Search

Wheat is the most important foodproduct in the world and has been cultivated as an essential product sincehuman settlement. Endemic wheat genotypes may have different source genes interms of resistance to diseases. However, many farmers cultivate modernvarieties resulting from national and international breeding program. Previousstudies have demonstrated that some of these varieties are not resistant to oneor more diseases. Therefore, a rich variety program is an attempt to make an assessmentthe potential donor of local and exotic varieties of wheat. In this study,yellow rust resistance of Tir wheat has been studied at the molecular levelwhich is a local genotype frequently cultivated in Van Lake Basin in Turkey. Asa simple and practical approach, R55 (6AL / 6VS) translocation line thatcontains yellow rust resistance gene Yr-26 and Near Isogenic Lines which havingknown the disease resistance genes Yr-1, Yr-7, Yr-3 and Yr-4 were examinedusing the SSR markers identified by Gatersleben Wheat Microsatellite (Xgwm) andBeltsville Agricultural Research (Xbarc) which is known to be associated withYR resistance genes and closely related to the respective gene regions on thechromosome. Observed rust, surveying was determined as medium sensitive"MS" according to the Cobb scale value. Totally 212 polymorphic bandsobtained from the using SSR primers and the mean number of the polymorphic bandfound as 5.2 for each primer and the polymorphic information content of theevaluated primers varied between 0.37 and 0.41. The local Tir genotypes havefound to be closely related to genotypes known having the yr-2 and yr-3b, 4bresistance genes, Buğday, dünyadaki en önemli besin ürünüdür ve insanyerleşiminden bu yana önemli bir ürün olarak yetiştirilmektedir. Endemik buğdaygenotipleri, hastalıklara karşı direnç açısından farklı kaynak genlerine sahipolabilirler. Bununla birlikte, birçok çiftçi ulusal ve uluslararası ıslahprogramlarından çıkan modern çeşitleri yetiştirmektedir. Önceki çalışmalar, buçeşitlerin bazılarının bir veya daha fazla hastalığa karşı direncininolmadığını göstermiştir. Bu nedenle, çeşit zenginliği programı yerel ve egzotikbuğday çeşitlerinin potansiyel donör ebeveynleri olarak değerlendirilmesineyönelik bir girişimdir. Bu çalışma için Türkiye’de Van ve çevresinde sıklıklayetiştiriciliği yapılan lokal bir genotip olan Tir Buğdayının sarı pas direncimoleküler düzeyde incelenmiştir. Basit ve pratik bir yaklaşım olarak Xgwm (Gatersleben wheatmicrosatellite) ve Xbarc (Beltsville agricultural research) tarafındanbelirlenmiş YRdirenç genleri ile bağlantılı olduğu bilinen ve kromozom üzerindeki ilgili genbölgeleri ile yakın ilişkili olan SSR markerleri ile hastalık direnç genlerinesahip sarı pasa dayanıklılık geni Yr-26’yı barındırdığı bilinen R55 (6AL/6VS)translokasyon hattı ile Yr-1, Yr-7, Yr-3a ve Yr-4a dayanıklılık genlerinitaşıdığı bilinen yakın izogenik hatlar bakımından incelenmiştir. Gözlenen pasokumaları sonucu Cobb skala değeri “MS” orta duyarlı olarak belirlenmiştir.Kullanılan SSR primerleri toplam 212 polimorfik bant vermiş ve Ortalamapolimorfik bant sayısı primer başına 5.2 olurken, değerlendirmeye alınmış primerlerinpolimorfik bilgi içerikleri ise 0.37 ile 0.41 arasında değişiklik göstermiştir.Lokal Tir genotipinin Yr-2 ve Yr-3b,4b dayanıklılık genlerini barındırdığıbilinen genotiplerle yakın ilgisi olduğu belirlenmiştir.

