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2. Effect of a speed ascent to the top of Europe on cognitive function in elite climbers
- Author
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Benoit Champigneulle, Karen Davranche, Julien Vincent Brugniaux, Sébastien Baillieul, Thibault Gajdos, Stéphane Doutreleau, Paul Robach, Pierre Bouzat, Samuel Verges, Université Grenoble Alpes (UGA), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), HP2 - Hypoxie : Physiopathologie Respiratoire et Cardiovasculaire, CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Facultés de médecine et de pharmacie Domaine de la merci, Laboratoire de psychologie cognitive (LPC), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hypoxie et PhysioPathologie (HP2), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Pôle Thorax et Vaisseaux [CHU Grenoble], Ecole Nationale des Sports de Montagne (ENSM), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), CHU Grenoble, Laboratoire de Neurosciences Cognitives [Marseille] (LNC), Ecole Nationale de Ski et d'Alpinisme (E.N.S.A.), Dynamique et Structure du Cytosquelette Neuronal, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), and SALAS, Danielle
- Subjects
Adult ,Male ,Physiology ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SCCO]Cognitive science ,Cognition ,Oxygen Consumption ,Heart Rate ,Physiology (medical) ,Task Performance and Analysis ,Humans ,Orthopedics and Sports Medicine ,Hypoxia ,Exercise ,Fatigue ,Reaction time ,Spectroscopy, Near-Infrared ,Altitude ,Simon task ,Public Health, Environmental and Occupational Health ,General Medicine ,Mountaineering ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Cerebrovascular Circulation ,Cognitive control ,Female ,France ,Blood Flow Velocity - Abstract
International audience; Purpose: The combined effects of acute hypoxia and exercise on cognition remain to be clarified. We investigated the effect of speed climbing to high altitude on reactivity and inhibitory control in elite climbers.Methods: Eleven elite climbers performed a speed ascent of the Mont-Blanc (4810 m) and were evaluated pre- (at 1000 m) and immediately post-ascent (at 3835 m). In both conditions, a Simon task was done at rest (single-task session, ST) and during a low-intensity exercise (dual-task session, DT). Prefrontal cortex (PFC) oxygenation and middle cerebral artery velocity (MCAv) were monitored using near-infrared spectroscopy and transcranial Doppler, respectively, during the cognitive task. Self-perceived mental fatigue and difficulty to perform the cognitive tests were estimated using a visual analog scale. Heart rate and pulse oxygenation (SpO2) were monitored during the speed ascent.Results: Elite climbers performed an intense (~ 50% of the time ≥ 80% of maximal heart rate) and prolonged (8h58 ± 6 min) exercise in hypoxia (minimal SpO2 at 4810 m: 78 ± 4%). Reaction time and accuracy during the Simon task were similar pre- and post-ascent (374 ± 28 ms vs. 385 ± 39 ms and 6 ± 4% vs. 5 ± 4%, respectively; p > 0.05), despite a reported higher mental fatigue and difficulty to perform the Simon task post-ascent (all p < 0.05). The magnitude of the Simon effect was unaltered (p > 0.05), suggesting a preserved cognitive control post-ascent. Pattern of PFC oxygenation and MCAv differed between pre- and post-ascent as well as between ST and DT conditions.Conclusions: Cognitive control is not altered in elite climbers after a speed ascent to high-altitude despite substantial cerebral deoxygenation and fatigue perception.
- Published
- 2022
3. A mean-field approach to the dynamics of networks of complex neurons, from nonlinear Integrate-and-Fire to Hodgkin–Huxley models
- Author
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Alain Destexhe, M. di Volo, Charlotte Héricé, M. Jedynak, L. Dalla Porta, Cristiano Capone, P. Muratore, E. Köksal Ersöz, Selma Souihel, Damien Depannemaecker, Yann Zerlaut, O. Chehab, M. Carlu, Institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay), Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), Universitat de Barcelona (UB), University of Strathclyde [Glasgow], [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Mathématiques pour les Neurosciences (MATHNEURO), Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Biologically plausible Integrative mOdels of the Visual system : towards synergIstic Solutions for visually-Impaired people and artificial visiON (BIOVISION), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare [Sezione di Roma 1] (INFN), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, H2020-720270 & H2020-785907, Human Brain project, 616268, European Reseach Council, European Project: 720270,H2020 Pilier Excellent Science,H2020-Adhoc-2014-20,HBP SGA1(2016), European Project: 616268,EC:FP7:ERC,ERC-2013-CoG,F-TRACT(2014), Souihel, Selma, Human Brain Project Specific Grant Agreement 1 - HBP SGA1 - - H2020 Pilier Excellent Science2016-04-01 - 2018-03-31 - 720270 - VALID, Functional Brain Tractography - F-TRACT - - EC:FP7:ERC2014-08-01 - 2019-07-31 - 616268 - VALID, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Institut des Neurosciences de Paris-Saclay (Neuro-PSI), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Strathclyde, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sapienza University [Rome], and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)
- Subjects
mean field ,cortical dynamics ,Physiology ,Computer science ,asynchronous irregular ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Models, Neurological ,population models ,[PHYS.MPHY]Physics [physics]/Mathematical Physics [math-ph] ,Population ,Inhibitory postsynaptic potential ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,spiking networks ,Animals ,Humans ,education ,[INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] ,030304 developmental biology ,Neurons ,0303 health sciences ,education.field_of_study ,Quantitative Biology::Neurons and Cognition ,General Neuroscience ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,[PHYS.MPHY] Physics [physics]/Mathematical Physics [math-ph] ,Electrophysiological Phenomena ,Exponential function ,Hodgkin–Huxley model ,Electrophysiology ,Nonlinear system ,nervous system ,Mean field theory ,Population model ,Asynchronous communication ,Excitatory postsynaptic potential ,RC0321 ,Neural Networks, Computer ,Nerve Net ,[INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] ,Biological system ,030217 neurology & neurosurgery ,Research Article - Abstract
We present a mean-field formalism able to predict the collective dynamics of large networks of conductance-based interacting spiking neurons. We apply this formalism to several neuronal models, from the simplest Adaptive Exponential Integrate-and-Fire model to the more complex Hodgkin-Huxley and Morris-Lecar models. We show that the resulting mean-field models are capable of predicting the correct spontaneous activity of both excitatory and inhibitory neurons in asynchronous irregular regimes, typical of cortical dynamics. Moreover, it is possible to quantitatively predict the populations response to external stimuli in the form of external spike trains. This mean-field formalism therefore provides a paradigm to bridge the scale between population dynamics and the microscopic complexity of the individual cells physiology.NEW & NOTEWORTHYPopulation models are a powerful mathematical tool to study the dynamics of neuronal networks and to simulate the brain at macroscopic scales. We present a mean-field model capable of quantitatively predicting the temporal dynamics of a network of complex spiking neuronal models, from Integrate-and-Fire to Hodgkin-Huxley, thus linking population models to neurons electrophysiology. This opens a perspective on generating biologically realistic mean-field models from electrophysiological recordings.
- Published
- 2020
4. Development and Validation of a New Risk Prediction Score for Life-Threatening Ventricular Tachyarrhythmias in Laminopathies
- Author
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Mélanie Fradin, Nicolas Sadoul, Xavier Waintraub, Didier Klug, Albert Hagège, Pascal Sabouraud, Arnaud Isapof, Julien Durigneux, Olivier Lascols, Pascal Laforêt, Armelle Magot, Ivana Dabaj, Eloi Marijon, Camille Vatier, Pascal Cintas, Emmanuelle Salort, Bénédicte Gaborit, Antoine Muchir, Xavier Ferrer, Pascale Richard, Corinne Metay, Stéphane Boulé, Sarah Leonard-Louis, Philippe Mabo, V. Tiffreau, Caroline Stalens, Jitendra K. Vohra, Stéphane Schaeffer, Khadija Chikhaoui, Eric Bieth, Sandra Mercier, Pierre Ambrosi, Aleksandra Nadaj-Pakleza, Michèle Mayer, Katja Zeppenfeld, Gisèle Bonne, Véronique Manel, Jean-Marc Davy, Guilhem Sole, Ghassan Moubarak, Nicolas Lamblin, Klaus Dieterich, Christophe Meune, Abdallah Fayssoil, Arnaud Lazarus, Philippe Maury, Karim Wahbi, Philippe Petiot, Isabelle Jéru, Annick Toutain, Corinne Vigouroux, Ana Ferreiro, Maud Michaud, H.M. Bécane, Bruno Eymard, Thomas D. Gossios, Marie-Christine Vantyghem, Saurabh Kumar, Estelle Gandjbakhch, Yann Péréon, T. Thompson, Marie-Christine Minot-Myhié, Anthony Behin, Frédéric Sacher, Philippe Charron, Nicolas Combes, Julien Praline, Dominique Babuty, Emmanuelle Lagrue, Usha B. Tedrow, Jean-Marc Sellal, Florence Petit, Perry M. Elliott, Frédéric Anselme, Philippe Chevalier, Frederic Taithe, Christine Barnerias, Vincent Laugel, Andoni Echaniz-Laguna, Raphaël P. Martins, Alexander F.A. Androulakis, Rabah Ben Yaou, Franck Boccara, Ulrike Walther-Louvier, Tanya Stojkovic, Françoise Bouhour, Annachiara De Sandre-Giovannoli, Susana Quijano-Roy, Françoise Chapon, Jean-Noël Trochu, Céline Tard, Anne Rollin, Jean-Marie Cuisset, Denis Duboc, Raphaël Porcher, Catherine Sarret, Jonathan M. Kalman, Florence Demurger, Damien Bonnet, Christine Francannet, Neal K. Lakdawala, Romain Eschalier, Fabien Labombarda, Kostantinos Savvatis, Raul Juntas Morales, Isabelle Desguerre, Nicolas Lévy, Anne-Claire Brehin, Service de Cardiologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Rouen, Normandie Université (NU), St Bartholomew's Hospital (London), Brigham & Women’s Hospital [Boston] (BWH), Harvard Medical School [Boston] (HMS), Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC (UMR_S 970/ U970)), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon), IHU-LIRYC, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de Cardiologie B, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Unité de recherche de l'institut du thorax (ITX-lab), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], William Harvey Research Institute, Barts and the London Medical School, Biostatistique et épidemiologie clinique, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Myologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de cardiologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Filière Neuromusculaire (FILNEMUS), Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université de Caen Normandie (UNICAEN), Laboratoire d'Informatique Scientifique et Industrielle (LISI), Université de Poitiers-Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et d'Aérotechnique [Poitiers] (ISAE-ENSMA), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], CHU Lille, Institut Européen de Génomique du Diabète - European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 - UFR de Médecine Pierre et Marie Curie (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Aix Marseille Université (AMU), Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Institut de cardiologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de cardiologie et maladies vasculaires [Rennes] = Cardiac, Thoracic, and Vascular Surgery [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clinique Pasteur [Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), The Royal Melbourne Hospital, Leiden University Medical Center (LUMC), Universiteit Leiden, Service de neurologie pédiatrique [CHU Necker], Institut Cochin (UMR_S567 / UMR 8104), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Hôpital Privé Le Bois Ramsay Santé [Lille], Service de génétique [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Mobilités : Vieillissement, Pathologie, Santé (COMETE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Roger Salengro [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre de ressources biologiques Tissus ADN Cellules [Hôpital de la Timone - APHM] (CRB TAC), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Cytogénétique et de Biologie Cellulaire, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Clermont-Ferrand, Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative (BFA (UMR_8251 / U1133)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [Bordeaux], Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de chirurgie cadiovasculaire et thoracique [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Service de cardiologie [CHU HEGP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), CHU Trousseau [APHP], Département de neurologie [Montpellier], Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Gui de Chauliac [CHU Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 (RID-AGE), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CHU Strasbourg, Clinique Ambroise Paré [Centres Médico-Chirurgicaux Ambroise Pré, Pierre Cherest, Hartmann], Hôpital Cochin [AP-HP], Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Lorraine (UL), Service de neurologie [Angers], Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 (JPArc), Université Lille Nord de France (COMUE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Neurologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de Neurologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Laboratoire d'étude de la motricité humaine - EA 3608 (LEMH), Université de Lille, Droit et Santé, Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Physiopathologie et thérapie du muscle strié, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR14-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montréal (UdeM), Laboratoire Génie des procédés papetiers (LGP2 ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The Heart Hospital [London], University College of London [London] (UCL), This study was funded by grants from the AFM-Téléthon (French Alliance against Myopathies), which was not involved in the design and conduct of the study, collection, management, analysis, and interpretation of the data, preparation, review, or approval of the manuscript, and decision to submit the manuscript for publication. Some of this work was undertaken at University College London (United Kingdom) and St. Bartholomew’s Hospital (London, United Kingdom), which received a portion of funding from the United Kingdom Department of Health’s National Institute for Health Research Biomedical Research Centres funding scheme., Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], Centre de recherche en myologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-CHU Trousseau [APHP], unité de recherche de l'institut du thorax UMR1087 UMR6291 (ITX), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de cardiologie et maladies vasculaires, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Unit of Neuromuscular Morphology [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Institut de Myologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de référence des maladies rares neuromusculaires Aquitaine-Grand Sud Ouest, CHU Bordeaux [Bordeaux], Laboratoire d'Informatique Scientifique et Industrielle (LISI / ENSMA), LISI-ENSMA, Service de Biochimie-Génétique [Béclère], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Thérapie des maladies du muscle strié, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Cardiologie A, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'Endocrinologie et Métabolisme, Unité de Cardiologie et Soins Intensifs, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de Génétique [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Centre de Référence M3C Malformations Cardiaques Congénitales Complexes, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Hôpital neurologique, Centre Hospitalier Universitaire de Lille (CHU de Lille), Service Neurologie Pédiatrique, Service de Neuropédiatrie, INSERM U836, équipe 4, Muscles et pathologies, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Département de Neurologie, Hôpital Civil de Strasbourg, Groupe Myologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique médicale, CHU - HÔTEL-DIEU Clermont-Ferrand, CLAD Ouest, Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Service de Neuropédiatrie [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Imagerie et cerveau, Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement (Inserm U1167 - RID-AGE - Institut Pasteur), Clinique Ambroise Paré, CHU Cochin [AP-HP], Epilepsie, sommeil et explorations fonctionnelles neuropédiatriques, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hopital Neurologique-Hôpital Femme Mère Enfant, Department of Medicine, Columbia University [New York]-College of Physicians and Surgeons, Service de neurologie, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer (JPArc - U837 Inserm), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université Lille 2 - Faculté de Médecine, Hôpital de Rangueil, Institut Pascal - Clermont Auvergne (IP), Sigma CLERMONT (Sigma CLERMONT)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), laboratoire d'étude de la motricité humaine (LEMH EA3608), Université de Montréal - UdeM (CANADA), Laboratoire Génie des procédés papetiers (LGP2), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche en Myologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Sorbonne Université, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut de Myologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), European Genomic Institute for Diabetes - FR 3508 (EGID), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Hôpital Purpan [Toulouse], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Hôpital Gui de Chauliac [Montpellier]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Myologie, and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
Adult ,Male ,Tachycardia ,medicine.medical_specialty ,implantable ,Accurate estimation ,Ventricular Tachyarrhythmias ,Validation Studies as Topic ,030204 cardiovascular system & hematology ,tachycardia ,Sudden death ,LMNA ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,[SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system ,death ,Physiology (medical) ,Internal medicine ,defibrillators ,medicine ,Humans ,In patient ,030212 general & internal medicine ,sudden ,[SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics ,Prediction score ,business.industry ,Defibrillators, Implantable ,ventricular ,Tachycardia, Ventricular ,Cardiology ,Female ,medicine.symptom ,Cardiomyopathies ,Cardiology and Cardiovascular Medicine ,business - Abstract
Background: An accurate estimation of the risk of life-threatening (LT) ventricular tachyarrhythmia (VTA) in patients with LMNA mutations is crucial to select candidates for implantable cardioverter-defibrillator implantation. Methods: We included 839 adult patients with LMNA mutations, including 660 from a French nationwide registry in the development sample, and 179 from other countries, referred to 5 tertiary centers for cardiomyopathies, in the validation sample. LTVTA was defined as (1) sudden cardiac death or (2) implantable cardioverter defibrillator–treated or hemodynamically unstable VTA. The prognostic model was derived using the Fine-Gray regression model. The net reclassification was compared with current clinical practice guidelines. The results are presented as means (SD) or medians [interquartile range]. Results: We included 444 patients, 40.6 (14.1) years of age, in the derivation sample and 145 patients, 38.2 (15.0) years, in the validation sample, of whom 86 (19.3%) and 34 (23.4%) experienced LTVTA over 3.6 [1.0–7.2] and 5.1 [2.0–9.3] years of follow-up, respectively. Predictors of LTVTA in the derivation sample were: male sex, nonmissense LMNA mutation, first degree and higher atrioventricular block, nonsustained ventricular tachycardia, and left ventricular ejection fraction (https://lmna-risk-vta.fr). In the derivation sample, C-index (95% CI) of the model was 0.776 (0.711–0.842), and the calibration slope 0.827. In the external validation sample, the C-index was 0.800 (0.642–0.959), and the calibration slope was 1.082 (95% CI, 0.643–1.522). A 5-year estimated risk threshold ≥7% predicted 96.2% of LTVTA and net reclassified 28.8% of patients with LTVTA in comparison with the guidelines-based approach. Conclusions: In comparison with the current standard of care, this risk prediction model for LTVTA in laminopathies significantly facilitated the choice of candidates for implantable cardioverter defibrillators. Clinical Trial Registration: URL: https://www.clinicaltrials.gov . Unique identifier: NCT03058185.
- Published
- 2019
5. CYP46A1 gene therapy deciphers the role of brain cholesterol metabolism in Huntington’s disease
- Author
-
Antonin Lamaziere, Coline Mounier, Wilhelm Christaller, Sandrine Betuing, Peter Vanhoutte, Satish Sasidharan Nair, Jocelyne Caboche, Nicolas Heck, Radhia Kacher, Vincent Kappes, Nathalie Cartier, Valérie Messent, Gaëtan Despres, Elodie Perrin, Laurent Venance, Frédéric Saudou, Yulia Dembitskaya, Christian Neri, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Signalisation Neuronale et Régulations Géniques = Neuronal Signaling and Gene Regulation (NPS-02), Neurosciences Paris Seine (NPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurobiologie des processus adaptatifs (NPA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Team Dynamic and Pathophysiology of Neuronal Networks, Center for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Chaire Neuropharmacologie (INSERM U114), Collège de France (CdF (institution)), Régulations cellulaires et oncogenèse (RCO), Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Adaptation Biologique et Vieillissement = Biological Adaptation and Ageing (B2A), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuroscience Paris Seine (NPS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Collège de France (CdF)-PSL Research University (PSL), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neurobiologie pharmacologique, Collège de France (CdF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Thérapie génique, Génomique et Epigénomique (U 1169), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Dynamics and Pathophysiology of neuronal networks, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Vanhoutte, Peter, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Chimie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
0301 basic medicine ,Huntingtin ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Tropomyosin receptor kinase B ,Disease ,Axonal Transport ,Mice ,0302 clinical medicine ,Neural Pathways ,Medicine ,Gene Knock-In Techniques ,Cells, Cultured ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Cerebral Cortex ,Huntingtin Protein ,Membrane Glycoproteins ,Brain ,Oxysterols ,Dependovirus ,Protein-Tyrosine Kinases ,3. Good health ,Huntington Disease ,Neuroprotective Agents ,neuroprotection ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Proteasome Endopeptidase Complex ,autophagy ,Genetic Vectors ,Mice, Transgenic ,Endosomes ,Protein Aggregation, Pathological ,Neuroprotection ,03 medical and health sciences ,Huntington's disease ,mental disorders ,Cholesterol 24-Hydroxylase ,Animals ,Humans ,synaptic transmission ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Brain-derived neurotrophic factor ,business.industry ,Brain-Derived Neurotrophic Factor ,Autophagy ,cholesterol ,Genetic Therapy ,medicine.disease ,Corpus Striatum ,Mice, Inbred C57BL ,030104 developmental biology ,Proteasome ,Rotarod Performance Test ,Neurology (clinical) ,business ,transcriptome ,Neuroscience ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
Dysfunctions in brain cholesterol homeostasis have been extensively related to brain disorders. The main pathway for brain cholesterol elimination is its hydroxylation into 24S-hydroxycholesterol by the cholesterol 24-hydrolase, CYP46A1. Increasing evidence suggests that CYP46A1 has a role in the pathogenesis and progression of neurodegenerative disorders, and that increasing its levels in the brain is neuroprotective. However, the mechanisms underlying this neuroprotection remain to be fully understood. Huntington’s disease is a fatal autosomal dominant neurodegenerative disease caused by an abnormal CAG expansion in huntingtin’s gene. Among the multiple cellular and molecular dysfunctions caused by this mutation, altered brain cholesterol homeostasis has been described in patients and animal models as a critical event in Huntington’s disease. Here, we demonstrate that a gene therapy approach based on the delivery of CYP46A1, the rate-limiting enzyme for cholesterol degradation in the brain, has a long-lasting neuroprotective effect in Huntington’s disease and counteracts multiple detrimental effects of the mutated huntingtin. In zQ175 Huntington’s disease knock-in mice, CYP46A1 prevented neuronal dysfunctions and restored cholesterol homeostasis. These events were associated to a specific striatal transcriptomic signature that compensates for multiple mHTT-induced dysfunctions. We thus explored the mechanisms for these compensations and showed an improvement of synaptic activity and connectivity along with the stimulation of the proteasome and autophagy machineries, which participate to the clearance of mutant huntingtin (mHTT) aggregates. Furthermore, BDNF vesicle axonal transport and TrkB endosome trafficking were restored in a cellular model of Huntington’s disease. These results highlight the large-scale beneficial effect of restoring cholesterol homeostasis in neurodegenerative diseases and give new opportunities for developing innovative disease-modifying strategies in Huntington’s disease.
