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1. Evaluating post-treatment Loa loa microfilarial densities to classify serious adverse events caused by ivermectin: a retrospective analysis

Author: Charlotte Boullé, Cédric B Chesnais, Joseph Kamgno, Jacques Gardon, Jean-Philippe Chippaux, Stéphane Ranque, André Garcia, Sébastien D Pion, Michel Boussinesq, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Colombière, University of Yaoundé [Cameroun], Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), Service de Santé des Armées, Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), and Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille)
Subjects: Microbiology (medical), Infectious Diseases, Virology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Microbiology
Abstract: International audience; Background: The elimination of onchocerciasis requires increasing ivermectin treatment coverage in communities hypoendemic for onchocerciasis. In areas where loiasis is co-endemic, this approach is complicated by the risk of serious adverse events following treatment with ivermectin in individuals with a high Loa loa microfilarial density (MFD). We aimed to evaluate the extent to which the pre-treatment MFD can be inferred from post-treatment MFDs.Methods: For this retrospective analysis, we used data from seven clinical or community trials (six were used for the main analysis and one for the secondary analysis) conducted in Cameroon, in which MFDs were measured both before and after (within 14 days) receiving a single dose of ivermectin (150-200 μg/kg bodyweight). The primary objective was to establish the receiver operating characteristic curves and the corresponding area under the curve statistics of MFD measured after treatment to classify pre-treatment MFD (MFDD0) according to common risk thresholds of serious adverse events. We assessed the performance of post-treatment MFD to accurately classify MFDD0 according to commonly used thresholds using bootstrap procedures.Findings: 281 individuals with MFD measurements available before and 3-10 days after ivermectin treatment were enrolled. Our results show that an MFD of more than 3500 L loa microfilariae per mL of blood (mf per mL) 3 or 4 days after treatment indicates a 68·6% chance (positive predictive value) of an MFDD0 of more than 20 000 mf per mL. An MFD of more than 3500 mf per mL at day 5-10 corresponds to a 72·2% chance of having an MFDD0 of more than 20 000 mf per mL. Conversely, an MFD of less than 2500 microfilariae per mL at day 3-4 or day 5-10 corresponds to a probability of 92·3% or 92·8% (negative predictive value) of having MFDD0 of less than 20 000 mf per mL. An MFD less than 1500 mf per mL on days 3-4 after treatment was associated with a 78·3% probability of having an MFDD0 less than 8000 mf per mL; this probability increased to 89·6% on days 5-10 after treatment.Interpretation: The MFD threshold of 1000 mf per mL within 1 month of treatment, which is commonly used to attribute the occurrence of a serious adverse event to ivermectin, should be revised. In this study, we present tables that can help to assess this attributability as part of mass or individual treatments.
Published: 2023

2. Concomitant and productive genital infections by HSV-2 and HPV in two young women: A case report

Author: Ilkay Başak Uysal, Vanina Boué, Carmen Lia Murall, Christelle Graf, Christian Selinger, Christophe Hirtz, Claire Bernat, Jacques Ravel, Jacques Reynes, Marine Bonneau, Massilva Rahmoun, Michel Segondy, Nathalie Boulle, Sophie Grasset, Soraya Groc, Tim Waterboer, Vincent Tribout, Ignacio G. Bravo, Sonia Burrel, Vincent Foulongne, Samuel Alizon, Nicolas Tessandier, Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), University of Maryland School of Medicine, University of Maryland System, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] (DKFZ), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Project: 648963,H2020,ERC-2014-CoG,EVOLPROOF(2015), Alizon, Samuel, and Are HPV vaccines ‘evolution-proof’? Multilevel evolutionary ecology of human oncoviruses - EVOLPROOF - - H20202015-09-01 - 2020-08-31 - 648963 - VALID
Subjects: HPV, Human papillomavirus, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, Human papillomavirus Herpes Simplex Virus-2 Co-infection Interaction Vaginal microbiota qPCR HSV-2, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.BID.SPT] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, CST, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, quantitative PCRs, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.EE.IEO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Community State Type, qPCR, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Herpes Simplex Virus-2, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.GEN.GPO] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [INFO.INFO-MO] Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, STI, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Sexually Transmitted Infection, [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis
Abstract: International audience; Human papillomaviruses (HPVs), the most oncogenic virus known to humans, are often associated with Herpes Simplex Virus-2 (HSV-2) infections. The involvement of the latter in cervical cancer is controversial but its longterm infections might modulate the mucosal microenvironment in a way that favors carcinogenesis. We know little about coinfections between HSV-2 and HPVs, and studying the immunological and microbiological dynamics in the early stages of these infections may help identify or rule out potential interactions. We report two cases of concomitant productive, although asymptomatic, HSV-2 and HPV infections in young women (aged 20 and 25). The women were followed up for approximately a year, with clinical visits every two months and weekly self-samples. We performed quantitative analyses of their HSV-2 and HPV viral loads, immunological responses (IgG and IgM antibodies and local cytokines expression profiles), vaginal microbiota composition, as well as demographic and behavior data. We detect interactions between virus loads, immune response, and the vaginal microbiota, which improve our understanding of HSV-2 and HPVs' coinfections and calls for further investigation with larger cohorts.
Published: 2022

3. [Survey on HIV, HBV and HCV screening practices in cancerology, France]

Author: Marianne Veyri, Isabelle Poizot-Martin, Sylvie Bregigeon, Caroline Solas, Anne-Geneviève Marcelin, Myriam Taouqi, Michèle Pibarot, Alain Makinson, Jean-Philippe Spano, Sylvain Choquet, Plateforme Cancer et Fertilité ONCOPACA-Corse / CECOS [Hôpital La Conception - APHM], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Aix Marseille Université (AMU), Simulation and Modeling of Adaptive Response for Therapeutics in Cancer (SMARTc), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montpellier (UM), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Malbec, Odile, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, medicine.medical_specialty, VHB, [SDV]Life Sciences [q-bio], Human immunodeficiency virus (HIV), Hiv testing, VHC, medicine.disease_cause, Patient care, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Regional cancer, HBV, medicine, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, National level, Medical prescription, Cancer, business.industry, HIV, VIH, virus diseases, Hematology, General Medicine, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Dépistage, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Family medicine, HCV, Screening, business
Abstract: HIV testing is recommended at time of cancer diagnosis, HBV and HCV screening because of the risk of reactivation with certain anticancer drugs.This is a cross-sectional study. The objectives were to assess the screening practices in cancer patients and the satisfaction of professionals in the event of use of the CancerHIV network. A questionnaire drafted by the CancerHIV expert and the OncoPaca-Corse Regional Cancer Network (RCN) was distributed in the region at the end of 2018 (part 1: V1) before being extended to the national level via the CancerHIV network (part 2: V2). Participation reached 160 and 130 respondents (V1 and V2, respectively). At the initial cancer assessment, 23% of respondents declared that they systematically screened for HIV at V1 (V2: 17%), 25% for HBV (V2: 20%) and 24% for HCV (V2: 19%). Before immunotherapy, the rates were 54% for HIV in V1 (V2: 52%), 57% for HBV (V2: 60%) and 55% for HCV (V2: 57%). Among the respondents, satisfaction when requesting a regional or national remedy was high (almost 100%). Screening for HIV, HBV and HCV allows supervised prescription of immunosuppressive or cytotoxic treatment to a potentially immunosuppressed patient. This study, resulting of an original collaboration between a RCN and a national expert network, underlines the lack of screening at the 2 examined stages of patient care, and the need for raising practitioners' awareness to recommendations., Le dépistage de l’infection par le VIH est recommandé lors du bilan initial de tout cancer, celui de l’hépatite B et C en raison d’un risque de réactivation avec certains anticancéreux. Il s’agit d’une étude descriptive transversale. Les objectifs étaient d’évaluer les pratiques de dépistage chez des patients atteints de cancer et la satisfaction des professionnels en cas de recours au réseau CancerVIH. Un questionnaire élaboré par l’expert CancerVIH et le Réseau Régional de Cancérologie (RRC) OncoPaca-Corse a été diffusé fin 2018 en région (volet 1 : V1) avant une extension au niveau national via le réseau CancerVIH (volet 2 : V2). La participation a atteint 160 et 130 répondants (V1 et V2, respectivement). Au bilan initial de cancer, 23 % des répondants déclaraient dépister systématiquement le VIH au V1 (V2 : 17 %), 25 % le VHB (V2 : 20 %) et 24 % le VHC (V2 :19 %). Avant immunothérapie, les chiffres étaient de 54 % pour le VIH dans le V1 (V2 : 52 %), 57 % pour le VHB (V2 : 60 %) et 55 % pour le VHC (V2 : 57 %). Parmi les répondants, la satisfaction en cas de sollicitation du recours régional ou national était élevée (près de 100 %). Le dépistage du VIH, VHB et VHC permet la prescription encadrée d’un traitement immunosuppresseur ou cytotoxique à un patient potentiellement immunodéprimé. Cette enquête, fruit d’une collaboration originale entre RRC et réseau expert national, souligne l’insuffisance du dépistage aux 2 étapes de la prise en charge étudiées et la nécessité de sensibiliser les professionnels aux recommandations existantes.
Published: 2021

