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Séance : Santé; International audience; In this communication we carried an analysis of the activity of 3 veterinarians during 3 annual health visits in organic dairy farms. This visit is defined here as a joint activity between two professionals who aim at improving the herd’ sanitary condition. Our qualitative study covers 3 cases of these visits. An analysis grid was designed to highlight the objectives of veterinarians, the dilemmas they face in this peculiar situation and the decisions they make based on their guiding principles. The dilemmas encountered by the veterinarians during the health visit are 1. the choice of topics to be addressed in a limited time; 2. the consideration of the perspective of the breeder; 3. the discrepancy between advices on preventive zootechnical measures and prudent drug uses and the vets’ income being based on the sale of medicines. These dilemmas are solved on the basis of assumptions that differ from one veterinarian to another, for example a partnership posture or a training posture. The health visit is also an opportunity to exchange knowledge far beyond the strict Framework of the farm that improves the technical, sectoral and strategic knowledge search of the veterinarian, especially on organic farming. Finally, the vets does mentor the health strategy of the farmer, which the stakeholders are not fully aware.The results of this study show many opportunities to improve the herd health thanks to the health visit. They also show how the veterinarian can learn from the exchanges with the breeder, during the visit. Finally, the methodology belongs to a process based on the activity analysis and aimed at redesigning the veterinary education. It indeed offers new perspectives for veterinary training and skills to be used during the health visit.; Cette communication présente l’analyse de l’activité de 3 vétérinaires lors de 3 visites de bilan sanitaire d’élevage (BSE) au sein d’élevages bovins laitiers biologiques. Cette visite est ici définie comme une activité conjointe entre deux professionnels dont l’objectif est l’amélioration de l’état sanitaire de l’élevage. Notre étude qualitative porte sur 3 cas de visites de BSE. Une grille d’analyse a été construite afin de mettre en lumière les objectifs des vétérinaires, les dilemmes auxquels ils font face en situation et les décisions qu’ils prennent en fonction de leurs principes directeurs. Le contexte de la visite met le vétérinaire face à des dilemmes 1. dans le choix des thèmes à aborder par rapport à la contrainte temporelle ; 2. dans la prise en compte des divergences de vue de l’éleveur ; 3.dans le conseil sur les mesures zootechniques préventives et la réduction des intrants médicamenteux alors que son revenu se base sur la vente de médicaments. Ces dilemmes sont tranchés au regard de postulats qui diffèrent selon les vétérinaires, par exemple une posture de partenariat ou une posture de formateur. La visite de BSE est également un moment d’échanges de connaissances dépassant le cadre strict de l’élevage qui alimentent la veille technique, sectorielle et stratégique du vétérinaire, en particulier sur l’agriculture biologique. Enfin, elle joue un rôle de mentoring sur la stratégie sanitaire de l’éleveur dont les parties prenantes ne sont pas entièrement conscientes. Les résultats de cette étude montrent les perspectives que le travail du vétérinaire lors de la visite du BSE offre à l’éleveur pour l’amélioration de la santé des animaux dans les élevages dans le cadre du BSE. Ils montrent également comment, lors de la visite, le vétérinaire peut s’enrichir à partir de ses échanges avec l’éleveur. Enfin, la méthodologie utilisée pour obtenir ces résultats s’inscrit dans une démarche qui a pour but de repenser la formation à la lumière de l’activité analysée. Elle ouvre de nouvelles perspectives pour la formation vétérinaire sur le BSE et sa mise en pratique sur le terrain.

