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32 results on '"Genson, Guénaëlle"'

2. IMPULsE - développement et Intégration de Méthodes innovantes pour la maîtrise des PUnaises en cultures LEgumières

Author

Gard, Benjamine, Bout, Alexandre, Chaillout, Sandrine, Camoin, Laurent, Canal, Xavier, Cesari, Lily, Clerc, Henri, Delamarre, Cécile, Ginez, Anthony, Lambion, Jérôme, Genson, Guénaëlle, Streito, Jean-Claude, Tosello, Lucas, Thibaut, Verfaille, Patrice, Pierre, Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UCA), Koppert France, Chambre d'Agriculture des Bouches du Rhônes, INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Invenio, Association Provençale de Recherche et d'Expérimentation Légumière (APREL), Groupe de Recherche en Agriculture Biologique (GRAB), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)

Subjects
Pentatomidae, [SDV]Life Sciences [q-bio], biological control, biocontrôle, Miridae, lutte biologique, Protection Biologique Intégrée, Integrated Pest Management
Abstract

Ce volume regroupe les textes issus du programme Casdar "Innovation et Partenariat" et "Recherche technologique" de 2016. Il a été réalisé sous l’égide du GIS Relance Agronomique.; Several management methods for phytophagous bugs on tomato, eggplants and cabbage crops wereevaluated during the research program IMPULsE (2017-2020). In addition, a huge work was carried outfor characterization of the species of bugs present, in order to better understand and to be able to correctlyidentify these highly problematic pests in vegetable crops. In parallel, a study aimed at characterizing thenatural diversity of bug parasitoids was carried out, which succeeded in identifying natural enemies andpotential biological control agents. At this stage, management methods based on physical protection(nets, chromatic sticky traps) and biological control (parasitoids, entomopathogenic nematodes) gave themost interesting results in tomato and eggplant crops under cover. The use of trap plants showed a real potential in cultivation for the management of cabbage bugs in the field. At the end of the project, variousmanagement levers were identified, but the overall strategies remain to be refined.; Le projet IMPULsE (2017-2020) a permis d’évaluer plusieurs méthodes de gestion des punaisesphytophages sur cultures de tomate, aubergine et chou. De plus, un travail important de caractérisationdes espèces de punaises présentes a été conduit afin de mieux connaître et d’être en mesure d’identifiercorrectement ces ravageurs très problématiques en culture. En parallèle, une étude visant à caractériserla diversité naturelle des parasitoïdes de punaises a été réalisée, permettant ainsi d’identifier les ennemisnaturels et de potentiels agents de lutte biologiques. A ce stade, les méthodes de gestions basées sur laprotection physique (filets, pièges chromatiques englués) et la lutte biologique (parasitoïdes, nématodesentomopathogènes) donnent les résultats les plus intéressants en culture de tomate et d’aubergines sousabris. L’utilisation de plantes pièges montre un réel intérêt en culture pour la gestion des punaises duchou en plein champ. A l’issue du projet, différents leviers de gestion ont été identifiées, cependant lesstratégies globales restent à affiner.

Published
2022
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3. A new species of minute litter bug of the genus Cryptostemma(Heteroptera: Dipsocoromorpha: Dipsocoridae) from Basse-Terre (Guadeloupe Islands)

Author

Streito, Jean-Claude, Genson, Guénaëlle, Pierre, Éric, Matocq, Armand, and Pluot-Sigwalt, Dominique

Abstract

SummaryA new species of the genus CryptostemmaHerrich-Schaeffer, 1835, C. karukeraensisn. sp., was collected in several localities of the island of Basse-Terre (Guadeloupe), by prospecting the particular micro-habitats specific to the Dipsocoridae. Males and females (macropterous) and 5th instar nymphs are described and illustrated, in particular details of the pregenital abdomen, and the highly asymmetric and modified genitalia in the male. Among its American congeners, the new species shows morphological similarities with C. haywardiWygodzinsky described from Argentina, but differs in male and female genital characters. The standard barcode DNA sequence (COI) is given for this new species, which is the third known dipsocoromorphan representative from Guadeloupe, after Ceratocombus bifenestratusPoppius, 1910 (Ceratocombidae) and Schizoptera elegansPoppius, 1910 (Schizopteridae).

Published
2023
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4. On the importance of multidisciplinary studies on insect vectors to better understand vector-borne plant diseases

Author

Cruaud, Astrid, Chartois, Marguerite, Farigoule, Pauline, Godefroid, Martin, Mesmin, Xavier, Quiquerez, Ileana, Borgomano, Sabrina, Casabianca, François, Genson, Guénaëlle, Gonzalez, Anne-Alicia, Hugot, Laetitia, Lambert, Maxime, Pierre, Eric, Santoni, Sylvain, Streito, Jean‐Claude, Rossi, Jean-Pierre, Rasplus, Jean‐Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AgroParisTech, Conservatoire Botanique (CBNC), Office de l'Environnement Corse, Systèmes d'Elevage Méditerranéens et Tropicaux - Laboratoire de Recherche sur le Développement de l'Elevage (SELMET-LRDE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, EFSA and XF-ACTORS project, European Project: SFS-09-2016,XF-ACTORS, and European Project: 1122378(2011)

Subjects
Xylella fastidiosa, P. tesselatus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Corsica, biological control, insect vectors, distribution of vectors, Philaenus spumarius, olive, Cistus monspeliensis, spittlebugs, clementine, sentinel, plant diseases
Abstract

International audience; Insect vectors are key actors of the Xylella fastidiosa (Xf) pathosystem. Studies on their host plants, population dynamics and natural enemies as well as large-scale screening of populations for the presence of Xf are essential to understand and control the bacterium spread across agro-ecosystems. In this communication, we will summarize the studies conducted in Corsica since 2017 using field observations, molecular biology, statistical modeling and species distribution modelling. We will elaborate on results transferable to other European areas and, by contrast, on results indicating situations where a case-by-case management strategy appears more appropriate. We will report on the ecological factors driving the abundance of Philaenus spumarius (Ps), which is mostly associated with Cistus monspeliensis and shows preference for cool but relatively dry conditions. In corsican agrosystems, Ps is not the only vector found on crop foliage and other insects could play a role for disease transmission. Managing C. monspeliensis in the vicinity of agricultural areas may nevertheless constitute a component of prophylaxis of Xf. We will also report on an egg parasitoid of Ps occurring throughout Europe that constitutes a potential control agent to be further evaluated....

