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1. Trophic position increases with thermocline depth in yellowfin and bigeye tuna across the Western and Central Pacific Ocean

Author

Aurore Receveur, Lydie I. E. Couturier, Heidi Pethybridge, Jean-Marie Munaron, Elodie Vourey, Yves Letourneur, Patrick Raimbault, Brittany S. Graham, Tsuguo Otake, Sophie Bonnet, Eric Feunteun, Laura Tremblay-Boyer, Valerie Allain, Anne Lorrain, Petra M. Kuhnert, Christophe E. Menkès, Brian P. V. Hunt, Martine Rodier, Bruno Leroy, Benoit Lebreton, Patrick Houssard, David Point, Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Insulaire du Vivant et de l'Environnement (LIVE), Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pacific community (SPC), National Institute of Water and Atmospheric Research [Wellington] (NIWA), Processus de couplage à Petite Echelle, Ecosystèmes et Prédateurs Supérieurs (PEPS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Subjects
0106 biological sciences, Delta, Yellowfin tuna, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Mesopelagic zone, Depth of the 20°C isotherm, Bigeye tuna, Aquatic Science, 01 natural sciences, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Isoscapes Bigeye tuna, Compound-specific isotope analysis, 14. Life underwater, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Trophic level, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, POM, biology, Depth of the 20 degrees C isotherm, 010604 marine biology & hydrobiology, Nitrogen isotopes, ACL, Biochemical markers, food and beverages, Geology, biology.organism_classification, Food web, Amino acid, Fishery, Oceanography, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Tuna, Thermocline, human activities
Abstract

International audience; Estimates of trophic position are used to validate ecosystem models and understand food web structure. A consumer's trophic position can be estimated by the stable nitrogen isotope values (delta N-15) of its tissue, once the baseline isotopic variability has been accounted for. Our study established the first data-driven baseline delta N-15 isoscape for the Western and Central Pacific Ocean using particulate organic matter. Bulk delta N-15 analysis on 1039 muscle tissue of bigeye and yellowfin tuna were conducted together with amino acid compound-specific delta N-15 analysis (AA-CSIA) on a subset of 21 samples. Both particulate organic matter and tuna bulk delta N-15 values varied by more than 10 parts per thousand across the study area. Fine-scaled trophic position maps were constructed and revealed higher tuna trophic position (by similar to 1) in the southern latitudes compared to the equator. AA-CSIA confirmed these spatial patterns for bigeye and, to a lesser extent, yellowfin tuna. Using generalized additive models, spatial variations of tuna trophic positions were mainly related to the depth of the 20 degrees C isotherm, a proxy for the thermocline behavior, with higher tuna trophic position estimates at greater thermocline depths. We hypothesized that a deeper thermocline would increase tuna vertical habitat and access to mesopelagic prey of higher trophic position. Archival tagging data further suggested that the vertical habitat of bigeye tuna was deeper in the southern latitudes than at the equator. These results suggest the importance of thermocline depth in influencing tropical tuna diet, which affects their vulnerability to fisheries, and may be altered by climate change.

Published
2017

2. Impact of ashes from the 2022 Tonga volcanic eruption on satellite ocean color signatures

Author

Whiteside, Andra, Dupouy, Cécile, Singh, Awnesh, Bani, Philipson, Tan, Jing, Frouin, Robert, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PACE-SD, University of the South Pacific (USP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Laboratoire Magmas et Volcans (LMV), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement et la société-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Observatoire de Physique du Globe de Clermont-Ferrand (OPGC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Scripps Institution of Oceanography (SIO - UC San Diego), University of California [San Diego] (UC San Diego), and University of California (UC)-University of California (UC)

Subjects
HTHH, particle backscattering, remote sensing, Global and Planetary Change, chlorophyll-a (Chl-a), volcanic ash, [SDU.STU]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences, Ocean Engineering, ocean currents, Aquatic Science, light attenuation, Oceanography, Water Science and Technology
Abstract

A powerful eruption within the Hunga Tonga-Hunga Ha’apai (HTHH) volcano (20.64°S, 175.19°W) in the Kingdom of Tonga, occurred on 15 January 2022. The volcanic blast was enormous, leading many scientists to investigate the full impact and magnitude of this event via satellite observations. In this study, we describe a new ocean color signature from a discolored water patch created by the HTHH eruption using NASA and CMEMS products of satellite-derived biological and optical properties. Elevated surface chlorophyll-a concentration (Chl-a) between 0.15 to 2.7 mg.m-3 was not associated with phytoplankton growth, but to basalt-andesitic ash material expelled by the volcano and into the ocean, which resulted in erroneous Chl-a estimates. Distribution of the patch over time was aligned with CMEMS ocean currents for 19 days. The gradual decrease of light attenuation or diffuse attenuation coefficient for downward irradiance at 490 nm, Kd(490), was interpreted as due to the sinking of ash particles with time. It is suggested that due to high porosity of 30-40%, a density close to that of seawater, ash particles stay suspended in the water column for more than 10 days with sustained high values of satellite-derived Chl-a, Kd(490), and particulate backscattering coefficient at 443 nm. The high attenuation of light due to ash, reducing the penetration depth to less than 10 meters during the first period after the eruption may have had implications on ecological processes and biogeochemical cycles in Tongan waters.

