligheten att genomföra en djupstabilisering med multicementpelare (MC-pelare) i ett område med högt ställda sättningskrav. Detta genom att numeriskt simulera hur djupstabiliserad lera kan bete sig vid belastning med avseende på långtidsdeformationer. Vidare utvärderas hur väl olika materialmodeller kan simulera sättningar med hänsyn till kryp samt huruvida krypsättningar bör beaktas vid denna typ av dimensionering. Simuleringarna är genomförda enligt de geotekniska förutsättningarna och den planerade byggnationen på Galoppfältet i Täby Park. Som en grund för beräkningarna genomfördes en litteraturstudie där bland annat valet att simulera pelarna med Mohr-Coulomb (MoC), Soft Soil Creep (SSC) och Concrete Model (CM) i Plaxis 2D motiveras. Pelarna simulerades med en axissymmetrisk 2D-modell och i samtliga beräkningar simulerades leran med kryp medan pelarna simulerades både med och utan krypsättningar. En kalibrering mot tidigare forskning på området samt sättningsberäkningar av lera på Galoppfältet genomfördes för att säkerställa den valda modellens lämplighet. Därefter simulerades pelare med olika geometriska förutsättningar och varierande uppfyllnadshöjd. En sensitivitetsanalys gjordes även för att åskådliggöra vilka av de osäkra parametrarna som ger stor påverkan på resultatet. Simuleringarna visade att det antagligen är lämpligt att djupförstärka leran med multicementpelare för att uppnå låga sättningar över tid. För en pelardiameter på 800 mm och ett centrumavstånd på 1200 mm uppnåddes följande sättningar med de olika uppfyllnadshöjderna samt de olikamaterial modellerna. Av de testade pelarna ansågs denna geometri mest lämplig för de givna förutsättningarna på Galoppfältet. Detta baseras på den totala sättningen och att vissa pelare gick till brott i simuleringarna för övriga geometrier med större centrumavstånd och mindre pelardiameter. Beräkningarna där pelarna simulerades med SSC- och CM med kryp visade på stor variation sinsemellan. Resultaten med SSC anses felaktigt låga på grund av bristfälliga materialdata och visas därför inte i sammanfattningen. Resultaten med CM utan kryp och MoC utan kryp anses mest trovärdiga om än dock potentiellt för låga eftersom krypsättningar i pelarna inte är inkluderade. Vidare anses CM överlag vara en lämplig modell för att simulera sättningar med kryp i djupförstärkt lera förutsatt att ett tillräckligt underlag för val av materialparametrar finns att tillgå. SSC kan potentiellt vara lämplig enligt resultat från sensitivitetsanalysen förutsatt att materialparametrar kan undersökas för de lokala förutsättningarna. Dock förordas CM för fortsatta studier med krypsättningar i djupförstärkt lera. MoC anses som en god modell om kryp försummas. Med hänsyn till detta anser författarna att kryptester på multicementpelare bör övervägas för att skapa bättre förutsättningar för dimensionering av djupförstärkt lera med krypsättningar. Något som kan ge underlag för dimensionering med högre precision och potentiellt ekonomisk vinning. This master thesis investigates the suitability of using multicement, a mixture of cement and cement kiln dust (CKD), for deep cement mixing (DCM) as soil improvement in an area with high requirements regarding the maximum allowed settlements. This was done by numerical modelling of long-term settlement behaviour for a DCM improved soil. Furthermore, the usability of different material models when considering creep behaviour are studied. The report also investigates whether creep behaviour should be considered or not in this type of simulation. The simulations are done according to the geotechnical conditions and the planned design for an old gallop track in Täby Park, Sweden. A literature review is done as a basis for the simulations performed in Plaxis 2D with an axis symmetric 2D-model. The use of Mohr-Coulomb (MoC), Soft SoilCreep (SSC) and Concrete Model (CM) for the columns are motivated. Creep settlements are included in the clay for all simulations while the columns are simulated both with and without creep settlements. To ensure the suitability of the model, a calibration is done by replication of a research study as well as replication of settlement calculations of the unimproved clay on Galoppfältet. Thereafter different geometric options for the columns and varying fill depths are simulated. Lastly a sensitivity analysis is conducted to display how much the uncertain material properties affect the result. Using multicement columns (MC columns) for DCM seems to be a good method for stabilizing the soil in Galoppfältet to achieve small