The objective of this study was to assess, in the context of typical dairy farms in western France, the preventive effects of prepartum diet acidification (AcD) and mineral intake during late gestation on the incidence of subclinical hypocalcemia (SHC) and subclinical hypophosphatemia (SHP) after calving. We conducted a longitudinal study that followed a cohort of 371 Holstein cows from 26 French dairy farms; of these, 235 cows (15 farms) were supplied with anionic salts during late gestation, and 136 cows (11 farms) were not. Blood samples were collected from 1 to 22 cows per farm (average of 14.3 cows per farm) between 24 and 48 h after calving. Total calcium and inorganic phosphorus concentrations in plasma were then quantified by inductively coupled plasma - optical emission spectrometry. The effects of AcD on the incidence of SHC and SHP were assessed using mixed linear models that evaluated the cow-level factors parity, milk yield index, and individual health events/treatments, and the farm-level factors diet calcium and magnesium content, dietary phosphorus intake, vitamin D supply, diet crude protein content, and duration of AcD, with farm as a random effect. Approximately 55% of cows were diagnosed with SHC (calcium < 2.0 mmol/l, n = 203) and 37% with SHP (inorganic phosphorus < 1.3 mmol/l, n=136). The first model confirmed earlier findings that the risk of SHC is higher with increased parity (P ≤ 0.0001) and revealed a higher risk associated with high milk yield (P = 0.0005), high phosphorus intake (40–60 g/cow per day, OR = 3.5; ≥ 60 g/cow per day, OR = 7.3; P = 0.0003) and high vitamin D supply (≥ 19950 IU/cow per day, OR = 3, P = 0.007). The second model highlighted a greater risk of SHP with increasing parity (P = 0.03) and showed trends for the preventive effects of AcD (OR = 0.4, P = 0.07) and moderate amounts of phosphorus in the diet (OR = 0.4, P = 0.10). Overall, our results do not support the effectiveness of AcD in preventing SHC or SHP under field conditions examined here, probably resulting from insufficient diet acidification.

International audience

International audience; Introduction: Paratuberculosis is a chronic infection of the intestine, mainly the ileum, caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map) in cattle and other ruminants. This enzootic disease is present worldwide and has a strong impact on the dairy cattle industry. For this species, the typing tools do not make it possible to investigate the genetic diversity of the strains. These limitations can be overcome by the application of Whole Genome Sequencing (WGS), particularly for clonal populations such as Map. WGS analyses can provide comprehensive genetic information, including information on genome evolution, discrimination of closely related strains and virulence determinants.The purpose of the present study was to undertake a whole-genome analysis of Map strains to identify accurate phylogenetic relationships between isolates and establish correlations between genomic traits and epidemiologicaldata within a population of well documented-strains.Materials and methods: A set of 200 animal field strains were selected based on a previous large-scale longitudinal study representative of the French Map population circulating in the West of France. Strains were isolated from bovine of breed Prim’Holstein or Normande naturally infected by Map. For each strain isolated, all information about the animal is available including: breed, herd prevalence, locations, serological status and excretion level. The genomic sequences of Map strains were obtained by Illumina MiSeq sequencing. Genomic sequences were assessed for potential contamination using Kraken2. Cleaned reads were aligned to the reference genome K-10 and SNP were called using FreeBayes. IQ-Tree was used to infer a SNP-based phylogeny.Results, discussion and conclusion: This study provided 200 new genomes of French strains isolates from naturally infected animals. Pangenome analysis of this panel confirmed the degree of Map clonality. SNP analyzes provided accurate phylogeny able to distinguish each strain divided into 4 clusters independently of the breed of the cattle. Interestingly, the phylogeny clearly distinct the two major MLVA profiles. A phylogeny was inferred with French Map isolates and with other Map isolates found across the world. Relations between genetic traits and epidemiological data will be investigated to better understand the transmission dynamics of the disease

International audience; Bovine paratuberculosis is a contagious and incurable disease, caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP), with adverse effects on animal welfare and serious economic consequences. In a previous GWAS conducted on 1644 Holstein cows with an accurately defined status for MAP (controls, non-clinical and clinical cases) and whole genome sequences (WGS) imputed using the 6th Run of the 1000 bull genomes (1kBG) project (multibreed population, UMD3.1 reference genome), we identified three genomic regions on chromosomes 12, 13, and 23. The objective of the present study was to conduct further investigations using the 7th Run of the 1kBG, which includes a larger Holstein population with WGS based on the recent ARS-UCD1.2 reference genome. 50K genotypes of the 1644 Holstein cows were imputed to the high-density (HD) level with FImpute and then up to WGS with Minimac using reference sets of 776 and 700 Holstein bulls, respectively. GWAS was carried out with GCTA, testing the individual effect of ~25M variant and accounting for the population structure through a HD-based genomic relationship matrix. After filtering variants for low imputation accuracy (R² < 0.3) or frequency (MAF < 0.001), 4815 variants had significant effects (6 ≤ -log(P) ≤ 34.5) on resistance to MAP. They were located in eight different genomic regions on chromosomes 6, 9, 12, 13 (2 regions), 14, 18, and 23. Two-thirds of these variants (3194) were located in genes, mainly in introns (2170), upstream or downstream regions (907), and exons (101 including 65 non-synonymous). In each region, the variants with the most significant effects were located in the TMPRSS11F, HS6T3, ABCC4, SNTA1, SNTB1, NOTCH4, NFKBTL1, ATP6V1G2, DDX39B, and ELOVL5 genes. This study confirms the three genomic regions we detected before and reveals five novel regions for resistance to MAP.

