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Healthcare associated infections due to carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) are a major concern in Portuguese hospitals. Whole genome sequencing (WGS) can improve infection control, but this practice is not routinely used by hospital clinical laboratories in Portugal. We simulated the investigation of a CRKP outbreak based on WGS, with the aim of determining, in the minimum possible time, genetic relatedness between CRKP clinical and environmental isolates.Ten CRKP clinical isolates routinely obtained in the hospital laboratory were used. Forty environmental samples - from sinks and sink drains of ward rooms - were collected. Environmental samples were plated on selective media and presumptive CRKP colonies were isolated. Total DNA was extracted from all putative CRKP isolates and sequenced. Clonal relatedness was determined by multi-locus sequence typing and core genome single nucleotide polymorphism analysis; the presence of carbapenemase genes was evaluated.Clinical isolates were characterized in 48 hours: eight strains were confirmed as CRKP, of which six were of ST13 and carried blaKPC-3. Environmental samples results were obtained in six days: eight CRKP were isolated from which five were of ST13 and carried blaKPC-3. Clinical and environmental ST13 isolates were highly related: ten (of 11) isolates differed from each other in0.001% of 2 172 367 core nucleotides.WGS can be used as a high-resolution effective tool to investigate healthcare associated infections and track routes of dissemination in real-time.In Portugal, routine use of WGS to improve infection control could thrive through collaborative initiatives between hospitals and research institutes.Introdução: As infeções associadas aos cuidados de saúde por Klebsiella pneumoniae resistente aos carbapenemos (CRKP) são uma preocupação nos hospitais portugueses. A sequenciação total do genoma [whole genome sequencing (WGS)] pode ajudar no controlo de infecção, mas esta prática não é comummente utilizada nos laboratórios clínicos hospitalares em Portugal. O objetivo deste estudo foi simular a investigação de um surto causado por CRKP, utilizando WGS. Pretendia-se testar a utilização desta técnica e determinar, no menor tempo possível, relações genéticas entre estirpes. Material e Métodos: Foram analisados dez isolados clínicos de CRKP. Foram obtidas quarenta amostras ambientais que foram inoculadas em meio seletivo para isolamento de colónias sugestivas de CRKP e depois sequenciado o DNA total dos isolados presumptivamente identificados como CRKP A relação clonal entre as estirpes foi determinada por multi-locus sequence typing e análise de single nucleotide polymorphisms no genoma core. Foi determinada a presença de genes de carbapenemases. Resultados: Os isolados clínicos foram caraterizados em 48 horas: oito isolados foram confirmados como CRKP. A maioria pertencia ao ST13 (n = 6) e possuía o gene blaKPC-3. As amostras ambientais foram caraterizadas em seis dias: foram isoladas oito CRKP, das quais cinco eram ST13 e continham o gene blaKPC-3. Os isolados ST13 clínicos e ambientais eram muito semelhantes entre si: dez dos 11 isolados diferiam entre si em menos de 0,001% dos 2 172 367 nucleótidos core analisados. Discussão: A sequenciação total do genoma pode ser usada como uma ferramenta útil para investigar infecções nosocomiais e rastrear cadeias de disseminação em tempo real. Conclusão: Em Portugal, o uso desta técnica em controlo de infecção pode ser implementado através de colaborações entre hospitais e institutos de investigação.