Published
2023

3. Amélioration et harmonisation des indices de recharge d'El Niño

Author

Maxime Colin, Takeshi Izumo, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de la Polynésie Française (UPF), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)

Subjects
warm water volume (WWV) optimisation, El Nino Southern Oscillation (ENSO), Geophysics, [SDE]Environmental Sciences, General Earth and Planetary Sciences, oceanic metrics for Recharge Oscillator conceptual model, climate seasonal operational forecasts, El Nino Southern Oscillation ENSO, equatorial and south west tropical Pacific, recharge and discharge process, ENSO simple models, seasonal climate and ocean forecast and operational diagnostics
Abstract

El Niño Southern Oscillation (ENSO) is the leading mode of interannual climate variability, with large socioeconomical and environmental impacts. The main conceptual model for ENSO, the Recharge Oscillator (RO), considers two independent modes: the fast zonal tilt mode in phase with central-eastern Pacific Temperature (Te), and the slow recharge mode in phase quadrature. However, usual indices (western or equatorial sea level/thermocline depth h) do not orthogonally isolate the slow recharge mode, leaving it correlated with Te. Furthermore the optimal index is currently debated. Here, we develop an improved recharge index by objectively optimizing the RO equations fit to observations. (a) Te-variability is regressed out, to build hind statistically-independent from Te. Capturing the pure recharge, hind reconciles usual indices. (b) The optimum is equatorial plus southwestern Pacific hind_eq+sw (because of ENSO Ekman pumping meridional asymmetry). Using hind_eq+sw, the RO becomes more consistent with observations. hind_eq+sw is more relevant for ENSO operational diagnostics. Key Points To clarify the debate on the Recharge Oscillator index, we develop an objective approach optimizing equation fit to observations The recharge index must be based on the slow component of sea level/thermocline depth, taken independently from the fast zonal tilt mode: this reconciles usual metrics The optimal index is this independent component averaged in the equatorial and southwestern Pacific. It is better suited for operational diagnostics Plain Language Summary El Niño and La Niña events have important impacts globally. A key element for long-lead forecasts is the recharge state of the tropical Pacific Ocean, as captured in the Recharge Oscillator (RO) conceptual model. The RO considers two independent modes of oceanic variability, a fast adjustment process and a slow recharge/discharge process. However, usual recharge indices mix these two modes of variability, and can thus lead to ambiguous operational diagnostics of the actual oceanic recharge state. Here we develop a better recharge index, independent of the fast mode, which reconciles typical indices and allows us to go beyond the current geographical debate on the optimal metrics. We use an objective approach optimizing the RO resemblance to observations to find the optimal index: the independent sea level (or equivalently thermocline depth) averaged over the equatorial and southwestern tropical Pacific. We recommend this simple and unambiguous index for El Niño operational forecasts diagnostics.

Published
2022

4. Thyroid Doses to French Polynesians Resulting from Atmospheric Nuclear Weapons Tests: Estimates Based on Radiation Measurements and Population Lifestyle Data

Author

Drozdovitch, Vladimir, Bouville, André, Taquet, Marc, Gardon, J., Tetuanui, Tetuaura, Xhaard, Constance, Ren, Yan, Doyon, Françoise, de Vathaire, Florent, National Cancer Institute [Bethesda] (NCI-NIH), National Institutes of Health [Bethesda] (NIH), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Gustave Roussy (IGR), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Gardon, Jacques

Subjects
Male, Radioactive Fallout, Neoplasms, Radiation-Induced, Epidemiology, Health, Toxicology and Mutagenesis, Thyroid Gland, Physiology, 030218 nuclear medicine & medical imaging, thyroid, Iodine Radioisotopes, Eating, 0302 clinical medicine, Pregnancy, health effects, Ingestion, Thyroid cancer, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, 80 and over, Nuclear Weapons, education.field_of_study, Thyroid, Middle Aged, Radiation Exposure, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Inhalation, Prenatal Exposure Delayed Effects, 030220 oncology & carcinogenesis, Total dose, Female, radiation dose, nuclear weapons, Population, Water Pollution, Radioactive, chemistry.chemical_element, Radiation Dosage, Iodine, Polynesia, Article, 03 medical and health sciences, Fetus, medicine, Humans, Dosimetry, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, Thyroid Neoplasms, education, Food Contamination, Radioactive, Life Style, Aged, Radionuclide, business.industry, Infant, Newborn, Infant, History, 20th Century, medicine.disease, chemistry, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Case-Control Studies, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business
Abstract

Thyroid doses were estimated for the subjects of a population-based case-control study of thyroid cancer in a population exposed to fallout after atmospheric nuclear weapons tests conducted in French Polynesia between 1966 and 1974. Thyroid doses due to (i) intake of (131)I and of short-lived radioiodine isotopes ((132)I, (133)I, (135)I) and (132)Te, (ii) external irradiation from gamma-emitting radionuclides deposited on the ground, and (iii) ingestion of long-lived (137)Cs with foodstuffs were reconstructed for each study subject. The dosimetry model that had been used in 2008 in Phase I of the study was substantially improved with (i) results of radiation monitoring of the environment and foodstuffs, which became available in 2013 for public access, and (ii) historical data on population lifestyle related to the period of the tests, which were collected in 2016–2017 using focus-group discussions and key informant interviews. The mean thyroid dose among the study subjects was found to be around 5 mGy while the highest dose was estimated to be around 36 mGy. Doses from (131)I intake ranged up to 27 mGy, while those from intake of short-lived iodine isotopes ((132)I, (133)I, (135)I) and (132)Te ranged up to 14 mGy. Thyroid doses from external exposure ranged up to 6 mGy and those from internal exposure due to (137)Cs ingestion did not exceed 1 mGy. Intake of (131)I was found to be the main pathway for thyroid exposure accounting for 72% of the total dose. Results of this study are being used to evaluate the risk of thyroid cancer among the subjects of the epidemiologic study of thyroid cancer among French Polynesians.