Wheat in grain, is a foodsource with high strategic importance and it was cultured since ancient times.Since the increase of population in the world, it was necessary in order to increase the yield per unit area. Increasing yield per unit area ofwheat, can be achievable by various breeding methods. Knowing the geneticsimilarities - differences of plant genetic resources are very important forbreeding. In recent years, molecular marker methods are often preferred inwheats. This study was aimed to molecular characterization of 23 bread wheatvarieties which collected from different regions of Turkey using capillaryelectrophoretic method for 32 SSR primers. As a result of molecular markeranalysis the genetic similarities and differences between the varieties arerevealed at the molecular level. In addition, this study emphasizes once againthe importance and necessity of using molecular markers for breeding studies., Tahıllar içerisindebuğday, ilk çağlardan beri kültürü yapılan ve stratejik önemi yüksek olan birbesin kaynağıdır. Nüfusun artmasıyla birlikte birim alandan alınan verimiarttırma ihtiyacı doğmuştur. Buğdayda birim alandan alınan verimi arttırmakçeşitli ıslah yöntemleri ile mümkün olabilir. Gen kaynaklarının genetikbenzerlik-farklılıklarının bilinmesi bitki ıslahı açısından oldukçaönemlidir. Son yıllarda buğdayda yapılan çalışmalarda moleküler markör yöntemlerisıklıkla tercih edilmektedir. Bu çalışmada, Türkiye’nin farklıbölgelerinden toplanan 23 adet ekmeklik buğday çeşidinin molekülerkarakterizasyonunun belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla 32 adetSSR primeri kullanılarak spesifik DNA bölgelerinin çoğaltılması sağlanmışve kapillar yöntemle elektroforez işlemini gerçekleştirilmiştir.Yapılan moleküler markör analizi sonucunda çeşitler arasındaki genetikbenzerlik ve farklılıklar moleküler düzeyde ortaya konmuştur. Ayrıca buçalışmayla moleküler markör kullanımının ıslah çalışmaları için önemi vegerekliliği bir kez daha vurgulanmıştır.

B u çalışmada amaç, sarı pasa dayanıklı ve duyarlı bazı ekmeklik buğday genotipleri arasında pasa dayanıklılık açısından DNA düzeyinde SSR markörleri yardımıyla genetik analizlerin incelenmesidir. Sarı pasa dayanıklı ve duyarlı olan bu genotiplerin arasındaki genetik ilişki SSR (Simple Sequence Repeat) markörlerinin kullanılması ile incelenerek belirlenmeye çalışılmıştır. Araştırmada sarı pasa duyarlı yerli çeşit ile dayanıklılık geni barındıran yakın izogenik test hattı melezlenmiş, ebeveynler ile bunların F1 ve F2 dölleri üzerinde SSR moleküler markörleri kullanılarak genetik analizleri yapılmıştır. Çalışmanın SSR analizleri forward ve reverse olmak üzere 5 SSR primeri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Yapılan moleküler markör analizi sonucunda sarı pasa duyarlı yerli çeşit ile tek gen dayanıklı hat arasındaki genetik benzerlik ve farklılıklar moleküler düzeyde ortaya konmuştur. Ayrıca bu çalışmayla moleküler markör kullanımının dayanıklılık ıslahındaki önemi ve gerekliliği birkez daha vurgulanmıştır

E ge Bölgesi’nde verim yönünden ön plana çıkan dört makarnalık buğday çeşidi ile uzun yıllar yapılan denemeler sonucu ümitvar görülen CIMMYT kökenli üç introdüksiyon hattında, moleküler markör yöntemlerinden RAPD metodu ile söz konusu genotipler arasında genetik olarak benzerliklerin ve farklılıkların incelenmesi bu çalışmanın amacını oluşturmuştur. Yapılan DNA analizleri sonucunda, çalışmada incelenen çeşit ve hatların genetik olarak birbirine yakın olduğu ve bunlara ait ortalama genetik benzerlik oranının 0.86 olduğu saptanmıştır. Ayrıca Ege-88 ile Yavaros-79 çeşitlerinin birbirlerine en yakın genotipler olduğu anlaşılmıştır

Hypericum perforatum L. is a pharmaceutically important medicinal plant with antidepressant, antiviral, antibacterial and anticancer effects of its metabolites. The hypericin contents and genetic structures of superior H. perforatum clones were identified by spectrophotometric analysis and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, respectively. At the first harvest the hypericin content of the clones was higher than second harvest and higher in 2007 compared to 2008. For initial screening, 38 random primers were used and 26 of them detected a total of 378 scorable fragments. Effective multiplex ratio (EMR), average heterozygosity (H-av), marker index (MI), resolving power (RP) and polymorphic information content (PIC) of the primers were calculated for RAPD marker system. Genetic similarity value among the clones varied from 0.40 to 0.93 and the average genetic similarity values was determined as 0.60. Clustering based on RAPD data showed a partial relationship on a regional basis in the clones. Cluster analyses of hypericin contents and RAPD markers grouped the clones in two major clusters and significant correlations were observed between them. In conclusion, combined analysis of RAPD markers and hypericin content is an optimal approach for further progress and breeding programs. (C) 2011 Friends Science Publishers

