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21 results on '"Jerome Enjalbert"'

3. Increasing intraspecific diversity of wheat affects plant nutrient contents but not N recovery in the plant-soil system

Author

Thomas Bécu, Sébastien Barot, Jean-Christophe Lata, Xavier Le Roux, Jérôme Enjalbert, and Audrey Niboyet

Subjects
Agroecology, Functional diversity, Intraspecific diversity, Nitrogen content, 15N recovery, Plant nutrient content, Ecology, QH540-549.5
Abstract

Crop homogenization in conventional agriculture has been pervasive while ecology has shown positive effects of biodiversity on ecosystem functioning, that arise from complementarity/facilitation and sampling/selection effects. These effects are well documented for interspecific diversity in both natural ecosystems and agroecosystems but remain less documented at an intraspecific level, particularly for the rates of nutrient uptake by plants and nutrient losses from ecosystems. We conducted a field experiment with 88 experimental plots cultivated with 1, 2, 4 or 8 wheat varieties and 1, 2, 3 or 4 functional groups to assess the effects of the number of varietal and functional diversity of winter wheat on plant biomass production, plant nutrient contents (N, Ca, Cu, Fe, Mg, Mn, P, K, Na and Zn) and fertilizer N recovery in the plant-soil system using a 15N labeling method. We found both negative and positive effects of the number of varieties or number of functional groups on shoot Cu, Fe, Zn, Na and P contents, but no significant effects of intraspecific diversity on biomass production, N content and 15N recovery in the plant-soil system. Our results show differential responses to an increase of intraspecific diversity of wheat on the contents of several essential nutrients in plants and highlight the need to jointly analyze multiple nutrients. Our study also suggests that increasing intraspecific diversity had no overall negative effects on biomass production or N content. Using knowledge on variety functional traits to target specific complementarity mechanisms when designing variety mixtures could thus lead to a positive effect on nutrient absorption and biomass production.

Published
2024
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4. New Stability Method of a Multirate Controller for a Three-Axis High- <tex-math notation='LaTeX'>$Q$ </tex-math> MEMS Accelerometer With Simultaneous Electrostatic Damping

Author

Jerome Enjalbert, Thierry Cassagnes, Lavinia E. Ciotirca, Hugues Beaulaton, Hélène Tap, Serdar Sahin, and Olivier D. Bernal

Subjects
Digital electronics, Signal processing, Coriolis force, Computer science, business.industry, 020208 electrical & electronic engineering, 010401 analytical chemistry, Open-loop controller, Electrical engineering, Gyroscope, 02 engineering and technology, Sensor fusion, Accelerometer, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, law.invention, Analog front-end, Transducer, Inertial measurement unit, Control theory, law, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, Electrical and Electronic Engineering, business, Instrumentation
Abstract

Over the past years, cutting-edge advances in electronics and microfabrication have allowed the integration of multiple sensors within integrated analog and digital circuits to design microelectromechanical systems. The multiple sensor integration or sensor fusion enables both cost and surface reduction, while maintaining high performances. This paper presents a new control system for an underdamped three-axis accelerometer, which allows the co-integration in the same cavity with a three-axis Coriolis gyroscope to design a six degrees-of-freedom combo sensor. The accelerometer analog front end consumes $300~\mu \text{A}$ from a 1.6V power supply and is able to reach its steady state in $800~\mu \text{s}$ compared with a 400ms open loop and no damping configuration. The transducer control is implemented using a simultaneous multirate electrostatic damping method. To conclude on the closed-loop system stability, an innovative approach based on the multirate signal processing theory has been developed.

