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Standard de soins pour les pathologies hépatiques de stade avancé, la transplantation hépatique (TH) a été le théâtre de nombreux progrès au cours des 40 dernières années. Le taux de survie du patient est désormais supérieur à 85 % à 1 an dans les grands centres. La période post-opératoire précoce expose le patient transplanté à la morbi-mortalité la plus élevée, dont les facteurs de risque sont pré-, per- et post-opératoires. L’objectif principal de notre étude était d’analyser l’évolution précoce post-transplantation hépatique pédiatrique et la survie du patient à 1 an. Les objectifs secondaires étaient d’identifier les facteurs de risque de mortalité, et d’analyser les complications et la survie du greffon à 1 an. Nous avons conduit une étude rétrospective et observationnelle dans l’unité de réanimation pédiatrique du centre hospitalo-universitaire de Marseille, incluant les enfants ayant bénéficié d’une transplantation hépatique entre janvier 2005 et mars 2020. Pour chaque cas, étaient recueillies les données pré-transplantation concernant le receveur, le donneur et le greffon ; les données per-opératoires intéressant la chirurgie et l’anesthésie ; les données post-opératoires portant sur la survie du patient et du greffon, les complications médicales et chirurgicales et la durée de séjour en unités de soins intensifs, au cours de l’année post-transplantation. Quatre-vingt-dix patients ont été inclus, avec un âge médian de 35,0 [15,0 – 72,5] mois (14,6% étaient âgés de moins de 1 an). La pathologie hépatique principale était l’atrésie des voies biliaires. Le score PELD médian au moment de la TH était de 25,0 [16,2 – 30,0] et 15,9% des patients étaient hospitalisés en unité des soins intensifs en pré-transplantation. Tous les types de greffons étaient représentés : split (41,0 %), foie entier (30,1 %), foie réduit (15,7 %), dons vivants (13,3 %). Dix décès ont été observés, tous en réanimation, plaçant le taux de mortalité globale à 1 an à 11,1 %, avec un délai médian de décès de 2,0 [1,0 – 8,8] jours. Plusieurs facteurs prédictifs de mortalité ressortaient en analyse univariée, comme le degré d’atteinte hépatique et la localisation du patient en pré-transplantation, la survenue en post-opératoire de complications hémorragiques, d’une défaillance hémodynamique ou le recours à l’épuration extra-rénale. Les principales causes de décès étaient la défaillance multi-viscérale, la thrombose veineuse porte et le choc hémorragique. Le taux de survie du greffon était de 82,4 % et la principale cause de perte du greffon était la complication vasculaire. Parmi les complications médicales, les infections étaient fréquentes (67,1 %), sans pour autant qu’elles n’aient causé de décès, et le rejet aigu a concerné 30 patients (36,6 %). Le taux de complications chirurgicales était plus élevé que ceux décrits dans la littérature, avec 48,8 % de ré intervention et 6 re-transplantations dans un délai médian de 29,0 jours. La survie du patient dans notre cohorte est similaire à celle retrouvée dans la plupart des grands centres et dépend de facteurs pré-per- et post-transplantation.

Additional file 2: Figure S1. PCoA showing similarities/differences between bacterial communities from different colonic segments. In all pairwise comparisons between the four groups, only differences between ascending vs sigmoid colonic communities were statistically significant (PERMANOVA P = 0.0449, R2 = 0.0855, F = 1.4952).

The risk of acquisition of multidrug-resistant Enterobacteriaceae (MRE) and of occurrence of diarrhoea is high when travelling to tropical regions. The relationships between these phenomena and the composition of human gut microbiota have not yet been assessed. Here, we investigated the dynamics of changes of metabolically active microbiota by sequencing total RNA from faecal samples taken before and after travel to tropical regions. We found that the occurrence of diarrhoea during the travel was associated with a higher relative abundance of Prevotella copri before departure and after return. The composition of microbiota, before travel as well as at return, was not correlated with the acquisition of MRE. However, the clearance of MRE one month after return was linked to a specific pattern of bacterial species that was also found before and after return.

Effect of in silico decontamination on taxonomic profiles of culture dilutions and negative extraction controls. Means for three samples obtained in separate DNA extraction experiments are given. The R-OTU (ratio between mean ‘absolute’ abundance of OTUs in negative extraction controls and culture samples) cut-offs of 1 to 0.001 were applied for decontamination. This ratio was calculated from the relative OTU abundance and qPCR data obtained using the E. coli standard curve. Dilutions of the master stock are indicated from 1E0 (no dilution) to 1E-8 (10−8). EC, E. coli; SA, S. aureus. NEC_W, negative extraction controls obtained by substituting culture for water; NEC_B, negative extraction controls obtained by substituting culture for lysis buffer; ND, no decontamination was performed. (PDF 16 kb)

Relative abundance of bacterial genera before and after the decontamination procedure. Genera with mean relative abundance >0.5 % in negative extraction controls are presented. The proportion is indicated by the scale at the bottom of the plot. The R-OTU (ratio between mean ‘absolute’ abundance of OTUs in negative extraction controls and culture samples) cut-off of 0.01 was applied for decontamination. This ratio was calculated from the relative OTU abundance and qPCR data obtained using the S. aureus standard curve. For a given culture/dilution or negative extraction control, the data obtained from DNA extractions performed at three different time points (Exp1–Exp3) are presented from left to right. Dilutions of the master stock are indicated from 1E0 (no dilution) to 1E-8 (10−8). NEC_W, negative extraction controls obtained by substituting culture for water; NEC_B, negative extraction controls obtained by substituting culture for lysis buffer. (PDF 13 kb)

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* INRA Unité de Pathologie végétale, Domaine St Maurice, 84140 Montfavet Diffusion du document : INRA Unité de Pathologie végétale, Domaine St Maurice, 84140 Montfavet