Published
2021
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5. Wanted egg parasitoids: Ooctonus vulgatus parasitizes Philaenus spumarius in Corsica and is probably widely distributed in Europe

Author

Mesmin Xavier, Chartois Marguerite, Genson Guénaëlle, Rossi Jean-Pierre, Cruaud Astrid, Rasplus Jean-Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), EFSA and XF-ACTORS project, European Project: 727987,XF-ACTORS, and European Project: 1122378(2011)

Subjects
Chalcidoidea, [SDV]Life Sciences [q-bio], xylella, plant health, Integrated Pest Management, Pest natural regulation
Abstract

Current management of Xylella fastidiosa (Xf) epidemics worldwide predominantly involves plant uprooting, soil tillage or insecticide use. Improving vector biological control may be an interesting environmentally friendly lever to help lower vector density, but this research field has been overlooked until very recently. Three types of natural enemies of Philaenus spumarius have been described: egg parasitoids, larval and adult predators, and adult parasitoids. In the present study, we tried to identify egg parasitoids of P. spumarius in Corsica and to give a first assessment of their efficiency in natura. For that purpose, we collected bunches of branches of Cistus monspeliensis in winter, checked for the presence of eggs of P. spumarius on leaf underside, and monitored insect emergence. Ooctonus vulgatus Haliday, 1833 was identified by morphological and molecular methods as emerging from 255 P. spumarius eggs, out of 808 emerged individuals (total sample size = 1107 eggs). This was the only parasitoid species found and it was recorded on 7 out of 9 sampling sites, with parasitism rates ranging from 4 to 69 %. Species distribution models fitted on all available occurrences of O. vulgatus worldwide show that this species is likely to be found commonly in northwestern Europe. Among known natural enemies of P. spumarius, egg parasitoids have a unique combination of features: they kill the pest before it reaches the most harmful stage, and usually exhibit a high level of host specialization. Consequently, we can expect that spatially restricted mass releases in host habitats could decrease Xf transmission without side effects on the local fauna. Egg parasitoids are promising biocontrol agents for the Xf vectors and, provided that we gain more information on their level of specialization and establish mass-rearings, they can be a tool of an IPM strategy for the management of the Xf pathosystem., FR; PPT; xavier.mesmin@inrae.fr

Published
2021
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8. Morphological and genomic assessment of divergence between closely related species of the genus Philaenus (Hemiptera, Aphrophoridae)

Author

Seabra, S.G., Neto, C., Rodrigues, A.S.B., Streito, Jean-Claude, Genson, Guénaëlle, Pierre, Eric, Silva, S.E., Marabuto, E., Figueiredo, E., Mateus, C., Wilson, M., Rei, F., Quartau, J.A., Paulo, O.S., Rebelo, M.T., Universidade de Lisboa (ULISBOA), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária = National Institute for Agrarian and Veterinary Research [Oeiras, Portugal] (INIAV), National Museum of Wales, Universidade de Évora, and Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA)

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2019

9. Ooctonus vulgatus (Hymenoptera, Mymaridae), a potential biocontrol agent to reduce the populations of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) in Europe

Author

Mesmin, Xavier, Chartois, Marguerite, Genson, Guénaëlle, Rossi, Jean-Pierre, Cruaud, Astrid, Rasplus, Jean Yves, Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales Corse - Antenne Corse (AGAP-Corse), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2019

10. A barcode database to identify the vectors of Xylella fastidiosa in Europe

Author

Streito, Jean-Claude, Pierre, Eric, Genson, Guénaëlle, Bellifa, Maxime, Chartois, Marguerite, Germain, Jean-François, Cruaud, Astrid, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), LSV, and Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)

Subjects
Animal biology, xylella fastidiosa, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale, europe, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2019

11. COLEOTOOL - Développement d’outils moléculaires en vue d’identifier les principaux charançons ravageurs du colza et leurs auxiliaires parasitoïdes

Author

Bothorel, S., Pierre, Eric, Luce , S., Lauvernay, A., Leflon, Martine, Delvare, Gérard, Streito, Jean-Claude, Cruaud, Perrine, Ollivier, Mélodie, Genson, Guénaëlle, Cruaud, Astrid, Rasplus, Jean Yves, and Robert, C.

Subjects
régulation naturelle, barcoding, clés d’identification, taux de parasitisme, Ceutorhynchus, parasitoïdes, colza, biological control, identification keys, parasitism rates, parasitoids, oilseed rape
Abstract