Published
2018
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5. Progresser dans la simulation mathématique des performances des mélanges de variétés fourragères pour composer et améliorer les prairies

Author

Jean-Louis Durand, Bruno Andrieu, Romain Barillot, Philippe Barre, Didier Combes, Jerome Enjalbert, Abraham ESCOBAR GUTIERREZ, Lucas Faverjon, Christophe Lecarpentier, Isabelle Litrico, Gaëtan Louarn, Vincent Migault, Leopoldo Sanchez Rodriguez, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (AGPF), Climagie, Métaprogramme ACCAF, Jean-Louis Durand, Unité de recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (UAGPF), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, cutting rate, production de semences, grass, croissance végétale, drought, modèle, légumineuse, modèle de croissance, modelling, gazon, prairie multispécifique, espèce fourragère, mélange fourrager, rythme de coupe, intraspecific variability, sécheresse, modélisation, numerical models, sown pastures, système racinaire, mélange de variétés, prairie, graminée, legume, plant growth, prairie artificielle, simulation, mathematical simulation, turf grasses, simulation mathématique, growth model, forage mixture, seed production, cultivar breeding, variabilité intraspécifique, root system, grassland, sélection variétale
Abstract

Ce numéro de la revue Fourrages présente les résultats des travaux du projet Climagie du métaprogramme Adaptation au changement climatique de l'agriculture et de la forêt (ACCAF) de l'Inra; Les modélisateurs ont progressé dans la façon de simuler l'évolution de la production de fourrage au cours de l'exploitation de la prairie, en utilisant de nouveaux modèles numériques basés sur les réponses individuelles des composantes de la prairie aux variables du microclimat, notamment la température, l'eau et le rayonnement. Ces modèles individu-centrés permettent de simuler l'état et la croissance des talles et des ramifications individuelles pour la plupart des types de graminées et de légumineuses fourragères. Virtual Grassland est un modèle qui associe ainsi plusieurs espèces composant une prairie semée multispécifique et permettra de prendre en compte la variabilité intra-spécifique. Au-delà des cycles successifs de production végétative, et sur la base de modèles de céréales, ces nouveaux modèles simulent aussi la production individuelle de graines des plantes. Le couplage avec des approches de génétique quantitative appliquées aux caractères fonctionnels des plantes, permet de relier le fonctionnement écophysiologique du peuplement à la composition génétique de la génération suivante. Ces progrès ouvrent des perspectives d'applications en sélection et dans la rationalisation des mélanges variétaux préconisés pour les prairies semées pour adapter ces cultures au changement climatique.

Published
2016

6. L'innovation à l'épreuve d'un climat et d'un monde changeant rapidement : intérêt de la co-conception dans le domaine des semences

Author

Laurent Hazard, Arnaud Gauffreteau, Julie Borg, Marie-Hélène Moirez-Charron, Matthew Deo, Jerome Enjalbert, Vladimir Goutiers, Gressier, E., Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Association Vétérinaires Eleveurs du Millavois (AVEM), Climagie, Métaprogramme ACCAF, ANR O2LA (ANR-09-STRA-09), ANR Agrobiosphere (ANR-13-AGRO-0008-04), Mélibio, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Jean-Louis Durand

Subjects
agroecology, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, farmers' practices, agroécologie, agricultural development, environmental factor, pratiques des agriculteurs, mélange fourrager, fourrage, aide à la décision, prairie, forage, facteur milieu, innovation, méthode, approches participatives, forage mixture, développement agricole, participatory approaches, plant association, method, cultivar breeding, aid to decision, grassland, sélection variétale, association végétale, cultivar
Abstract

Ce numéro de la revue Fourrages présente les résultats des travaux du projet Climagie du métaprogramme Adaptation au changement climatique de l'agriculture et de la forêt (ACCAF) de l'Inra; Valoriser la biodiversité cultivée permet d'augmenter la résilience des cultures face aux aléas tout en réduisant l'utilisation des intrants chimiques. Implémenter une telle agriculture basée sur la biodiversité nécessite le développement d'approches de co-conception pour tenir compte de la singularité des situations locales et de la variabilité accrue des conditions de culture.La production agricole doit réduire l'usage des intrants à un moment où elle fait face aux effets du changement climatique. Or l'utilisation des intrants, si elle permet d'augmenter la production, tamponne également la variabilité spatiale et temporelle des conditions de culture, atténuant notamment les effets des aléas climatiques. L'utilisation d'une diversité d'espèces et de variétés, de populations génétiquement diversifiées constitue une alternative agroécologique à l'utilisation des intrants synthétiques. Le défi est alors de créer des innovations génétiques (variétés, mélanges des variétés, mélanges d'espèces) qui soient adaptées aux conditions locales. Cela nécessite donc de raisonner à l'échelle locale et d'impliquer l'utilisateur dans ce travail de conception de ces innovations. Nous verrons à travers la présentation de différents travaux de co-conception que travailler avec les acteurs de terrain permet (i) d'affiner les objectifs poursuivis et d'ainsi faire évoluer les questions de recherche et les critères d'évaluation des innovations, (ii) de produire des connaissances et des innovations adaptées aux usagers (idéotypage participatif d'associations variétales), (iii) de concevoir des outils leur permettant de créer leurs propres solutions (outil Capflor® d'aide à la conception de prairies à flore variée), ou (iv) d'accompagner le développement d'un programme de la sélection paysanne. Ces travaux rompent avec la logique du transfert de connaissances des chercheurs vers les agriculteurs au profit d'apprentissages croisés favorisant l'adaptation locale dans le processus d'innovation.

