129 results on '"Falentin, Cyril"'
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2. Combined cytogenetic and molecular methods for taxonomic verification and description of Brassica populations deriving from different origins
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Falentin, Cyril, primary, Hadj-Arab, Houria, additional, Aissiou, Fella, additional, Bartoli, Claudia, additional, Bazan, Giuseppe, additional, Boudet, Matéo, additional, Bousset-Vaslin, Lydia, additional, Chwikhi, Marwa, additional, Coriton, Olivier, additional, Deniot, Gwénaelle, additional, Ferreira de Carvalho, Julie, additional, Gay, Laurène, additional, Geraci, Anna, additional, Glory, Pascal, additional, Huteau, Virginie, additional, Ilahy, Riadh, additional, Ilardi, Vincenzo, additional, Jarillo, José A., additional, Meglic, Vladimir, additional, Oddo, Elisabetta, additional, Pernas, Monica, additional, Pineiro, Manuel, additional, Pipan, Barbara, additional, Rhim, Thouraya, additional, Richer, Vincent, additional, Rizza, Fulvia, additional, Ronfort, Joelle, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, Schicchi, Rosario, additional, Sinkovic, Lovro, additional, Taburel, Maryse, additional, Terzi, Valeria, additional, Théréné, Sylvain, additional, Tiret, Mathieu, additional, Tlili, Imen, additional, Wagner, Marie-Hélène, additional, Werner Badeck, Franz, additional, and Chèvre, Anne-Marie, additional
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- 2024
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3. Playing with the ploidy level enables to switch on and off the strict recombination control even in the vicinity ofBrassicacentromeres
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Boideau, Franz, primary, Huteau, Virginie, additional, Brunet, Anael, additional, Maillet, Loeiz, additional, Coriton, Olivier, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Lodé-Taburel, Maryse, additional, Deniot, Gwenaelle, additional, Eber, Frédérique, additional, Gilet, Marie, additional, Boutte, Julien, additional, Morice, Jérôme, additional, Falentin, Cyril, additional, Martin, Olivier, additional, Falque, Matthieu, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, and Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional
- Published
- 2024
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4. Genetic diversity in Mediterranean Brassica vegetables: seed phenotyping could be useful for sustainable crop production
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European Commission, Wagner, Marie Hélène [0000-0001-6224-5271], Badeck, Franz Werner [0000-0001-7821-8825], Deniot, Gwenaëlle [0009-0004-1196-3256], Ducournau, Sylvie [0000-0002-8515-7730], Dupont, Audrey [0000-0002-0993-7209], Falentin, Cyril [0000-0002-9901-3412], Gay, Laurene [0000-0002-9861-8188], Geraci, Anna [0000-0002-4860-487X], Hadj-Arab, Houria [0009-0005-7352-7553], Jarillo, José Antonio [0000-0002-2963-7641], Meglic, Vladimir [0000-0002-7739-0145], Morcia, Caterina [0000-0001-5316-7435], Pipan, Barbara [0000-0002-3860-119X], Sinkovič, Lovro [0000-0002-6123-8085], Oddo, Elisabetta [0000-0003-1548-2551], Pernas Ochoa, Mónica [0000-0002-6521-9164], Piñeiro, Manuel [0000-0002-4640-6511], Richer, Vincent [0000-0002-3115-1173], Rizza, Fulvia [0000-0003-2933-5480], Ronfort, Jöelle [0000-0002-1011-308X], Schicchi, Rosario [0000-0001-8295-3670], Terzi, Valeria [0000-0002-8006-6805], Chèvre, Anne Marie [0000-0001-5312-032X], Wagner, Marie Hélène, Aïsiou, F., Badeck, Franz Werner, Deniot, Gwenaëlle, Ducournau, Sylvie, Dupont, Audrey, Falentin, Cyril, Gay, Laurene, Geraci, Anna, Glory, Pascal, Hadj-Arab, Houria, Jarillo, José Antonio, Meglic, Vladimir, Morcia, Caterina, Pipan, Barbara, Sinkovič, Lovro, Oddo, Elisabetta, Pernas Ochoa, Mónica, Piñeiro, Manuel, Richer, Vincent, Rizza, Fulvia, Ronfort, Jöelle, Schicchi, Rosario, Terzi, Valeria, Chèvre, Anne Marie, European Commission, Wagner, Marie Hélène [0000-0001-6224-5271], Badeck, Franz Werner [0000-0001-7821-8825], Deniot, Gwenaëlle [0009-0004-1196-3256], Ducournau, Sylvie [0000-0002-8515-7730], Dupont, Audrey [0000-0002-0993-7209], Falentin, Cyril [0000-0002-9901-3412], Gay, Laurene [0000-0002-9861-8188], Geraci, Anna [0000-0002-4860-487X], Hadj-Arab, Houria [0009-0005-7352-7553], Jarillo, José Antonio [0000-0002-2963-7641], Meglic, Vladimir [0000-0002-7739-0145], Morcia, Caterina [0000-0001-5316-7435], Pipan, Barbara [0000-0002-3860-119X], Sinkovič, Lovro [0000-0002-6123-8085], Oddo, Elisabetta [0000-0003-1548-2551], Pernas Ochoa, Mónica [0000-0002-6521-9164], Piñeiro, Manuel [0000-0002-4640-6511], Richer, Vincent [0000-0002-3115-1173], Rizza, Fulvia [0000-0003-2933-5480], Ronfort, Jöelle [0000-0002-1011-308X], Schicchi, Rosario [0000-0001-8295-3670], Terzi, Valeria [0000-0002-8006-6805], Chèvre, Anne Marie [0000-0001-5312-032X], Wagner, Marie Hélène, Aïsiou, F., Badeck, Franz Werner, Deniot, Gwenaëlle, Ducournau, Sylvie, Dupont, Audrey, Falentin, Cyril, Gay, Laurene, Geraci, Anna, Glory, Pascal, Hadj-Arab, Houria, Jarillo, José Antonio, Meglic, Vladimir, Morcia, Caterina, Pipan, Barbara, Sinkovič, Lovro, Oddo, Elisabetta, Pernas Ochoa, Mónica, Piñeiro, Manuel, Richer, Vincent, Rizza, Fulvia, Ronfort, Jöelle, Schicchi, Rosario, Terzi, Valeria, and Chèvre, Anne Marie
- Abstract
The European BrasExplor project aims to explore the genetic diversity present in two economically important Brassica crop species, Brassica oleracea and B. rapa, for sustainable crop production. This diversity is present in wild populations but also in cultivated landraces and has been shaped by contrasting environments. An international consortium of 11 partners has begun to collect and multiply wild populations extending from the French North Atlantic coast to the southern Algerian desert as well as local cultivars from 6 contributing countries in order to characterize the genetic diversity available over a wide soil-climate gradient. A total of 100 populations has been obtained for each species. Identifying the genetic variation and understanding the basis for it will allow the development of breeding strategies for a better adaptation of turnip (Brassica rapa) and cabbage (Brassica oleracea var. capitata) to climate change. One third of the collection has been already phenotyped for its germination traits of native seeds harvested in 2020 for wild populations or of local landraces provided by farmers and seed banks. In favourable conditions, a high diversity in germination capacity and germination rate was observed independently of seed age. The two species have a different germination profile: some turnip seeds can stand higher temperature and lower water potential than most cabbage seeds. Variation in flowering time has also been documented in these plants.