Published
2021

5. Yeast-Based Biosensors: Current Applications and New Developments

Author

Hélène Martin-Yken, Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)

Subjects
[SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Computer science, lcsh:Biotechnology, Clinical Biochemistry, detection, yeasts, 02 engineering and technology, Biosensing Techniques, Saccharomyces cerevisiae, Review, 03 medical and health sciences, Human health, Chemical marker, lcsh:TP248.13-248.65, Animals, Humans, cell signaling, 030304 developmental biology, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, 0303 health sciences, General Medicine, 021001 nanoscience & nanotechnology, biosensors, Yeast, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, environmental contaminants, Biochemical engineering, Smartphone, 0210 nano-technology, Biosensor
Abstract

International audience; Biosensors are regarded as a powerful tool to detect and monitor environmental contaminants, toxins, and, more generally, organic or chemical markers of potential threats to human health. They are basically composed of a sensor part made up of either live cells or biological active molecules coupled to a transducer/reporter technological element. Whole-cells biosensors may be based on animal tissues, bacteria, or eukaryotic microorganisms such as yeasts and microalgae. Although very resistant to adverse environmental conditions, yeasts can sense and respond to a wide variety of stimuli. As eukaryotes, they also constitute excellent cellular models to detect chemicals and organic contaminants that are harmful to animals. For these reasons, combined with their ease of culture and genetic modification, yeasts have been commonly used as biological elements of biosensors since the 1970s. This review aims first at giving a survey on the different types of yeast-based biosensors developed for the environmental and medical domains. We then present the technological developments currently undertaken by academic and corporate scientists to further drive yeasts biosensors into a new era where the biological element is optimized in a tailor-made fashion by in silico design and where the output signals can be recorded or followed on a smartphone.

Published
2020

6. Journal de bord de la campagne PUFFAlis, 18 mars - 02 avril 2017

Author

Valérie Allain, Philippe Borsa, Anne Lebourges-Dhaussy, Menkès, Christophe E., Martine RODIER, David Varillon, Mina Vilayleck, Pacific community (SPC), Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Instrumentation, Moyens analytiques, Observatoires en Géophysique et Océanographie (IMAGO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), IRD, Secretariat of the Pacific Community, Biocomplexité des écosystèmes coralliens de l'Indo-Pacifique (CoReUS2), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Processus de couplage à Petite Echelle, Ecosystèmes et Prédateurs Supérieurs (PEPS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de recherche pour le développement, Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)

Subjects
[SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], ECHANTILLONNAGE, Oiseaux marins, [SDV]Life Sciences [q-bio], micronekton, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, GPS SYSTEME DE POSITIONNEMENT GLOBAL, mer de Corail, océanographie, Seabirds, CAMPAGNE OCEANOGRAPHIQUE, NOUVELLE CALEDONIE PROVINCE NORD, GPS.SYSTEME DE POSITIONNEMENT GLOBAL, COMPORTEMENT ALIMENTAIRE, Coral Sea, oceanography, micronecton, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, GPS. SYSTEME DE POSITIONNEMENT GLOBAL / MER DE CORAIL, PLANCTON, MER DE CORAIL, FOS: Natural sciences, OISEAU MARIN
Abstract

From March 18 to April 2, 2017, the PUFFAlis expedition took place aboard research vessel Alis of IRD. This campaign was a continuation of previous oceanographic expeditions concerned with the feeding areas of seabirds (MOMAlis) as well as on land on the Gouaro Deva shearwater colony. It was also the extension of the NECTAlis campaigns that were dedicated at studying the oceanic trophic chain that leads to tunas. Six scientists embarked to sample the different levels of the oceanic trophic chain of the New Caledonia basin off Pindai. In the middle of the expedition, a day was devoted to communicating with the high school students of Pouembout and the services of the environment and fisheries of the Northern Province. The expedition’s logbook is preceded by the press release issued on this occasion., Du 18 mars au 02 avril 2017 s’est déroulée la mission PUFFAlis à bord du navire océanographique Alis de l’IRD. Cette campagne s’inscrit dans la continuité d’expéditions océanographiques centrées sur les zones d’alimentation des oiseaux marins, effectuées précédemment en mer (MOMAlis) comme à terre sur la colonie de puffins de Gouaro Deva. Elle est aussi la prolongation des campagnes NECTAlis destinées à étudier la chaîne trophique océanique qui conduit aux thons. Six scientifiques ont embarqué pour échantillonner les différents niveaux de la chaîne trophique océanique du bassin de Nouvelle-Calédonie au large de Pindaï. En milieu de mission, une journée a été consacrée à la communication avec les lycéens de Pouembout et les services de l’environnement et des pêches de la Province nord. Le journal de bord de la mission est précédé du communiqué de presse diffusé à cette occasion.