Published
2016

7. Increasing within-field diversity to foster agro-ecosystem services and cope with climate change

Author

Jerome Enjalbert, Xavier Le Roux, Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Dominique Descoureaux, Claude Pope de Vallavieille, Arnaud Gauffreteau, Isabelle Goldringer, Stephane Lemarié, Sébastien Saint-Jean, Emmanuelle Porcher, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Chambre d'Agriculture du Loir et Cher (CA 41), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Agronomie, Laboratoire d'Economie Appliquée = Grenoble Applied Economics Laboratory (GAEL), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Wheatamix Project, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) ( GQE-Le Moulon ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Chambre d'Agriculture du Loir et Cher ( CA 41 ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble ( GAEL ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Muséum National d’Histoire Naturelle ( MNHN ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble (GAEL), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)

Subjects
[ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Diversité génétique, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Variabilité génotypique, Couvert végétal, Association culturale, Triticum
Abstract

During the 20th century, agriculture experienced major gains in productivity via homogenization and intensive use of inputs. This model is jeopardized by the awareness of rapid global change, in particular climate change, and the need for greater agricultural sustainability. Crop genetic diversity should play an essential role in this context, as it could promote various ecosystem services essential for adaptation to climate change. Increasing within field diversity through the use of cultivar mixtures is a timely option, testified by with some significant “success stories” in the past. Despite the abundant bibliography demonstrating the interest of intra-specific crop diversity, cultivar mixtures are poorly developed worldwide. In this context, the WHEATAMIX project studies the interest of mixing wheat genotypes to reinforce the sustainability and resilience of agricultural production and the provision of various ecosystem services. Based on a highly multidisciplinary approach we analyze the interactions among genotypes and with the environment, to develop new methods for breeding and/or combining wheat varieties to obtain performing blends in a global change context. Complementary experimental approaches are being deployed: i) a main diversity experiment (Eighty- eight wheat plots with 1, 2, 4 or 8 varieties, under low input) to quantify over several years the variety diversity effects on ecosystem services; ii) replicates of the same diversity experiment in 4 sites across France, to test the robustness of wheat diversity effects under a wide range of soil and climate conditions; iii) a network of 50 farms, encompassing agro-climatic variability in the Paris basin, to compare the ecological and techno-economic performance of blends with that of monocultures, using direct links with key stakeholders. The first results provide a comprehensive characterization of the multiple ecosystem services provided by genetic diversity (yield stability; regulation of foliar diseases; insect pest and weed biocontrol; maintenance of soil fertility; biodiversity conservation), and the trade-offs and synergies that exist among ecosystem services. The result also guide the selection of variety mixtures and corresponding bundles of functional traits that can deliver particular groups of services to tackle the climate change issue.

