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Résumé; Allis shad (Alosa alosa) populations showed important decline among last decades, and it is assumed that the species' distribution area has restricted. In some watersheds, the status of the species is preocupating, however this remains poorly explained. In the Gironde-Garonne-Dordogne system (SW France), its decline leads to the adoption of a fishery moratorium in 2008. Despite this measure, local populations don't show signs of a recovering. One hypothesis consists in the unefficiency of the recruitment process: indeed, young-of-the-year Allis shad are exposed to many pressures during their downstream migration, such as hypoxia (low water oxygen concentration). In the Gironde estuary, hypoxic events are frequent in summertime, and can consist in episodes of several days with water O2 saturations under 30%. In addition, hypoxic events are thought to be even more severe and frequent in the future, according to most of climate change scenarios. Such low O2 availability could threaten young Allis shad, and as a consequence, this could condition their migration success. To our knowledge, if authors have suggested that 3-months old Allis shad show lower resistance to hypoxia at higher temperature, the abilities of younger developmental stages (larval and migrating stages) have never been studied. Here we meant to describe tolerance range of 10, 30, 60 and 90-days old Allis shad to oxythermic stress, by conducting behavioural analysis at individual scale in decreasing water oxygen saturation conditions (from 100 to 30%), at temperatures 18, 22, or 26°C. By this study, we aimed to bring useful information on the importance of oxythermic conditions for Allis shad in both larvae reintroduction purposes and juvenile migration success.

Résumé; Allis shad (Alosa alosa) populations have shown an important decline throughout thelast few decades, and it is assumed that the species’ distribution area has been restricted. In the Gironde-GaronneDordogne system (GGD, SW France), its decline leads to the adoption of a fishery moratorium in 2008. Despite this measure, locally no signs of recovery are observed. One hypothesis consists of the inefficiency of the recruitment process: young-of-the-year Allis shad are exposed to many pressures during their downstream migration, such as hypoxia. In the GGD system, hypoxic events are frequent in summertime (periods of several days with water O2 saturations under 30%). Those events are thought to become more severe andfrequent according to most climate change scenarios. Such low O2 availability could threaten young Allis shadby altering their migration success. If authors have suggested that 3-months old Allis shad show lower resistance to hypoxia at highertemperature, the abilities of younger development stages have never been studied. Here we meant to describe tolerance range of 10, 30, 60 and 90-days oldAllis shad to oxythermic stress by conducting behavioural analysis at an individual scale in decreasing water oxygen saturation conditions (from 100 to 30%), at four temperatures (18, 22, 26°C for 10, 30 days-old ; 22, 26, 28°C for 60, 90 days-old). By this study, we aimed to bring useful information on the importance of oxythermic conditions for Allis shad in both larvae reintroduction purposes and juvenile migration success

International audience; This presentation defines what an ex-situ stock is and when it can be useful. After presenting the French and German cases concerning the special case of the European sturgeon, the main advantages, constraints and associated risks are listed.

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the first assessment of quality of cryopreserved sperms; a synthesis on the quality of the male gametes; the set up and first developments of a genetic tool for parental assignment, the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions.The season started on May 2nd with the pre-selection of the breeders. No females were found fit for breeding. From the ultrasonography, 6 males were selected and placed in Sturio 1. Only one male gave sperm whose quality improved between the two sampling periods. But this good quality sperm was not frozen due to the very low concentration of spermatozoa.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des premières estimations de la qualité des spermes congelés ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; les perspectives d'application des avancées en génétique au programme de conservation, le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. La saison a débuté le 2 mai avec les pré-sélections des géniteurs. Aucune femelle n'a été jugée apte pour les reproductions. A partir des échographies, 6 mâles ont été sélectionnés et placés dans Sturio 1. Un seul mâle a donné du sperme dont la qualité s'est améliorée entre les 2 prélèvements. Mais ce sperme de bonne qualité n'a pas été congelé du fait de la très faible concentration en spermatozoïdes.

