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13 results on '"Garcia P.R."'

1. Meta-analysis uncovers genome-wide significant variants for rapid kidney function decline

Author

Gorski, M. (Mathias), Jung, B. (Bettina), Li, Y. (Yong), Matias-Garcia, P.R. (Pamela R.), Wuttke, M. (Matthias), Coassin, S. (Stefan), Thio, C.H.L. (Chris H.L.), Kleber, M.E. (Marcus E.), Winkler, T.W. (Thomas W.), Wanner, V. (Veronika), Chai, J.-F. (Jin-Fang), Chu, A.Y. (Audrey Y), Cocca, M. (Massimiliano), Feitosa, M.F. (Mary Furlan), Ghasemi, S. (Sahar), Hoppmann, A. (Anselm), Horn, K. (Katrin), Li, M. (Man), Nutile, T. (Teresa), Scholz, M. (Markus), Sieber, K.B. (Karsten B.), Teumer, A. (Alexander), Tin, A. (Adrienne), Wang, J. (Judy), Tayo, B. (Bamidele), Ahluwalia, T.S. (Tarunveer Singh), Almgren, P. (Peter), Bakker, S.J.L. (Stephan), Banas, B. (Bernhard), Bansal, N. (Nisha), Biggs, M.L. (M.), Boerwinkle, E.A. (Eric), Bottinger, E.P. (Erwin), Brenner, H. (Hermann), Carroll, R.J. (Robert J.), Chalmers, J. (John), Chee, M.-L. (Miao-Li), Chee, M.-L. (Miao-Ling), Cheng, C.-Y. (Ching-Yu), Coresh, J. (Josef), de Borst, M.H. (Martin H.), Degenhardt, F. (Frauke), Eckardt, K.-U. (Kai-Uwe), Endlich, K. (Karlhans), Franke, A. (Andre), Freitag-Wolf, S. (Sandra), Gampawar, P. (Piyush), Gansevoort, R.T. (Ron), Ghanbari, M. (Mohsen), Gieger, C. (Christian), Hamet, P. (Pavel), Ho, K. (Kevin), Hofer, E. (Edith), Holleczek, B. (B.), Xian Foo, V.H. (Valencia Hui), Hutri-Kähönen, N. (Nina), Hwang, S.-J. (Shih-Jen), Ikram, M.A. (Arfan), Josyula, N.S. (Navya Shilpa), Kähönen, M. (Mika), Khor, C.C., Koenig, W. (Wolfgang), Kramer, H. (Holly), Krämer, B.K. (Bernhard), Kuhnel, B. (Brigitte), Lange, L.A. (Leslie A.), Lehtimäki, T. (Terho), Lieb, W. (Wolfgang), Alizadeh, B.Z. (Behrooz), Boezen, H.M. (H. Marike), Franke, L. (Lude), van der Harst, P. (Pim), Matullo, G., Rots, M.G. (M.), Snieder, H. (Harold), Swertz, M. (Morris), Wolffenbuttel, B.H.R. (Bruce), Wijmenga, C. (Cisca), Abecasis, G.R. (Gonçalo), Baras, A. (Aris), Cantor, M. (Michael), Coppola, G. (Giovanni), Economides, A. (Aris), Lotta, L.A. (Luca A.), Overton, J.D. (John D.), Reid, J.G. (Jeffrey G.), Shuldiner, A. (Alan), Beechert, C. (Christina), Forsythe, C. (Caitlin), Fuller, E.D. (Erin D.), Gu, Z. (Zhenhua), Lattari, M. (Michael), Lopez, A. (Alexander), Schleicher, T.D. (Thomas D.), Padilla, M.S. (Maria Sotiropoulos), Toledo, K. (Karina), Widom, L. (Louis), Wolf, S.E. (Sarah E.), Pradhan, M. (Manasi), Manoochehri, K. (Kia), Ulloa, R.H. (Ricardo H.), Bai, X. (Xiaodong), Balasubramanian, S. (Suganthi), Barnard, L. (Leland), Blumenfeld, A. (Andrew), Eom, G. (Gisu), Habegger, L. (Lukas), Hawes, A. (Alicia), Khalid, S. (Shareef), Maxwell, E.K. (Evan K.), Salerno, W. (William), Staples, J.C. (Jeffrey C.), Jones, M.B. (Marcus B.), Mitnaul, L.J. (Lyndon), Loos, R.J.F. (Ruth J.F.), Lukas, M.A. (Mary Ann), Lyytikäinen, L.