Published
2015

8. Editorial: Breeding for intercropping

Author

Diego Rubiales, Jérôme Enjalbert, Pierre Hohmann, Niels P.R. Anten, and Martin Weih

Subjects
plant breeding, intercropping, selection, modelling, quantitative prediction, Plant culture, SB1-1110
Published
2023
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9. CLIMAGIE: a French INRA project to adapt grasslands to climate change

Author

Jean Louis Durand, Lina Qadir Ahmed, Bruno Andrieu, Philippe Barre, Didier Combes, Pablo Cruz, Marie-Laure Decau, Jerome Enjalbert, Abraham Escobar Gutierrez, Florian Fort, Ela FRAK, Marc Ghesquière, Francois Gastal, Isabelle Goldringer, Laurent Hazard, Claire Jouany, Bernadette Julier, Isabelle Litrico, Gaëtan Louarn, Frédéric Meuriot, Annette Bertrand, Catherine Picon-Cochard, Julien Pottier, Marie-Pascale Prud'Homme, Jean Paul Sampoux, Florence Volaire, Serge Zaka, Marine Zwicke, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), European Grassland Federation (EGF). CHE., AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)

Subjects
modelling, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, climate change, grasses, water status, legumes, grasslands, plant breeding, temperature
Abstract

absent

Published
2014

10. WHEATAMIX Project : Increasing within-field wheat diversity to foster ecosystem services in the Parisian basin

Author

Vincent Allard, Bruno Andrieu, Sébastien Barot, Julie Borg, Amélie Cantarel, Céline Cervek, François Coléno, Claude Pope de Vallavieille, Dominique Descoureaux, Florence Dubs, Jerome Enjalbert, Feret, M., Nathalie Galic, Arnaud Gauffreteau, Gilet, J. D., Isabelle Goldringer, Mourad Hannachi, Houivet, G., Sophie Pin, Marie-Helene Jeuffroy, Christian Kerbiriou, Pierre Labarthe, Jean Christophe Lata, Christophe Lecarpentier, Lejars, L., Lemain, B., Stephane Lemarié, Leny, F., Xavier Le Roux, Le Viol, M., Christophe Montagnier, Audrey Niboyet, Omond, B., Piaud, S., Franck Poly, Thomas Pommier, Emmanuelle Porcher, Sébastien Saint-Jean, Sandrine Salmon, Didier Tropee, Tiphaine Vidal, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Chambre Régionale d'Agriculture du Centre, Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), CA 41, Chambre d'Agriculture du Loir et Cher, France., Chambre d'Agriculture du Loir et Cher (CA 41), Chambre d'Agriculture de l'Indre (CA 36), Agronomie, FDGEDA Cher, Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Chambre d'Agriculture du Loiret, Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble (GAEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Chambre d'Agriculture de l'Eure (CA 27), Domaine expérimental de Versailles-Grignon (UEVG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Chambre d'Agriculture de la Seine et Marne, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES), Laboratoire d'Economie Appliquée = Grenoble Applied Economics Laboratory (GAEL), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Environnement et Grandes Cultures ( EGC ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) ( GQE-Le Moulon ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires ( SADAPT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Chambre d'Agriculture du Loir et Cher ( CA 41 ), Chambre d'Agriculture de l'Indre ( CA 36 ), Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation ( CESCO ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris ( IEES ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble ( GAEL ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Chambre d'Agriculture de l'Eure ( CA 27 ), Domaine expérimental de Versailles-Grignon ( UEVG ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ProdInra, Archive Ouverte, and Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )

Subjects
[SDE.MCG] Environmental Sciences/Global Changes, [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, triticum, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, région parisienne, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, service écosystémique, winter wheat
Abstract

WHEATAMIX Project : Increasing within-field wheat diversity to foster ecosystem services in the Parisian basin. 3. International Conference on Biodiversity and the UN Millennium Development Goals,Biodiversity and Food Security – From Trade-offs to Synergies

Published
2014

12. A highly recombinant and multi-parental MAGIC population for genetic mapping in wheat

Author

Stéphanie Thepot, Ian Mackay, Gwendal RESTOUX, Christine Dillmann, David Gouache, Jerome Enjalbert, Isabelle Goldringer, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Norwich Research Park, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), and AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

13. CLIMAGIE: A French INRA project to adapt the grasslands to climate change

Author

Jean-Louis Durand, Jerome Enjalbert, Laurent Hazard, Isabelle Litrico, Catherine Picon-Cochard, Marie-Pascale Prud'Homme, Florence Volaire, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Climagie métaprogramme ACCAF, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
Phenology, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Climate change, Plant productivity, prairie, programme de recherche scientifique, adaptation au changement climatique, stress hydrique, productivité fourragère, Milieux et Changements globaux, phénologie
Abstract