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the first assessment of quality of cryopreserved sperms; a synthesis on the quality of the male gametes; the set up and first developments of a genetic tool for parental assignment, the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions.The season started on May 2nd with the pre-selection of the breeders. No females were found fit for breeding. From the ultrasonography, 6 males were selected and placed in Sturio 1. Only one male gave sperm whose quality improved between the two sampling periods. But this good quality sperm was not frozen due to the very low concentration of spermatozoa.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des premières estimations de la qualité des spermes congelés ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; les perspectives d'application des avancées en génétique au programme de conservation, le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. La saison a débuté le 2 mai avec les pré-sélections des géniteurs. Aucune femelle n'a été jugée apte pour les reproductions. A partir des échographies, 6 mâles ont été sélectionnés et placés dans Sturio 1. Un seul mâle a donné du sperme dont la qualité s'est améliorée entre les 2 prélèvements. Mais ce sperme de bonne qualité n'a pas été congelé du fait de la très faible concentration en spermatozoïdes.

The Allis Shad population experiences a strong decline in the Garonne - Dordogne basin. A problem of recruitment was identified. The first studies showed, in certain conditions, the negative effect of abiotic factors (temperature, oxygen), but they cannot account alone for the weakness of the cohorts sampled in estuary. The general objective of this study is to improve our knowledge on the downstream migration phase. In this context it seems necessary to determine the respective part of each of the rivers in the natural juvenile production. From 2013, experimental samplings were realized from June till October in the downstream part of the Garonne and the Dordogne Rivers, with the cooperation of a professional fisherman. The 2017 season was marked by a very low number of catches (186) and the absence of allis shad. The synthesis of the data on the study as a whole highlights 3 points in particular. Maintaining oxygen levels is a point of vigilance, because during some campaigns the levels are on the limit of tolerance for juveniles of allis shad. The capture of large individuals at the beginning of the season suggests that some of the recruits remain in fresh water during the first year. The distinction between the 2 species is possible up to a limit size of 33 mm in standard length.; La population de grande alose est fort déclin dans le bassin Garonne - Dordogne. Un défaut de recrutement a été identifié. Les premières études ont montrés, dans certaines conditions, l'effet négatif de facteurs abiotiques (température, oxygène), mais n'expliquant pas à eux seuls la faiblesse des cohortes échantillonnées en estuaire. L'objectif général de cette étude est d'améliorer nos connaissances sur la phase de dévalaison. Dans ce cadre il apparait nécessaire de déterminer la part respective de chacun des fleuves dans la production naturelle d'alosons. Depuis 2013, des pêches d'échantillonnage ont été réalisées de juin à octobre dans la partie aval des fleuves Garonne et Dordogne, avec le concours d'un pêcheur professionnel. La saison 2017 a été marquée par le très faible nombre de captures (186) et l'absence de grande alose. La synthèse des données sur l'ensemble l'étude met notamment en exergue 3 points. Le maintien des niveaux d'oxygène est un point de vigilance, car lors de certaines campagnes les niveaux sont en limite de tolérance pour les juvéniles de grande alose. La capture d'individus de grande taille en début de saison laisse supposer qu'une partie des recrues restent en eau douce durant la première année. La distinction entre les 2 espèces est possible jusqu'à une taille limite de 33 mm en longueur standard.

International audience; The potential effects of global warming on the allis shad population were tested by combining a time series of spawning acts with expected thermal survival rates for embryos and larvae until 14 days post hatching. The yearly mean survival of spawn for each reproductive season was calculated and an index of reproductive efficiency based on this survival rate was proposed. The randomness of the spawning tactics was evaluated by shuffling the spawn acts time series. This approach was applied to the Gironde-Garonne-Dordogne (south-west France) population, which recently collapsed. The yearly mean thermal survival of spawn is slightly variable at approximately 55% over 2003