-P. (Leo-Pekka), Meisinger, C. (Christa), Meitinger, T. (Thomas), Melander, O. (Olle), Milaneschi, Y. (Yuri), Mishra, P.P. (Pashupati P.), Mononen, N. (Nina), Mychaleckyj, J.C. (Josyf), Nadkarni, G. (Girish), Nauck, M. (Matthias), Nikus, K. (Kjell), Ning, B. (Boting), Nolte, I.M. (Ilja), O'Donoghue, M.L. (Michelle L.), Orho-Melander, M. (Marju), Pendergrass, S.A. (Sarah), Penninx, B.W.J.H. (Brenda), Preuss, M. (Michael), Psaty, B.M. (Bruce M.), Raffield, L.M. (Laura M.), Raitakari, O. (Olli), Rettig, R. (Rainer), Rheinberger, M. (Myriam), Rice, K.M. (Kenneth M.), Rosenkranz, A.R. (Alexander R.), Rossing, K., Rotter, J.I. (Jerome I.), Sabanayagam, C. (Charumathi), Schmidt, H. (Helena), Schmidt, R. (Reinhold), Schöttker, B. (Ben), Schulz, C.A. (Christina Alexandra), Sedaghat, S. (Sanaz), Shaffer, C.M. (Christian M.), Strauch, K. (Konstantin), Szymczak, S. (Silke), Taylor, K.D. (Kent D.), Tremblay, J. (Johanne), Chaker, L. (Layal), Most, P.J. (Peter) van der, Verweij, N. (Niek), Völker, U. (Uwe), Waldenberger, M. (Melanie), Wallentin, L.C. (Lars), Waterworth, D.M. (Dawn M.), White, H.D. (Harvey), Wilson, J.G. (James G.), Wong, T.-Y. (Tien-Yin), Woodward, M. (Mark), Yang, Q. (Qiong), Yasuda, M. (Masayuki), Yerges-Armstrong, L.M. (Laura), Zhang, Y. (Yan), Wanner, C. (Christoph), Böger, C.A. (Carsten), Köttgen, A. (Anna), Kronenberg, F. (Florian), Penninx, B.W.J.H., Heid, I.M. (Iris), Gorski, M. (Mathias), Jung, B. (Bettina), Li, Y. (Yong), Matias-Garcia, P.R. (Pamela R.), Wuttke, M. (Matthias), Coassin, S. (Stefan), Thio, C.H.L. (Chris H.L.), Kleber, M.E. (Marcus E.), Winkler, T.W. (Thomas W.), Wanner, V. (Veronika), Chai, J.-F. (Jin-Fang), Chu, A.Y. (Audrey Y), Cocca, M. (Massimiliano), Feitosa, M.F. (Mary Furlan), Ghasemi, S. (Sahar), Hoppmann, A. (Anselm), Horn, K. (Katrin), Li, M. (Man), Nutile, T. (Teresa), Scholz, M. (Markus), Sieber, K.B. (Karsten B.), Teumer, A. (Alexander), Tin, A. (Adrienne), Wang, J. (Judy), Tayo, B. (Bamidele), Ahluwalia, T.S. (Tarunveer Singh), Almgren, P. (Peter), Bakker, S.J.L. (Stephan), Banas, B. (Bernhard), Bansal, N. (Nisha), Biggs, M.L. (M.), Boerwinkle, E.A. (Eric), Bottinger, E.P. (Erwin), Brenner, H. (Hermann), Carroll, R.J. (Robert J.), Chalmers, J. (John), Chee, M.-L. (Miao-Li), Chee, M.-L. (Miao-Ling), Cheng, C.-Y. (Ching-Yu), Coresh, J. (Josef), de Borst, M.H. (Martin H.), Degenhardt, F. (Frauke), Eckardt, K.-U. (Kai-Uwe), Endlich, K. (Karlhans), Franke, A. (Andre), Freitag-Wolf, S. (Sandra), Gampawar, P. (Piyush), Gansevoort, R.T. (Ron), Ghanbari, M. (Mohsen), Gieger, C. (Christian), Hamet, P. (Pavel), Ho, K. (Kevin), Hofer, E. (Edith), Holleczek, B. (B.), Xian Foo, V.H. (Valencia Hui), Hutri-Kähönen, N. (Nina), Hwang, S.