Afin de réduire la dépendance en intrants, la lutte biologique par conservation est une stratégie de choix pour gérer les ravageurs. Cela nécessite de mieux comprendre les interactions entre ravageurs et auxiliaires. Sur colza, ces interactions concernent principalement les charançons et des microhyménoptères parasitoïdes qui sont leurs principaux ennemis naturels. L’étude de ces interactions se heurte à des verrous méthodologiques, notamment en termes d’identifications des ennemis naturels, qui appartiennent à des groupes taxonomiques mal connus. Le principal objectif de Coleotool est de lever un de ces verrous en proposant des outils d’identification des charançons ravageurs du colza et de leurs parasitoïdes et des méthodes de quantification du service de régulation. Plusieurs méthodes et outils (élevages, clés d’identification, outils d’identification moléculaire haut débit…) ont été développés dans le cadre de notre projet. La plupart des sorties du projet sont accessibles à tous, directement en ligne via le site Coleotool (fiches descriptives, base de séquences et clés d’identifications des principales espèces de charançons et des parasitoïdes qui leur sont associés) : http://www1.montpellier.inra.fr/CBGP/coleotool/index.html. Le développement de ces outils a également permis de collecter de nombreux spécimens sur l’ensemble du territoire et ainsi de mettre à jour les références sur les espèces de parasitoïdes présentes en France, leur répartition, leur phénologie et leur potentiel de régulation., Conservation biological control is a sustainable approach to pest management that can contribute to reduce our dependency on chemicals. A good understanding of the interactions between pests and their natural enemies which means, on oilseed rape (OSR), between weevils and parasitoid wasps is a prerequisite to implement such an approach. However, weevils and their parasitoids are difficult to identify to species by non-specialists. This limits our understanding of their interactions. The main objective of the project Coleotool was to develop tools to identify weevil pests and their parasitoid wasps and methods to quantify parasitism rate.Several methods and tools (rearing, identification keys, high-throughput molecular identification …) were used and developed during the project. The main outputs are publicly available through the Coleotool website: http://www1.montpellier.inra.fr/CBGP/coleotool/index.html. During this project, many specimens were collected all over France. Then, it was possible to update our records on parasitoids: their distribution, their phenology and their potential to control weevils associated with oilseed rape.

Published
2019

12. COLEOTOOL - Développement d’outils moléculaires en vue d’identifier les principaux charançons ravageurs du colza et leurs auxiliaires parasitoïdes

Author

Robert, C., Bothorel, S., Pierre, Eric, Luce, S., Lauvernay, A., Leflon, Martine, Delvare, Gérard, Streito, Jean-Claude, Cruaud, Perrine, Ollivier, Mélodie, Genson, Guénaëlle, Cruaud, Astrid, Rasplus, Jean Yves, Terres Inovia, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
clés d’identification, oilseed rape, parasitism rates, [SDV]Life Sciences [q-bio], taux de parasitisme, régulation naturelle, biological control, parasitoïdes, colza, identification keys, barcoding, parasitoids, Ceutorhynchus
Abstract

Ce volume regroupe les textes issus du programme Casdar "Innovation et Partenariat" et "Recherche finalisée et innovation" de 2013. Le colloque de restitution s’est déroulé le 6 février 2019 sous l’égide du GIS Relance Agronomique; Conservation biological control is a sustainable approach to pest management that can contribute toreduce our dependency on chemicals. A good understanding of the interactions between pests and theirnatural enemies which means, on oilseed rape (OSR), between weevils and parasitoid wasps is aprerequisite to implement such an approach. However, weevils and their parasitoids are difficult toidentify to species by non-specialists. This limits our understanding of their interactions. The mainobjective of the project Coleotool was to develop tools to identify weevil pests and their parasitoid waspsand methods to quantify parasitism rate.Several methods and tools (rearing, identification keys, high-throughput molecular identification …) were used and developed during the project. The main outputs are publicly available through the Coleotool website: http://www1.montpellier.inra.fr/CBGP/coleotool/index.html.During this project, many specimens were collected all over France. Then, it was possible to update ourrecords on parasitoids: their distribution, their phenology and their potential to control weevilsassociated with oilseed rape.; Afin de réduire la dépendance en intrants, la lutte biologique par conservation est une stratégie de choixpour gérer les ravageurs. Cela nécessite de mieux comprendre les interactions entre ravageurs etauxiliaires. Sur colza, ces interactions concernent principalement les charançons et des microhyménoptères parasitoïdes qui sont leurs principaux ennemis naturels. L’étude de ces interactions seheurte à des verrous méthodologiques, notamment en termes d’identifications des ennemis naturels,qui appartiennent à des groupes taxonomiques mal connus. Le principal objectif de Coleotool est delever un de ces verrous en proposant des outils d’identification des charançons ravageurs du colza etde leurs parasitoïdes et des méthodes de quantification du service de régulation.Plusieurs méthodes et outils (élevages, clés d’identification, outils d’identification moléculaire hautdébit…) ont été développés dans le cadre de notre projet. La plupart des sorties du projet sontaccessibles à tous, directement en ligne via le site Coleotool (fiches descriptives, base de séquences etclés d’identifications des principales espèces de charançons et des parasitoïdes qui leur sontassociés) : http://www1.montpellier.inra.fr/CBGP/coleotool/index.html.Le développement de ces outils a également permis de collecter de nombreux spécimens surl’ensemble du territoire et ainsi de mettre à jour les références sur les espèces de parasitoïdesprésentes en France, leur répartition, leur phénologie et leur potentiel de régulation.

Published
2019
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14. Ten years of Heteroptera barcoding at CBGP: outputs and prospects

Author

Streito, Jean-Claude, Genson, Guénaëlle, Pierre, Eric, Cruaud, Astrid, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, hétéroptera
Abstract

International audience

Published
2018

15. Pushing the limits of whole genome amplification: successful sequencing of RADseq library from a single microhymenopteran (Chalcidoidea, Trichogramma)

Author

Cruaud, Astrid, Groussier, Geraldine, Genson, Guénaëlle, SAUNE, Laure, Polaszek, Andrew, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Natural History Museum, ANR project TriPTIC : ANR-14-CE18-0002, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
GenomiPhi, [SDV]Life Sciences [q-bio], High-throughput genotyping, Microarthropods, lcsh:R, RAD, Small amount of DNA, lcsh:Medicine, WGA, Biodiversity, Genomics, [SDE]Environmental Sciences, Entomology, Molecular Biology, Taxonomy
Abstract