- Published
- 2019
6. How reversible are the effects of silver nanoparticles on macrophages? A proteomic-instructed view
- Author
-
Catherine Aude-Garcia, Jacques Bourguignon, Sarah Cianférani, Anaelle Torres, Thierry Rabilloud, Karin Pernet-Gallay, Marie Carrière, Pierre-Henri Jouneau, Stéphane Ravanel, Hélène Diemer, Bastien Dalzon, Véronique Collin-Faure, Protéomique, Métaux et Différenciation (ProMD ), Laboratoire de Chimie et Biologie des Métaux (LCBM - UMR 5249), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plantes, Stress & Métaux (MetalStress), Physiologie cellulaire et végétale (LPCV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Laboratoire d'Etude des Matériaux par Microscopie Avancée (LEMMA ), Modélisation et Exploration des Matériaux (MEM), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), SYstèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l’Energie et la Santé (SYMMES), ANSES (Agence Nationale de Sécurité Alimentaire, Environnementale et du Travail) (PNREST 2011/25, Innimmunotox project), CEA toxicology program (Nanostress grant), ANR-11-IDEX-0001,Amidex,INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE(2011), ANR-10-EQPX-0039,NanoID,Plateforme d'identification des nanoparticules dédiée à la sécurité(2010), Rabilloud, Thierry, INITIATIVE D'EXCELLENCE AIX MARSEILLE UNIVERSITE - - Amidex2011 - ANR-11-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Equipements d'excellence - Plateforme d'identification des nanoparticules dédiée à la sécurité - - NanoID2010 - ANR-10-EQPX-0039 - EQPX - VALID, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Etude des Matériaux par Microscopie Avancée (LEMMA), Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Protéomique, Métaux et Différenciation (ProMD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), ANR-11-IDEX-0001-02/11-LABX-0064,SERENADE,Vers une conception de nanomatériaux innovants, durables et sûrs(2011), ANR-11-IDEX-0001-02/11-IDEX-0001,AMIDEX,AMIDEX(2011), ANR-10-EQPX-0039/10-EQPX-0039,NanoID,Plateforme d'identification des nanoparticules dédiée à la sécurité(2010), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
Materials Science (miscellaneous) ,medicine.medical_treatment ,Cellular homeostasis ,02 engineering and technology ,010501 environmental sciences ,medicine.disease_cause ,01 natural sciences ,Silver nanoparticle ,Nitric oxide ,chemistry.chemical_compound ,Immune system ,[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,medicine ,Macrophage ,0105 earth and related environmental sciences ,General Environmental Science ,Chemistry ,Lipid metabolism ,021001 nanoscience & nanotechnology ,Cell biology ,[SDV.TOX] Life Sciences [q-bio]/Toxicology ,Cytokine ,[SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology ,[SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,0210 nano-technology ,Oxidative stress - Abstract
International audience; Silver nanoparticles are known to strongly affect biological systems, and numerous toxicological studies have investigated their effects. Most of these studies examine the effects immediately following acute exposure. In this work, we have conducted further investigation by studying not only the acute, post-exposure response, but also the cellular response after a 72 hour-recovery-phase post exposure. As a biological model we have used macrophages, which are very important cells with respect to their role in the immune response to particulate materials. To investigate the response of macrophages to nanoparticles and their recovery post exposure, we have used a combination of proteomics and targeted experiments. These experiments provided evidence that the cellular reaction to nanoparticles, including the reaction during the recovery phase, is a very active process involving massive energy consumption. Pathways such as the oxidative stress response, central and lipid metabolism, protein production and quality control are strongly modulated during the cellular response to nanoparticles, and restoration of basic cellular homeo-stasis occurs during the recovery period. However, some specialized macrophage functions, such as lipopolysaccharide-induced cytokine and nitric oxide production, did not return to their basal levels even 72 hours post exposure, showing that some effects of silver nanoparticles persist even after exposure has ceased.
- Published
- 2019
7. La boucle est bouclée
- Author
-
Christophe Bosc, Leticia Peris, Marie-Jo Moutin, Annie Andrieux, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Organisation Fonctionnelle du Cytosquelette, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR27, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
0301 basic medicine ,03 medical and health sciences ,030104 developmental biology ,Chemistry ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,General Medicine ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology - Abstract
International audience; No abstract available
- Published
- 2018
8. MP3: Medical Software for Processing Multi-Parametric Images Pipelines
- Author
-
Clément Brossard, Olivier Montigon, Fabien Boux, Aurélien Delphin, Thomas Christen, Emmanuel L. Barbier, Benjamin Lemasson, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Modèles statistiques bayésiens et des valeurs extrêmes pour données structurées et de grande dimension (STATIFY), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2020-....] (Grenoble INP [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2020-....] (Grenoble INP [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....]), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), ANR-19-P3IA-0003,MIAI,MIAI @ Grenoble Alpes(2019), Brossard, Clément, MIAI @ Grenoble Alpes - - MIAI2019 - ANR-19-P3IA-0003 - P3IA - VALID, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2020-....] (Grenoble INP [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, and Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
Computer science ,[SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,[INFO.INFO-IM] Computer Science [cs]/Medical Imaging ,Biomedical Engineering ,Neuroscience (miscellaneous) ,ComputingMethodologies_IMAGEPROCESSINGANDCOMPUTERVISION ,Image processing ,Computed tomography ,computer.software_genre ,050105 experimental psychology ,lcsh:RC321-571 ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Software ,Computer graphics (images) ,Medical software ,medicine ,[INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging ,0501 psychology and cognitive sciences ,Technology and Code ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry ,pipelines ,database ,[INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] ,Multi parametric ,medicine.diagnostic_test ,MP3 ,business.industry ,software ,05 social sciences ,Process (computing) ,medical images ,Pipeline (software) ,Computer Science Applications ,image processing ,Pipeline transport ,[SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,[INFO.INFO-TI] Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] ,[INFO.INFO-TI]Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,[INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM] ,business ,computer ,030217 neurology & neurosurgery ,Neuroscience ,MRI ,CT - Abstract
International audience; This article presents an open source software able to convert, display and process medical images. It differentiates itself from the existing software by its ability to design complex processing pipelines and to wisely execute them on a large database. An MP3 pipeline can contain unlimited homemade or ready-made processes and can be carried out with a parallel execution system. As a viewer, MP3 allows to display up to 4 images together and to draw Regions Of Interest (ROI). Two applications showing the strengths of the software are here exposed: a preclinical study involving Magnetic Resonance Imaging (MRI) data and a clinical one involving Computed Tomography (CT) images. MP3 is downloadable at https://github.com/nifm-gin/MP3.
- Published
- 2020
9. Bayesian inverse regression for vascular magnetic resonance fingerprinting
- Author
-
Julyan Arbel, Emmanuel L. Barbier, Florence Forbes, Fabien Boux, Benjamin Lemasson, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences, Modèles statistiques bayésiens et des valeurs extrêmes pour données structurées et de grande dimension (STATIFY), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Equipe 5 : NeuroImagerie Fonctionnelle et Perfusion Cérébrale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-[GIN] Grenoble Institut des Neurosciences, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), NeuroImagerie Fonctionnelle et Perfusion Cérébrale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), ANR-16-CE37-0013,Epicyte,Dynamique cérébrovasculaire au cours de l'épilepsie: interface endothélium-pericyte(2016), ANR-11-INBS-0006,FLI,France Life Imaging(2011), ANR-19-P3IA-0003,MIAI,MIAI @ Grenoble Alpes(2019), Forbes, Florence, Dynamique cérébrovasculaire au cours de l'épilepsie: interface endothélium-pericyte - - Epicyte2016 - ANR-16-CE37-0013 - AAPG2016 - VALID, Infrastructures - France Life Imaging - - FLI2011 - ANR-11-INBS-0006 - INBS - VALID, and MIAI @ Grenoble Alpes - - MIAI2019 - ANR-19-P3IA-0003 - P3IA - VALID
- Subjects
Matching (statistics) ,Magnetic Resonance Spectroscopy ,Computer science ,Bayesian probability ,multiparametric mapping ,Quantitative imaging ,brain vascular structure ,030218 nuclear medicine & medical imaging ,Data modeling ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Sampling (signal processing) ,[MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST] ,Image Processing, Computer-Assisted ,Animals ,Computer Simulation ,Electrical and Electronic Engineering ,[MATH.MATH-ST] Mathematics [math]/Statistics [math.ST] ,Radiological and Ultrasound Technology ,business.industry ,Estimation theory ,Phantoms, Imaging ,inverse regression ,Deep learning ,Brain ,Pattern recognition ,Bayes Theorem ,Magnetic Resonance Imaging ,Computer Science Applications ,Rats ,Undersampling ,Noise (video) ,Artificial intelligence ,magnetic resonance fingerprinting ,business ,dictionary learning ,Software ,Algorithms - Abstract
International audience; Standard parameter estimation from vascular magnetic resonance fingerprinting (MRF) data is based on matching the MRF signals to their best counterparts in a grid of coupled simulated signals and parameters, referred to as a dictionary. To reach a good accuracy, the matching requires an informative dictionary whose cost, in terms of design, storage and exploration, is rapidly prohibitive for even moderate numbers of parameters. In this work, we propose an alternative dictionary-based \textcolor{black}{statistical} learning (DB-SL) approach made of three steps: 1) a quasi-random sampling strategy to produce efficiently an informative dictionary, 2) an inverse statistical regression model to learn from the dictionary a correspondence between fingerprints and parameters, and 3) the use of this mapping to provide both parameter estimates and their confidence indices. The proposed DB-SL approach is compared to both the standard dictionary-based matching (DBM) method and to a dictionary-based deep learning (DB-DL) method. Performance is illustrated first on synthetic signals including scalable and standard MRF signals with spatial undersampling noise. Then, vascular MRF signals are considered both through simulations and real data acquired in tumor bearing rats. Overall, the two learning methods yield more accurate parameter estimates than matching and to a range not limited to the dictionary boundaries. DB-SL in particular resists to higher noise levels and provides in addition confidence indices on the estimates at no additional cost. DB-SL appears as a promising method to reduce simulation needs and computational requirements, while modeling sources of uncertainty and providing both accurate and interpretable results.
- Published
- 2020
10. Deletion of the microtubule-associated protein 6 (MAP6) results in skeletal muscle dysfunction
- Author
-
Sylvie Gory-Fauré, Annie Andrieux, Mathilde Chivet, Christophe Bosc, Laura Pietrangelo, Julie Brocard, Muriel Sébastien, Isabelle Marty, Perrine Aubin, Benoît Giannesini, Anne Fourest-Lieuvin, John Rendu, Jacques Brocard, Simona Boncompagni, Julien Fauré, INSERM U836, équipe 4, Muscles et pathologies, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Grenoble Alpes (UGA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University 'G. d'Annunzio' of Chieti-Pescara [Chieti], INSERM U836, équipe 1, Physiopathologie du cytosquelette, Organisation Fonctionnelle du Cytosquelette, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR27, Université de Montpellier (UM), Canaux calciques , fonctions et pathologies, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Association Française contre lesMyopathies (AFM-Téléthon) to MS, PA, and IM, and from Italian Ministry ofHealth - GR2011-02352681 to SB, Giannesini, Benoit, Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
Male ,0301 basic medicine ,lcsh:Diseases of the musculoskeletal system ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Muscle Fibers, Skeletal ,Triad ,Sarcoplasmic reticulum ,[SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,Microtubules ,Mice ,03 medical and health sciences ,Microtubule ,medicine ,[SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology ,Animals ,Orthopedics and Sports Medicine ,[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology ,Calcium Signaling ,MAP6 ,Molecular Biology ,[SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,Cells, Cultured ,Calcium release ,Chemistry ,Myogenesis ,Microtubule-associated protein ,Muscle weakness ,Skeletal muscle ,Cell Biology ,Muscle atrophy ,Cell biology ,Mice, Inbred C57BL ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,030104 developmental biology ,medicine.anatomical_structure ,Muscle contraction ,Knockout mouse ,Female ,medicine.symptom ,lcsh:RC925-935 ,Microtubule-Associated Proteins ,Gene Deletion - Abstract
Background The skeletal muscle fiber has a specific and precise intracellular organization which is at the basis of an efficient muscle contraction. Microtubules are long known to play a major role in the function and organization of many cells, but in skeletal muscle, the contribution of the microtubule cytoskeleton to the efficiency of contraction has only recently been studied. The microtubule network is dynamic and is regulated by many microtubule-associated proteins (MAPs). In the present study, the role of the MAP6 protein in skeletal muscle organization and function has been studied using the MAP6 knockout mouse line. Methods The presence of MAP6 transcripts and proteins was shown in mouse muscle homogenates and primary culture using RT-PCR and western blot. The in vivo evaluation of muscle force of MAP6 knockout (KO) mice was performed on anesthetized animals using electrostimulation coupled to mechanical measurement and multimodal magnetic resonance. The impact of MAP6 deletion on microtubule organization and intracellular structures was studied using immunofluorescent labeling and electron microscopy, and on calcium release for muscle contraction using Fluo-4 calcium imaging on cultured myotubes. Statistical analysis was performed using Student’s t test or the Mann-Whitney test. Results We demonstrate the presence of MAP6 transcripts and proteins in skeletal muscle. Deletion of MAP6 results in a large number of muscle modifications: muscle weakness associated with slight muscle atrophy, alterations of microtubule network and sarcoplasmic reticulum organization, and reduction in calcium release. Conclusion Altogether, our results demonstrate that MAP6 is involved in skeletal muscle function. Its deletion results in alterations in skeletal muscle contraction which contribute to the global deleterious phenotype of the MAP6 KO mice. As MAP6 KO mouse line is a model for schizophrenia, our work points to a possible muscle weakness associated to some forms of schizophrenia.
- Published
- 2018
11. Automatic bad channel detection in intracranial electroencephalographic recordings using ensemble machine learning
- Author
-
Philippe Kahane, Manik Bhattacharjee, Blandine Chanteloup-Foret, Viateur Tuyisenge, Louis Maillard, Olivier David, Sylvain Rheims, Delphine Taussig, Carole Saubat-Guigui, Lena Trebaul, Ioana Mîndruţă, Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Medicine and Pharmacy 'Carol Davila' Bucharest (UMPCD), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de neurologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Fondation Rothschild, Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR), and Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris]
- Subjects
0301 basic medicine ,Computer science ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Feature extraction ,Article ,Stereo-EEG ,Stereoelectroencephalography ,Correlation ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Physiology (medical) ,Machine learning ,Humans ,Bad channels ,ECoG, electrocorticography ,iEEG, intracranial electroencephalography ,Epilepsy ,Ensemble bagging ,Intracranial EEG ,business.industry ,Brain ,Pattern recognition ,Ensemble learning ,Intracranial eeg ,Sensory Systems ,ComputingMethodologies_PATTERNRECOGNITION ,030104 developmental biology ,Neurology ,Electrocorticography ,Neurology (clinical) ,Artificial intelligence ,SEEG, stereo-electroencephalography ,business ,[SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing ,Classifier (UML) ,DES, direct electrical stimulation ,EEG, electroencephalography ,030217 neurology & neurosurgery ,Data selection ,Communication channel - Abstract
Highlights • We propose a method that detects automatically bad channels from intracranial EEG (iEEG) datasets. • It computes iEEG features specific to bad channels and uses an ensemble bagging classifier. • The bad channel classification accuracy was demonstrated to be excellent on a large data sample., Objective Intracranial electroencephalographic (iEEG) recordings contain “bad channels”, which show non-neuronal signals. Here, we developed a new method that automatically detects iEEG bad channels using machine learning of seven signal features. Methods The features quantified signals’ variance, spatial–temporal correlation and nonlinear properties. Because the number of bad channels is usually much lower than the number of good channels, we implemented an ensemble bagging classifier known to be optimal in terms of stability and predictive accuracy for datasets with imbalanced class distributions. This method was applied on stereo-electroencephalographic (SEEG) signals recording during low frequency stimulations performed in 206 patients from 5 clinical centers. Results We found that the classification accuracy was extremely good: It increased with the number of subjects used to train the classifier and reached a plateau at 99.77% for 110 subjects. The classification performance was thus not impacted by the multicentric nature of data. Conclusions The proposed method to automatically detect bad channels demonstrated convincing results and can be envisaged to be used on larger datasets for automatic quality control of iEEG data. Significance This is the first method proposed to classify bad channels in iEEG and should allow to improve the data selection when reviewing iEEG signals.
- Published
- 2018
12. French guidelines on stereoelectroencephalography (SEEG)
- Author
-
Agnès Trébuchon, Vincent Navarro, Hélène Catenoix, Fabrice Bartolomei, Louis Maillard, Aileen McGonigal, Axel Lebas, Francine Chassoux, Delphine Taussig, William Szurhaj, Anne-Sophie Job-Chapron, Maria Paola Valenti-Hirsch, Lorella Minotti, Anca Nica, Mathilde Chipaux, Luc Valton, Vianney Gilard, Stéphane Derrey, Marc Guénot, Jean-Christophe Sol, Julia Scholly, Georg Dorfmüller, Pierre Bourdillon, Marie Denuelle, Stéphane Clemenceau, Jean-Pierre Vignal, Nicolas Reyns, Louise Tyvaert, Bertrand Devaux, Alexandra Montavont, Sophie Colnat-Coulbois, Paul Sauleau, Elisabeth Landré, Jean Isnard, CHU Lille, CNRS, Inserm, Université de Lille, Thérapies Lasers Assistées par l'Image pour l'Oncologie (ONCO-THAI) - U1189, Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U1171, Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 [ONCO-THAI], Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 [TCDV], Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physiologie-Explorations Fonctionnelles, Université de Rennes (UR), Institut de Neurosciences des Systèmes (INS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neuro-chirurgie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre Hospitalier Saint-Anne (GHU Paris), Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service de neurochirurgie [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Nutrition, inflammation et dysfonctionnement de l'axe intestin-cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service de psychiatrie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Hôpital Sainte-Anne, Service de neurochirurgie pédiatrique [Fondation Rothschild, Paris], Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], Endothélium microcirculatoire cérébral et lésions du système nerveux central au cours du développement (Néovasc), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Neurologie [Lyon], CHU Lyon, Université de Lyon, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Strasbourg, Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 (TCDV), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de recherche cerveau et cognition (CERCO), Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Comportement et noyaux gris centraux = Behavior and Basal Ganglia [Rennes], Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes = Institute of Clinical Neurosciences of Rennes (INCR), The authors would like to thank the Société de Neurophysiologie Clinique de Langue Française (SNCLF) and the Ligue Française Contre l’Épilepsie (LFCE) for their logistic and financial support for this work., Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre Hospitalier Saint-Anne, Service de Neurochirurgie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Toulouse [Toulouse], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fondation Rothschild, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Neurosciences des Systèmes ( INS ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute ( ICM ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition, inflammation et dysfonctionnement de l'axe intestin-cerveau ( ADEN ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Endothélium microcirculatoire cérébral et lésions du système nerveux central au cours du développement ( Néovasc ), Institute for Research and Innovation in Biomedicine ( IRIB ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de Recherche en Automatique de Nancy ( CRAN ), Université de Lorraine ( UL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image ( LTSI ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires ( DN2M ), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ) -INSERM, Centre de recherche cerveau et cognition ( CERCO ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Comportement et noyaux gris centraux [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université européenne de Bretagne ( UEB ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 (TCDV), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Centre Hospitalier Saint-Anne, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Cortex et Epilepsie [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU), Service de neurochirurgie [Rouen], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Hôpital Sainte-Anne, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires (U1171), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-INSERM, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut des sciences du cerveau de Toulouse. (ISCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Université de Rennes 1 (UR1)
- Subjects
Drug Resistant Epilepsy ,medicine.medical_specialty ,Drug-resistant epilepsy ,Adults ,Thermocoagulations ,Stereo-electroencephalogram ,Invasive exploration ,Guidelines ,Focal epilepsy ,Epilepsy surgery ,Children ,Guidelines as Topic ,Stereoelectroencephalography ,030218 nuclear medicine & medical imaging ,03 medical and health sciences ,Epileptic discharge ,0302 clinical medicine ,Physiology (medical) ,Electrocoagulation ,medicine ,Humans ,Medical physics ,[ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,Focal Epilepsies ,Electroencephalography ,General Medicine ,Electrodes, Implanted ,3. Good health ,Clinical Practice ,Neurology ,Current practice ,[SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,France ,Neurology (clinical) ,Psychology ,International league against epilepsy ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience; Stereoelectroencephalography (SEEG) was designed and developed in the 1960s in France by J. Talairach and J. Bancaud. It is an invasive method of exploration for drug-resistant focal epilepsies, offering the advantage of a tridimensional and temporally precise study of the epileptic discharge. It allows anatomo-electrical correlations and tailored surgeries. Whereas this method has been used for decades by experts in a limited number of European centers, the last ten years have seen increasing worldwide spread of its use. Moreover in current practice, SEEG is not only a diagnostic tool but also offers a therapeutic option, i.e., thermocoagulation. In order to propose formal guidelines for best clinical practice in SEEG, a working party was formed, composed of experts from every French centre with a large SEEG experience (those performing more than 10 SEEG per year over at least a 5 year period). This group formulated recommendations, which were graded by all participants according to established methodology. The first part of this article summarizes these within the following topics: indications and limits of SEEG; planning and management of SEEG; surgical technique; electrophysiological technical procedures; interpretation of SEEG recordings; and SEEG-guided radio frequency thermocoagulation. In the second part, those different aspects are discussed in more detail by subgroups of experts, based on existing literature and their own experience. The aim of this work is to present a consensual French approach to SEEG, which could be used as a basic document for centers using this method, particularly those who are beginning SEEG practice. These guidelines are supported by the French Clinical Neurophysiology Society and the French chapter of the International League Against Epilepsy.