-J. (Shih-Jen), Ikram, M.A. (Arfan), Josyula, N.S. (Navya Shilpa), Kähönen, M. (Mika), Khor, C.C., Koenig, W. (Wolfgang), Kramer, H. (Holly), Krämer, B.K. (Bernhard), Kuhnel, B. (Brigitte), Lange, L.A. (Leslie A.), Lehtimäki, T. (Terho), Lieb, W. (Wolfgang), Alizadeh, B.Z. (Behrooz), Boezen, H.M. (H. Marike), Franke, L. (Lude), van der Harst, P. (Pim), Matullo, G., Rots, M.G. (M.), Snieder, H. (Harold), Swertz, M. (Morris), Wolffenbuttel, B.H.R. (Bruce), Wijmenga, C. (Cisca), Abecasis, G.R. (Gonçalo), Baras, A. (Aris), Cantor, M. (Michael), Coppola, G. (Giovanni), Economides, A. (Aris), Lotta, L.A. (Luca A.), Overton, J.D. (John D.), Reid, J.G. (Jeffrey G.), Shuldiner, A. (Alan), Beechert, C. (Christina), Forsythe, C. (Caitlin), Fuller, E.D. (Erin D.), Gu, Z. (Zhenhua), Lattari, M. (Michael), Lopez, A. (Alexander), Schleicher, T.D. (Thomas D.), Padilla, M.S. (Maria Sotiropoulos), Toledo, K. (Karina), Widom, L. (Louis), Wolf, S.E. (Sarah E.), Pradhan, M. (Manasi), Manoochehri, K. (Kia), Ulloa, R.H. (Ricardo H.), Bai, X. (Xiaodong), Balasubramanian, S. (Suganthi), Barnard, L. (Leland), Blumenfeld, A. (Andrew), Eom, G. (Gisu), Habegger, L. (Lukas), Hawes, A. (Alicia), Khalid, S. (Shareef), Maxwell, E.K. (Evan K.), Salerno, W. (William), Staples, J.C. (Jeffrey C.), Jones, M.B. (Marcus B.), Mitnaul, L.J. (Lyndon), Loos, R.J.F. (Ruth J.F.), Lukas, M.A. (Mary Ann), Lyytikäinen, L.-P. (Leo-Pekka), Meisinger, C. (Christa), Meitinger, T. (Thomas), Melander, O. (Olle), Milaneschi, Y. (Yuri), Mishra, P.P. (Pashupati P.), Mononen, N. (Nina), Mychaleckyj, J.C. (Josyf), Nadkarni, G. (Girish), Nauck, M. (Matthias), Nikus, K. (Kjell), Ning, B. (Boting), Nolte, I.M. (Ilja), O'Donoghue, M.L. (Michelle L.), Orho-Melander, M. (Marju), Pendergrass, S.A. (Sarah), Penninx, B.W.J.H. (Brenda), Preuss, M. (Michael), Psaty, B.M. (Bruce M.), Raffield, L.M. (Laura M.), Raitakari, O. (Olli), Rettig, R. (Rainer), Rheinberger, M. (Myriam), Rice, K.M. (Kenneth M.), Rosenkranz, A.R. (Alexander R.), Rossing, K., Rotter, J.I. (Jerome I.), Sabanayagam, C. (Charumathi), Schmidt, H. (Helena), Schmidt, R. (Reinhold), Schöttker, B. (Ben), Schulz, C.A. (Christina Alexandra), Sedaghat, S. (Sanaz), Shaffer, C.M. (Christian M.), Strauch, K. (Konstantin), Szymczak, S. (Silke), Taylor, K.D. (Kent D.), Tremblay, J. (Johanne), Chaker, L. (Layal), Most, P.J. (Peter) van der, Verweij, N. (Niek), Völker, U. (Uwe), Waldenberger, M. (Melanie), Wallentin, L.C. (Lars), Waterworth, D.M. (Dawn M.), White, H.D. (Harvey), Wilson, J.G. (James G.), Wong, T.-Y. (Tien-Yin), Woodward, M. (Mark), Yang, Q. (Qiong), Yasuda, M. (Masayuki), Yerges-Armstrong, L.M. (Laura), Zhang, Y. (Yan), Wanner, C. (Christoph), Böger, C.A. (Carsten), Köttgen, A. (Anna), Kronenberg, F. (Florian), Penninx, B.W.J.H., and Heid, I.M. (Iris)