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the first assessment of quality of cryopreserved sperms; a synthesis on the quality of the male gametes; the set up and first developments of a genetic tool for parental assignment, the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions. The season started on May 3rd with the pre-selections of the broodstock. No females were found suitable for breeding. Evertheless semen was frozen. The latest genetic results show the practical applications of this knowledge and tools for the species restoration program, particularly in terms of crossbreeding, detection of potential hybridization with Atlantic sturgeon. Work carried out on the population in the natural environment showed an increase in catches compared to 2016. They have also confirmed the arrival near the French coast of large individuals, suggesting the maturation of future spawners.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des premières estimations de la qualité des spermes congelés ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; les perspectives d'application des avancées en génétique au programme de conservation, le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. La saison a débuté le 3 mai avec les pré-sélections des géniteurs. Aucune femelle n'a été jugée apte pour les reproductions. Néanmoins du sperme a été congelé. Les derniers résultats en génétique montrent les applications pratiques de ces connaissances et outils pour le programme de restauration de l'espèce, notamment en matière de croisement, détection d'hybridation potentielle avec l'esturgeon Atlantique. Les travaux effectués sur la population en milieu naturel ont montré une augmentation des captures par rapport à 2016. Ils ont également permis de confirmer l'arrivée près des côtes françaises, d'individus de grande taille, laissant présager l'arrivée à maturation de futurs géniteurs.

International audience

International audience; Importance of monitoring methods in a restoration program: case study on Acipenser sturio sustained population.

The Allis Shad population experiences a strong decline in the Garonne - Dordogne basin. A problem of recruitment was identified. The first studies showed, in certain conditions, the negative effect of abiotic factors (temperature, oxygen), but they cannot account alone for the weakness of the cohorts sampled in estuary. The general objective of this study is to improve our knowledge on the downstream migration phase. In this context it seems necessary to determine the respective part of each of the rivers in the natural juvenile production. From 2013, experimental samplings were realized from June till September in the downstream part of the Garonne and the Dordogne Rivers, with the cooperation of a professional fisherman. In 2016, catches were balanced between the two rivers, and reached 1095 individuals. Only one allis shad was caught in the Dordogne River. Small individuals which cannot be determined with the gill raker criteria represented the majority of the catches (90%).; La population de grande alose est fort déclin dans le bassin Garonne - Dordogne. Un défaut de recrutement a été identifié. Les premières études ont montrés, dans certaines conditions, l'effet négatif de facteurs abiotiques (température, oxygène), mais n'expliquant pas à eux seuls la faiblesse des cohortes échantillonnées en estuaire. L'objectif général de cette étude est d'améliorer nos connaissances sur la phase de dévalaison. Dans ce cadre il apparait nécessaire de déterminer la part respective de chacun des fleuves dans la production naturelle d'alosons. Depuis 2013, des pêches d'échantillonnage ont été réalisées de juin à septembre dans la partie aval des fleuves Garonne et Dordogne, avec le concours d'un pêcheur professionnel. Au cours de la saison 2016, 1 095 alosons ont été capturés avec une répartition équilibrée entre les 2 fleuves. Une seule vague de migration a été détectée en juillet sur chacun des fleuves. L'année 2016 a été marquée par la quasi absence de grande alose, un seul spécimen ayant été capturé en Dordogne. Les individus de petite taille et donc indéterminés selon le critère branchiospine, représentent la majorité des captures (90 %).

The Allis Shad population experiences a strong decline in the Garonne - Dordogne basin. A problem of recruitment was identified. The first studies showed, in certain conditions, the negative effect of abiotic factors (temperature, oxygen), but they cannot account alone for the weakness of the cohorts sampled in estuary. The general objective of this study is to improve our knowledge on the downstream migration phase. In this context it seems necessary to determine the respective part of each of the rivers in the natural juvenile production. From 2013, experimental samplings were realized from June till September in the downstream part of the Garonne and the Dordogne Rivers, with the cooperation of a professional fisherman. In 2016, catches were balanced between the two rivers, and reached 1095 individuals. Only one allis shad was caught in the Dordogne River. Small individuals which cannot be determined with the gill raker criteria represented the majority of the catches (90%).; La population de grande alose est fort déclin dans le bassin Garonne - Dordogne. Un défaut de recrutement a été identifié. Les premières études ont montrés, dans certaines conditions, l'effet négatif de facteurs abiotiques (température, oxygène), mais n'expliquant pas à eux seuls la faiblesse des cohortes échantillonnées en estuaire. L'objectif général de cette étude est d'améliorer nos connaissances sur la phase de dévalaison. Dans ce cadre il apparait nécessaire de déterminer la part respective de chacun des fleuves dans la production naturelle d'alosons. Depuis 2013, des pêches d'échantillonnage ont été réalisées de juin à septembre dans la partie aval des fleuves Garonne et Dordogne, avec le concours d'un pêcheur professionnel. Au cours de la saison 2016, 1 095 alosons ont été capturés avec une répartition équilibrée entre les 2 fleuves. Une seule vague de migration a été détectée en juillet sur chacun des fleuves. L'année 2016 a été marquée par la quasi absence de grande alose, un seul spécimen ayant été capturé en Dordogne. Les individus de petite taille et donc indéterminés selon le critère branchiospine, représentent la majorité des captures (90 %).