- Published
- 2018
13. Anterior pallidal deep brain stimulation for Tourette's syndrome: a randomised, double-blind, controlled trial
- Author
-
Marie-Laure Welter, Jean-Luc Houeto, Stéphane Thobois, Benoit Bataille, Marc Guenot, Yulia Worbe, Andreas Hartmann, Virginie Czernecki, Eric Bardinet, Jerome Yelnik, Sophie Tezenas du Montcel, Yves Agid, Marie Vidailhet, Philippe Cornu, Audrey Tanguy, Solène Ansquer, Nematollah Jaafari, Emmanuel Poulet, Giulia Serra, Pierre Burbaud, Emmanuel Cuny, Bruno Aouizerate, Pierre Pollak, Stephan Chabardes, Mircea Polosan, Michel Borg, Denys Fontaine, Bruno Giordana, Sylvie Raoul, Tiphaine Rouaud, Anne Sauvaget, Isabelle Jalenques, Carine Karachi, Luc Mallet, M.L. Welter, E. Cuny, P. Derkinderen, D. Fontaine, J.L. Houeto, I. Jalenques, L. Mallet, P. Pollak, S. Thobois, A. Bissery, H. Oya, E. Bardinet, J. Yelnik, A. Buot, V. Czernecki, S. Tezenas du Montcel, A. Tanguy, M. Hajji, C. Karachi, A. Hartmann, Y. Agid, Y. Worbe, D. Dormont, M. Vidailhet, P. Cornu, B. Aouizerate, P. Burbaud, F. Durif, C. Fauchon, F. Rondepierre, P. Derost, M. Aya Kombo, M. Polosan, S. Chabardès, A. Krainik, P. Krack, B. Piallat, M. Guenot, E. Poulet, H. Klinger, G. Serra, E. Broussolle, T. Rouaud, A. Sauvaget, P. Damier, S Raoul, M. Borg, B. Giordana, M.-N. Magnie-Mauro, N. Jaafari, B. Bataille, S. Ansquer, I. Benatru, A. Fradet, E. Dugast, A. Ouerdani, E. Rabois, M. Quintin, S. Palfi, Krack, Paul, Pollak, Pierre, Service de Neuroradiologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CIC - Poitiers, Université de Poitiers-Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Direction Générale de l'Organisation des Soins (DGOS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Neurologie, Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de neurologie [Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de neurochirurgie fonctionnelle [Hôpital Pierre Wertheimer - HCL], CIC AP-HP (pitie-Salpetriere)/inserm, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service des Maladies du Système Nerveux [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre de Neuro-Imagerie de Recherche (CENIR), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurologie et thérapeutique expérimentale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR70-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service de neurologie [Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 - UFR de Médecine Pierre et Marie Curie (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Ecole de Technologie Supérieure [Montréal] (ETS), Immunologie antivirale systémique et cérébrale, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-IFR93-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiologie et physiopathologie de la signalisation cellulaire (PPSC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Charles Perrens, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Psychiatrie, CHU Grenoble, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Laboratoire de Psychologie et NeuroCognition (LPNC ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Service de neurologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre Mémoire de Ressources et de Recherche [CHU Clermont-Ferrand] (CMRR), CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Hôpital Guillaume-et-René-Laennec [Saint-Herblain], Hôpital de La Milétrie, Service de Biostatistiques [Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL), Department of Neurosurgery, Carver College of Medicine [Iowa City], University of Iowa [Iowa City]-University of Iowa [Iowa City], Service de Neurologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, UM des troubles du mouvement, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurosciences précliniques, Clinique neurologique, Hôpital Laennec, inconnu, Inconnu, Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Service d'Explorations Fonctionnelles Neurologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Neurosurgery, Centre de Référence National 'Syndrome Gilles de la Tourette', Pôle des Maladies du Système Nerveux, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Assistance Publique des Hôpitaux de Paris, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Station Expérimentale des Procédés Pilotes en Environnement (STEPPE), Institut des Maladies Neurodégénératives [Bordeaux] (IMN), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANTE-INSERM U836, équipe 11, Fonctions cérébrales et neuromodulation, Clinique de psychiatrie, CHU Grenoble-CHU Grenoble, Réseau d'Etude des Gliomes, REG, Neuro-Psycho Pharmacologie des Systèmes Dopimanégiques sous-corticaux - Clermont Auvergne (NPsy-Sydo), CHU Clermont-Ferrand-Université Clermont Auvergne (UCA), Service de Neurochirurgie [CHU Pitié-Salpêtrière], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Transduction du Signal et Plasticite Dans Le Systeme Nerveux, Gaz de France Suez (GDF Suez), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Center for NeuroImaging Research-Human MRI Neuroimaging core facility for clinical research [ICM Paris] (CENIR), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR70-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier Charles Perrens [Bordeaux], [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université de Rennes (UR), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pôle des Maladies du Système Nerveux [CHU Pitié-Salpêtrière] (Pôle MSN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [CHU Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Laboratoire de Psychologie et NeuroCognition (LPNC), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre Mémoire de Ressources et de Recherche [CHU de Clermont-Ferrand], Service de neurologie, and Hôpital Gabriel Montpied
- Subjects
Adult ,Male ,medicine.medical_specialty ,Movement disorders ,Deep brain stimulation ,Deep Brain Stimulation ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,medicine.medical_treatment ,Stimulation ,Globus Pallidus ,Severity of Illness Index ,law.invention ,Young Adult ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Double-Blind Method ,Randomized controlled trial ,law ,Outcome Assessment, Health Care ,Severity of illness ,medicine ,Clinical endpoint ,Humans ,Treatment Failure ,Young adult ,Adverse effect ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,[SDV.NEU.PC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Psychology and behavior ,business.industry ,[SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience ,musculoskeletal, neural, and ocular physiology ,[SDV.NEU.SC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Cognitive Sciences ,Middle Aged ,nervous system diseases ,ddc:616.8 ,030227 psychiatry ,3. Good health ,Surgery ,surgical procedures, operative ,nervous system ,Anesthesia ,Female ,Neurology (clinical) ,medicine.symptom ,business ,therapeutics ,030217 neurology & neurosurgery ,Tourette Syndrome - Abstract
Summary Background Deep brain stimulation (DBS) has been proposed to treat patients with severe Tourette's syndrome, and open-label trials and two small double-blind trials have tested DBS of the posterior and the anterior internal globus pallidus (aGPi). We aimed to specifically assess the efficacy of aGPi DBS for severe Tourette's syndrome. Methods In this randomised, double-blind, controlled trial, we recruited patients aged 18–60 years with severe and medically refractory Tourette's syndrome from eight hospitals specialised in movement disorders in France. Enrolled patients received surgery to implant bilateral electrodes for aGPi DBS; 3 months later they were randomly assigned (1:1 ratio with a block size of eight; computer-generated pairwise randomisation according to order of enrolment) to receive either active or sham stimulation for the subsequent 3 months in a double-blind fashion. All patients then received open-label active stimulation for the subsequent 6 months. Patients and clinicians assessing outcomes were masked to treatment allocation; an unmasked clinician was responsible for stimulation parameter programming, with intensity set below the side-effect threshold. The primary endpoint was difference in Yale Global Tic Severity Scale (YGTSS) score between the beginning and end of the 3 month double-blind period, as assessed with a Mann-Whitney-Wilcoxon test in all randomly allocated patients who received active or sham stimulation during the double-blind period. We assessed safety in all patients who were enrolled and received surgery for aGPi DBS. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT00478842. Findings Between Dec 6, 2007, and Dec 13, 2012, we enrolled 19 patients. We randomly assigned 17 (89%) patients, with 16 completing blinded assessments (seven [44%] in the active stimulation group and nine [56%] in the sham stimulation group). We noted no significant difference in YGTSS score change between the beginning and the end of the 3 month double-blind period between groups (active group median YGTSS score 68·5 [IQR 34·0 to 83·5] at the beginning and 62·5 [51·5 to 72·0] at the end, median change 1·1% [IQR −23·9 to 38·1]; sham group 73·0 [69·0 to 79·0] and 79·0 [59·0 to 81·5], median change 0·0% [–10·6 to 4·8]; p=0·39). 15 serious adverse events (three in patients who withdrew before stimulation and six each in the active and sham stimulation groups) occurred in 13 patients (three who withdrew before randomisation, four in the active group, and six in the sham group), with infections in DBS hardware in four patients (two who withdrew before randomisation, one in the sham stimulation group, and one in the active stimulation group). Other serious adverse events included one electrode misplacement (active stimulation group), one episode of depressive signs (active stimulation group), and three episodes of increased tic severity and anxiety (two in the sham stimulation group and one in the active stimulation group). Interpretation 3 months of aGPi DBS is insufficient to decrease tic severity for patients with Tourette's syndrome. Future research is needed to investigate the efficacy of aGPi DBS for patients over longer periods with optimal stimulation parameters and to identify potential predictors of the therapeutic response. Funding French Ministry of Health.
- Published
- 2017
14. Classification of neuron types from calcium imaging
- Author
-
Becq, Guillaume, Badreddine, Nagham, Tremblay, Nicolas, Appaix, Florence, Zalcman, Gisela, Fino, Elodie, Achard, Sophie, GIPSA-Services (GIPSA-Services), Grenoble Images Parole Signal Automatique (GIPSA-lab ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), GIPSA - Communication Information and Complex Systems (GIPSA-CICS), Département Images et Signal (GIPSA-DIS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Grenoble Images Parole Signal Automatique (GIPSA-lab ), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), GIPSA-Services (GIPSA-Services [2016-2019]), Grenoble Images Parole Signal Automatique [2016-2019] (GIPSA-lab [2016-2019]), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2007-2019] (Grenoble INP [2007-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2007-2019] (Grenoble INP [2007-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GIPSA Pôle Géométrie, Apprentissage, Information et Algorithmes [2020-....] (GIPSA-GAIA [2020-....]), Grenoble Images Parole Signal Automatique [2020-....] (GIPSA-lab [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2020-....] (Grenoble INP [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2020-....] (Grenoble INP [2020-....]), Université Grenoble Alpes [2020-....] (UGA [2020-....])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems [2016-2019] (MISTIS [2016-2019]), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2007-2019] (Grenoble INP [2007-2019])-Laboratoire Jean Kuntzmann [2016-2019] (LJK [2016-2019]), and Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology [2007-2019] (Grenoble INP [2007-2019])-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
[INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing - Abstract
International audience; Videos of calcium activities of mice striatum slices are recorded under stimulations by two-photon fluorescence microscopy. Neurons are selected by regions of interests (ROI) on the images and labelled into two classes: medium spiny neuron (MSN); interneurons (IN). Each ROI enables to obtain a neural signal. Features are extracted on these ROI and signals. A subset feature selection is performed with a quadratic discriminant analysis, to solve the supervised learning of the two classes of neuron of the striatum. It is shown, that a realistic evaluation of the database leads to a classification with an accuracy of 75 % for IN and 90% for MSN.; Les activités calciques de neurones dans des tranches de striatum de souris sont enregistrées en réponse à des stimulations sous forme de films par microscopie de fluorescence biphoton. Les neurones sont répérés sur les images sous forme de régions d'intérêt (ROI) et étiquetés suivant deux classes: neurone épineux moyen (medium spiny neuron, MSN) ; interneurone (interneuron, IN). L'analyse des ROI permet de calculer les signaux calciques neuronaux. Des caractéristiques sont extraites sur ces ROI et sur ces signaux calciques. Une recherche des caractéristiques pertinentes est proposée en utilisant une analyse discriminante quadratique sur la base d'un apprentissage supervisé des deux classes de neurones du striatum. On montre qu'une évaluation réaliste de la base de données permet d'obtenir un taux de bonne classification de l'ordre de 75 % pour les IN, tout en obtenant un taux de bonne classification de l'ordre de 90 % pour les MSN.
- Published
- 2019
15. LKB1 specifies neural crest cell fates through pyruvate-alanine cycling
- Author
-
Sakina Torch, Nadege Bondurand, Laurence Lafanechère, Karin Pernet-Gallay, Anca G. Radu, Lionel Larue, Nicolas Tricaud, Véronique Delmas, Renaud Blervaque, Chantal Thibert, Pierre Hainaut, Anthony Lucas, Marc Billaud, Nabeel Bardeesy, Florence Fauvelle, Veronique Pingault, Uwe Schlattner, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), IRMaGe (IRMaGe ), CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Physiopathologie du Cytosquelette, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Air Normand, Laboratory of Fundamental and Applied Bioenergetics = Laboratoire de bioénergétique fondamentale et appliquée (LBFA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Equipe n°3 Inserm U823, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Earth and Life Institute, Stress Agronomy Group, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), INSERM U955, équipe 11, Service de Biochimie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Massachusetts General Hospital Cancer Center, Harvard Medical School [Boston] (HMS), Ctr Rech, Institut Curie [Paris], Apoptose Cancer et Développement, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique moléculaire, signalisation et cancer (GMSC), This work was founded by 'l’Institut National du Cancer' (Programme recherche translationnelle en cancérologie), 'la Ligue régionale contre le cancer' (comité de l’Isère R17030CC), 'l’Association pour la Recherche sur le Cancer' (Fondation ARC R17158CC), and NIH/NCI (1R01CA219670-01A1)., We are grateful to E. Fontaine and K. Padmanabhan for helpful comments about the results. We thank J. Courchet, B. Viollet, and J. Maurer for sharing cells and reagents. We thank S. Michallet, B. Sefrin, and P. Vernet from the animal facility of the Institute for Advanced Biosciences and F. Blanquet and C. Colomb from the animal facility PHTA of Grenoble. We are grateful to D. Bouvard for giving us the R26R mice and to G. Chevallier for help with mouse breeding and genotyping. We thank V. Blanc-Marquis for technical help. S. Michallet and M. Schweitzer were very helpful with excellent technical assistance. C. Caron helped us with human sample studies. This work benefited from the help of T. Dufourd and M. Aguilera during their internships in the laboratory. J. Delaroche and A. Bertrand from the electron microscopy facility of the Neuroscience Institute of Grenoble performed semithin sections, staining, and electronic microscopy experiments and analyses. We thank N. Gadot and the ANIPATH facility, University Lyon1 Laennec, for tissue sections., Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), Hamant, Sarah, and Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,AMP-Activated Protein Kinases ,Enteric Nervous System ,Mice ,0302 clinical medicine ,[SDV.BC.IC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Cell Behavior [q-bio.CB] ,Pyruvic Acid ,skin and connective tissue diseases ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Research Articles ,Mice, Knockout ,0303 health sciences ,education.field_of_study ,Multidisciplinary ,Alanine ,Neural crest ,Peripheral Nervous System Diseases ,SciAdv r-articles ,Cell Differentiation ,Cell biology ,Mitochondria ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,medicine.anatomical_structure ,Phenotype ,Neural Crest ,embryonic structures ,Melanocytes ,Stem cell ,Signal transduction ,Neuroglia ,Signal Transduction ,Research Article ,congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities ,Population ,Schwann cell ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,Cell fate determination ,Biology ,Protein Serine-Threonine Kinases ,03 medical and health sciences ,medicine ,Animals ,Gene Silencing ,education ,030304 developmental biology ,[SDV.BDD.MOR]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Morphogenesis ,Cell Biology ,Embryonic stem cell ,[SDV.BDD.EO]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis ,Nerve Degeneration ,Enteric nervous system ,Energy Metabolism ,030217 neurology & neurosurgery ,Developmental Biology - Abstract
Glial specification of neural crest cells requires the tumor suppressor LKB1-mediated action on alanine biosynthesis., Metabolic processes underlying the development of the neural crest, an embryonic population of multipotent migratory cells, are poorly understood. Here, we report that conditional ablation of the Lkb1 tumor suppressor kinase in mouse neural crest stem cells led to intestinal pseudo-obstruction and hind limb paralysis. This phenotype originated from a postnatal degeneration of the enteric nervous ganglia and from a defective differentiation of Schwann cells. Metabolomic profiling revealed that pyruvate-alanine conversion is enhanced in the absence of Lkb1. Mechanistically, inhibition of alanine transaminases restored glial differentiation in an mTOR-dependent manner, while increased alanine level directly inhibited the glial commitment of neural crest cells. Treatment with the metabolic modulator AICAR suppressed mTOR signaling and prevented Schwann cell and enteric defects of Lkb1 mutant mice. These data uncover a link between pyruvate-alanine cycling and the specification of glial cell fate with potential implications in the understanding of the molecular pathogenesis of neural crest diseases.
- Published
- 2019
16. Troubles de l’humeur : quand recourir à la stimulation magnétique transcrânienne ?
- Author
-
Samuel Bulteau, Charline Guirette, Jérôme Brunelin, Emmanuel Poulet, Benoît Trojak, Raphaëlle Richieri, David Szekely, Djamila Bennabi, Antoine Yrondi, Maud Rotharmel, Thierry Bougerol, Gaëlle Dall’Igna, Jérôme Attal, René Benadhira, Noomane Bouaziz, Maxime Bubrovszky, Benjamin Calvet, Sonia Dollfus, Jack Foucher, Filipe Galvao, Aurélia Gay, Frédéric Haesebaert, Emmanuel Haffen, Isabelle Jalenques, Dominique Januel, Renaud Jardri, Bruno Millet, Clément Nathou, Cecilia Nauczyciel, Marion Plaze, Fady Rachid, Jean-Marie Vanelle, Anne Sauvaget, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de psychiatrie générale et addictologie [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Laboratoire de Neurosciences Intégratives et Cliniques - UFC (UR 481) (NEURO), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre d'Investigation Clinique de Besançon (Inserm CIC 1431), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier le Vinatier [Bron], Laboratoire Sciences Cognitives et Sciences Affectives - UMR 9193 (SCALab), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie et Stratégies Thérapeutiques des pathologies Cérébrales et Tumorales (ISTCT), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Comportement et noyaux gris centraux = Behavior and Basal Ganglia [Rennes], Université de Rennes (UR)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes = Institute of Clinical Neurosciences of Rennes (INCR), Centre de Psychiatrie et Neurosciences (U894), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Neurosciences Intégratives et Cliniques - UFC (EA 481) (NEURO), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS [Bourgogne-Franche-Comté]), Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sciences Cognitives et Sciences Affectives (SCALab) - UMR 9193 (SCALab), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR), Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Université de Lille, CNRS, CHU Lille, Centre hospitalier universitaire de Nantes [CHU Nantes], Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center [CRNL], Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie [CEReSS], Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques [GMFC], Hôpital Lapeyronie [Montpellier] [CHU], Laboratoire de Neurosciences Intégratives et Cliniques - UFC (UR 481) [NEURO], Centre d'Investigation Clinique de Besançon [Inserm CIC 1431], Neuroépidémiologie Tropicale [NET], Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie [ICube], 415060|||Laboratoire Sciences Cognitives et Sciences Affectives - UMR 9193 [SCALab], Imagerie et Stratégies Thérapeutiques des pathologies Cérébrales et Tumorales [ISTCT], Institut de psychiatrie et neurosciences [U894 / UMS 1266], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre d'Investigation Clinique de Besançon (CICB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang Bourgogne Franche-Comté-Université de Franche-Comté (UFC), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Institut des Neurosciences Cliniques de Rennes (INCR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
- Subjects
Gynecology ,03 medical and health sciences ,medicine.medical_specialty ,0302 clinical medicine ,business.industry ,medicine ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,General Medicine ,business ,030217 neurology & neurosurgery ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,030227 psychiatry ,3. Good health - Abstract
La stimulation magnétique transcrânienne répétée (rTMS) est un outil thérapeutique d’utilisation encore récente en psychiatrie. Cet article a pour objectif d’actualiser l’état des connaissances sur la rTMS dans le traitement des troubles de l’humeur. La rTMS possède une efficacité certaine (niveau de preuve de grade 1) dans le traitement initial curatif de la dépression unipolaire à condition d’utiliser des paramètres efficaces, c’est-à-dire, pour les schémas classiques à haute fréquence (5 à 20 Hz) : 20 à 30 séances, plus de 1200 pulses/séance, 5 Hz à 20 Hz, et au moins 110 % du seuil moteur. Les protocoles à 1 Hz sont également efficaces et bien tolérés. La durée de l’efficacité varie avec des taux de rechutes autour de 50 % à 1 an. Un traitement pharmacologique est, en règle, associé. La rTMS se positionne préférentiellement comme un traitement adjuvant aux psychotropes après échec ou efficacité partielle d’un ou deux antidépresseurs (niveau de résistance peu élévée) pour traiter des épisodes non chroniques (< 2 ans), sans critère de gravité (absence de symptômes psychotiques, risque suicidaire faible). En ce qui concerne les états maniaques et les états mixtes, les résultats ont encore un faible niveau de preuve se limitant à une possible réduction des symptômes. Dans le risque suicidaire associé aux troubles de l’humeur, l’intérêt de la rTMS est encore à démontrer, ainsi que dans la catatonie. Repeated transcranial magnetic stimulation (rTMS) is still a recent treatment in psychiatry. This article aims at updating the clinicians’knowledge about rTMS in the treatment of mood disorders (uni and bipolar depressive disorders, manic/mixed states, suicidal risk, catatonia). It is intended for clinicians who are required to indicate and/or use rTMS in their current practice. rTMShas the highest level of evidence for the treatment of unipolar depression, provided that effective parameters are used, that is to say, for classical high frequency protocols: 20 to 30 sessions, 1000 pulses/session, 5 to 20 Hz, and 110 % of the motor threshold. Low frequency protocol are also efficient and well tolerated. The duration of the efficacy varies with relapses rates around 50 % at one year. Pharmacological treatment generally remains associated. With regard to manic states, and mixed states the results are preliminary and limited to a possible reduction in symptoms. In the suicidal risk associated with mood disorders, the interest of rTMS is still to demonstrate, as well as in catatonia. The current place of the rTMS is no longer disputed in the curative treatment of major depressive disorder, preferentially used after one or two lines of antidepressants upstream. Further studies are needed to confirm preliminary positive findings in other aspects of mood disorders. 48;6
- Published
- 2019
17. Quantitative Mri Characterization of Brain Abnormalities in DE NOVO Parkinsonian Patients
- Author
-
Verónica Muñoz Ramírez, Florence Forbes, Julyan Arbel, Alexis Arnaud, Michel Dojat, Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
business.industry ,Brain ,Biomarker ,Disease ,3. Good health ,030218 nuclear medicine & medical imaging ,Biomarker (cell) ,Statistical mixture models ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,[MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST] ,Medicine ,Parkinson ,business ,Neuroscience ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience; Currently there is an important delay between the onset of Parkinson's disease and its diagnosis. The detection of changes in physical properties of brain structures may help to detect the disease earlier. In this work, we propose to take advantage of the informative features provided by quantitative MRI to construct statistical models representing healthy brain tissues. This allows us to detect atypical values for these features in the brain of Parkinsonian patients. We introduce mixture models to capture the non-standard shape of the data multivariate distribution. Promising preliminary results demonstrate the potential of our approach in discriminating patients from controls and revealing the subcortical structures the most impacted by the disease.