Abstract

Rapid decline of glomerular filtration rate estimated from creatinine (eGFRcrea) is associated with severe clinical endpoints. In contrast to cross-sectionally assessed eGFRcrea, the genetic basis for rapid eGFRcrea decline is largely unknown. To help define this, we meta-analyzed 42 genome-wide association studies from the Chronic Kidney Diseases Genetics Consortium and United Kingdom Biobank to identify genetic loci for rapid eGFRcrea decline. Two definitions of eGFRcrea decline were used: 3 mL/min/1.73m2/year or more (“Rapid3”; encompassing 34,874 cases, 107,090 controls) and eGFRcrea decline 25% or more and eGFRcrea under 60 mL/min/1.73m2 at follow-up among those with eGFRcrea 60 mL/min/1.73m2 or more at baseline (“CKDi25”; encompassing 19,901 cases, 175,244 controls). Seven independent variants were identified across six loci for Rapid3 and/or CKDi25: consisting of five variants at four loci with genome-wide significance (near UMOD-PDILT (2), PRKAG2, WDR72, OR2S2) and two variants among 265 known eGFRcrea variants (near GATM, LARP4B). All these loci were novel for Rapid3 and/or CKDi25 and our bioinformatic follow-up prioritized varia

Published
2021
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2. Genome-wide association studies identify 137 genetic loci for DNA methylation biomarkers of aging.

