Search

To sustainably feed a growing global population, yield can be increased by reducing crop losses to plant pathogens. During infection of plants, several pathogens attempt to colonise the intercellular space, the apoplast. Apoplastic defence against attempted invasions includes the secretion of defence-related proteins, turning the apoplast into a molecular battlefield. While few apoplastic hydrolases have been characterised in plant immunity, many secreted proteins remain uncharacterised. Thus, in order to improve our understanding of apoplastic plant defence responses, we aimed to identify novel apoplastic proteins involved in immunity in this thesis. We combined comparative proteomics with molecular evolution and bioluminescence-based high-throughput disease assays. First, to identify core extracellular tomato proteins in immune responses, we studied apoplastic fluids (AF) of different biotic stress-induced tomato species S.lycopersicum, S.peruvianum and S.pennellii by mass spectrometry (MS). We identified that P69 subtilases were the most abundant proteins in tomato AFs during defence. Molecular evolution studies further implicated P69 subtilases in plant immunity and implicated another 20 biotic stress-induced tomato proteins under positive selection in plant immunity. Second, we compared apoplastic proteomic landscapes between tomato species and N.benthamiana, G.max and A.thaliana which marked distinct differences in profiles of accumulating defence proteins, implicating subtilases from G.max and chitinases from tomato species in plant immunity. Third, we established a bioluminescence-based, high-throughput disease assay for the N.benthamiana-Pseudomonas syringae pv. tomato (Pto) pathosystem, but failed to identify increased immunity in N.benthamiana against Pto for three proteins implicated in plant immunity, including P69B. Last, we used AlphaFold2 multimer as a high-throughput in silico screening tool to identify inhibitor-enzyme complexes from the plant-pathogen interface and identified 13 novel, putative hydrolase inhibitors, including six putative P69B inhibitors. This thesis has contributed to understanding apoplastic defence responses by identifying proteins implicated in plant immunity.

pdfファイル:英目次のタイトル「Exp anation to the Map showing the Dsitribution of Demolition at the Oku-Tango Earthquake, March 7th, 1927」

pdfファイル:英目次のタイトル「Value of Schneider's Classifica'ion of Volcanoes」

Voor een optimale gewasproduktie is een goede vochthuishouding van de grond een van de vereisten. Deze vochthuishouding moet aan twee criteria voldoen. In het voor- en najaar moet de grond droog genoeg zijn voor een goede bewerkbaarheid, zelfs voor zwaardere machines. In het groeiseizoen moet de grond voldoende vocht bevatten om samen met de neerslag de voor groei en verdamping benodigde hoeveelheid water te kunnen leveren. Een goed werkend drainage c.q. infiltratiesysteem met een juist beheer van het open waterpeil kan ertoe bijdragen om gelijktijdig aan beide voorwaarden te voldoen. Voor de peilbeheersing is het nodig te v1eten hoeveel water moet Horden aangevoerd om de neerslagtekorten door middel van capillaire opstijging of beregening te kunnen aanvullen. Anderzijds moet de hoeveelheid af te voeren neerslag bekend zijn.

Voor het handhaven van een optimale ontwateringstoestand van de bodem kunnen in het algemeen twee limiterende grondwaterstandsdiepten worden onderscheiden. De bovengrens garandeert een vochtgehalte dat voldoende laag is voor een goede bewerkbaarheid in voor- en najaar en voor een goede lucht- en stikstofhuishouding tijdens het groeiseizoen. De ondergrens wordt gesteld door de eisen aangaande de waterbehoefte van het gewas, De optimale grondwaterstand zal tussen deze twee grenzen moeten liggen, In het jonge veenkoloniale gebied van het waterschap 'DE RUNDE' (nu de VEENMARKEN) nabij Emmercompascuum zijn in enige wijken de peilen opgezet om water te infiltreren in de tussenliggende percelen. Het doel van deze proef was de invloed vast te stellen van de grondwaterstandsverhoging op de gewasproduktie en daaraan gekoppeld het vaststellen van de optimale grondwaterstand.

In een jong veenkoloniaal gebied zijn in 1972 en in 1973 als proef in enige wijken de peilen opgezet om water te infiltreren in de tussenliggende percelen. Het doel daarvan was de invloed van een verhoogde grondwaterstand op de gewasopbrengst na te gaan en met behulp daarvan de optimale grondwaterstand voor verschillende gewassen vast te stellen.