Published
2020

7. New biosensors to detect ciguatoxins and characterization of their binding on mammalian neuronal cell by single molecule force spectroscopy Supprimé: strategies in the detection

Author

Martin-Yken, Hélène, Chinain, M, Trévisiol, Emmanuelle, DAGUE, Etienne, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Équipe Ingénierie pour les sciences du vivant (LAAS-ELIA), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract

International audience; Ciguatera is a prominent cause of poisonings by seafood worldwide. It is caused by very potent neurotoxins, ciguatoxins (CTXs) which are lipid-soluble polyether compounds produced by dinoflagellates in the genera Gambierdiscus and Fukuyoa.. CTXs are mostly found in tropical and subtropical areas. However, both CTXs and Gambierdiscus spp. have recently been identified in European waters. CTXs bind to voltage gated sodium channels (VGSCs) at the surface of human sensory neurons where they remain, causing Ciguatera Poisoning. This severe disease is characterized by a variety of gastrointestinal, cardiovascular and neurological symptoms (paresthesia, ataxia, cold allodynia), including chronic neurological effects in some cases. Despite the wide range of tests presently available for CTXs detection, there is still no simple and rapid way of detecting these toxins in contaminated samples. In this prospect, we have engineered biosensors based on the yeast model Saccharomyces cerevisiae. This unicellular eukaryotic model is well-known and easy to genetically modify, grows fast and presents a very good conservation of signaling pathways with higher eukaryotes. Our approach relies on the detection of a transcriptional signaling activated in yeast cells by exposure to CTXs and their binding to an endogenous receptor homologous to mammalian VGSCs. New results, simplified protocol and attempts to lower down the limit of detection (LOD) will be presented. Moreover, in an attempt to use nanobiotechnology approaches, we are in parallel developing another strategy to characterize and study the binding of ciguatoxins on mammalian neuronal cells by single molecule force spectroscopy using atomic force microscopy. I will present this project and its potentialities in terms of molecular characterization of the binding between … and ex-vivo testing of inhibitor compounds. 1

Published
2019

8. Biodiversité en Océanie, un besoin urgent d'action, Nouméa 2019

Author

Meyer, J.Y., Letourneur, Yves, Payri, Claude, Taquet, Marc, Vidal, Eric, André, Laure, Dumas, Pascal, Gaertner, Jean-Claude, Gerbeaux, P., Mccoy, S., Pauly, D., Rodolfo-Metalpa, Riccardo, Steven, A., Thaman, R., van Wynsberge, S., Payri, Claude (dir.), Vidal, Eric (dir.), Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie]), Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), and HORIZON, IRD

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ANTHROPISATION, BIODIVERSITE, MILIEU MARIN, SERVICE ECOSYSTEMIQUE, SAVOIR TRADITIONNEL, PATRIMOINE NATUREL, MILIEU TERRESTRE, PACIFIQUE ILES, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, INDICATEUR SOCIOECONOMIQUE, EXPLOITATION DES RESSOURCES NATURELLES, ACTIVITE SOCIOECONOMIQUE
Abstract

Atelier Biodiversité en Océanie, Nouméa, NCL, 24-/06/2019 - 25/06/2019; En quoi la biodiversité de l’Océanie est-elle si singulière et donc si remarquable ? Avec quel niveau de gravité est-elle affectée par la crise mondiale de biodiversité et par les conséquences délétères des différentes activités humaines ? Quelles relations entretiennent les peuples océaniens avec la nature et en quoi les savoirs traditionnels complètent les connaissances scientifiques ? Telles sont les principales questions qui ont animé les débats de cet atelier qui a abordé les écosystèmes marins ainsi que les écosystèmes terrestres et d’eaux douces. Plus de cinquante experts ont dressé un diagnostic de l’état de la biodiversité et des différentes pressions qu’elle subit et ont proposé des solutions et des recommandations spécifiques.

Published
2019

9. Biodiversity, ecosystem services and socio-economic activities using natural resources

Author

Meyer, J.Y., Letourneur, Yves, Payri, Claude, Taquet, Marc, Vidal, Eric, André, Laure, Dumas, Pascal, Gaertner, Jean-Claude, Gerbeaux, P., Mccoy, S., Pauly, D., Rodolfo-Metalpa, Riccardo, Steven, A., Thaman, R., van Wynsberge, S., Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Payri, Claude (dir.), Vidal, Eric (dir.), Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and HORIZON, IRD

Subjects
[SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ANTHROPISATION, MILIEU MARIN, PATRIMOINE NATUREL, PACIFIQUE ILES, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, EXPLOITATION DES RESSOURCES NATURELLES
Abstract

Workshop Biodiversity en Oceania, Nouméa, NCL, 24-/06/2019 - 25/06/2019; Why is Oceania's biodiversity so unique and therefore so remarkable? How severely is it affected by the global biodiversity crisis and the deleterious consequences of various human activities? What is the relationships between the peoples of Oceania and nature and how can traditional knowledge complement scientific knowledge? These were the main questions that guided the discussions in this workshop, focused on marine ecosystems , on the one hand, and terrestrial and freshwater ecosystems, on the other. More than fifty experts diagnosed the current state of biodiversity and the various pressures it faces in order to propose specific solutions and recommendations.