4. RNA testing for the diagnosis of acute hepatitis A during the 2017 outbreak in France

Author: Karine Bollore, Anne-Marie Mondain, Georges-Philippe Pageaux, Paul Le Baccon-Sollier, Philippe Van de Perre, Jacques Ducos, Edouard Tuaillon, Patrick Pastor, Alain Makinson, Julie Tram, Pathogénèse et contrôle des infections chroniques (PCCI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier ), Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], viruses, Viremia, Hepatitis A Antibodies, Virus, Disease Outbreaks, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Virology, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Pathogen, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Prothrombin time, Hepatology, medicine.diagnostic_test, Diagnostic Tests, Routine, business.industry, fungi, virus diseases, Outbreak, RNA, Hepatitis A, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, medicine.disease, digestive system diseases, 3. Good health, Infectious Diseases, Immunoglobulin M, Nucleic acid, RNA, Viral, 030211 gastroenterology & hepatology, France, business
Abstract: Diagnostic of acute hepatitis A virus (HAV) infection is based on the detection of anti-HAV IgM without testing for the pathogen itself. We evaluated the usefulness of HAV RNA testing for confirmation of acute hepatitis A and to provide indications about the level of HAV replication in HIV-positive and HIV-negative subjects during an unprecedented outbreak of HAV observed in France in 2017. HAV RNA was detected in 38 out of 41 (92.6%) subjects with a clinical diagnosis of acute hepatitis A, whereas nine cases tested positive for anti-HAV IgM in whom the diagnosis of acute hepatitis A was not retained were found negative for HAV RNA. All subjects in the control group were also tested negative for HAV RNA. HAV viremia was correlated to ALT peak (r = .64; P < .0001). HIV-infected patients have similar HAV RNA levels but were less likely to have prolonged international normalized ratio of prothrombin time when compared to the HIV-uninfected group (P = .016), suggesting a less severe course of acute hepatitis. HAV RNA was detected in the serum of most of the patients with acute hepatitis A, indicating that the direct detection of HAV can be used to confirm hepatitis A in patients tested positive for anti-HAV IgM antibodies. Nucleic acid tests should serve more broadly during the diagnosis workup of acute hepatitis A to improve the predictive values of HAV in vitro diagnostic tests and to confirm acute hepatitis A in patients tested positive with IgM with moderate or low S/CO values.
Published: 2020

5. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Nucleocapsid Antigen in Urine of Hospitalized Patients With Coronavirus Disease 2019

Author: Nicolas Veyrenche, Amandine Pisoni, Ségolène Debiesse, Karine Bollore, Anne Sophie Bedin, Alain Makinson, Clémence Niel, Carmen Alcocer-Cordellat, Anne Marie Mondain, Vincent Le Moing, Philippe Van de Perre, Edouard Tuaillon, BONIZEC, Sandrine, Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]-Université de Montpellier (UM), Université de Montpellier (UM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), EFS, UNIVERSITY OF ANTILLES, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Tropical and Infectious Diseases, University Hospital, Montpellier, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), GReCSS - IRD UMI233, Maison méditerranéenne des sciences de l'Homme (MMSH), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Montpellier University Hospital
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, SARS-CoV-2, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], COVID-19, Coronavirus Nucleocapsid Proteins, Humans, Immunology and Allergy, Antibodies, Viral, Nucleocapsid, Antigens, Viral, Sensitivity and Specificity
Abstract: Background Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) nucleocapsid antigen (N-Ag) can be detected in the blood of patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19). We used a highly sensitive and specific assay to explore the presence of N-Ag in urine during the course of COVID-19 and its relationship with the severity of disease. Methods We studied urinary and plasma N-Ag using a highly sensitive immunoassay in 82 patients with SARS-CoV-2 infection proved by polymerase chain reaction. Results In the first and second weeks of COVID-19, hospitalized patients tested positive for urinary N-Ag (81.25% and 71.79%, respectively) and plasma N-Ag (93.75% and 94.87%, respectively). High urinary N-Ag levels were associated with the absence of SARS-CoV-2 nucleocapsid antibodies, admission in intensive care units, high C-reactive protein levels, lymphopenia, eosinopenia, and high lactate dehydrogenase levels. Higher accuracy was observed for urinary N-Ag as a predictor of severe COVID-19 than for plasma N-Ag. Conclusions Our study demonstrates that N-Ag is present in the urine of patients hospitalized in the early phase of COVID-19. As a direct marker of SARS-CoV-2, urinary N-Ag reflects the dissemination of viral compounds in the body. Urinary N-Ag may be a useful marker for disease severity in SARS-CoV-2 infections.
Published: 2022

6. Assessing fetal growth in Africa: Application of the international WHO and INTERGROWTH-21st standards in a Beninese pregnancy cohort

Author: Emmanuel Yovo, Manfred Accrombessi, Gino Agbota, Alice Hocquette, William Atade, Olaiitan T. Ladikpo, Murielle Mehoba, Auguste Degbe, Ghyslain Mombo-Ngoma, Achille Massougbodji, Nikki Jackson, Nadine Fievet, Barbara Heude, Jennifer Zeitlin, Valérie Briand, Institut de Recherche Clinique du Bénin [Abomey-Calavi, Bénin] (IRCB), London School of Hygiene and Tropical Medicine (LSHTM), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Equipe 1 : EPOPé - Épidémiologie Obstétricale, Périnatale et Pédiatrique (CRESS - U1153), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherches Médicales de Lambaréné, University of Tübingen, Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg] (UKE), University of Oxford, Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), Research Team on Early life Origins of Health (EarOH), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Global Health in the Global South (GHiGS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)- Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Agence Nationale de la Recherche, Fondation de France, and ANR-13-JSV1-0004,RECIPAL,Impact du paludisme précoce au cours de la grossesse sur la croissance fœtale au Bénin(2013)
Subjects: Adult, Computer and Information Sciences, Embryology, Epidemiology, Maternal Health, Science, Blood Pressure, World Health Organization, Tanzania, Infographics, Vascular Medicine, Fetal Development, Young Adult, Medical Conditions, Pregnancy, Hypertensive Disorders in Pregnancy, Medicine and Health Sciences, Parasitic Diseases, Benin, Humans, Growth Charts, Data Management, Fetuses, Multidisciplinary, Data Visualization, Obstetrics and Gynecology, Biology and Life Sciences, Anemia, Hematology, Tropical Diseases, Charts, Malaria, Pregnancy Complications, Medical Risk Factors, Hypertension, Birth, Women's Health, Medicine, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Research Article, Developmental Biology
Abstract: Background Fetal growth restriction is a major complication of pregnancy and is associated with stillbirth, infant death and child morbidity. Ultrasound monitoring of pregnancy is becoming more common in Africa for fetal growth monitoring in clinical care and research, but many countries have no national growth charts. We evaluated the new international fetal growth standards from INTERGROWTH-21st and WHO in a cohort from southern Benin. Methods Repeated ultrasound and clinical data were collected in women from the preconceptional RECIPAL cohort (241 women with singleton pregnancies, 964 ultrasounds). We modelled fetal biometric parameters including abdominal circumference (AC) and estimated fetal weight (EFW) and compared centiles to INTERGROWTH-21st and WHO standards, using the Bland and Altman method to assess agreement. For EFW, we used INTERGROWTH-21st standards based on their EFW formula (IG21st) as well as a recent update using Hadlock’s EFW formula (IG21hl). Proportions of fetuses with measurements under the 10th percentile were compared. Results Maternal malaria and anaemia prevalence was 43% and 69% respectively and 11% of women were primigravid. Overall, the centiles in the RECIPAL cohort were higher than that of INTERGROWTH-21st and closer to that of WHO. Consequently, the proportion of fetuses under 10th percentile thresholds was systematically lower when applying IG21st compared to WHO standards. At 27–31 weeks and 33–38 weeks, respectively, 7.4% and 5.6% of fetuses had EFW th percentile using IG21hl standards versus 10.7% and 11.6% using WHO standards. Conclusion Despite high anemia and malaria prevalence in the cohort, IG21st and WHO standards did not identify higher than expected proportions of fetuses under the 10th percentiles of ultrasound parameters or EFW. The proportions of fetuses under the 10th percentile threshold for IG21st charts were particularly low, raising questions about its use to identify growth-restricted fetuses in Africa.
Published: 2022

7. Incidence of cervical, breast and colorectal cancers between 2010 and 2015 in people living with HIV in France

Author: Rojas Rojas, Teresa, Poizot-Martin, Isabelle, Rey, David, Duvivier, Claudine, Bani-Sadr, Firouzé, Cabie, André, Delobel, Pierre, Jacomet, Christine, Allavena, Clotilde, Ferry, Tristan, Pugliese, Pascal, Valantin, Marc-Antoine, Lamaury, Isabelle, Hustache-Matthieu, Laurent, Fresard, Anne, Houyou, Tamazighth, Huleux, Thomas, Cheret, Antoine, Makinson, Alain, Obry-Roguet, Véronique, Lions, Caroline, Carrieri, Maria, Protopopescu, Camelia, Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des sciences de la santé publique [Marseille] (ISSPAM), Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Strasbourg, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU de la Martinique [Fort de France], Université des Antilles (UA), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Clermont-Ferrand, Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôtel-Dieu de Nantes, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Observatoire régional de la santé Provence-Alpes-Côte d'Azur [Marseille] (ORS PACA), Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Etienne, and DIAMANT-BERGER, Valérie
Subjects: Male, Multidisciplinary, Coinfection, Incidence, Uterine Cervical Neoplasms, Breast Neoplasms, HIV Infections, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.GEO]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Gynecology and obstetrics, Hepatitis C, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.MHEP.GEO] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Gynecology and obstetrics, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Colorectal Neoplasms, Retrospective Studies
Abstract: Background We aimed to evaluate the incidence rates between 2010 and 2015 for invasive cervical cancer (ICC), breast cancer (BC), and colorectal cancer (CRC) in people living with HIV (PLWH) in France, and to compare them with those in the French general population. These cancers are targeted by the national cancer-screening program. Setting This is a retrospective study based on the longitudinal data of the French Dat’AIDS cohort. Methods Standardized incidence ratios (SIR) for ICC and BC, and incidence rates for all three cancers were calculated overall and for specific sub-populations according to nadir CD4 cell count, HIV transmission category, HIV diagnosis period, and HCV coinfection. Results The 2010–2015 CRC incidence rate was 25.0 [95% confidence interval (CI): 18.6–33.4] per 100,000 person-years, in 44,642 PLWH (both men and women). Compared with the general population, the ICC incidence rate was significantly higher in HIV-infected women both overall (SIR = 1.93, 95% CI: 1.18–3.14) and in the following sub-populations: nadir CD4 ≤ 200 cells/mm3 (SIR = 2.62, 95% CI: 1.45–4.74), HIV transmission through intravenous drug use (SIR = 5.14, 95% CI: 1.93–13.70), HCV coinfection (SIR = 3.52, 95% CI: 1.47–8.47) and HIV diagnosis before 2000 (SIR = 2.06, 95% CI: 1.07–3.97). Conversely, the BC incidence rate was significantly lower in the study sample than in the general population (SIR = 0.56, 95% CI: 0.42–0.73). Conclusion The present study showed no significant linear trend between 2010 and 2015 in the incidence rates of the three cancers explored in the PLWH study sample. Specific recommendations for ICC screening are still required for HIV-infected women and should focus on sub-populations at greatest risk.
Published: 2022

