1. Characterization of powdery mildews strains from soybean, bean, sunflower, and weeds in Brazil using rDNA-ITS sequences
- Author
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Silvana Regina Rockenbach Marin, Eliseu Binneck, Fernanda F. Piuga, César Augusto Silveira, Paula R.Z. Ribeiro do Valle, and Álvaro M. R. Almeida
- Subjects
biology ,food and beverages ,Plant Science ,sequencing ,biology.organism_classification ,sequenciamento ,Sonchus oleraceus ,PCR ,Bidens pilosa ,Botany ,Helianthus annuus ,Phaseolus ,Erysiphe ,Agronomy and Crop Science ,Ribosomal DNA ,Powdery mildew ,Podosphaera fusca - Abstract
Soybean powdery mildew (Erysiphe diffusa) was considered a minor disease in Brazil in the decades immediately after its identification. However, since the outbreak in 1996/97 in all cultivated areas the disease has become a constant threat to farmers and losses of up to 25% have been reported. The report of a new species, E. glycines, infecting soybean in Japan, and the occurrence of the disease in other plant species (Phaseolus vulgaris, Helianthus annuus,Sonchus oleraceus,Hypochaeris brasiliensis, and Bidens pilosa) commonly found growing nearby soybean fields, raised questions in relation to the taxonomy of the powdery mildew strains found in or around soybean fields in Brazil. Analysis of the internal transcribed sequence (ITS) of the rDNA was undertaken to ascertain the pathogen species associated to each of the hosts. Powdery mildew strains isolated from Glycine max were identified as E. diffusa. Strains from P. vulgaris were very similar to E. diffusa, with 4 nt differences, and differed from Erysiphe poligony by 11 nt. Strains from H. annuus and S. oleraceus grouped with the species Golovinomyces cichoracearum, while strains from H. brasiliensis and B. pilosa were similar to Podosphaera fusca and Neoerysiphe cumminsiana, respectively. To our knowledge this is the first molecular identification of powdery mildew in Brazil based on rDNA sequence comparison. In addition, this study presented evidence for the occurrence of N. cumminsiana in America. O oídio da soja, causado por Erysiphe diffusa, foi considerado uma doença de menor importância, desde a sua identificação no Brasil. Entretanto, após o surto na safra de 1996/97, em todas as áreas cultivadas, a doença tornou-se uma ameaça constante para os agricultores, com perdas relatadas de até 25%. A identificação de uma nova espécie (E. glycines) no Japão e a ocorrência em outras espécies de plantas comumente encontradas próximas a campos de soja (Phaseolus vulgaris,Helianthus annuus,Sonchus oleraceus,Hypochaeris brasiliensis e Bidens pilosa) levantou questões em relação à taxonomia dos oídios encontrados nas lavouras. Análises moleculares da região espaçadora interna transcrita (ITS) do rDNA foi utilizada para a identificação molecular das espécies presentes em cada planta hospedeira. Oídios isolados de soja (Glycine max) foram identificados como E. diffusa. Isolados de feijão (P. vulgaris) foram similares a E. diffusa, com 4 nt diferentes, e diferiram de E. poligony em 11 nt. Isolados de H. annuus e S. oleraceus agruparam-se com a espécie Golovinomyces cichoracearum, enquanto isolados de H. brasiliensis e B. pilosa foram similares a Podosphaera fusca e Neoerysiphe cumminsiana, respectivamente. Ao nosso conhecimento esta é a primeira identificação molecular de oídios no Brasil, através da comparação de seqüências de rDNA. Esta também é uma evidência da ocorrência de N. cumminsiana na América.
- Published
- 2008