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302 results on '"Fafi‐kremer, S"'

1. Impact of the mutational load on the virological response to a first-line rilpivirine-based regimen.

Author: Dimeglio, Chloé, Raymond, Stéphanie, Nicot, Florence, Jeanne, Nicolas, Carcenac, Romain, Lefebvre, Caroline, Izopet, Jacques, Roussel, C, Guillou-Guillemette, H Le, Alloui, C, Bettinger, D, Pallier, C, Fleury, H, Bellecave, P, Recordon-Pinson, P, Payan, C, Vallet, S, Vabret, A, Dina, J, Henquell, C, Mirand, A, Bouvier-Alias, M, de Rougemont, A, Si-Mohammed, A, Santos, G Dos, Morand, P, Signori-Schmuck, A, Bocket, L, Rogez, S, Andre, P, Tardy, JC, Trabaud, MA, Tamalet, C, Delamare, C, Montes, B, Schvoerer, E, Jeulin, H, Ferré, V, Rodallec, A, Guen, L Le, Cottalorda, J, Guinard, J, Guiguon, A, Descamps, D, Charpentier, C, Visseaux, B, Peytavin, G, Krivine, A, Bouviers-Alias, M, Avettand-Fenoel, V, Marcelin, AG, Calvez, V, Soulié, C, Wirden, M, Morand-Joubert, L, Lambert-Niclot, S, Fofana, D, Delaugerre, C, Chaix, ML, Mahjoub, N, Amiel, C, Schneider, V, Giraudeau, G, Beby-Defaux, A, Brodard, V, Maillard, A, Plantier, JC, Mourez, T, Leoz, M, Chaplain, C, Bourlet, T, Fafi-Kremer, S, Stoll-Keller, F, Schmitt, MP, Barth, H, Yerly, S, Poggi, C, Izopet, J, Raymond, S, Barin, F, Chaillon, A, Marque-Juillet, S, Roque-Afonso, AM, Haïm-Boukobza, S, Flandre, P, Grudé, M, Assoumou, L, and Costagliola, D
Subjects: Clinical Research, Genetics, HIV/AIDS, Infectious Diseases, Infection, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Drug Resistance, Viral, Female, Genome, Viral, Genotype, HIV Infections, HIV-1, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Humans, Male, Mutation, Rilpivirine, Treatment Outcome, Viral Load, French National Agency for Research on AIDS and Viral Hepatitis (ANRS) AC11 Resistance Study Group, Microbiology, Medical Microbiology, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences
Abstract: ObjectivesTo determine how the load of rilpivirine-resistant variants (mutational load) influences the virological response (VR) of HIV-1-infected patients to a rilpivirine-based first-line regimen.Patients and methodsFour hundred and eighty-nine patients infected with HIV-1 whose reverse transcriptase gene had been successfully resistance genotyped using next-generation sequencing were given a first-line regimen containing rilpivirine. Variables associated with the VR at 12 months were identified using a logistic model. The results were used to build a multivariate model for each mutational load threshold and the R2 variations were analysed to identify the mutational load threshold that best predicted the VR.ResultsThe mutational load at baseline was the only variable linked to the VR at 12 months (P 1700 copies/mL and to 50% when the mutational load was > 9000 copies/mL. The threshold of 9000 copies/mL was associated with the VR at 12 months with an OR of 36.7 (95% CI 4.7-285.1). The threshold of 1700 copies/mL was associated with the VR at 12 months with an OR of 7.2 (95% CI 1.4-36.8).ConclusionsThere is quantifiable evidence that determining a mutational load threshold can be used to identify those patients on a first-line regimen containing rilpivirine who are at risk of virological failure. The clinical management of HIV-infected patients can be improved by evaluating the frequency of mutant variants at a threshold of
Published: 2019

2. COVID-19 et transplantation d’organes, les leçons du recensement national de la Société francophone de transplantation