settlements over time. For columns with a diameter of 800 mm and a center distance of 1200 mm the following settlements were calculated with the different material models for different fill heights. This geometry was considered most suitable for the conditions at Galoppfältet. The two material models which account for creep in the columns show significantly different levels of total settlement. Due to lack of material data the results from simulations with SSC is deemed incorrect and thus not shown in the abstract. Thereby the results from MoC and CM without creep are deemed most credible even though they may be slightly low since they do not consider creep settlements in the columns. Furthermore, the Concrete Model is considered a good model to simulate settlements including creep in improved clay given that the material properties are carefully selected based on testing of the material. Soft Soil Creep may potentially be suitable for columns according to the calibration given that the different material parameters are investigated for the local conditions. However, CMare favoured. Mohr-Coulomb is deemed as a good model if creep settlements are neglected. With regards to this, the authors believe that creep tests of multicement columns should be considered to create improved preconditions for dimensioning of DCM columns with creep. This to improve the accuracy of design and potentially create cost reductions.
- Published
- 2021
45. Derivatives in Textbooks : A Quantitative Content Analysis of Task Types in Swedish Textbooks
- Author
-
Grönbäck, Daniel and Johansson, Emil
- Subjects
Annan matematik ,Derivata ,problemlösning ,Didactics ,kvantitativ innehållsanalys ,läromedel ,Didaktik ,Other Mathematics ,imitation - Abstract
Den här studien syftar till att undersöka om svenska läromedel för Matematik 3b genom användandet av problemlösningsuppgifter ger elever möjlighet att kunna skapa förståelse för derivata. Metoden är kvantitativ innehållsanalys, och läromedlen analyserades med hjälp av ett kodningsschema med sju dimensioner. Huvudfokus för kodningen var uppgiftstyp, som kategoriserades utifrån grad av problemlösning. Kategorierna representerar olika uppgiftstyper med olika grad av imitation, resonemang och problemlösning. Detta gjordes för att kunna hitta mönster i hur läromedlens upplägg i termer av hur uppgiftstyp (grad av problemlösning) relaterar till svårighetsgrad och avsnittstyp. Resultaten framställs genom tabeller och diagram. Resultaten pekar på att läromedlen generellt sett är relativt lika i sitt upplägg och uppgiftsfokus, även om det i vissa aspekter finns vissa skillnader. Det tydligaste mönstret är hur imitationsuppgifter dominerar den ordinarie uppgiftssamlingen, framför allt på grundläggande nivå. Dessutom finns mönster i hur specialavsnitt skiljer sig från de andra avsnittstyperna i termer av vilka uppgifter som är i fokus. Slutsatsen är även att trots att det finns en övervikt av imitationsuppgifter i de flesta läromedel, kan elever fortfarande utveckla alla förmågor som behövs – om läraren använder läromedlet på ett effektivt sätt. This study’s purpose is to investigate if Swedish textbooks in the course “Matematik 3b”, through the use of problem-solving tasks, give students the possibility to create a deeper understanding of the concept of derivatives. The method is a quantitative content analysis, and the textbooks were analyzed by the usage of a coding schedule consisting of seven dimensions. The main focus regarding the coding of tasks was type of task, which was categorized according to level of problem-solving required to solve the task. The categories represent different task types defined by different amounts of problem-solving, reasoning and imitation. This was done in order to find patterns regarding how the textbooks were structured in terms of how task type relates to degree of difficulty and type of section in which the task appears. The results are presented through tables and diagrams. They point to the fact that in general, the textbooks are similar in terms of structure and task focus, even though there are some differences in certain aspects. The most obvious pattern is how imitation dominates the main tasks, especially those that are on a basic level. Furthermore, there are patterns in how the “special sections” differ in terms of which task types are in focus. The conclusion is that even though imitation dominates most textbooks, textbooks still offer students possibilities to develop in every aspect of mathematics – if the teacher uses the textbook in an efficient way.
