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1. Occupational exposure to ultrafine particles and lung cancer in a population exposed to asbestos

Author

Carine Rostello, Céline Gramond, Sabyne Audignon, Isabelle Thaon, Patrick Brochard, Julia Benoist, Antoine Gislard, François Laurent, Christophe Paris, Pascal Andujar, Bénédicte Clin, Jean-Claude Pairon, and Fleur Delva

Subjects
Ultrafine particles, Lung cancer, Occupational exposures, Asbestos, Public aspects of medicine, RA1-1270
Abstract

Abstract Background Ultrafine particles are present in ever greater quantities in the workplace and only one epidemiological study to date has found an association with the occurrence of lung cancer. Objective To investigate the effect of occupational exposure to ultrafine particles on the risk of lung cancer. Methods The ARDCO is a surveillance program involving retiree workers who had been exposed to asbestos during their working life. Exposure to ultrafine particles over the complete lifetime occupational history was assessed using the French job exposure matrix MATPUF. Cox proportional hazard models were used to estimate hazard ratios (HRs) and 95% confidence intervals (95% CI). Results There was no association between exposure to ultrafine particles and lung cancer after adjustment for smoking and exposure to asbestos and crystalline silica. Conclusion The findings do not indicate increased risks of lung cancer for UFP after adjustment for level of exposure to asbestos, crystalline silica, and smoking status. Clinical trial number Not applicable.

Published
2025
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2. Asbestos exposure, pleural plaques and digestive cancers

Author

Bénédicte Clin, Céline Gramond, Fleur Delva, Pascal Andujar, Isabelle Thaon, Patrick Brochard, Julia Benoist, Antoine Gislard, François Laurent, Ilyes Benlala, Christophe Paris, and Jean-Claude Pairon

Subjects
Asbestos, Cancer, Digestive cancer, Oesophageal cancer, Occupational exposure, Incidence, Public aspects of medicine, RA1-1270
Abstract

Abstract Background The aim of this study was to analyse the incidence and mortality from various digestive cancer sites and their potential link with pleural plaques, in a French cohort of workers previously occupationally exposed to asbestos. Methods We conducted a 10-year follow-up study in 13,481 male subjects, included in the cohort between October 2003 and December 2005, for whom asbestos exposure was assessed by calculation of a cumulative exposure index (CEI) in equivalent fibres.years/mL for each subject. We conducted an incidence study and a mortality study. Complementary analysis was restricted to men who had performed at least one chest CT-scan (N = 4,794). We used a Cox model with age as the time axis variable, adjusted for smoking, time since first exposure (TSFE), CEI to asbestos and the existence of pleural plaques on CT-scan. Results In the incidence study, a significant dose–response relationship was observed between CEI to asbestos and oesophageal cancer (HR 1.03, 95% CI [1.01–1.06]) in the entire cohort after adjustment for TSFE and smoking status. In subjects undergoing CT-scan, a significant association between pleural plaques was observed for oesophageal cancer incidence (HR 2.80, 95% CI [1.09–7.20]) and in the mortality study, multivariate analyses showed a significant dose–effect response between CEI to asbestos and death from oesophageal cancer (HR 1.03, 95% CI [1.00–1.05]) in the entire cohort. Conclusions This large-scale study confirms results concerning a likely relationship between asbestos exposure and oesophageal cancer, and the association between this cancer and pleural plaques after adjustment on CEI to asbestos.

Published
2025
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3. Leveraging deep learning and computer vision technologies to enhance management of coastal fisheries in the Pacific region

Author

George Shedrawi, Franck Magron, Bernard Vigga, Pauline Bosserelle, Sebastien Gislard, Andrew R. Halford, Sapeti Tiitii, Faasulu Fepuleai, Chris Molai, Manibua Rota, Shivam Jalam, Viliami Fatongiatau, Abel P. Sami, Beia Nikiari, Ada H. M. Sokach, Lucy A. Joy, Owen Li, Dirk J. Steenbergen, and Neil L. Andrew

Subjects
Artificial intelligence, Monitoring, Coastal fisheries management, Co-management, Artisanal fisheries, Data poor fisheries, Medicine, Science
Abstract

Abstract This paper presents the design and development of a coastal fisheries monitoring system that harnesses artificial intelligence technologies. Application of the system across the Pacific region promises to revolutionize coastal fisheries management. The program is built on a centralized, cloud-based monitoring system to automate data extraction and analysis processes. The system leverages YoloV4, OpenCV, and ResNet101 to extract information from images of fish and invertebrates collected as part of in-country monitoring programs overseen by national fisheries authorities. As of December 2023, the system has facilitated automated identification of over six hundred nearshore finfish species, and automated length and weight measurements of more than 80,000 specimens across the Pacific. The system integrates other key fisheries monitoring data such as catch rates, fishing locations and habitats, volumes, pricing, and market characteristics. The collection of these metrics supports much needed rapid fishery assessments. The system’s co-development with national fisheries authorities and the geographic extent of its application enables capacity development and broader local inclusion of fishing communities in fisheries management. In doing so, the system empowers fishers to work with fisheries authorities to enable data-informed decision-making for more effective adaptive fisheries management. The system overcomes historically entrenched technical and financial barriers in fisheries management in many Pacific island communities.

Published
2024
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5. Genome sequence and annotation of Periconia digitata a hopeful biocontrol agent of phytopathogenic oomycetes

Author

Elena Bovio, Corinne Rancurel, Aurélie Seassau, Marc Magliano, Marie Gislard, Anaïs Loisier, Claire Kuchly, Michel Ponchet, Etienne G. J. Danchin, and Cyril Van Ghelder

Subjects
Science
Abstract

Abstract The Periconia fungal genus belongs to the phylum Ascomycota, order Pleosporales, family Periconiaceae. Periconia are found in many habitats, but little is known about their ecology. Several species from this genus produce bioactive molecules. Periconia digitata extracts were shown to be deadly active against the pine wilt nematode. Furthermore, P. digitata was shown to inhibit the plant pathogenic oomycete Phytophthora parasitica. Because P. digitata has great potential as a biocontrol agent and high quality genomic resources are still lacking in the Periconiaceae family, we generated long-read genomic data for P. digitata. Using PacBio Hifi sequencing technology, we obtained a highly-contiguous genome assembled in 13 chromosomes and totaling ca. 39 Mb. In addition, we produced a reference transcriptome, based on 12 different culture conditions, and proteomic data to support the genome annotation. Besides representing a new reference genome within the Periconiaceae, this work will contribute to our better understanding of the Eukaryotic tree of life and opens new possibilities in terms of biotechnological applications.

Published
2023
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7. Occupational exposure to ultrafine particles and lung cancer in a population exposed to asbestos.