Author: Caillard, S., Moulin, B., Fafi-Kremer, S., Hazzan, M., Anglicheau, D., Hertig, A., Tourret, J., Barrou, B., Morelon, E., Thaunat, O., Couzi, L., Merville, P., Moal, V., Legris, T., Westeel, P.-F., Jaureguy, M., Frimat, L., Ducloux, D., Bamoulid, J., Bertrand, D., Tsimaratos, M., Garaix-Gilardo, F., Dumortier, J., Mussot, S., Roux, A., Sebbag, L., Le Meur, Y., Blancho, G., Masset, C., Kamar, N., Francois, H., Rondeau, E., Bouvier, N., Mousson, C., Buchler, M., Gatault, P., Augusto, J.-F., Duveau, A., Vigneau, C., Morin, M.-C., Chemouny, J., Golbin, L., Grimbert, P., Matignon, M., Durrbach, A., Greze, C., Snanoudj, R., Colosio, C., Schvartz, B., Malvezzi, P., Mariat, C., Thierry, A., Le Quintrec, M., Sicard, A., Rerolle, J.P., Heng, A.-É., Garrouste, C., Coponat, H.V., Epailly, É., Brugiere, O., Dharancy, S., Salame, É., Saliba, F., and Caillard, Sophie
Published: 2022
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3. Impact of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Minority Variants on the Virus Response to a Rilpivirine-Based First-line Regimen

Author: Raymond, Stéphanie, Nicot, Florence, Pallier, Coralie, Bellecave, Pantxika, Maillard, Anne, Trabaud, Mary Anne, Morand-Joubert, Laurence, Rodallec, Audrey, Amiel, Corinne, Mourez, Thomas, Bocket, Laurence, Beby-Defaux, Agnès, Bouvier-Alias, Magali, Lambert-Niclot, Sidonie, Charpentier, Charlotte, Malve, Brice, Mirand, Audrey, Dina, Julia, Le Guillou-Guillemette, Hélène, Marque-Juillet, Stéphanie, Signori-Schmuck, Anne, Barin, Francis, Si-Mohamed, Ali, Fenoel, Véronique Avettand, Roussel, Catherine, Calvez, Vincent, Saune, Karine, Marcelin, Anne Geneviève, Rodriguez, Christophe, Descamps, Diane, Izopet, Jacques, Lagier, E, Roussel, C, Le Guillou-Guillemette, H, Alloui, C, Bettinger, D, Pallier, C, Fleury, H, Reigadas, S, Bellecave, P, Recordon-Pinson, P, Payan, C, Vallet, S, Vabret, A, Dina, J, Henquell, C, Mirand, A, Bouvier-Alias, M, de Rougemont, A, Dos Santos, G, Morand, P, Signori-Schmuck, A, Bocket, L, Rogez, S, Andre, P, Tardy, JC, Trabaud, MA, Tamalet, C, Delamare, C, Montes, B, Schvoerer, E, Ferré, V, André-Garnier, E, Cottalorda, J, Guinard, J, Guiguon, A, Descamps, D, Brun-Vézinet, F, Charpentier, C, Visseaux, B, Peytavin, G, Krivine, A, Si-Mohamed, A, Avettand-Fenoel, V, Marcelin, AG, Calvez, V, Lambert-Niclot, S, Soulié, C, Wirden, M, Morand-Joubert, L, Delaugerre, C, Chaix, ML, Amiel, C, Schneider, V, Giraudeau, G, Defaux, A Beby-, Brodard, V, Maillard, A, Plantier, JC, Chaplain, C, Bourlet, T, Fafi-Kremer, S, Stoll-Keller, F, Schmitt, MP, Barth, H, Yerly, S, Poggi, C, Izopet, J, Raymond, S, and Barin, F
Subjects: Medical Microbiology, Biomedical and Clinical Sciences, Clinical Sciences, Immunology, Antimicrobial Resistance, Genetics, HIV/AIDS, Clinical Research, Infectious Diseases, Aetiology, 2.1 Biological and endogenous factors, Infection, Good Health and Well Being, Adult, Drug Resistance, Viral, Female, Genetic Variation, HIV Infections, HIV-1, Humans, Male, Mutation, Rilpivirine, Viral Load, minority resistant variants, rilpivirine, first-line antiretroviral therapy, ultra-deep sequencing, French National Agency for Research on AIDS and Viral Hepatitis (ANRS) AC11 Resistance Study Group, Biological Sciences, Medical and Health Sciences, Microbiology, Clinical sciences
Abstract: BackgroundMinority resistant variants of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) could influence the virological response to treatment based on nonnucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs). Data on minority rilpivirine-resistant variants are scarce. This study used next-generation sequencing (NGS) to identify patients harboring minority resistant variants to nucleos(t)ide reverse transcriptase inhibitors and NNRTIs and to assess their influence on the virological response (VR).MethodsAll the subjects, 541 HIV-1-infected patients started a first-line regimen containing rilpivirine. VR was defined as a HIV-1 RNA load 20% in 29% of samples. We identified 43 (8.8%) and 36 (7.4%) patients who harbored rilpivirine-resistant variants with a 1% sensitivity threshold according to the French National Agency for Research on AIDS and Viral Hepatitis and Stanford algorithms, respectively. The VR was 96.9% at month 12. Detection of minority rilpivirine resistant variants was not associated with virological failure (VF). Multivariate analysis indicated that VF at month 12 was associated with a CD4 count
Published: 2018