- Published
- 2021
46. How do you approach your client? : A study of how the auditor interacts with their client
- Author
-
Johansson, Emil and Landén, Hanna
- Subjects
Auditing process ,Relationship ,Pandemic ,Revision ,Communication ,Revisionsprocess ,Auditing ,Interaktionsteknik ,Kommunikation ,Pandemi ,Klient ,Relation ,Client ,Interaction technique ,Business Administration ,Företagsekonomi - Abstract
Examensarbete, Civilekonomprogrammet, Ekonomihögskolan vid Linnéuniversitetet, VT 2021 Författare: Emil Johansson och Hanna Landén Handledare: Sven-Olof Yrjö Collin Examinator: Andreas Jansson Titel: Hur pratar du med din klient? - En studie om hur revisorn interagerar med sin klient Bakgrund: Coronapandemins inträde i samhället har inneburit att människor förväntas dra ner på sina fysiska kontakter med andra människor. Eftersom revisionsbranschen å ena sidan kommit långt i digitaliseringen är det möjligt att den inte påverkas i större utsträckning, men å andra sidan är fysiska kontakter viktiga för att upprätthålla en god relation med klienten. Hur interaktionen sker kan påverka relationen som i sin tur kan påverka revisionskvalitén. Studien undersöker därför dessa interaktioner genom att studera val av interaktionsteknik mellan revisor och klient. Syfte: Uppsatsens syfte är att kartlägga och förklara hur revisorn interagerar med klienten i revisionens olika delar. Metod: Utifrån en teoretisk referensram sammanställs och kategoriseras de interaktionstekniker som används mellan revisor och klient i en typologi. Vidare genomförs en flermetodsforskning som inleds med en kvalitativ förstudie där dennatypologi prövas och som induktivt fångar sådant tidigare studier inte utforskat. Den teoretiska referensramen och förstudien ligger sedan till grund för den kvantitativa huvudstudiens utformning som har för avsikt att beskriva användandet av interaktionsteknikerna i revisionens olika delar. Slutsats: Studien kartlägger och förklarar varför en interaktionsteknik väljs i respektive del av revisionen genom att i en typologi och empirisk studie beskriva interaktionsteknikerna. Studien finner tre faktorer som påverkar valet av teknik; grad av digitalisering, teknikens tidsåtgång samt hur avancerad tekniken är. Studien påvisar även substitutionseffekter mellan några av interaktionsteknikerna. Denna kartläggning av interaktionstekniker möjliggör också framtida forskning på ämnet. Nyckelord: Interaktionsteknik, Revision, Relation, Klient, Kommunikation, Revisionsprocess, Pandemi Master Thesis in Business Administration, School of Business and Economics at Linnaeus University, VT 2021 Authors: Emil Johansson and Hanna Landén Supervisor: Sven-Olof Yrjö Collin Examiner: Andreas Jansson Title: How do you approach your client? - A study of how the auditor interacts with their client Background: The coronavirus pandemic’s entry into society has meant that people are expected to reduce their physical contacts with other people. As the auditing industry has come a long way in digitalization, it is possible that it is not affected to a greater extent. But on the other hand, physical contacts are important for maintaining a good relationship with the client. How the interaction takes place can affect the relationship, which in turn can affect the audit quality. The study therefore examines these interactions by studying the choice of interaction technique between auditor and client. Purpose: The aim of the study is to map and explain how the auditor interacts with the client in the various parts of the audit. Method: Based on a theoretical framework, the interaction techniques used between auditor and client are compiled and categorized in a typology. Furthermore, a multi-method research is carried out which begins with a qualitative pilot study where the typology is tested. The pilot study also inductively captures what previous studies have not explored. The theoretical framework and the pilot study then form the basis for the design of the quantitative main study, which intends to explain the choice of interaction technique in the various parts of the audit. Conclusion: The study maps and explains why an interaction technique is chosen in each part of the audit in a typology and empirical study by describing the interaction techniques. The study finds three factors that influence the choice of technique; level of digitalization, the time required and how advanced the technique is. The study also discovers substitution effects between some of the interaction techniques. This mapping of interaction techniques also enables further research on the subject. Keywords: Interaction technique, Auditing, Relationship, Client, Communication, Auditing process, Pandemic