International audience; A major obstacle to high-throughput genotyping of microhymenoptera is their small size. As species are difficult to discriminate, and because complexes may exist, the sequencing of a pool of specimens is hazardous. Thus, one should be able to sequence pangenomic markers (e.g., RADtags) from a single specimen. To date, whole genome amplification (WGA) prior to library construction is still a necessity as at most 10 ng of DNA can be obtained from single specimens (sometimes less). However, this amount of DNA is not compatible with manufacturer's requirements for commercial kits. Here we test the accuracy of the GenomiPhi kit V2 on Trichogramma wasps by comparing RAD libraries obtained from the WGA of single specimens (F0 and F1 generation, about1 ng input DNA for the WGA (0.17-2.9 ng)) and a biological amplification of genomic material (the pool of the progeny of the F1 generation). Globally, we found that 99% of the examined loci (up to 48,189 for one of the crosses, 109 bp each) were compatible with the mode of reproduction of the studied model (haplodiploidy) and Mendelian inheritance of alleles. The remaining 1% (0.01% of the analysed nucleotides) could represent WGA bias or other experimental/analytical bias. This study shows that the multiple displacement amplification method on which the GenomiPhi kit relies, could also be of great help for the high-throughput genotyping of microhymenoptera used for biological control, or other organisms from which only a very small amount of DNA can be extracted, such as human disease vectors (e.g., sandflies, fleas, ticks etc.).

Published
2018
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16. Pushing the limits of whole genome amplification: Successful sequencing of RADseq libraries from single micro-hymenoptera (Chalcidoidea, Trichogramma)

Author

Cruaud, Astrid, Groussier, Geraldine, Genson, Guénaëlle, SAUNE, Laure, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract

A major obstacle to high-throughput genotyping of micro-hymenoptera is their small size. As species are difficult to discriminate and because complexes may exist, the sequencing of a pool of specimens is hazardous. Thus, one should be able to sequence pangenomic markers (e.g. RADtags) from a single specimen. To date, whole genome amplification (WGA) prior to library construction is still a necessity as only ca 10ng of DNA can be obtained from single specimens. However this amount of DNA is not compatible with manufacturer’s requirements for commercialised kits. Here we tested the accuracy of the GenomiPhi kit V2 on Trichogramma wasps by comparing RAD libraries obtained from the WGA of single specimens (generation F0 and F1, ca 1 ng input DNA for the WGA) and a biological amplification of genomic material (the pool of the progeny of the F1 generation). Globally, we found that ca 99% of the examined loci (up to 48,189; 109 bp each) were compatible with the mode of reproduction of the studied model (haplodiploidy) or a Mendelian inheritance of alleles. The remaining 1% (ca 0.01% of the analysed nucleotides) could represent WGA bias or other experimental / analytical bias. This study shows that the multiple displacement amplification method on which the GenomiPhi kit relies, could also be of great help for the high-throughput genotyping of micro-hymenoptera used for biological control or other organisms from which only a very low amount of DNA can be extracted such as human disease vectors (e.g. sand flies, fleas, ticks etc.).

Published
2018
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17. First report of two predatory bugs of interest for biological control in Reunion Island: Orius naivashae and Cyrtopeltis callosus (Hemiptera, Anthocoridae and Miridae)

Author

Streito, Jean-Claude, Fontaine, Olivier, Morguen, Atiama, Genson, Guénaëlle, Pierre, Eric, Sadeyen, Joëlle, Frago, Enric, Nibouche, Samuel, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), SARL La Coccinelle, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), and Nous remercions le métaprogramme SMaCH de l’INRA pour le soutien du projet Lycovitis concernant les ravageurs et auxiliaires de la tomate et de la vigne, qui nous a permis la récolte et le séquençage d’un abondant matériel. Ce travail a également été cofinancé par l’Union Européenne : Fonds Européen Agricole pour le Développement Rural (FEADER), par le Conseil Départemental de La Réunion et par le Centre de coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). La plateforme technique du Pôle de Protection des Plantes bénéficie du soutien du GIS IBISA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie).

Subjects
Reunion Island, Biological control, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences
Abstract

National audience; In the process of finding out alternatives to chemical control in horticultural settings in Reunion island, two predatory bugs have been discovered: Orius naivashae (Poppius, 1920) (Heteroptera, Anthocoridae) and Cyrtopeltis callosus Odhiambo, 1961 (Heteroptera, Miridae). These two species are already known in Eastern Africa; they are now established in the island and their voluntary introduction is unlikely. O. naivashae has already been studied in South Africa as a biological control agent, and is therefore a predator with potential interest for controlling pests, especially in integrated pest management programs. However, the biology of C. callosus is so far little known and future studies are needed to allow its use as a biological control agent.; Dans le cadre de recherche de solutions alternatives à la lutte chimique, deux Punaises prédatrices ont été découvertes dans les systèmes de cultures maraîchers de La Réunion : Orius naivashae (Poppius, 1920) (Heteroptera, Anthocoridae) et Cyrtopeltis callosus Odhiambo, 1961 (Heteroptera, Miridae). Ces deux Punaises connues également de l'est de l'Afrique n'ont, a priori, pas été introduites volontairement et sont établies sur l'île de La Réunion. O. naivashae a déjà été étudiée en Afrique du Sud dans le cadre de programmes de lutte biologique et est un prédateur potentiellement intéressant dans le contexte de programmes de lutte intégrée à La Réunion ; la biologie de C. callosus est complètement inconnue et nécessite d'être étudiée avant d'envisager son utilisation en protection des cultures.

Published
2018

18. Nouvelle contribution à la connaissance des Coccinellidae de l’île de La Réunion

Author

Bellifa, M., Pierre, Eric, Genson, Guénaëlle, Streito, Jean-Claude, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Nous tenons à remercier le département SPE (Santé des Plantes et Environnement) de l’INRA qui en soutenant le projet AuxiGene a permis la collecte et le séquençage des coccinelles listées dans cet article et bien d’autres auxiliaires des cultures.