International audience; Routine identification of cows suffering from subclinical hypocalcemia around calving has great significance in dairy cattle to adapt prevention programs. Milk and blood calcium contents may be correlated, as the calcium sensing receptor contributes to the regulation of calcium secretion into milk according to blood calcium level. Milk would be a more convenient sample to identify cows at risk. Thus, our objective was to describe milk calcium (MiCa) dynamics and plasma calcium (PlCa) one during the week after calving and to assess their correlation. Eight primiparous and 12 multiparous Holstein dairy cows, milked twice a day, were submitted to morning daily simultaneous blood and milk sampling from the day of calving to 7 d later. Plasma and milk samples were analyzed for total calcium content by atomic absorption spectrometry. Plasma and milk calcium dynamics were first described using PROC GLIMMIX in SAS, with a generalized linear mixed model with repeated values. Time, parity and the interaction between both were included as fixed effect and cow as random effect. Post hoc tests were then realized to identify sampling times which differ between them. Finally, a Spearman correlation matrix aimed to identify sampling days with best correlations between PlCa and MiCa. PlCa increased from the day of calving to d 7 (time effect, P = 7.10−11), and decreased with parity (P = 0.002). Primiparous and multiparous PlCa dynamics were different (interaction time × parity, P = 0.007), as multiparous had lower PlCa on the day of calving (75 ± 12 mg/L) and the day after (80 ± 12 mg/L), and primiparous had lower PlCa only the day of calving (89 ± 5 mg/L). MiCa was higher in the first 2 d after calving, sharply decreased until d 3 before stabilizing over the following days (time effect, P = 2.10−9). MiCa was not affected by parity and correlations between PlCa and MiCa greatly depended on parity. Higher correlations were observed between PlCa on d 3 and MiCa on d 4 when considering only multiparous cows (r = −0.8, P = 0.002). Our results suggest that milk calcium measurements might be effective to assess blood calcium levels after calving in multiparous dairy cows, but these results remain to be confirmed in broader experimental conditions.

International audience

International audience; New technologies for sensors, communication and data processing have entered farms. This new source of information is more diverse, obtained at higher frequencies, for longer periods of time and from more entities. They raise new problems of qualification, reliability and maintenance of information, which remain largely to be explored. In decision theory, ’information’ relates to what is likely to have an impact on a decision. When the information is acquired by automatic devices rather than obtained by observation or measurement by humans, such devices quickly find their place on the condition that they are reliable. Information on animal health and welfare or on the environment, resources are still little used and their integration into effective decision-making tools is still insufficient. In addition, today, the use of this information is not limited to the livestock farm. Consumers want to know where their food comes from, how it was produced, with what level of environment protection or animal welfare, and to be able to trust this information. In conclusion, new information technologies allow accessing to a lot of new information in animal production, but it is not yet clear how it can be used in the decision-making by livestock farmers or other actors of the food-chain.; Les nouvelles technologies des capteurs, de la communication et du traitement des données ont fait leur entrée dans les élevages. Elles constituent une nouvelle source d’informations à la fois plus nombreuses et diversifiées, à plus haute fréquence, sur plus longtemps et pour plus d’entités. Elles soulèvent dans le même temps des problèmes de qualification, de fiabilité et de maintenance des informations qui restent largement à explorer. Dans la théorie de la décision, le terme information ne concerne que ce qui est susceptible d’avoir un impact sur la décision. Lorsque les informations acquises par des dispositifs automatiques se substituent à des informations obtenues par des activités de surveillance ou de mesure manuelles, ces dispositifs trouvent rapidement leur place s’ils sont fiables. A l’opposé, pour d’autres informations concernant les alertes de santé, le bien-être ou l’environnement, les dispositifs sont encore peu utilisés et leur intégration dans des outils performants d’aide à la décision est encore insuffisante. De plus, aujourd’hui, l’information sort du cadre strict de l’élevage. Les consommateurs veulent savoir d’où vient leur aliment, comment il a été produit, dans quel respect de l’environnement ou du bien-être animal, avec des garanties sur ces informations. En conclusion, les nouvelles technologies de l’information permettent l’accès à beaucoup de nouvelles informations en élevage, mais avec une idée encore trop imprécise de leurs utilisations dans les processus de décision de l’éleveur ou d’autres acteurs.