Author

Rostello, Carine, Gramond, Céline, Audignon, Sabyne, Thaon, Isabelle, Brochard, Patrick, Benoist, Julia, Gislard, Antoine, Laurent, François, Paris, Christophe, Andujar, Pascal, Clin, Bénédicte, Pairon, Jean-Claude, and Delva, Fleur

Subjects
PROPORTIONAL hazards models, OCCUPATIONAL exposure, SILICA, LUNG cancer, OCCUPATIONAL health services
Abstract

Background: Ultrafine particles are present in ever greater quantities in the workplace and only one epidemiological study to date has found an association with the occurrence of lung cancer. Objective: To investigate the effect of occupational exposure to ultrafine particles on the risk of lung cancer. Methods: The ARDCO is a surveillance program involving retiree workers who had been exposed to asbestos during their working life. Exposure to ultrafine particles over the complete lifetime occupational history was assessed using the French job exposure matrix MATPUF. Cox proportional hazard models were used to estimate hazard ratios (HRs) and 95% confidence intervals (95% CI). Results: There was no association between exposure to ultrafine particles and lung cancer after adjustment for smoking and exposure to asbestos and crystalline silica. Conclusion: The findings do not indicate increased risks of lung cancer for UFP after adjustment for level of exposure to asbestos, crystalline silica, and smoking status. Clinical trial number: Not applicable. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2025
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8. In vitro shared transcriptomic responses of Aedes aegypti to arboviral infections: example of dengue and Rift Valley fever viruses

Author

Séverine Licciardi, Etienne Loire, Eric Cardinale, Marie Gislard, Emeric Dubois, and Catherine Cêtre-Sossah

Subjects
In vitro, Transcriptomic responses, Aedes aegypti, Dengue, Rift Valley fever, Infectious and parasitic diseases, RC109-216
Abstract

Abstract Background Arthropod borne virus infections are the cause of severe emerging diseases. Among the diseases due to arboviruses, dengue (DEN) and Rift Valley fever (RVF) are in the top ten in the list of diseases responsible of severe human cases worldwide. Understanding the effects of viral infection on gene expression in competent vectors is a challenge for the development of early diagnostic tools and may enable researchers and policy makers to better anticipate outbreaks in the next future. Methods In this study, alterations in gene expression across the entire Aedes aegypti genome during infection with DENV and RVFV were investigated in vitro at two time points of infection, the early phase (24 h) and the late phase (6 days) of infection using the RNA sequencing approach Results A total of 10 upregulated genes that share a similar expression profile during infection with both viruses at early and late phases of infection were identified. Family B and D clip-domain serine proteases (CLIP) were clearly overrepresented as well as C-type lectins and transferrin. Conclusions Our data highlight the presence of 10 viral genes upregulated in Ae. aegypti during infection. They may also be targeted in the case of the development of broad-spectrum anti-viral diagnostic tools focusing the mosquito vectors rather than the mammalian hosts as they may predict the emergence of outbreaks.

Published
2020
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9. The Carboniferous (Serpukhovian) macroflora from the “Coteaux du Pont Barré”, Beaulieu-sur-Layon (Maine-et-Loire), South of the Armorican Massif, France

Author

Strullu-Derrien, C, Ballèvre, Michel, Spencer, Alan RT, Guillou, Erwan, Gislard, Jean-Paul, Lardeux, Hubert, Cleal, Christopher J, Strullu-Derrien, C, Ballèvre, Michel, Spencer, Alan RT, Guillou, Erwan, Gislard, Jean-Paul, Lardeux, Hubert, and Cleal, Christopher J

Abstract

The “Coteaux du Pont Barré” in Beaulieu-sur-Layon is a Regional Natural Reserve which is home to exceptional flora and fauna. Recently fossil plants have been discovered at the site adding to its natural heritage significance. The exposure which is part of the “Sillon Houiller de la Basse-Loire” contains Serpukhovian-age (330–320 Ma) remains of sphenophytes, ferns, and lyginopteridopsid and cycadopsid pteridosperms, which are described for the first time as well as the geology of the site. Most Carboniferous macroflora previously described from the Maine-et-Loire has been based on ex situ specimens from now abandoned and inaccessible coal mines. The newly described macroflora shows evidence of in situ remains and differs somewhat in composition from those reported from the coal workings, especially in the total absence of lycopsids and Calymmotheca pteridosperms, and instead having abundant medullosalean foliage (Neuralethopteris). The co-occurrence of Sphenopteris elegans and Neuralethopteris densifolia suggests a slightly younger age compared to the macrofloras documented from the coal-bearing deposits. However, this could be an ecological consequence of the flora growing in better-drained substrate habitats., Copyright © 2023 The Author(s). Published by Informa UK Limited, trading as Taylor & Francis Group. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives License (http://creativecommons.org/licenses/bync-nd/4.0/), which permits non-commercial re-use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited, and is not altered, transformed, or built upon in any way. The linked document is the published version of the article., NHM Repository

Published
2024

13. Effect of paleopolyploidy and allopolyploidy on gene expression in banana

Author

Alberto Cenci, Yann Hueber, Yasmin Zorrilla-Fontanesi, Jelle van Wesemael, Ewaut Kissel, Marie Gislard, Julie Sardos, Rony Swennen, Nicolas Roux, Sebastien Christian Carpentier, and Mathieu Rouard

Subjects
Banana, Polyploidy, Paralogs, Genome structure, Transcriptomics, Biotechnology, TP248.13-248.65, Genetics, QH426-470
Abstract

Abstract Background Bananas (Musa spp.) are an important crop worldwide. Most modern cultivars resulted from a complex polyploidization history that comprised three whole genome duplications (WGDs) shaping the haploid Musa genome, followed by inter- and intra-specific crosses between Musa acuminata and M. balbisiana (A and B genome, respectively). Unresolved hybridizations finally led to banana diversification into several autotriploid (AAA) and allotriploid cultivars (AAB and ABB). Using transcriptomic data, we investigated the impact of the genome structure on gene expression patterns in roots of 12 different triploid genotypes covering AAA, AAB and ABB subgenome constitutions. Results We demonstrate that (i) there are different genome structures, (ii) expression patterns go beyond the predicted genomic groups, and (iii) the proportion of the B genome influences the gene expression. The presence of the B genome is associated with a higher expression of genes involved in flavonoid biosynthesis, fatty acid metabolism, amino sugar and nucleotide sugar metabolism and oxidative phosphorylation. There are cultivar-specific chromosome regions with biased B:A gene expression ratios that demonstrate homoeologous exchanges (HE) between A and B sub-genomes. In two cultivars, aneuploidy was detected. We identified 3674 genes with a different expression level between allotriploid and autotriploid with ~ 57% having recently duplicated copies (paralogous). We propose a Paralog Inclusive Expression (PIE) analysis that appears to be suitable for genomes still in a downsizing and fractionation process following whole genome duplications. Our approach allows highlighting the genes with a maximum likelihood to affect the plant phenotype. Conclusions This study on banana is a good case to investigate the effects of alloploidy in crops. We conclude that allopolyploidy triggered changes in the genome structure of a crop and it clearly influences the gene.

Published
2019
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17. Spatio-temporal diversity and genetic architecture of pyrantel resistance in Cylicocyclus nassatus, the most abundant horse parasite

Author

Sallé, Guillaume, primary, Courtot, Elise, additional, Cabau, Cédric, additional, Parrinello, Hugues, additional, Serreau, Delphine, additional, Reigner, Fabrice, additional, Gesbert, Amandine, additional, Jacquinot, Lauriane, additional, Lenhof, Océane, additional, Aimé, Annabelle, additional, Picandet, Valérie, additional, Kuzmina, Tetiana, additional, Holovachov, Oleksandr, additional, Bellaw, Jennifer, additional, Nielsen, Martin K, additional, von Samson-Himmelstjerna, Georg, additional, Valière, Sophie, additional, Gislard, Marie, additional, Lluch, Jérôme, additional, Kuchly, Claire, additional, and Klopp, Christophe, additional

Published
2023
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20. Genome sequence and annotation ofPericonia digitata, a promising biocontrol agent of phytopathogenic oomycetes

Author

Elena Bovio, Corinne Rancurel, Aurélie Seassau, Marc Magliano, Marie Gislard, Anaïs Loisier, Claire Kuchly, Michel Ponchet, Etienne G.J. Danchin, and Cyril Van Ghelder

Abstract

ThePericoniafungal genus belongs to the phylum Ascomycota, order Pleosporales, family Periconiaceae.Periconiaare found in many habitats but little is known about their ecology. Several species from this genus produce bioactive molecules.Periconia digitataextracts were shown to be deadly active against the pine wilt nematode. Furthermore,P. digitatawas shown to inhibit plant pathogenic oomycetePhytophthora parasitica. BecauseP. digitatahas great potential as a biocontrol agent and high quality genomic resources are still lacking in the Periconiaceae family, we generated long-read genomic data forP. digitata. Using the PacBio Hifi sequencing technology, we obtained a highly-contiguous genome assembled in 13 chromosomes and totalling ca. 39 Mb. In addition, we produced a reference transcriptome, based on 12 different culture conditions, and proteomic data to support the genome annotation. Besides representing a new reference genome within the Periconiaceae, this work will contribute to our better understanding of the Eukaryotic tree of life and opens new possibilities in terms of biotechnological applications.