Subjects
Coccinellidae, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, inventaire, survey, La Réunion
Abstract

National audience; This paper deals with the results of surveys carried out on the Reunion Island in 2014, including the specimens preserved in the CIRAD collection of the CBGP. The different species are illustrated. Specimens of each species have been barcoded when conserved in alcohol.; Cet article présente les résultats de prospections menées sur l’île de La Réunion en 2014, ainsi que les données présentes dans la collection CIRAD du CBGP. Les différentes localités sont listées, et les espèces illustrées. Des individus de chaque espèce ont été barcodés lorsqu’ils étaient conservés en alcool.

Published
2017

19. Ooctonus vulgatus (Hymenoptera, Mymaridae), a potential biocontrol agent to reduce populations of Philaenus spumarius (Hemiptera, Aphrophoridae) the main vector of Xylella fastidiosa in Europe.

Author

Mesmin, Xavier, Chartois, Marguerite, Genson, Guénaëlle, Rossi, Jean-Pierre, Cruaud, Astrid, and Rasplus, Jean-Yves

Subjects
XYLELLA fastidiosa, BIOLOGICAL pest control agents, HYMENOPTERA, HEMIPTERA, BRACONIDAE, REDUCING agents
Abstract

As a vector of Xylella fastidiosa (Wells, 1987) in Europe, the meadow spittlebug Phi- laenus spumarius (Linnaeus, 1758) (Hemiptera, Aphrophoridae) is a species of major concern. Therefore, tools and agents to control this ubiquitous insect that develops and feeds on hundreds of plant species are wanted. We conducted a field survey of P. spumarius eggs in Corsica and provide a first report of Ooctonus vulgatus Haliday, 1833 (Hymenoptera, Mymaridae) as a potential biocontrol agent of P. spumarius in Europe. To allow species identification, we summarized the main characters distinguishing O. vulgatus from other European species of Ooctonus and generated COI DNA barcodes. Parasitism rates were variable in the four localities included in the survey but could reach 69% (for an average number of eggs that hatched per locality of 109). Based on the geographic occurrences of O. vulgatus obtained from the literature, we calibrated an ecological niche model to assess its potential distribution in the Holarctic. Obviously, several questions need to be addressed to determine whether O. vulgatus could become an effective biocontrol agent of P. spumarius in Europe. So far, O. vulgatus has been reared only from P. spumarius eggs, but its exact host-range should be evaluated to ensure efficiency and avoid non-target effect. The top-down impact of the parasitoid on vector populations should also be assessed on large data sets. Finally, the feasibility of mass rearing should be tested. We hope this report serves as a starting point to initiate research on this parasitoid wasp to assess whether it could contribute to reduce the spread and impact of X. fastidiosa in Europe. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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20. Présence sur l’île de La Réunion de deux espèces de Punaises prédatrices potentiellement utilisables pour la lutte biologique : Orius naivashae et Cyrtopeltis callosus (Hemiptera, Anthocoridae et Miridae)

Author

Streito, Jean-Claude, primary, Fontaine, Olivier, additional, Atiama, Morguen, additional, Genson, Guénaëlle, additional, Pierre, Éric, additional, Sadeyen, Joëlle, additional, Frago, Enric, additional, and Nibouche, Samuel, additional

Published
2018
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21. Reconstruction des réseaux d’interactions entre les plantes, Xylella fastidiosa Wells et al., et ses vecteurs potentiels à l’aide d’outils de séquençage à haut débit : intérêt pour le contrôle de la maladie

Author

Rasplus, Jean Yves, Streito, Jean-Claude, Rossi, Jean-Pierre, Genson, Guénaëlle, Germain, Jean-François, Godefroid, Martin, Gonzales, Anne-Alicia, Nidelet, Sabine, Pierre, Eric, Puissant, Stéphane, Santoni, Sylvain, Cruaud, Astrid, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA.

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2016

22. Unjumbling the jumbled trichogrammatids: NGS to the rescue

Author

Cruaud, Astrid, Bout, G., Genson, Guénaëlle, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
[SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2016

24. Molecular phylogenetics, systematics and host-plant associations of the Bruchidius albosparsus (Fåhraeus) species group (Coleoptera, Chrysomelidae, Bruchinae) with the description of four new species

Author

Delobel, Alex, Ru, Bruno Le, Genson, Guénaëlle, Musyoka, Boaz K, Kergoat, Gael, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Recherche pour le Développement, Partenaires INRAE, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Plant Health and Environment Division of INRA (project INRA-SPE EVOSEED)

Subjects
molecular phylogenetics, Vachellia, [SDV]Life Sciences [q-bio], morphology, systematics, Bruchidius
Abstract

International audience; Bruchidius Schilsky is a large paraphyletic genus of seed beetles (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) which consists of multiple lineages that are usually associated with narrow sets of host-plants. In this study we focus on a group that mostly develops on wattle trees (acacias) belonging to the genus Vachellia Wight & Arn. This group originally included nine species and was designated as the Bruchidius centromaculatus (Allard) species group, but recent phylogenetic analyses revealed that these species belong to a much wider group of species with similar morphologies. For reasons of anteriority we call this enlarged group Bruchidius albosparsus (Fåhraeus). Here we review the morphology of species in this group and provide new diagnoses and ecological data for 10 species. The following combinations and synonymies are proposed: Bruchidius tanaensis (Pic, 1921) (= Bruchus tanaensis Pic, 1921) comb. nov. and Bruchidius albosparsus (Fåhraeus, 1839) (= Bruchus spadiceus Fåhraeus, 1839) syn. nov. Four new species are also described: B. eminingensis sp. nov., B. gerrardiicola sp. nov., B. glomeratus sp. nov. and B. haladai sp. nov. Finally we carried out molecular phylogenetic analyses on a multi-marker dataset of 59 specimens and 35 species, including 14 species from the group. The resulting trees allow us to confirm the monophyly of the group of interest and provide a more detailed picture of their evolutionary relationships.