Author

McCartney D.L., Min J.L., Richmond R.C., Lu A.T., Sobczyk M.K., Davies G., Broer L., Guo X., Jeong A., Jung J., Kasela S., Katrinli S., Kuo P.-L., Matias-Garcia P.R., Mishra P.P., Nygaard M., Palviainen T., Patki A., Raffield L.M., Ratliff S.M., Richardson T.G., Robinson O., Soerensen M., Sun D., Tsai P.-C., van der Zee M.D., Walker R.M., Wang X., Wang Y., Xia R., Xu Z., Yao J., Zhao W., Correa A., Boerwinkle E., Dugue P.-A., Durda P., Elliott H.R., Gieger C., de Geus E.J.C., Harris S.E., Hemani G., Imboden M., Kahonen M., Kardia S.L.R., Kresovich J.K., Li S., Lunetta K.L., Mangino M., Mason D., McIntosh A.M., Mengel-From J., Moore A.Z., Murabito J.M., Ollikainen M., Pankow J.S., Pedersen N.L., Peters A., Polidoro S., Porteous D.J., Raitakari O., Rich S.S., Sandler D.P., Sillanpaa E., Smith A.K., Southey M.C., Strauch K., Tiwari H., Tanaka T., Tillin T., Uitterlinden A.G., Van Den Berg D.J., van Dongen J., Wilson J.G., Wright J., Yet I., Arnett D., Bandinelli S., Bell J.T., Binder A.M., Boomsma D.I., Chen W., Christensen K., Conneely K.N., Elliott P., Ferrucci L., Fornage M., Hagg S., Hayward C., Irvin M., Kaprio J., Lawlor D.A., Lehtimaki T., Lohoff F.W., Milani L., Milne R.L., Probst-Hensch N., Reiner A.P., Ritz B., Rotter J.I., Smith J.A., Taylor J.A., van Meurs J.B.J., Vineis P., Waldenberger M., Deary I.J., Relton C.L., Horvath S., Marioni R.E., McCartney D.L., Min J.L., Richmond R.C., Lu A.T., Sobczyk M.K., Davies G., Broer L., Guo X., Jeong A., Jung J., Kasela S., Katrinli S., Kuo P.-L., Matias-Garcia P.R., Mishra P.P., Nygaard M., Palviainen T., Patki A., Raffield L.M., Ratliff S.M., Richardson T.G., Robinson O., Soerensen M., Sun D., Tsai P.-C., van der Zee M.D., Walker R.M., Wang X., Wang Y., Xia R., Xu Z., Yao J., Zhao W., Correa A., Boerwinkle E., Dugue P.-A., Durda P., Elliott H.R., Gieger C., de Geus E.J.C., Harris S.E., Hemani G., Imboden M., Kahonen M., Kardia S.L.R., Kresovich J.K., Li S., Lunetta K.L., Mangino M., Mason D., McIntosh A.M., Mengel-From J., Moore A.Z., Murabito J.M., Ollikainen M., Pankow J.S., Pedersen N.L., Peters A., Polidoro S., Porteous D.J., Raitakari O., Rich S.S., Sandler D.P., Sillanpaa E., Smith A.K., Southey M.C., Strauch K., Tiwari H., Tanaka T., Tillin T., Uitterlinden A.G., Van Den Berg D.J., van Dongen J., Wilson J.G., Wright J., Yet I., Arnett D., Bandinelli S., Bell J.T., Binder A.M., Boomsma D.I., Chen W., Christensen K., Conneely K.N., Elliott P., Ferrucci L., Fornage M., Hagg S., Hayward C., Irvin M., Kaprio J., Lawlor D.A., Lehtimaki T., Lohoff F.W., Milani L., Milne R.L., Probst-Hensch N., Reiner A.P., Ritz B., Rotter J.I., Smith J.A., Taylor J.A., van Meurs J.B.J., Vineis P., Waldenberger M., Deary I.J., Relton C.L., Horvath S., and Marioni R.E.

Abstract

Background: Biological aging estimators derived from DNA methylation data are heritable and correlate with morbidity and mortality. Consequently, identification of genetic and environmental contributors to the variation in these measures in populations has become a major goal in the field. Result(s): Leveraging DNA methylation and SNP data from more than 40,000 individuals, we identify 137 genome-wide significant loci, of which 113 are novel, from genome-wide association study (GWAS) meta-analyses of four epigenetic clocks and epigenetic surrogate markers for granulocyte proportions and plasminogen activator inhibitor 1 levels, respectively. We find evidence for shared genetic loci associated with the Horvath clock and expression of transcripts encoding genes linked to lipid metabolism and immune function. Notably, these loci are independent of those reported to regulate DNA methylation levels at constituent clock CpGs. A polygenic score for GrimAge acceleration showed strong associations with adiposity-related traits, educational attainment, parental longevity, and C-reactive protein levels. Conclusion(s): This study illuminates the genetic architecture underlying epigenetic aging and its shared genetic contributions with lifestyle factors and longevity.Copyright © 2021, The Author(s).

