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Air quality can be altered by fungal contaminants suspended in the air, forming bioaerosols. Aspergilli section Nidulantes series Versicolores are recurrent in bioaerosols and are mainly responsible for allergies and asthma aggravation. Phylogenetic studies recently identified 12 new species within this series. This study is the first to identify species of Aspergillus series Versicolores in French bioaerosols and to characterize them macroscopically, microscopically and molecularly. Bioaerosols were collected in a cancer treatment center, in contaminated homes and in agricultural environments. A total of 93 isolates were cultured on selective media, observed by optical microscopy and identified by benA amplification before sequencing. The field data (temperature and relative humidity) were statistically tested to explore the ecology of these species. Eight species were identified from bioaerosols: Aspergillus creber and A. jensenii, which represent more than 80% of the isolates, and A. protuberus, A. puulaauensis, A. sydowii, A. tabacinus, A. amoenus and A. fructus. Aspergilli series Versicolores are distributed differently depending on the sampling site and climatic determinants. Aspergillus protuberus was found in bioaerosols collected under significantly lower relative humidity (p = 3.899 × 10−4). Characterization and repartition of these isolates belonging to the Versicolores series constitute an important step to better assess exposure to fungal bioaerosols.

International audience

International audience

National audience; Introduction et objectifs :Les souches de Pseudomonas aeruginosa (Pyo) proche de la toto-résistance aux antibiotiques sont en augmentation. Pyo tend également à acquérir des résistances aux ammoniums quaternaires (CDMA) utilisés dans les détergents/désinfectants usuels. Cette problématique est autant retrouvée en médecine vétérinaire et humaine. Les objectifs sont ici, sur 10 souches de Pyo hospitalière (5) et équine (5), de déterminer leur niveau de résistance aux antibiotiques et au CDMA, d’étudier leur formation de biofilm et de déterminer leurs supports génétiques associés.Matériels et méthodes :Les profils de résistance à 6 familles d’antibiotiques et les concentrations minimales inhibitrices (CMI) vis-à-vis du CDMA ont été déterminés selon les recommandations du CA-SFM. Le biofilm formé a été caractérisé en « statique » par impédancemétrie couplée à la microscopie 3D et en « dynamique » par microfluidique. Enfin, le séquençage complet des génomes, une approche transcriptomique et des essais de conjugaison ont été réalisés pour tenter d’identifier les supports génétiques de la résistance au CDMA.Résultats, discussion et conclusion :Les profils de résistances aux antibiotiques sont variés. Les CMI au CDMA les plus élevées (128mg/L) retrouvées pour la moitié des souches (2 cliniques et 3 équines) ne sont pas corrélées à un profil type de résistance aux antibiotiques. Le résistome obtenu explique la résistance à toutes les classes antibiotiques retrouvées. Le gène de la carbapénémase de type VIM-2, de support plasmidique, est retrouvé exclusivement sur les souches cliniques. La pompe RND (Résistance-Nodulation-Division) MexA/B-OprM est surexprimée pour les souches résistantes au CDMA, et plusieurs de ses régulateurs présentent des altérations chromosomiques (substitutions ou délétions sur rocS2 et mexR). Concernant la formation de biofilm associée aux souches étudiées, les mesures d’impédancemétrie et en microfluidique ont mis en évidence plusieurs profils de production distincts. Cependant, ces profils semblent ne pas être corrélés aux profils de résistance aux antibiotiques et/ou au CDMA. La résistance aux biocides et antibiotiques s’accumule chez Pyo. Ces molécules très utilisées tant en filière animale qu’en clinique humaine aboutissent à des impasses qui nécessitent une meilleure connaissance des mécanismes et l’évaluation d’autres biocides.Mots clés : P. aeruginosa – antibiorésistance - ammonium quaternaire – biofilm - pompe RND.