Climate change in France, central and southern Europe is expected to provoke more frequent and more intensesummer water deficits, with increased amplitude in temperatures, exposing the same perennial crops to frosts as well as to heat waves and severe droughts. The impacts on sown monospecific grasslands have been assessed using crop models (Durand et al. 2010) but with less accuracy in extreme situations. Since less work has been done on intraspecific genetic variability there is urgent need to investigate both ranges of climate conditions and genetic variability (Poirier et al. 2012). Phenology and plant productivity responses to water, temperature and nitrogen (N) in particular need to be re-assessed over the full range of temperatures projected in the future.

Published
2013

14. Genetic Architecture of Powdery Mildew Resistance Revealed by a Genome-Wide Association Study of a Worldwide Collection of Flax (Linum usitatissimum L.)

Author

Adrien Speck, Jean-Paul Trouvé, Jérôme Enjalbert, Valérie Geffroy, Johann Joets, and Laurence Moreau

Subjects
flax (Linum usitatissimum L.), GBS, genetic diversity, powdery mildew, genome wide association studies (GWAS), Plant culture, SB1-1110
Abstract

Powdery mildew is one of the most important diseases of flax and is particularly prejudicial to its yield and oil or fiber quality. This disease, caused by the obligate biotrophic ascomycete Oïdium lini, is progressing in France. Genetic resistance of varieties is critical for the control of this disease, but very few resistance genes have been identified so far. It is therefore necessary to identify new resistance genes to powdery mildew suitable to the local context of pathogenicity. For this purpose, we studied a worldwide diversity panel composed of 311 flax genotypes both phenotyped for resistance to powdery mildew resistance over 2 years of field trials in France and resequenced. Sequence reads were mapped on the CDC Bethune reference genome revealing 1,693,910 high-quality SNPs, further used for both population structure analysis and genome-wide association studies (GWASs). A number of four major genetic groups were identified, separating oil flax accessions from America or Europe and those from Asia or Middle-East and fiber flax accessions originating from Eastern Europe and those from Western Europe. A number of eight QTLs were detected at the false discovery rate threshold of 5%, located on chromosomes 1, 2, 4, 13, and 14. Taking advantage of the moderate linkage disequilibrium present in the flax panel, and using the available genome annotation, we identified potential candidate genes. Our study shows the existence of new resistance alleles against powdery mildew in our diversity panel, of high interest for flax breeding program.

Published
2022
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15. Mixture × Genotype Effects in Cereal/Legume Intercropping

Author

Dereje T. Demie, Thomas F. Döring, Maria R. Finckh, Wopke van der Werf, Jérôme Enjalbert, and Sabine J. Seidel

Subjects
cultivar combination, intercropping performance, mixture, mixing ability, trait combination, Plant culture, SB1-1110
Abstract

Cropping system diversification through annual intercropping provides a pathway for agricultural production with reduced inputs of fertilizer and pesticides. While several studies have shown that intercrop performance depends on the genotypes used, the available evidence has not been synthesized in an overarching analysis. Here, we review the effects of genotypes in cereal/legume intercropping systems, showing how genotype choice affects mixture performance. Furthermore, we discuss the mechanisms underlying the interactions between genotype and cropping system (i.e., sole cropping vs. intercropping). Data from 69 articles fulfilling inclusion criteria were analyzed, out of which 35 articles reported land equivalent ratio (LER), yielding 262 LER data points to be extracted. The mean and median LER were 1.26 and 1.24, respectively. The extracted genotype × cropping system interaction effects on yield were reported in 71% out of 69 publications. Out of this, genotype × cropping system interaction effects were significant in 75%, of the studies, whereas 25% reported non-significant interactions. The remaining studies did not report the effects of genotype × cropping system. Phenological and morphological traits, such as differences in days to maturity, plant height, or growth habit, explained variations in the performance of mixtures with different genotypes. However, the relevant genotype traits were not described sufficiently in most of the studies to allow for a detailed analysis. A tendency toward higher intercropping performance with short cereal genotypes was observed. The results show the importance of genotype selection for better in cereal/legume intercropping. This study highlights the hitherto unrevealed aspects of genotype evaluation for intercropping systems that need to be tackled. Future research on genotype effects in intercropping should consider phenology, root growth, and soil nutrient and water acquisition timing, as well as the effects of weeds and diseases, to improve our understanding of how genotype combination and breeding may help to optimize intercropping systems.