4. Cross-resistance to elvitegravir and dolutegravir in 502 patients failing on raltegravir: a French national study of raltegravir-experienced HIV-1-infected patients

Author: Fourati, Slim, Charpentier, Charlotte, Amiel, Corinne, Morand-Joubert, Laurence, Reigadas, Sandrine, Trabaud, Mary-Anne, Delaugerre, Constance, Nicot, Florence, Rodallec, Audrey, Maillard, Anne, Mirand, Audrey, Jeulin, Hélène, Montès, Brigitte, Barin, Francis, Bettinger, Dominique, Le Guillou-Guillemette, Hélène, Vallet, Sophie, Signori-Schmuck, Anne, Descamps, Diane, Calvez, Vincent, Flandre, Philippe, Marcelin, Anne-Genevieve, Lagier, E, Roussel, C, Le Guillou, H, Alloui, C, Bettinger, D, Pallier, C, Fleury, H, Reigadas, S, Bellecave, P, Recordon-Pinson, P, Payan, C, Vallet, S, Vabret, A, Henquell, C, Mirand, A, Bouvier-Alias, M, de Rougemont, A, Dos Santos, G, Morand, P, Signori-Schmuck, A, Bocket, L, Rogez, S, Andre, P, Tardy, JC, Trabaud, MA, Tamalet, C, Delamare, C, Montes, B, Schvoerer, E, Ferre, V, André-Garnier, E, Cottalorda, J, Guinard, J, Guiguon, A, Descamps, D, Brun-Vézinet, F, Charpentier, C, Visseaux, B, Peytavin, G, Krivine, A, Si-Mohamed, A, Avettand-Fenoel, V, Marcelin, AG, Calvez, V, Lambert-Niclot, S, Soulié, C, Wirden, M, Morand-Joubert, L, Delaugerre, C, Chaix, ML, Amiel, C, Schneider, V, Giraudeau, G, Brodard, V, Maillard, A, Plantier, JC, Chaplain, C, Bourlet, T, Fafi-Kremer, S, Stoll-Keller, F, Schmitt, MP, Barth, H, Yerly, S, Poggi, C, Izopet, J, Raymond, S, Barin, F, Chaillon, A, Marque-Juillet, S, Roque-Afonso, AM, Haïm-Boukobza, S, Flandre, P, Grudé, M, Assoumou, L, Costagliola, D, Allegre, T, Schmit, JL, and Chennebault, JM
Subjects: Medical Microbiology, Biomedical and Clinical Sciences, Infectious Diseases, Genetics, Aetiology, 2.1 Biological and endogenous factors, Infection, Adult, Anti-HIV Agents, Drug Resistance, Viral, Female, France, HIV Infections, HIV Integrase, HIV Protease, HIV Reverse Transcriptase, HIV-1, Heterocyclic Compounds, 3-Ring, Humans, Male, Middle Aged, Mutant Proteins, Oxazines, Piperazines, Pyridones, Quinolones, Raltegravir Potassium, Sequence Analysis, DNA, integrase, inhibitors, mutations, patterns, ANRS AC11 Resistance Study Group, Microbiology, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Clinical sciences, Pharmacology and pharmaceutical sciences
Abstract: ObjectivesThe objectives of this study were to determine the prevalence and patterns of resistance to integrase strand transfer inhibitors (INSTIs) in patients experiencing virological failure on raltegravir-based ART and the impact on susceptibility to INSTIs (raltegravir, elvitegravir and dolutegravir).Patients and methodsData were collected from 502 treatment-experienced patients failing a raltegravir-containing regimen in a multicentre study. Reverse transcriptase, protease and integrase were sequenced at failure for each patient. INSTI resistance-associated mutations investigated were those included in the last ANRS genotypic algorithm (v23).ResultsAmong the 502 patients, at failure, median baseline HIV-1 RNA (viral load) was 2.9 log10 copies/mL. Patients had been previously exposed to a median of five NRTIs, one NNRTI and three PIs. Seventy-one percent harboured HIV-1 subtype B and the most frequent non-B subtype was CRF02_AG (13.3%). The most frequent mutations observed were N155H/S (19.1%), Q148G/H/K/R (15.4%) and Y143C/G/H/R/S (6.7%). At failure, viruses were considered as fully susceptible to all INSTIs in 61.0% of cases, whilst 38.6% were considered as resistant to raltegravir, 34.9% to elvitegravir and 13.9% to dolutegravir. In the case of resistance to raltegravir, viruses were considered as susceptible to elvitegravir in 11% and to dolutegravir in 64% of cases. High HIV-1 viral load at failure (P
Published: 2015

5. Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma

Author: Soulie, C, Descamps, D, Grude, M, Schneider, V, Trabaud, M-A, Morand-Joubert, L, Delaugerre, C, Montes, B, Barin, F, Ferre, V, Raymond, S, Jeulin, H, Alloui, C, Yerly, S, Pallier, C, Reigadas, S, Signori-Schmuck, A, Guigon, A, Fafi-Kremer, S, Haim-Boukobza, S, Mirand, A, Maillard, A, Vallet, S, Roussel, C, Assoumou, L, Calvez, V, Flandre, P, Marcelin, A-G, Lagier, E, Le Guillou, H, Bettinger, D, Fleury, H, Bellecave, P, Recordon-Pinson, P, Payan, C, Vabret, A, Henquell, C, Bouvier-Alias, M, de Rougemont, A, Dos Santos, G, Morand, P, Bocket, L, Rogez, S, Andre, P, Tardy, JC, Trabaud, MA, Tamalet, C, Delamare, C, Schvoerer, E, Andre-Garnier, E, Cottalorda, J, Guinard, J, Guiguon, A, Brun-Vezinet, F, Charpentier, C, Visseaux, B, Peytavin, G, Krivine, A, Si-Mohamed, A, Avettand-Fenoel, V, Marcelin, AG, Lambert-Niclot, S, Wirden, M, Chaix, ML, Amiel, C, Giraudeau, G, Brodard, V, Plantier, JC, Chaplain, C, Bourlet, T, Stoll-Keller, F, Schmitt, MP, Barth, H, Poggi, C, Izopet, J, Chaillon, A, Marque-Juillet, S, and Roque-Afonso, AM
Subjects: Medical Microbiology, Biomedical and Clinical Sciences, Clinical Sciences, HIV/AIDS, Infectious Diseases, Antimicrobial Resistance, Genetics, Clinical Research, Neurosciences, Infection, Adult, Anti-HIV Agents, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Drug Resistance, Viral, Female, Genotype, HIV Infections, HIV-1, Humans, Male, Microbial Sensitivity Tests, Middle Aged, Mutation, Nervous System Diseases, Viral Load, ANRS Resistance AC11 Group, ARV, CSF, HIV, resistance, Microbiology, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Clinical sciences, Pharmacology and pharmaceutical sciences
Abstract: OBJECTIVES: The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. METHODS: Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were >50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. RESULTS: On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P=0.0455) and T215Y (P=0.0455). CONCLUSIONS: In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performed.
Published: 2015

6. Dépistage de l'Ag HBs et prise en charge d'une hépatite B en contexte de grossesse en structure hospitalière, 2018-2022.