Published
2019

10. Ciguatoxins activate the Calcineurin signalling pathway in Yeasts: Potential for development of an alternative detection tool?

Author

Christophe Furger, Dominique Laurent, Hélène Martin-Yken, Camille Gironde, Mireille Chinain, Sylvain Derick, Hélène Taiana Darius, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Équipe Micro et nanosystèmes HyperFréquences Fluidiques (LAAS-MH2F), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, LED Engineering Development, Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)

Subjects
0301 basic medicine, Ciguatoxin, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Calcineurin Pathway, Saccharomyces cerevisiae, detection, yeasts, Biology, Biochemistry, Bioassays, Ciguatoxins, 03 medical and health sciences, man, Yeasts, Mediterranean Sea, Bioassay, Animals, Humans, intoxication alimentaire, 14. Life underwater, produit de la mer, bioassays, canal à sodium, General Environmental Science, Calcium signaling, 030102 biochemistry & molecular biology, Calcineurin, Ciguatera Poisoning, cytotoxicité, biology.organism_classification, calcineurin pathway, Yeast, Hedgehog signaling pathway, ciguatoxins, Genetically modified organism, Detection, 030104 developmental biology, Spain, food poisoning, Calcineurin pathway, humain
Abstract

International audience; Ciguatoxins (CTXs) are lipid-soluble polyether compounds produced by dinoflagellates from the genus Gambierdiscus spp. typically found in tropical and subtropical zones. This endemic area is however rapidly expanding due to environmental perturbations, and both toxic Gambierdiscus spp. and ciguatoxic fishes have been recently identified in the North Atlantic Ocean (Madeira and Canary islands) and Mediterranean Sea. Ciguatoxins bind to Voltage Gated Sodium Channels on the membranes of sensory neurons, causing Ciguatera Fish Poisoning (CFP) in humans, a disease characterized by a complex array of gastrointestinal, neurological, neuropsychological, and cardiovascular symptoms. Although CFP is the most frequently reported non bacterial food-borne poisoning worldwide, there is still no simple and quick way of detecting CTXs in contaminated samples. In the prospect to engineer rapid and easy-to-use CTXs live cells-based tests, we have studied the effects of CTXs on the yeast Saccharomyces cerevisiae, a unicellular model which displays a remarkable conservation of cellular signalling pathways with higher eukaryotes. Taking advantage of this high level of conservation, yeast strains have been genetically modified to encode specific transcriptional reporters responding to CTXs exposure. These yeast strains were further exposed to different concentrations of either purified CTX or micro-algal extracts containing CTXs. Our data establish that CTXs are not cytotoxic to yeast cells even at concentrations as high as 1μM, and cause an increase in the level of free intracellular calcium in yeast cells. Concomitantly, a dose-dependent activation of the calcineurin signalling pathway is observed, as assessed by measuring the activity of specific transcriptional reporters in the engineered yeast strains. These findings offer promising prospects regarding the potential development of a yeast cells-based test that could supplement or, in some instances, replace current methods for the routine detection of CTXs in seafood products.

Published
2018

11. Development of new biosensors to detect ciguatoxins

Author

Yken, Helene, Derick, Sylvain, Gironde, Camille, Darius, Hélène Taiana, Furger, Christophe, Laurent, Dominique, François, Jean-Marie, Chinain, Mireille, ProdInra, Archive Ouverte, Priority environmental contaminants in seafood: safety assessment, impact and public perception - 311820 - INCOMING, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Équipe Micro et nanosystèmes HyperFréquences Fluidiques (LAAS-MH2F), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, LED Engineering Development, Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), 'OcéaSafe', PEPs CNRS, 2016., European Project: 311820, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), LAAS-2I, Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Méiose et reproduction : génétique moléculaire, physiologie, pathologies, applications (MRGMPPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)

Subjects
[SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [SPI.GPROC] Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, sensory neuron, Biotechnologies, yeast, brewer s, Ciguatoxins, intoxication, saccharomyces cerevisiae, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, 14. Life underwater, biosenseur, Génie des procédés, micro-algue, CIguatera, biosensors, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, poisoning, Detection, Process Engineering, environment, marine toxins, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, [SDE]Environmental Sciences, fruit de mer, neurone sensoriel, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract

International audience; Ciguatoxins are lipid-soluble polyether compounds produced by dinoflagellates from the genus Gambierdiscus spp.. Ciguatoxins are mostly found in tropical and subtropical zones; however, within the last decade, they have been identified in fishes caught in European waters, notably in Madeira (1) and Canary Islands (2), while Gambierdiscus spp. have also been found both in the NE Atlantic Ocean (3) and in the Mediterranean Sea (4). These toxins bind to Voltage Gated Sodium Channels at the surface of human sensory neurons where they remain, causing Ciguatera Fish Poisoning with a variety of gastrointestinal, cardiovascular and neurological symptoms (paresthesia, ataxia, cold allodynia), including persistent neurological effects. Ciguatera is the major cause of food poisonings by seafood worldwide, with an estimated 50 000 to 500 000 victims per year. However, there is so far no simple and quick way of detecting these toxins in contaminated samples. Currently, only heavy and expensive laboratory methods are available to detect them: LC-MS/MS, receptor-binding assays by competition with radiolabeled compounds, and neuroblastoma cell-based assays performed on mammalian neurons (5). We have started to engineer biosensors based on the detection of a transcriptional signal in the yeast model Saccharomyces cerevisiae. This unicellular eukaryotic model is well-known and easy to genetically modify, grows fast and presents a very good conservation of signaling pathways with higher eukaryotes. We present a series of genetically modified yeast strains which allow us to follow the activation of specific signaling pathways responding linearly to ciguatoxin exposure. This pre-exploratory project received a seed-funding by CNRS (PEPs project, Océasafe). References : 1 Otero et al., Anal. Chem. 2010, 82, 6032 2 Nuñez et al., 2012. Euro Surveill. 17, 20188 3 Fraga et Rodriguez, 2014 Protist 165, 839 4 Aligizaki et Nikolaidis, 2008. J. Biol. Res. Thessalon 9, 75. 5 Caillaud et al., 2010 Mar. Drugs. 8, 1838