Objetivo: Determinar o perfil e a prevalência das infecções relacionadas a Klebsiella pneumoniae carbapenemase na assistência à saúde. Metodologia: Este foi um estudo transversal descritivo retrospectivo (Yin, 2015) e analisou o perfil dessas infecções em um único hospital público entre 2019 e 2021, por meio da coleta de dados com o Núcleo de Controle de Infecção Hospitalar e em prontuários eletrônicos. Os dados coletados incluíram informações demográficas, clínicas e laboratoriais relacionados a infecção. Resultados: Foram analisados 59 pacientes com infecção associada a KPC (8,3%, 65/780), sendo a Klebsiella pneumoniae a espécie mais isolada (93,4%, 57/61). O maior número de infecções foi encontrado na unidade de terapia intensiva (76,7%, 46/60), a maioria relacionado a pneumonia associada a ventilação (29,2%, 19/65), a presença de 3 comorbidades ou mais (55,9%, 33/59) e assistidos com pelo menos um dispositivo invasivo (78%, 46/59). Antibioticoterapia prévia foi encontrada em 96,7% (58/60) e, após a cultura, 31,7% recebeu amicacina e polimixina B. Desses pacientes, 66,1% (39/59) evoluíram a óbito e 33,9% (20/59) receberam alta hospitalar. Conclusão: os resultados estão em concordância com a literatura atual, destacando a importância das medidas preventivas à disseminação de agentes multirresistentes e o impacto da pandemia do COVID-19 no aumento das IRAS por bactérias Gram-negativas. Aim: To determine the profile and prevalence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase-related infections in health care. Method: This was a retrospective cross-sectional descriptive study (Yin, 2015) and analyzed the profile of these infections in a single public hospital between 2019 and 2021, through data collection with the Center for Hospital Infection Control and in electronic medical records. The data collected included demographic, clinical, and laboratory information related to infection. Results: Fifty-nine patients with KPC-associated infection were analyzed (8.3% 65/780), with Klebsiella pneumoniae being the most isolated species (93.4%, 57/61). The highest number of infections was found in the intensive care unit (76.7%, 46/60), most related to ventilator-associated pneumonia (29.2%, 19/65), the presence of 3 comorbidities or more (55.9%, 33/59) and assisted with at least one invasive device (78%, 46/59). Prior antibiotic therapy was found in 96.7% (58/60) and, after culture, 31.7% received amikacin and polymyxin B. Of these patients, 66.1% (39/59) evolved to death and 33.9% (20/59) received medical release. Conclusion: the results agree with the current literature, highlighting the importance of preventive measures to the dissemination of multidrug-resistant agents and the impact of the COVID-19 pandemic on the increase of HCAIs by Gram-negative bacteria. Objetivo: Determinar el perfil y la prevalencia de las infecciones asociadas con la Klebsiella pneumoniae carbapenemase en el ámbito sanitario. Método: Se trata de un estudio descriptivo transversal retrospectivo (Yin, 2015) y se analiza el perfil de estas infecciones en un único hospital público entre 2019 y 2021, a través de la recogida de datos con el Centro de Control de Infecciones Hospitalarias y en las historias clínicas electrónicas. La recopilación incluyo información demográfica, clínica y de laboratorio relacionada con la infección. Resultados: Se analizaron 59 pacientes con infección asociada a KPC (8,3%, 65/780), siendo Klebsiella pneumoniae la especie más aislada (93,4%, 57/61). El mayor número de infecciones se encontró en la unidad de cuidados intensivos (76,7%, 46/60), la mayoría relacionadas con la neumonía asociada al ventilador (29,2%, 19/65), la presencia de 3 comorbilidades o más (55,9%, 33/59) y la atención con al menos un dispositivo invasivo (78%, 46/59). Se encontró terapia antibiótica previa en el 96,7% (58/60) y, tras el cultivo, el 31,7% recibió amikacina y polimixina B. De estos pacientes, 66,1% (39/59) fallecieron y el 33,9% (20/59) fueron dados de alta. Conclusión: los resultados coinciden con la literatura actual, destacando la importancia de la prevención para la diseminación de agentes multirresistentes y el impacto de la pandemia de COVID-19 en el aumento de las IRAS por bacterias Gram negativas.