Published
2021

3. Eléments d'information sur les effets de l'environnement aromatique de la pulpe de cacao pendant la fermentation sur le profil d'arôme des chocolats

Author

Eskes, Albertus, Ahnert, Dario, Carrion, Luis Garcia, Seguine, Edward, Assemat, Sophie, Guarda, D., and Garcia, P.R.

Subjects
Q02 - Traitement et conservation des produits alimentaires, Q04 - Composition des produits alimentaires
Abstract

Des observations empiriques réalisées par le premier auteur au cours de ses nombreuses visites dans des pays producteurs de cacao ont laissé penser qn'il pour exister une relation entre les caractéristiques aromatiques de la pulpe de cacao et les caractéristiques sensorielles de la liqueur de cacao et des chocolats. Une première tentative visant à démontrer cette relation a été faite en évaluant les caractéristiques aromatiques suivantes: arôme volatil à l'ouverture des cabosses, douceur de la pulpe, acidité de la pulpe, astringence de la pulpe, intensité et type d'arôme de la pulpe, préférence globale pour le goût de la pulpe et degré d'amertume du cotylédon. Un test de dégustation à l'aveugle de la pulpe a été réalisé par un jury de six personnes sur des fruits mûrs de neuf variétés clonales de cacaoyers, représentant différentes origines génétiques, dont plusieurs sont bien connues pour les caractéristiques sensorielles contrastées de leurs chocolats. La préférence globale relative à la pulpe était significativement liée au potentiel d'arôme fin connu des diférentes variétés de cacao testés, alors que les caractéristiques aromatiques spécifiques de la pulpe sont apparues comme étant liées à des types spécifiques d'arôme fin des génotypes de cacaoyers testés. Une illustration frappante de ce phénomène a été donnée par le clone EET 63 (Nacional x Trinitario), qui présentait une odeur florale de "jasmin" à l'ouverture du fruit mûr, une pulpe sucrée avec un arôme agréable intense qui a été qualifié de floral et fruité. Ces caractéristiques aromatiques sont apparement liées à l'arôme "Arriba" typique reconnu du clone EET62. L'arôme typique de fruit frais du cacao Trinitario du clone ICS 1 semblait être associé à une combinaison équili"brée de teneur relativement élevée d'acidité et de douceur et un arôme d'agrumes modéré de sa pulpe. D'autre part, la pulpe du clone CCN51, potentiellement associée à un arôme léger, a été classée comme très astringente et acide, avec une faible intensité et qualité d'arôme. La pulpe du clone Pandora 1 de Colombie était caractérisée par un arôme de corossol (Guanabana) et pour donc représenter un nouveau type de cacao d'arôme fin intéressant Ces résultats suggèrent qu'une partie significative des caractéristiques aromatiques des produits cacaoyers (en dehors de l'arôme de base du cacao) peuvent être asés à des caractéristiques sensorielles identifiables dans la pulpe des cabosses de cacao mûres. L'effet de l'environnement aromatique de la pulpe sur le goût des chocolats a encore été démontré par des expériences, en ajoutant des quantités égales de pulpe aromatique de deux espèces de fruits tropicaux (Theobroma grandiflorum et Anona muricata) avec les fèves Amelonado pendant le processus de fermentation. Les chocolats obtenus par cette méthode ont révélé la présence des caractéristiques aromatiques typiques de T. grandiflorum et A. muricata. Ceci montre que les composés aromatiques ajoutés sont absorbés par le cotylédon de cacao pendant le processus de fermentation. Un panel d'amateurs à Montpellier, en France, a manifesté une préférence marquée pour les chocolats qui avaient acquis des arômes de T grandiflorum et A. muricata par rapport à ceux du traitement témoin Amelonado pur. Les conclusions combinées constituent: 1) des éléments démontrant clairement qu'une présélection de génotypes de cacaoyers de haute qualité spécifiques peut être faite efficacement par une évaluation sensorielle rapide des pulpes de cacao, 2) les premiers éléments scientifiques publiés démontrant que les arômes du chocolat peuvent être modifiés de façon significative en ajoutant des substances aromatiques aux fèves de cacao pendant le processus de fermentation; La poursuite du développement de cette méthode innovante de production de liqueurs de cacao et de chocolats avec des profils aromatiques améliorés et/ou modifiés devrait avoir des applications commerciales importantes. Elle offrirait aussi de nouvelles opportunités p