- Published
- 2019
18. Anomaly detection in the MRI data of newly diagnosed Parkinsonian patients
- Author
-
Muñoz Ramírez, Verónica, Forbes, Florence, Arnaud, Alexis, Moro, Elena, Dojat, Michel, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
[STAT.AP]Statistics [stat]/Applications [stat.AP] ,[SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience ,[INFO.INFO-TI]Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] ,Parkinson Disease ,Mixture Modeling ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,MRI Imaging - Abstract
National audience
- Published
- 2019
19. Mixture Models for the characterization of brain abnormalities in 'de novo' Parkinsonian patients
- Author
-
Muñoz Ramírez, Verónica, Dojat, Michel, Forbes, Florence, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), and Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
[STAT.AP]Statistics [stat]/Applications [stat.AP] ,[SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience ,[INFO.INFO-TI]Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2019
20. Apprentissage de dictionnaires par régression : application à l’IRM vasculaire
- Author
-
Boux, Fabien, Forbes, Florence, Arbel, Julyan, Barbier, Emmanuel, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
Machine Learning ,Imagerie par Résonance Magnétique ,[STAT.AP]Statistics [stat]/Applications [stat.AP] ,[STAT.ML]Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML] ,[SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,MR Fingerprinting ,Quantitative imaging ,Imagerie quantitative ,Magnetic Resonance Imaging ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,MRI ,IRM - Abstract
International audience
- Published
- 2019
21. Long-term effects of subthalamic stimulation in Obsessive-Compulsive Disorder: Follow-up of a randomized controlled trial
- Author
-
Mallet, Luc, Du Montcel, Sophie Tezenas, Clair, Anne-Hélène, Arbus, Christophe, Bardinet, Eric, Baup, Nicolas, Chabardès, Stephan, Chéreau, Isabelle, Czernecki, Virginie, Fontaine, Denys, Harika-Germaneau, Ghina, Haynes, William Inaki, Houeto, Jean-Luc, Jaafari, Nematollah, Krack, Paul, Millet, Bruno, Navarro, Soledad, Polosan, Mircea, Pelissolo, Antoine, Welter, Marie-Laure, STOC Long-term Study Group, Pôle de Psychiatrie [Hôpital Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital H. Mondor - A. Chenevier, Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Geneva [Switzerland], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Purpan], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Sainte Anne [Paris], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Grenoble, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Clermont-Ferrand, Université Côte d'Azur (UCA), CIC - Poitiers, Université de Poitiers-Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Direction Générale de l'Organisation des Soins (DGOS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de neurologie [Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de Neurochirurgie [Poitiers], CHU Pontchaillou [Rennes], Service de Neurochirurgie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Groupe Henri Mondor-Albert Chenevier, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital H. Mondor - A. Chenevier, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Hôpital Albert Chenevier, Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]
- Subjects
medicine.medical_specialty ,Obsessive-Compulsive Disorder ,Deep brain stimulation ,Efficacy ,Long term follow up ,medicine.medical_treatment ,Biophysics ,Neurosurgery ,Subthalamic nucleus ,lcsh:RC321-571 ,law.invention ,03 medical and health sciences ,ddc:616.89 ,0302 clinical medicine ,Physical medicine and rehabilitation ,Randomized controlled trial ,law ,Obsessive compulsive ,medicine ,030212 general & internal medicine ,lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry ,Long-term follow-up ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,ddc:613 ,[SDV.NEU.PC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Psychology and behavior ,business.industry ,General Neuroscience ,3. Good health ,Term (time) ,Subthalamic stimulation ,[SDV.MHEP.PSM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Psychiatrics and mental health ,Neurology (clinical) ,business ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience
- Published
- 2019
22. Mécanismes physiopathologiques des comportements impulsifs associés à la maladie de Parkinson : approches expérimentales chez le rat
- Author
-
Magnard, Robin, STAR, ABES, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Grenoble Alpes, Sébastien Carnicella, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
Impulsivity ,Maladie de Parkinson ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Parkinson's disease ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Impulse control disorders ,Système dopaminergique nigrostrié ,Impulsivité ,Mtorc1 ,Pramipexole/6-OHDA ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Dopaminergic nigrostriatal pathway ,Trouble du contrôle des impulsions - Abstract
Beyond motor symptoms, Parkinson’s disease (PD) is also characterized by a plethora of neuropsychiatric deficits, ranging from apathy and depression to Impulse control disorders (ICDs). ICDs represent a complex group of behavioral addictions including gambling disorders, hypersexuality and compulsive shopping, displayed by 10 to 14% of PD patients under dopamine replacement therapies, whose quality of life is greatly diminished. Importantly, cognitive impulsivity reflecting in particular, an inability to tolerate delays to reinforcements, appears as a core symptom of ICDs. Indeed, recent evidence suggested that this kind of impulsivity would be exacerbated in PD and under treatment by dopaminergic D2/3 receptor agonists. However, the mechanisms underlying ICDs in PD remain unknown and the respective contribution of dopamine lesion and treatment, combined with factors of vulnerability, remain to be determined. Moreover, waiting impulsivity, another form of behavioral inhibition which may lead to compulsive behaviors, has been poorly investigated in the framework of ICDs.In this thesis project, using a lesional rodent model of non-motor symptoms of PD, we addressed the question of whether denervation of the dopaminergic nigrostriatal system would promote the development of impulsivity when combined with dopamine agonist treatments. Rats were bilaterally injected in the SNc with the neurotoxin 6-OHDA to induce selective and partial denervation of the dorsal striatum. We then treated them with the dopamine D2/3 receptor agonist, pramipexole, a medication known to favor the development of ICDs in PD patients. Two different tasks were used to measure cognitive and motor impulsivity: the delay discounting task (DDT) and the 5-choice serial reaction time task (5-CSRTT) respectively. In the former, rats have to press a lever and choose between a smaller, but immediate reward and a larger, but delayed reward. For the latter, they have to wait for a stimulus light to come on. In the DDT, chronic administration of pramipexole treatment only increased impulsive choices in non-lesioned rats. Indeed, the dopaminergic lesion by itself, or in adjunction with the treatment, did not increase impulsivity. In the 5-CSRTT, pramipexole progressively increased premature responses, reflecting a pro-impulsive effect when the inter-trial interval is constant. However, when the interval was increased, pramipexole reduced the premature responses, exhibiting an anti-impulsive effect. Interestingly, this modulation of motor impulsivity was only observed in rats with a high level of impulsivity, suggesting that an impulsive endophenotype might be an important factor of vulnerability to the iatrogenic effects of pramipexole.The effect of this treatment was then investigated at a cellular level. It promotes overexpression of the dopamine D2 receptor mRNA within the striatum, and seems to alter glutamatergic synaptic connectivity suggested by electron microscopy. Moreover, we showed that the mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) pathway is lastingly over-activated in the nucleus accumbens, as already observed in drug addictions. In an attempt to make a causal link between this pathway and the behavioral changes, we treated rats with pramipexole and rapamycine, a specific inhibitor of this pathway. Surprisingly, this combination accentuated impulsivity even more, whereas rapamycine by itself did not promote impulsivity. This effect may be explained by the complexity of the kinetics of activation and inhibition of mTORC1 pathway.Taken together, these results suggest that impulsivity in PD may be triggered by an iatrogenic effect of the dopaminergic pramipexole treatment through an abnormal activation of the mTORC1 pathway within the nucleus accumbens., Au-delà des symptômes moteurs, la maladie de Parkinson (MP) est également caractérisée par une myriade de symptômes neuropsychiatriques allant de l’apathie et la dépression aux troubles du contrôle des impulsions (TCI). Les TCI représentent un groupe d’addictions comportementales incluant le jeu pathologique, l’hypersexualité et les achats faits de manière compulsive. Observés chez 10 à 14 % des patients parkinsoniens sous traitement dopaminergique, ils affectent fortement leur qualité de vie. L’impulsivité cognitive reflétant notamment l’incapacité à tolérer les délais de renforcements, est au cœur des TCI. En effet, différentes études suggèrent que cette impulsivité serait exacerbée dans la MP et sous traitements dopaminergiques. Cependant, les mécanismes sous-tendant les TCI dans la MP demeurent méconnus, et la contribution respective de la lésion, du traitement dopaminergique, et de certains facteurs de vulnérabilité reste à déterminer. De plus, l’impulsivité d’attente, une autre forme de déficit d’inhibition qui peut conduire au développement de comportements compulsifs, a été peu étudiée dans le cadre des TCI.L’objectif de ce projet de thèse a été d’évaluer l’influence d’une dénervation dopaminergique de la voie nigrostriée, avec ou sans adjonction d’agoniste dopaminergique, sur le développement d’impulsivité. Pour cela, nous avons utilisé un modèle lésionnel des troubles non-moteurs de la MP. Ces rats ont reçu une injection bilatérale de neurotoxine 6-OHDA dans la SNc, afin d’induire une dénervation sélective, bilatérale et partielle du striatum dorsal. Ils ont ensuite été traités avec du pramipexole, un agoniste des récepteurs D2/3, connu pour favoriser le développement de TCI chez les patients parkinsoniens. Les tâches d’intolérance au délai et de réaction en série à 5 choix (5-CSRTT) ont été utilisées pour évaluer respectivement l’impulsivité cognitive et l’impulsivité d’attente. Dans le premier paradigme, les rats doivent appuyer sur un levier pour choisir entre une petite récompense immédiate, ou une plus grosse récompense, avec un un délai. Dans le second paradigme, ils doivent inhiber l’émission d’une réponse motrice jusqu’à l’apparition d’un stimulus lumineux. Le traitement chronique au pramipexole augmente considérablement les choix impulsifs effectués dans la tâche d’intolérance au délai, mais seulement chez les rats non lésés. En effet, la lésion dopaminergique seule ou avec le traitement ne favorise pas les comportements impulsifs. Dans la tâche de 5-CSRTT, le pramipexole semble également promouvoir l’émission de réponses prématurées (effet pro-impulsif), lorsque l’intervalle inter-essais est constant. Cependant, lorsque cet intervalle augmente, le pramipexole provoque à l’inverse une diminution des réponses prématurées (effet anti-impulsif). Cette modulation d’impulsivité étant seulement observée chez les rats hautement impulsifs, ceci suggère qu’un endophénotype impulsif puisse être un facteur de vulnérabilité à l’effet iatrogène du pramipexole.A l’échelle neuronale, ce traitement favorise la surexpression des ARNm codants pour les récepteurs dopaminergiques D2 dans le striatum et y modifie la connectivité glutamatergique telle qu’observée en microscopie électronique. De plus, nous avons observé une suractivation de la voie mTORC1 dans le noyau accumbens, comme déjà constaté dans les processus addictifs. Afin d’apporter un lien causal à cette étude, nous avons bloqué l’activité de la voie mTORC1 par un inhibiteur spécifique, la rapamycine, chez des rats traités au pramipexole. Etonnamment, cette combinaison accentue fortement l’intolérance au délai, alors que la rapamycine seule ne provoque aucun effet notable. Ceci pourrait s’expliquer par une cinétique d’activation et d’inhibition complexe de cette voie. L’ensemble de ces résultats suggère que l’impulsivité observée dans la MP serait causée par une action iatrogène du pramipexole via une activation anormale de la voie mTORC1 dans le noyau accumbens.
- Published
- 2019
23. Reconsideration of the factorial structure of the Barratt Impulsiveness Scale (BIS-11): Assessment of impulsivity in a large population of euthymic bipolar patients
- Author
-
Frank Bellivier, Thierry Bougerol, Bruno Etain, Sébastien Gard, Caroline Dubertret, Marion Leboyer, Christine Passerieux, Valerie Aubin, Raoul Belzeaux, Jean-Pierre Kahn, Philippe Courtet, Emilie Olié, Mircea Polosan, Chantal Henry, Renaud Cohen, Fondation FondaMental [Créteil], Université de Lorraine (UL), Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation (APEMAC), Optimisation thérapeutique en Neuropsychopharmacologie (OPTeN (UMR_S_1144 / U1144)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Princesse Grace [Monaco], Département Universitaire de Psychiatrie - [Hôpital Sainte Marguerite - APHM] (Hôpitaux Sud), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Pôle Psychiatrie et Neurologie [Grenoble], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique (PSNREC), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Psychiatrie et Neurosciences (U894), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier Charles Perrens [Bordeaux], Pôle de Psychiatrie [Hôpital Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital H. Mondor - A. Chenevier, Neuropsychologie Cognitive et Prise en Charge des Troubles de la Communication Schizophreniques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud )-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Hôpital Charles Perrens, CCSD, Accord Elsevier, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université de Lorraine (UL), Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10
- Subjects
Male ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Suicide, Attempted ,0302 clinical medicine ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Reliability (statistics) ,education.field_of_study ,[SHS.STAT]Humanities and Social Sciences/Methods and statistics ,Barratt Impulsiveness Scale 11 ,Psychometric study ,Cognition ,Middle Aged ,16. Peace & justice ,Cyclothymic Disorder ,3. Good health ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Psychiatry and Mental health ,Clinical Psychology ,[SCCO.PSYC]Cognitive science/Psychology ,Female ,medicine.symptom ,Psychology ,[STAT.ME]Statistics [stat]/Methodology [stat.ME] ,Clinical psychology ,Adult ,Predictive validity ,Impulsivity ,Psychometrics ,Scale (ratio) ,Bipolar disorder ,Population ,Suicidal Ideation ,Suicidality ,03 medical and health sciences ,Barratt Impulsiveness Scale ,medicine ,Humans ,education ,Substance misuse ,Psychiatric Status Rating Scales ,[SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience ,Reproducibility of Results ,medicine.disease ,030227 psychiatry ,Disruptive, Impulse Control, and Conduct Disorders ,Impulsive Behavior ,Factor Analysis, Statistical ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience; Background: Impulsivity is commonly assessed using the Barratt Impulsiveness Scale (BIS-11). Some studies challenged the reliability of its three dimensional structure and proposed a bi-dimensional structure. Methods: The psychometric reliability of the BIS-11 scale was studied in a sample of 580 euthymic bipolar patients. An alternative structure of the scale was conceived, using confirmatory factorial analysis (CFA) in the first half (N = 290) and cross-validated in the second half of our sample. Associations between the newly defined shortened scale and predefined clinical variables were computed. Results: The original three dimensional structure did not fit in our sample according to statistical criteria in CFA. A 12 items Impulsivity Scale (IS-12) was designed with strong indices of fitting in the first half of our sample and replicated in the second half of our sample. The IS-12 evidences two dimensions: "behavioral impulsivity" and "cognitive impulsivity". Associations between "behavioral impulsivity" and both presence of past suicide attempts and number of suicide attempts were observed. Substance misuse was strongly associated with both subscores of the new scale. Limitations: The rating of the items assessing the two dimensions of the IS-12 is reversed. The population is restricted to euthymic bipolar patients. Conclusions: The Impulsivity Scale assesses two distinct dimensions named behavioral and cognitive impulsivity. It was reliable and valid in our sample and associated with the existence of suicidal behavior and with substance misuse (alcohol and cannabis). Further studies are needed to demonstrate its predictive validity.
- Published
- 2019
24. Locomotion and eating behavior changes in Yucatan minipigs after unilateral radio-induced ablation of the caudate nucleus
- Author
-
Elisabeth Schültke, Audrey Bouchet, Alexandre Ocadiz, Benjamin Lemasson, Emmanuel L. Barbier, Jayde Livingstone, Loic De Saint Jean, Samy Kefs, Christian Nemoz, Nicolas Coquery, Stefan Bartzsch, Régis Janvier, Raphaël Serduc, David Val-Laillet, Jean-François Adam, Jean A. Laissue, Alain Chauvin, Cécile Guerineau, Elke Bräuer-Krisch, Jacques Balosso, Albert Siegbahn, Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Synchrotron Radiation for Biomedicine Laboratory (STROBE), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Australian Synchrotron [Clayton], BIOEPAR, INRA, Oniris, 44307, Nantes, France, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), University Medical Center Rostock, Department of Medical Physics, Karolinska University Hospital [Stockholm], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Oncology - Pathology - Anatomy, Institute of Pathology-University of Bern, ANR-19-P3IA-0003,MIAI,MIAI @ Grenoble Alpes(2019), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Rayet, Béatrice, and MIAI @ Grenoble Alpes - - MIAI2019 - ANR-19-P3IA-0003 - P3IA - VALID
- Subjects
Male ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,High interest ,Swine ,medicine.medical_treatment ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Caudate nucleus ,lcsh:Medicine ,Early detection ,Brain injuries ,Radiosurgery ,Article ,Stereotactic radiotherapy ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,medicine ,Animals ,lcsh:Science ,Radiation Injuries ,Multidisciplinary ,Behavior, Animal ,business.industry ,lcsh:R ,Brain ,Feeding Behavior ,Ablation ,ddc ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Brain region ,030220 oncology & carcinogenesis ,Eating behavior ,Swine, Miniature ,lcsh:Q ,Caudate Nucleus ,Cranial Irradiation ,business ,030217 neurology & neurosurgery ,Locomotion ,Synchrotrons ,Neuroscience - Abstract
The functional roles of the Caudate nucleus (Cd) are well known. Selective Cd lesions can be found in neurological disorders. However, little is known about the dynamics of the behavioral changes during progressive Cd ablation. Current stereotactic radiosurgery technologies allow the progressive ablation of a brain region with limited adverse effects in surrounding normal tissues. This could be of high interest for the study of the modified behavioral functions in relation with the degree of impairment of the brain structures. Using hypofractionated stereotactic radiotherapy combined with synchrotron microbeam radiation, we investigated, during one year after irradiation, the effects of unilateral radio-ablation of the right Cd on the behavior of Yucatan minipigs. The right Cd was irradiated to a minimal dose of 35.5 Gy delivered in three fractions. MRI-based morphological brain integrity and behavioral functions, i.e. locomotion, motivation/hedonism were assessed. We detected a progressive radio-necrosis leading to a quasi-total ablation one year after irradiation, with an additional alteration of surrounding areas. Transitory changes in the motivation/hedonism were firstly detected, then on locomotion, suggesting the influence of different compensatory mechanisms depending on the functions related to Cd and possibly some surrounding areas. We concluded that early behavioral changes related to eating functions are relevant markers for the early detection of ongoing lesions occurring in Cd-related neurological disorders.