8. An open-label randomized controlled trial of the effect of lopinavir/ritonavir, lopinavir/ritonavir plus IFN-β-1a and hydroxychloroquine in hospitalized patients with COVID-19

Author: Lionel Piroth, Bruno Mourvillier, Joy Mootien, François-Xavier Lescure, Emmanuel Faure, S. Gallien, Dominique Costagliola, Jean-Christophe Richard, Noemie Mercier, Florent Wallet, Yazdan Yazdanpanah, Marion Noret, Claire Andrejak, Jean-Philippe Lanoix, Julien Poissy, Johan Courjon, Saad Nseir, François Danion, Violaine Tolsma, Alain Makinson, Odile Launay, Raphaël Clere-Jehl, Bruno Lina, Drifa Belhadi, Valérie Pourcher, Antoine Kimmoun, Karine Lacombe, Juliette Saillard, Maude Bouscambert-Duchamp, Stéphane Jauréguiberry, Charles Burdet, Toni Alfaiate, Olivier Epaulard, Minh Patrick Lê, Gilles Peytavin, Elisabeth Botelho-Nevers, Thérèse Staub, Guillaume Martin-Blondel, Alpha Diallo, Lila Bouadma, Aline Dechanet, François Goehringer, Florence Ader, Nathan Peiffer-Smadja, Jean-Christophe Navellou, Christelle Delmas, Rostane Gaci, Kevin Bouiller, Maya Hites, André Cabié, Jean Reuter, Sylvie Leroy, Axelle Dupont, François Raffi, Amandine Gagneux-Brunon, Jean Reignier, Clément Dubost, Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP)-Université Sorbonne Paris Nord, National Institute for Health Research [Cambridge, UK], Imperial College London, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Lille, Centre National de Reference des virus des Infections Respiratoires France Sud [HCL, Lyon], Virology and human respiratory Pathologies - Virology and human respiratory Pathologies (VirPath), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre d'investigation Clinique [CHU Bichat] - Épidémiologie clinique (CIC 1425), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Institut de Santé Publique, Université de Médecine Carol Davila, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique (DCAC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), French-Clinical Research Infrastructure Network - F-CRIN [Paris] (Cardiovascular & Renal Clinical Trialists - CRCT ), Cardiovascular and Renal Clinical Trialists [Vandoeuvre-les-Nancy] (INI-CRCT), Institut Lorrain du Coeur et des Vaisseaux Louis Mathieu [Nancy], Service de Réanimation Médicale [CHRU Nancy], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Centre National de Référence du Paludisme [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Nantes (UN), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), LabEx Transplantex [Strasbourg], Université de Strasbourg (UNISTRA), Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg, Fédération Hospitalo-Universitaire (OMICARE), Centre de Recherche d’Immunologie et d’Hématologie [Strasbourg], Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg (FMTS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Centre Hospitalier Annecy-Genevois [Saint-Julien-en-Genevois], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier], Etablissement français du don du sang [Montpellier], CHU de la Martinique [Fort de France], Hôpital d'Instruction des Armées Begin, Service de Santé des Armées, Université Paris-Saclay, Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay), CB - Centre Borelli - UMR 9010 (CB), Service de Santé des Armées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-Université de Paris (UP), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] (OncoAge), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire [UNIV Côte d'Azur] (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Emile Muller [Mulhouse] (CH E.Muller Mulhouse), Groupe Hospitalier de Territoire Haute Alsace (GHTHA), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Université Lille Nord de France (COMUE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CIC Cochin Pasteur (CIC 1417), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université de Paris (UP)-Groupe hospitalier Broca-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294 (AGIR ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-CHU Saint-Eloi-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Toulouse [Toulouse], Physiopathologie et biothérapies des infections muqueuses (GIMAP), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Fédération d’Infectiologie Multidisciplinaire de l’Arc Alpin [CHU Grenoble-Alpes], Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Centre Hospitalier de Luxembourg [Luxembourg] (CHL), Institut des Agents Infectieux [Lyon] (IAI), Réseau national de recherche clinique en infectiologie (RENARCI), CHU Amiens-Picardie, Université libre de Bruxelles (ULB), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Université de Lorraine (UL), Hôpital Bicêtre, Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Université de Lille, Sorbonne Université, Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CIC Saint Etienne, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Nord (Saint Etienne), Optimisation thérapeutique en Neuropsychopharmacologie (OPTeN (UMR_S_1144 / U1144)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Département d'Epidemiologie, Biostatistique et Recherche Clinique (DEBRC), Centre National de Référence du Paludisme [CHU Pitié-Salpétrière] (CNRpalu), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Santé des Armées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-Université Paris Cité (UPCité), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire [UNIV Côte d'Azur] (UPMC)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], AP-HP, Hôpital Henri-Mondor Albert-Chenevier, Service d'Immunologie Clinique et Maladies Infectieuses 94000 Créteil, France, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Faculté de médecine (UPEC Médecine), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service des maladies infectieuses et tropicales [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse], Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), CHU Grenoble, Université Grenoble Alpes (UGA), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Centre d'Investigation Clinique - Epidémiologie Clinique Saint-Etienne (CIC-EC), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Université Sorbonne Paris Nord, Service de Santé des Armées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay)-Université Paris Cité (UPC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lopinavir/ritonavir, law.invention, 0302 clinical medicine, Randomized controlled trial, law, immune system diseases, MESH: Antiviral Agents* / therapeutic use, 030212 general & internal medicine, MESH: Treatment Outcome, education.field_of_study, MESH: Middle Aged, virus diseases, Lopinavir, General Medicine, MESH: Lopinavir / therapeutic use, 3. Good health, Infectious Diseases, MESH: Interferon beta-1a / therapeutic use, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Pharmaceutical Preparations, MESH: Hydroxychloroquine / therapeutic use, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Original Article, medicine.drug, Hydroxychloroquine, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, Population, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Interferon β-1a, Internal medicine, medicine, Humans, education, Adverse effect, MESH: COVID-19* / drug therapy, MESH: Drug Combinations, MESH: Humans, business.industry, SARS-CoV-2, Drug Repositioning, Interferon beta-1a, COVID-19, MESH: Adult, MESH: Male, MESH: Ritonavir / therapeutic use, Ritonavir, business, MESH: Female, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Objectives: We evaluated the clinical, virological and safety outcomes of lopinavir/ritonavir, lopinavir/ritonavir-interferon (IFN)-β-1a, hydroxychloroquine or remdesivir in comparison to standard of care (control) in coronavirus 2019 disease (COVID-19) inpatients requiring oxygen and/or ventilatory support.Methods: We conducted a phase III multicentre, open-label, randomized 1:1:1:1:1, adaptive, controlled trial (DisCoVeRy), an add-on to the Solidarity trial (NCT04315948, EudraCT2020-000936-23). The primary outcome was the clinical status at day 15, measured by the WHO seven-point ordinal scale. Secondary outcomes included quantification of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in respiratory specimens and pharmacokinetic and safety analyses. We report the results for the lopinavir/ritonavir-containing arms and for the hydroxychloroquine arm, trials of which were stopped prematurely.Results: The intention-to-treat population included 583 participants-lopinavir/ritonavir (n = 145), lopinavir/ritonavir-IFN-β-1a (n = 145), hydroxychloroquine (n = 145), control (n = 148)-among whom 418 (71.7%) were male, the median age was 63 years (IQR 54-71), and 211 (36.2%) had a severe disease. The day-15 clinical status was not improved with the investigational treatments: lopinavir/ritonavir versus control, adjusted odds ratio (aOR) 0.83, (95% confidence interval (CI) 0.55-1.26, p 0.39), lopinavir/ritonavir-IFN-β-1a versus control, aOR 0.69 (95%CI 0.45-1.04, p 0.08), and hydroxychloroquine versus control, aOR 0.93 (95%CI 0.62-1.41, p 0.75). No significant effect of investigational treatment was observed on SARS-CoV-2 clearance. Trough plasma concentrations of lopinavir and ritonavir were higher than those expected, while those of hydroxychloroquine were those expected with the dosing regimen. The occurrence of serious adverse events was significantly higher in participants allocated to the lopinavir/ritonavir-containing arms.Conclusion: In adults hospitalized for COVID-19, lopinavir/ritonavir, lopinavir/ritonavir-IFN-β-1a and hydroxychloroquine improved neither the clinical status at day 15 nor SARS-CoV-2 clearance in respiratory tract specimens.
Published: 2021

9. Residual Viremia Is Linked to a Specific Immune Activation Profile in HIV-1-Infected Adults Under Efficient Antiretroviral Therapy