Published
2017

12. A global neural network-based parameterization of biogeochemical water mass properties and processes based on GLODAP data

Author

Bittig, Henry, Sauzède, Raphaëlle, Claustre, Hervé, Fommervault, Orens, Gattuso, Jean-Pierre, Legendre, Louis, Johnson, Kenneth S, Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Centro de Investigacion Cientifica y de Education Superior de Ensenada [Mexico] (CICESE), Monterey Bay Aquarium Research Institute (MBARI), and Monterey Bay Aquarium Research Institute

Subjects
[SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography
Abstract

International audience

Published
2017

13. Spatial and temporal variability of zooplankton off New Caledonia (Southwestern Pacific) from acoustics and net measurements

Author

Smeti, H., Pagano, Marc, Menkès, Christophe, Lebourges Dhaussy, Anne, Hunt, B. P. V., Allain, V., Rodier, Martine, de Boissieu, F., Kestenare, Elodie, Sammari, C., Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut National des Sciences et Technologies de la Mer [Salammbô] (INSTM), Processus de couplage à Petite Echelle, Ecosystèmes et Prédateurs Supérieurs (PEPS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences [Vancouver] (UBC EOAS), University of British Columbia (UBC), Pacific community (SPC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
zooplankton, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, South Pacific, ACL, [SDE]Environmental Sciences, water masses, mesoscale dynamics, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, vertical migration, acoustics, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography
Abstract

International audience; Spatial and temporal distribution of zooplankton off New Caledonia in the eastern Coral Sea was studied during two multidisciplinary cruises in 2011, during the cool and the hot seasons. Acoustic measurements of zooplankton were made using a shipborne acoustic Doppler current profiler (S-ADCP), a scientific echosounder and a Tracor acoustic profiling system (TAPS). Relative backscatter from ADCP was converted to biomass estimates using zooplankton weights from net-samples collected during the cruises. Zooplankton biomass was estimated using four methods: weighing, digital imaging (ZooScan), ADCP and TAPS. Significant correlations were found between the different biomass estimators and between the back-scatters of the ADCP and the echosounder. There was a consistent diel pattern in ADCP derived biomass and echosounder backscatter resulting from the diel vertical migration (DVM) of zooplankton. Higher DVM amplitudes were associated with higher abundance of small zooplankton and cold waters to the south of the study area, while lower DVM amplitudes in the north were associated with warmer waters and higher abundance of large organisms. Zooplankton was largely dominated by copepods (71–73%) among which calanoids prevailed (40–42%), with Paracalanus spp. as the dominant species (16–17%). Overall, zooplank-ton exhibited low abundance and biomass (mean night dry biomass of 4.7 6 2.2 mg m3 during the cool season and 2.4 6 0.4 mg m3 during the hot season) but high richness and diversity (Shannon index ∼4). Substantially enhanced biomass and abundance appeared to be episodically associated with mesoscale features contributing to shape a rather patchy zooplankton distribution.

Published
2015

14. Impacts of climate on marine top predators

Author

Martine Rodier, Anne Lorrain, Houssem Smeti, Inna Senina, Erwan Josse, Valerie Allain, Brian P. V. Hunt, Marc Pagano, Francis Gallois, Patrick Lehodey, Simon J. Nicol, A. Daroux, Christophe E. Menkès, Anne Lebourges-Dhaussy, Elodie Kestenare, Processus de couplage à Petite Echelle, Ecosystèmes et Prédateurs Supérieurs (PEPS), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pacific community (SPC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Instrumentation, Moyens analytiques, Observatoires en Géophysique et Océanographie (IMAGO), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Earth, Ocean and Atmospheric Sciences [Vancouver] (UBC EOAS), University of British Columbia (UBC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut National des Sciences et Technologies de la Mer [Salammbô] (INSTM), Collecte Localisation Satellites (CLS), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Project: 302010,EC:FP7:PEOPLE,FP7-PEOPLE-2011-IIF,ISOZOO(2012), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hobday, A.J. (ed.), Arrizabalaga, H. (ed.), Evans, K. (ed.), Nicol, S. (ed.), Young, J.W. (ed.), and Weng, K.C. (ed.)