- Published
- 2019
25. AGuIX® from bench to bedside-Transfer of an ultrasmall theranostic gadolinium-based nanoparticle to clinical medicine
- Author
-
Camille Verry, Awatef Allouch, Carolyn J. Anderson, Olivier Tillement, Cyrus Chargari, Nathalie Mignet, Benoit Larrat, Marc Janier, Jacqueline Sidi-Boumedine, Kevin M. Prise, Peter Fries, Bich-Thuy Doan, Erika Porcel, Fabien Rossetti, Jacques Balosso, Marie-Caline Abadjian, Dominique Ardail, Frédéric Boschetti, Yannick Crémillieux, Alexandre Detappe, Claire Rodriguez-Lafrasse, Ross Berbeco, Marie-Thérèse Aloy, Sébastien Mériaux, Vu Long Tran, Emmanuel L. Barbier, Sandrine Lacombe, Sandrine Dufort, Matteo Martini, Andreas Müller, Eric Deutsch, Karl T. Butterworth, Emmanuelle Canet-Soulas, Géraldine Le Duc, Franck Denat, Goran Angelovski, Guillaume Bort, Céline Frochot, Jean-Luc Perfettini, Eloise Thomas, Stéphane Roux, Tristan Doussineau, Muriel Barberi-Heyob, Michael J. Evans, François Lux, Charles Truillet, Stephen J. McMahon, Penelope Bouziotis, Thomas, Noémie, Formation, élaboration de nanomatériaux et cristaux (FENNEC), Institut Lumière Matière [Villeurbanne] (ILM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), NH TherAguix SA [Meylan], Nano-H SAS, Imagerie Moléculaire in Vivo (IMIV - U1023 - ERL9218), Service Hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Moléculaire de l'Université de Bourgogne [Dijon] (ICMUB), Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CheMatech - Macrocycle Design Technologies, Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Max-Planck-Gesellschaft, Dana-Farber Cancer Institute [Boston], Centre de résonance magnétique des systèmes biologiques (CRMSB), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS - UM 4 (UMR 8258 / U1022)), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris sciences et lettres (PSL), Service NEUROSPIN (NEUROSPIN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Univers, Transport, Interfaces, Nanostructures, Atmosphère et environnement, Molécules (UMR 6213) (UTINAM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Clinic for Diagnostic and Interventional Radiology, Saarland University Medical Center, University of Pittsburgh (PITT), Pennsylvania Commonwealth System of Higher Education (PCSHE), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), National Center for Scientific Research 'Demokritos' (NCSR), Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (LRGP), Rayonnement synchrotron et Recherche Médicale, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), University of California [San Francisco] (UC San Francisco), University of California (UC), Université de Lyon, Centre for Cancer Research and Cell Biology, Queen's University [Belfast] (QUB), PRISME (PRISME), Institut de Physique des 2 Infinis de Lyon (IP2I Lyon), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Physique Nucléaire de Lyon (IPNL), Institut des Sciences Moléculaires d'Orsay (ISMO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Radiothérapie moléculaire (UMR 1030), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 - Faculté de médecine (UP11 UFR Médecine), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Curiethérapie, Département de radiothérapie [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut Gustave Roussy (IGR), Institut Gustave Roussy (IGR), Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), French Military Health Service Academy, École du Val de Grâce (EVDG), Service de Santé des Armées-Service de Santé des Armées, Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), University of California [San Francisco] (UCSF), University of California, Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), NH Theraguix, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Service Hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Résonance magnétique des systèmes biologiques (RMSB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Paris Sciences et Lettres (PSL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Equipe 6 : Rayonnement synchrotron et Recherche Médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-[GIN] Grenoble Institut des Neurosciences, Université Paris-Sud 11 - Faculté de médecine (UP11 UFR Médecine), Ecole du Val-de-Grâce, UM Biochimie des Cancers et Biothérapies, CHU Grenoble-Institut de Biologie et Pathologie, Institut Européen des membranes (IEM), Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Galien Paris-Sud (IGPS), Centre de biophysique moléculaire (CBM), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Imagerie et de Spectroscopie (LRMN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Laboratoire de Mécanique et Technologie (LMT), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Computer Science VI, Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP)-Institut National Polytechnique de Lorraine (INPL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Rhône-Alpes Research Program on Hadrontherapy, National French Hadrontherapy Centre - Etoile, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neurorestoration Group, King‘s College London-Wolfson Centre for Age-related Diseases, Ciblage thérapeutique en Oncologie (EA3738), Unité Médicale d'Oncologie Moléculaire et Transfert (UMOMT), Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire des collisions atomiques et moléculaires (LCAM), Service d'oncologie-radiothérapie, Hôpital d'Instruction des Armées du Val de Grâce, Service de Santé des Armées, and European Synchrotron Radiation Facility (ESRF)
- Subjects
Radiation-Sensitizing Agents ,Gadolinium ,medicine.medical_treatment ,02 engineering and technology ,Review Article ,Pharmacology ,Theranostic Nanomedicine ,Mice ,0302 clinical medicine ,Melanoma ,Brain Neoplasms ,General Medicine ,[CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry ,[SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences ,021001 nanoscience & nanotechnology ,3. Good health ,[SDV.SP] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences ,Nuclear Medicine & Medical Imaging ,Radiology Nuclear Medicine and imaging ,Head and Neck Neoplasms ,030220 oncology & carcinogenesis ,Toxicity ,[SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,0210 nano-technology ,Clinical Sciences ,chemistry.chemical_element ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,Enhanced permeability and retention effect ,03 medical and health sciences ,SDG 3 - Good Health and Well-being ,[SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer ,In vivo ,[CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry ,medicine ,Animals ,Humans ,Radiology, Nuclear Medicine and imaging ,[SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,business.industry ,Cancer ,medicine.disease ,Radiation therapy ,Clinical trial ,chemistry ,Nanoparticles ,business ,Forecasting - Abstract
International audience; AGuIX® are sub-5 nm nanoparticles made of a polysiloxane matrix and gadolinium chelates. This nanoparticle has been recently accepted in clinical trials in association with radiotherapy. This review will summarize the principal preclinical results that have led to first in man administration. No evidence of toxicity has been observed during regulatory toxicity tests on two animal species (rodents and monkeys). Biodistributions on different animal models have shown passive uptake in tumours due to enhanced permeability and retention effect combined with renal elimination of the nanoparticles after intravenous administration. High radiosensitizing effect has been observed with different types of irradiations in vitro and in vivo on a large number of cancer types (brain, lung, melanoma, head and neck…). The review concludes with the second generation of AGuIX nanoparticles and the first preliminary results on human.
- Published
- 2019
26. Mapping Chemical Elements and Iron Oxidation States in the Substantia Nigra of 6-Hydroxydopamine Lesioned Rats Using Correlative Immunohistochemistry With Proton and Synchrotron Micro-Analysis
- Author
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Asuncion Carmona, Stéphane Roudeau, Laura Perrin, Carole Carcenac, Delphine Vantelon, Marc Savasta, Richard Ortega, Centre d'Etudes Nucléaires de Bordeaux Gradignan (CENBG), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)
- Subjects
metal ,brain ,Substantia nigra ,01 natural sciences ,lcsh:RC321-571 ,03 medical and health sciences ,iron ,0302 clinical medicine ,synchrotron ,medicine ,PIXE ,Parkinson ,lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry ,Original Research ,[PHYS]Physics [physics] ,Hydroxydopamine ,biology ,Tyrosine hydroxylase ,Chemistry ,Pars compacta ,General Neuroscience ,010401 analytical chemistry ,imaging ,3. Good health ,0104 chemical sciences ,Ventral tegmental area ,Ferritin ,medicine.anatomical_structure ,manganese ,biology.protein ,Biophysics ,Immunohistochemistry ,Pars reticulata ,030217 neurology & neurosurgery ,Neuroscience - Abstract
Brain metal homeostasis is altered in neurodegenerative diseases and the concentration, the localization and/or the chemical speciation of the elements can be modified compared to healthy individuals. These changes are often specific to the brain region affected by the neurodegenerative process. For example, iron concentration is increased in the substantia nigra (SN) of Parkinson’s disease patients and iron redox reactions might be involved in the pathogenesis. The identification of the molecular basis behind metal dyshomeostasis in specific brain regions is the subject of intensive research and chemical element imaging methods are particularly useful to address this issue. Among the imaging modalities available, Synchrotron X-ray fluorescence (SXRF) and particle induced X-ray emission (PIXE) using focused micro-beams can inform about the quantitative distribution of metals in specific brain regions. Micro-X-ray absorption near edge spectroscopy (XANES) can in addition identify the chemical species of the elements, in particular their oxidation state. However, in order to bring accurate information about metal changes in specific brain areas, these chemical imaging methods must be correlated to brain tissue histology. We present a methodology to perform chemical element quantitative mapping and speciation on well-identified brain regions using correlative immunohistochemistry. We applied this methodology to the study of an animal model of Parkinson’s disease, the 6-hydroxydopamine (6-OHDA) lesioned rat. Tyrosine hydroxylase immunohistochemical staining enabled to identify the SN pars compacta (SNpc) and pars reticulata (SNpr) as well as the ventral tegmental area (VTA). Using PIXE we found that iron content was higher respectively in the SNpr > SNpc > VTA, but was not statistically significantly modified by 6-OHDA treatment. In addition, micro-SXRF revealed the higher manganese content in the SNpc compared to the SNpr. Using micro-XANES we identified Fe oxidation states in the SNpr and SNpc showing a spectral similarity comparable to ferritin for all brain regions and exposure conditions. This study illustrates the capability to correlate immunohistochemistry and chemical element imaging at the brain region level and this protocol can now be widely applied to other studies of metal dyshomeostasis in neurology.
- Published
- 2019
27. Dusty core disease (DuCD): expanding morphological spectrum of RYR1 recessive myopathies
- Author
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Guy Brochier, Julien Fauré, Jocelyn Laporte, Clémence Labasse, Isabelle Marty, Jorge A. Bevilacqua, Ana Lia Taratuto, Emmanuelle Lacène, Julie Brocard, Edoardo Malfatti, Maud Beuvin, Giovanni Antonini, John Rendu, Soledad Monges, A. Madelaine, Matteo Garibaldi, Fabiana Lubieniecki, Norma B. Romero, Institut de Myologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unit of Neuromuscular Morphology [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Myologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Myologie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université - Faculté de Médecine (SU FM), Sorbonne Université (SU), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Handicap neuromusculaire : Physiopathologie, Biothérapie et Pharmacologies appliquées (END-ICAP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universidad de Chile = University of Chile [Santiago] (UCHILE), Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia [Buenos Aires] (FLENI), FLENI, Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Sorbonne Université (SU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
- Subjects
0301 basic medicine ,Pathology ,muscle ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,lcsh:RC346-429 ,centronuclear myopathy ,0302 clinical medicine ,cohort studies ,newborn ,congenital myopathy ,middle aged ,genes ,humans ,child ,medicine.diagnostic_test ,adult ,ryanodine receptor calcium release channel ,musculoskeletal system ,skeletal ,muscular diseases ,aged ,female ,entral core disease ,dusty core disease ,ryanodine receptor ,RYR1 recessive ,adolescent ,biopsy ,child, preschool ,genes, recessive ,infant ,infant, newborn ,male ,muscle, skeletal ,young adult ,Child, Preschool ,Immunohistochemistry ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,medicine.symptom ,medicine.medical_specialty ,Genes, Recessive ,Biology ,preschool ,Pathology and Forensic Medicine ,Lesion ,03 medical and health sciences ,Cellular and Molecular Neuroscience ,Central Core Disease ,medicine ,Centronuclear myopathy ,Muscle, Skeletal ,lcsh:Neurology. Diseases of the nervous system ,RYR1 ,Muscle biopsy ,Research ,Infant, Newborn ,recessive ,medicine.disease ,Congenital myopathy ,030104 developmental biology ,Neurology (clinical) ,Myofibril ,030217 neurology & neurosurgery ,Central core disease - Abstract
Several morphological phenotypes have been associated to RYR1-recessive myopathies. We recharacterized the RYR1-recessive morphological spectrum by a large monocentric study performed on 54 muscle biopsies from a large cohort of 48 genetically confirmed patients, using histoenzymology, immunohistochemistry, and ultrastructural studies. We also analysed the level of RyR1 expression in patients’ muscle biopsies. We defined “dusty cores” the irregular areas of myofibrillar disorganisation characterised by a reddish-purple granular material deposition with uneven oxidative stain and devoid of ATPase activity, which represent the characteristic lesion in muscle biopsy in 54% of patients. We named Dusty Core Disease (DuCD) the corresponding entity of congenital myopathy. Dusty cores had peculiar histological and ultrastructural characteristics compared to the other core diseases. DuCD muscle biopsies also showed nuclear centralization and type1 fibre predominance. Dusty cores were not observed in other core myopathies and centronuclear myopathies. The other morphological groups in our cohort of patients were: Central Core (CCD: 21%), Core-Rod (C&R:15%) and Type1 predominance “plus” (T1P+:10%). DuCD group was associated to an earlier disease onset, a more severe clinical phenotype and a lowest level of RyR1 expression in muscle, compared to the other groups. Variants located in the bridge solenoid and the pore domains were more frequent in DuCD patients. In conclusion, DuCD is the most frequent histopathological presentation of RYR1-recessive myopathies. Dusty cores represent the unifying morphological lesion among the DuCD pathology spectrum and are the morphological hallmark for the recessive form of disease. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s40478-018-0655-5) contains supplementary material, which is available to authorized users.
- Published
- 2019
28. Electroporation of mice zygotes with dual guide RNA/Cas9 complexes for simple and efficient cloning-free genome editing
- Author
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Teixeira, Marie, Py, Bénédicte F., Bosc, Christophe, Laubreton, Daphné, Moutin, Marie-Jo, Marvel, Jacqueline, Flamant, Frédéric, Markossian, Suzy, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Moutin, Marie-Jo, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon), and École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
- Subjects
zygote ,électroporation ,génome animal ,[SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics ,lcsh:R ,lcsh:Medicine ,lcsh:Q ,[SDV.GEN.GA] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics ,souris ,ribonucléoprotéine ,lcsh:Science ,Article ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
In this report, we present an improved protocol for CRISPR/Cas9 genome editing in mice. The procedure consists in the electroporation of intact mouse zygotes with ribonucleoprotein complexes prepared in vitro from recombinant Cas9 nuclease and synthetic dual guide RNA. This simple cloning-free method proves to be extremely efficient for the generation of indels and small deletions by non-homologous end joining, and for the generation of specific point mutations by homology-directed repair. The procedure, which avoids DNA construction, in vitro transcription and oocyte microinjection, greatly simplifies genome editing in mice.
- Published
- 2018
29. Region-specific and state-dependent action of striatal GABAergic interneurons
- Author
-
Laurent Venance, Frédéric Saudou, Elodie Fino, Sylvie Perez, Marie Vandecasteele, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Collège de France (CdF (institution))-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dynamics and Pathophysiology of neuronal networks, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole doctorale Cerveau Cognition et Comportement [Paris] (ED 158 - 3C), Sorbonne Université (SU), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), HAL UPMC, Gestionnaire, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
0301 basic medicine ,Dorsomedial striatum ,Science ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,General Physics and Astronomy ,Action Potentials ,Striatum ,General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology ,Basal Ganglia ,Article ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Region specific ,Interneurons ,Animals ,GABAergic Neurons ,lcsh:Science ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Multidisciplinary ,biology ,Chemistry ,musculoskeletal, neural, and ocular physiology ,fungi ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Depolarization ,General Chemistry ,Mice, Inbred C57BL ,Neostriatum ,Substantia Nigra ,030104 developmental biology ,Somatostatin ,Parvalbumins ,nervous system ,State dependent ,Organ Specificity ,biology.protein ,GABAergic ,lcsh:Q ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Neuroscience ,030217 neurology & neurosurgery ,Parvalbumin - Abstract
Striatum processes a wide range of functions including goal-directed behavior and habit formation, respectively encoded by the dorsomedial striatum (DMS) and dorsolateral striatum (DLS). GABAergic feedforward inhibition is known to control the integration of cortical information by striatal projection neurons (SPNs). Here we questioned whether this control is specific between distinct striatal functional territories. Using opto-activation and opto-inhibition of identified GABAergic interneurons, we found that different circuits are engaged in DLS and DMS, both ex vivo and in vivo: while parvalbumin interneurons efficiently control SPNs in DLS, somatostatin interneurons control SPNs in DMS. Moreover, both parvalbumin and somatostatin interneurons use a dual hyperpolarizing/depolarizing effect to control cortical input integration depending on SPN activity state: GABAergic interneurons potently inhibit spiking SPNs while in resting SPNs, they favor cortical activity summation via a depolarizing effect. Our findings establish that striatal GABAergic interneurons exert efficient territory-specific and state-dependent control of SPN activity and functional output., Striatal GABAergic interneurons regulate the influence of cortical inputs on striatal projection neurons through feedforward inhibition. Here, the authors report that this inhibition is mediated mainly by PV interneurons in the dorsolateral striatum and SOM interneurons in the dorsomedial striatum.
- Published
- 2018
30. Loss of the deglutamylase CCP5 perturbs multiple steps of spermatogenesis and leads to male infertility
- Author
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Annie Andrieux, Sophie Leboucher, Ivan Bièche, Tiziana Giordano, Stefan Geimer, Christophe Arnoult, Carsten Janke, Satish Bodakuntla, Sudarshan Gadadhar, Guillaume Martinez, Walid Chemlali, Christophe Bosc, Jonas Straub, Stress génotoxiques et cancer, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Curie [Paris], University of Bayreuth, Centre d'Investigation Clinique - Innovation Technologique - INSERM - CHU de Grenoble (CIC-IT Grenoble (CIT803)), CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Genetique Moleculaire des Cancers d'Origine Epitheliale, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U836, équipe 1, Physiopathologie du cytosquelette, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Organisation Fonctionnelle du Cytosquelette, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR27, AGeing and IMagery (AGIM), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Zellbiologie/Elektronenmikroskopie, Universität Bayreuth, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École pratique des hautes études (EPHE)
- Subjects
Axoneme ,Male ,endocrine system ,Centriole ,Tubulin code ,Tubulin glutamylation ,Glutamic Acid ,Carboxypeptidases ,[SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,Biology ,Microtubules ,[SDV.BDLR.RS]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology/Sexual reproduction ,03 medical and health sciences ,Mice ,0302 clinical medicine ,Cytosol ,Tubulin post-translational modifications ,Microtubule ,Tubulin ,Basal body ,Animals ,Humans ,Spermatogenesis ,Polyglutamylation ,[SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology ,Infertility, Male ,[SDV.BDD.GAM]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Gametogenesis ,030304 developmental biology ,Centrioles ,Cell Nucleus ,Mice, Knockout ,0303 health sciences ,urogenital system ,Cell Biology ,Sperm ,Spermatids ,Cell biology ,Sperm Tail ,Sperm development ,biology.protein ,Protein Processing, Post-Translational ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience; Sperm cells are highly specialized mammalian cells, and their biogenesis requires unique intracellular structures. Perturbation of spermatogenesis often leads to male infertility. Here, we assess the role of a post-translational modification of tubulin, glutamylation, in spermatogenesis. We show that mice lacking the tubulin deglutamylase CCP5 (also known as AGBL5) do not form functional sperm. In these mice, spermatids accumulate polyglutamylated tubulin, accompanied by the occurrence of disorganized microtubule arrays, in particular in the sperm manchette. Spermatids further fail to rearrange their intracellular space and accumulate organelles and cytosol, while nuclei condense normally. Strikingly, spermatids lacking CCP5 show supernumerary centrioles, suggesting that glutamylation could control centriole duplication. We show that most of these observed defects are also present in mice in which CCP5 is deleted only in the male germ line, strongly suggesting that they are germ-cell autonomous. Our findings reveal that polyglutamylation is, beyond its known importance for sperm flagella, an essential regulator of several microtubule-based functions during spermatogenesis. This makes enzymes involved in glutamylation prime candidates for being genes involved in male sterility.
- Published
- 2018
31. Short- and long-term efficacy of electroconvulsive stimulation in animal models of depression: The essential role of neuronal survival
- Author
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Christophe Porcher, Gaëlle Dall’Igna, Anne-Sophie Nguon, Sylvie Gory-Fauré, Eric Denarier, Christophe Heinrich, Nicolas Chauliac, Jean-Christophe Deloulme, Sabine Brugière, Jérôme Holtzmann, Julie Jonckheere, Yohann Couté, Celia Lentini, Jacques Brocard, Marie-Françoise Suaud-Chagny, Albane Pelluet, Annie Andrieux, Institut Neurosciences, Université Grenoble Alpes (UGA), Mécanismes d'expression cellulaire des effecteurs humoraux, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Psymobile, Service Hospitalo-Universitaire du pôle Ouest, Centre Hospitalier Le Vinatier, Bron Cedex, Unité de Catalyse et de Chimie du Solide - UMR 8181 (UCCS), Université d'Artois (UA)-Ecole Centrale de Lille-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Lille (ENSCL)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe Physiopathologie du Cytosquelette (GPC), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Etude de la dynamique des protéomes (EDyP), Laboratoire de Biologie à Grande Échelle (BGE - UMR S1038), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Experimental Epilepsy Group, University of Freiburg [Freiburg], Institut de neurobiologie de la Méditerranée (INMED), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fondation FondaMental [Créteil], Vulnérabilité à la schizophrénie : des bases neurobiologiques à la thérapeutique, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-IFR19-Centre Hospitalier le Vinatier [Bron], [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Transduction du signal : signalisation calcium, phosphorylation et inflammation, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Etude de la dynamique des protéomes (EDyP ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Groupe d'Etude du Stress et des Interactions Neuro-Digestives (GESIND), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Institut Fédératif des Neurosciences de Lyon (IFNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Centre Hospitalier le Vinatier [Bron]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
Male ,0301 basic medicine ,Time Factors ,Cell Survival ,Neurogenesis ,medicine.medical_treatment ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Biophysics ,Synaptogenesis ,Antidepressant ,Adult neurogenesis ,Hippocampus ,MAP6 KO mice ,lcsh:RC321-571 ,Mice ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Electroconvulsive therapy ,Animal models of depression ,[SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] ,Neuroplasticity ,Genetic model ,medicine ,Animals ,Electroconvulsive Therapy ,lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Mice, Knockout ,Neurons ,Depression ,business.industry ,General Neuroscience ,ECS ,ECT ,medicine.disease ,3. Good health ,Disease Models, Animal ,Treatment Outcome ,030104 developmental biology ,Schizophrenia ,Major depressive disorder ,Neurology (clinical) ,business ,Microtubule-Associated Proteins ,Neuroscience ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
Background Severe and medication-resistant psychiatric diseases, such as major depressive disorder, bipolar disorder or schizophrenia, can be effectively and rapidly treated by electroconvulsive therapy (ECT). Despite extensive long-standing clinical use, the neurobiological mechanisms underlying the curative action of ECT remain incompletely understood. Objective Unravel biological basis of electroconvulsive stimulation (ECS) efficacy, the animal equivalent of ECT. Methods Using MAP6 KO mouse, a genetic model that constitutively exhibits features relevant to some aspects of depression; we analyzed the behavioral and biological consequences of ECS treatment alone (10 stimulations over a 2-week period) and associated with a continuation protocol (2 stimulations per week for 5 weeks). Results ECS treatment had a beneficial effect on constitutive behavioral defects. We showed that behavioral improvement is associated with a strong increase in the survival and integration of neurons born before ECS treatment. Retroviral infection revealed the larger number of integrated neurons to exhibit increased dendritic complexity and spine density, as well as remodeled synapses. Furthermore, our results show that ECS triggers a cortical increase in synaptogenesis. A sustained newborn neuron survival rate, induced by ECS treatment, is associated with the behavioral improvement, but relapse occurred 40 days after completing the ECS treatment. However, a 5-week continuation protocol following the initial ECS treatment led to persistent improvement of behavior correlated with sustained rate survival of newborn neurons. Conclusion Altogether, these results reveal that increased synaptic connectivity and extended neuronal survival are key to the short and long-term efficacy of ECS.