- Published
- 2023
5. Plant genetic bases explaining microbiota diversity shed light into a novel holobiont generalist gene theory
- Author
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Maillet, Loeiz, primary, Norest, Manon, additional, Kautsky, Adam, additional, Geraci, Anna, additional, Oddo, Elisabetta, additional, Troia, Angelo, additional, GUILLERM-ERCKELBOUDT, Anne-Yvonne, additional, Falentin, Cyril, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, Chevre, Anne-Marie, additional, Istace, Benjamin, additional, Cruaud, Corinne, additional, Belser, Caroline, additional, Aury, Jean-Marc, additional, Schicchi, Rosario, additional, Frachon, Lea, additional, and Bartoli, Claudia, additional
- Published
- 2023
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6. Warnings/Cautions when collecting Brassica diversity along a large climatic gradient
- Author
-
Falentin, Cyril, primary, Hadj-Arab, Houria, additional, Aissiou, Fella, additional, Bartoli, Claudia, additional, Bazan, Giuseppe, additional, Boudet, Mateo, additional, Bousset-Vaslin, Lydia, additional, Chwikhi, Marwa, additional, Coriton, Olivier, additional, Deniot, Gwenaelle, additional, Ferreira de Carvalho, Julie, additional, Gay, Laurene, additional, Geraci, Anna, additional, Glory, Pascal, additional, Huteau, Virginie, additional, Ilahy, Riadh, additional, Ilardi, Vicenzo, additional, Jarillo, Jose A., additional, Meglic, Vladimir, additional, Oddo, Elisabetta, additional, Pernas, Monica, additional, Manuel, Pineiro, additional, Pipan, Barbara, additional, Rhim, Thouraya, additional, Richer, Vincent, additional, Rizza, Fulvia, additional, Ronfort, Joelle, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, Schicchi, Rosario, additional, Sinkovic, Lovro, additional, Taburel, Maryse, additional, Terzi, Valeria, additional, Therene, Sylvain, additional, Tiret, Mathieu, additional, Tlili, Imen, additional, Werner Badeck, Franz, additional, and Chevre, Anne-Marie, additional
- Published
- 2023
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7. Chromosome-scale assemblies of plant genomes using nanopore long reads and optical maps
- Author
-
Belser, Caroline, Istace, Benjamin, Denis, Erwan, Dubarry, Marion, Baurens, Franc-Christophe, Falentin, Cyril, Genete, Mathieu, Berrabah, Wahiba, Chèvre, Anne-Marie, Delourme, Régine, Deniot, Gwenaëlle, Denoeud, France, Duffé, Philippe, Engelen, Stefan, Lemainque, Arnaud, Manzanares-Dauleux, Maria, Martin, Guillaume, Morice, Jérôme, Noel, Benjamin, Vekemans, Xavier, D’Hont, Angélique, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Barbe, Valérie, Cruaud, Corinne, Wincker, Patrick, and Aury, Jean-Marc
- Published
- 2018
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8. Multi-year linkage and association mapping confirm the high number of genomic regions involved in oilseed rape quantitative resistance to blackleg
- Author
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Kumar, Vinod, Paillard, Sophie, Fopa-Fomeju, Berline, Falentin, Cyril, Deniot, Gwenaëlle, Baron, Cécile, Vallée, Patrick, Manzanares-Dauleux, Maria J., and Delourme, Régine
- Published
- 2018
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9. Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome
- Author
-