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the assisted reproductions; a synthesis on the quality of the male gametes; the set up and first developments of a genetic tool for parental assignment, the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions. The reproduction season began on 13 April with pre-selections of spawners, but no reproduction was obtained. Nevertheless sperm was cryopreserved. The work done in genetics has helped to develop a reliable and accurate method of parental assignment and useful for the choice of crossings to be performed. Work on the population in the natural environment has allowed to refine the knowledge on the diet of juveniles in the estuary. An important work has also been done to build a database.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des essais de reproductions assistées ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; la mise au point et les premières applications d'un outil génétique d'assignation parentale, le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. La saison de reproduction a débutée le 13 avril avec les pré-sélections des géniteurs. Les tentatives de reproduction assistée n'ont pas permis d'obtenir d'ovulation. Néanmoins du sperme a été congelé. Les travaux menés en génétique ont permis de mettre au point une méthode fiable et précise d'assignation parentale et utile pour le choix des croisements à effectuer. Les travaux effectués sur la population en milieu naturel ont permis d'affiner les connaissances sur le régime alimentaire des juvéniles en estuaire. Un important travail a également été réalisé pour la construction d'une base de données.

Objectifs : suivre l'état de la population, documenter l'évolution des différentes cohortes, analyser l'intégration des poissons issus de reproductions ex situ et renseigner les captures accidentelles.

International audience; Post release monitoring strategies for Acipenser sturio in France.

Le terme de reproduction sturio regroupe un ensemble d'actions, multiples, parfois complexes, allant de la préparation du matériel à l'élevage des larves. C'est pourquoi il est apparu nécessaire de transcrire toutes ces actions dans des fiches au format qualité afin de standardiser les méthodes de travail. Ces fiches sont apparues d'autant plus nécessaires dans le cadre du transfert de compétences à l'Association Migado. La procédure qualité répond à certaines règles de nomenclature : Les procédures - numérotation 1xx - présentation générale d'un ensemble de modes opératoires nécessaires pour atteindre l'objectif de la procédure ; Les modes opératoires - numérotation 4xx - regroupe différentes instructions ; Instructions - numérotation 7xx - correspond à la description détaillé d'une action particulière ; La procédure Reproduction sturio regroupe différentes actions et interventions qui s'échelonnent dans le temps. Elles sont regroupées en 5 grandes étapes (ou modes opératoires), classés chronologiquement. Chaque mode opératoire regroupe plusieurs instructions correspondant à des actions ou interventions unitaires. Certaines actions peuvent être réalisées plusieurs fois et se retrouver dans plusieurs modes opératoires. Ce premier travail qui a consisté à mettre à jour quelques instructions existantes, rédiger de nouvelles instructions, les modes opératoires, regrouper, harmoniser et organiser l'ensemble dans un document homogène, n'est qu'une étape. Certaines fiches sont en cours de finalisation et ne figurent pas dans ce document. Ces documents sont appelés à évoluer, s'enrichir des remarques des utilisateurs, à être compléter par de nouvelles instructions.