- Published
- 2021
47. Tailored conjugates of N-acetylneuraminic acid and small molecules targeting virus cell attachment and entry
- Author
-
Johansson, Emil
- Subjects
(HAdV-D37 ,Organisk kemi ,Organic Chemistry ,Human adenovirus D37 ,multivalency ,HAdV-D36) ,Neu5Ac ,sialic acid ,Coxsackievirus A24v (CVA24v) ,conjunctivitis ,cryo-EM ,D36 ,N-acetylneuraminic acid ,D26 ,4-O-alkyl Neu5Ac ,HAdV-D26 ,branched pleconaril probes - Abstract
Viruses are obligate intracellular parasites, unable to replicate without exploiting machinery andmaterials from host cells. Pandemics of viral diseases have had large impacts on human socieities and are continued threats to global health. The most efficient means of controlling viral diseases are preventive measures such as immunization of the population, social distancing, and basic hygiene routines. Another mean is development of antiviral drugs that could be used as preventive measures and in treatment of infected individuals. Coxsackievirus A24 variant (CVA24v) is a highly contagious pathogen that cause large outbreaks and pandemics of the eye infection acute hemorrhagic conjunctivitis. Human adenovirus D species type 37 (HAdV-D37) causes epidemics of the severe eye infection epidemic keratoconjunctivitis, that can become life-threatening in immunocompromised individuals. Currently, no specific treatments (vaccine or antivirals) are available to combat the diseases caused by these two pathogens. CVA24v and HAdV-D37 bind to N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac) glycans on host cells facilitating attachment and subsequent infection. In this thesis, we explored inhibition of this common recognition motif by development of pentavalent Neu5Ac containing molecules with radial topology to act as decoy receptors. This allowed us to study the potential of development of a general inhibitor targeting both these viruses. The developed compounds inhibited attachment of CVA24v and HAdVD37 to cells. Furthermore, we developed divalent Neu5Ac tools to validate if targeting the Neu5Acmediated attachment of CVA24v to cells were a potential target for antiviral drug discovery and development. The results from these studies indicate that development of a Neu5Ac-based antiviral targeting CVA24v looks bleak as the primary receptor utilized by this virus is ICAM-1. The work with developing Neu5Ac tools led to a side project with synthesis of 4-O-alkyl Neu5Ac analogs. In this project we provided a method to synthesize 4-O-alkyl analogs of Neu5Ac and gave insights into the scope of the reaction. This work could have have value in drug discovery. Targeting enterovirus uncoating is a well explored strategy for the inhibition of enterovirus infection. In this thesis, we synthezied novel branched probes of pleconaril (a well-known pocket binding molecule) to study if targeting the unique branched pocket of CVA24v could have potential as a target for antiviral drug discovery. Further experiments are needed to draw conclusions in regards to the future prospects of targeting this unique feature. At last, two novel classes of trivalent Neu5Ac conjugates were develop using a structure-based approach targeting HAdV-D37, -D36, and -D26. This led to a more potent compound towards HAdVD37 further validating that targeting the attachment of this virus to cells is a reasonable strategy for antiviral drug development. Towards HAdV-D26 the inhibitory effect was saturated at 50%, likely due to engagement of other receptors. Evaluation towards HAdV-D36 is currently ongoing. Structural biology studies, indicates the compounds bind to the viruses via chelation of their trimeric binding sites. Taken together, these compounds have potential to be used as chemical tools to study the biology of human adenoviruses and perhaps other Neu5Ac binding proteins.