Published
2023
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21. The Carboniferous (Serpukhovian) macroflora from the 'Coteaux du Pont Barré', Beaulieu-sur-Layon (Maine-et-Loire), South of the Armorican Massif, France

Author

Christine Strullu-Derrien, Michel Ballèvre, Alan R.T. Spencer, Erwan Guillou, Jean-Paul Gislard, Hubert Lardeux, Christopher J. Cleal, Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), The Natural History Museum [London] (NHM), Géosciences Rennes (GR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imperial College London, University of Bristol [Bristol], and Fondation ARS Cuttoli–Paul Appell–Fondation de France

Subjects
Carboniferous, macrofloras, Maine-et-Loire, [SDU.STU.ST]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Stratigraphy, coal swamps, Plant Science, Serpukhovian, [SDU.STU.PG]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Paleontology, Sillon houiller de la Basse-Loire
Abstract

International audience; The “Coteaux du Pont Barré” in Beaulieu-sur-Layon is a Regional Natural Reserve which is home to exceptional flora and fauna. Recently fossil plants have been discovered at the site adding to its natural heritage significance. The exposure which is part of the “Sillon Houiller de la Basse-Loire” contains Serpukhovian-age (330–320 Ma) remains of sphenophytes, ferns, and lyginopteridopsid and cycadopsid pteridosperms, which are described for the first time as well as the geology of the site. Most Carboniferous macroflora previously described from the Maine-et-Loire has been based on ex situ specimens from now abandoned and inaccessible coal mines. The newly described macroflora shows evidence of in situ remains and differs somewhat in composition from those reported from the coal workings, especially in the total absence of lycopsids and Calymmotheca pteridosperms, and instead having abundant medullosalean foliage (Neuralethopteris). The co-occurrence of Sphenopteris elegans and Neuralethopteris densifolia suggests a slightly younger age compared to the macrofloras documented from the coal-bearing deposits. However, this could be an ecological consequence of the flora growing in better-drained substrate habitats.

Published
2023
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25. DNA Adenine Methyltransferase (Dam) Overexpression Impairs Photorhabdus luminescens Motility and Virulence

Author

Amaury Payelleville, Anne Lanois, Marie Gislard, Emeric Dubois, David Roche, Stéphane Cruveiller, Alain Givaudan, and Julien Brillard

Subjects
entomopathogenic bacterium, MTase, insect, pathogenicity, flagellar genes, RNA-seq, Microbiology, QR1-502
Abstract

Dam, the most described bacterial DNA-methyltransferase, is widespread in gamma-proteobacteria. Dam DNA methylation can play a role in various genes expression and is involved in pathogenicity of several bacterial species. The purpose of this study was to determine the role played by the dam ortholog identified in the entomopathogenic bacterium Photorhabdus luminescens. Complementation assays of an Escherichia coli dam mutant showed the restoration of the DNA methylation state of the parental strain. Overexpression of dam in P. luminescens did not impair growth ability in vitro. In contrast, compared to a control strain harboring an empty plasmid, a significant decrease in motility was observed in the dam-overexpressing strain. A transcriptome analysis revealed the differential expression of 208 genes between the two strains. In particular, the downregulation of flagellar genes was observed in the dam-overexpressing strain. In the closely related bacterium Xenorhabdus nematophila, dam overexpression also impaired motility. In addition, the dam-overexpressing P. luminescens strain showed a delayed virulence compared to that of the control strain after injection in larvae of the lepidopteran Spodoptera littoralis. These results reveal that Dam plays a major role during P. luminescens insect infection.

Published
2017
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27. Cost-Effectiveness of an Organized Lung Cancer Screening Program for Asbestos-Exposed Subjects

Author

Sébastien Gendarme, Jean-Claude Pairon, Pascal Andujar, François Laurent, Patrick Brochard, Fleur Delva, Bénédicte Clin, Antoine Gislard, Christophe Paris, Isabelle Thaon, Helene Goussault, Florence Canoui-Poitrine, Christos Chouaïd, Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Clinical Epidemiology and Ageing : Geriatrie Soins Primaires et Santé Publique (CEpiA), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Interuniversitaire de Médecine du Travail de Paris Ile-de-France (IIMTPIF), Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Cancer environnement (EPICENE ), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements (ABTE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), CHU Rouen, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), IMRB - CEPIA/'Clinical Epidemiology And Ageing : Geriatrics, Primary Care and Public Health' [Créteil] (U955 Inserm - UPEC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), and Tapia, Claudia

Subjects
Cancer Research, screening, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, lung neoplasms, asbestos, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, [SDV.MHEP.PSR]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, JEL: I - Health, Education, and Welfare/I.I1 - Health/I.I1.I18 - Government Policy • Regulation • Public Health, Oncology, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, occupational diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, cost-effectiveness, [SDV.MHEP.PSR] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SHS.ECO] Humanities and Social Sciences/Economics and Finance
Abstract

Background: The National Lung Screening Trial (NLST) and NELSON study opened the debate on the relevance of lung cancer (LC) screening in subjects exposed to occupational respiratory carcinogens. This analysis reported the incremental cost-effectiveness ratios (ICER) of an organized LC screening program for an asbestos-exposed population. Methods: Using Markov modelization, individuals with asbestos exposure were either monitored without intervention or annual low-dose thoracic computed-tomography (LDTCT) scan LC screening. LC incidence came from a prospective observational cohort of subjects with occupational asbestos exposure. The intervention parameters were those of the NLST study. Utilities and LC-management costs came from published reports. A sensitivity analysis evaluated different screening strategies. Results: The respective quality-adjusted life year (QALY) gain, supplementary costs and ICER [95% confidence interval] were: 0.040 [0.010–0.065] QALY, 6900 [3700–11,800] € and 170,000 [75,000–645,000] €/QALY for all asbestos-exposed subjects; and 0.144 [0.071–0.216] QALY, 13,000 [5700–26,800] € and 90,000 [35,000–276,000] €/QALY for smokers with high exposure. When screening was based on biennial LDTCT scans, the ICER was 45,000 [95% CI: 15,000–116,000] €/QALY. Conclusions: Compared to the usual ICER thresholds, biennial LDTCT scan LC screening for smokers with high occupational exposure to asbestos is acceptable and preferable to annual scans.