Published
2022
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16. Functional–Structural Plant Modeling Highlights How Diversity in Leaf Dimensions and Tillering Capability Could Promote the Efficiency of Wheat Cultivar Mixtures

Author

Emmanuelle Blanc, Pierre Barbillon, Christian Fournier, Christophe Lecarpentier, Christophe Pradal, and Jérôme Enjalbert

Subjects
aerial architecture, competition for light, variety mixture, sensitivity analysis, functional traits, tillering plasticity, Plant culture, SB1-1110
Abstract

Increasing the cultivated diversity has been identified as a major leverage for the agroecological transition as it can help improve the resilience of low input cropping systems. For wheat, which is the most cultivated crop worldwide in terms of harvested area, the use of cultivar mixtures is spreading in several countries, but studies have seldom focused on establishing mixing rules based on plant architecture. Yet, the aerial architecture of plants and the overall canopy structure are critical for field performance as they greatly influence light interception, plant interactions and yield. The very high number of trait combinations in wheat mixtures makes it difficult to conduct experimentations on this issue, which is why a modeling approach appears to be an appropriate solution. In this study, we used WALTer, a functional structural plant model (FSPM), to simulate wheat cultivar mixtures and try to better understand how differences between cultivars in key traits of the aerial architecture influence mixture performance. We simulated balanced binary mixtures of cultivars differing for different critical plant traits: final height, leaf dimensions, leaf insertion angle and tillering capability. Our study highlights the impact of the leaf dimensions and the tillering capability on the performance of the simulated mixtures, which suggests that traits impacting the plants' leaf area index (LAI) have more influence on the performance of the stand than traits impacting the arrangement of the leaves. Our results show that the performance of mixtures is very variable depending on the values of the explored architectural traits. In particular, the best performances were achieved by mixing cultivars with different leaf dimensions and different tillering capability, which is in agreement with numerous studies linking the diversity of functional traits in plant communities to their productivity. However, some of the worst performances were also achieved by mixing varieties differing in their aerial architecture, which suggests that diversity is not a sufficient criterion to design efficient mixtures. Overall, these results highlight the importance of simulation-based explorations for establishing assembly rules to design efficient mixtures.

Published
2021
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17. Advances in Breeding for Mixed Cropping – Incomplete Factorials and the Producer/Associate Concept

Author

Benedikt Haug, Monika M. Messmer, Jérôme Enjalbert, Isabelle Goldringer, Emma Forst, Timothée Flutre, Tristan Mary-Huard, and Pierre Hohmann

Subjects
mixed cropping, intercropping, breeding, general mixing ability, producer/associate concept, incomplete factorial design, Plant culture, SB1-1110
Abstract

Mixed cropping has been suggested as a resource-efficient approach to meet high produce demands while maintaining biodiversity and minimizing environmental impact. Current breeding programs do not select for enhanced general mixing ability (GMA) and neglect biological interactions within species mixtures. Clear concepts and efficient experimental designs, adapted to breeding for mixed cropping and encoded into appropriate statistical models, are lacking. Thus, a model framework for GMA and SMA (specific mixing ability) was established. Results of a simulation study showed that an incomplete factorial design combines advantages of two commonly used full factorials, and enables to estimate GMA, SMA, and their variances in a resource-efficient way. This model was extended to the Producer (Pr) and Associate (As) concept to exploit additional information based on fraction yields. It was shown that the Pr/As concept allows to characterize genotypes for their contribution to total mixture yield, and, when relating to plant traits, allows to describe biological interaction functions (BIF) in a mixed crop. Incomplete factorial designs show the potential to drastically improve genetic gain by testing an increased number of genotypes using the same amount of resources. The Pr/As concept can further be employed to maximize GMA in an informed and efficient way. The BIF of a trait can be used to optimize species ratios at harvest as well as to extend our understanding of competitive and facilitative interactions in a mixed plant community. This study provides an integrative methodological framework to promote breeding for mixed cropping.