International audience; The aims of this study are to continue the stocking of Allis shad, Alosa alosa, in the Rhine initiated in 2007 and to improve knowledge on the population of Gironde-Garonne-Dordogne to save and restore it. In the beginning of the 20th century, the Allis shad population of the Rhine suffered from overexploitation, pollution and habitat partitioning. However, in recent decades, the environmental situation has improved and populations have increased. In 2007, LIFE Shad project was launched to reintroduce the Allis shad on the Rhine from the population of Gironde-Garonne-Dordogne, which at the time was the largest population. Adult shads in upstream migration were caught on the Garonne and the Dordogne, and bred ex-situ. Produced larvae were released on the Rhine. In 2011, this supplemental program was continued to increase stocks as well as further studies to help manage the population. The Irstea, Aquarium, La Rochelle and Borea Team developed ex-situ rearing methods for Allis shad, and the monitoring of sexual maturation. Rearing facilities and husbandry techniques developed are presented. The results in terms of survival, growth, sexual maturation monitoring and observed pathologies are included.

National audience; Cette étude a été réalisée de 2011 à 2016 dans le cadre du projet Européen Life+ « conservation et restauration de la Grande Alose dans les bassins du Rhin et de la Gironde ». L’objectif des travaux menés par l’IRSTEA Bordeaux, l’Aquarium de La Rochelle, et BOREA, était la mise au point pour la 1ère fois de l ’élevage ex situ de juvéniles de grande alose Alosa alosa, et le suivi de leur croissance et de leur maturation sexuelle, dans le but d’obtenir des géniteurs en captivité, cette espèce étant classée en danger au niveau Européen. Une vingtaine d’aloses a été échantillonnée chaque année, de l’âge de 1 à 4 ans. En plus des paramètres biométriques, l’étude histologique des gonades a été réalisée, avec en parallèle des dosages immuno-enzymatiques (ELISA) des stéroïdes sexuels plasmatiques, afin de suivre l’évolution du développement gonadique.

International audience; Post release monitoring strategies for Acipenser sturio in France.

International audience; Cette présentation synthétise les résultats des effets des contaminants organiques et minéraux présents sur les frayères et évalue la tolérance oxy-thermique des embryons et jeunes larves

This report presents works managed by Irstea, Aquarium La Rochelle and Borea Team concerning the setup of an ex situ rearing method for juveniles Allis shads Alosa alosa, and the monitoring of sexual maturation. It presents in a first part the rearing structures, the conditions of breeding and the feeding. The results in terms of survival, growth and the observed pathologies are then presented. The last part presents the results of the sexual maturation monitoring. At the end of this 4 years-experiment the survival is 10 %. Very strong mortalities were recorded in the beginning of the rearing following the appearance of a cyst near the mouth. During the second year, a "nephrocalcinosis" was detected which also induced a strong mortality. Besides the direct mortalities, these pathologies caused delayed mortalities which were difficult to quantify. The results of growth show a smaller mean size and weight of 4 years-old fish compared to wild fish. A balanced sex ratio was observed within fish sampled. Five spermating males and one female with advanced maturation were recorded at 4 years-old. These results demonstrate for the first time, the ability to obtain matured allis shads in captivity, which represents a great interest in the framework of the reintroduction plan of this species.; Ce rapport présente les travaux conduits par Irstea, Aquarium La Rochelle et l’équipe Borea dans le cadre de la mise au point d’une méthode d’élevage ex situ de juvéniles de grande alose Alosa alosa et du suivi de la maturation sexuelle. Il présente dans une première partie les structures utilisées, les conditions d’élevage et l’alimentation. Les résultats de l’élevage en termes de survie, de croissance et de pathologies observées sont ensuite détaillés. La dernière partie expose les résultats du suivi de la maturation sexuelle. A la fin des 4 ans d’expérimentation la survie est de 10%. De très fortes mortalités ont été enregistrées en début d’élevage suite à l’apparition d’un kyste près de la bouche. Au cours de la deuxième année, une « néphrocalcinose » a été détectée qui a également engendré une forte mortalité. En plus des mortalités directes, ces pathologies ont induit des mortalités différées difficilement quantifiables. Les résultats de croissance montrent que les poissons de 4 ans ont une taille et un poids moyens inférieurs à des poissons sauvages. Un sexe ratio équilibré a été observé parmi les poisons échantillonnés. Cinq mâles spermiant et une femelle avec une maturation avancée ont été détectés chez les poissons âgés de 4 ans. Ces résultats montrent pour la première fois, qu’il est possible d’obtenir des grandes aloses matures en captivité, ce qui est un résultat majeur dans le cadre de la réintroduction de cette espèce dans le bassin du Rhin.