Author: Mehwish Younas, Christina Psomas, Christelle Reynes, Renaud Cezar, Lucy Kundura, Pierre Portalès, Corinne Merle, Nadine Atoui, Céline Fernandez, Vincent Le Moing, Claudine Barbuat, Albert Sotto, Robert Sabatier, Audrey Winter, Pascale Fabbro, Thierry Vincent, Jacques Reynes, Pierre Corbeau, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Guerineau, Nathalie C., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Virulence bactérienne et maladies infectieuses (VBMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut Desbrest de santé publique (IDESP), Institute of Numerical Mathematics [Moscou] (INM-RAS), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), and Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI)
Subjects: CD4-Positive T-Lymphocytes, 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, CD38, Lymphocyte Activation, endothelium activation, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Immunology and Allergy, Medicine, Original Research, Disease Management, Middle Aged, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], medicine.anatomical_structure, Host-Pathogen Interactions, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Disease Susceptibility, low-level viremia, medicine.symptom, Adult, lcsh:Immunologic diseases. Allergy, [SDV.IMM] Life Sciences [q-bio]/Immunology, Endothelium, CD14, T cell, 030106 microbiology, Immunology, Inflammation, Viremia, 03 medical and health sciences, Humans, coagulation, virologic responder, Aged, Duration of Therapy, business.industry, Monocyte, medicine.disease, Cross-Sectional Studies, 030104 developmental biology, inflammation, HIV-1, blip, lcsh:RC581-607, business, Biomarkers, CD8
Abstract: International audience; Chronic immune activation persists in persons living with HIV-1 even though they are aviremic under antiretroviral therapy, and fuels comorbidities. In previous studies, we have revealed that virologic responders present distinct profiles of immune activation, and that one of these profiles is related to microbial translocation. In the present work, we tested in 140 HIV-1-infected adults under efficient treatment for a mean duration of eight years whether low-level viremia might be another cause of immune activation. We observed that the frequency of viremia between 1 and 20 HIV-1 RNA copies/mL (39.5 ± 24.7% versus 21.1 ± 22.5%, p = 0.033) and transient viremia above 20 HIV-1 RNA copies/mL (15.1 ± 16.9% versus 3.3 ± 7.2%, p = 0.005) over the 2 last years was higher in patients with one profile of immune activation, Profile E, than in the other patients. Profile E, which is different from the profile related to microbial translocation with frequent CD38+ CD8+ T cells, is characterized by a high level of CD4+ T cell (cell surface expression of CD38), monocyte (plasma concentration of soluble CD14), and endothelium (plasma concentration of soluble Endothelial Protein C Receptor) activation, whereas the other profiles presented low CD4:CD8 ratio, elevated proportions of central memory CD8+ T cells or HLA-DR+ CD4+ T cells, respectively. Our data reinforce the hypothesis that various etiological factors shape the form of the immune activation in virologic responders, resulting in specific profiles. Given the type of immune activation of Profile E, a potential causal link between low-level viremia and atherosclerosis should be investigated.
Published: 2021

10. Intimate partner violence by men living with HIV in Cameroon: Prevalence, associated factors and implications for HIV transmission risk (ANRS-12288 EVOLCAM)

Author: Fiorentino, Marion, Sow, Abdourahmane, Sagaon-Teyssier, Luis, Mora, Marion, Mengue, Marie-Thérèse, Vidal, Laurent, Kuaban, Christopher, March, Laura, Laurent, Christian, Spire, Bruno, Boyer, Sylvie, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Catholique d'Afrique Centrale - Institut Catholique de Yaoundé (UCAC), University of Yaoundé [Cameroun], Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), EVOLCam study Group, Centre de Recherche et de Documentation sur l'Océanie (CREDO), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Malbec, Odile
Subjects: RNA viruses, Male, Epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Intimate Partner Violence, Social Sciences, HIV Infections, Criminology, Pathology and Laboratory Medicine, Sociology, Immunodeficiency Viruses, Risk Factors, Surveys and Questionnaires, Medicine and Health Sciences, Psychology, Public and Occupational Health, Cameroon, Traumatic Injury Risk Factors, HIV diagnosis and management, Vaccination and Immunization, [SDV] Life Sciences [q-bio], Medical Microbiology, HIV epidemiology, Viral Pathogens, Viruses, population characteristics, Female, Crime, Pathogens, Research Article, Adult, HIV prevention, Immunology, education, Antiretroviral Therapy, Microbiology, behavioral disciplines and activities, Antiviral Therapy, Retroviruses, mental disorders, Humans, Violent Crime, Microbial Pathogens, Preventive medicine, Behavior, Lentivirus, Organisms, Biology and Life Sciences, HIV, social sciences, Diagnostic medicine, Cross-Sectional Studies, Logistic Models, Socioeconomic Factors, Medical Risk Factors, Human Sexual Behavior
Abstract: International audience; Objectives: Intimate partner violence (IPV) against women is frequent in Central Africa and may be a HIV infection risk factor. More data on HIV-positive men (MLHIV) committing IPV are needed to develop perpetrator-focused IPV and HIV prevention interventions. We investigated the relationship between IPV and HIV transmission risk and IPV-associated factors.Methods: We used data from the cross-sectional survey EVOLCam which was conducted in Cameroonian outpatient HIV structures in 2014. The study population comprised MLHIV declaring at least one sexual partner in the previous year. Using principal component analysis, we built three variables measuring, respectively, self-reported MLHIV-perpetrated psychological and physical IPV (PPV), severe physical IPV (SPV), and sexual IPV (SV). Ordinal logistic regressions helped investigate: i) the relationship between HIV transmission risk (defined as unstable aviremia and inconsistent condom use) and IPV variables, ii) factors associated with each IPV variable.Results: PPV, SPV and SV were self-reported by 28, 15 and 11% of the 406 study participants, respectively. IPV perpetrators had a significantly higher risk of transmitting HIV than non-IPV perpetrators. Factors independently associated with IPV variables were: i) socio-demographic, economic and dyadic factors, including younger age (PPV and SPV), lower income (PPV), not being the household head (SPV and SV), living with a main partner (SPV), and having a younger main partner (SPV); ii) sexual behaviors, including ≥2 partners in the previous year (PPV and SPV), lifetime sex with another man (SPV), inconsistent condom use (SV), and >20 partners during lifetime (SV); iii) HIV-related stigma (PPV and SV).Conclusion: IPV perpetrators had a higher risk of transmitting HIV and having lifetime and recent risky sexual behaviors. Perpetrating IPV was more frequent in those with socioeconomic vulnerability and self-perceived HIV-related stigma. These findings highlight the need for interventions to prevent IPV by MLHIV and related HIV transmission to their(s) partner(s).
Published: 2021

11. Multiplex detection of antibodies to Chikungunya, O’nyong-nyong, Zika, Dengue, West Nile and Usutu viruses in diverse non-human primate species from Cameroon and the Democratic Republic of Congo

Author: Severin Loul, Simon-Pierre Ndimbo-Kumugo, Karen Kerkhof, Ahidjo Ayouba, Eitel Mpoudi Ngole, Eric Delaporte, Guillaume Thaurignac, Raisa Raulino, Vincent Foulongne, Thomas Foe, Martine Peeters, Placide Mbala-Kingebeni, Steve Ahuka-Mundeke, Kevin K. Ariën, Sheila Makiala-Mandanda, Christian Julian Villabona-Arenas, Christelle Butel, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre de recherches sur les maladies émergentes, ré-émergentes et la médecine nucléaire [Yaoundé, Cameroun] (CREMER), Institut de Recherches Médicales et d'Etudes des Plantes Médicinales (IMPM), Institut National de Recherche Biomédicale [Kinshasa] (INRB), Institute of Tropical Medicine [Antwerp] (ITM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), University of Antwerp (UA), BONIZEC, Sandrine, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Montpellier, and Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI)
Subjects: RNA viruses, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], viruses, RC955-962, Monkeys, Dengue virus, Pathology and Laboratory Medicine, Antibodies, Viral, medicine.disease_cause, Biochemistry, Serology, Dengue fever, Zika virus, 0302 clinical medicine, Seroepidemiologic Studies, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Arctic medicine. Tropical medicine, Immune Physiology, Medicine and Health Sciences, 030212 general & internal medicine, Chikungunya, Mammals, [SDV.MHEP.ME] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, 0303 health sciences, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Chikungunya Virus, Immune System Proteins, Yellow fever, Eukaryota, virus diseases, Hominidae, Haplorhini, Recombinant Proteins, 3. Good health, Infectious Diseases, Medical Microbiology, Viral Pathogens, Vertebrates, Viruses, Apes, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Public aspects of medicine, RA1-1270, Pathogens, West Nile virus, Research Article, Primates, Alphaviruses, Immunology, Biology, Microbiology, Arbovirus, Antibodies, Togaviruses, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, Humans, O'nyong-nyong Virus, Seroprevalence, Serologic Tests, Microbial Pathogens, 030304 developmental biology, Flaviviruses, Flavivirus, Organisms, Public Health, Environmental and Occupational Health, Biology and Life Sciences, Proteins, Zika Virus, Dengue Virus, medicine.disease, biology.organism_classification, Virology, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Immunoglobulin G, Amniotes, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Human medicine, Zoology, Arboviruses
Abstract: Background Epidemic arbovirus transmission occurs among humans by mosquito bites and the sylvatic transmission cycles involving non-human primates (NHPs) still exists. However, limited data are available on the extent in NHPs infections and their role. In this study, we have developed and validated a high-throughput serological screening tool to study the circulation of multiple arboviruses that represent a significant threat to human health, in NHPs in Central Africa. Methodology/Principal findings Recombinant proteins NS1, envelope domain-3 (DIII) for the dengue (DENV), yellow fever (YFV), usutu (USUV), west nile (WNV) and zika (ZIKV) and envelope 2 for the chikungunya (CHIKV) and o'nyong-nyong (ONNV) were coupled to Luminex beads to detect IgG directed against these viruses. Evaluation of test performance was made using 161 human sera of known arboviral status (66 negative and 95 positive). The sensitivity and specificity of each antigen were determined by statistical methods and ROC curves (except for ONNV and USUV). All NS1 antigens (except NS1-YFV), CHIKV-E2 and WNV-DIII had sensitivities and specificities > 95%. For the other DIII antigens, the sensitivity was low, limiting the interest of their use for seroprevalence studies. Few simultaneous reactions were observed between the CHIKV+ samples and the NS1 antigens to the non-CHIKV arboviruses. On the other hand, the DENV+ samples crossed-reacted with NS1 of all the DENV serotypes (1 to 4), as well as with ZIKV, USUV and to a lesser extent with YFV. A total of 3,518 samples of 29 species of NHPs from Cameroon and the Democratic Republic of Congo (DRC) were tested against NS1 (except YFV), E2 (CHIKV/ONNV) and DIII (WNV) antigens. In monkeys (n = 2,100), the global prevalence varied between 2 and 5% for the ten antigens tested. When we stratified by monkey’s biotope, the arboreal species showed the highest reactivity. In monkeys from Cameroon, the highest IgG prevalence were observed against ONNV-E2 and DENV2-NS1 with 3.95% and 3.40% respectively and in DRC, ONNV-E2 (6.63%) and WNV-NS1 (4.42%). Overall prevalence was low in apes (n = 1,418): ranging from 0% for USUV-NS1 to 2.6% for CHIKV-E2. However, a very large disparity was observed among collection site and ape species, e.g. 18% (9/40) and 8.2% (4/49) of gorillas were reactive with CHIKV-E2 or WNV-NS1, respectively in two different sites in Cameroon. Conclusions/Significance We have developed a serological assay based on Luminex technology, with high specificity and sensitivity for simultaneous detection of antibodies to 10 antigens from 6 different arboviruses. This is the first study that evaluated on a large scale the presence of antibodies to arboviruses in NHPs to evaluate their role in sylvatic cycles. The overall low prevalence (, Author summary In the last decades, chikungunya, zika, yellow fever, usutu and dengue viruses have (re)-emerged in different parts of the world and many of these outbreaks occur in resource-limited countries with limited or under-equipped health facilities and where endemic malaria with very similar clinical symptoms confounds surveillance. Most arboviruses that circulate today likely originated in Africa where sporadic human outbreaks occur. In this work, we developed a serological tool that allows simultaneous detection of IgG antibodies to multiple arbovirus in a biological sample. With this highly sensitive and specific multiplex assay, we screened more than 3,500 samples collected from 29 species of monkeys and apes in Africa. We found a global IgG antibody prevalence of less than 5%. However, this seroprevalence varied by collection site, NPHs species and virus type. Given these findings, we concluded that African non-human primates are most likely not the reservoirs, but rather are intermediate hosts.
Published: 2021