Chalhoub, Boulos, Denoeud, France, Liu, Shengyi, Parkin, Isobel A. P., Tang, Haibao, Wang, Xiyin, Chiquet, Julien, Belcram, Harry, Tong, Chaobo, Samans, Birgit, Corréa, Margot, Da Silva, Corinne, Just, Jérémy, Falentin, Cyril, Koh, Chu Shin, Le Clainche, Isabelle, Bernard, Maria, Bento, Pascal, Noel, Benjamin, Labadie, Karine, Alberti, Adriana, Charles, Mathieu, Arnaud, Dominique, Guo, Hui, Daviaud, Christian, Alamery, Salman, Jabbari, Kamel, Zhao, Meixia, Edger, Patrick P., Chelaifa, Houda, Tack, David, Lassalle, Gilles, Mestiri, Imen, Schnel, Nicolas, Le Paslier, Marie-Christine, Fan, Guangyi, Renault, Victor, Bayer, Philippe E., Golicz, Agnieszka A., Manoli, Sahana, Lee, Tae-Ho, Thi, Vinh Ha Dinh, Chalabi, Smahane, Hu, Qiong, Fan, Chuchuan, Tollenaere, Reece, Lu, Yunhai, Battail, Christophe, Shen, Jinxiong, Sidebottom, Christine H. D., Wang, Xinfa, Canaguier, Aurélie, Chauveau, Aurélie, Bérard, Aurélie, Deniot, Gwenaëlle, Guan, Mei, Liu, Zhongsong, Sun, Fengming, Lim, Yong Pyo, Lyons, Eric, Town, Christopher D., Bancroft, Ian, Wang, Xiaowu, Meng, Jinling, Ma, Jianxin, Pires, J. Chris, King, Graham J., Brunel, Dominique, Delourme, Régine, Renard, Michel, Aury, Jean-Marc, Adams, Keith L., Batley, Jacqueline, Snowdon, Rod J., Tost, Jorg, Edwards, David, Zhou, Yongming, Hua, Wei, Sharpe, Andrew G., Paterson, Andrew H., Guan, Chunyun, and Wincker, Patrick
- Published
- 2014
10. A Dominant Point Mutation in a RINGv E3 Ubiquitin Ligase Homoeologous Gene Leads to Cleistogamy in Brassica napus
- Author
-
Lu, Yun-Hai, Arnaud, Dominique, Belcram, Harry, Falentin, Cyril, Rouault, Patricia, Piel, Nathalie, Lucas, Marie-Odile, Just, Jérémy, Renard, Michel, Delourme, Régine, and Chalhoub, Boulos
- Published
- 2012
11. Projet BrasExplor : élargir les ressources génétiques du CRB BrACySol pour Brassica oleracea et Brassica rapa
- Author
-
FALENTIN, Cyril, RICHER, Vincent, GLORY, Pascal, DENIOT, Gwenaëlle, FERREIRA DE CARVALHO, Julie, BARTOLI-KAUTSKY, Claudia, GUILLERM-ERCKELBOUDT, Anne-Yvonne, Sylvain THÉRÉNÉ, DORÉ, Stéphane, GILET, Marie, ROUSSEAU-GUEUTIN, Mathieu, GAY, Laurène, CHÈVRE, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM)
- Subjects
navets ,[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,navettes ,contraintes climatiques ,Choux ,contrôle génétique ,diversité - Abstract
National audience; Plusieurs espèces de Brassica sont conservées au sein du Centre de Ressources Biologique BrACySol à Ploudaniel (https://www6.rennes.inrae.fr/igepp/L-IGEPP/Plateformes/BrACySol). Pour le chou (Brassica oleracea, CC,2n=18) et le navet (Brassica rapa, AA, 2n=20), les ressources comprennent essentiellement des populations fermières collectées dans les années 1980. Ces deux espèces existent cependant sous forme de populations sauvages ou férales sur l’ensemble du territoire français, et leurs collectes s’avèrent indispensables pour élargir les ressources disponibles. Dans le cadre du projet H2020 Prima BrasExplor comprenant 11 partenaires de six pays, nous proposons de collecter environ 100 populations sauvages et fermières de chacune de ces deux espèces, sur un gradient nord de la France jusqu’à la zone subsaharienne d’Afrique du Nord. Ce matériel offre une opportunité très originale (i) d’identifier les déterminants génétiques responsables de l’adaptation aux contraintes climatiques, et (ii) de valoriser des populations fermières. Nous présentons ici la méthodologie suivie, les collectes en cours sur le territoire français et les travaux qui seront engagés dans le cadre du projet BrasExplor.Ces travaux ouvrent des perspectives d’amélioration vis-à-vis des contraintes abiotiques et biotiques chez le chou, le navet, ou encore le colza (Brassica napus, AACC, 2n=38) issu de l’hybridation naturelle entre ces deux espèces diploïdes.