Published
2021
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18. Mélanges variétaux et mélanges plurispécifiques – atouts et contraintes

Author

Jerome Enjalbert, Isabelle Litrico, Elisabeth Fournier, Safia Médiène, Arnaud Gauffreteau, Julie Borg, Guenaelle Hellou, Isabelle Goldringer, Hanachi, M., Etienne-Pascal Journet, Eric Justes, Jean-Benoit Morel, Naudin, C., Hervé Sanguin, Muriel Morison, Valentin Verret, Laurent Bedoussac, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite (UMR BGPI), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SFR UA 4207 QUAlité et SAnté du Végétal (QUASAV), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Nantes (UN)-AGROCAMPUS OUEST-Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Laboratoire d'Expertise et de Validation des Applications combustibles multi-filières (LEVA), Service d'Etudes de Simulation du Comportement du combustibles (SESC), Département d'Etudes des Combustibles (DEC), CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Département d'Etudes des Combustibles (DEC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Nantes (UN)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Université de Nantes (UN)-AGROCAMPUS OUEST-Université d'Angers (UA)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, biodiversité cultivée, F08 - Systèmes et modes de culture, agroécologie, interaction GxE, interactions plante-plante, biodiversité, blé, diversité intra et interspécifique, Agriculture durable, mélange variétal, Triticum, riz, Oryza, Agricultural sciences, Rendement des cultures, Agroécosystème, Diversification, Système de culture, P01 - Conservation de la nature et ressources foncières, Culture associée, Sciences agricoles, Agroecology
Abstract

article issus du colloque « Biodiversité et durabilité des agricultures » qui s’est tenu à Paris le 11 avril 2019https://www6.inra.fr/ciag/CIAg-Environnement/Biodiversite-et-agricultures; Pour réduire les impacts négatifs des systèmes agricoles, la transition agroécologique appelle en premier lieu à l’utilisation d’une plus grande biodiversité cultivée. Une telle diversification peut être conduite à l'échelle de la parcelle, en associant différentes espèces, ou différentes variétés d'une même espèce. Nous abordons les avantages de cette diversification intra-parcellaire, en développant 5 exemples : (1) les mélanges variétaux de blé en France, (2) les populations de riz au YuanYang, (3) le colza associé à des plantes de services, (4) les mélanges d’espèces fourragères et (5) les associations céréales-légumineuses à graines. Nous discutons des avantages conférés par cette diversification sur : (i) l’optimisation et la stabilisation des productions, (ii) les interactions avec les pratiques culturales, (iii) la sélection variétale, et (iv) l’impact de ces peuplements et pratiques sur la biodiversité sauvage associée.

19. Structure spatio-temporelle de la diversité cultivée du blé tendre et de ses déterminants potentiels : Étude de cas en France

Author

Rémi Perronne, David Makowski, Céline Schott, Mourad Hannachi, Robin Goffaux, Pierre Montalent, Jean-Noel Aubertot, Vincent Cellier, Stephane Lemarié, Aline Fugeray-Scarbel, Claude Pope de Vallavieille, Marc Leconte, Jerome Enjalbert, Juan Fernández-Manjarrés, Marie Stetzler, Solene Diguet, Nicolas Poulain, Isabelle Goldringer, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agronomie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Fondation pour la recherche sur la Biodiversité (FRB), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Domaine expérimental d'Époisses - UE0115 U2E (DIJ EPOISSES), Laboratoire d'Economie Appliquée de Grenoble (GAEL), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Picardie Jules Verne (UPJV). Amiens, FRA., ANR-11-IDEX-0003,IPS,Idex Paris-Saclay(2011), European Project: 633571,H2020,H2020-SFS-2014-2,DIVERSIFOOD(2015), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)

Subjects
blé tendre, variété, agriculture durable, [SDV]Life Sciences [q-bio], diversité, assolement, résilience des agros-écosystèmes, service écosystémique, système de culture, filière, pression pathogène, [SHS]Humanities and Social Sciences, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

20. Origin, migration routes and worldwide population genetic structure of the wheat yellow rust pathogen Puccinia striiformis f.sp. tritici.