Synthèse des actions de communication recueillies en 2015 par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions.

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the assisted reproductions; a synthesis on the quality of the male gametes; the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions. New developments have been made in 2015. The most important concerned the Sturio 1 building, with the setting up of the tanks dedicated to the reproduction purposes. The reproduction season began on 11 May with pre-selections of spawners. Reproduction attempts were realized from 17 June to 22 July, but all efforts remained unsuccessful.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des essais de reproductions assistées ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. De nouveaux aménagements ont été réalisés en 2015. Les plus importants ont concernés le bâtiment Sturio 1, avec la fin de l'aménagement des bacs destinés à la reproduction. La saison de reproduction a débutée le 11 mai avec les pré-sélections des géniteurs. Les tentatives de reproduction assistée se sont déroulées du 17 juin au 22 juillet. Malgré tous les efforts déployés, aucune ovulation n'a été obtenue.

Synthèse des opérations de reproduction et des aménagements réalisés en 2015.

This report presents works managed by Irstea, Aquarium La Rochelle and Borea Team concerning the setup of an ex situ rearing method for juveniles Allis shads Alosa alosa, and the monitoring of sexual maturation. It presents in a first part the rearing structures, the conditions of breeding and the feeding. The results in terms of survival, growth and the observed pathologies are then presented. The last part presents the results of the sexual maturation monitoring. At the end of this 4 years-experiment the survival is 10 %. Very strong mortalities were recorded in the beginning of the rearing following the appearance of a cyst near the mouth. During the second year, a "nephrocalcinosis" was detected which also induced a strong mortality. Besides the direct mortalities, these pathologies caused delayed mortalities which were difficult to quantify. The results of growth show a smaller mean size and weight of 4 years-old fish compared to wild fish. A balanced sex ratio was observed within fish sampled. Five spermating males and one female with advanced maturation were recorded at 4 years-old. These results demonstrate for the first time, the ability to obtain matured allis shads in captivity, which represents a great interest in the framework of the reintroduction plan of this species.; Ce rapport présente les travaux conduits par Irstea, Aquarium La Rochelle et l’équipe Borea dans le cadre de la mise au point d’une méthode d’élevage ex situ de juvéniles de grande alose Alosa alosa et du suivi de la maturation sexuelle. Il présente dans une première partie les structures utilisées, les conditions d’élevage et l’alimentation. Les résultats de l’élevage en termes de survie, de croissance et de pathologies observées sont ensuite détaillés. La dernière partie expose les résultats du suivi de la maturation sexuelle. A la fin des 4 ans d’expérimentation la survie est de 10%. De très fortes mortalités ont été enregistrées en début d’élevage suite à l’apparition d’un kyste près de la bouche. Au cours de la deuxième année, une « néphrocalcinose » a été détectée qui a également engendré une forte mortalité. En plus des mortalités directes, ces pathologies ont induit des mortalités différées difficilement quantifiables. Les résultats de croissance montrent que les poissons de 4 ans ont une taille et un poids moyens inférieurs à des poissons sauvages. Un sexe ratio équilibré a été observé parmi les poisons échantillonnés. Cinq mâles spermiant et une femelle avec une maturation avancée ont été détectés chez les poissons âgés de 4 ans. Ces résultats montrent pour la première fois, qu’il est possible d’obtenir des grandes aloses matures en captivité, ce qui est un résultat majeur dans le cadre de la réintroduction de cette espèce dans le bassin du Rhin.