- Published
- 2022
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12. A sequence-tagged genetic map for the brown alga Ectocarpus siliculosus provides large-scale assembly of the genome sequence
- Author
-
Heesch, Svenja, Cho, Ga Youn, Peters, Akira F., Le Corguillé, Gildas, Falentin, Cyril, Boutet, Gilles, Coëdel, Solène, Jubin, Claire, Samson, Gaelle, Corre, Erwan, Coelho, Susana M., and Cock, J. Mark
- Published
- 2010
13. Epigenomic and structural events preclude recombination in Brassica napus
- Author
-
Boideau, Franz, primary, Richard, Gautier, additional, Coriton, Olivier, additional, Huteau, Virginie, additional, Belser, Caroline, additional, Deniot, Gwenaelle, additional, Eber, Frédérique, additional, Falentin, Cyril, additional, Ferreira de Carvalho, Julie, additional, Gilet, Marie, additional, Lodé‐Taburel, Maryse, additional, Maillet, Loeiz, additional, Morice, Jérôme, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Aury, Jean‐Marc, additional, Chèvre, Anne‐Marie, additional, and Rousseau‐Gueutin, Mathieu, additional
- Published
- 2022
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14. A Modified Meiotic Recombination in Brassica napus Largely Improves Its Breeding Efficiency
- Author
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Boideau, Franz, primary, Pelé, Alexandre, additional, Tanguy, Coleen, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Eber, Frédérique, additional, Maillet, Loeiz, additional, Gilet, Marie, additional, Lodé-Taburel, Maryse, additional, Huteau, Virginie, additional, Morice, Jérôme, additional, Coriton, Olivier, additional, Falentin, Cyril, additional, Delourme, Régine, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, and Chèvre, Anne-Marie, additional
- Published
- 2021
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15. Sequencing and Chromosome-Scale Assembly of Plant Genomes, Brassica rapa as a Use Case
- Author
-
Istace, Benjamin, primary, Belser, Caroline, additional, Falentin, Cyril, additional, Labadie, Karine, additional, Boideau, Franz, additional, Deniot, Gwenaëlle, additional, Maillet, Loeiz, additional, Cruaud, Corinne, additional, Bertrand, Laurie, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, Wincker, Patrick, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, and Aury, Jean-Marc, additional
- Published
- 2021
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16. PLANT GENETICS: Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome
- Author
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Chalhoub, Boulos, Denoeud, France, Liu, Shengyi, Parkin, Isobel A. P., Tang, Haibao, Wang, Xiyin, Chiquet, Julien, Belcram, Harry, Tong, Chaobo, Samans, Birgit, Corréa, Margot, Da Silva, Corinne, Just, Jérémy, Falentin, Cyril, Koh, Chu Shin, Le Clainche, Isabelle, Bernard, Maria, Bento, Pascal, Noel, Benjamin, Labadie, Karine, Alberti, Adriana, Charles, Mathieu, Arnaud, Dominique, Guo, Hui, Daviaud, Christian, Alamery, Salman, Jabbari, Kamel, Zhao, Meixia, Edger, Patrick P., Chelaifa, Houda, Tack, David, Lassalle, Gilles, Mestiri, Imen, Schnel, Nicolas, Le Paslier, Marie-Christine, Fan, Guangyi, Renault, Victor, Bayer, Philippe E., Golicz, Agnieszka A., Manoli, Sahana, Lee, Tae-Ho, Thi, Vinh Ha Dinh, Chalabi, Smahane, Hu, Qiong, Fan, Chuchuan, Tollenaere, Reece, Lu, Yunhai, Battail, Christophe, Shen, Jinxiong, Sidebottom, Christine H. D., Wang, Xinfa, Canaguier, Aurélie, Chauveau, Aurélie, Bérard, Aurélie, Deniot, Gwenaëlle, Guan, Mei, Liu, Zhongsong, Sun, Fengming, Lim, Yong Pyo, Lyons, Eric, Town, Christopher D., Bancroft, Ian, Wang, Xiaowu, Meng, Jinling, Ma, Jianxin, Pires, Chris J., King, Graham J., Brunel, Dominique, Delourme, Régine, Renard, Michel, Aury, Jean-Marc, Adams, Keith L., Batley, Jacqueline, Snowdon, Rod J., Tost, Jorg, Edwards, David, Zhou, Yongming, Hua, Wei, Sharpe, Andrew G., Paterson, Andrew H., Guan, Chunyun, and Wincker, Patrick
- Published
- 2014
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17. Long-read assembly of the Brassica napus reference genome Darmor-bzh
- Author
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Rousseau-Gueutin, Mathieu, Belser, Caroline, Da silva, Corinne, Richard, Gautier, Istace, Benjamin, Cruaud, Corinne, Falentin, Cyril, Boideau, Franz, Boutte, Julien, Delourme, Régine, Deniot, Gwenaëlle, Engelen, Stefan, Ferreira de Carvalho, Julie, Lemainque, Arnaud, Maillet, Loeiz, Morice, Jérôme, Wincker, Patrick, Denoeud, France, Chèvre, Anne-Marie, Aury, Jean-Marc, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Génomique métabolique (UMR 8030), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Genoscope, the Commissariat à l'Energie Atomique et aux Énergies Alternatives, China Earthquake Administration, ANR-10-INBS-09–08, France Génomique, 791 908, Horizon 2020 Framework Programme, Biology and Plant Breeding Department, ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), European Project: 791908,SURFinG, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)
- Subjects
assembly ,Genome ,oilseed rape ,AcademicSubjects/SCI02254 ,Brassica napus ,High-Throughput Nucleotide Sequencing ,food and beverages ,Brassica ,Data Note ,direct RNA ,[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,Nanopores ,chromosome-scale ,optical mapping ,Phenotype ,nanopore sequencing ,AcademicSubjects/SCI00960 ,Darmor-bzh - Abstract
International audience; Backgroubd: The combination of long reads and long-range information to produce genome assemblies is now accepted as a common standard. This strategy not only allows access to the gene catalogue of a given species but also reveals the architecture and organization of chromosomes, including complex regions such as telomeres and centromeres. The Brassica genus is not exempt, and many assemblies based on long reads are now available. The reference genome for Brassica napus, Darmor-bzh, which was published in 2014, was produced using short reads and its contiguity was extremely low compared with current assemblies of the Brassica genus. Findings: Herein, we report the new long-read assembly of Darmor-bzh genome (Brassica napus) generated by combining long-read sequencing data and optical and genetic maps. Using the PromethION device and 6 flowcells, we generated ∼16 million long reads representing 93× coverage and, more importantly, 6× with reads longer than 100 kb. This ultralong-read dataset allows us to generate one of the most contiguous and complete assemblies of a Brassica genome to date (contig N50 > 10 Mb). In addition, we exploited all the advantages of the nanopore technology to detect modified bases and sequence transcriptomic data using direct RNA to annotate the genome and focus on resistance genes.Conclusion: Using these cutting-edge technologies, and in particular by relying on all the advantages of the nanopore technology, we provide the most contiguous Brassica napus assembly, a resource that will be valuable to the Brassica community for crop improvement and will facilitate the rapid selection of agronomically important traits.