Author: Grisard, M., primary, Rebaï, I., additional, Gontard, L., additional, Laugel, E., additional, Grèze, C., additional, Wendling, M., additional, Fafi-Kremer, S., additional, and Velay, A., additional
Published: 2023
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7. Parsonage-Turner syndrome due to autochthonous acute genotype 3f hepatitis E virus infection in a nonimmunocompromised 55-year-old patient

Author: Velay, A., Kack-Kack, W., Abravanel, F., Lhomme, S., Leyendecker, P., Kremer, L., Chamouard, P., Izopet, J., Fafi-Kremer, S., and Barth, H.
Published: 2017
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8. Depressive symptoms after hepatitis C cure and socio-behavioral correlates in aging people living with HIV (ANRS CO13 HEPAVIH)

Author: Salmon, D., Usubillaga, R., Sogni, P., Terris, B., Tremeaux, P., Katlama, C., Valantin, M.A., Stitou, H., Simon, A., Cacoub, P., Nafissa, S., Benhamou, Y., Charlotte, F., Fourati, Virologie: S., Poizot-Martin, I., Zaegel, O., Laroche, H., Tamalet, C., Pialoux, G., Chas, J., Callard, P., Bendjaballah, F., Amiel, C., Le Pendeven, C., Marchou, B., Alric, L., Barange, K., Metivier, S., Selves, J., Larroquette, F., Rosenthal, E., Infectiologie, Naqvi, A., Rio, V., Haudebourg, J., Saint-Paul, M.C., Monte, A. De, Giordanengo, V., Partouche, C., Bouchaud, O., Martin, A., Ziol, M., Baazia, Y., Iwaka-Bande, V., Gerber, A., Uzan, M., Bicart-See, A., Garipuy, D., Ferro-Collados, M.J., Virologie, Nicot, F., Gervais, A., Yazdanpanah, Y., Adle-Biassette, H., Alexandre, G., Peytavin, G., Lascoux-Combe, C., Molina, J.M., Bertheau, P., Chaix, M.L., Delaugerre, C., Maylin, S., Lacombe, K., Bottero, J., Krause, J., Girard, P.M., Wendum, D., Cervera, P., Adam, J., Viala, C., Vittecocq, D., Goujard, C., Quertainmont, Y., Teicher, E., Pallier, C., Lortholary, O., Duvivier, C., Rouzaud, C., Lourenco, J., Touam, F., Louisin, C., Avettand-Fenoel, V., Gardiennet, E., Mélard, A., Neau, D., Ochoa, A., Blanchard, E., Castet-Lafarie, S., Cazanave, C., Malvy, D., Dupon, M., Dutronc, H., Dauchy, F., Lacaze-Buzy, L., Desclaux, A., Bioulac-Sage, P., Trimoulet, P., Reigadas, S., Morlat, P., Lacoste, D., Bonnet, F., Bernard, N., Hessamfar, M., J, Paccalin, F., Martell, C., Pertusa, M.C., Vandenhende, M., Mercié, P., Pistone, T., Receveur, M.C., Méchain, M., Duffau, P., Rivoisy, C., Faure, I., Caldato, S., Bellecave, P., Tumiotto, C., Pellegrin, J.L., Viallard, J.F., Lazzaro, E., Greib, C., Zucman, D., Majerholc, C., Brollo, M., Farfour, E., Boué, F., Devoto, J. Polo, Kansau, I., Chambrin, V., Pignon, C., Berroukeche, L., Fior, R., Martinez, V., Abgrall, S., Favier, M., Deback, C., Lévy, Y., Dominguez, S., Lelièvre, J.D., Lascaux, A.S., Melica, G., Billaud, E., Raffi, F., Allavena, C., Reliquet, V., Boutoille, D., Biron, C., Lefebvre, M., Hall, N., Bouchez, S., Rodallec, A., Le