Published
2012

13. Immunogenomic identification and characterization of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in multiple myeloma

Author

Perez C., Botta C., Zabaleta A., Puig N., Cedena M. -T., Goicoechea I., Alameda D., Jose-Eneriz E. S., Merino J., Rodriguez-Otero P., Maia C., Alignani D., Maiso P., Manrique I., Lara-Astiaso D., Vilas-Zornoza A., Sarvide S., Riillo C., Rossi M., Rosinol L., Oriol A., Blanchard M. -J., Rios R., Sureda A., Martin J., Martinez R., Bargay J., de la Rubia J., Hernandez M. -T., Martinez-Lopez J., Orfao A., Agirre X., Prosper F., Mateos M. -V., Lahuerta J. -J., Blade J., San-Miguel J. F., Paiva B., Espinosa M. C., Zamudio J. L. G., Herranz E. R., Tamayo R. R., Sanchez J. M., Bernal L. P., Rodriguez A. P. G., Garcia M. E. G., Mayol A. S., Lleonart J. B., Suarez A., Garcia M. T. H., Gaisan C. M., Ruiz B. H., Montero F. C., de Miguel Llorente D., Ramos F. S., Garcia A. I., Manteca M. M., Martin J. M. H., Barrigon F. E., Frade J. G., de Coca A. G., Franco C. A., Gomez J. L., Perez E. C., Creixenti J. B., Balari A. M. S., Montes Y. G., Teigell L. E., Guinon A. G., Monreal E. A., Campos J. A. S., Tutusaus J. M. M., Rocafiguera A. O., Gorrochategui M. G., Mesa M. G., Silva C. C., Perez M. S. G., Loureiro A. D., Sanchez J. A. M., Irazu M. J. N., Parraga F. J. P., Palacios J. J. L., Barahona P. B., Rodriguez C. E., Rivas J. A. H., de Oteyza J. P., del Barrio R. I., de la Guia A. L., Amor A. A., Pareja E. P., Castello I. K., Rodriguez M. J. B., Martinez R. M., Grau R. R., Mesa E. G., Sainz E. R., de Arriba F., Jimenez J. M. M., Romera M., Cardoso F. P., Perez J. M. A., Pomposo M. P., Persona E. P., Casasus A. I. T., Garcia P. R., Ramos I. J., Lor M. B. V., Garcia P. L. F., Chamorro C. M., Perez C., Botta C., Zabaleta A., Puig N., Cedena M.-T., Goicoechea I., Alameda D., Jose-Eneriz E.S., Merino J., Rodriguez-Otero P., Maia C., Alignani D., Maiso P., Manrique I., Lara-Astiaso D., Vilas-Zornoza A., Sarvide S., Riillo C., Rossi M., Rosinol L., Oriol A., Blanchard M.-J., Rios R., Sureda A., Martin J., Martinez R., Bargay J., de la Rubia J., Hernandez M.-T., Martinez-Lopez J., Orfao A., Agirre X., Prosper F., Mateos M.-V., Lahuerta J.-J., Blade J., San-Miguel J.F., Paiva B., Espinosa M.C., Zamudio J.L.G., Herranz E.R., Tamayo R.R., Sanchez J.M., Bernal L.P., Rodriguez A.P.G., Garcia M.E.G., Mayol A.S., Lleonart J.B., Suarez A., Garcia M.T.H., Gaisan C.M., Ruiz B.H., Montero F.C., de Miguel Llorente D., Ramos F.S., Garcia A.I., Manteca M.M., Martin J.M.H., Barrigon F.E., Frade J.G., de Coca A.G., Franco C.A., Gomez J.L., Perez E.C., Creixenti J.B., Balari A.M.S., Montes Y.G., Teigell L.E., Guinon A.G., Monreal E.A., Campos J.A.S., Tutusaus J.M.M., Rocafiguera A.O., Gorrochategui M.G., Mesa M.G., Silva C.C., Perez M.S.G., Loureiro A.D., Sanchez J.A.M., Irazu M.J.N., Parraga F.J.P., Palacios J.J.L., Barahona P.B., Rodriguez C.E., Rivas J.A.H., de Oteyza J.P., del Barrio R.I., de la Guia A.L., Amor A.A., Pareja E.P., Castello I.K., Rodriguez M.J.B., Martinez R.M., Grau R.R., Mesa E.G., Sainz E.R., de Arriba F., Jimenez J.M.M., Romera M., Cardoso F.P., Perez J.M.A., Pomposo M.P., Persona E.P., Casasus A.I.T., Garcia P.R., Ramos I.J., Lor M.B.V., Garcia P.L.F., and Chamorro C.M.