Subjects
0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, nekton, Temperature salinity diagrams, [PHYS.PHYS.PHYS-GEO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Geophysics [physics.geo-ph], Oceanography, Oceanographic surveys, 01 natural sciences, Zooplankton, Oligotrophic, oceanographic surveys, Mesoscale eddies, Phytoplankton, Acoustic data, South Pacific convergence zone, acoustic data, Nekton, 14. Life underwater, [SDU.STU.OC]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Oceanography, 0105 earth and related environmental sciences, Trophic level, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, Biomass (ecology), Primary production, 010604 marine biology & hydrobiology, ACL, Pelagic zone, mesoscale eddies, oligotrophic, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Tuna, primary production
Abstract

International audience; Tuna catches represent a major economic and food source in the Pacific Ocean, yet are highly variable. This variability in tuna catches remains poorly explained. The relationships between the distributions of tuna and their forage (micronekton) have been mostly derived from model estimates. Observations of micronekton and other mid-trophic level organisms, and their link to regional oceanography, however are scarce and constitute an important gap in our knowledge and understanding of the dynamics of pelagic ecosystems. To fill this gap, we conducted two multidisciplinary cruises (Nectalis1 and Nectalis2) in the New Caledonian Exclusive Economic Zone (EEZ) at the southeastern edge the Coral Sea, in 2011 to characterize the oceanography of the region during the cool (August) and the hot (December) seasons. The physical and biological environments were described by hydrology, nutrients and phytoplankton size structure and biomass. Zooplankton biomass was estimated from net sampling and acoustics and micronecton was estimated from net sampling, the SEAPODYM ecosystem model, a dedicated echosounder and non-dedicated acoustics. Results demonstrated that New Caledonia is located in an oligotrophic area characterized by low nutrient and low primary production which is dominated by a high percentage of picoplankton cyanobacteria Prochlorococcus (>90%). The area is characterized by a large-scale north-south temperature and salinity gradient. The northern area is influenced by the equatorial Warm Pool and the South Pacific Convergence Zone and is characterized by higher temperature, lower salinity, lower primary production and micronekton biomass. The southern area is influenced by the Tasman Sea and is characterized by cooler temperature, higher salinity, higher primary production and micronekton biomass. Interactions between the dynamic oceanography and the complex topography creates a myriad of mesoscale eddies, inducing patchy structures in the frontal area. During the cool season, a tight coupling existed between the ocean dynamics and primary production, while there was a stronger decoupling during the hot season. There was little difference in the composition of mid-trophic level organisms (zooplankton and micronekton) between the two seasons. This may be due to different turn-over times and delays in the transmission of primary production to upper trophic levels. Examination of various sampling gears for zooplankton and micronekton showed that net biomass estimates and acoustic-derived estimates compared reasonably well. Estimates of micronekton from net observations and the SEAPODYM model were in the same range. The non-dedicated acoustics adequately reproduced trends observed in zooplankton from nets, but the acoustics could not differentiate between zooplankton and micronekton and absolute biomasses could not be calculated. Understanding the impact of mesoscale features on higher trophic levels will require further investigation and patchiness induced by eddies raises the question of how to best sample highly dynamic areas via sea experiments.

Published
2015

15. Nutrient fluxes between water column and sediments : potential influence of the pearl oyster culture

Author

Loïc Charpy, Martine Rodier, Alain Bodoy, Joel Orempuller, Nabila Gaertner-Mazouni, Élise Lacoste, Lisa Peacock, Marie-José Langlade, Andréfouët, Serge (ed.), Charpy, Loïc (ed.), YUNE, RUFIN, Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Université de la Polynésie Française (UPF), Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
0106 biological sciences, Oyster, Geologic Sediments, Nitrogen, [SDV]Life Sciences [q-bio], chemistry.chemical_element, Ecological and Environmental Phenomena, Sediment interface, Aquaculture, 010501 environmental sciences, Aquatic Science, engineering.material, Oceanography, 01 natural sciences, Polynesia, Water column, biology.animal, Pearl oyster, Animals, Seawater, 14. Life underwater, Pinctada, 0105 earth and related environmental sciences, biology, 010604 marine biology & hydrobiology, Phosphorus, Sediment, Benthic-pelagic coupling, Sedimentation, biology.organism_classification, Pollution, [SDV] Life Sciences [q-bio], Nutrient fluxes, chemistry, Benthic zone, Environmental chemistry, engineering, Environmental science, Pearl, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring
Abstract

International audience; This study quantifies benthic nutrient fluxes and sedimentation rates in the Ahe Atoll lagoon (French Polynesia), in two stations located under pearl oyster frames, and two control stations away from the pearl culture facility. Dissolved inorganic nitrogen fluxes ranged between 2 and 35 μmol N m(-2) h(-1) and Soluble Reactive Phosphorus varied between -3 and 8.2 μmol P m(-2) h(-1). Particulate sedimentation rates beneath the oysters were approximately five times higher than in the control zone and the percentage of small particles (≤63μm) were about the twice. In contrast, sediment composition was similar under and outside the direct influence of oyster frames. In this ecosystem, where primary production is dependent on the available nitrogen, our study revealed that, while highly variable, benthic fluxes could sometimes contribute up to 28% of the nitrogen demand for primary production.