Published
2022
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29. Cost-Effectiveness of an Organized Lung Cancer Screening Program for Asbestos-Exposed Subjects

Author

Gendarme, Sébastien, primary, Pairon, Jean-Claude, additional, Andujar, Pascal, additional, Laurent, François, additional, Brochard, Patrick, additional, Delva, Fleur, additional, Clin, Bénédicte, additional, Gislard, Antoine, additional, Paris, Christophe, additional, Thaon, Isabelle, additional, Goussault, Helene, additional, Canoui-Poitrine, Florence, additional, and Chouaïd, Christos, additional

Published
2022
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30. Pleural plaques and risk of lung cancer in workers formerly occupationally exposed to asbestos: extension of follow-up

Author

Gallet, Justine, primary, Laurent, François, additional, Paris, Christophe, additional, Clin, Bénédicte, additional, Gislard, Antoine, additional, Thaon, Isabelle, additional, Chammings, Soizick, additional, Gramond, Celine, additional, Ogier, Guy, additional, Ferretti, Gilbert, additional, Andujar, Pascal, additional, Brochard, Patrick, additional, Delva, Fleur, additional, Pairon, Jean-Claude, additional, and Lacourt, Aude, additional

Published
2022
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32. Head and neck cancer and asbestos exposure

Author

Clin, Bénédicte, primary, Gramond, Celine, additional, Thaon, Isabelle, additional, Brochard, Patrick, additional, Delva, Fleur, additional, Chammings, Soizick, additional, Gislard, Antoine, additional, Laurent, François, additional, Paris, Christophe, additional, Lacourt, Aude, additional, and Pairon, Jean-Claude, additional

Published
2022
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33. Deep Learning for the Automatic Quantification of Pleural Plaques in Asbestos-Exposed Subjects

Author

Ilyes Benlala, Baudouin Denis De Senneville, Gael Dournes, Morgane Menant, Celine Gramond, Isabelle Thaon, Bénédicte Clin, Patrick Brochard, Antoine Gislard, Pascal Andujar, Soizick Chammings, Justine Gallet, Aude Lacourt, Fleur Delva, Christophe Paris, Gilbert Ferretti, Jean-Claude Pairon, François Laurent, CHU Bordeaux [Bordeaux], Institut de Mathématiques de Bordeaux (IMB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modélisation Mathématique pour l'Oncologie (MONC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER-Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHRU de Nancy, CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Unité de recherche interdisciplinaire pour la prévention et le traitement des cancers (ANTICIPE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Faculté de médecine (UPEC Médecine), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Institut Interuniversitaire de Médecine du Travail de Paris Ile-de-France (IIMTPIF), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This research was funded by French National Health Insurance (Occupational Risk Prevention Department), French Ministry of Labour and Social Relations, French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety (ANSES grant 07-CRD-51, EST 2006/1/43, EST 2009/68)., Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux (Bordeaux INP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Normandie Université (NU), Université de Bordeaux (UB), Aliments Bioprocédés Toxicologie Environnements (ABTE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), CHU Rouen, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Ministère du Travail, de l’Emploi, de la Formation Professionnelle et du Dialogue Social, and Admin, Oskar

Subjects
artificial intelligence, pleural plaques, asbestos exposure, Health, Toxicology and Mutagenesis, Public Health, Environmental and Occupational Health, Asbestos, Deep Learning, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Artificial Intelligence, Occupational Exposure, Medicine, Humans, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, Retrospective Studies
Abstract

International audience; OBJECTIVE: This study aimed to develop and validate an automated artificial intelligence (AI)-driven quantification of pleural plaques in a population of retired workers previously occupationally exposed to asbestos. METHODS: CT scans of former workers previously occupationally exposed to asbestos who participated in the multicenter APEXS (Asbestos PostExposure Survey) study were collected retrospectively between 2010 and 2017 during the second and the third rounds of the survey. A hundred and forty-one participants with pleural plaques identified by expert radiologists at the 2nd and the 3rd CT screenings were included. Maximum Intensity Projection (MIP) with 5 mm thickness was used to reduce the number of CT slices for manual delineation. A Deep Learning AI algorithm using 2D-convolutional neural networks was trained with 8280 images from 138 CT scans of 69 participants for the semantic labeling of Pleural Plaques (PP). In all, 2160 CT images from 36 CT scans of 18 participants were used for AI testing versus ground-truth labels (GT). The clinical validity of the method was evaluated longitudinally in 54 participants with pleural plaques. RESULTS: The concordance correlation coefficient (CCC) between AI-driven and GT was almost perfect (>0.98) for the volume extent of both PP and calcified PP. The 2D pixel similarity overlap of AI versus GT was good (DICE = 0.63) for PP, whether they were calcified or not, and very good (DICE = 0.82) for calcified PP. A longitudinal comparison of the volumetric extent of PP showed a significant increase in PP volumes (p < 0.001) between the 2nd and the 3rd CT screenings with an average delay of 5 years. CONCLUSIONS: AI allows a fully automated volumetric quantification of pleural plaques showing volumetric progression of PP over a five-year period. The reproducible PP volume evaluation may enable further investigations for the comprehension of the unclear relationships between pleural plaques and both respiratory function and occurrence of thoracic malignancy.

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2022
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34. Expertise préalable à la création d’un tableau de maladie professionnelle ou à l’élaboration de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles. Exposition à l’amiante et cancers de l’ovaire et du larynx: Avis de l’Anses Rapport d’expertise collective

Author

Paris, Christophe, Prete, Giovanni, Bailleux, Dominique, Bertin, Mélanie, Brochard, Patrick, Chatelot, Juliette, Counil, Emilie, Daubas-Letourneux, Véronique, d'Escatha, Alexis, Dewitte, Jean Dominique, Dumas, Orianne, Garras, Loic, Garrigou, Alain, Gislard, Antoine, Henry, Emmanuel, Keim-Bagot, Morane, Laborde-Castérot, Hervé, Laurent, Philippe, Leclerc, Annette, Leray, Fabrice, Lucas, David, Luce, Danièle, Papadopoulos, Alexandra, Épidémiologie en Santé au Travail et Ergonomie (IRSET-ESTER), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Paris 13 (UP13), Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon, École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Département Méthodes quantitatives en santé publique (METIS), Centre de Recherches sur l'Action Politique en Europe (ARENES), Université de Rennes (UR)-Institut d'Études Politiques [IEP] - Rennes-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherche sur les services et le management en santé (RSMS), Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Institut national d'études démographiques (INED), Département Santé Environnement Travail et Génie Sanitaire (DSETGS), Département des sciences humaines et sociales (SHS), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sciences Sociales (IRISSO), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris sciences et lettres (PSL), Université de Bourgogne (UB), Centre antipoison et de toxicovigilance (Paris) (CAPTV Paris), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpitaux Universitaires Saint-Louis, Lariboisière, Fernand-Widal, Retraité, Caisse d'assurance retraite et de la santé au travail, CHRU de Brest, Département information médicale (CHU - BREST ), Direction de l'Evaluation des Risques (DER), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), and Anses

Subjects
Cancer du larynx, Ovary cancer, Cancer de l’ovaire, [SDV]Life Sciences [q-bio], Medical diagnosis, Occupational disease, Causal relationship, Asbestos, Exposition professionnelle, Occupational exposure, Maladie professionnelle, Amiante, Diagnostic médical, Laryngeal cancer, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Compensation, Relation causale, Reconnaissance
Abstract

L’amiante est classé en tant que substance cancérogène avérée pour l’humain (groupe 1 du Centre International de Recherche sur la Cancer (CIRC)) depuis les années 70 pour le poumon et la plèvre. La monographie sur l’amiante actualisée en 2012 indique que des preuves suffisantes sont maintenant disponibles pour démontrer le lien entre l’exposition à l’amiante et les cancers du larynx et de l'ovaire. Dans cette monographie, les cancers du pharynx, de l’estomac et les cancers colorectaux sont considérés comme possiblement liés à une exposition à l’amiante, mais avec un niveau de preuve limité.A ce jour, seuls les cancers broncho-pulmonaires provoqués par l'inhalation de poussières d'amiante [tableaux 47C et 47 bis du régime agricole (RA) ou 30C et 30 bis du régime général (RG)] et d’autres affections consécutives à l'inhalation de poussières d'amiante dont les mésothéliomes [tableaux 47D du RA ou 30D du RG] font déjà l’objet d’une présomption d’origine donnant droit à une réparation dans le cadre des tableaux de maladies professionnelles.Dans ce contexte, l’Agence a été saisie le 26 novembre 2018 par la Direction générale du travail, la Direction de la sécurité sociale et le service des affaires financières, sociales et logistiques du ministère en charge de l’agriculture pour la réalisation de l’expertise suivante : « Demande d'expertise préalable à la création de tableaux de maladies professionnelles ou de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP) en lien avec les cancers de l’ovaire, du larynx, du pharynx, de l’estomac et colorectaux provoqués par l’inhalation de poussières d’amiante ».Cette expertise permettra aux commissions de maladies professionnelles et à l’État de mettre à jour, le cas échéant, les modalités de la reconnaissance des maladies professionnelles liées à l’amiante, tant pour le régime agricole que pour le régime général, ou de formuler des recommandations aux CRRMP.Afin de pouvoir répondre aux saisines qui lui sont adressées dans le cadre de cette mission, l’Anses a élaboré dans un premier temps une méthodologie de travail, avec l’appui du groupe de travail « Maladies Professionnelles » (GT MP). En octobre 2020, elle a publié, dans un guide méthodologique, la démarche scientifique à mettre en œuvre en vue de caractériser les liens entre des expositions professionnelles ou des conditions de travail et des problèmes de santé (Anses 2020), afin de documenter les éléments scientifiques utiles pour les consultations et la prise de décision. Les travaux rapportés dans ce rapport s’appuient sur cette méthodologie.