Guen, L., Hemon, C., Miailhes, P., Peyramond, D., Chidiac, C., Ader, F., Biron, F., Boibieux, A., Cotte, L., Ferry, T., Perpoint, T., Koffi, J., Zoulim, F., Bailly, F., Lack, P., Maynard, M., Radenne, S., Amiri, M., Valour, F., Augustin-Normand, C., Scholtes, C., Le-Thi, T.T., Piroth, L., Chavanet, P., Duong Van Huyen, M., Buisson, M., Waldner-Combernoux, A., Mahy, S., Salmon Rousseau, A., Martins, C., Aumaître, H., Galim, S., Bani-Sadr, F., Lambert, D., Nguyen, Y., Berger, J.L., Hentzien, M., Brodard, V., Rey, D., Partisani, M., Batard, M.L., Cheneau, C., Priester, M., Bernard-Henry, C., de Mautort, E., Fischer, P., Gantner, P., Fafi-Kremer, S., Roustant, F., Platterier, P., Kmiec, I., Traore, L., Lepuil, S., Parlier, S., Sicart-Payssan, V., Bedel, E., Anriamiandrisoa, S., Pomes, C., Mole, M., Bolliot, C., Catalan, P., Mebarki, M., Adda-Lievin, A., Thilbaut, P., Ousidhoum, Y., Makhoukhi, F.Z., Braik, O., Bayoud, R., Gatey, C., Pietri, M.P., Le Baut, V., Ben Rayana, R., Bornarel, D., Chesnel, C., Beniken, D., Pauchard, M., Akel, S., Lions, C., Ivanova, A., Ritleg, A.-S., Debreux, C., Chalal, L., Zelie, J., Hue, H., Soria, A., Cavellec, M., Breau, S., Joulie, A., Fisher, P., Gohier, S., Croisier-Bertin, D., Ogoudjobi, S., Brochier, C., Thoirain-Galvan, V., Le Cam, M., Wittkop, L., Esterle, L., Izopet, J., Serfaty, L., Paradis, V., Spire, B., Carrieri, P., Zaegel-Faucher, O., Meyer, L., Boufassa, F., Autran, B., Roque, A.M., Solas, C., Fontaine, H., Costagliola, D., Petrov-Sanchez, V., Levier, A., P. Carrieri, Chalouni, M., Conte, V., Dequae-Merchadou, L., Desvallées, M., Gilbert, C., Gillet, S., Guillochon, Q., Khan, C., Knight, R., Marcellin, F., Michel, L., Mora, M., Protopopescu, C., Roux, P., Barré, T., Ramier, C., Sow, A., Di Beo, V., Bureau, M., Marcellin, Fabienne, Brégigeon-Ronot, Sylvie, Ramier, Clémence, Protopopescu, Camelia, Gilbert, Camille, Di Beo, Vincent, Duvivier, Claudine, Bureau-Stoltmann, Morgane, Rosenthal, Eric, Wittkop, Linda, Salmon-Céron, Dominique, Carrieri, Patrizia, Sogni, Philippe, and Barré, Tangui
Published: 2023
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9. First cases of Omicron in France are exhibiting mild symptoms, November 2021–January 2022