This report presents the assessment of scientific and technical research and conservation actions by Irstea in the framework of the National Action Plan for the European sturgeon. These works were funded by the Adour Garonne Water Agency and the General Council of the Gironde with the support of Dreal Aquitaine. This document presents the results of the assisted reproductions; a synthesis on the quality of the male gametes; the monitoring of the population in the wild via «Sturat» sampling campaigns in the estuary; a summary of the communication actions. New developments have been made in 2015. The most important concerned the Sturio 1 building, with the setting up of the tanks dedicated to the reproduction purposes. The reproduction season began on 11 May with pre-selections of spawners. Reproduction attempts were realized from 17 June to 22 July, but all efforts remained unsuccessful.; Ce rapport présente le bilan scientifique et technique des actions de recherche et de conservation menées par Irstea dans le cadre du Plan National d'Actions en faveur de l'esturgeon européen. Ces travaux ont été financés par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et le Conseil Général de la Gironde avec le soutien de la DREAL Aquitaine. Ce document présente les résultats des essais de reproductions assistées ; une synthèse sur la qualité des gamètes mâles ; le suivi de la population en milieu naturel via les campagnes d'échantillonnage « Sturat » en estuaire ; une synthèse des actions de communication. De nouveaux aménagements ont été réalisés en 2015. Les plus importants ont concernés le bâtiment Sturio 1, avec la fin de l'aménagement des bacs destinés à la reproduction. La saison de reproduction a débutée le 11 mai avec les pré-sélections des géniteurs. Les tentatives de reproduction assistée se sont déroulées du 17 juin au 22 juillet. Malgré tous les efforts déployés, aucune ovulation n'a été obtenue.

Synthèse du suivi de la population d'esturgeon européen en milieu naturel, bilan des captures accidentelles.

International audience; La compréhension des capacités de dispersion des espèces migratrices est d’importance capitale pour leur gestion. En jumelant la microchimie des otolithes aux analyses génétiques reposant sur les microsatellites, nous avons obtenu de l’information sur la capacité de dispersion immédiate et à long terme de l’alose vraie (Alosa alosa), un poisson clupéidé anadrome en déclin dans toute son aire de répartition. L’affectation de l’origine natale a été établie sur la base de la signature de l’eau et des signatures d’otolithes d’individus juvéniles et matures au sein d’un modèle bayésien. La majorité des adultes a été affectée à une rivière source avec des degrés de confiance élevés, et seulement 4 % des individus étaient d’origine indéterminée. L’origine natale obtenue des otolithes a été utilisée pour définir une ligne de base des populations en regroupant les individus de la même rivière natale plutôt que du même lieu d’échantillonnage, comme cela se fait habituellement. Si A. alosa faisait preuve d’un degré élevé de fidélité au site natal, cette espèce présentait une structure génétique faible, ce qui appuie les indices d’un flux significatif d’individus égarés entre bassins versants rapprochés ou plus éloignés. Cependant, l’égarement sur de grandes distances était probable, mais pas fréquent. Dans un contexte de changements planétaires, l’égarement constituerait un important mécanisme de dispersion qui conférerait de la résilience aux populations d’aloses vraies.; Understanding dispersal capacities for migratory species is crucial for their management. By coupling otolith microchemistry and microsatellite genetic analyses, we provided information on snapshot and long-term dispersal capacity of Allis shad, an anadromous clupeid in decline throughout its distribution range. The allocation of natal origin was obtained from water chemistry, signatures in otoliths of juveniles and spawners within a Bayesian model. The majority of adults were assigned to a source river with high degrees of confidence, only 4% were undetermined. Otolith natal origins were used to define a population baseline by grouping individuals from the same natal river and not from the same sampling location as usually done. While Alosa alosa exhibited a high level of natal site fidelity, this species showed weak genetic structure which supported the evidence of a significant flow of strayers between river basins in vicinity or at longer distances. However, long distance straying was probable but not frequent. In a context of global change, straying would be a key mechanism to drive dispersal and allow resilience of Allis shad populations.