- Published
- 2020
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18. Untangling structural factors driving genome stabilization in nascent Brassica napus allopolyploids
- Author
-
Ferreira de Carvalho, Julie, primary, Stoeckel, Solenn, additional, Eber, Frédérique, additional, Lodé‐Taburel, Maryse, additional, Gilet, Marie‐Madeleine, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Morice, Jérôme, additional, Falentin, Cyril, additional, Chèvre, Anne‐Marie, additional, and Rousseau‐Gueutin, Mathieu, additional
- Published
- 2021
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19. Characterization of a radish introgression carrying the Ogura fertility restorer gene Rfo in rapeseed, using the Arabidopsis genome sequence and radish genetic mapping
- Author
-
Giancola, Sandra, Marhadour, Sylvie, Desloire, Sophie, Clouet, Vanessa, Falentin-Guyomarc'h, Hélène, Laloui, Wassila, Falentin, Cyril, Pelletier, Georges, Renard, Michel, Bendahmane, Abdelhafid, Delourme, Régine, and Budar, Françoise
- Published
- 2003
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20. Identification of the fertility restoration locus, Rfo, in radish, as a member of the pentatricopeptide‐repeat protein family
- Author
-
Desloire, Sophie, Gherbi, Hassen, Laloui, Wassila, Marhadour, Sylvie, Clouet, Vanessa, Cattolico, Laurence, Falentin, Cyril, Giancola, Sandra, Renard, Michel, Budar, Françoise, Small, Ian, Caboche, Michel, Delourme, Régine, and Bendahmane, Abdelhafid
- Published
- 2003
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21. Untangling structural factors and evolutionary drivers in nascent polyploids
- Author
-
de Carvalho, Julie Ferreira, primary, Stoeckel, Solenn, additional, Eber, Frédérique, additional, Lodé-Taburel, Maryse, additional, Gilet, Marie-Madeleine, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Morice, Jérôme, additional, Falentin, Cyril, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, and Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional
- Published
- 2020
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22. Genome Size Variation and Comparative Genomics Reveal Intraspecific Diversity in Brassica rapa
- Author
-
Boutte, Julien, primary, Maillet, Loeiz, additional, Chaussepied, Thomas, additional, Letort, Sébastien, additional, Aury, Jean-Marc, additional, Belser, Caroline, additional, Boideau, Franz, additional, Brunet, Anael, additional, Coriton, Olivier, additional, Deniot, Gwenaëlle, additional, Falentin, Cyril, additional, Huteau, Virginie, additional, Lodé-Taburel, Maryse, additional, Morice, Jérôme, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, and Ferreira de Carvalho, Julie, additional
- Published
- 2020
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23. Long-reads assembly of theBrassica napusreference genome, Darmor-bzh
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, primary, Belser, Caroline, additional, Silva, Corinne Da, additional, Richard, Gautier, additional, Istace, Benjamin, additional, Cruaud, Corinne, additional, Falentin, Cyril, additional, Boideau, Franz, additional, Boutte, Julien, additional, Delourme, Regine, additional, Deniot, Gwenaëlle, additional, Engelen, Stefan, additional, de Carvalho, Julie Ferreira, additional, Lemainque, Arnaud, additional, Maillet, Loeiz, additional, Morice, Jérôme, additional, Wincker, Patrick, additional, Denoeud, France, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, and Aury, Jean-Marc, additional
- Published
- 2020
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24. Large genomic variants reveal unexplored intraspecific diversity in Brassica rapa genomes
- Author
-
Boutte, Julien, primary, Maillet, Loeiz, additional, Chaussepied, Thomas, additional, Letort, Sébastien, additional, Aury, Jean-Marc, additional, Belser, Caroline, additional, Boideau, Franz, additional, Brunet, Anael, additional, Coriton, Olivier, additional, Deniot, Gwenaëlle, additional, Falentin, Cyril, additional, Huteau, Virginie, additional, Lodé, Maryse, additional, Morice, Jérôme, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Chèvre, Anne-Marie, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, and de Carvalho, Julie Ferreira, additional
- Published
- 2020
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25. Structural and functional evolutionary dynamics of duplicated genes and genomes in nascent and natural B. napus
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, Lucas, Jérémy, Denoeud, France, Ferreira de Carvalho, Julie, He, Zhesi, Boutte, Julien, Deniot, Gwenaëlle, Falentin, Cyril, Filangi, Olivier, Gilet, Marie-Madeleine, Legeai, Fabrice, Lodé-Taburel, Maryse, Morice, Jérôme, Trotoux, Gwenn, Aury, Jean-Marc, Barbe, Valérie, Snowdon, Rod J., Wincker, Patrick, Bancroft, Ian, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), University of York [York, UK], Institut für Insektenbiotechnologie [Justus-Liebig-Universität Gießen], Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University (JLU), Rousseau-Gueutin, Mathieu, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Justus-Liebig-Universität Gießen (JLU)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
26. Functional consequences of transposable elements on duplicated gene transcription and retention in polyploid Brassica species
- Author
-
Ferreira De Carvalho, Julie, Boutte, Julien, Maillet, Loeiz, Chaussepied, Thomas, Letort, Sébastien, Deniot, Gwenaëlle, Falentin, Cyril, Gilet, Marie-Madeleine, Legeai, Fabrice, Lodé-Taburel, Maryse, Morice, Jérôme, Trotoux, Gwenn, Chèvre, Anne-Marie, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
27. Co-evolution of chloroplast and nuclear genomes in flowering plants and impact of allopolyploidy on fine tune cytonuclear interactions
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, Ferreira de Carvalho, Julie, Lucas, Jérémy, Deniot, Gwenaëlle, Falentin, Cyril, Archambeau, Heloïse, Gilet, Marie-Madeleine, Legeai, Fabrice, Lodé-Taburel, Maryse, Morice, Jérôme, Trotoux, Gwenn, Montes, Emilie, Aury, Jean-Marc, Barbe, Valérie, Snowdon, Rod J., He, Zhesi, Denoeud, France, Wincker, Patrick, Bancroft, Ian, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut für Insektenbiotechnologie [Justus-Liebig-Universität Gießen], Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University (JLU), University of York [York, UK], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Justus-Liebig-Universität Gießen (JLU), and Rousseau-Gueutin, Mathieu