International audience; New technologies for sensors, communication and data processing have entered farms. This new source of information is more diverse, obtainedat higher frequencies, for longer periods of time and from more entities. They raise new problems of qualification, reliability and maintenance ofinformation, which remain largely to be explored. In decision theory, ’information’ relates to what is likely to have an impact on a decision. Whenthe information is acquired by automatic devices rather than obtained by observation or measurement by humans, such devices quickly find theirplace on the condition that they are reliable. Information on animal health and welfare or on the environment, resources are still little used and theirintegration into effective decision-making tools is still insufficient. In addition, today, the use of this information is not limited to the livestock farm.Consumers want to know where their food comes from, how it was produced, with what level of environmental protection or animal welfare, andto be able to trust this information. In conclusion, new information technologies allow accessing a lot of new information in animal production,but it is not yet clear how it can be used in decision-making by livestock farmers or other actors of the food-chain.; Les nouvelles technologies des capteurs, de la communication et du traitement des données ont fait leur entrée dans les élevages. Elles constituent une nouvelle source d’informations à la fois plus nombreuses et diversifiées, à plus haute fréquence, sur des durées plus longues et pour plus d’entités. Elles soulèvent dans le même temps des problèmes de qualification, de fiabilité et de maintenance des informations qui restent largement à explorer. Dans la théorie de la décision, le terme information ne concerne que ce qui est susceptible d’avoir un impact sur la décision. Lorsque les informations acquises par des dispositifs automatiques se substituent à des informations obtenues par des activités de surveillance ou de mesure manuelles, ces dispositifs trouvent rapidement leur place s’ils sont fiables. À l’opposé, pour d’autres informations concernant les alertes de santé, le bien-être ou l’environnement, les dispositifs sont encore peu utilisés et leur intégration dans des outils performants d’aide à la décision est encore insuffisante. De plus, aujourd’hui, l’information sort du cadre strict de l’élevage. Les consommateurs veulent savoir d’où vient leur aliment, comment il a été produit, dans quel respect de l’environnement ou du bien-être animal, avec des garanties sur ces informations. En conclusion, les nouvelles technologies de l’information permettent l’accès à beaucoup de nouvelles informations en élevage, mais avec une idée encore trop imprécise de leurs utilisations dans les processus de décision de l’éleveur ou d’autres acteurs.

Additional file 1: Figure S1. −log(P-value) plotted against the position of variants detected by GWAS (in grey) and conditional GWAS (GWAS_COJO; in blue).

Bovine digital dermatitis (DD), is a highly prevalent disease among dairy cattle characterized by ulcerative and painful lesions. While multiple risk factors are involved in the disease, its precise etiology remains unclear and the effectiveness of the current control strategies still highly variable. However, and even if the main role of Treponema spp. in the development of the disease is consistently recognized, the importance of other bacterial communities and the factors affecting the skin environment remains uncertain. The objective of this study was to investigate the dynamics of microbiotas from feet affected by DD, before and after the implementation of disinfectant footbaths under field conditions. During this investigation, the diversity, structure, and composition of microbiotas from DD lesions over time were explored according to different clinical factors. The findings of this investigation confirmed a particular microbiota related to DD lesions dominated by Treponema spp. and highly different from those microbiotas of healthy skin. However, the diversity and structure of microbiotas from DD lesions did not vary according to the usage of footbaths or individual topical antibiotic treatments. Otherwise, microbiotas from proliferative lesions evidenced a different structure and diversity in comparison to non-proliferative lesions. The composition of microbiotas changed over time revealing the potential main role of Treponema spp. , Fusobacterium spp. , Mycoplasma spp. and Porphyromonas spp. in the dynamics of DD lesion progression. Further studies are necessaries to confirm if the clinical evolution of DD lesions is driven by a particular microbiota and how this microbiota induces disease. Highlights Multiple bacteria have been identified in DD lesions. However, a large part of these microorganisms are inhabitants of the foot skin and the farm environment. For the first time, the microbiotas of DD lesions were followed over 45 days under field conditions to explore their evolution over time and how footbaths practices may affect their dynamics. The results of this investigation confirmed a particular microbiota related to DD lesions dominated by Treponema spp. and highly different from those microbiotas of healthy skin. The microbiotas from DD lesions evolved over the study period and the differential bacteria were identified. Further studies are guaranteed to determine the role of the bacteria composing these microbiotas on the lesion occurrence and its outcome.