Author: Maisa, A., primary, Spaccaferri, G., additional, Fournier, L., additional, Schaeffer, J., additional, Deniau, J., additional, Rolland, P., additional, Coignard, B., additional, Andrieu, A., additional, Broustal, O., additional, Chene, S., additional, Chent, S., additional, Fougère, E., additional, Gbaguidi, G., additional, Hamidouche, M., additional, Lamy, A., additional, Mano, Q., additional, Mastrovito, B., additional, Mercier, A., additional, Modenesi, G., additional, Picard, G., additional, Prudhomme, J., additional, Rapilly, F., additional, Riondel, A., additional, Rivière, M., additional, Villegas Ramirez, B., additional, Zhu-Soubise, A., additional, Zurbaran, M., additional, Amzert, A., additional, Andreoletti, L., additional, Bal, A., additional, Beaurepere, R., additional, Behillil, S., additional, Belec, L., additional, Bernard, C., additional, Bocket, L., additional, Bouri, L., additional, Bourlet, T., additional, Bressollette-Bodin, C., additional, Brichler, S., additional, Brugerolles, C., additional, Cado, S., additional, Calvez, V., additional, Capron, N., additional, Castelain, S., additional, Castro-Alvarez, J., additional, Chaix, M.-L., additional, Charpentier, C., additional, Che, D., additional, Chillou, C., additional, Colson, P., additional, Coudene, P., additional, Crinquette, A., additional, De Rougemont, A., additional, Delagrèverie, H., additional, Delamare, C., additional, Denecker-Berardino, T., additional, Descamps, D., additional, Desroches, M., additional, Destras, G., additional, Dos Santos, G., additional, Ducancelle, A., additional, Ducreux, S., additional, Duret, T., additional, Enouf, V., additional, Fafi-Kremer, S., additional, Felici, C., additional, Fourati, S., additional, Fournier, P.-E., additional, Gaudy, C., additional, Germain, H., additional, Giordanengo, V., additional, Gorge, O., additional, Haim-Boukobza, S., additional, Henquell, C., additional, Holstein, A., additional, Houhamdi, L., additional, Izopet, J., additional, Jacomo, V., additional, Jacques, A., additional, Jaffar-Bandjee, M.-C., additional, Jimenez, M., additional, Josset, L., additional, Kemeny, S., additional, Lafon, M.-E., additional, Le Bars, A., additional, Le Corguille, G., additional, Lepiller, Q., additional, Levasseur, A., additional, Leveque, N., additional, Lina, B., additional, Madelaine, C., additional, Malabat, C., additional, Marque-Juillet, S., additional, Martin-Dunavit, T., additional, Mavingui, P., additional, Merens, A., additional, Messak, I., additional, Morand-Joubert, L., additional, Naudot, X., additional, Neybecker, P., additional, Pawlotsky, J.-M., additional, Pilorge, L., additional, Plantier, J.-C., additional, Poggi, C., additional, Pretet, M., additional, Ragot, C., additional, Raoul, H., additional, Rogez, S., additional, Roque-Afonso, A.-M., additional, Roquebert, B., additional, Rousset, D., additional, Rozenberg, F., additional, Sagot, C., additional, Sahnoune, S., additional, Salgado, D., additional, Sand, O., additional, Saudemont, C., additional, Schvoerer, E., additional, Simon-Loriere, E., additional, Stephan, R., additional, Sudour, J., additional, Thibault, V., additional, Tuaillon, E., additional, Vabret, A., additional, Vallee, E., additional, Van Der Werf, S., additional, Van Helden, J., additional, Verdurme, L., additional, Vignola, A., additional, Wilkinson, D., additional, and Yazdanpanah, Y., additional
Published: 2022
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10. Post‐HCV cure self‐reported changes in physical activity, eating behaviours, and fatigue in people living with HIV (ANRS CO13 HEPAVIH)