National audience; INTRODUCTION/OBJECTIF DU TRAVAILUn nombre de 65 cas cliniques à Pseudomonas aeruginosa producteurs de carbapènémases de type VIM-2 (pyoVIM2) ont été notifiées dans notre établissement entre 2011 et 2018, et ce, malgré les précautions prises (dépistage des patients, isolement contact et procédure spécifique d’entretien des locaux). Cela nous a amené à évaluer l’activité bactéricide des détergents-désinfectants (DD) utilisés dans notre établissement sur des souches Pseudomonas de notre écologie hospitalière.MATÉRIEL & MÉTHODESLa détermination de l’activité bactéricide de sept DD de surfaces a été effectuée sur 12 souches de Pseudomonas :- deux souches de référence (PAO1 et ATCC15442)- trois souches de pyoVIM2 cliniques ou environnementales en 2018- Six souches de Pseudomonas autre que aeruginosa et productrices de VIM-2 (putida, oleovorans, nitroreducens, monteilii, pleicoglossicida)- Deux transconjugants (TC) obtenus par conjugaison, en utilisant une souche donneuse de plasmide VIM-2 et la souche receveuse PAO1. - L’activité bactéricide in vitro a été évaluée selon le protocole de filtration sur membrane en conditions de propreté (NF EN 13727 + A2). Par ailleurs, 5 souches parmi elles ont été séquencées en génome entier afin d’étudier le contenu en gènes de résistance aux biocides (antibiotiques et ammonium quaternaire).RÉSULTATSSix DD sur sept présentent une activité bactéricide aux dilutions d’usage préconisées par le fabricant sur ces souches. Un seul DD ayant la particularité de ne contenir qu’un seul ammonium quaternaire ne retrouve son activité bactéricide qu’à double dose sur les souches pyoVIM2 (souches cliniques, environnementales et TC). Après analyse des génomes, il a été mis en évidence la co-localisation plasmidique de gènes de résistance à de nombreuses classes antibiotiques (béta-lactamines incluant les carbapénèmes, les aminosides et les fluoroquinolones) ainsi que du gène qacEdelta connu pour conférer la résistance aux ammoniums quaternaires.CONCLUSIONL’utilisation de ce protocole a permis de révéler une sensibilité diminuée à un DD largement utilisé pour l’entretien des locaux dans les établissements de santé en France. Ce constat nous a fait préconiser l’utilisation de ce DD à double dose pour l’entretien des surfaces dans les services où circulait le pyoVIM-2. L’acquisition de cette résistance semble liée à celle du plasmide VIM-2. Nous allons poursuivre la compréhension du mécanisme de la résistance aux biocides et étendre l’étude de sensibilité à d’autres bactéries multi-résistantes aux antibiotiques.

International audience; Background: Inonotus obliquus, also known as Chaga, is a parasitic fungus growing on birches and used in traditional medicine (especially by Khanty people) to treat various health problems. In this study, we aimed to quantify the 3 metabolites frequently cited in literature, that is, betulin, betulinic acid, and inotodiol in the Chaga recently discovered in forests located in Normandy (France), and to compare their concentrations with Ukrainian and Canadian Chaga. This study also explores the cytotoxicity of the French Chaga against cancer-derived cells and transformed cells.Methods: A quantification method by HPLC-MS-MS (high-performance liquid chromatography–tandem mass spectrometry) of betulin, betulinic acid, and inotodiol was developed to study the French Chaga and compare the concentration of these metabolites with extracts provided from Chaga growing in Canada and Ukraine. This method was also used to identify and quantify those 3 compounds in other traditional preparations of Chaga (aqueous extract, infusion, and decoction). Among these preparations, the aqueous extract that contains betulin, betulinic acid, and inotodiol was chosen to evaluate and compare its cytotoxic activity toward human lung adenocarcinoma cells (A549 line) and human bronchial epithelial cells (BEAS-2B line).Results: French Chaga contains betulin and betulinic acid at higher levels than in other Chaga, whereas the concentration of inotodiol is greater in the Canadian Chaga. Moreover, the results highlighted a cytotoxic activity of the Chaga’s aqueous extract after 48 and 72 hours of exposure with a higher effect on cancer-derived cells A549 than on normal transformed cells BEAS-2B (P = 0.025 after 48 hours of exposure and P = 0.004 after 72 hours of exposure).