Published
2015

25. Cretaceous environmental changes led to high extinction rates in a hyperdiverse beetle family: Cretaceous environmental changes led to high extinction rates in a hyperdiverse beetle family

Author

Kergoat, Gael, Bouchard, Patrice, Clamens, Anne Laure, Abbate, Jessica Lee, Jourdan, Herve, Jabbour-Zahab, Roula, Genson, Guénaëlle, Soldati, Laurent, Condamine, Fabien L., Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Canadian National Collection of Insects, Arachnids and Nematodes, Agriculture and Agri-Food [Ottawa] (AAFC), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Department of Biological and Environmental Sciences [Gothenburg], University of Gothenburg (GU), 'ANR Biodiversité' of the French National Agency for Research (Project BIONEOCAL 2008–2012), INRA, program 'Bibliothèque du Vivant' (Project CIAM) supported by a joint CNRS, INRA and MNHN consortium, ANR grants (Projects ECOEVOBIO-CHEX2011 and SPATEVOLEPID-10-PDOC- 017-01, respectively), Agriculture and Agri-Food (AAFC), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), École pratique des hautes études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226

Subjects
Biodiversity and Ecology, Cretaceous-palaeogene mass extinction, Cretaceous terrestrial revolution, Dating analyses, Diversification analyses, Environmental changes, Palaeoclimates, Tenebrionidae, Biodiversité et Ecologie, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, humanities
Abstract

Times Cited: 00; Background: As attested by the fossil record, Cretaceous environmental changes have significantly impacted the diversification dynamics of several groups of organisms. A major biome turnover that occurred during this period was the rise of angiosperms starting ca. 125 million years ago. Though there is evidence that the latter promoted the diversification of phytophagous insects, the response of other insect groups to Cretaceous environmental changes is still largely unknown. To gain novel insights on this issue, we assess the diversification dynamics of a hyperdiverse family of detritivorous beetles (Tenebrionidae) using molecular dating and diversification analyses. Results: Age estimates reveal an origin after the Triassic-Jurassic mass extinction (older than previously thought), followed by the diversification of major lineages during Pangaean and Gondwanan breakups. Dating analyses indicate that arid-adapted species diversified early, while most of the lineages that are adapted to more humid conditions diversified much later. Contrary to other insect groups, we found no support for a positive shift in diversification rates during the Cretaceous; instead there is evidence for an 8.5-fold increase in extinction rates that was not compensated by a joint increase in speciation rates. Conclusions: We hypothesize that this pattern is better explained by the concomitant reduction of arid environments starting in the mid-Cretaceous, which likely negatively impacted the diversification of arid-adapted species that were predominant at that time.

Published
2014
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26. Higher level molecular phylogeny of darkling beetles (Coleoptera: Tenebrionidae)

Author

Kergoat, Gael, Soldati, Laurent, Clamens, Anne Laure, Jourdan, Hervé, Jabbour-Zahab, Roula, Genson, Guénaëlle, Bouchard, Patrice, Condamine, Fabien, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Aix Marseille Université (AMU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Canadian National Collection of Insects, Arachnids and Nematodes, Agriculture and Agri-Food (AAFC), Centre de Mathématiques Appliquées - Ecole Polytechnique (CMAP), École polytechnique (X)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), program 'ANR Biodiversite' of the French National Agency for Research (Project BIONEOCAL), INRA, IRD, program 'Bibliotheque du Vivant' (Project CIAM), CNRS, MNHN consortium, ANR [ECOEVOBIO-CHEX2011], Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), and Agriculture and Agri-Food [Ottawa] (AAFC)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology
Abstract

International audience; Insect diversity represents about 60% of the estimated million-and-a-half described eukaryotic species worldwide, yet comprehensive and well-resolved intra-ordinal phylogenies are still lacking for the majority of insect groups. This is the case especially for the most species-rich insect group, the beetles (Coleoptera), a group for which less than 4% of the known species have had their DNA sequenced. In this study, we reconstruct the first higher level phylogeny based on DNA sequence data for the species-rich darkling beetles, a family comprising at least 20000 species. Although amongst all families of beetles Tenebrionidae ranks seventh in terms of species diversity, the lack of knowledge on the phylogeny and systematics of the group is such that its monophyly has been questioned (not to mention those of the subfamilies and tribes contained within it). We investigate the evolutionary history of Tenebrionidae using multiple phylogenetic inference methods (Bayesian inference, maximum likelihood and parsimony) to analyse a dataset consisting of eight gene fragments across 404 taxa (including 250 tenebrionid species). Although the resulting phylogenetic framework only encompasses a fraction of the known tenebrionid diversity, it provides important information on their systematics and evolution. Whatever the methods used, our results provide strong support for the monophyly of the family, and highlight the likely paraphyletic or polyphyletic nature of several important tenebrionid subfamilies and tribes, notably the polyphyletic subfamilies Diaperinae and Tenebrioninae that clearly require substantial revision in the future. Some interesting associations in several groups are also revealed by the phylogenetic analyses, such as the pairing of Aphtora Bates with Phrenapatinae. Furthermore this study advances our knowledge of the evolution of the group, providing novel insights into much-debated theories, such as the apparent relict distribution of the tribe Elenophorini.