Objectives Polymyxin resistance has been increasing in many regions, and appropriate determination of polymyxin susceptibility is now a major challenge worldwide. Many clinical laboratories rely on gradient diffusion methods to assess polymyxin susceptibility, although broth microdilution (BMD) is the only method currently recommended by the CLSI and EUCAST. The aim of this study was to assess the performance of the polymyxin B (PMB) Etest in a setting with a high prevalence of KPC-producing Klebsiella pneumoniae (KPC-KP). Methods A commercial Etest susceptibility testing method was evaluated and compared with the reference BMD method, considering isolates with a minimum inhibitory concentration (MIC) ≤2 mg/L for PMB as susceptible to this drug. A total of 310 clinical KPC-KP isolates were evaluated. Results Susceptibility was significantly higher by Etest compared with BMD (82.6% vs. 75.8%). The MIC50, MIC90 and modal MICs for PMB were 0.25, 32 and 0.25 mg/L (27.1%) by BMD and 0.5, 16 and 0.5 mg/L (49.7%) by Etest, respectively. Although categorical agreement was 90.0%, there was poor essential agreement (50.6%). A high rate (34.7%) of very major errors (VMEs) and a relatively low rate (2.1%) of major errors were found. Conclusion The considerable number of resistant isolates in this study allowed an accurate estimation of VME rates and, consequently, a more comprehensive assessment of susceptibility testing for polymyxins. Etest did not meet fully the acceptance criteria for US FDA requirements. These data do not support the use of this commercial method for determining PMB MICs in carbapenem-resistant Enterobacterales populations.

Poor penetration through the outer membrane (OM) of Gram-negative bacteria is a major barrier of antibiotic development. While β-lactam antibiotics are commonly used against Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae, there are limited data on OM permeability especially in K. pneumoniae. Here, we developed a novel cassette assay, which can simultaneously quantify the OM permeability to five β-lactams in carbapenem-resistant K. pneumoniae and E. cloacae. Both clinical isolates harbored a blaKPC-2 and several other β-lactamases. The OM permeability of each antibiotic was studied separately (“discrete assay”) and simultaneously (“cassette assay”) by determining the degradation of extracellular β-lactam concentrations via multiplex liquid chromatography-tandem mass spectrometry analyses. Our K. pneumoniae isolate was polymyxin resistant, whereas the E. cloacae was polymyxin susceptible. Imipenem penetrated the OM at least 7-fold faster than meropenem for both isolates. Imipenem penetrated E. cloacae at least 258-fold faster and K. pneumoniae 150-fold faster compared to aztreonam, cefepime, and ceftazidime. For our β-lactams, OM permeability was substantially higher in the E. cloacae compared to the K. pneumoniae isolate (except for aztreonam). This correlated with a higher OmpC porin production in E. cloacae, as determined by proteomics. The cassette and discrete assays showed comparable results, suggesting limited or no competition during influx through OM porins. This cassette assay allowed us, for the first time, to efficiently quantify the OM permeability of multiple β-lactams in carbapenem-resistant K. pneumoniae and E. cloacae. Characterizing the OM permeability presents a critical contribution to combating the antimicrobial resistance crisis and enables us to rationally optimize the use of β-lactam antibiotics.

Base Teórica: Bacteremias causadas por Klebsiella pneumoniae produtoras de carbapenemase são infecções ameaçadoras da vida e com elevadas taxas de mortalidade. As Enterobacteriaceae são as principais reponsáveis por bacteremias nos hospitais brasileiros. Há limitadas opções terapêuticas e o melhor tratamento para essas infecções ainda não está definido. O racional teórico para a terapia combinada nesse cenário seria o aumento da ação bactericida e a diminuição da indução de resistência. A terapia combinada com colistina parece estar relacionada com maior sobrevida. Com relação a terapia combinada com polimixina B, no entanto, as evidências são exíguas. Objetivo: Avaliar a mortalidade em 30 dias de pacientes com bacteremias por KPC-KP com enfoque na terapia combinada.Métodos: Trata-se de um estudo de coorte retrospectivo e unicêntrico que incluiu pacientes maiores de 18 anos com diagnóstico de bacteremia por KPC-KP. O desfecho primário avaliado foi mortalidade em 30 dias. Bacteremia por KPC-KP foi definida como uma ou mais hemoculturas positivas para esse microorganismo. A identificação bacteriana e os testes de susceptibilidade foram realizados utilizando o sistema automatizado Vitek 2 (bioMérieux, France). A terapia antimicrobiana foi caracterizada como empírica (iniciada nas primeiras 48 horas) e definitiva (esquemas iniciados ou mantidos após 48 horas) e avaliada da seguinte forma: nenhuma droga ativa, monoterapia (apenas um agente ativo), terapia