12. La prophylaxie pré-exposition permet de mieux vivre sa sexualité et de guider les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes vers une approche responsable de leur santé : une étude qualitative phénoménologique sur les motivations principales de la PrEP

Author: Gérard Bourrel, Alain Makinson, Marie Bistoquet, Vincent Tribout, Jacques Reynes, Cyril Perrollaz, Agnès Oude Engberink, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Desbrest de santé publique (IDESP), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)
Subjects: Male, lcsh:Immunologic diseases. Allergy, Quality of life, Anti-HIV Agents, media_common.quotation_subject, HIV prevention, Human sexuality, HIV Infections, Men who have sex with men, 03 medical and health sciences, Pre-exposure prophylaxis, Sexual and Gender Minorities, 0302 clinical medicine, Quality of life (healthcare), Nursing, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Virology, Social representation, Qualitative research, Medicine, Humans, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Homosexuality, Male, media_common, Sexual identity, Motivation, 030505 public health, business.industry, Research, 3. Good health, Happiness, Molecular Medicine, Phenomenology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 0305 other medical science, business, lcsh:RC581-607
Abstract: BackgroundPre-exposure prophylaxis (PrEP) for HIV is instrumental in the prevention of HIV for HIV-uninfected persons, by drastically reducing the risk of acquisition in the case of high-risk exposures. Despite its demonstrated efficacy, it remained under-prescribed in France until 2018. The principal aim of this study was to understand the motivations of Men who have Sex with Men (MSM) who started using PrEP in Montpellier, France.MethodsA phenomenological study was undertaken, using semi-structured interviews with twelve participants attending the University Hospital of Montpellier for PrEP. Interviews were analysed by means of triangulation up to the point of theoretical saturation, using a semio-pragmatic method.ResultsFear of HIV infection, personalised regular follow-up, and the wish to take care of one’s health were the primary motivational factors. PrEP allows for a better sexual life restoring a sense of freedom despite the risks of STI, deemed manageable by PrEPers. PrEP does not modify long-term risk-taking behaviours but helps them better live their own sexuality and guides them towards a responsible approach to sexuality. Unclear information on PrEP, delivered by their family doctor, public campaigns or the media, leads to misrepresentations or negative social representation, including within the MSM community, which may delay its implementation.ConclusionsFear of HIV infection and the benefits of regular medical follow-up to take care of one’s health were motivational factors of importance for the use of PrEP by MSM in this study. PrEP transforms all existential dimensions of their lived experience, improving sexual identity and happiness. There is a need to improve professional awareness of the effectiveness of PrEP and to develop a patient centered approach, to disseminate information more widely to the general public and among MSM to reduce stigmatisation.
Published: 2021

13. Pre-exposure prophylaxis makes it possible to better live one’s sexuality and guide men who have sex with men towards a responsible approach to their health: a phenomenological qualitative study about primary motivations for PrEP

Author: Bistoquet, Marie, Makinson, Alain, Tribout, Vincent, Perrollaz, Cyril, Bourrel, Gérard, Reynes, Jacques, Oude Engberink, Agnès, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Desbrest de santé publique (IDESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), and Oude engberink, Agnes
Subjects: Quality of life, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Qualitative research, HIV prevention, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Pre-exposure prophylaxis, Phenomenology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: International audience; Background Pre-exposure prophylaxis (PrEP) for HIV is instrumental in the prevention of HIV for HIV-uninfected persons, by drastically reducing the risk of acquisition in the case of high-risk exposures. Despite its demonstrated efficacy, it remained under-prescribed in France until 2018. The principal aim of this study was to understand the motivations of Men who have Sex with Men (MSM) who started using PrEP in Montpellier, France.Methods A phenomenological study was undertaken, using semi-structured interviews with twelve participants attending the University Hospital of Montpellier for PrEP. Interviews were analysed by means of triangulation up to the point of theoretical saturation, using a semio-pragmatic method.Results Fear of HIV infection, personalised regular follow-up, and the wish to take care of one’s health were the primary motivational factors. PrEP allows for a better sexual life restoring a sense of freedom despite the risks of STI, deemed manageable by PrEPers. PrEP does not modify long-term risk-taking behaviours but helps them better live their own sexuality and guides them towards a responsible approach to sexuality. Unclear information on PrEP, delivered by their family doctor, public campaigns or the media, leads to misrepresentations or negative social representation, including within the MSM community, which may delay its implementation.Conclusions Fear of HIV infection and the benefits of regular medical follow-up to take care of one’s health were motivational factors of importance for the use of PrEP by MSM in this study. PrEP transforms all existential dimensions of their lived experience, improving sexual identity and happiness. There is a need to improve professional awareness of the effectiveness of PrEP and to develop a patient centered approach, to disseminate information more widely to the general public and among MSM to reduce stigmatisation.
Published: 2021

14. Resurgence of Ebola Virus in 2021 in Guinea Suggests a New Paradigm for Outbreaks

Author: Fodé B. Sako, Jacob Camara, Amadou A. Sall, Ariane Düx, Giuditta Annibaldis, Meike Pahlmann, Abdoulaye Toure, Ousmane Faye, Mamadou Condé, Haby Diallo, Steven T. Pullan, Amadou Sidibe, Moriba Povogui, Fara Raymond Koundouno, Christophe Peyrefitte, Liana E. Kafetzopoulou, Alpha Kabinet Keita, Saa L. Millimono, Mandiou Diakite, Ahmadou Doré, Karla Pietro, N'. Faly Magassouba, Fabian H. Leendertz, Nicole Vidal, Stephan Günther, Anke Thielebein, Julia Hinzmann, Dembo Diakite, Ahidjo Ayouba, Cheikh Loucoubar, Kaka Kourouma, Martin Faye, Philippe Lemey, Moussa Moïse Diagne, Mamadou D. Barry, Fodé Y. Soumah, Annick Renevey, Georges Ki-Zerbo, Kékoura Ifono, Andrew Rambaut, Abdoul K. Soumah, Miles W. Carroll, Mamadou S. Bah, Joseph Akoi Bore, Ibrahima Camara, Mamadou S. Sow, Sébastien Calvignac-Spencer, Fodé A. Traore, Sophie Duraffour, Assaïtou Bah, John T. McCrone, Nathalie J. Vielle, Joshua Quick, Noël Tordo, Moussa Baldé, Mamadou Diop, Youssouf Sidibé, Martine Peeters, Madeleine Kourouma, Sakoba Keita, Mamadou B. Keita, Frédéric Le Marcis, Cé D. Saouromou, Anais Legand, Amadou Diallo, Pierre Formenty, Almudena Mari-Saez, Michael R. Wiley, Karifa Kourouma, Eric Delaporte, Barré Soropogui, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université Gamal Abdel Nasser de Conakry, Laboratoire des Fièvres Hémorragiques en Guinée, Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine - Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin [Hamburg, Germany] (BNITM), Institut Pasteur de Dakar, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Robert Koch Institute [Berlin] (RKI), German Center for Infection Research - Partner Site Hamburg-Lübeck-Borstel-Riems, German Centre for Infection Research (DZIF), Centre de Recherche et de Formation en Infectiologie de Guinée [Conakry, Guinée] (CERFIG), Triangle : action, discours, pensée politique et économique (TRIANGLE), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Sciences Po Lyon - Institut d'études politiques de Lyon (IEP Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital National Donka, The Wellcome Trust Centre for Human Genetics [Oxford], University of Oxford, Epidemiology of Highly Pathogenic Microorganisms, Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), CEA Tech Grand-Est (DGDE), CEA Tech en régions (CEA-TECH-Reg), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de Santé Publique [Conakry, Guinée] (INSP), Ministère de la Santé [Conakry, Guinea], Laboratoire de Physique de l'Atmosphère et de l'Océan Siméon Fongang (LPAO-SF), École Supérieure Polytechnique de Dakar (ESP), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Public Health England, University of Birmingham [Birmingham], Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), World Health Organization [Geneva], The University of Texas Medical Branch (UTMB), University of Nebraska Medical Center, University of Nebraska System, Institut Pasteur de Guinée, Unité des Virus Emergents (UVE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Antenne Marseille] (IRBA), University of Edinburgh, Division Prévention et Lutte contre la Maladie, Ministère de la Santé et de l’Hygiène Publique, Ecole Nationale Superieure de Lyon, Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig], Max-Planck-Gesellschaft, ANR-16-IDEX-0006,MUSE,MUSE(2016), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sciences Po Lyon - Institut d'études politiques de Lyon (IEP Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), University of Oxford [Oxford], Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CEA Tech Alsace Champagne-Ardenne Lorraine, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Sciences Po Lyon - Institut d'études politiques de Lyon (IEP Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Michel de l'Hospital : laboratoire de recherche en sciences juridiques et politiques (CMH ), and Université Clermont Auvergne (UCA)
Subjects: Male, Zaire ebolavirus, Time Factors, viruses, Disease, Biology, medicine.disease_cause, Disease cluster, Models, Biological, Viral Zoonoses, Virus, Disease Outbreaks, 03 medical and health sciences, Ebola virus, 0302 clinical medicine, medicine, Animals, Humans, Survivors, 030212 general & internal medicine, Clade, Phylogeny, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Transmission (medicine), Guinea-2021, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Outbreak, Hemorrhagic Fever, Ebola, [SHS.ANTHRO-SE]Humanities and Social Sciences/Social Anthropology and ethnology, Ebolavirus, Virology, 3. Good health, Democratic Republic of the Congo, Female, Persistent Infection, epidemiology, Guinea, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: Seven years after the declaration of the first epidemic of Ebola virus disease in Guinea, the country faced a new outbreak—between 14 February and 19 June 2021—near the epicentre of the previous epidemic1,2. Here we use next-generation sequencing to generate complete or near-complete genomes of Zaire ebolavirus from samples obtained from 12 different patients. These genomes form a well-supported phylogenetic cluster with genomes from the previous outbreak, which indicates that the new outbreak was not the result of a new spillover event from an animal reservoir. The 2021 lineage shows considerably lower divergence than would be expected during sustained human-to-human transmission, which suggests a persistent infection with reduced replication or a period of latency. The resurgence of Zaire ebolavirus from humans five years after the end of the previous outbreak of Ebola virus disease reinforces the need for long-term medical and social care for patients who survive the disease, to reduce the risk of re-emergence and to prevent further stigmatization. The viral lineage responsible for the February 2021 outbreak of Ebola virus disease in Guinea is nested within a clade that predominantly consists of genomes sampled during the 2013–2016 epidemic, suggesting that the virus might have re-emerged after a long period of latency within a previously infected individual.
Published: 2021