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
28. Modifications of recombination rules by changing the ploidy level: Brassica model
- Author
-
Boideau, Franz, Huteau, Virginie, Falentin, Cyril, Trotoux, Gwenn, Lodé-Taburel, Maryse, Eber, Frederique, Gilet, Marie-Madeleine, Maillet, Loeiz, Morice, Jérôme, Coriton, Olivier, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
29. From hills to mountains: modifying the recombination landscape in Brassica AAC allotriploids
- Author
-
Boideau, Franz, Trotoux, Gwenn, Maillet, Loeiz, Huteau, Virginie, Lodé-Taburel, Maryse, Eber, Frederique, Gilet, Marie-Madeleine, Brunet, Anael, Morice, Jérôme, Boutte, Julien, Falentin, Cyril, Coriton, Olivier, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
30. From hills to mountains: modifying the recombination landscape in Brassica AAC allotriploids. EMBO meiosis
- Author
-
Boideau, Franz, Falentin, Cyril, Huteau, Virginie, Trotoux, Gwenn, Lodé-Taburel, Maryse, Eber, Frederique, Gilet, Marie-Madeleine, Maillet, Loeiz, Morice, Jérôme, Boutte, Julien, Coriton, Olivier, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2019
31. Séquençage d'ADN grande longueur 'synthétique' par la technique 10X Genomics
- Author
-
Falentin, Cyril, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2018
32. Cartographie optique de génomes (Optical Mapping)
- Author
-
Falentin, Cyril, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2018
33. Séquençage d'ADN par la technique Illumina
- Author
-
Falentin, Cyril, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2018
34. Séquençage d'ADN par la technique Single Molecule real Time (SPRT) : PacBio
- Author
-
Falentin, Cyril, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2018
35. Séquençage d'ADN grande longueur par la technique Nanopore
- Author
-
Falentin, Cyril, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
National audience
- Published
- 2018
36. Cytonuclear interactions overcome inter-genomic conflict resulting from interspecific hybridization and genome doubling
- Author
-
Ferreira De Carvalho, Julie, Lucas, Jérémy, Falentin, Cyril, Deniot, Gwenaëlle, Filangi, Olivier, Gilet, Marie-Madeleine, Legeai, Fabrice, Lodé-Taburel, Maryse, Morice, Jérôme, Trotoux, Gwenn, Aury, Jean-Marc, Barbe, Valérie, Keller, Jean, Snowdon, Rod J., He, Zhesi, Denoeud, France, Wincker, Patrick, Bancroft, Ian, Chèvre, Anne-Marie, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Justus-Liebig-Universität Gießen (JLU), University of York [York, UK], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University (JLU), and Rousseau-Gueutin, Mathieu
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
37. New insights into the genetic diversity and reproduction of Brassica rapa L
- Author
-
Aïssiou, F., Rousseau-Gueutin, Mathieu, Laperche, Anne, Falentin, Cyril, Lodé-Taburel, Maryse, Deniot, Gwenaëlle, Regnier, F., Trotoux, Gwenn, Huteau, Virginie, Coriton, Olivier, Chèvre, Anne-Marie, Hadj-Arab, Houria, University of Sciences and Technology Houari Boumediene [Alger] (USTHB), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene = University of Sciences and Technology Houari Boumediene [Alger] (USTHB), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
38. Chromosome-scale assemblies of Brassica oleracea and Brassica rapa using nanopore long reads and optical maps
- Author
-
Belser, Caroline, Istace, Bejamin, Engemann, Denis, Dubarry, M, Falentin, Cyril, Genete, Matthieu, Berrabah, Wahiba, Chèvre, Anne-Marie, Delourme, Régine, Deniot, Gwenaëlle, Denoeud, France, Duffe, Philippe, Engelen, Stefan, Lemainque, Arnaud, Manzanares-Dauleux, Maria, Morice, Jérôme, Noel, Benjamin, Vekemans, Xavier, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Barbe, Valérie, Cruaud, Corine, Wincker, Patrick, Aury, Jean-Marc, Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[INFO]Computer Science [cs] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
39. Towards a genetic map for the brown alga Saccorhiza polyschides
- Author
-
Heesch, Svenja, Youn Cho, Ga, Peters, Akira F., Le Corguillé, Gildas, Falentin, Cyril, Boutet, Gilles, Coedel, Solene, Jubin, Claire, Samson, Gaëlle, Corre, Erwan, Coelho, Susana M., Cock, J. Mark, Station biologique de Roscoff (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Végétaux marins et biomolécules, Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-GOEMAR-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bezhin Rosko, Amélioration des Plantes et Biotechnologies Végétales (APBV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Plateforme Génomique Santé Biogenouest®, Institut de Génomique d'Evry (IG), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDE]Environmental Sciences ,[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
40. Impact of structural variations on the meiotic stability and plant fertility of the allotetraploid B. napus (oilseed rape)
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, Ferreira De Carvalho, Julie, Stoeckel, Solenn, Morice, Jérôme, Gilet, Marie-Madeleine, Eber, Frederique, Lodé-Taburel, Maryse, Trotoux, Gwenn, Falentin, Cyril, Deniot, Gwenaëlle, Huteau, Virginie, Coriton, Olivier, Pelé, Alexandre, Chèvre, Anne-Marie, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
41. How a polyploid becomes a new species: example from the Brassica model
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, Ferreira De Carvalho, Julie, Lucas, J., Denoued, F., Legeai, Fabrice, He, Z., Morice, Jérôme, Lodé-Taburel, Maryse, Boutte, Julien, Deniot, Gwenaëlle, Falentin, Cyril, Filangi, Olivier, Trotoux, Gwenn, Gilet, Marie-Madeleine, Coriton, Olivier, Huteau, Virginie, Aury, J.M., Barbe, Valérie, Salse, Jérôme, Winckler, P., Snowdon, R., Bancroft, Ian, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.BID.EVO] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE] ,[SDV.BV.AP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2018
42. Cytonuclear interactions remain stable during allopolyploid evolution despite repeated whole‐genome duplications in Brassica
- Author
-