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2022

35. Expertise préalable à la création d’un tableau de maladie professionnelle ou à l’élaboration de recommandations aux comités régionaux dereconnaissance des maladies professionnelles Bronchopneumopathie chronique obstructive en lien avec l’exposition aux pesticides

Author

Paris, Christophe, Prete, Giovanni, Bailleux, Dominique, Bertin, Mélanie, Brochard, Patrick, Chatelot, Juliette, Counil, Emilie, Daubas-Letourneux, Véronique, d'Escatha, Alexis, Dewitte, Jean Dominique, Dumas, Orianne, Garras, Loic, Garrigou, Alain, Gislard, Antoine, Henry, Emmanuel, Keim-Bagot, Morane, Laurent, Philippe, Leclerc, Annette, Leray, Fabrice, Lucas, David, Luce, Danièle, Papadopoulos, Alexandra, Andrianjafimasy, Miora, Brunet, Dominique, Debil, Fanny, Keirsbulck, Marion, Kerkhof, Odile, Druesne, Christine, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris 13 (UP13), Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon, École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Université de Bordeaux (UB), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Institut national d'études démographiques (INED), Université d'Angers (UA), Université de Brest (UBO), Direction santé environnement travail - Santé Publique France, Centre Hospitalier Universitaire de Rouen (CHU de Rouen), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sciences Sociales (IRISSO), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Bourgogne (UB), Retraité, Caisse d'assurance retraite et de la santé au travail, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Direction de l'Evaluation des Risques (DER), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Mission Sciences sociales Expertise et Société (MiSSES), and Anses

Subjects
medical diagnosis, [SDV]Life Sciences [q-bio], causal relationship, reconnaissance, Occupational disease, occupational exposure, pesticides, Maladie professionnelle, chronic obstructive pulmonary disease, compensation, exposition professionnelle, [SDV] Life Sciences [q-bio], diagnostic médical, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Bronchopneumopathie chronique obstructive, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, relation causale
Abstract

Le plan d’actions sur les produits phytopharmaceutiques publié en avril 2018 vise notamment, sur la base des recommandations formulées par l’Inspection générale des affaires sociales, l’Inspection générale des finances et le Conseil général de l’alimentation, de l’agriculture etdes espaces ruraux dans leur rapport conjoint de janvier 2018, à améliorer la prise en charge des maladies professionnelles liées aux pesticides.Dans ce cadre, les pouvoirs publics ont, par courrier en date du 24 avril 2018, saisi l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm) afin d’actualiser l’expertise collective « Pesticides : effets sur la santé » parue en 2013. Cette expertise synthétise les connaissancesdes effets sur la santé pouvant résulter des expositions aux pesticides liées à des usages professionnels ou encore sur les conséquences d’une exposition, professionnelle ou non, pendant la grossesse sur le développement du fœtus et de l’enfant. La mise à jour de cetteexpertise a été publiée le 30 juin 2021. Par ailleurs, l’Anses, qui est en charge de la réalisation de l’expertise scientifique préalable à l’élaboration des tableaux de maladies professionnelles ou à l’élaboration de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP), a été saisie le 26 novembre 2018 par la Direction générale du travail, la Direction de la sécurité sociale et la Direction des affaires financières, sociales et logistiques pour réaliser un travail d’expertise préalable à la création de tableaux en lien avec les expositions professionnelles aux pesticides.Cette saisine fait mention de plusieurs maladies en lien avec l’exposition aux pesticides dont le cancer de la prostate, la maladie de Parkinson et les hémopathies malignes, mais également les pathologies associées positivement avec l’exposition aux pesticides d’après l’actualisation de l’expertise de l’Inserm. L’Anses a rendu publique une première expertise en octobre 2021.Le périmètre de ce travail portait uniquement sur le cancer de la prostate en lien avec les pesticides en général, avec une attention particulière sur le chlordécone (Anses 2021).Ȧ la suite de la mise à jour de l’expertise collective par l’Inserm, mentionnée plus haut, les pouvoirs publics ont décidé de poursuivre l’instruction de cette saisine sur les pesticides en considérant cette fois-ci la bronchopneumopathie chronique obstructive (BPCO).

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2022

36. Pleural plaques and risk of lung cancer in workers formerly occupationally exposed to asbestos: extension of follow-up

Author

Justine Gallet, François Laurent, Christophe Paris, Bénédicte Clin, Antoine Gislard, Isabelle Thaon, Soizick Chammings, Celine Gramond, Guy Ogier, Gilbert Ferretti, Pascal Andujar, Patrick Brochard, Fleur Delva, Jean-Claude Pairon, Aude Lacourt, Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Unité de recherche interdisciplinaire pour la prévention et le traitement des cancers (ANTICIPE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Lorraine (UL), CHI Créteil, Institut Interuniversitaire de Médecine du Travail de Paris Ile-de-France (IIMTPIF), Caisse primaire d'assurance maladie (CPAM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Université Grenoble Alpes (UGA), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), French Ministry of Labour and Social Relations, French National Health Insurance (Occupational Risk Prevention Department), French Agency for Food, Environmental and Occupational Health Safety [07-CRD-51, EST 2006/1/43, EST 2009/68], Jonchère, Laurent, Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], CT scan, screening, [SDV]Life Sciences [q-bio], occupational health, Public Health, Environmental and Occupational Health, Lung cancer, asbestos, pleural plaques, respiratory system
Abstract

BackgroundOccupational asbestos exposure is associated with pleural plaques (PP), a benign disease often seen as a marker of past exposure to asbestos and lung cancer. The association between these two diseases has not been formally proved, the aim of this study was to evaluate this association in the asbestos-related disease cohort (ARDCO) cohort.MethodsARDCO is a French multicentric cohort including workers formerly occupationally exposed to asbestos from 2003 to 2005. CT scan was performed to diagnose PP with double reading and lung cancer (incidence and mortality) was followed through health insurance data and death certificates. Cox models were used to estimate the association between PP and lung cancer adjusting for occupational asbestos exposure (represented by cumulative exposure index, time since first exposure and time since last exposure) and smoking status.ResultsA total of 176 cases (of 5050 subjects) and 88 deaths (of 4938 subjects) of lung cancer were recorded. Smoking status was identified as an effect modifier. Lung cancer incidence and mortality were significantly associated with PP only in non-smokers, respectively, HR=3.13 (95% CI 1.04 to 9.35) and HR=16.83 (95% CI 1.87 to 151.24) after adjustment for age, occupational asbestos exposure and smoking status.ConclusionsARDCO study was the first to study this association considering equal asbestos exposure, and more specifically, our study is the first to test smoking as an effect modifier, so comparison with scientific literature is difficult. Our results seem to consolidate the hypothesis that PP may be an independent risk factor for lung cancer but they must be interpreted with caution.