Si pour certaines affections très fréquentes comme les troubles respiratoires ou les mammites il existe une littérature abondante tant du point de vue de leur étiologie que de leur traitement ou prévention, plusieurs indications, pourtant fréquentes sur le terrain également (comme les omphalites ou les arthrites) ou plus rares (méningites) ne font l'objet que de peu d'études ce qui en fait des indications orphelines de recommandations. De fait, les pratiques de traitement relèvent plus d'une expérience et d'un empirisme éclairé, ayant souvent fait ses preuves, sans pour autant que ces preuves aient été publiées ou diffusées. Au final, en confrontant les fiches de bonnes pratiques pour ces affections orphelines avec la littérature existante via une approche de type médecine factuelle (Evidence Based Veterinary Medicine), il n'y a pas lieu de remettre en cause d'un point de vue théorique les recommandations émises même si pour la plupart elles ne sont supportées par aucune preuve tangible publiée. Par contre, un recours plus systématique aux AINS dans la prise en charge (douleur, choc toxinique) de ces affections semble justifié par la littérature. La priorité semble donc devoir être de diffuser et évaluer ensuite ces recommandations, en publiant régulièrement les résultats d'efficacité

L’actinobacillose est habituellement une infection sporadique qui affecte la langue chez les bovins (“langue de bois”), avec une dissémination possible au tractus digestif. Deux vaches Rouge-des- Prés âgées de 4 ans issues du même élevage ont été référées au CHUV d’Onirispour tuméfaction et nodules cutanés apparus depuis plusieurs mois sur les membres postérieurs. A leur admission, les deux vaches sont cachectiques et ont, en plus des signes cutanés, une boiterie des membres tuméfiés et une atteinte respiratoire modérées. Aucune anomalie n’est détectée à l’examen des calques et des raclages cutanés. Le pronostic sombre conduit à l’euthanasie des deux vaches. L’examen histopathologique de prélèvements cutanés et pulmonaires met en évidence une dermatite et une pneumonie pyo-granulomateuses sévères chroniques, associés à des corps de Splendore- Hoeppliavec des bactéries Gram-négatives intra-lésionnelles. Les cultures réalisées sur prélèvements de peau, noeuds lymphatiques et poumons identifient une bactérie de la famille des Pasteurellaceae, qui est confirmée comme étant Actinobacillus lignieresii par séquençage partiel du gène rpoB. Ce cas clinique rappelle qu’Actinobacillus lignieresii peut affecter d’autres tissus que la langue chez les bovins. Une tuméfaction des membres doit conduire à un examen attentif de la peau pour déceler des nodules cutanés et à un examen clinique détaillé pour détecter de potentielles affections secondaires, y compris une pneumonie. Un traitement antibiotique doit être mis en place le plus rapidement possible pour éviter la dissémination des bactéries aux organes internes. Ce cas clinique suggère aussi que la gale chorioptique puisse être un facteur prédisposant à ces cas atypiques, pouvant conduire à des pseudo- épizooties en élevage bovin

Si l’offre en matière d’outils de monitoring est en constante augmentation, il est étonnant de constater que cette offre n’est encadrée par aucune réglementation. Ainsi les performances de ces outils, ainsi que leur innocuité sont très peu renseignées. Et derrière le mot performance peuvent se cacher de nombreux aspects : performance métrologique, valeur informative, ergonomie, économie. Cet article se propose de dresser un panorama de la façon dont on pourrait envisager la mesure de la performance de ces outils