Ferreira de Carvalho, Julie, primary, Lucas, Jérémy, additional, Deniot, Gwenaëlle, additional, Falentin, Cyril, additional, Filangi, Olivier, additional, Gilet, Marie, additional, Legeai, Fabrice, additional, Lode, Maryse, additional, Morice, Jérôme, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Aury, Jean‐Marc, additional, Barbe, Valérie, additional, Keller, Jean, additional, Snowdon, Rod, additional, He, Zhesi, additional, Denoeud, France, additional, Wincker, Patrick, additional, Bancroft, Ian, additional, Chèvre, Anne‐Marie, additional, and Rousseau‐Gueutin, Mathieu, additional
- Published
- 2019
- Full Text
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43. Integration of linkage maps for the Amphidiploid Brassica napus and comparative mapping with Arabidopsis and Brassica rapa
- Author
-
Delourme Régine, Falentin Cyril, Parkin Isobel AP, Lydiate Derek J, Wang Jun, Carion Pierre WC, and King Graham J
- Subjects
Biotechnology ,TP248.13-248.65 ,Genetics ,QH426-470 - Abstract
Abstract Background The large number of genetic linkage maps representing Brassica chromosomes constitute a potential platform for studying crop traits and genome evolution within Brassicaceae. However, the alignment of existing maps remains a major challenge. The integration of these genetic maps will enhance genetic resolution, and provide a means to navigate between sequence-tagged loci, and with contiguous genome sequences as these become available. Results We report the first genome-wide integration of Brassica maps based on an automated pipeline which involved collation of genome-wide genotype data for sequence-tagged markers scored on three extensively used amphidiploid Brassica napus (2n = 38) populations. Representative markers were selected from consolidated maps for each population, and skeleton bin maps were generated. The skeleton maps for the three populations were then combined to generate an integrated map for each LG, comparing two different approaches, one encapsulated in JoinMap and the other in MergeMap. The BnaWAIT_01_2010a integrated genetic map was generated using JoinMap, and includes 5,162 genetic markers mapped onto 2,196 loci, with a total genetic length of 1,792 cM. The map density of one locus every 0.82 cM, corresponding to 515 Kbp, increases by at least three-fold the locus and marker density within the original maps. Within the B. napus integrated map we identified 103 conserved collinearity blocks relative to Arabidopsis, including five previously unreported blocks. The BnaWAIT_01_2010a map was used to investigate the integrity and conservation of order proposed for genome sequence scaffolds generated from the constituent A genome of Brassica rapa. Conclusions Our results provide a comprehensive genetic integration of the B. napus genome from a range of sources, which we anticipate will provide valuable information for rapeseed and Canola research.
- Published
- 2011
- Full Text
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44. Brassica rapa genetic resources from Algeria: diversity and population structure based on SSR markers
- Author
-
Aïssiou, F., Falentin, Cyril, Laperche, Anne, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Hadj-Arab, Houria, University of Sciences and Technology Houari Boumediene [Alger] (USTHB), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université des Sciences et de la Technologie Houari Boumediene = University of Sciences and Technology Houari Boumediene [Alger] (USTHB), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2017
45. The poor lonesome Brassica napus A subgenome may not survive without its mate
- Author
-
Pelé, Alexandre, Trotoux, Gwenn, Eber, Frederique, Negre, Sylvie, Morice, Jérôme, Lodé-Taburel, Maryse, Gilet, Marie-Madeleine, Falentin, Cyril, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,2. Zero hunger ,[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,Brassica napus ,subgenome extraction ,evolution ,structural rearrangements ,[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology - Abstract
International audience; Whole genome duplication (WGD) is recognized as a major force in plant evolution and speciation, resulting from both structural and/or functional alterations. These modifications occur in the first few generations following WGD events and continue during the lifespan of the polyploid species. To study the long-term evolutionary impact of allopolyploidy, previous studies have almost exclusively compared a present allotetraploid species with its current diploid progenitors. However, the diploid progenitors have independently evolved since the allotetraploid formation, preventing to fully understand its evolution. To circumvent this problem, another approach corresponding to the subgenome extraction, offers the unique opportunity to elucidate the long-term evolution in an allopolyploid context. Presently, one of the best model to determine the role of allopolyploidy in genome evolution corresponds to oilseed rape (Brassica napus, AACC, 2n=38), formed about 8,500 years ago from a cross between B. rapa (AA, 2n=20) and B. oleracea (CC, 2n=18). To identify the structural rearrangements that occurred since this allotetraploid formation, we performed two different strategies to extract its diploid AA component. For the 1st strategy, a cross between B. napus var. Darmor and B. rapa was realized to produce a triploid AAC F1 interspecific hybrid. This triploid was then backcrossed three times to B. napus and the AAC progenies were selected at each generation in order to obtain an almost pure B. napus A subgenome. We finally attempted to separate the AA and C components by selfing the last AAC plant but no AA plant was obtained. For the 2nd strategy, a cross between the initial AAC F1 hybrid and B. rapa was performed to generate AA plants. After four cycles of selfed and also backcrossed to B. napus, AA plants mainly containing the B. napus A subgenome were obtained. Using the 60k SNP Illumina micro array and the genome sequence of B. napus var. Darmor, we assessed the genomic structure of the last AA plants produced. They presented a lower proportion of B. napus A subgenome extracted than expected and some introgressions from the C subgenome. Our analyses revealed that the genomic regions from B. rapa conserved in diploid AA plants were not randomly distributed along the A subgenome, suggesting that the A subgenome may not survive without the C subgenome, most presumably due to the loss of one homoeologous copy since the formation of the allotetraploid B. napus.