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37. Expertise préalable à la création d’un tableau de maladie professionnelle ou à l’élaboration de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles. Exposition à l’amiante et cancers de l’ovaire et du larynx

Author

Paris, Christophe, Prete, Giovanni, Bailleux, Dominique, Bertin, Mélanie, Brochard, Patrick, Chatelot, Juliette, Counil, Emilie, Daubas-Letourneux, Véronique, d'Escatha, Alexis, Dewitte, Jean Dominique, Dumas, Orianne, Garras, Loic, Garrigou, Alain, Gislard, Antoine, Henry, Emmanuel, Keim-Bagot, Morane, Laborde-Castérot, Hervé, Laurent, Philippe, Leclerc, Annette, Leray, Fabrice, Lucas, David, Luce, Danièle, Papadopoulos, Alexandra, and Druesne, Christine

Subjects
Cancer du larynx, Ovary cancer, Cancer de l’ovaire, Medical diagnosis, Occupational disease, Causal relationship, Asbestos, Exposition professionnelle, Occupational exposure, Maladie professionnelle, Amiante, Diagnostic médical, [SDV] Life Sciences [q-bio], Laryngeal cancer, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Compensation, Relation causale, Reconnaissance
Abstract

L’amiante est classé en tant que substance cancérogène avérée pour l’humain (groupe 1 du Centre International de Recherche sur la Cancer (CIRC)) depuis les années 70 pour le poumon et la plèvre. La monographie sur l’amiante actualisée en 2012 indique que des preuves suffisantes sont maintenant disponibles pour démontrer le lien entre l’exposition à l’amiante et les cancers du larynx et de l'ovaire. Dans cette monographie, les cancers du pharynx, de l’estomac et les cancers colorectaux sont considérés comme possiblement liés à une exposition à l’amiante, mais avec un niveau de preuve limité.A ce jour, seuls les cancers broncho-pulmonaires provoqués par l'inhalation de poussières d'amiante [tableaux 47C et 47 bis du régime agricole (RA) ou 30C et 30 bis du régime général (RG)] et d’autres affections consécutives à l'inhalation de poussières d'amiante dont les mésothéliomes [tableaux 47D du RA ou 30D du RG] font déjà l’objet d’une présomption d’origine donnant droit à une réparation dans le cadre des tableaux de maladies professionnelles.Dans ce contexte, l’Agence a été saisie le 26 novembre 2018 par la Direction générale du travail, la Direction de la sécurité sociale et le service des affaires financières, sociales et logistiques du ministère en charge de l’agriculture pour la réalisation de l’expertise suivante : « Demande d'expertise préalable à la création de tableaux de maladies professionnelles ou de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP) en lien avec les cancers de l’ovaire, du larynx, du pharynx, de l’estomac et colorectaux provoqués par l’inhalation de poussières d’amiante ».Cette expertise permettra aux commissions de maladies professionnelles et à l’État de mettre à jour, le cas échéant, les modalités de la reconnaissance des maladies professionnelles liées à l’amiante, tant pour le régime agricole que pour le régime général, ou de formuler des recommandations aux CRRMP.Afin de pouvoir répondre aux saisines qui lui sont adressées dans le cadre de cette mission, l’Anses a élaboré dans un premier temps une méthodologie de travail, avec l’appui du groupe de travail « Maladies Professionnelles » (GT MP). En octobre 2020, elle a publié, dans un guide méthodologique, la démarche scientifique à mettre en œuvre en vue de caractériser les liens entre des expositions professionnelles ou des conditions de travail et des problèmes de santé (Anses 2020), afin de documenter les éléments scientifiques utiles pour les consultations et la prise de décision. Les travaux rapportés dans ce rapport s’appuient sur cette méthodologie.

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38. Head and neck cancer and asbestos exposure

Author

Bénédicte Clin, Celine Gramond, Isabelle Thaon, Patrick Brochard, Fleur Delva, Soizick Chammings, Antoine Gislard, François Laurent, Christophe Paris, Aude Lacourt, Jean-Claude Pairon, Unité de recherche interdisciplinaire pour la prévention et le traitement des cancers (ANTICIPE), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Interactions Gènes-Risques environnementaux et Effets sur la Santé (INGRES), Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Université de Bordeaux (UB), CHU Pontchaillou [Rennes], Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, and Admin, Oskar

Subjects
Male, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Lung Neoplasms, Public Health, Environmental and Occupational Health, Asbestos, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Pleural Diseases, Otorhinolaryngologic Diseases, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Head and Neck Neoplasms, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Occupational Exposure, Humans, [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Laryngeal Neoplasms, Occupational Health, Follow-Up Studies, Cancer
Abstract

ObjectivesThe aim of this study was to analyse, within a French cohort of workers previously occupationally exposed to asbestos, incidence and mortality from various sites of head and neck cancers (larynx excluded) and to examine the potential link of these cancers with pleural plaques.MethodsA 10-year follow-up study was conducted in the 13 481 male subjects included in the cohort between October 2003 and December 2005. Asbestos exposure was assessed by industrial hygienist analysis of a standardised questionnaire. The final cumulative exposure index (CEI; in equivalent fibres.years/mL) for each subject was calculated as the sum of each employment period’s four-level CEI. The number of head and neck cancers recorded by the National Health Insurance fund was collected in order to conduct an incidence study. Complementary analysis was restricted to men who had performed at least one chest CT scan (N=4804). A mortality study was also conducted. We used a Cox model with age as the time axis variable adjusted for smoking, time since first exposure, CEI of exposure to asbestos and pleural plaques on CT scans.ResultsWe reported a significant dose–response relationship between CEI of exposure to asbestos and head and neck cancers after exclusion of laryngeal cancers, in the mortality study (HR 1.03, 95% CI (1.01 to 1.06) for an increase of 10 f.years/mL) and a close to significant dose–response relationship in the incidence study (HR 1.02, 95% CI (1.00 to 1.04) for an increase of 10 f.years/mL). No statistically significant association between pleural plaques and head and neck cancer incidence was observed.ConclusionsThis large-scale study suggests a relationship between asbestos exposure and head and neck cancers, after exclusion of laryngeal cancers, regardless of whether associated pleural plaques were present.

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42. Brain virtual histology with X-ray phase-contrast tomography Part II: 3D morphologies of amyloid-β plaques in Alzheimer’s disease models

Author

Chourrout, Matthieu, primary, Roux, Margaux, additional, Boisvert, Carlie, additional, Gislard, Coralie, additional, Legland, David, additional, Arganda-Carreras, Ignacio, additional, Olivier, Cécile, additional, Peyrin, Françoise, additional, Boutin, Hervé, additional, Rama, Nicolas, additional, Baron, Thierry, additional, Meyronet, David, additional, Brun, Emmanuel, additional, Rositi, Hugo, additional, Wiart, Marlène, additional, and Chauveau, Fabien, additional

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43. Deep Learning for the Automatic Quantification of Pleural Plaques in Asbestos-Exposed Subjects

Author

Benlala, Ilyes, primary, De Senneville, Baudouin Denis, additional, Dournes, Gael, additional, Menant, Morgane, additional, Gramond, Celine, additional, Thaon, Isabelle, additional, Clin, Bénédicte, additional, Brochard, Patrick, additional, Gislard, Antoine, additional, Andujar, Pascal, additional, Chammings, Soizick, additional, Gallet, Justine, additional, Lacourt, Aude, additional, Delva, Fleur, additional, Paris, Christophe, additional, Ferretti, Gilbert, additional, Pairon, Jean-Claude, additional, and Laurent, François, additional

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44. Brain virtual histology with X-ray phase-contrast tomography Part II: 3D morphologies of amyloid-β plaques in Alzheimer’s disease models