Published
2014
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27. Taxonomy, host-plant associations and phylogeny of African Crotalaria-feeding seed beetles (Coleoptera, Chrysomelidae, Bruchinae): the Conicobruchus strangulatus (Fahraeus) species group

Author

Le Ru, Bruno P., Delobel, Alex, Gyoergy, Zoltan, Genson, Guénaëlle, Kergoat, Gael, ProdInra, Migration, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), International Centre of Insect Physiology and Ecology (ICIPE), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Department of Zoology, Eszterházy Károly College, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
host-plants, molecular phylogenetics, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], morphology, Crotalarieae, systematics
Abstract

International audience; A small group of six morphologically related seed beetles (Coleoptera: Chrysomelidae: Bruchinae) belonging to the Conicobruchus genus is reviewed. Species in this group for which host-plants are known feed on various species of Crotalaria (Fabaceae, Crotalarieae). Here we provide diagnoses and a dichotomous key for all six species. The following synonymies are proposed: Conicobruchus cicatricosus (Fahraeus, 1839) (= Bruchus cicatricosus pallidioripennis Pic, 1941) syn. nov.; Conicobruchus strangulatus (Fahraeus, 1839) (= Bruchus hargreavesi Pic, 1933) syn. nov. The corresponding Conicobruchus strangulatus species group is hereby designated. New host-plant data are also included, which correspond to the results of recent collections of legume pods in East Africa. In addition we carried out molecular phylogenetic analyses on a representative sampling of Conicobruchus species (including the six species of interest). The latter allow us to assess the monophyly of the group of interest and to unravel their evolutionary relationships. Molecular phylogenetic analyses also indicate that at least two lineages of Conicobruchus successfully shifted toward Crotalarieae during the course of their diversification.

Published
2014

28. Torymidae (Hymenoptera, Chalcidoidea) revised: molecular phylogeny, circumscription and reclassification of the family with discussion of its biogeography and evolution of life‐history traits.

Author

Janšta, Petr, Cruaud, Astrid, Delvare, Gérard, Genson, Guénaëlle, Heraty, John, Křížková, Barbora, and Rasplus, Jean‐Yves

Subjects
TORYMIDAE, MOLECULAR phylogeny, CLASSIFICATION of insects, GEOGRAPHICAL distribution of insects, GALL wasps
Abstract

A phylogeny of the Torymidae (Chalcidoidea) is estimated using 4734 nucleotides from five genes. Twelve outgroups and 235 ingroup taxa are used, representing about 70% of the recognized genera. Our analyses do not recover Torymidae as monophyletic and we recognize instead two families: Megastigmidae (stat. rev.) and Torymidae s.s. (stat. rev.). Within Torymidae s.s., we recognize six subfamilies and six tribes, including Chalcimerinae, Glyphomerinae and Microdontomerinae (subf. nov.), and two new tribes: Boucekinini and Propalachiini (trib. nov.). Seven unclassified genera (i.e. Cryptopristus, Echthrodape, Exopristoides, Exopristus, part of Glyphomerus, Thaumatorymus, Zaglyptonotus) are assigned to tribes within our new classification. Five genera are restored from synonymy—Ameromicrus and Didactyliocerus from under Torymoides (stat. rev.), Iridophaga and Iridophagoides from under Podagrionella (stat. rev.) and Nannocerus from under Torymus (stat. rev.)—and three genera are synonymized—Allotorymus under Torymussyn. nov., Ditropinotus under Eridontomerussyn. nov. and Pseuderimerus under Erimerussyn. nov. A Palaearctic or Eurasian origin for Torymidae is proposed. The ancestral area of Megastigmidae is indicated as the Australian region. The most probable ancestral life strategy for Torymidae s.s. is ectoparasitism on gall‐forming Cynipidae. The life strategy and putative hosts of the common ancestor of Megastigmidae remain uncertain. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2018
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29. Les taupins du genre Agriotes démasqués par leurs empreintes génétiques

Author

Pic, M., Pierre, Eric, Martinez, Michel, Genson, Guénaëlle, Rasplus, Jean Yves, Albert, H., Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Bayer Cropscience, and Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA.

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, taupin, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, barcode, distribution, identification, Agriotes, wireworm
Abstract

The genus Agriotes includes most of the pest wireworm species in France. Proper identification of these species is very important due to their growing economic impact. This study examined the feasibility and reproducibility of using the Barcode approach (mitochondrial gene COI) to distinguish Agriotes species, to assign a genetic print of each stage of wireworm development to species and to validate a key of morphological characters for larval identification. A distribution map of each pest species in France was also proposed. The results showed that the Barcode approach can be applied to the species used in this study. Genetic analysis revealed distinguishing morphological characters of larvae but was itself useful for resolving problems of identifying larvae to species. Distribution mapping of the species revealed clear boundaries for some species and biotypes; Le genre Agriotes comprend la plupart des espèces nuisibles de taupins de France. Leur identification précise revêt une importance capitale du fait de leur impact économique croissant. Cette étude vérifie la faisabilité et la reproductibilité de l’approche Barcode (gène mitochondrial COI) pour l’identification des espèces du genre Agriotes dans le but d’assigner l’empreinte génétique de chaque stade de développement à son identité spécifique et de valider les caractères morphologiques d’identification larvaire. Elle tente d’établir la cartographie de la distribution française des principales espèces nuisibles. Les résultats obtenus confirment que l’approche Barcode est applicable aux espèces étudiées. Ils valident des caractères morphologiques mais soulèvent des problèmes d’identification larvaire pour une espèce. La répartition des espèces montre une délimitation marquée pour certaines espèces et certains biotypes.

Published
2011

30. Out-of-Australia and back again: the worldwide historical biogeography of non-pollinating fig wasps (Hymenoptera: Sycophaginae)

Author

Cruaud, Astrid, Zahab, Roula, Genson, Guénaëlle, Couloux, Arnaud, Yan-Quiong, Peng, Da-Rong, Yang, Ubaidillah, Rosichon, Pereira, Rodrigo A.S., Kjellberg, Finn, Van Noort, Simon, Kerdelhue, Carole, Rasplus, Jean Yves, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Bayer Cropscience, Key Laboratory of Tropical Forest Ecology, Xishuangbanna Tropical Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences [Changchun Branch] (CAS), Museum Zoologicum Bogoriense, Universidade de São Paulo (USP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Natural History Division, South African Museum, ANR (National Research Agency) 04/10299-4, and NRF GUN 61497

Subjects
PHYLOGENY, GALL-INDUCING INSECTS, [SDV]Life Sciences [q-bio], NINETYEAST RIDGE, DIVERGENCE TIMES, INSECTE, RELATIONS PLANTES-HERBIVORES, DISPERSAL, FIGUIER, FIG WASPS, ESPECE INVASIVE, HISTOIRE BIOGEOGRAPHIQUE, BIOGEOGRAPHY, FICUS
Abstract