- Published
- 2018
32. Specific Targeting of Plant and Apicomplexa Parasite Tubulin through Differential Screening Using In Silico and Assay-Based Approaches
- Author
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Véronique Roussel, Bastien Touquet, Isabelle Tardieux, Emmanuelle Soleilhac, Caroline Barette, Dragos Horvath, Laurence Lafanechère, Eric Maréchal, Loraine Brillet-Guéguen, Renaud Prudent, Sylvaine Roy, Marylin Vantard, Cyrille Y. Botté, Vinod Kasam, Samia Aci-Sèche, Sheena Dass, Vincent Breton, Anne Imberty, Genetics and Chemogenomics (GenChem), Laboratoire de Biologie à Grande Échelle (BGE - UMR S1038), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS), Fédération de recherche de Roscoff (FR2424), Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Physiologie cellulaire et végétale (LPCV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Dynamique cellulaire et membranaire des interactions hôte-parasite (Equipe de recherche), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique de Clermont (LPC), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV ), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Atip-Avenir and Finovi programs (CNRS-INSERM-Finovi Atip-Avenir Apicolipid projects), ANR-05-CIGC-0008,DOCK,Conformation Sampling and Docking on Girds(2005), ANR-12-PDOC-0028,ApicoLipid,ApicoLipid: Etude du rôle de l'apicoplaste dans la synthèse lipidique et la biogénèse des parasites Apicomplexa(2012), ANR-11-LABX-0024,ParaFrap,Alliance française contre les maladies parasitaires(2011), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (FR2424), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS), Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mutations des activités, des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-ENITA Clermont-AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Transduction du signal : signalisation calcium, phosphorylation et inflammation, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de biophysique moléculaire (CBM), Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand (LPC), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille, Institut Cochin (UMR_S567 / UMR 8104), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Grenoble Alpes (UGA)-Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR-11-LABX-0024/11-LABX-0024,ParaFrap,Alliance française contre les maladies parasitaires(2011), Imberty, Anne, Programme de recherche 'Calcul Intensif et Grilles de Calcul' - Conformation Sampling and Docking on Girds - - DOCK2005 - ANR-05-CIGC-0008 - CIGC - VALID, Retour Post-Doctorant - ApicoLipid: Etude du rôle de l'apicoplaste dans la synthèse lipidique et la biogénèse des parasites Apicomplexa - - ApicoLipid2012 - ANR-12-PDOC-0028 - PDOC - VALID, and Laboratoires d'excellence - Alliance française contre les maladies parasitaires - - ParaFrap2011 - ANR-11-LABX-0024 - LABX - VALID
- Subjects
Models, Molecular ,0301 basic medicine ,tubuline ,cell-based assays ,Protein Conformation ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Dinitroaniline ,Microtubules ,lcsh:Chemistry ,chemistry.chemical_compound ,Tubulin ,[CHIM] Chemical Sciences ,Arabidopsis thaliana ,Photosynthesis ,lcsh:QH301-705.5 ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Spectroscopy ,biology ,cellule végétale ,food and beverages ,General Medicine ,Plants ,dinitroanilines ,plant cells ,Toxoplasma gondii ,Plasmodium falciparum ,virtual screening ,small molecules ,3. Good health ,Computer Science Applications ,[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology ,Biochemistry ,In silico ,[SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,Article ,Catalysis ,Inorganic Chemistry ,Apicomplexa ,03 medical and health sciences ,Microtubule ,parasitic diseases ,Animals ,Humans ,[CHIM]Chemical Sciences ,Physical and Theoretical Chemistry ,[SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,[SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology ,Molecular Biology ,Virtual screening ,fungi ,Organic Chemistry ,dinitroaniline ,biology.organism_classification ,030104 developmental biology ,chemistry ,lcsh:Biology (General) ,lcsh:QD1-999 ,biology.protein ,HeLa Cells - Abstract
Dinitroanilines are chemical compounds with high selectivity for plant cell &alpha, tubulin in which they promote microtubule depolymerization. They target &alpha, tubulin regions that have diverged over evolution and show no effect on non-photosynthetic eukaryotes. Hence, they have been used as herbicides over decades. Interestingly, dinitroanilines proved active on microtubules of eukaryotes deriving from photosynthetic ancestors such as Toxoplasma gondii and Plasmodium falciparum, which are responsible for toxoplasmosis and malaria, respectively. By combining differential in silico screening of virtual chemical libraries on Arabidopsis thaliana and mammal tubulin structural models together with cell-based screening of chemical libraries, we have identified dinitroaniline related and non-related compounds. They inhibit plant, but not mammalian tubulin assembly in vitro, and accordingly arrest A. thaliana development. In addition, these compounds exhibit a moderate cytotoxic activity towards T. gondii and P. falciparum. These results highlight the potential of novel herbicidal scaffolds in the design of urgently needed anti-parasitic drugs.
- Published
- 2018
33. Controlled Tau Cleavage in Cells Reveals Abnormal Localizations of Tau Fragments
- Author
-
Fourest-Lieuvin, Anne, Vinit, Angélique, Blot, Béatrice, Perrot, Anthime, Denarier, Eric, Saudou, Frédéric, Arnal, Isabelle, Fourest-Lieuvin, Anne, Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)
- Subjects
Protein cleavage ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,General Neuroscience ,nucleus ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,[SDV.BC.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,TEV protease ,Microtubule ,[SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,Tau ,Actin - Abstract
International audience; In several forms of dementia, such as Alzheimer's disease, the cytoskeleton-associated protein tau undergoes proteolysis, giving rise to fragments that have a toxic impact on neuronal homeostasis. How these fragments interact with cellular structures, in particular with the cytoskeleton, is currently incompletely understood. Here, we developed a method, derived from a Tobacco Etch Virus (TEV) protease system, to induce controlled cleavage of tau at specific sites. Five tau proteins containing specific TEV recognition sites corresponding to pathological proteolytic sites were engineered, and tagged with GFP at one end and mCherry at the other. After a controlled cleavage to produce GFP-N-terminal and C-terminal-mCherry fragments, we followed the fate of tau fragments in cells. Our results showed that whole engineered tau proteins associate with the cytoskeleton similarly to the non-modified tau, whereas tau fragments adopted different localizations with respect to the actin and microtubule cytoskeletons. These distinct localizations were confirmed by expressing each separate fragment in cells. Some cleavages-in particular cleavages at amino-acid positions 124 or 256-displayed a certain level of cellular toxicity, with an unusual relocalization of the N-terminal fragments to the nucleus. Based on the data presented here, inducible cleavage of tau by the TEV protease appears to be a valuable tool to reproduce tau fragmentation in cells and study the resulting consequences on cell physiology.
- Published
- 2023
34. Diurnal symptoms of sleepiness and dysfunction predict future suicidal ideation in a French cohort of outpatients (FACE-DR) with treatment resistant depression: A 1-year prospective study about sleep markers
- Author
-
Maruani, Julia, Molière, Fanny, Godin, Ophelia, Yrondi, Antoine, Bennabi, Djamila, Richieri, Raphaelle, El-Hage, Wissan, Allauze, Etienne, Anguill, Loic, Bouvard, Alexandra, Camus, Vincent, Dorey, Jean-Michel, Etain, Bruno, Fond, Guillaume, Genty, Jean-Baptiste, Haffen, Emmanuel, Holtzmann, Jérôme, Horn, Mathilde, Kazour, François, Nguon, Anne-Sophie, Petrucci, Jean, Rey, Romain, Stephan, Florian, Vaiva, Guillaume, Walter, Michel, Lejoyeux, Michel, Leboyer, Marion, Llorca, Pierre-Michel, Courtet, Philippe, Aouizerate, Bruno, Geoffroy, Pierre, Fondation FondaMental [Créteil], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Neuropsychiatrie : recherche épidémiologique et clinique (PSNREC), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Toulouse Neuro Imaging Center (ToNIC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre d'Investigation Clinique de Besançon (Inserm CIC 1431), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut FRESNEL (FRESNEL), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 1253 IBrain Imagerie & Cerveau Equipe 1 : 'Psychiatrie Neuro-Fonctionnelle' (PNF), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Nutrition et Neurobiologie intégrée (NutriNeuro), Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole nationale supérieure de chimie, biologie et physique-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre hospitalier Charles Perrens [Bordeaux], Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier le Vinatier [Bron], Optimisation thérapeutique en Neuropsychopharmacologie (OPTeN (UMR_S_1144 / U1144)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), CHU Lille, Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hopital de Bohars - CHRU Brest (CHU - BREST ), Soins Primaires, Santé Publique, Registre des cancers de Bretagne Occidentale (EA7479 SPURBO), Université de Brest (UBO)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), GHU Paris Psychiatrie et Neurosciences, Maladies neurodéveloppementales et neurovasculaires (NeuroDiderot (UMR_S_1141 / U1141)), and FondaMental Advanced Centers of Expertise in Resistant Depression (FACE-DR) Collaborators
- Subjects
MESH: Humans ,MESH: Suicidal Ideation ,MESH: Sleepiness ,MESH: Sleep ,Excessive daytime sleepiness ,Circadian ,MESH: Depressive Disorder, Major ,Daytime dysfunction ,MESH: Prospective Studies ,MESH: Outpatients ,MESH: Depressive Disorder, Treatment-Resistant ,Psychiatry and Mental health ,Clinical Psychology ,MESH: Risk Factors ,Suicidal ideation ,[SDV.MHEP.PSM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Psychiatrics and mental health ,Treatment-resistant depression ,Sleep - Abstract
International audience; Background: Patients suffering from treatment-resistant depression (TRD) are at risk of suicide. Sleep and circadian rhythm alterations are widely recognized as core symptoms of major depressive disorder and are associated with suicidal ideation. Thus, sleep and circadian rhythm alterations may be targeted to prevent suicide.Methods: Patients were recruited from a prospective cohort of the French network of TRD expert centers. Mood, sleep and circadian rhythms were assessed at baseline; suicidal risk was assessed both at baseline and during a one-year follow-up with standardized subjective questionnaires.Results: Excessive daytime sleepiness (adjusted odds ratio aOR = 1.7(1-3.3), p = 0.04) and daytime dysfunction (aOR = 1.81(1.16-2.81), p = 0.0085) increased the risk of suicidal thoughts over the one-year follow-up period in patients with TRD after adjustment on age, gender, depression, trauma, anxiety, impulsivity, current daily tobacco smoking and body mass index. Hypnotics intake is associated with a reduced risk of suicidal ideation at one-year follow-up after the same adjustments (OR = 0.73(0.56-0.95), p = 0.019). Other associations between sleep quality or circadian rhythms and suicidal ideations at either baseline or one year did not remain significant in multivariate analyses after the same adjustments.Limitations: Sleep assessments were based on self-reported questionnaires rather than objective measures.Conclusions: Daytime sleepiness and dysfunction are predictors of suicidal ideations, whereas hypnotics intake is associated with a reduced risk of suicidal ideations. Diurnal symptoms of sleep disturbances are therefore red flags to target for preventing suicide in depressed patients, and hypnotics seem efficient in preventing suicide for patients with TRD.
- Published
- 2023
35. Vascular permeability in the RG2 glioma model can be mediated by macropinocytosis and be independent of the opening of the tight junction
- Author
-
Chantal Rémy, Régine Farion, Julie Delaroche, Karin Pernet-Gallay, Anne Bertrand, Emmanuel L. Barbier, Pierre-Henri Jouneau, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie du Cytosquelette, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria de Paris
- Subjects
0301 basic medicine ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,[SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Vascular permeability ,Blood–brain barrier ,Tight Junctions ,Capillary Permeability ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Cell Line, Tumor ,Glioma ,[INFO.INFO-IM]Computer Science [cs]/Medical Imaging ,medicine ,Animals ,Magnetite Nanoparticles ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Tight junction ,Brain Neoplasms ,Chemistry ,Pinocytosis ,[INFO.INFO-CV]Computer Science [cs]/Computer Vision and Pattern Recognition [cs.CV] ,Original Articles ,medicine.disease ,Magnetic Resonance Imaging ,Ferrosoferric Oxide ,Rats, Inbred F344 ,Extravasation ,Amiloride ,030104 developmental biology ,medicine.anatomical_structure ,Neurology ,Blood-Brain Barrier ,[INFO.INFO-TI]Computer Science [cs]/Image Processing [eess.IV] ,Biophysics ,Basal lamina ,Neurology (clinical) ,Cardiology and Cardiovascular Medicine ,[SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing ,Neoplasm Transplantation ,030217 neurology & neurosurgery ,medicine.drug - Abstract
This study evaluates the extravasation pathways of circulating macromolecules in a rat glioma model (RG2) which was observed by both magnetic resonance imaging using ultrasmall superparamagnetic iron oxide and electron microscopy. Although magnetic resonance imaging signal enhancement was observed as soon as 10 min after injection (9.4% 2 h after injection), electron microscopy showed that endothelial cells were still tightly sealed. However, circulating immunoglobulin G and ultrasmall superparamagnetic iron oxide were found in large membrane compartments of endothelial cells, in the basal lamina (7.4 ± 1.2 gold particles/µm2 in the tumor versus 0.38 ± 0.17 in healthy tissue, p = 1.4.10−5) and between tumoral cells. Altogether, this strongly suggests an active transport mediated by macropinocytosis. To challenge this transport mechanism, additional rats were treated with amiloride, an inhibitor of macropinocytosis, leading to a reduction of membrane protrusions (66%) and of macropinosomes. Amiloride however also opened tumoral tight junctions allowing a larger extravasation of ultrasmall superparamagnetic iron oxide (magnetic resonance imaging signal enhancement of 35.7% 2 h after injection). Altogether, these results suggest that ultrasmall superparamagnetic iron oxide and immunoglobulin G in the RG2 glioma model follow an active extravasation pathway mediated by a macropinocytosis process. Amiloride also appears as a potential strategy to facilitate the extravasation of chemotherapeutic drugs in glioma.
- Published
- 2016
36. Microdeletion del(22)(q12.1) excluding theMN1gene in a patient with craniofacial anomalies
- Author
-
Françoise Devillard, Pierre-Simon Jouk, Gaëlle Vieville, Florence Amblard, Fanny Dubois-Teklali, Klaus Dieterich, Sophie Brouillet, Béatrice Morand, Joris Andrieux, Charles Coutton, Véronique Satre, Pierre F. Ray, C Bosson, Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Département de génétique et procréation, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Hôpital Couple-Enfant, AGeing and IMagery (AGIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Paediatric Department, CHU Grenoble, Laboratoire de biochimie et génétique moléculaire, Laboratoire de Génétique Médicale, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Biologie du Cancer et de l'Infection (BCI ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and Dynamiques Cellulaire et Tissulaire - Interdisciplinarité, Modélisation & Microscopie (TIMC-IMAG-DyCTiM2)
- Subjects
Adult ,Male ,0301 basic medicine ,[SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,Craniofacial abnormality ,MESH: Chromosome Deletion ,Chromosomes, Human, Pair 22 ,030105 genetics & heredity ,Biology ,MESH: Phenotype ,Craniofacial Abnormalities ,03 medical and health sciences ,Genetics ,medicine ,MESH: Craniofacial Abnormalities ,Humans ,MESH: Tumor Suppressor Proteins ,Global developmental delay ,MESH: Chromosomes, Human, Pair 22 ,Craniofacial ,Gene ,Genetics (clinical) ,craniofacial anomalies ,Comparative Genomic Hybridization ,MESH: Humans ,MESH: Middle Aged ,MN1 ,deletion 22q12.1 ,Tumor Suppressor Proteins ,MESH: Child, Preschool ,Chromosome ,MESH: Adult ,Middle Aged ,medicine.disease ,Phenotype ,MESH: Male ,MESH: Comparative Genomic Hybridization ,NF2 ,Child, Preschool ,Trans-Activators ,Female ,Chromosome Deletion ,Haploinsufficiency ,MESH: Female ,Comparative genomic hybridization - Abstract
International audience; Several studies have recently reported that 22q12.1 deletions encompassing the MN1 gene are associated with craniofacial anomalies. These observations are consistent with the hypothesis that MN1 haploinsufficiency may be solely responsible for craniofacial anomalies and/or cleft palate. We report here the case of a 4-year-old boy presenting with global developmental delay and craniofacial anomalies including severe maxillary protrusion and retromicrognathia. Array-CGH detected a 2.4 Mb de novo deletion of chromosome 22q12.1 which did not encompass the MN1 gene thought to be the main pathological candidate in 22q12.1 deletions. This observation, combined with data from other patients from the Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans Using Ensemble Resources (DECIPHER), suggests that other gene(s) in the 22q12.1 region are likely involved in craniofacial anomalies and/or may contribute to the phenotypic variability observed in patients with MN1 deletion.
- Published
- 2015
37. Technical Note: Clinical translation of the Rapid‐Steady‐State‐ T 1 MRI method for direct cerebral blood volume quantification
- Author
-
Teodora-Adriana Perles-Barbacaru, Jean-François Le Bas, Sylvie Grand, Hana Lahrech, François Berger, Michel G. Sarraf, Irène Troprès, D. Chechin, Affif Zaccaria, Clinatec - Centre de recherche biomédicale Edmond J.Safra (SCLIN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (CEA-LETI), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), IRMaGe (IRMaGe ), CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Grenoble, and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])
- Subjects
Steady state (electronics) ,[SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging ,Contrast Media ,Blood volume ,Models, Biological ,Sensitivity and Specificity ,Magnetic resonance angiography ,White matter ,Imaging, Three-Dimensional ,Heterocyclic Compounds ,Image Interpretation, Computer-Assisted ,Organometallic Compounds ,medicine ,Humans ,Computer Simulation ,Arterial input function ,First pass ,Brain Diseases ,Blood Volume ,Blood Volume Determination ,medicine.diagnostic_test ,business.industry ,Brain ,Reproducibility of Results ,Magnetic resonance imaging ,General Medicine ,Image Enhancement ,medicine.anatomical_structure ,Blood Volume Fraction ,Cerebrovascular Circulation ,Feasibility Studies ,business ,Nuclear medicine ,Algorithms ,Blood Flow Velocity ,Magnetic Resonance Angiography - Abstract
Purpose: In preclinical studies, the Rapid-Steady-State-T 1 (RSST 1) MRI method has advantages over conventional MRI methods for blood volume fraction (BVf) mapping, since after contrast agent administration, the BVf is directly quantifiable from the signal amplitude corresponding to the vascular equilibrium magnetization. This study focuses on its clinical implementation and feasibility. Methods: Following sequence implementation on clinical Philips Achieva scanners, the RSST 1-method is assessed at 1.5 and 3 T in the follow-up examination of neurooncological patients receiving 0.1–0.2 mmol/kg Gd-DOTA to determine the threshold dose needed for cerebral BVf quantification. Confounding effects on BVf quantification such as transendothelial water exchange, transverse relaxation, and contrast agent extravasation are evaluated. Results: For a dose ≥0.13 mmol/kg at 1.5 T and ≥0.16 mmol/kg at 3 T, the RSST 1-signal time course in macrovessels and brain tissue with Gd-DOTA impermeable vasculature reaches a steady state at maximum amplitude for about 8 s. In macrovessels, a BVf of 100% was obtained validating cerebral microvascular BVf quantification (3.5%–4.5% in gray matter and 1.5%–2.0% in white matter). In tumor tissue, a continuously increasing signal is detected, necessitating signal modeling for tumor BVf calculation. Conclusions: Using approved doses of Gd-DOTA, the steady state RSST 1-signal in brain tissue is reached during the first pass and corresponds to the BVf. The first-pass duration is sufficient to allow accurate BVf quantification. The RSST 1-method is appropriate for serial clinical studies since it allows fast and straightforward BVf quantification without arterial input function determination. This quantitative MRI method is particularly useful to assess the efficacy of antiangiogenic agents.