Subjects
Male, Transcription, Genetic, Neutrophils, T-Lymphocytes, Immunology, CD33, Biology, CD16, Biochemistry, Follow-Up Studie, Flow cytometry, Antigens, CD, medicine, Humans, Cytotoxic T cell, Lymphocyte Count, Tumor microenvironment, medicine.diagnostic_test, Myeloid-Derived Suppressor Cells, Cell Biology, Hematology, Middle Aged, Cell sorting, Neoplasm Proteins, medicine.anatomical_structure, T-Lymphocyte, Cancer research, Myeloid-derived Suppressor Cell, Female, Bone marrow, Multiple Myeloma, Human, Follow-Up Studies
Abstract

Granulocytic myeloid-derived suppressor cells (G-MDSCs) promote tumor growth and immunosuppression in multiple myeloma (MM). However, their phenotype is not well established for accurate monitoring or clinical translation. We aimed to provide the phenotypic profile of G-MDSCs based on their prognostic significance in MM, immunosuppressive potential, and molecular program. The preestablished phenotype of G-MDSCs was evaluated in bone marrow samples from controls and MM patients using multidimensional flow cytometry; surprisingly, we found that CD11b+CD14−CD15+CD33+HLADR− cells overlapped with common eosinophils and neutrophils, which were not expanded in MM patients. Therefore, we relied on automated clustering to unbiasedly identify all granulocytic subsets in the tumor microenvironment: basophils, eosinophils, and immature, intermediate, and mature neutrophils. In a series of 267 newly diagnosed MM patients (GEM2012MENOS65 trial), only the frequency of mature neutrophils at diagnosis was significantly associated with patient outcome, and a high mature neutrophil/T-cell ratio resulted in inferior progression-free survival (P < .001). Upon fluorescence-activated cell sorting of each neutrophil subset, T-cell proliferation decreased in the presence of mature neutrophils (0.5-fold; P = .016), and the cytotoxic potential of T cells engaged by a BCMA×CD3-bispecific antibody increased notably with the depletion of mature neutrophils (fourfold; P = .0007). Most interestingly, RNA sequencing of the 3 subsets revealed that G-MDSC–related genes were specifically upregulated in mature neutrophils from MM patients vs controls because of differential chromatin accessibility. Taken together, our results establish a correlation between the clinical significance, immunosuppressive potential, and transcriptional network of well-defined neutrophil subsets, providing for the first time a set of optimal markers (CD11b/CD13/CD16) for accurate monitoring of G-MDSCs in MM.

Published
2020

Catalog

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