- Published
- 2021
48. Identifiering av antistatiska och antifogging additiv i polymerer, inklusive använda plastförpackningar
- Author
-
Lund, Rebecka, Ibrahim, Raam, and Johansson, Emil
- Subjects
Gas kromatografi ,Vegetabiliskt ursprung ,Antifogging additiv ,Antistatiska additiv ,Analytisk kemi ,Polyolefiner ,Glycerol monostearat ,Mass spektrometri ,Animaliskt ursprung ,Analytical Chemistry - Abstract
Huvudmålet i projektet var att analysera det vanligt förekommande additivet glycerolmonostearat, GMS, i plastprover. Projektet är en del av ett samarbete mellan KTH och det norska företaget Norner. Projektgruppen har jobbat för att utvärdera och optimera företagets nuvarande analysmetod samt att identifiera glycerolmonostearat i polypropylen. Olika lösningsmedel och derivatiseringsreagens testades, såväl som olika temperaturprofiler, för gaskromatografen jämfördes under projektet. Resultaten visade att glycerolmonostearat kunde derivatiseras genom silylering. Alla prover har sammanfattats i en slutgiltig metod som är lämpad för analys av polyolefiner som innehåller glycerolmonostearat. Slutmetoden saknade möjligheten för kvantitativ analys och kan därför förbättras i framtiden. The main task was to analyze the very common additive, glycerol monostearate, GMS in plastic samples. The project was a collaboration between KTH students and the Norwegian company Norner. The goal was to evaluate and optimize the company's current method of analysis and identification of the content of GMS in polyolefins. Different solvents, derivatization agents and methods for gas chromatography were compared to find an effective process by which additives in polypropylene samples can be analyzed. The results showed that glycerol monostearate can be derivatized through a process called silylation. All different attempts have been summarized into one final method that was most suitable for the analysis of polyolefins containing glycerol monostearate. The final method was reproducible but lacked a properly determined quantification analysis. The final method can be improved further after this project. To give a few examples there are a lot more potential derivatization agents and solvents that can be substituted which requires further research.
- Published
- 2021
49. Agent-based Social Simulation of the Covid-19 Pandemic : A Systematic Review
- Author
-
Lorig, Fabian, Johansson, Emil, and Davidsson, Paul
- Subjects
Literature Study ,Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi ,Datavetenskap (datalogi) ,Non-Pharmaceutical Interventions ,SARS-CoV-2 ,Epidemiology ,Computer Sciences ,PRISMA ,Public Health, Global Health, Social Medicine and Epidemiology ,Transmission Processes - Abstract
When planning interventions to limit the spread of Covid-19, the current state of knowledge about the disease and specific characteristics of the population need to be considered. Simulations can facilitate policy making as they take prevailing circumstances into account. Moreover, they allow for the investigation of the potential effects of different interventions using an artificial population. Agent-based Social Simulation (ABSS) is argued to be particularly useful as it can capture the behavior of and interactions between individuals. We performed a systematic literature reviewand identified 126 articles that describe ABSS of Covid-19 transmission processes. Our reviewshowed that ABSS is widely used for investigating the spread of Covid-19. Existing models are very heterogeneous with respect to their purpose, the number of simulated individuals, and the modeled geographical region, as well as how they model transmission dynamics, disease states, human behavior, and interventions. To this end, a discrepancy can be identified between the needs of policy makers and what is implemented by the simulation models. This also includes how thoroughly the models consider and represent the real world, e.g. in terms of factors that affect the transmission probability or how humans make decisions. Shortcomingswere also identified in the transparency of the presented models, e.g. in terms of documentation or availability, as well as in their validation, which might limit their suitability for supporting decision-making processes. We discuss how these issues can be mitigated to further establish ABSS as a powerful tool for crisis management.