15. Spectrum and incidence trends of AIDS and non-AIDS defining cancers between 2010-2015 in the French Dat'AIDS cohort

Author: Isabelle Lamaury, Anne Frésard, Christine Jacomet, Alain Makinson, Tristan Ferry, Clotilde Allavena, Isabelle Poizot-Martin, Olivia Zaegel-Faucher, Pascal Pugliese, Catherine Chirouze, T. Huleux, David Rey, Véronique Obry-Roguet, Claudine Duvivier, Firouzé Bani-Sadr, Pierre Delobel, Antoine Cheret, Caroline Lions, Sylvie Bregigeon, Teresa Rojas Rojas, André Cabié, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), School of Civil and Environmental Engineering [Sydney], University of New South Wales [Sydney] (UNSW), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU de la Martinique [Fort de France], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Universitaire Marseille, CHU Marseille, Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Cholley, Pascal, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Aix Marseille Université (AMU), Hôtel-Dieu de Nantes, Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Le Trait d'Union, centre de soins de l'infection par le VIH [CHU Strasbourg], CHU Strasbourg, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris] (IP), Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université Côte d'Azur (UCA), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital JeanMinjoz, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), GReCSS - IRD UMI233, Maison méditerranéenne des sciences de l'Homme (MMSH), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre Médical de l'Institut Pasteur, Institut Pasteur [Paris], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), and BONIZEC, Sandrine
Subjects: 0301 basic medicine, Oncology, Adult, Male, medicine.medical_specialty, Adolescent, Epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, education, History, 21st Century, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, Prostate cancer, Young Adult, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Prostate, Internal medicine, Neoplasms, medicine, Humans, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Aged, Cervical cancer, Aged, 80 and over, education.field_of_study, Acquired Immunodeficiency Syndrome, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, business.industry, Incidence (epidemiology), Incidence, Cancer, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, Female, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Background: Cancer risk is higher in people living with HIV (PLWH) compared with the general population, and cancers related to age are expected to be most prevalent. Methods: We determined the spectrum and incidence rates of AIDS-defining cancers (ADC) and non–AIDS-defining cancers (NADC) and of lung, Hodgkin lymphoma (HL), head and neck (HNC), colon–rectum, anal, liver, breast, prostate, and urinary bladder cancers between January 2010 and December 2015 in the French Dat'AIDS cohort. Incidence rates were calculated by year and compared using the χ2 test for linear trend. Standardized incidence ratios [SIR (95% confidence interval)] were calculated relative to the French general population. Results: Among 44,642 patients, corresponding to 180,216.4 person-years (PY), 1,440 cancer cases occurred in 1,314 patients. ADC incidence was 191.4 (172.3–212.7)/105 PY and declined over time overall and in men, whereas NADC incidence was higher [548.8 (515.6–584.1)/105 PY] and did not change. In men, non-Hodgkin lymphoma was the most common cancer, but prostate cancer had the highest incidence among NADCs. Breast cancer was the most common cancer in women. SIRs were higher for cervical cancer [1.93 (1.18–3.14)], HNC in women [2.4 (1.4–4.2)], liver [overall: 3.8 (3.1–4.6); men: 3.2 (2.5–4.0); women: 12.9 (8.3–20.0)], and HL [overall: 13.8 (11.1–17.1); men: 16.2 (12.9–20.4); women: 6.2 (3.22–11.9)] but lower for lung [overall: 0.7 (0.6–0.9); men: 0.7 (0.5–0.8)], prostate [0.6 (0.5–0.7)], and breast cancers [0.6 (0.4–0.7)]. Conclusions: Spectrum of NADCs has changed, with prostate and breast cancers becoming the most common despite their lower SIR. Impact: These results confirm the need to maintain regular epidemiologic cancer monitoring in order to update screening guidelines.
Published: 2020

16. MDR M. tuberculosis outbreak clone in Eswatini missed by Xpert has elevated bedaquiline resistance dated to the pre-treatment era

Author: Elisabeth Sanchez-Padilla, Nazir Ahmed Ismail, Thomas Kohl, Christian Utpatel, Patrick Beckert, Stefan Niemann, Claudio U. Köser, Harald Hoffmann, Sönke Andres, Robin M. Warren, Bouke C. de Jong, Marisa Klopper, Matthias Merker, Florian P. Maurer, Shaheed V. Omar, Katharina Kranzer, Maryline Bonnet, Bernhard Kerschberger, Viola Dreyer, Ivan Barilar, Elisa Ardizzoni, Birgit Schramm, Gugu Maphalala, Forschungszentrum Borstel - Research Center Borstel, German Center for Infection Research (DZIF), Heidelberg University, Epicentre [Paris] [Médecins Sans Frontières], University of Cambridge [UK] (CAM), National Institute for Communicable Diseases [Johannesburg] (NICD), University of Pretoria [South Africa], University of the Witwatersrand [Johannesburg] (WITS), Stellenbosch University, Institute of Tropical Medicine [Antwerp] (ITM), London School of Hygiene and Tropical Medicine (LSHTM), Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg] (UKE), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Namibia (UNAM), Parts of this work have been supported by the European Union TB-PAN-NET (FP7-223681) project, by Médecins Sans Frontières-Switzerland, and by German Center for Infection Research, Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under Germanys Excellence Strategy – EXC 2167, and Leibniz Science Campus Evolutionary Medicine of the LUNG (EvoLUNG). The funders had no role in the study design, in the collection, analysis, and interpretation of the data, in the writing of the report, and in the decision to submit the paper for publication., European Project: 223681,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,TB PAN-NET(2009), Niemann, Stefan [0000-0002-6604-0684], and Apollo - University of Cambridge Repository
Subjects: 0301 basic medicine, MESH: Mycobacterium tuberculosis, Antitubercular Agents, Drug resistance, Multidrug resistance, Disease Outbreaks, Clofazimine, chemistry.chemical_compound, Tuberculosis, Multidrug-Resistant, MESH: Disease Outbreaks, Diarylquinolines, MESH: Bacterial Proteins, Genetics (clinical), MESH: Microbial Sensitivity Tests, Resistance mutation, MESH: Diarylquinolines, Mycobacterium tuberculosis complex, Molecular Medicine, medicine.drug, MESH: Mutation, Tuberculosis, 030106 microbiology, Microbial Sensitivity Tests, Biology, 03 medical and health sciences, Bacterial Proteins, MESH: Eswatini, Genetics, medicine, Humans, Molecular Biology, MESH: Tuberculosis, Multidrug-Resistant, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, MESH: Humans, Diagnostice escape, Research, MESH: Clone Cells, Resistance evolution, Treatment escape, Mycobacterium tuberculosis, rpoB, medicine.disease, biology.organism_classification, MESH: Antitubercular Agents, Virology, Clone Cells, Multiple drug resistance, MDR outbreak strains, 030104 developmental biology, chemistry, Treatment failure, Mutation, Bedaquiline, Eswatini
Abstract: Background Multidrug-resistant (MDR) Mycobacterium tuberculosis complex strains not detected by commercial molecular drug susceptibility testing (mDST) assays due to the RpoB I491F resistance mutation are threatening the control of MDR tuberculosis (MDR-TB) in Eswatini. Methods We investigate the evolution and spread of MDR strains in Eswatini with a focus on bedaquiline (BDQ) and clofazimine (CFZ) resistance using whole-genome sequencing in two collections ((1) national drug resistance survey, 2009–2010; (2) MDR strains from the Nhlangano region, 2014–2017). Results MDR strains in collection 1 had a high cluster rate (95%, 117/123 MDR strains) with 55% grouped into the two largest clusters (gCL3, n = 28; gCL10, n = 40). All gCL10 isolates, which likely emerged around 1993 (95% highest posterior density 1987–1998), carried the mutation RpoB I491F that is missed by commercial mDST assays. In addition, 21 (53%) gCL10 isolates shared a Rv0678 M146T mutation that correlated with elevated minimum inhibitory concentrations (MICs) to BDQ and CFZ compared to wild type isolates. gCL10 isolates with the Rv0678 M146T mutation were also detected in collection 2. Conclusion The high clustering rate suggests that transmission has been driving the MDR-TB epidemic in Eswatini for three decades. The presence of MDR strains in Eswatini that are not detected by commercial mDST assays and have elevated MICs to BDQ and CFZ potentially jeopardizes the successful implementation of new MDR-TB treatment guidelines. Measures to limit the spread of these outbreak isolates need to be implemented urgently.
Published: 2020