combinada entre uma droga ativa e uma ou mais drogas inativas e terapia combinada com duas ou mais drogas ativas A análise estatística foi realizada com o software SPSS para Windows, versão 18.0. As análises de sobrevivência foram realizadas com curvas de Kaplan-Meier e as diferenças foram avaliadas utilizando o log-rank test. Todos os testes foram bicaudais considerando um nível de significância de 95%. Um modelo de regressão de Cox foi realizado para identificar fatores independentemente relacionados com a mortalidade em 30 dias. Resultados: Foram incluídas 105 bacteremias por KPC-KP. A mortalidade em 30 dias foi de 63 (60%) pacientes. O tempo médio de sobrevida foi de 24 dias (95% IQR, 17-21 dias). A taxa de mortalidade em pacientes tratados com terapia combinada foi significativamente menor (16,5/1000 pacientes-dia) comparada com os pacientes recebendo outros regimes terapêuticos (57,5/1000 pacientes-dia). Terapia combinada (Hazard Ratio [HR]; 0,32; 95% IC, 0,18-0.57; p

Contexto: As infecções associadas aos cuidados de saúde e o aumento da resistência dos microrganismos aos antimicrobianos relacionam-se e são um problema mundial. Um dos microorganismos multirresistentes que tem gerado maiores receios tem sido a bactéria Gram-negativo Enterobacteriaceae Klebsiella pneumoniae resistente às cefalosporinas de terceira geração, o que levou a um aumento no uso de Carbapenemos. Contudo, começaram a ser identificadas enzimas capazes de degradar esses antibióticos, destacando-se a carbapenemase, comumente associada à Klebsiella pneumoniae. Uma das hipóteses levantadas para redução do risco de transmissão horizontal é a tentativa de diminuição da carga de Klebsiella pneumoniae carbapenemase na pele dos doentes, nomeadamente com banho diário de clorexidina. Objetivo: Analisar, através da análise da literatura, a eficácia do banho com clorexidina na redução/eliminação de Klebsiella pneumoniae carbapenemase no doente colonizado/infectado, internado em unidades hospitalares. Métodos: Revisão integrativa da literatura, usando como descritores “Klebsiella”, “Clorexidina”, “Banho”, “Colonização” e “Infecção” em diferentes bases de dados internacionais. Foram pesquisados artigos em língua inglesa, portuguesa e espanhola, sem limitação na data de publicação, sendo obtidas publicações em inglês entre 2002 e 2014. Resultados: Incluíram-se dois estudos quase-experimentais, com desenhos “avaliação da variável dependente antes e após, com grupo único” e “séries temporais interrompidas simples”. Em ambos houve uma diminuição de colonização/prevalência de Klebsiella pneumoniae carbapenemase após realização/introdução de banho diário com clorexidina. De referir que num dos estudos o banho diário com clorexidina estava incluído numa bundle de procedimentos. Conclusões: O banho diário com clorexidina, aparentemente, mostra-se eficaz na redução de colonização/prevalência de Klebsiella pneumoniae carbapenemase. Contudo, foram encontrados poucos estudos e apenas quase-experimentais. São necessários mais estudos, de preferência experimentais, capazes de tradução mais fidedigna. Descritores: Klebsiella; Clorexidina; Banho; Colonização; Infecção. Abstract Context: The infections associated with the healthcare and the increased of antimicrobial resistance are related and became a global problem. One of the multiresistent microorganisms that are generating major concerns is the Gram-negative bacteria Enterobacteriaceae Klebsiella pneumoniae resistant to third-generation cephalosporins, which has led to an increase in the use of carbapenems. However, start to be identified enzymes capable of degrading these antibiotics, specifically the carbapenemase, usually associated with Klebsiella pneumoniae. One of the hypotheses to decrease the risk of horizontal transmission is to attempt to reduce the level of Klebsiella pneumoniae carbapenemase on the patient’s skin, with daily chlorhexidine bath. Objective: Evaluate the effectiveness of bath with chlorhexidine on the reduction/elimination of Klebsiella pneumoniae carbapenemase on the colonized/infected hospitalized patient. Methods: Integrative literature review, using descriptors as “Klebsiella”, “Chlorhexidine”, Bath”, “Colonization” and “Infection” in different international databases. Articles were searched in English, Portuguese and Spanish without limitation on the year of publication. Only articles in English were found, published between 2002 and 2014. Results: Were included two studies quasi-experimental, with designs “evaluation of the dependent variable before and after, with a single group” and “simple interrupted temporal series”. In both cases there was a decrease of colonization/prevalence of Klebsiella pneumoniae carbapenemase after the realization/introduction of the daily bath with chlorhexidine. It should be referred that in one of the studies daily bath with chlorhexidine was included in a bundle of procedures. Descriptors: Klebsiella; Chlorhexidine; Bath; Colonization; Infection.