National audience; Cette synthèse de la littérature montre que, de manière générale, le pâturage est bénéfique à la santé des bovins, en réduisant la fréquence des principales maladies à savoir des boiteries et affections des membres, des affections de la mamelle, des métrites, de certaines parasitoses cutanées (pulicose, gale, dermatophytose) et en limitant la transmission intra-troupeau de maladies contagieuses. In fine, il diminue le risque de mortalité des bovins adultes. A côté de cet effet favorable dominant, le pâturage présente cependant des risques spécifiques que l’éleveur doit apprendre à gérer. Il s’agit principalement des parasitoses internes de pâturage (voir article spécifique dans ce numéro). Les boiteries, en cas de chemin d’accès au pâturage très mal entretenu, peuvent également survenir. De plus, la présence en pâture augmente le risque d’infestation par les mouches et les tiques, avec leurs conséquences en termes de kérato-conjonctivite infectieuse de maladies bactériennes (ehrlichiose, anaplasmose...), virales (fièvre catarrhale ovine, maladie de Schmallenberg), de protozooses (babésiose, theilériose…). Enfin, le pâturage de jeunes pousses d’herbe induit un risque pour la tétanie d’herbage, la météorisation spumeuse et les entérotoxémies

Monitoring temperature of cattle: applications and future prospects. The monitoring of body temperature using portable sensors attached to cattle is becoming more and more frequent. Initially, the sensors were designed to detect the drop in temperature prior to calving. Currently, the systems record in real-time variations in temperature which greatly increases the field of application (for example: health, heat stress). The objective of this paper is to provide an update of the sensors and systems available to monitor cattle body temperature; Le monitoring de la température à l’aide d’outils embarqués sur les bovins se démocratise. Initialement, les outils visaient à détecter les baisses de température précédant le vêlage. Aujourd’hui ce sont des systèmes enregistrant en continu les courbes de température de l’animal ce qui ouvre un champ d’application bien plus grand (santé, stress thermique entre autre). L’objectif de cet article est de faire un état des lieux des outils et dispositifs disponibles pour monitorer la température chez lez bovins)

Why and how to evaluate the performance of monitoring devices in cattle farms? If the availability of monitoring tools is constantly increasing, it is surprising to note that these devices are not regulated. There is very little information about device performance and safety. In addition, behind the word performance can hide many aspects: metrological performance, informative value, ergonomics and economics. This article aims to provide an overview of the different types of performance which need to be considered and the limits of the current data on known performance; Si l'offre en matière d'outils de monitoring est en constante augmentation, il est étonnant de constater que cette offre n'est encadrée par aucune réglementation. Ainsi, les performances de ces outils, ainsi que leur innocuité sont très peu renseignées. Et derrière le mot performance peuvent se cacher ne nombreux aspects : performance métrologique, valeur informative, ergonomie , économie. Cet article se propose de dresser un panorama des différents types de performances à considérer et de la limite des données actuelles concernant les performances connues

Avec l’augmentation de la taille des troupeaux, les vaches passent plus de temps en bâtiment et les bâtiments avec logettes se développent. Ainsi, les éleveurs se préoccupent davantage de la nature, de la conception et des coûts des sols des aires de circulation et des conséquences de ceux-ci sur la santé et le comportement des vaches. Le projet SOLVL a été conduit pour apporter de nouveaux éléments sur ce sujet en combinant dans un premier temps une enquête postale à visée descriptive auprès de 645 élevages, puis dans un deuxième temps une enquête épidémiologique transversale sur la santé et la propreté des animaux auprès de 87 élevages équipés des sols les plus courants (bétons pleins, caillebotis et tapis) identifiés dans la première étape, pour finir par un suivi longitudinal dans 9 élevages équipés de sols innovants. En pratique, ce projet a permis de compléter les interventions en élevage en mettant au point une méthode de diagnostic des sols des aires de circulation, et de donner des recommandations sur le choix, la conception, la réfection et l’entretien des sols., With the increase of dairy herd size, an extended time of the cows in housing and the development of free-stall barns, the flooring in the walking areas of cubicle housing systems became a concern for many farmers and stakeholders. Therefore, farmers must consider design, cost and also consequences of flooring on health and behavior of dairy cows. This project was carried out to provide new elements on flooring in the walking area. First, a descriptive survey was conducted among 645 farms. Then, an epidemiological survey was conducted over winter 2015, where 87 farms were randomly selected from the 645 free-stall barns database in order to represent the seven most common types of flooring. Eventually, nine innovative floors were assessed. This study led to complement observations in farms by the creation of methods to make a diagnosis of flooring. Also, many recommendations and advices were made to better improve conception and renovation and to help farmers to choose the best type of floor for their dairy cows.