Published
2012

16. Mapping, diversity and biomass of Sargassum beds in the South West lagoon of New Caledonia (South Pacific)

Author

Mattio, Lydiane, Dirberg, G., Payri, Claude, Andréfouët, S., Leballeur, Philippe, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Systématique, adaptation, évolution (SAE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie])

Subjects
[SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2008

17. First observation of the giant clam Tridacna squamosa in French Polynesia : a species range extension

Author

Serge Andréfouët, Antoine Gilbert, Serge Planes, Georges Remoissenet, Kim Friedman, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École pratique des hautes études (EPHE), PROCFish Coastal Fisheries Programme, and Service de la Pêche

Subjects
0106 biological sciences, geography, geography.geographical_feature_category, biology, 010604 marine biology & hydrobiology, [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], Species distribution, Giant clam, Coral reef, Aquatic Science, biology.organism_classification, Bivalvia, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Tridacna, Fishery, Oceanography, Mollusca
Published
2007

18. Larvicidal activity of isoflavonoids from Muellera frutescens extracts against Aedes aegypti

Author

Charlotte Nirma, Lionel Chevolot, Charlie Basset, Romain Girod, Didier Stien, Isabelle Dusfour, Alice M. S. Rodrigues, Véronique Eparvier, Christian Moretti, Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), UPS CNRS Guyane (UCG), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Entomologie médicale, Laboratoire de Parasitologie, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Département de Biologie - UMR 7138 Systématique, Adaptation, Evolution, Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), The authors gratefully acknowledge Dr M-F Prévost (IRD, Cayenne, France) for her assistance in the identification of Muellera frutescens, Université des Antilles (UA)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Parasitologie [Cayenne, Guyane française], Systématique, adaptation, évolution (SAE), and Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
Insecticides, 030231 tropical medicine, Plant Science, Aedes aegypti, Biology, Plant Roots, 01 natural sciences, Insecticide Resistance, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Muellera, 0302 clinical medicine, Isoflavonoid, Aedes, Rotenone, Drug Discovery, Animals, Chromatography, High Pressure Liquid, Pharmacology, Traditional medicine, Plant Extracts, 010405 organic chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, Fabaceae, Tephrosin, Biological activity, General Medicine, biology.organism_classification, Isoflavones, Isoflavonoids, 0104 chemical sciences, French Guiana, Plant Leaves, Complementary and alternative medicine, chemistry, Larva, visual_art, Plant Bark, Solvents, visual_art.visual_art_medium, Spectrophotometry, Ultraviolet, Bark, Deguelin, Muellera frutescens
Abstract

International audience; The biological activity of extracts from the leaves, bark and roots of Muellera frutescens, an Amazonian ichtyotoxic plant, were evaluated to find new environmentally safe insecticides. The n-hexane extracts of bark, leaf, and root showed a strong toxic activity against Aedes aegypti mosquito larvae. Bioguided fractionation of the bark extract led to the isolation of seven isoflavonoids (12a-hydroxyelliptone, elliptone, (-)-variabilin, rotenone, rotenolone, tephrosin and deguelin). Rotenone and deguelin are responsible for the larvicidal activity of the plant. M frutescens leaves contain up to 0.6%, w/w, deguelin. These results justify the traditional ichtyotoxic use of M frutescens. The leaves contain a relatively high proportion of deguelin and, therefore, can be considered as a renewable source of this environmentally friendly insecticidal isoflavonoid.

19. Ahe atoll and pearl oyster aquaculture in the Tuamotu archipelago

Author

Marie-José Langlade, Loïc Charpy, Jonathan Fournier, Martine Rodier, Nabila Gaertner-Mazouni, Andréfouët, Serge (ed.), Charpy, Loïc (ed.), YUNE, RUFIN, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Polynésie]), Ecosystèmes Insulaires Océaniens (UMR 241) (EIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de la Polynésie Française (UPF), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Université de la Polynésie Française (UPF)-Institut Louis Malardé [Papeete] (ILM), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)

Subjects
0106 biological sciences, Chlorophyll, Salinity, PHYTOPLANCTON, Atoll, SEL NUTRITIF, Aquaculture, 010501 environmental sciences, Oceanography, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Nutrient, LAGON, Biomass, Photosynthesis, geography.geographical_feature_category, Ecology, Nitrogen Cycle, Pollution, Archipelago, Pearl, Environmental Monitoring, Nitrogen, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Aquatic Science, engineering.material, Polynesia, Phytoplankton, RELATION ESPECE ENVIRONNEMENT, Animals, Seawater, 14. Life underwater, Pinctada, DISTRIBUTION SPATIALE, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, 0105 earth and related environmental sciences, geography, BIOMASSE, business.industry, 010604 marine biology & hydrobiology, PRODUCTION BIOLOGIQUE, chemistry, engineering, Environmental science, business
Abstract

International audience; The environmental characteristics of Ahe deep lagoon (Tuamotu Archipelago, French Polynesia) were studied over 3 years with the aim of explaining the spatial and temporal variability of the natural food available for pearl oysters with a special focus on phytoplankton biomass and global photosynthesis/respiration ratio of the lagoon. Chlorophyll averaged 0.34±0.01 μg L(-1) and our findings did not confirm increased phytoplankton biomass in deep lagoonal waters. Phytoplankton production appears to be limited firstly by nitrogen and respiratory processes overpass photosynthetic processes at least in the north-eastern edge of the atoll. Grazing by pearl oysters in culture seems to decrease the POC concentration but not the phytoplankton biomass. Oysters graze mainly on non chlorophyllian particles.

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