Tahıllar dünyada kültürü yapılan bitkiler içersinde en fazla ekimalanına ve üretime sahiptir. İnsan ve hayvanlar tarafından tüketilen yıllıkprotein miktarının oldukça büyük bir kısmı tahıllar tarafındankarşılanmaktadır ve tahıllar içersinde buğday, oldukça önemli bir besinkaynağı olarak tüketilen proteinin de büyük bir kısmını karşılamaktadır.Tarımsal üretimde verimi arttıran çevre faktörleri çoğu zaman ona zararveren mikroorganizmaların da gelişmesi için uygun koşulları sağlamaktadır.Bu nedenle verimi ve ürünün kalitesini yükseltmek için bumikroorganizmaların yol açtığı hastalıklarla mücadele etmek zorunludur.Bu çalışmada amaç, sarı pasa dayanıklı ve duyarlı bazı ekmeklikbuğday genotipleri arasında pasa dayanıklılık açısından DNA düzeyindegenetik farklılıkların ve benzerliklerin araştırılarak genetik uzaklığınsaptanmasıdır. Sarı pasa dayanıklı ve duyarlı olan bu genotiplerinarasındaki genetik ilişki SSR (Simple sequence repeat) ve RAPD (RandomAmplified Polymorphic DNA) markörlerinin kullanılması ile incelenerekbelirlenmeye çalışılmıştır.Araştırmada sarı pasa duyarlı üç yerli çeşit ile üç dayanıklı tek gen hatmelezlenmiş, ebeveynler ile bunların F1 ve F2 dölleri üzerinde RAPD veSSR moleküler markörleri kullanılarak genetik analizleri yapılmıştır.Çalışmanın RAPD analizleri kısmında ebeveynlerde 40 , F1 ve F2 döllerindeise 10 primer kullanılmıştır. .Çalışmanın SSR analizleri ise forward vereverse olmak üzere 5 SSR primeri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Yapılanher iki moleküler markör analizi sonucunda sarı pasa duyarlı çeşitler iledayanıklı hatlar arasındaki genetik benzerlik ve farklılıklar molekülerdüzeyde ortaya konmuştur.Ayrıca bu çalışmayla moleküler markör kullanımının dayanıklılıkıslahındaki önemi ve gerekliliği birkez daha vurgulanmıştır.Anahtar Kelimeler: RAPD markörleri , SSR markörleri, buğday,sarı pas Cereals have greatest planting area and production within the plantsthat are cutivated in the world. An important amount of the yearly proteinneed of humans and animals are supplied by the cereals and among themwheat stands as a resource of food providing protein with the humans.The enviromental factors that increase the efficiency of the agriculturalproduction also provide the proper conditions for the development of themicroorganism that often destructs the wheat. Therefore, in order toincrease the efficiency and the quality of the product, the diseases causedby such microorganisms must be tought.The aim of this study to determine genetic distance and differencessearch at the DNA level according to resistance and susceptible to striperust between some of bread wheat genotyps. The genetic relationshipbetween of resistance and susceptible genotype is going to be worked ondetermine using molecular analysis.In this research project, three susceptible to stripe rust local varietywas crossed with three resistance single gene lines and, genetic analysiswere made using the RAPD and SSR markers on parents with their F1and F2 offsprings. In the part of the RAPD analysis of this study , 40 primerswere used for parents and 10 primers for F1 and F2 offsprings to. on theother hand 5 primers were used to be forward and reverse in the part ofSSR analysis.As a result of either molecular markers analysis were displayeddifferences and similarities between susceptible vareties and resistancelines to stripe rustFurthermore had been to emphasized importance of using molecularmarker thanks to this studyKey Words: RAPD markers, SSR markers, wheat, yellow rust 208