Ce volume regroupe les textes issus du programme Casdar "Innovation et Partenariat" et "Recherche finalisée et innovation" de 2013. Le colloque de restitution s’est déroulé le 6 février 2019 sous l’égide du GIS Relance Agronomique; With the increase of dairy herd size, an extended time of the cows in housing and the development offree-stall barns, the flooring in the walking areas of cubicle housing systems became a concern formany farmers and stakeholders. Therefore, farmers must consider design, cost and also consequencesof flooring on health and behavior of dairy cows. This project was carried out to provide new elementson flooring in the walking area. First, a descriptive survey was conducted among 645 farms. Then, anepidemiological survey was conducted over winter 2015, where 87 farms were randomly selected fromthe 645 free-stall barns database in order to represent the seven most common types of flooring.Eventually, nine innovative floors were assessed. This study led to complement observations in farmsby the creation of methods to make a diagnosis of flooring. Also, many recommendations and adviceswere made to better improve conception and renovation and to help farmers to choose the best type offloor for their dairy cows.; Avec l’augmentation de la taille des troupeaux, les vaches passent plus de temps en bâtiment et lesbâtiments avec logettes se développent. Ainsi, les éleveurs se préoccupent davantage de la nature, dela conception et des coûts des sols des aires de circulation et des conséquences de ceux-ci sur la santéet le comportement des vaches. Le projet SOLVL a été conduit pour apporter de nouveaux élémentssur ce sujet en combinant dans un premier temps une enquête postale à visée descriptive auprès de645 élevages, puis dans un deuxième temps une enquête épidémiologique transversale sur la santé etla propreté des animaux auprès de 87 élevages équipés des sols les plus courants (bétons pleins,caillebotis et tapis) identifiés dans la première étape, pour finir par un suivi longitudinal dans 9 élevageséquipés de sols innovants. En pratique, ce projet a permis de compléter les interventions en élevage enmettant au point une méthode de diagnostic des sols des aires de circulation, et de donner desrecommandations sur le choix, la conception, la réfection et l’entretien des sols.