17. Kaposi sarcoma among people living with HIV in the French DAT'AIDS cohort between 2010 and 2015

Author: Obry-Roguet, Véronique, Duvivier, Claudine, Lions, Caroline, Huleux, Thomas, Jacomet, Christine, Ferry, Tristan, Cheret, Antoine, Allavena, Clotilde, Bani-Sadr, Firouzé, Palich, Romain, Cabié, André, Pugliese, Pascal, Delobel, Pierre, Lamaury, Isabelle, Hustache-Mathieu, Laurent, Bregigeon, Sylvie, Makinson, Alain, Rey, David, Poizot-Martin, Isabelle, Hustache‐Mathieu, Laurent, Drobacheff‐Thiébaut, C., Foltzer, A., Bouiller, K., Hustache‐ Mathieu, L., Chirouze, C., LEPILLER, Q., Bozon, F., Babre, O, Brunel, A.S., Muret, P., Laurichesse, H., Lesens, O., Vidal, M., Mrozek, N., Aumeran, C., Baud, O., Corbin, V., Letertre‐Gibert, P., Casanova, S., Prouteau, J., Fabre, I., Curlier, E., Ouissa, R., Herrmann‐Storck, C., Tressieres, B., Bonijoly, T., Receveur, M.C., Boulard, F., Daniel, C., Clavel, C., Merrien, D., Perré, P., Guimard, T., Bollangier, O., Leautez, S., Morrier, M., Laine, L., Ader, F., Becker, A., Biron, F., Boibieux, A., Cotte, L., Miailhes, P., Perpoint, T., Roux, S., Triffault‐Fillit, C., Degroodt, S., Brochier, C., Valour, F., Chidiac, C., Ménard, A., Belkhir, A.Y., Colson, P., Dhiver, C., Madrid, A., Martin‐Degioanni, M., Meddeb, L., Mokhtari, M., Motte, A., Raoux, A., Ravaux, I., Tamalet, C., Tomei, C., Tissot Dupont, H., Zaegel‐Faucher, O., Obry‐Roguet, Véronique, Laroche, H, Orticoni, M., Soavi, M.J., Geneau de Lamarlière, P, Ressiot, E, Ducassou, M.J., Jaquet, I., Galie, S., Galinier, A., Martinet, P., Landon, M., Ritleng, A.S., Ivanova, A., Debreux, C., Poizot‐Martin, I., Abel, S., Cabras, O., Cuzin, L., Guitteaud, K., Illiaquer, M., Pierre‐François, S., Osei, L., Pasquier, J., Rome, K., Sidani, E., Turmel, JM, Varache, C., Atoui, N., Bistoquet, M., Delaporte, E., Le Moing, V., Meftah, N., Merle de Boever, C., Montes, B., Montoya Ferrer, A., Tuaillon, E., Reynes, J., André, M., Boyer, L., Bouillon, MP., Delestan, M., Rabaud, C., May, T., Hoen, B., Bernaud, C., Billaud, E., Biron, C., Bonnet, B., Bouchez, S., Boutoille, D., Brunet‐Cartier, C., Deschanvres, C., Hall, N., Morineau, P., Reliquet, V., Sécher, S., Cavellec, M., Soria, A., Paredes, E., Ferre, V., André‐Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M., Grossi, O., Aubry, O., Raffi, F., Breaud, S., Ceppi, C., Chirio, D., Cua, E., Dellamonica, P., Demonchy, E., De Monte, A., Durant, J., Etienne, C., Ferrando, S., Garraffo, R., Michelangeli, C., Mondain, V., Naqvi, A., Oran, N., Perbost, I., Pillet, S., Pradier, C., Prouvost‐Keller, B., Risso, K., Rio, V., Roger, PM., Rosenthal, E., Sausse, S., Touitou, I., Wehrlen‐Pugliese, S., Zouzou, G., Hocqueloux, L., Prazuck, T., Gubavu, C., Sève, A., Maka, A., Boulard, C., Thomas, G., Lerolle, N., Landman, R., Joly, V., Ghosn, J., Rioux, C., Lariven, S., Gervais, A., Lescure, F.X., Matheron, S., Louni, F., Julia, Z., Mackoumbou‐Nkouka, C., Le Gac, S., Charpentier, C., Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G., Bossi, P., Cessot, G., Charlier, C., Consigny, P.H., Danion, F., Dureault, A., Goesch, J., Guery, R., Henry, B., Jidar, K., Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C., Lourenco, J., Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M.A., Tubiana, R., Agher, R, Seang, S., Schneider, L., Blanc, C., Katlama, C., Berger, J.L., N'guyen, Y., Lambert, D., Kmiec, I., Hentzien, M., Brunet, A., Brodard, V., Bani‐Sadr, Firouze, Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat‐Delon, S., Chapplain, J.M., Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., Maillard, A., Pronier, C., Lemaitre, F., Guennoun, C., Poisson‐Vanier, M., Jovelin, T., Sinteff, J.P., Arvieux, C., Botelho‐Nevers, E., Gagneux‐Brunon, A., Frésard, Anne, Ronat, V., Lucht, F., Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, ML, Bernard‐Henry, C, de Mautort, E, Fafi‐Kremer, S., Alvarez, M., Biezunski, N., Debard, A., Delpierre, C., Lansalot, P., Lelievre, L., Martin‐Blondel, G., Piffaut, M., Porte, L., Saune, K., Ajana, F., Aïssi, E., Alcaraz, I., Baclet, V., Bocket, L., Boucher, A., Choisy, P., Lafon‐Desmurs, B., Meybeck, A., Pradier, M., Robineau, O., Viget, N., Valette, M., Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Tourcoing, Département des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services des maladies infectieuses [CH Turcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Alliance for International medical Action (ALIMA), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire d'Ingénierie Circulation Transport (LICIT), Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Université de Lyon, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU Besançon), Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Gabriel Montpied, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Gabriel Montpied (CHU), CHU Clermont-Ferrand, CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Montpellier Research in Management (MRM), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathologies Pulmonaires et Plasticité Cellulaire - UMR-S 1250 (P3CELL), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurobiologie, plasticité tissulaire et métabolisme énergétique (NPTME), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CECIL, Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre IRD de Montpellier (IRD), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Service de virologie [CHU Nantes], Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Public Health Department, Hôpital de l'Archet, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Infectious Diseases Department, Université Montpellier 1 (UM1), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Régional de recherche et de Formation à la prise en charge Clinique de Fann (CRCF), CHNU Fann, Registre EPIMAD, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Laboratoire d'aérologie (LA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), University Hospital and University Jean Monnet, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virologie et pathogenèse virale (VPV), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Département d'Hématologie Clinique [CHU Nantes] (Hôtel-Dieu), Hôtel-Dieu de Nantes-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Dermatologie et Maladies infectieuses [Pointe-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre de Gestion du Risque Infectieux Nosocomial [Pointe-à-Pitre] (CGRIN), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dat'AIDS study group: C Drobacheff-Thiébaut, A Foltzer, K Bouiller, C Chirouze, Q Lepiller, F Bozon, O Babre, A S Brunel, P Muret, H Laurichesse, O Lesens, M Vidal, N Mrozek, C Aumeran, O Baud, V Corbin, P Letertre-Gibert, S Casanova, J Prouteau, I Fabre, E Curlier, R Ouissa, C Herrmann-Storck, B Tressieres, T Bonijoly, M C Receveur, F Boulard, C Daniel, C Clavel, D Merrien, P Perré, T Guimard, O Bollangier, S Leautez, M Morrier, L Laine, F Ader, A Becker, F Biron, A Boibieux, L Cotte, P Miailhes, T Perpoint, S Roux, C Triffault-Fillit, S Degroodt, C Brochier, F Valour, C Chidiac, A Ménard, A Y Belkhir, P Colson, C Dhiver, A Madrid, M Martin-Degioanni, L Meddeb, M Mokhtari, A Motte, A Raoux, I Ravaux, C Tamalet, C Toméi, H Tissot Dupont, O Zaegel-Faucher, H Laroche, M Orticoni, M J Soavi, P Geneau de Lamarlière, E Ressiot, M J Ducassou, I Jaquet, S Galie, A Galinier, P Martinet, M Landon, A S Ritleng, A Ivanova, C Debreux, S Abel, O Cabras, L Cuzin, K Guitteaud, M Illiaquer, S Pierre-François, L Osei, J Pasquier, K Rome, E Sidani, J M Turmel, C Varache, N Atoui, M Bistoquet, E Delaporte, V Le Moing, N Meftah, C Merle de Boever, B Montes, A Montoya Ferrer, E Tuaillon, J Reynes, M André, L Boyer, M P Bouillon, M Delestan, C Rabaud, T May, B Hoen, C Bernaud, E Billaud, C Biron, B Bonnet, S Bouchez, D Boutoille, C Brunet-Cartier, C Deschanvres, N Hall, T Jovelin, P Morineau, V Reliquet, S Sécher, M Cavellec, A Soria, E Paredes, V Ferré, E André-Garnier, A Rodallec, M Lefebvre, O Grossi, O Aubry, F Raffi, S Breaud, C Ceppi, D Chirio, E Cua, P Dellamonica, E Demonchy, A De Monte, J Durant, C Etienne, S Ferrando, R Garraffo, C Michelangeli, V Mondain, A Naqvi, N Oran, I Perbost, S Pillet, C Pradier, B Prouvost-Keller, K Risso, V Rio, P M Roger, E Rosenthal, S Sausse, I Touitou, S Wehrlen-Pugliese, G Zouzou, L Hocqueloux, T Prazuck, C Gubavu, A Sève, A Maka, C Boulard, G Thomas, C Goujard, Y Quertainmont, E Teicher, N Lerolle, O Deradji, A Barrail-Tran, R Landman, V Joly, J Ghosn, C Rioux, S Lariven, A Gervais, F X Lescure, S Matheron, F Louni, Z Julia, C Mackoumbou-Nkouka, S Le Gac, C Charpentier, D Descamps, G Peytavin, Y Yazdanpanah, K Amazzough, G Benabdelmoumen, P Bossi, G Cessot, C Charlier, P H Consigny, F Danion, A Dureault, J Goesch, R Guery, B Henry, K Jidar, F Lanternier, P Loubet, O Lortholary, C Louisin, J Lourenco, P Parize, B Pilmis, F Touam, M A Valantin, R Tubiana, R Agher, S Seang, L Schneider, C Blanc, C Katlama, J L Berger, Y N'Guyen, D Lambert, I Kmiec, M Hentzien, A Brunet, V Brodard, P Tattevin, M Revest, F Souala, M Baldeyrou, S Patrat-Delon, J M Chapplain, F Benezit, M Dupont, M Poinot, A Maillard, C Pronier, F Lemaitre, C Guennoun, M Poisson-Vanier, T Jovelin, J P Sinteff, C Arvieux, E Botelho-Nevers, A Gagneux-Brunon, A Frésard, V Ronat, F Lucht, P Fischer, M Partisani, C Cheneau, M Priester, M L Batard, C Bernard-Henry, E de Mautort, S Fafi-Kremer, M Alvarez, N Biezunski, A Debard, C Delpierre, P Lansalot, L Lelièvre, G Martin-Blondel, M Piffaut, L Porte, K Saune, F Ajana, E Aïssi, I Alcaraz, V Baclet, L Bocket, A Boucher, P Choisy, B Lafon-Desmurs, A Meybeck, M Pradier, O Robineau, N Viget, M Valette., Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut Pasteur [Paris], Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, and Dupuis, Christine
Subjects: 0301 basic medicine, Pediatrics, medicine.medical_specialty, MESH: Sarcoma, Kaposi* / epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, HIV Infections, Dermatology, Skin Infectiology, Venereology and Sexual Health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), medicine, Humans, MESH: HIV Infections* / complications, 030212 general & internal medicine, Sarcoma, Kaposi, Retrospective Studies, Response rate (survey), MESH: Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Herpesvirus 8, Human, Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Humans, business.industry, Kaposi sarcoma, HIV, Retrospective cohort study, MESH: Retrospective Studies, MESH: HIV Infections* / drug therapy, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], medical dermatology, Regimen, Infectious Diseases, Clinical research, clinical research, Herpesvirus 8, Human, Cohort, oncology, Original Article, Sarcoma, business, Viral load, MESH: HIV Infections* / epidemiology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Background - Although antiretroviral therapy (ART) has reduced the risk of Kaposi sarcoma (KS), KS cases still occur in HIV-infected people. Objective - To describe all KS cases observed between 2010 and 2015 in a country with high ART coverage. Methods - Retrospective study using longitudinal data from 44 642 patients in the French Dat'AIDS multicenter cohort. Patients' characteristics were described at KS diagnosis according to ART exposure and to HIV-plasma viral load (HIV-pVL) (≤50 or >50) copies/mL. Results - Among the 209 KS cases diagnosed during the study period, 33.2% occurred in ART naïve patients, 17.3% in ART-experienced patients and 49.5% in patients on ART, of whom 23% for more than 6 months. Among these patients, 24 (11.5%) had HIV-pVL ≤50 cp/mL, and 16 (66%) were treated with a boosted-PI-based regimen. The distribution of KS localization did not differ by ART status nor by year of diagnosis. Limitations - Data on human herpesvirus 8, treatment modalities for KS and response rate were not collected. Conclusion - Half of KS cases observed in the study period occurred in patients not on ART, reflecting the persistence of late HIV diagnosis. Factors associated with KS in patients on ART with HIV-pVL ≤50 cp/mL remain to be explored.
Published: 2020