Author

Sajid Ali, Pierre Gladieux, Marc Leconte, Angélique Gautier, Annemarie F Justesen, Mogens S Hovmøller, Jérôme Enjalbert, and Claude de Vallavieille-Pope

Subjects
Immunologic diseases. Allergy, RC581-607, Biology (General), QH301-705.5
Abstract

Analyses of large-scale population structure of pathogens enable the identification of migration patterns, diversity reservoirs or longevity of populations, the understanding of current evolutionary trajectories and the anticipation of future ones. This is particularly important for long-distance migrating fungal pathogens such as Puccinia striiformis f.sp. tritici (PST), capable of rapid spread to new regions and crop varieties. Although a range of recent PST invasions at continental scales are well documented, the worldwide population structure and the center of origin of the pathogen were still unknown. In this study, we used multilocus microsatellite genotyping to infer worldwide population structure of PST and the origin of new invasions based on 409 isolates representative of distribution of the fungus on six continents. Bayesian and multivariate clustering methods partitioned the set of multilocus genotypes into six distinct genetic groups associated with their geographical origin. Analyses of linkage disequilibrium and genotypic diversity indicated a strong regional heterogeneity in levels of recombination, with clear signatures of recombination in the Himalayan (Nepal and Pakistan) and near-Himalayan regions (China) and a predominant clonal population structure in other regions. The higher genotypic diversity, recombinant population structure and high sexual reproduction ability in the Himalayan and neighboring regions suggests this area as the putative center of origin of PST. We used clustering methods and approximate Bayesian computation (ABC) to compare different competing scenarios describing ancestral relationship among ancestral populations and more recently founded populations. Our analyses confirmed the Middle East-East Africa as the most likely source of newly spreading, high-temperature-adapted strains; Europe as the source of South American, North American and Australian populations; and Mediterranean-Central Asian populations as the origin of South African populations. Although most geographic populations are not markedly affected by recent dispersal events, this study emphasizes the influence of human activities on recent long-distance spread of the pathogen.

Published
2014
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21. Multiple infections by the anther smut pathogen are frequent and involve related strains.

Author

Manuela López-Villavicencio, Odile Jonot, Amélie Coantic, Michael E Hood, Jérôme Enjalbert, and Tatiana Giraud

Subjects
Immunologic diseases. Allergy, RC581-607, Biology (General), QH301-705.5
Abstract

Population models of host-parasite interactions predict that when different parasite genotypes compete within a host for limited resources, those that exploit the host faster will be selected, leading to an increase in parasite virulence. When parasites sharing a host are related, however, kin selection should lead to more cooperative host exploitation that may involve slower rates of parasite reproduction. Despite their potential importance, studies that assess the prevalence of multiple genotype infections in natural populations remain rare, and studies quantifying the relatedness of parasites occurring together as natural multiple infections are particularly scarce. We investigated multiple infections in natural populations of the systemic fungal plant parasite Microbotryum violaceum, the anther smut of Caryophyllaceae, on its host, Silene latifolia. We found that multiple infections can be extremely frequent, with different fungal genotypes found in different stems of single plants. Multiple infections involved parasite genotypes more closely related than would be expected based upon their genetic diversity or due to spatial substructuring within the parasite populations. Together with previous sequential inoculation experiments, our results suggest that M. violaceum actively excludes divergent competitors while tolerating closely related genotypes. Such an exclusion mechanism might explain why multiple infections were less frequent in populations with the highest genetic diversity, which is at odds with intuitive expectations. Thus, these results demonstrate that genetic diversity can influence the prevalence of multiple infections in nature, which will have important consequences for their optimal levels of virulence. Measuring the occurrence of multiple infections and the relatedness among parasites within hosts in natural populations may be important for understanding the evolutionary dynamics of disease, the consequences of vaccine use, and forces driving the population genetic structure of parasites.

Published
2007
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