- Published
- 2016
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46. Gene Introgression in Weeds Depends on Initial Gene Location in the Crop: Brassica napus–Raphanus raphanistrum Model
- Author
-
Adamczyk-Chauvat, Katarzyna, primary, Delaunay, Sabrina, additional, Vannier, Anne, additional, François, Caroline, additional, Thomas, Gwenaëlle, additional, Eber, Frédérique, additional, Lodé, Maryse, additional, Gilet, Marie, additional, Huteau, Virginie, additional, Morice, Jérôme, additional, Nègre, Sylvie, additional, Falentin, Cyril, additional, Coriton, Olivier, additional, Darmency, Henri, additional, Alrustom, Bachar, additional, Jenczewski, Eric, additional, Rousseau-Gueutin, Mathieu, additional, and Chèvre, Anne-Marie, additional
- Published
- 2017
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47. The Impact of Open Pollination on the Structural Evolutionary Dynamics, Meiotic Behavior, and Fertility of Resynthesized AllotetraploidBrassica napusL.
- Author
-
Rousseau-Gueutin, Mathieu, primary, Morice, Jérôme, additional, Coriton, Olivier, additional, Huteau, Virginie, additional, Trotoux, Gwenn, additional, Nègre, Sylvie, additional, Falentin, Cyril, additional, Deniot, Gwennaëlle, additional, Gilet, Marie, additional, Eber, Frédérique, additional, Pelé, Alexandre, additional, Vautrin, Sonia, additional, Fourment, Joëlle, additional, Lodé, Maryse, additional, Bergès, Hélène, additional, and Chèvre, Anne-Marie, additional
- Published
- 2017
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48. Can a lonesome poor A genome of Brassica napus survive at diploid stage?
- Author
-
Pelé, Alexandre, Trotoux, Gwenn, Eber, Frederique, Negre, Sylvie, Morice, Jérôme, Lodé-Taburel, Maryse, Gilet, Marie-Madeleine, Falentin, Cyril, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.BV.AP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Plant breeding ,polyploid evolution ,B. napus ,food and beverages ,structural rearrangements ,[SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology - Abstract
International audience; Background: There are two strategies available for understanding structural and/or functional modifications that took place during the stabilization of polyploid species. The first one allows assessment of events that arose immediately after the formation of a polyploid species by crossing and doubling its parental genomes in order to produce synthetic forms. The second one tries to elucidate the changes that occurred since the polyploid species was created by extracting in the polyploidy one of its parental genome.Objectives: In the present study, we tried to identify the structural rearrangements that occurred since the origin (about 8000 years ago) of oilseed rape (Brassica napus, AACC, 2n=38), which is a natural hybrid between B. rapa (AA, 2n=20) and B. oleracea (CC, 2n=18). To that purpose, we produced an original plant material in which the B. napus A subgenome was extracted. Methods: We used two methods to extract the diploid AA genome from B. napus. Firstly, AAC F1 interspecific hybrids (produced by crosses between B. napus var Darmor and B. rapa) were backcrossed three times to B. napus, and AAC plants were selected at each generation. Secondly, the initial AAC F1 hybrids were crossed to B. rapa and plants with AA genomes were selected for, selfed and also backcrossed to B. napus. After four cycles of such crossing, we selected AA plants with mainly the A genome of B. napus. Using the 60k SNP Illumina microarray and the sequence of B. napus genomes var Darmor, we assessed the genomic structure of the so far extracted B. napus A subgenome. Result: We found that the backcrosses of AAC F1 interspecific hybrids to B. napus (first strategy) could not permit to eliminate the C chromosomes by selfing since the progenies were male sterile. The second strategy allowed production of AA plants with a regular meiosis. We expected more than 68% of Darmor A genome in this plant. To validate this assessment, genomic structure was established by SNP analysis using markers specific of A genome of Darmor and of the B. rapa variety used in the initial crosses. The homozygous or heterozygous stage of each marker physically anchored was determined. Additionally, CDarmor genome regions introduced by homeologous recombination were characterized. Conclusions: From this original material, it will be possible to determine the comparative evolution of the A genome in a diploid and polyploid genetic background. The first data seem to indicate that rearrangements are too large and/or too frequent to obtain 100% A genome of B. napus at the diploid stage. However, functional analyses will allow identification of the rearrangement impacts.
- Published
- 2015
49. Can a poor lonesome A genome of Brassica napus survive at diploid stage?
- Author
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Pelé, Alexandre, Trotoux, Gwenn, Eber, Frédérique, Nègre, Sylvie, Morice, Jérôme, Lodé, Maryse, Gilet, Marie, Falentin, Cyril, Rousseau-Gueutin, Mathieu, and Chèvre, Anne-Marie
- Published
- 2015
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50. Extracting the A genome from oilseed rape
- Author
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Trotoux, Gwenn, Pelé, Alexandre, Eber, Frederique, Negre, Sylvie, Morice, Jérôme, Lodé-Taburel, Maryse, Gilet, Marie-Madeleine, Falentin, Cyril, Rousseau-Gueutin, Mathieu, Chèvre, Anne-Marie, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Rousseau-Gueutin, Mathieu, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
- Subjects
[SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,[SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS - Abstract
International audience
- Published
- 2015
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