Author

Coralie Gislard, Marlène Wiart, David Meyronet, Ignacio Arganda-Carreras, Hugo Rositi, Matthieu Chourrout, David Legland, Nicolas Rama, Cécile Olivier, Françoise Peyrin, Margaux Roux, Hervé Boutin, Carlie Boisvert, Emmanuel Brun, Fabien Chauveau, Thierry Baron, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BioInformatique et BioStatistiques (BIBS), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad del Pais Vasco / Euskal Herriko Unibertsitatea [Espagne] (UPV/EHU), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Manchester [Manchester], Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Hospices Civils de Lyon (HCL), Synchrotron Radiation for Biomedicine (STROBE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Université de Lyon-Université de Lyon-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Chauveau, Fabien, Imagerie de l'inflammation cérébrale dans l'AVC ischémique : développement d'une sonde nanoparticulaire multimodale & méthodes d'imagerie cérébrale - - NanoBrain2015 - ANR-15-CE18-0026 - AAPG2015 - VALID, European Synchrotron Research Facility - ESRF - LS2292 - INCOMING, European Synchotron Research Facility - ESRF - MD1018 - INCOMING, European Synchrotron Research Facility - ESRF - IN1041 - INCOMING, ANR-11-LABX-0063 - INCOMING, ANR-11-IDEX-0007 - INCOMING, Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Imagerie Tomographique et Radiothérapie, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Léon Bérard [Lyon], Université de Lyon, Laboratoire de Lyon [ANSES], Université de Lyon-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Synchrotron Radiation for Biomedicine = Rayonnement SynchroTROn pour la Recherche BiomédicalE (STROBE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), ANR-15-CE18-0026,NanoBrain,Imagerie de l'inflammation cérébrale dans l'AVC ischémique : développement d'une sonde nanoparticulaire multimodale & méthodes d'imagerie cérébrale(2015), European Project: LS2292,ESRF, European Project: MD1018,ESRF, European Project: IN1041,ESRF, European Project, Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Maladies Neuro-Dégénératives (MND), and Université de Lyon-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université de Lyon-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)

Subjects
Genetically modified mouse, Pathology, medicine.medical_specialty, Amyloid β, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, 3d analysis, PROPAGATION, 03 medical and health sciences, Myelin, 0302 clinical medicine, medicine, COMPUTED-TOMOGRAPHY, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], FLUORESCENCE, IMAGE-ANALYSIS, A-BETA, IN-VIVO, TANGLES, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Phase contrast tomography, Chemistry, INDUCTION, Histology, MOUSE MODEL, 3. Good health, MICE, [SDV.IB.IMA] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, medicine.anatomical_structure, Immunohistochemistry, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Signal intensity, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract

While numerous transgenic mouse strains have been produced to model the formation of amyloid-β (Aβ) plaques in the brain, efficient methods for whole-brain 3D analysis of Aβ deposits are lacking. Moreover, standard immunohistochemistry performed on brain slices precludes any shape analysis of Aβ plaques. The present study shows how in-line (propagation-based) X-ray phase-contrast tomography (XPCT) combined with ethanol-induced brain sample dehydration enables hippocampus-wide detection and morphometric analysis of Aβ plaques. Performed in three distinct Alzheimer mouse strains, the proposed workflow identified differences in signal intensity and 3D shape parameters: 3xTg displayed a different type of Aβ plaques, with a larger volume and area, greater elongation, flatness and mean breadth, and more intense average signal than J20 and APP/PS1. As a label-free non-destructive technique, XPCT can be combined with standard immunohistochemistry. XPCT virtual histology could thus become instrumental in quantifying the 3D spreading and the morphological impact of seeding when studying prion-like properties of Aβ aggregates in animal models of Alzheimer’s disease. This is Part II of a series of two articles reporting the value of in-line XPCT for virtual histology of the brain; Part I shows how in-line XPCT enables 3D myelin mapping in the whole rodent brain and in human autopsy brain tissue.HighlightsX-ray phase-contrast tomography (XPCT) enables whole brain detection of Aβ plaquesMorphometric parameters of Aβ plaques may be readily retrieved from XPCT dataNew shape parameters were successfully extracted from three Alzheimer’s disease modelsA Fiji-based “biologist-friendly” analysis workflow is proposed and sharedXPCT is a powerful virtual histology tool that requires minimal sample preparationGraphical abstract

Published
2021
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45. Occupational contact urticaria: lessons from the French National Network for Occupational Disease Vigilance and Prevention (RNV3P)*

Author

Bensefa-Colas, L., Telle-Lamberton, M., Faye, S., Bourrain, J.-L., Crépy, M.-N., Lasfargues, G., Choudat, D., Momas, I., Le Barbier, M., Marny, C., Doutrellot-Philippon, C., Roquelaure, Y., Petit, A., Verdun-Esquer, C., Leclerc, I., Dewitte, J. D., Loddé, B., Clin, B., Marquignon, M. F., Chamoux, A., Dutheil, F., Andujar, P., Pairon, J. C., Smolik, H. J., Fernandez, N., Bonneterre, V., Michel, E., Gehanno, J. F., Frimat, P., Nisse, C., Druet-Cabanac, M., Massardier, A., Charbotel, B., Lehucher-Michel, M. P., Roulet, A., Lesage, F. X., Paris, C., Penven, E., Dupas, D., Descatha, A., Mediouni, Z., Léger, D., Bayon, V., Langrand, J., Villa, A., Ben-Brik, E., Martinez, H., Deschamps, F., Gouyet, T., Verger, C., Gislard, A., Rollin, L., Fontana, L., Pélissier, C., Gonzalez, M., Nourry, N., Esquirol, Y., Hérin, F., and Haguenoer, K.

Published
2015
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46. Brain virtual histology with X-ray phase-contrast tomography Part II:3D morphologies of amyloid

Author

Matthieu, Chourrout, Margaux, Roux, Carlie, Boisvert, Coralie, Gislard, David, Legland, Ignacio, Arganda-Carreras, Cécile, Olivier, Françoise, Peyrin, Hervé, Boutin, Nicolas, Rama, Thierry, Baron, David, Meyronet, Emmanuel, Brun, Hugo, Rositi, Marlène, Wiart, and Fabien, Chauveau

Subjects
Article
Abstract

While numerous transgenic mouse strains have been produced to model the formation of amyloid-β (Aβ) plaques in the brain, efficient methods for whole-brain 3D analysis of Aβ deposits have to be validated and standardized. Moreover, routine immunohistochemistry performed on brain slices precludes any shape analysis of Aβ plaques, or require complex procedures for serial acquisition and reconstruction. The present study shows how in-line (propagation-based) X-ray phase-contrast tomography (XPCT) combined with ethanol-induced brain sample dehydration enables hippocampus-wide detection and morphometric analysis of Aβ plaques. Performed in three distinct Alzheimer mouse strains, the proposed workflow identified differences in signal intensity and 3D shape parameters: 3xTg displayed a different type of Aβ plaques, with a larger volume and area, greater elongation, flatness and mean breadth, and more intense average signal than J20 and APP/PS1. As a label-free non-destructive technique, XPCT can be combined with standard immunohistochemistry. XPCT virtual histology could thus become instrumental in quantifying the 3D spreading and the morphological impact of seeding when studying prion-like properties of Aβ aggregates in animal models of Alzheimer’s disease. This is Part II of a series of two articles reporting the value of in-line XPCT for virtual histology of the brain; Part I shows how in-line XPCT enables 3D myelin mapping in the whole rodent brain and in human autopsy brain tissue.