National audience

The main objective of this study was to evaluate the effect of the implementation of different footbathing practices using a new biocide solution (Pink-Step™, Qalian) in the healing and the occurrence of bovine digital dermatitis (DD) lesions. The investigation was conducted through a controlled within cow clinical trial in which the hind feet of cows from each farm were allocated either to the control group or to one of two footbath regimen groups. The trial involved 1036 cows (2072 feet) from 10 dairy farms located in western France and where DD was endemic. Split footbaths were placed at the exit of the milking parlor of each farm, allowing administering specifically the biocide solution to one side of the cows while using the other side as a negative control. According to the frequency of administration, footbaths regimen groups were moderate or intensive. Both regimens were administered during approximately 140 days, and feet were evaluated for the presence of DD lesions at least once a month in the milking parlor. Nested survival models were used to estimate the relative impact of the footbath regimens and other concomitant risk factors on the time that DD lesions occurred or healed. No preventive effect of the Pink-Step™ solution was evidenced during the trial although that all feet were previously cleaned before the diagnosis, leading therefore to a potential under estimation of the effects. The risk for DD occurrence was increased importantly by poor feet cleanliness at both cow (HR = 1.69, CI 1.21–2.39), and farm level (HR = 2.06, CI 1.44–2.94). Otherwise, the results indicate that Pink-Step ™ is effective in improving the healing of active DD lesions when applied in moderate regimen (HR = 2.29, IC 1.11-4.72) or in an intensive regimen (HR = 2.18 IC 1.18-4.03). Inactive DD lesions improved in all three groups studied. Conversely, the time to healing was delayed in feet receiving hooftrimming (HR 0.33, CI 0.19-0.55), in cows which have a contralateral lesion (HR 0.15, CI 0.09- 0.24), and finally, in farms of larger herds (>100 cows) (HR = 0.46, CI 0.30-0.69). These findings reinforce the crucial role of hygiene on the disease dynamics and highlight the importance of implementing multiple control measures simultaneously, such as hygiene improvements in the barn, early detection and treatment of DD lesions and the correct usage of individual and collective treatments. The implementation of Pink-Step™ footbaths represents a promising strategy for reducing the persistence of DD lesions in affected herds; L'objectif principal de cette étude était d'évaluer l'efficacité préventive et curative d'une nouvelle solution biocide biodégradable (Pink-Step™ Qalian) applicable en pédiluve vis-à-vis de lésions de dermatite digitée (DD). L'étude a consisté en un essai clinique dans lequel les pieds postérieurs des vaches de chaque élevage ont été aléatoirement alloués soit au groupe témoin (aucun traitement), soit à l'un des deux différents régimes de traitement collectif par pédiluve (régime intensif ou modéré). L'essai a porté sur 1036 vaches (2072 pieds) provenant de 10 troupeaux laitiers situés dans l'ouest de la France où la DD était endémique. Des bi-pédiluves ont été placés à la sortie de la salle de traite, permettant d'administrer spécifiquement la solution de biocide d'un côté et d'utiliser l'autre côté comme groupe témoin négatif (split design). Avec l’objectif de déterminer la meilleure fréquence d'administration, deux groupes avec différents régimes d'administration (modéré et intensif) de pédiluves ont été conçus. Les deux régimes ont été administrés pendant 140 jours, et les pieds (préalablement nettoyés) ont été évalués pour le diagnostic des lésions de DD au moins une fois par mois en salle de traite. Des modèles d’analyse de survie emboîtés ont été utilisés pour estimer le risque relatif (exprimé en Hazard Ratio) des différents régimes de pédiluve et d'autres facteurs de risque concomitants au moment où les lésions de DD sont apparues (effet préventif) ou ont guéri (effet curatif). Les pieds ayant été nettoyés à chaque visite, il est possible que cela est contribué à ne mettre en évidence aucun effet préventif de la solution Pink-Step™, le lavage étant une prévention en soi. Le risque de survenue de lésions de DD était augmenté de façon significative par une mauvaise propreté des pieds au niveau de la vache (HR = 1,69, IC 1,21-2,39) et au niveau du troupeau (HR = 2,06, IC 1,44-2,94). Par contre, les résultats indiquent une efficacité de Pink-Step™ dans l’amélioration de la guérison des lésions actives de DD lors de son application dans un régime modéré (HR = 2.29, IC 1,11-4.72) ou dans un régime intensif (HR=2.18 IC 1,18-4,03). Les lésions inactives de DD ont suivi une amélioration dans les trois groupes étudiés. Inversement, le temps de cicatrisation a été retardé pour les pieds qui avaient été parés (HR 0,33, IC 0,19-0,55), pour les vaches présentant une lésion controlatérale (HR 0,15, IC 0,09-0,24) et finalement, dans les troupeaux avec un effectif important (> 100 vaches) (HR = 0,46, IC 0,30-0,69). Ces résultats renforcent le rôle crucial de l'hygiène dans la dynamique de la DD et soulignent l'importance de mettre en oeuvre simultanément plusieurs mesures de contrôle, telles que l’amélioration de l’hygiène dans les bâtiments, la détection précoce des lésions et l'utilisation correcte des traitements individuels et collectifs. En conclusion, la mise en oeuvre des pédiluves Pink - Step™ représente une stratégie prometteuse pour réduire la persistance des lésions de DD dans les troupeaux affectés

Le diagnostic et surtout l'attributatibilité d'une série d'avortements à Coxiella burnetii a fait l'objet d'une proposition dans le cadre de la démarche d'harmonisation nationale. Afin de maximiser la spécificité, un seuil élevé de 104 bactérie/mL a été établi. Toutefois, en bovin, un tel seuil est rarement atteint y compris dans des situations où l'implication de Coxiella semble réelle. Cette étude a ainsi comparé les résultats en qPCR obtenus sur des placentas en comparaison au gold standard théorique, l'histologie. Comme attendu, le seuil de 10⁴ maximise la spécificité mais la sensibilité correspondante (moins de 25%) est médiocre. Compte-tenu de la très forte spécificité à ce seuil, la nécessité de disposer d'un deuxième résultat positif en qPCR pourrait se discuter. Compte-tenu de la très faible sensibilité, on doit renforcer le message sur le besoin de sérologies concomitantes et peut-être ouvrir la discussion à réviser ce seuil chez les bovins ou en tout cas ne pas le considérer comme un seuil indiscutable