- Published
- 2015
38. Cluster versus ROI analysis to assess combined antiangiogenic therapy and radiotherapy in the F98 rat-glioma model
- Author
-
Emmanuel L. Barbier, Chantal Rémy, Raphaël Serduc, Nicolas Coquery, Benjamin Lemasson, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Rayonnement Synchrotron et Recherche Medicale (RSRM), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-11-IDEX-0007, Agence Nationale de la Recherche, Comité de la Drôme, Comité de l'Isère, Ligue Contre le Cancer, Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer, Région Rhône-Alpes, Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Nutrition, Métabolismes et Cancer ( NuMeCan ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Rayonnement Synchrotron et Recherche Medicale ( RSRM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -ESRF-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)
- Subjects
Oncology ,Male ,medicine.medical_specialty ,medicine.medical_treatment ,brain ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Angiogenesis Inhibitors ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,computer.software_genre ,030218 nuclear medicine & medical imaging ,unsupervised clustering ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Region of interest ,Voxel ,Glioma ,Internal medicine ,Cell Line, Tumor ,glioma ,medicine ,Effective diffusion coefficient ,Animals ,Cluster Analysis ,Radiology, Nuclear Medicine and imaging ,Spectroscopy ,combined therapies ,[ SDV ] Life Sciences [q-bio] ,business.industry ,Brain Neoplasms ,Sorafenib ,medicine.disease ,Magnetic Resonance Imaging ,Rats, Inbred F344 ,3. Good health ,Radiation therapy ,Disease Models, Animal ,Cerebral blood flow ,Tumor progression ,radiomics ,[SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology ,Molecular Medicine ,business ,computer ,030217 neurology & neurosurgery ,Preclinical imaging ,MRI - Abstract
International audience; For glioblastoma (GBM), current therapeutic approaches focus on the combination of several therapies, each of them individually approved for GBM or other tumor types. Many efforts are made to decipher the best sequence of treatments that would ultimately promote the most efficient tumor response. There is therefore a strong interest in developing new clinical in vivo imaging procedures that can rapidly detect treatment efficacy and allow individual modulation of the treatment. In this preclinical study, we propose to evaluate tumor tissue changes under combined therapies, tumor vascular normalization under antiangiogenic treatment followed by radiotherapy, using a voxel-based clustering approach. This approach was applied to a rat model of glioma (F98). Six MRI parameters were mapped apparent diffusion coefficient, vessel wall permeability, cerebral blood volume fraction, cerebral blood flow, tissue oxygen saturation and vessel size index. We compared the classical region of interest (ROI)-based analysis with a cluster-based analysis. Five clusters, defined by their MRI features, were sufficient to characterize tumor progression and tumor changes during treatments. These results suggest that the cluster-based analysis was as efficient as the ROI-based analysis to assess tumor physiological changes during treatment, but also gave additional information regarding the voxels impacted by treatments and their localization within the tumor. Overall, cluster-based analysis appears to be a powerful tool for subtle monitoring of tumor changes during combined therapies.
- Published
- 2018
39. Objective Evaluation of Multiple Sclerosis Lesion Segmentation using a Data Management and Processing Infrastructure
- Author
-
Franca Wagner, Sorina Camarasu-Pop, Hélène Urien, Isabelle Bloch, Xavier Tomas-Fernandez, Jeremy Beaumont, John Muschelli, Chunliang Wang, Baptiste Laurent, Charles R.G. Guttmann, Tristan Glatard, Michael Kain, Mathieu Simon, Michel Dojat, April Khademi, Martin Styner, Pascal Girard, Thomas Tourdias, Michel M. dos Santos, Wellington Pinheiro dos Santos, Sergi Valverde, Richard McKinley, Abel G. Silva-Filho, Jesse Knight, Eloy Roura, Sandra Vukusic, Francisco Javier Vera-Olmos, François Cotton, Xavier Lladó, Elizabeth M. Sweeney, Senan Doyle, Anne Kerbrat, Olivier Commowick, Mariano Cabezas, Florent Leray, Amirreza Mahbod, Norberto Malpica, Gilles Edan, Roxana Ameli, Christian Barillot, Frederic Cervenansky, Florence Forbes, Simon K. Warfield, Audrey Istace, Jean-Christophe Ferré, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA_D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National des Sciences Appliquées - Rennes ( INSA Rennes ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire ( IMT Atlantique ), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] ( CHLS ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale ( LaTIM ), Université européenne de Bretagne ( UEB ) -Télécom Bretagne-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Mines-Télécom [Paris], Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de neurochirurgie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Service de neurologie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ), Neuroinflammation: imagerie et thérapie de la sclérose en plaques, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Concordia University [Montreal], Pixyl Medical [Grenoble], Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems ( MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Laboratoire Jean Kuntzmann ( LJK ), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 ( UPMF ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ), University of Guelph, Department of Electrical and Computer Engineering [TORONTO] ( ECE ), University of Toronto, Royal Institute of Technology [Stockholm] ( KTH ), University of Bern, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health [Baltimore, MD, USA], Visio per computador I robotica ( VICOROB ), Universitat de Girona ( UdG ), Universidade Federal de Pernambuco [Recife] ( UFPE ), Computational Radiology Laboratory [Boston] ( CRL ), Brigham and Women's Hospital [Boston]-Children's Hospital, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information ( LTCI ), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris]-Université Paris-Saclay, Universidad Rey Juan Carlos [Madrid] ( URJC ), Brigham and Women's Hospital [Boston], Service de Neurologie, CHU Pontchaillou, Rennes, Grenoble Institut des Neurosciences ( GIN ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Computer Science ( North Carolina State University ), North Carolina State University [Raleigh] ( NCSU ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale (LaTIM), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes (UR), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Bordeaux [Bordeaux], Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Ryerson University [Toronto], Royal Institute of Technology [Stockholm] (KTH ), Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health [Baltimore], Johns Hopkins University (JHU), Research institute of Computer Vision and Robotics [Girona] (VICOROB), Universitat de Girona (UdG), Universidade Federal de Pernambuco [Recife] (UFPE), Computational Radiology Laboratory [Boston] (CRL), Brigham and Women's Hospital [Boston]-Boston Children's Hospital, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad Rey Juan Carlos [Madrid] (URJC), Service de Neurologie [Lyon], CHU Lyon, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), University of North Carolina [Chapel Hill] (UNC), University of North Carolina System (UNC), This work was partly funded by France Life Imaging (grant ANR-11-INBS-0006 from the French 'Investissements d’Avenir' program) for funding and sponsoring the challenge. This work has also been partly supported by a grant (OFSEP) provided by the French State and handled by the 'Agence nationale de la recherche', within the framework of the 'Investissements d’Avenir' program, under the reference ANR-10-COHO-002. We also thank the French national cohort OFSEP (a French 'Investissements d’Avenir' program), and particularly the imaging group inside this cohort consortium for their constant support, fruitful discussions on the challenge and providing the MR images., ANR-11-INBS-0006,FLI,France Life Imaging(2011), ANR-10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-Télécom Bretagne-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK), Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Pierre Mendès France - Grenoble 2 (UPMF)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG), Boston Children's Hospital-Brigham and Women's Hospital [Boston], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-11-INBS-0006/11-INBS-0006,FLI,France In vivo Imaging(2011), ANR-10-COHO-002-01/10-COHO-0002,OFSEP,Observatoire Français de la Sclérose en Plaques(2010), Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Images et Modèles, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Informatique et développements, Department of Electrical and Computer Engineering [University of Toronto] (ECE), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service de Neurologie [CHU Rennes], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Computer Science (North Carolina State University), North Carolina State University [Raleigh] (NC State), University of North Carolina System (UNC)-University of North Carolina System (UNC), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Edan, Gilles, Infrastructures - France Life Imaging - - FLI2011 - ANR-11-INBS-0006 - INBS - VALID, Cohortes - Observatoire Français de la Sclérose en Plaques - - OFSEP2010 - ANR-10-COHO-0002 - COHO - VALID, and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
Male ,Computer science ,Data management ,MESH: Parenchymal Tissue ,lcsh:Medicine ,Esclerosi múltiple ,computer.software_genre ,030218 nuclear medicine & medical imaging ,MESH: Magnetic Resonance Imaging ,Machine Learning ,0302 clinical medicine ,open science ,Image Processing, Computer-Assisted ,Segmentation ,[ SDV.IB ] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,Image processing -- Digital techniques ,lcsh:Science ,610 Medicine & health ,Multiple sclerosis lesion ,image segmentation ,MESH: Machine Learning ,Magnetic Resonance Imaging ,MESH: Image Processing, Computer-Assisted ,Random forest ,performance evaluation ,MESH: Neural Networks, Computer ,[SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering ,Female ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Objective evaluation ,Algorithms ,MESH: Algorithms ,Machine learning ,Article ,Multiple sclerosis ,03 medical and health sciences ,Imatges -- Processament -- Tècniques digitals ,distributed computing ,Image Interpretation, Computer-Assisted ,Humans ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Parenchymal Tissue ,Retrospective Studies ,MESH: Humans ,business.industry ,Deep learning ,Imatge -- Segmentació ,lcsh:R ,MESH: Retrospective Studies ,MESH: Multiple Sclerosis ,MESH: Male ,Imaging segmentation ,computing infrastructure ,[ SDV.NEU ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,lcsh:Q ,Neural Networks, Computer ,Artificial intelligence ,business ,computer ,MESH: Female ,MESH: Image Interpretation, Computer-Assisted ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
We present a study of multiple sclerosis segmentation algorithms conducted at the international MICCAI 2016 challenge. This challenge was operated using a new open-science computing infrastructure. This allowed for the automatic and independent evaluation of a large range of algorithms in a fair and completely automatic manner. This computing infrastructure was used to evaluate thirteen methods of MS lesions segmentation, exploring a broad range of state-of-theart algorithms, against a high-quality database of 53 MS cases coming from four centers following a common definition of the acquisition protocol. Each case was annotated manually by an unprecedented number of seven different experts. Results of the challenge highlighted that automatic algorithms, including the recent machine learning methods (random forests, deep learning, …), are still trailing human expertise on both detection and delineation criteria. In addition, we demonstrate that computing a statistically robust consensus of the algorithms performs closer to human expertise on one score (segmentation) although still trailing on detection scores This work was partly funded by France Life Imaging (grant ANR-11-INBS-0006 from the French “Investissements d’Avenir” program) for funding and sponsoring the challenge. This work has also been partly supported by a grant (OFSEP) provided by the French State and handled by the “Agence nationale de la recherche”, within the framework of the “Investissements d’Avenir” program, under the reference ANR-10-COHO-002. We also thank the French national cohort OFSEP (a French “Investissements d’Avenir” program), and particularly the imaging group inside this cohort consortium for their constant support, fruitful discussions on the challenge and providing the MR images
- Published
- 2018
40. Excessive tubulin polyglutamylation causes neurodegeneration and perturbs neuronal transport
- Author
-
Jakub Žiak, Satish Bodakuntla, André Calas, Sabrina Lacomme, Carsten Janke, Sophie Leboucher, Christophe Bosc, Maria M. Magiera, Matthias Kneussel, Patricia Marques Sousa, Marc Landry, Torben J. Hausrat, Martin Balastik, Annie Andrieux, Institut Curie [Paris], Stress génotoxiques et cancer, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Czech Academy of Sciences [Prague] (CAS), Pôle Microscopie Electronique, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université de Bordeaux (UB), Universitaetsklinikum Hamburg-Eppendorf = University Medical Center Hamburg-Eppendorf [Hamburg] (UKE), INSERM U836, équipe 1, Physiopathologie du cytosquelette, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe Physiopathologie du Cytosquelette (GPC), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Physiopathologie des Reseaux Neuronaux Medullaires, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UA 339 Laboratoire de Physiologie des Interactions Cellulaires, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and ANR-17-CE13-0021,TUBTUNE,Le ' code tubuline ' : un mécanisme qui adapte les fonctions des microtubules à la demande(2017)
- Subjects
0301 basic medicine ,Polarity & Cytoskeleton ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Biological Transport, Active ,Nerve Tissue Proteins ,Degeneration (medical) ,[SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,[SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology ,tubulin polyglutamylation ,03 medical and health sciences ,Mice ,Purkinje Cells ,Downregulation and upregulation ,Microtubule ,Tubulin ,medicine ,Animals ,Proteolysis & Proteomics ,[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology ,Peptide Synthases ,[SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM] ,Molecular Biology ,Polyglutamylation ,Neuronal transport ,Mice, Knockout ,General Immunology and Microbiology ,biology ,General Neuroscience ,Neurodegeneration ,tubulin posttranslational modifications Subject Categories Cell Adhesion ,neurodegeneration ,Neurodegenerative Diseases ,Articles ,medicine.disease ,Cell biology ,030104 developmental biology ,tubulin code ,biology.protein ,Axoplasmic transport ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,axonal transport ,Peptides ,Protein Processing, Post-Translational ,Post-translational Modifications ,Neuroscience - Abstract
International audience; Posttranslational modifications of tubulin are emerging regulators of microtubule functions. We have shown earlier that upregulated polyglutamylation is linked to rapid degeneration of Purkinje cells in mice with a mutation in the deglutamylating enzyme CCP1. How polyglutamylation leads to degeneration, whether it affects multiple neuron types, or which physiological processes it regulates in healthy neurons has remained unknown. Here, we demonstrate that excessive polyglutamylation induces neurodegeneration in a cell-autonomous manner and can occur in many parts of the central nervous system. Degeneration of selected neurons in CCP1-deficient mice can be fully rescued by simultaneous knockout of the counteracting polyglutamylase TTLL1. Excessive polyglutamylation reduces the efficiency of neuronal transport in cultured hippocampal neurons, suggesting that impaired cargo transport plays an important role in the observed degenerative phenotypes. We thus establish polyglutamylation as a cell-autonomous mechanism for neurodegen-eration that might be therapeutically accessible through manipulation of the enzymes that control this posttranslational modification.
- Published
- 2018
41. Dictionary-Free MR Fingerprinting Parameter Estimation Via Inverse Regression
- Author
-
Boux, Fabien, Forbes, Florence, Arbel, Julyan, Barbier, Emmanuel, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
[MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST] ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] - Abstract
International audience; MR Fingerprint requires an exhaustive search in a dictionary, which even for moderately sized problems, becomes costly and possibly intractable. In this work, we propose an alternative approach: instead of an exhaustive search for every signal, we use the dictionary to learn the functional relationship between signals and parameters. This allows the direct estimation of parameters without the need of searching through the dictionary. The comparison between a standard grid search and the proposed approach suggest that MR Fingerprinting could benefit from a regression approach to limit dictionary size and fasten computation time.
- Published
- 2018
42. The striatal kinase DCLK3 produces neuroprotection against mutant huntingtin
- Author
-
Galvan, Laurie, Francelle, Laetitia, Gaillard, Marie-Claude, De Longprez, Lucie, Carrillo-de Sauvage, Maria-Angeles, Liot, Géraldine, Cambon, Karine, Stimmer, Lev, Luccantoni, Sophie, Flament, Julien, Valette, Julien, De Chaldée, Michel, Auregan, Gwenaëlle, Guillermier, Martine, Joséphine, Charlène, Petit, Fanny, Jan, Caroline, Jarrige, Margot, Dufour, Noëlle, Bonvento, Gilles, Humbert, Sandrine, Saudou, Frédéric, Hantraye, Philippe, Mérienne, Karine, Bemelmans, Alexis-Pierre, Perrier, Anselme, Déglon, Nicole, Brouillet, Emmanuel, Service MIRCEN (MIRCEN), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 (LMN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'Imagerie BioMédicale (I2BM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Biocortech, Service de Biologie Intégrative et Génétique Moléculaire (SBIGeM), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des cellules souches pour le traitement et l'étude des maladies monogéniques (I-STEM), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), inconnu, Inconnu, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de neurosciences cognitives et adaptatives (LNCA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Ophtalmique Jules-Gonin [Lausanne], Université de Lausanne (UNIL)-Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), Fondation FondaMental [Créteil], Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Généthon-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Régulations cellulaires et oncogenèse (RCO), Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Généthon, ANR-11-INBS-0011,NeurATRIS,Infrastructure de Recherche Translationnelle pour les Biothérapies en Neurosciences(2011), European Project: 222925,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,NEUGENE(2008), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Service MIRCEN (MIRCEN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), cambon, karine, Infrastructures - Infrastructure de Recherche Translationnelle pour les Biothérapies en Neurosciences - - NeurATRIS2011 - ANR-11-INBS-0011 - INBS - VALID, and Advanced gene therapy tools for treatment of CNS-specific disorders - NEUGENE - - EC:FP7:HEALTH2008-10-01 - 2012-03-31 - 222925 - VALID
- Subjects
Male ,congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities ,Animals ,Cells, Cultured ,Corpus Striatum/enzymology ,Disease Models, Animal ,Down-Regulation/genetics ,Electron Transport Complex IV/metabolism ,Hand Strength/physiology ,Huntingtin Protein/genetics ,Huntington Disease/genetics ,Huntington Disease/therapy ,Macaca fascicularis ,Mice ,Mice, Inbred C57BL ,Mice, Transgenic ,Motor Activity ,Mutation/genetics ,Neurons/metabolism ,Phosphopyruvate Hydratase/metabolism ,Protein-Serine-Threonine Kinases/genetics ,Protein-Serine-Threonine Kinases/metabolism ,RNA, Small Interfering/genetics ,RNA, Small Interfering/metabolism ,Trans-Activators/genetics ,Trans-Activators/metabolism ,Transcription Factors/genetics ,Transcription Factors/metabolism ,Huntington ,kinase ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Down-Regulation ,neurons ,Protein Serine-Threonine Kinases ,Electron Transport Complex IV ,Doublecortin-Like Kinases ,mental disorders ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,RNA, Small Interfering ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Huntingtin Protein ,Hand Strength ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Original Articles ,Corpus Striatum ,Editor's Choice ,Huntington Disease ,nervous system ,Phosphopyruvate Hydratase ,Mutation ,Trans-Activators ,chromatin ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,transcription ,Transcription Factors - Abstract
Expression of the neuronal kinase DCLK3 is reduced in Huntington’s disease. Galvan et al. report that DCLK3 silencing in the mouse striatum exacerbates the toxicity of mutant huntingtin, whereas DCLK3 overexpression is neuroprotective, and show that DCLK3 regulates the expression of many genes involved in transcription regulation and chromatin remodelling., The neurobiological functions of a number of kinases expressed in the brain are unknown. Here, we report new findings on DCLK3 (doublecortin like kinase 3), which is preferentially expressed in neurons in the striatum and dentate gyrus. Its function has never been investigated. DCLK3 expression is markedly reduced in Huntington’s disease. Recent data obtained in studies related to cancer suggest DCLK3 could have an anti-apoptotic effect. Thus, we hypothesized that early loss of DCLK3 in Huntington’s disease may render striatal neurons more susceptible to mutant huntingtin (mHtt). We discovered that DCLK3 silencing in the striatum of mice exacerbated the toxicity of an N-terminal fragment of mHtt. Conversely, overexpression of DCLK3 reduced neurodegeneration produced by mHtt. DCLK3 also produced beneficial effects on motor symptoms in a knock-in mouse model of Huntington’s disease. Using different mutants of DCLK3, we found that the kinase activity of the protein plays a key role in neuroprotection. To investigate the potential mechanisms underlying DCLK3 effects, we studied the transcriptional changes produced by the kinase domain in human striatal neurons in culture. Results show that DCLK3 regulates in a kinase-dependent manner the expression of many genes involved in transcription regulation and nucleosome/chromatin remodelling. Consistent with this, histological evaluation showed DCLK3 is present in the nucleus of striatal neurons and, protein-protein interaction experiments suggested that the kinase domain interacts with zinc finger proteins, including the transcriptional activator adaptor TADA3, a core component of the Spt-ada-Gcn5 acetyltransferase (SAGA) complex which links histone acetylation to the transcription machinery. Our novel findings suggest that the presence of DCLK3 in striatal neurons may play a key role in transcription regulation and chromatin remodelling in these brain cells, and show that reduced expression of the kinase in Huntington’s disease could render the striatum highly vulnerable to neurodegeneration.