Published
2021

48. Expertise sur les pesticides incluant le chlordécone en lien avec le cancer de la prostate en vue de la création d'un tableau de maladie professionnelle ou de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP)

Author

Paris, Christophe, Prete, Giovanni, Bailleux, Dominique, Bertin, Mélanie, Brochard, Patrick, Chatelot, Juliette, Counil, Emilie, Daubas-Letourneux, Véronique, d'Escatha, Alexis, Dewitte, Jean Dominique, Dumas, Orianne, Garras, Loic, Garrigou, Alain, Gislard, Antoine, Henry, Emmanuel, Keim-Bagot, Morane, Laborde-Castérot, Hervé, Philippe, Laurent, Leclerc, Annette, Leray, Fabrice, Lucas, David, Luce, Danièle, Papadopoulos, Alexandra, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris 13 (UP13), Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon, École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Université de Bordeaux (UB), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Institut national d'études démographiques (INED), Université d'Angers (UA), Université de Brest (UBO), Direction santé environnement travail - Santé Publique France, Centre Hospitalier Universitaire de Rouen (CHU de Rouen), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut de Recherche Interdisciplinaire en Sciences Sociales (IRISSO), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Bourgogne (UB), Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Retraité, Caisse d'assurance retraite et de la santé au travail, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Direction de l'Evaluation des Risques (DER), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Anses, and Druesne, Christine

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], Prostate, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Pesticides, Chlordécone, Cancer
Abstract

Citation suggérée: Anses. (2021). Expertise sur les pesticides incluant le chlordécone en lien avec le cancer de la prostate en vue de la création d'un tableau de maladie professionnelle ou de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP). (Saisine 2018-SA-0267). Maisons-Alfort : Anses, 332 p; Le plan d’actions sur les produits phytopharmaceutiques publié en avril 2018 vise notamment, sur la base des recommandations formulées par l’Inspection générale des affaires sociales, l’Inspection générale des finances et le Conseil général de l’alimentation, de l’agriculture et des espaces ruraux dans leur rapport conjoint de janvier 2018, à améliorer la prise en charge des maladies professionnelles liées aux pesticides1. Dans ce cadre, les pouvoirs publics ont, par courrier en date du 24 avril 2018, saisi l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (INSERM) afin d’actualiser l’expertise collective « Pesticides : effets sur la santé » parue en 2013. Cette expertise synthétise les connaissances des effets sur la santé pouvant résulter des expositions aux pesticides liées à des usages professionnels ou encore sur les conséquences d’une exposition, professionnelle ou non, pendant la grossesse sur le développement du fœtus et de l’enfant. Un addendum a été joint à ladite saisine par courrier du 28 septembre 2018 sollicitant une priorisation sur le sujet du chlordécone, pour l’ensemble des expositions et effets possibles. Par ailleurs, depuis mai 2018, une nouvelle mission « Expertise des Maladies Professionnelles », préalable à l’élaboration des tableaux de maladies professionnelles ou à l’élaboration de recommandations aux comités régionaux de reconnaissance des maladies professionnelles (CRRMP) a été confiée à l’ANSES. Cette phase d’expertise collective, indépendante et pluridisciplinaire a pour objet de caractériser le lien de causalité entre l’exposition professionnelle à une nuisance et une maladie, d’identifier les travaux et professions exposant à cette nuisance, de caractériser cette maladie et dresser un état des lieux de la reconnaissance de cette maladie en lien avec cette nuisance au titre du système complémentaire. Le transfert de cette mission à l’Agence fait partie des mesures identifiées pour restaurer la capacité des pouvoirs publics à réviser la liste des tableaux de maladies professionnelles en fonction de l’évolution des connaissances scientifiques et des pratiques professionnelles. Un groupe de travail « Maladies Professionnelles » (GT MP), constitué suite à un appel à candidatures public, a été créé à cet effet. Dans ce contexte, l’Agence a été saisie le 26 novembre 2018 par la Direction générale du travail, la Direction de la sécurité sociale et la Direction des affaires financières, sociales et logistiques pour la réalisation de l’expertise suivante : « demande d'expertise sur les pesticides et notamment le chlordécone en vue de la création d'un tableau de maladie professionnelle ou de recommandations aux CRRMP » (voir annexe p. 241). Cette demande d’expertise complémentaire à celle de l’INSERM permettra aux partenaires sociaux et à l’État de définir, le cas échéant, les modalités de la reconnaissance en maladies professionnelles liées aux pesticides, tant pour le régime agricole que pour le régime général, ou de formuler des recommandations aux CRRMP. [Saisine liée n°2019-SA-0220]

Published
2021

50. Des chercheurs INRAE traquent les mutations de résistance aux herbicides à l’aide du séquençage à très haut débit. Newsletter SPE (Département INRAE Santé des Plantes et Environnement) n°19, 31 aout 2021

Author

Mallordy, François, Délye, Christophe, Michel, Séverine, Pernin, Fanny, Gautier, V., Gislard, Marie, Poncet, Charles, Le Corre, Valérie, and EL Mjiyad, Noureddine

Subjects
resistance, [SDV] Life Sciences [q-bio], acetolactate-synthase, newsletter INRAE, herbicide, diagnosis, genotyping-by-sequencing, illumina
Abstract

Les inhibiteurs de l’ALS en échec face à l’ambroisie à feuilles d’armoiseEn France, la résistance aux herbicides inhibiteurs de l’acétolactate-synthase (ALS) émerge chez l’ambroisie. Très utilisés car applicables sur la majorité des grandes cultures, ces produits phytosanitaires généralistes inhibent l’ALS, une enzyme clé des végétaux dans la synthèse d’acides aminés essentiels. Ils constituent la deuxième famille de désherbants la plus employée, et en paient le tribut : la résistance à cette classe d’herbicides a été identifiée dans plus de 160 espèces d’adventices, ou « mauvaises herbes ». Récemment rajoutée à cette liste, l’ambroisie à feuilles d’armoise (Ambrosia artemisiifolia) est une plante envahissante et allergène originaire d’Amérique du Nord introduite en Europe au XIXème siècle.Solidement implantée en France métropolitaine, elle s’est lentement étendue depuis son foyer dans la vallée du Rhône dans les années 1880, jusqu’à atteindre aujourd’hui la quasi-totalité des départements de l’hexagone. Plante pionnière tout-terrain, l’ambroisie peut aussi bien coloniser les cultures que les chantiers, les abords des routes ou les friches. Menaçante pour l’équilibre des écosystèmes locaux et les agriculteurs, elle l’est aussi pour nombre de personnes allergiques, puisque le pollen qu’elle relâche massivement entre août et octobre peut provoquer des réactions particulièrement violentes chez les individus sensibles.Trouver l’aiguille dans la botte de foin.Pour limiter la propagation de la résistance aux inhibiteurs de l’ALS, des chercheurs INRAE ont développé, avec l’ambroisie comme modèle, une procédure permettant la détection massive des mutations causant une résistance et la quantification de leurs fréquences. Pour ce faire, les chercheurs ont génotypé par séquençage à très haut débit des portions codantes du gène de l’ALS de 10950 plantes, collectées dans 219 parcelles sélectionnées au hasard sur la base de la présence de fortes infestations d’ambroisie. C’est dans les 40 millions de séquences obtenues que les scientifiques ont cherché des mutations du gène de l’ALS connues pour conférer une résistance aux herbicides, grâce à un programme informatique de leur conception capable de reconnaître ces infimes altérations génétiques dans un océan de données.Résultat : cinq mutations différentes ont été détectées dans 15 parcelles groupées en quatre foyers de résistance, dont le plus important dans le Tarn-et-Garonne, le département où a eu lieu le premier signalement de résistance de l’ambroisie aux inhibiteurs de l’ALS. Ce travail valide le concept de diagnostic massif des résistances aux produits phytosanitaires par séquençage à très haut débit, et permet d’établir une première cartographie des foyers de résistance de l’ambroisie, pouvant mener à l’avenir à des campagnes d’arrachage ciblé. L’équipe travaille désormais à étendre et systématiser ce type d’analyses à d’autres adventices.

Published
2021

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