- Published
- 2021
50. Tailored conjugates of N-acetylneuraminic acid and small molecules that block virus cell attachment and entry
- Author
-
Johansson, Emil
- Subjects
(HAdV-D37 ,Organisk kemi ,Organic Chemistry ,Human adenovirus D37 ,multivalency ,HAdV-D36) ,Neu5Ac ,sialic acid ,Coxsackievirus A24v (CVA24v) ,conjunctivitis ,cryo-EM ,D36 ,N-acetylneuraminic acid ,D26 ,4-O-alkyl Neu5Ac ,HAdV-D26 ,branched pleconaril probes - Abstract
Viruses are obligate intracellular parasites, unable to replicate without exploiting machinery andmaterials from host cells. Pandemics of viral diseases have had large impacts on human socieities and are continued threats to global health. The most efficient means of controlling viral diseases are preventive measures such as immunization of the population, social distancing, and basic hygiene routines. Another mean is development of antiviral drugs that could be used as preventive measures and in treatment of infected individuals. Coxsackievirus A24 variant (CVA24v) is a highly contagious pathogen that cause large outbreaks and pandemics of the eye infection acute hemorrhagic conjunctivitis. Human adenovirus D species type 37 (HAdV-D37) causes epidemics of the severe eye infection epidemic keratoconjunctivitis, that can become life-threatening in immunocompromised individuals. Currently, no specific treatments (vaccine or antivirals) are available to combat the diseases caused by these two pathogens. CVA24v and HAdV-D37 bind to N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac) glycans on host cells facilitating attachment and subsequent infection. In this thesis, we explored inhibition of this common recognition motif by development of pentavalent Neu5Ac containing molecules with radial topology to act as decoy receptors. This allowed us to study the potential of development of a general inhibitor targeting both these viruses. The developed compounds inhibited attachment of CVA24v and HAdVD37 to cells. Furthermore, we developed divalent Neu5Ac tools to validate if targeting the Neu5Acmediated attachment of CVA24v to cells were a potential target for antiviral drug discovery and development. The results from these studies indicate that development of a Neu5Ac-based antiviral targeting CVA24v looks bleak as the primary receptor utilized by this virus is ICAM-1. The work with developing Neu5Ac tools led to a side project with synthesis of 4-O-alkyl Neu5Ac analogs. In this project we provided a method to synthesize 4-O-alkyl analogs of Neu5Ac and gave insights into the scope of the reaction. This work could have have value in drug discovery. Targeting enterovirus uncoating is a well explored strategy for the inhibition of enterovirus infection. In this thesis, we synthezied novel branched probes of pleconaril (a well-known pocket binding molecule) to study if targeting the unique branched pocket of CVA24v could have potential as a target for antiviral drug discovery. Further experiments are needed to draw conclusions in regards to the future prospects of targeting this unique feature. At last, two novel classes of trivalent Neu5Ac conjugates were develop using a structure-based approach targeting HAdV-D37, -D36, and -D26. This led to a more potent compound towards HAdVD37 further validating that targeting the attachment of this virus to cells is a reasonable strategy for antiviral drug development. Towards HAdV-D26 the inhibitory effect was saturated at 50%, likely due to engagement of other receptors. Evaluation towards HAdV-D36 is currently ongoing. Structural biology studies, indicates the compounds bind to the viruses via chelation of their trimeric binding sites. Taken together, these compounds have potential to be used as chemical tools to study the biology of human adenoviruses and perhaps other Neu5Ac binding proteins. Titel på omslaget: Tailored conjugates of N-acetylneuraminic acid and small molecules that block virus attachment and entry
- Published
- 2021
Catalog
Discovery Service for Jio Institute Digital Library
For full access to our library's resources, please sign in.