- Published
- 2018
43. Management of severe traumatic brain injury (first 24 hours)
- Author
-
Jean-François Payen, Romain Carrillon, Gilles Orliaguet, Pierre-Etienne Leblanc, François Proust, Sébastien Mirek, Frédéric Dailler, Nicolas Bruder, Hervé Quintard, Gérard Audibert, Lamine Abdennour, Etienne Javouhey, François Cotton, L. Velly, Karim Tazarourte, Philippe Meyer, Vincent Cottenceau, Thomas Geeraerts, Bernard Vigué, Thomas Lieutaud, Nicolas Engrand, Catherine Ract, Gilles Francony, Claire Dahyot-Fizelier, Carole Ichai, Sonia Courtil-Teyssedre, Laurent Gergelé, Mohamed Srairi, Jean-Stéphane David, Dominique Fletcher, Pierre Bouzat, Karim Asehnoune, Toulouse Neuro Imaging Center (ToNIC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service d'anesthésie et de réanimation [Hôpital de la Timone - APHM], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut de Neurosciences de la Timone (INT), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Anesthésie réanimation [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service d'anesthésie et réanimation chirurgicale [Nantes], Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique (DCAC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Réanimation Médicale [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Pellegrin, RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de réanimation pédiatrique, Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d'Anesthésie Réanimation Chirurgicale [Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Pharmacologie des anti-infectieux (PHAR), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'anesthésie-réanimation [Centre Hospitalier Lyon Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Pôle anesthésie-réanimation (Grenoble), CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Service d'Anesthésie et de Soins Intensifs [Bicêtre], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Translational and Integrative Group in Epilepsy Research (TIGER), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Groupe Hospitalier Est-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Groupe Hospitalier Est, Unité Mixte de Recherche Epidémiologique et de Surveillance Transport Travail Environnement (UMRESTTE UMR T9405), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR), Service d'Anesthésie Réanimation [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Evaluation thérapeutique et pharmacologie périnatale et pédiatrique (EA_7323), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service d'anesthésie - réanimation chirurgicale [CHU de Dijon], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Clinique de réanimation médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Velly, Lionel, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), TIGER, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
- Subjects
Adult ,Emergency Medical Services ,medicine.medical_specialty ,Critical Care ,Traumatic brain injury ,Sedation ,Psychological intervention ,MEDLINE ,Guidelines as Topic ,Critical Care and Intensive Care Medicine ,Neurosurgical Procedures ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Brain Injuries, Traumatic ,medicine ,Emergency medical services ,Humans ,[SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Cerebral perfusion pressure ,Child ,Modalities ,[SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology ,business.industry ,030208 emergency & critical care medicine ,General Medicine ,Guideline ,medicine.disease ,3. Good health ,Anesthesiology and Pain Medicine ,Emergency medicine ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,France ,medicine.symptom ,business ,030217 neurology & neurosurgery ,[SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology - Abstract
International audience; The latest French Guidelines for the management in the first 24 hours of patients with severe traumatic brain injury (TBI) were published in 1998. Due to recent changes (intracerebral monitoring, cerebral perfusion pressure management, treatment of raised intracranial pressure), an update was required. Our objective has been to specify the significant developments since 1998. These guidelines were conducted by a group of experts for the French Society of Anesthesia and Intensive Care Medicine (Société francaise d’anesthésie et de réanimation [SFAR]) in partnership with the Association de neuro-anesthésie-réanimation de langue française (ANARLF), The French Society of Emergency Medicine (Société française de médecine d'urgence (SFMU), the Société française de neurochirurgie (SFN), the Groupe francophone de réanimation et d’urgences pédiatriques (GFRUP) and the Association des anesthésistes-réanimateurs pédiatriques d’expression française (ADARPEF). The method used to elaborate these guidelines was the Grade® method. After two Delphi rounds, 32 recommendations were formally developed by the experts focusing on the evaluation the initial severity of traumatic brain injury, the modalities of prehospital management, imaging strategies, indications for neurosurgical interventions, sedation and analgesia, indications and modalities of cerebral monitoring, medical management of raised intracranial pressure, management of multiple trauma with severe traumatic brain injury, detection and prevention of post-traumatic epilepsia, biological homeostasis (osmolarity, glycaemia, adrenal axis) and paediatric specificities.
- Published
- 2018
44. The link between structural connectivity and neurocognition illustrated by focal epilepsy
- Author
-
Marcela Perrone-Bertolotti, Elise Roger, Anne-Sophie Job, Laurent Petit, Philippe Kahane, Lorella Minotti, Monica Baciu, Laboratoire de Psychologie et NeuroCognition (LPNC ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Grenoble Alpes - UFR Médecine (UGA UFRM), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de physiopathologie de l'épilepsie (LNPEE), CHU Grenoble, and Hal, GIN
- Subjects
cognition ,focal epilepsy ,050105 experimental psychology ,White matter ,03 medical and health sciences ,Epilepsy ,[SCCO]Cognitive science ,0302 clinical medicine ,Neuroplasticity ,medicine ,Humans ,0501 psychology and cognitive sciences ,Neuronal Plasticity ,hodology ,[SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience ,05 social sciences ,Perspective (graphical) ,[SCCO.NEUR] Cognitive science/Neuroscience ,Healthy subjects ,Brain ,Cognition ,General Medicine ,[SCCO] Cognitive science ,medicine.disease ,medicine.anatomical_structure ,Neurology ,connectivity ,plasticity ,Curative surgery ,Epilepsies, Partial ,Neurology (clinical) ,Nerve Net ,Psychology ,Neurocognitive ,white matter ,030217 neurology & neurosurgery ,Cognitive psychology - Abstract
International audience; – Increasing attention is being paid to the assessment of white matter properties and its structural connectivity, both in healthy subjects and patients with cerebral lesions. Within this framework, new neurocogni-tive models based on hodological properties have been developed under a connectomic perspective in order to explain substrates and cognitive mechanisms related to cerebral functions such as language and memory. With regards to focal and drug-resistant epilepsy conceived as a network disorder , new insights in terms of structural connectivity have led to significant advances in epilepsy research, concerning fundamental research (neu-rocognitive mechanisms of plasticity) and clinical application (optimization of decision making for curative surgery). We believe that such findings in the literature, focused on the role of white matter in cerebral functioning in relation to neurocognition, may be helpful for both researchers and clinicians working in the field of epilepsy. Structural connectivity and neurocognition: general information Structural connectivity refers to the study of the anatomical features of brain networks in terms of subcorti-cal white matter (WM) that underlies interconnections between different cortical regions. Within the current context of growing interest with a connectomic perspective, many MRI methods and parameters are now available to assess WM anatomical properties including architecture, spatial trajectory, density or integrity (Sporns, 2013). These structural properties, investigated in relation to cognitive functions and behavioral performance, allows the development of more
- Published
- 2018
45. Recommendations for the use of electroencephalography and evoked potentials in comatose patients
- Author
-
Aileen McGonigal, Julie Zyss, Benjamin Rohaut, Jean-Pascal Lefaucheur, Philippe Merle, Laurent Vercueil, Jean-Michel Guerit, Arnaud Delval, Louise Tyvaert, Cécile Sabourdy, Sébastien Boulogne, Eric Azabou, Véronique Mutschler, Nathalie André-Obadia, Agnès Trébuchon, Martine Gavaret, Lionel Naccache, Service de neurologie fonctionnelle et d'épileptologie [Hôpital Pierre Wertheimer-HCL], Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Neurosciences des Systèmes (INS), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de physiologie et d'explorations fonctionnelles [CHU Raymond-Poincaré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Centre Hospitalier Interrégional Edith Cavell (CHIREC), CHU Amiens-Picardie, Service de Neurologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hopital Civil, Neuroimagerie cognitive (LCogn), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de neurologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Epilepsies, Lesions Cerebrales et Systemes Neuraux de la Cognition, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Troubles cognitifs vasculaires et dégénératifs, Université de Lille, Sciences et Technologies, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
medicine.medical_specialty ,Mismatch negativity ,Electroencephalography ,law.invention ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,law ,Physiology (medical) ,Visual evoked potentials ,medicine ,Disorder of consciousness ,Humans ,In patient ,Intensive care unit ,Coma ,Intensive care medicine ,Coma prognosis ,Evoked Potentials ,Somatosensory evoked potentials ,Persistent vegetative state ,Brainstem auditory evoked potentials ,medicine.diagnostic_test ,business.industry ,Brain ,030208 emergency & critical care medicine ,General Medicine ,Neurophysiology ,medicine.disease ,Cardiac arrest ,Brain Waves ,3. Good health ,Neurology ,Somatosensory evoked potential ,Event-related evoked potentials ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Neurology (clinical) ,medicine.symptom ,business ,Middle latency auditory evoked potentials ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
International audience; Predicting the outcome of a comatose or poorly responsive patient is a major issue for intensive care unit teams, in order to give the most accurate information to the family and to choose the best therapeutic option. However, determining the level of cortical activity in patients with disorders of consciousness is a real challenge. Reliable criteria are required to help clinicians in the decision-making process, especially in the acute phase of coma. In this paper, we propose recommendations for recording and interpreting electroencephalography and evoked potentials in comatose patients based on the literature and the clinical experience of a group of neurophysiologists trained in the management of comatose patients. We propose methodological guidelines and discuss prognostic value of each test as well as the limitations concerning recording and interpretation. Recommendations for the strategy and timing of neurophysiological assessments are also proposed according to various clinical situations.
- Published
- 2018
46. Author Correction: Electroporation of mice zygotes with dual guide RNA/Cas9 complexes for simple and efficient cloning-free genome editing
- Author
-
Marie-Jo Moutin, Jacqueline Marvel, Bénédicte F. Py, Marie Teixeira, Christophe Bosc, Daphné Laubreton, Suzy Markossian, Frédéric Flamant, SFR Biosciences, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Inflammasome NLRP3 – NLRP3 Inflammasome, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Immunité et lymphocytes cytotoxiques – Immunity and cytotoxic lymphocytes, Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL)
- Subjects
0301 basic medicine ,Male ,DNA End-Joining Repair ,Genotyping Techniques ,Zygote ,Mutation, Missense ,lcsh:Medicine ,Computational biology ,Biology ,Computer Science::Digital Libraries ,03 medical and health sciences ,Mice ,Genome editing ,INDEL Mutation ,Endopeptidases ,Animals ,Guide RNA ,lcsh:Science ,Author Correction ,Cloning ,Gene Editing ,Multidisciplinary ,Deubiquitinating Enzymes ,Cas9 ,Electroporation ,lcsh:R ,[SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology ,Mice, Inbred C57BL ,030104 developmental biology ,Genetic Loci ,[SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology ,ComputingMethodologies_DOCUMENTANDTEXTPROCESSING ,[SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology ,lcsh:Q ,Female ,CRISPR-Cas Systems ,RNA, Guide, Kinetoplastida - Abstract
In this report, we present an improved protocol for CRISPR/Cas9 genome editing in mice. The procedure consists in the electroporation of intact mouse zygotes with ribonucleoprotein complexes prepared in vitro from recombinant Cas9 nuclease and synthetic dual guide RNA. This simple cloning-free method proves to be extremely efficient for the generation of indels and small deletions by non-homologous end joining, and for the generation of specific point mutations by homology-directed repair. The procedure, which avoids DNA construction, in vitro transcription and oocyte microinjection, greatly simplifies genome editing in mice.
- Published
- 2018
47. Controlled education of patients after stroke (ceops)-nurse-led multimodal and long-term interventional program involving a patient's caregiver to optimize secondary prevention of stroke: study protocol for a randomized controlled trial
- Author
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Mendyk, Anne-Marie, Duhamel, Alain, Bejot, Yannick, Leys, Didier, Derex, Laurent, Dereeper, Olivier, Detante, Olivier, Garcia, Pierre-Yves, Godefroy, Olivier, Montoro, Francisco Macian, Neau, Jean-Philippe, Richard, Sébastien, Rosolacci, Thierry, Sibon, Igor, Sablot, Denis, Timsit, Serge, Zuber, Mathieu, Cordonnier, Charlotte, Bordet, Régis, Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 (TCDV), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Compiègne-Noyon (CHCN), Centre Hospitalier Compiègne-Noyon, CHU Amiens-Picardie, Service de Neurologie [CHU Limoges], CHU Limoges, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Bordeaux (UB), Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 (TCDV), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559 (LNFP), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Université de Lille, LillOA, CHU Lille, CNRS, Inserm, Université de Lille, METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694, Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U1171, Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 [TCDV], Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 [METRICS], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand [CHU Dijon], Université Claude Bernard Lyon 1 [UCBL], Grenoble Institut des Neurosciences [GIN], Centre Hospitalier Compiègne-Noyon [CHCN], Centre hospitalier universitaire de Poitiers [CHU Poitiers], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy [CHRU Nancy], Université de Bordeaux [UB], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest [CHRU Brest], and Université Paris Descartes - Paris 5 [UPD5]
- Subjects
Neurologic Examination ,Patient Care Team ,Time Factors ,Nurse ,Secondary prevention ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,Stroke Rehabilitation ,Recovery of Function ,Combined Modality Therapy ,Nurse's Role ,Multimodal intervention ,Family caregiver ,Stroke ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,Study Protocol ,Disability Evaluation ,Leadership ,Treatment Outcome ,Caregivers ,Patient Education as Topic ,Humans ,France ,Randomized Controlled Trials as Topic - Abstract
Background Setting up a follow-up secondary prevention program after stroke is difficult due to motor and cognitive impairment, but necessary to prevent recurrence and improve patients’ quality of life. To involve a referent nurse and a caregiver from the patient’s social circle in nurse-led multimodal and long-term management of risk factors after stroke could be an advantage due to their easier access to the patient and family. The aim of this study is to compare the benefit of optimized follow up by nursing personnel from the vascular neurology department including therapeutic follow up, and an interventional program directed to the patient and a caregiving member of their social circle, as compared with typical follow up in order to develop a specific follow-up program of secondary prevention of stroke. Methods/design The design is a randomized, controlled, clinical trial conducted in the French Stroke Unit of the Strokavenir network. In total, 410 patients will be recruited and randomized in optimized follow up or usual follow up for 2 years. In both group, patients will be seen by a neurologist at 6, 12 and 24 months. The optimized follow up will include follow up by a nurse from the vascular neurology department, including therapeutic follow up, and a training program on secondary prevention directed to the patient and a caregiving member of their social circle. After discharge, a monthly telephone interview, in the first year and every 3 months in the second year, will be performed by the nurse. At 6, 12 and 24 month, the nurse will give the patient and caregiver another training session. Usual follow up is only done by the patient’s general practitioner, after classical information on secondary prevention of risk factors during hospitalization. The primary outcome measure is blood pressure measured after the first year of follow up. Blood pressure will be measured by nursing personnel who do not know the group into which the patient has been randomized. Secondary endpoints are associated mortality, morbidity, recurrence, drug side-effects and medico-economic analysis. Discussion The result of this trial is expected to provide the benefit of a nurse-led optimized multimodal and long-term interventional program for management of risk factors after stroke, personalizing the role of the nurse and including the patient’s caregiver. Trial registration ClinicalTrials.gov, NCT 02132364. Registered on 7 May 2014. EUDRACT, A 00473-40. Electronic supplementary material The online version of this article (10.1186/s13063-018-2483-0) contains supplementary material, which is available to authorized users.
- Published
- 2018
48. Cell-Intrinsic Control of Interneuron Migration Drives Cortical Morphogenesis
- Author
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Silva, Carla G., Peyre, Elise, Adhikari, Mohit, Tielens, Sylvia, Tanco, Sebastian, Van Damme, Petra, Magno, Lorenzo, Crusy, Nathalie, Agirman, Gulistan, Magiera, Maria M., Kessaris, Nicoletta, Malgrange, Brigitte, Andrieux, Annie, Janke, Carsten, Nguyen, Laurent, GIGA-Neurosciences [Université Liège], GIGA [Université Liège], Université de Liège-Université de Liège, Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF), Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), University College of London [London] (UCL), Institut Curie [Paris], Stress génotoxiques et cancer, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Organisation Fonctionnelle du Cytosquelette, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR27, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and ANR-17-CE13-0021,TUBTUNE,Le ' code tubuline ' : un mécanisme qui adapte les fonctions des microtubules à la demande(2017)
- Subjects
CORTEX ,KINASE RHO-KINASE ,NEURON NUMBER ,genetic structures ,musculoskeletal, neural, and ocular physiology ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,fungi ,education ,Biology and Life Sciences ,PROTEIN ,POLYGLUTAMYLATION ,[SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology ,[SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC] ,CARBOXYPEPTIDASES ,MYOSIN PHOSPHATASE ,nervous system ,GABAERGIC INTERNEURONS ,[SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC] ,Human medicine ,AUTISM ,PHOSPHORYLATION ,Biology ,[SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology - Abstract
Interneurons navigate along multiple tangential paths to settle into appropriate cortical layers. They undergo a saltatory migration paced by intermittent nuclear jumps whose regulation relies on interplay between extracellular cues and genetic-encoded information. It remains unclear how cycles of pause and movement are coordinated at the molecular level. Post-translational modification of proteins contributes to cell migration regulation. The present study uncovers that carboxypeptidase 1, which promotes post-translational protein deglutamylation, controls the pausing of migrating cortical interneurons. Moreover, we demonstrate that pausing during migration attenuates movement simultaneity at the population level, thereby controlling the flow of interneurons invading the cortex. Interfering with the regulation of pausing not only affects the size of the cortical interneuron cohort but also impairs the generation of age-matched projection neurons of the upper layers.
- Published
- 2018
49. Structured Mixture of Linear Mappings in High Dimension
- Author
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Tu, Chun-Chen, Forbes, Florence, Lemasson, Benjamin, Wang, Naisyin, University of Michigan [Ann Arbor], University of Michigan System, Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems (MISTIS ), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Laboratoire Jean Kuntzmann (LJK ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), NeuroImagerie Fonctionnelle et Perfusion Cérébrale, [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Michigan Technological University (MTU), Neuro-imagerie fonctionnelle et métabolique (ANTE-INSERM U836, équipe 5), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), and Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
Mixture of regressions ,Magnetic resonance vascular fingerprinting ,inverse regression ,[MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST] ,Key-words: non linear regression ,Expectation-Maximization ,Robust regression ,EM algorithm ,High dimension - Abstract
When analyzing data with complex structures such as high dimensionality and non-linearity, one often needs sophisticated models to capture the intrinsic complexity. However, practical implementation using these models could be difficult. Striking a balance between parsimony and model flexibility is essential to tackle data complexity while maintaining feasibility and satisfactory prediction performances. In this work, we proposed the use of Structured Mixture of Gaussian Locally Linear Mapping (SMoGLLiM) when there is a need to use high-dimensional predictors to predict low-dimensional responses and there is a possibility that the underlying associations could be heterogeneous or non-linear. Besides using mixtures of linear associations to approximate non-linear patterns locally and using inverse regression to mitigate the complications due to high-dimensional predictors, SMoGLLiM also aims at achieving robustness by adopting cluster-size constraints and trimming abnormal samples. Its hierarchical structure enables covariance matrices and latent factors being shared across smaller clusters, which effectively reduce the number of parameters. An Expectation-Maximization (EM) algorithm is devised for parameter estimation and, with analytical solutions; the estimation process is computa-tionally efficient. Numerical results obtained from three real-world datasets demonstrate the flexibility and ability of SMoGLLiM in accommodating complex data structure. They include using high-dimensional face images to predict the parameters under which the images were taken, predicting the sucrose levels by the high-dimensional hyperspectral measurements obtained from different types of orange juice and a magnetic resonance vascular fingerprinting (MRvF) study in which researchers are interested at using the so-called MRv fingerprints at voxel level to predict the microvascular properties in brain. The three datasets bear different features and presents different types of challenges. For example , the size of the MRv fingerprint dataset demands special consideration to reduce computational burden. With the hierarchical structure of SMoGLLiM, we are able to adopt parallel computing techniques to reduce the model building time by 97%. These examples illustrate the wide range of applicability of SMoGLLiM on handling different kinds of complex data structure.
- Published
- 2018
50. Cytoskeleton stability is essential for the integrity of the cerebellum and its motor- and affective-related behaviors
- Author
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Christophe Bosc, José R. Alonso, Annie Andrieux, Carsten Janke, Eduardo Weruaga, Leticia Peris, David Díaz, Jose M. Muñoz-Castañeda, Marie-Jo Moutin, Rodrigo Muñoz-Castañeda, Instituto de Neurociencias de Castilla y León (INCyL), Universidad de Salamanca, Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie [Paris], [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), and Moutin, Marie-Jo
- Subjects
Male ,0301 basic medicine ,Cerebellum ,[SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Motor Disorders ,Purkinje cell ,Mutant ,lcsh:Medicine ,Degeneration (medical) ,Biology ,Microtubules ,Article ,Mice ,Purkinje Cells ,03 medical and health sciences ,Cognition ,0302 clinical medicine ,GTP-Binding Proteins ,medicine ,Cerebellar Degeneration ,Animals ,Longitudinal Studies ,Cytoskeleton ,lcsh:Science ,Mice, Knockout ,Multidisciplinary ,lcsh:R ,[SDV.NEU.NB] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology ,Flexibility (personality) ,Serine-Type D-Ala-D-Ala Carboxypeptidase ,Mice, Inbred C57BL ,030104 developmental biology ,medicine.anatomical_structure ,Female ,lcsh:Q ,Cognition Disorders ,Neuroscience ,030217 neurology & neurosurgery - Abstract
The cerebellum plays a key role in motor tasks, but its involvement in cognition is still being considered. Although there is an association of different psychiatric and cognitive disorders with cerebellar impairments, the lack of time-course studies has hindered the understanding of the involvement of cerebellum in cognitive and non-motor functions. Such association was here studied using the Purkinje Cell Degeneration mutant mouse, a model of selective and progressive cerebellar degeneration that lacks the cytosolic carboxypeptidase 1 (CCP1). The effects of the absence of this enzyme on the cerebellum of mutant mice were analyzed both in vitro and in vivo. These analyses were carried out longitudinally (throughout both the pre-neurodegenerative and neurodegenerative stages) and different motor and non-motor tests were performed. We demonstrate that the lack of CCP1 affects microtubule dynamics and flexibility, defects that contribute to the morphological alterations of the Purkinje cells (PCs), and to progressive cerebellar breakdown. Moreover, this degeneration led not only to motor defects but also to gradual cognitive impairments, directly related to the progression of cellular damage. Our findings confirm the cerebellar implication in non-motor tasks, where the formation of the healthy, typical PCs structure is necessary for normal cognitive and affective behavior.
- Published
- 2018
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