International audience; The final objective of this action is to reduce the amount of adults collected for larvae production. In the framework of this action, a batch of allis shad larvae was reared in Aquarium La Rochelle facilities to test the feasibility and to follow the sexual maturation process. Mortality was high during the first 4 months, and the survival rate was stabilized at 22%. At the end of the experiment survival was 12%. From 1 month old larvae, the feeding sequence was made of artificial feed and frozen zooplankton. After a 4 year rearing, mean total length was 35 ± 1 cm, and mean weight was 387 ± 34 g. Two main pathologies were observed: mouth malformation during the first weeks of rearing and renal nodules in 3 years old fish. In June 2015 the first mature fish were observed (males). The first allis shad ex situ rearing from larvae until 4 years old fish has been realized in Aquarium La Rochelle. Some recommendations are listed.; Dans l’optique de minimiser les prélèvements de géniteurs pour réaliser des productions de larves destinées au repeuplement, une action C1 Ex situ stock a été développée dans le cadre du projet Life+ Alosa alosa. Dans le cadre de cette action un lot de larves a été élevé pendant 4 ans à l’Aquarium La Rochelle, pour déterminer les particularités de cet élevage et le suivi de la maturation sexuelle. La mortalité a été très forte durant les 4 premiers mois. Le taux de survie s’est stabilisé à 22%. Il est de 12% à la fin des 4 ans d’élevage. A partir de l’âge de 1 mois, la séquence alimentaire a été composée d’un aliment artificiel et de zooplancton congelé. A la fin de l’élevage, les poissons avaient une longueur totale moyenne de 35 ± 1 cm, pour un poids moyen de 387 ± 34 g. Les principales pathologies observées ont concernées les déformations de la bouche et des nodules rénaux sur des poissons de 3 ans. En juin 2015 les premiers individus matures ont été observés (mâles fluents). Ce travail a permis de réaliser le premier élevage ex situ de grande alose, depuis le stade larvaire et jusqu’à l’âge de 4 ans. Des recommandations sont proposées à partir de cette première expérience.

International audience; For most species, only the realized climate niche can realistically be estimated through correlative distribution models. For some species, it has become possible to determine the fundamental niche based on physiological information and a mechanistic understanding. Predicting the future species distributions using both correlative and mechanistic distribution models under climate change scenarios remains as such a rare application. The Allis shad (Alosa alosa) benefited from the attention of the scientific community given its dramatically decreasing trend in all Western European fresh waters. Conservation and restoration measures for the species are undertaken in two key systems of its distribution range where the species was formally a highly abundant exploited natural resource. Both types of distribution models were developed for allis shad and used for predictions but conclusions were never confronted. In the present study, a joint analysis of their results were undertaken to refine conservation actions in the light of climate change impacts. We raised two main concerns regarding: (i) the potential local adaptation of northern populations and (2) the importance of managing a target watershed considering potential existing neighbouring sources of migrants.

International audience; European sturgeon (Acipenser sturio) is an anadromous fish which has been in sharp decline since the beginning of the 20th century. The last wild population of European sturgeon is settled in the Gironde Garonne Dordogne catchment. Because of global change, temperatures have risen and frequency and severity of hypoxic events have increased in this catchment. In addition, the A. sturio population faces chronic pollutant exposure due to increasing agricultural, industrial and domestic releases. The goal of this work is to examine the sensitivity of A. sturio early developmental stages to temperature variations, oxygen depletion and pollutions in environmentally realistic exposure conditions. Embryo-larvae were exposed to combined temperature conditions, ranged from 12°C to 30°C, and dissolved oxygen, ranged from 30 to 90 % O2 saturation (% O2 sat) and to four natural spawning grounds sediments. Lethal and sub-lethal effects were evaluated using embryonic and larval mortality, hatching success, malformation rate, yolk sac resorption, tissue development, routine metabolic rate (RMR), swimming speed and DNA damage (only for sediment exposure). Embryonic survival peaked at 20°C and no survival was recorded at 30°C. No hatching occurred at 50 % O2 sat or below. Malformation rate appeared to be minimum at 20°C and 90 % O2 sat. Maximum RMR were recorded at 20°C under 90 % O2 sat and at 16°C under 70 % O2 sat. At 20°C, RMR was lower at 70% O2 sat than at 90% O2 sat. Swimming speed peaked at 16°C. A. sturio's temperature optimum was shown to be close to 20°C. Its upper tolerance limit is between 26 and 30°C. Its lower tolerance limit was not reached and is supposed to be below 12°C. Oxygen depletion induce sublethal effects at 70 % and lethal effects at 50 % O2 sat. Strikingly, sediment quality of spawning ground had no effect on embryo-larval survival and hatching success. A significant increase of developmental defects and percentage of apoptotic cells was observed for one of the studied sediment. Current temperature, oxygen and sediment quality conditions in the Gironde basin are globally sustainable for A. sturio but a slight O2 levels decrease would impair European sturgeon maintenance capacity in the basin.