The hypervirulent K1 serotype Klebsiella pneumoniae is responsible for a new invasive syndrome, typically associated to hepatic abscesses with extra-hepatic complications. Initially described in Taiwan, it has significantly spread to several Asian countries and more recently to Europe and North America, thus constituting an emerging and global problem. The authors describe a case report of a 64-years-old portuguese caucasian woman without any previous diseases or epidemiological risk factors such as trips or contact with Asian products or population, diagnosed with a pyogenic liver abscess with pleural effusion caused by this hyper-virulent strain. A successful clinical cure was achieved after the etiological identification and treatment with antimicrobial therapy combined with catheter drainage. This is the first identification of hypervirulent Klebsiella pneumonia ST 23 clone in Portugal in the context of an invasive syndrome.A estirpe híper-virulenta Klebsiella pneumoniae serotipo K1 é responsável por uma síndrome invasiva infeciosa, caracterizada por abcessos hepáticos com manifestações extra-hepáticas. Inicialmente identificada em Taiwan, tem aumentado significativamente em vários países da Ásia, e mais recentemente na Europa e América do Norte, conferindo a esta entidade um caracter emergente e global. Os autores apresentam o caso clinico de uma mulher de 64 anos, caucasiana, portuguesa, sem antecedentes pessoais ou epidemiológicos como viagens ou exposição a produtos asiáticos, na qual foi diagnosticada, abcesso hepático piogénico complicado de derrame pleural por esta estirpe híper-virulenta. Após conhecimento do diagnóstico e instituição de terapêutica antibiótica combinada com drenagem percutânea, foi possível a resolução do caso clínico com sucesso. Este caso permitiu a identificação do primeiro caso de síndroma invasiva infeciosa, por Klebsiella pneumoniae do clone híper-virulento ST23 documentado em Portugal.

Introducao: Enterobacterias produtoras de carbapenemase do tipo Klebsiella pneumoniae (KPC) sao cada vez mais identificadas em pacientes hospitalizados, porem pouco se conhece sobre o perfil e o prognostico dos pacientes colonizados por elas. Este estudo objetiva avaliar o perfil epidemiologico e a mortalidade total intra-hospitalar dos pacientes colonizados por KPC em um centro de referencia. Metodos: Estudo de coorte retrospectivo em adultos colonizados por KPC em internacao clinica de novembro/2012 a marco/2013 no Hospital Nossa Senhora da Conceicao, Porto Alegre (RS). Foram definidos como colonizados pacientes com exame de rastreio ( swab ) positivo para bacterias produtoras de KPC durante a internacao. Resultados: Foram incluidos 75 pacientes, sendo 40 homens, com mediana de 52 anos. O tempo desde o inicio da internacao ate a positivacao do swab apresentou uma mediana e amplitude interquartil de 18 (9-33) dias, com periodo de internacao de 36 (24-56) dias. Foi identificado uso de cateter central em 93%, sondagem vesical de demora 88%, sondagem nasogastrica/nasoenterica 87%, ventilacao mecânica 81% e hemodialise 40%. Dois tercos dos pacientes apresentaram pelo menos um evento infeccioso apos a colonizacao. O escore de Charlson (OR 1,53 por cada ponto; IC95% 1,25-1,97) e dialise previa (OR 4,35; IC95% 1,39-15,37) foram preditores independentes de mortalidade. Obito ocorreu em 56% dos pacientes (n=42). Conclusao: Pacientes colonizados por KPC apresentam mortalidade total intra-hospitalar elevada. Comorbidades previas a colonizacao foram associadas com mortalidade. O presente estudo nao permite definir qual o papel da colonizacao no desfecho clinico dos pacientes.