Contact: cruaud@supagro.inra.fr; International audience; Aim Figs (Ficus, Moraceae) are exploited by rich communities of often host-specific phytophagous wasps. Among them, gall-inducing Sycophaginae (Hymenoptera, Chalcidoidea) may share a common history with Ficus and their mutualistic pollinators (Agaonidae). We investigate here, for the first time, the phylogeny and biogeographical history of Sycophaginae and compare the timing of radiation and dispersion of major clades with available data on Ficus and fig pollinators. Reconstructing the history of their host colonization and association over space and time is central to understanding how fig wasp communities were assembled. Location World-wide. Methods Maximum likelihood and Bayesian analyses were conducted on 4267 bp of mitochondrial and nuclear DNA to produce a phylogeny of all genera of Sycophaginae. Two relaxed clock methods with or without rate autocorrelation were used for date estimation. Analyses of ancestral area were also conducted to investigate the geographical origin of the Sycophaginae. Results The phylogeny is well resolved and supported. Our data suggest a post- Gondwanan origin for the Sycophaginae (50–40 Ma) and two independent outof- Australia dispersal events to continental Asia. Given palaeoclimatic and palaeogeographic records, the following scenario appears the most likely. The ancestor of Idarnes+Apocryptophagus migrated to Greater India through the Ninetyeast Ridge (40–30 Ma). The ancestor of Anidarnes+Conidarnes dispersed later via Sundaland (25–20 Ma). Idarnes and Anidarnes subsequently reached the New World via the North Atlantic land bridges during the Late Oligocene Warming Event. Apocryptophagus reached Africa c. 20 Ma via the Arabic corridors and returned to Australasia following the expansion of Sundaland tropical forests (20–10 Ma). Main conclusions Sycophaginae probably invaded the fig microcosm in Australia c. 50–40 Ma after the origin of their host plant. Once associated with figs, they dispersed out of Australia and radiated together with their host fig and associated pollinator through the tropics. We recorded a good coincidence of timing between dispersal events of Sycophaginae and continental connections. Furthermore, fruit pigeons that disperse figs probably spread out of Australasia through the Indian Ocean via the Ninetyeast Ridge c. 38 Ma. Therefore, our study highlights the potential for combining molecular phylogenetics with multiple methods of dating of interacting groups to reconstruct the historical

Published
2011
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31. Description of Eretmocerus cocois sp. n. (Hymenoptera: Chalcidoidea), a parasitoid of Aleurotrachelus atratus (Hemiptera: Aleyrodidae) on the coconut palm

Author

Delvare, Gérard, Genson, Guénaëlle, Borowiec, Nicolas, Karimé, Anliliochouroutu, Beaudoin-Ollivier, Laurence, ProdInra, Migration, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), and Direction Régionale de l'Agriculture et de la Forêt (DRAF)

Subjects
ALEUROTRACHELUS ATRATUS, ERETMOCERUS, CHALCIDOIDEA, PARASITOID, ERETMOCERUS COCOIS, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, BIOLOGICAL CONTROL, [SDV.BID] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity
Abstract

Publication Inra prise en compte dans l'analyse bibliométrique des publications scientifiques mondiales sur les Fruits, les Légumes et la Pomme de terre. Période 2000-2012. http://prodinra.inra.fr/record/256699; International audience; Eretmocerus cocois Delvare sp. n. (Hymenoptera, Chalcidoidea) is described and illustrated. The adults emerge from fourth instar larvae of Aleurotrachelus atratus Hempel (Hemiptera, Aleyrodidae) which presently heavily infest the coconut plantations in Comoros Islands. It is compared with E. pallidus Dozier a diagnosis of which is given, together with new illustrations and with two other Eretmocerus also reared from Aleurotrachelus nymphs. A lectotype is selected for E. pallidus.

Published
2008

32. Distinct barcodes for the Cereal leaf beetles Oulema melanopus and Oulema duftschmidi (Coleoptera: Chrysomelidae), two syntopical sibling species.

Author

LEROY, JULIE, CHAPELIN-VISCARDI, JEAN-DAVID, GENSON, GUÉNAËLLE, HARAN, JULIEN, PIERRE, ÉRIC, and STREITO, JEAN-CLAUDE

Subjects
*CHRYSOMELIDAE, *BEETLES, *BAR codes, *SPECIES, *RELIABILITY in engineering, *INSECTICIDE resistance, *TWO-dimensional bar codes
Abstract

Oulema melanopus (Linnaeus, 1758) and Oulema duftschmidi (Redtenbacher, 1874) (Coleoptera: Chrysomelidae) are two native West Palaearctic species developing on various cultivated and wild grasses. Along with O. obscura they are considered to be secondary pests of cereal crops. However, local outbreaks have been recorded recently and their status as secondary pests may evolve, especially as the use of broad-spectrum insecticides is now greatly reduced. Oulema melanopus and O. duftschmidi are considered to be sibling species. They are morphologically very close and difficult to distinguish from each other, which makes it difficult to study them. We tested the reliability of the standard barcode fragment (COI) for distinguishing between these species. A total of 92 samples of the two species, covering the majority of their natural range, was sequenced for the barcode fragment and inter- and intraspecific genetic distances were estimated. Our results confirm those of Bezděk & Baselga (2015, Acta Entomol. Mus. Nat. Prag. 55: 273-304) in that this marker cannot differentiate between all the species of the Oulema melanopus complex, which in the Mediterranean basin contains several described and possibly some undescribed cryptic species. However, this marker may be useful in an agricultural context in areas where only O. melanopus and O. duftschmidi occur (such as in cereal crops in France) where it can be used to reliably and rapidly separate all stages of these two taxa and can therefore help in studying their ecology and dynamics. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2020
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