18. Potential lung cancer screening outcomes using different age and smoking thresholds in the ANRS-CO4 French Hospital Database on HIV cohort

Author: Marguerite Guiguet, Alain Makinson, Bernard Milleron, Jacques Reynes, Sophie Grabar, Dominique Costagliola, F. Lert, David Morquin, V. Le Moing, Laure Tron, Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Unité de recherche interdisciplinaire pour la prévention et le traitement des cancers (ANTICIPE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Intergroupe Francophone de Cancérologie Thoracique [Paris] (IFCT), Intergroupe Francophone de Cancérologie thoracique, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, GRABAR, SOPHIE, Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-UNICANCER, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Sorbonne Université (SU), and Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Lung Neoplasms, Future studies, Human immunodeficiency virus (HIV), HIV Infections, computer.software_genre, medicine.disease_cause, [SDV.MHEP.PSR]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Sida, Early Detection of Cancer, Immunodeficiency, Aged, 80 and over, Database, biology, Health Policy, Age Factors, Middle Aged, 3. Good health, Infectious Diseases, medicine.anatomical_structure, Cohort, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Female, France, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, smoking, 03 medical and health sciences, medicine, Humans, Lung cancer, Aged, Lung, business.industry, screening, HIV, medicine.disease, biology.organism_classification, 030112 virology, lung cancer, age, [SDV.MHEP.PSR] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Tomography, X-Ray Computed, business, computer, Lung cancer screening
Abstract: International audience; Objectives: In most lung screening programmes, only subjects ≥ 55 years old and smoking ≥ 30 pack-years are eligible to undergo chest low-dose computed tomography. Whether the same criteria should apply to people living with HIV (PLHIV) is uncertain, given the increased lung cancer risks associated with immunodeficiency and high rates of smoking. We assessed different outcomes obtained from simulating one round of lung cancer screening in PLHIV using different age and smoking thresholds for eligibility.Methods: Data from the French Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les Hépatites Virales (ANRS)-CO4 French Hospital Database on HIV (FHDH) cohort of PLHIV and a national representative survey of PLHIV in care in 2011 (the ANRS-VESPA2 [enquête sur les personnes atteintes] study) were used to estimate the maximum proportion of incident lung cancers occurring between 2012 and 2016 that would have potentially been detected by screening in 2011. Secondary outcomes were numbers of eligible subjects in the cohort and numbers of subjects needed to screen (NNS) to detect one lung cancer.Results: Among 77819 PLHIV in 2011 (median age 46 years; 66% men), 285 subjects subsequently developed lung cancer. Adoption of the US Preventive Services Task Force (USPSTF) recommendations (55-80 years; ≥ 30 pack-years) would have detected 31% of lung cancers at most. Lowering the minimum age to 50 and 45 years would have detected 49% and 60% of cancers, respectively, but would have greatly increased the number of eligible subjects and the NNS to detect one case of lung cancer.Conclusions: Use of the USPSTF criteria would have detected only a minority of lung cancers in a large French cohort of PLHIV in 2011. Screening PLHIV at younger ages (45 or 50 years) and/or the use of lower smoking thresholds (20 pack-years) may be beneficial, despite the consequently higher numbers of eligible subjects and NNS to detect one case of lung cancer, and should be evaluated in future studies.
Published: 2019

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18 results on '"Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)"'

1. Evaluating post-treatment Loa loa microfilarial densities to classify serious adverse events caused by ivermectin: a retrospective analysis

2. Concomitant and productive genital infections by HSV-2 and HPV in two young women: A case report

3. [Survey on HIV, HBV and HCV screening practices in cancerology, France]

4. RNA testing for the diagnosis of acute hepatitis A during the 2017 outbreak in France

5. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Nucleocapsid Antigen in Urine of Hospitalized Patients With Coronavirus Disease 2019

6. Assessing fetal growth in Africa: Application of the international WHO and INTERGROWTH-21st standards in a Beninese pregnancy cohort

7. Incidence of cervical, breast and colorectal cancers between 2010 and 2015 in people living with HIV in France

8. An open-label randomized controlled trial of the effect of lopinavir/ritonavir, lopinavir/ritonavir plus IFN-β-1a and hydroxychloroquine in hospitalized patients with COVID-19

9. Residual Viremia Is Linked to a Specific Immune Activation Profile in HIV-1-Infected Adults Under Efficient Antiretroviral Therapy

10. Intimate partner violence by men living with HIV in Cameroon: Prevalence, associated factors and implications for HIV transmission risk (ANRS-12288 EVOLCAM)

11. Multiplex detection of antibodies to Chikungunya, O’nyong-nyong, Zika, Dengue, West Nile and Usutu viruses in diverse non-human primate species from Cameroon and the Democratic Republic of Congo

12. La prophylaxie pré-exposition permet de mieux vivre sa sexualité et de guider les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes vers une approche responsable de leur santé : une étude qualitative phénoménologique sur les motivations principales de la PrEP

13. Pre-exposure prophylaxis makes it possible to better live one’s sexuality and guide men who have sex with men towards a responsible approach to their health: a phenomenological qualitative study about primary motivations for PrEP

14. Resurgence of Ebola Virus in 2021 in Guinea Suggests a New Paradigm for Outbreaks

15. Spectrum and incidence trends of AIDS and non-AIDS defining cancers between 2010-2015 in the French Dat'AIDS cohort

16. MDR M. tuberculosis outbreak clone in Eswatini missed by Xpert has elevated bedaquiline resistance dated to the pre-treatment era

17. Kaposi sarcoma among people living with HIV in the French DAT'AIDS cohort between 2010 and 2015

18. Potential lung cancer screening outcomes using different age and smoking thresholds in the ANRS-CO4 French Hospital Database on HIV cohort

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