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INTRODUÇÃO: Rinoscleroma é uma doença infecciosa crônica do tipo granulomatosa causada pela bactéria Klebsiella rhinoscleromatis. Acomete a mucosa do trato respiratório, mais frequentemente o nariz. É considerada endêmica em determinadas regiões com África e América Central, porém é rara no Brasil. O acometimento nasal ocorre em 3 fases: catarral, granulomatosa e cicatricial. Em todo o seu curso a doença apresenta sintomatologia inespecífica, daí a dificuldade em ser diagnosticada. Seu diagnóstico é estabelecido através de cultura ou pelo encontro de células de Mikulicz ou corpúsculo de Russel no estudo anatomopatológico. O tratamento consiste em antibioticoterapia por longo período, associada ou não a cirurgia. OBJETIVO: Este relato tem por objetivo ilustrar um caso de rinoscleroma em uma paciente jovem com queixa de obstrução nasal bilateral de longa data e cefaleia. O intuito é alertar os otorrinolaringologistas para o diagnóstico desta doença rara, que se apresenta com sintomas inespecíficos e semelhantes a inúmeras patologias que acometem a região nasal.

INTRODUÇÃO: Rinoscleroma é uma doença infecciosa crônica do tipo granulomatosa causada pela bactéria Klebsiella rhinoscleromatis. Acomete a mucosa do trato respiratório, mais frequentemente o nariz. É considerada endêmica em determinadas regiões com África e América Central, porém é rara no Brasil. O acometimento nasal ocorre em 3 fases: catarral, granulomatosa e cicatricial. Em todo o seu curso a doença apresenta sintomatologia inespecífica, daí a dificuldade em ser diagnosticada. Seu diagnóstico é estabelecido através de cultura ou pelo encontro de células de Mikulicz ou corpúsculo de Russel no estudo anatomopatológico. O tratamento consiste em antibioticoterapia por longo período, associada ou não a cirurgia. OBJETIVO: Este relato tem por objetivo ilustrar um caso de rinoscleroma em uma paciente jovem com queixa de obstrução nasal bilateral de longa data e cefaleia. O intuito é alertar os otorrinolaringologistas para o diagnóstico desta doença rara, que se apresenta com sintomas inespecíficos e semelhantes a inúmeras patologias que acometem a região nasal. INTRODUCTION: Rhinoscleroma is a chronic granulomatous infectious disease, caused by the bacterium Klebsiella rhinoscleromatis. Affects the respiratory tract mucosa, more frequent in the nose. Is considered endemic in certain regions like Africa and Central America, but is rare in Brazil. The nasal involvement occurs in 3 phases: catarrhal, granulomatous and sclerotic stage. In all its course the disease presents nonspecific symptoms, and because of that, the difficulty of being diagnosed. Its diagnosis is established by culture or by the meeting of Mikulicz cell or Russel corpuscles in the anatomopathological study. The treatment consists in a long-term antibiotic, associated or not to a surgery. OBJECTIVE: This report aims ilustrate a case of rhinoscleroma in a female young patient complaining of bilateral nasal obstruction, long standing and headache. The intent is alert the otorhinolaringologists in diagnosing this rare disease, which presents itself with nonspecific symptoms as like numerous pathologies that affect the nasal region.

Infective Endocarditis is caused by bacteria or fungi involving the heart or the great vessels (Endarteritis). It is a rare and potentially ominous disease, with increasing incidence. Despite technological advances it remains difficult to diagnose and treat, particularly in children below two years. Congenital heart disease is the main risk factor for Infective Endocarditis in children. A patent ductus arteriosus clinically silent is infrequently implied. Over two-month-old Streptococci spp and Staphylococcus aureus are the main agents, responsible for 62-77% of cases. Gram negative rods count for 4-6%, being Klebsiella pneumoniae a rare pathogen. The authors report a case of a previously healthy four-months-old infant, admitted for bronchiolitis. He developed a Klebsiella pneumoniae persistent bacteremia related to Endarteritis of a silent patent ductus arteriosus. After prolonged and successful antibiotic therapy, the ductus arteriosus was surgically closed. He suffered no complication during the disease process and recovered uneventfully.