Author: Marcellin, Fabienne, Di Beo, Vincent, Esterle, Laure, Abgrall, Sophie, Pialoux, Gilles, Barré, Tangui, Wittkop, Linda, Salmon‐ceron, Dominique, Sogni, Philippe, Carrieri, Patrizia, Roustant, F, Platterier, P, Kmiec, I, Traore, L, Lepuil, S, Parlier, S, Sicart‐payssan, V, Bedel, E, Anriamiandrisoa, S, Pomes, C, Mole, M, Bolliot, C, Catalan, P, Mebarki, M, Adda‐lievin, A, Thilbaut, P, Ousidhoum, Y, Makhoukhi, F.Z, Braik, O, Bayoud, R, Gatey, C, Pietri, M.P, Le Baut, V, Ben Rayana, R, Bornarel, D, Chesnel, C, Beniken, D, Pauchard, M, Akel, S, Lions, C, Ivanova, A, Ritleg, A‐s, Debreux, C, Chalal, L, Zelie, J, Hue, H, Soria, A, Cavellec, M, Breau, S, Joulie, A, Fisher, P, Gohier, S, Croisier‐bertin, D, Ogoudjobi, S, Brochier, C, Thoirain‐galvan, V, Le Cam, M, Chalouni, M, Conte, V, Dequae‐merchadou, L, Desvallees, M, Gilbert, C, Gillet, S, Knight, R, Lemboub, T, Michel, L, Mora, M, Protopopescu, C, Roux, P, Tezkratt, S, Ramier, C, Sow, A, Bureau, M, Trimoulet, P, Izopet, J, Serfaty, L, Paradis, V, Spire, B, Valantin, V., Chas, J, Zaegel‐faucher, O, Barange, K, Naqvi, A, Rosenthal, E, Bicart‐see, A, Bouchaud, O, Gervais, A, Lascoux‐combe, C, Goujard, C, Lacombe, K, Duvivier, C, Neau, D, Morlat, P, Bani‐sadr, F, Meyer, L, Boufassa, F, Autran, B, Roque, A.M, Solas, C, Fontaine, H, Costagliola, D, Piroth, L, Simon, A, Zucman, D, Boué, F, Miailhes, P, Billaud, E, Aumaître, H, Rey, D, Peytavin, G, Petrov‐sanchez, V, Levier, A, Usubillaga, R., Terris, B, Tremeaux, P, Katlama, C, Stitou, H, Cacoub, P, Nafissa, S, Benhamou, Y, Charlotte, F, Fourati, S, Poizot‐martin, I, Zaegel, O, Laroche, H, Tamalet, C, Callard, P, Bendjaballah, F, Amiel, C, Le Pendeven, C, Marchou, B, Alric, L, Metivier, S, Selves, J, Larroquette, F, Rio, V, Haudebourg, J, Saint‐paul, M.C, de Monte, A, Giordanengo, V, Partouche, C, Martin, A, Ziol, M, Baazia, Y, Iwaka‐bande, V, Gerber, A, Uzan, M, Garipuy, D, Ferro‐collados, M.J, Nicot, F, Yazdanpanah, Y, Adle‐biassette, H, Alexandre, G, Molina, J.M, Bertheau, P, Chaix, M.L, Delaugerre, C, Maylin, S, Bottero, J, Krause, J, Girard, P.M, Wendum, D, Cervera, P, Adam, J, Viala, C, Vittecocq, D, Quertainmont, Y, Teicher, E, Pallier, C, Lortholary, O, Rouzaud, C, Lourenco, J, Touam, F, Louisin, C, Avettand‐fenoel, V, Gardiennet, E, Mélard, A, Ochoa, A, Blanchard, E, Castet‐lafarie, S, Cazanave, C, Malvy, D, Dupon, M, Dutronc, H, Dauchy, F, Lacaze‐buzy, L, Desclaux, A, Bioulac‐sage, P, Reigadas, S, Lacoste, D, Bonnet, F, Bernard, N, Hessamfar, M, Paccalin, J.F, Martell, C, Pertusa, M.C, Vandenhende, M, Mercié, P, Pistone, T, Receveur, M.C, Méchain, M, Duffau, P, Rivoisy, C, Faure, I, Caldato, S, Bellecave, P, Tumiotto, C, Pellegrin, J.L, Viallard, J.F, Lazzaro, E, Greib, C, Majerholc, C, Brollo, M, Farfour, E, Polo Devoto, J, Kansau, I, Chambrin, V, Pignon, C, Berroukeche, L, Fior, R, Martinez, V, Favier, M, Deback, C, Lévy, Y, Dominguez, S, Lelièvre, J.D, Lascaux, A.S, Melica, G, Raffi, F, Allavena, C, Reliquet, V, Boutoille, D, Biron, C, Lefebvre, M, Hall, N, Bouchez, S, Rodallec, A, Le Guen, L, Hemon, C, Peyramond, D, Chidiac, C, Ader, F, Biron, F, Boibieux, A, Cotte, L, Ferry, T, Perpoint, T, Koffi, J, Zoulim, F, Bailly, F, Lack, P, Maynard, M, Radenne, S, Amiri, M, Valour, F, Augustin‐normand, C, Scholtes, C, Le‐thi, T.T, Chavanet, P, Duong van Huyen, M, Buisson, M, Waldner‐combernoux, A, Mahy, S, Salmon Rousseau, A, Martins, C, Galim, S, Lambert, D, Nguyen, Y, Berger, J.L, Hentzien, M, Brodard, V, Partisani, M, Batard, M.L, Cheneau, C, Priester, M, Bernard‐henry, C, de Mautort, E, Fischer, P, Gantner, P, Fafi‐kremer, S, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des sciences de la santé publique [Marseille] (ISSPAM), Team MORPH3EUS (INSERM U1219 - UB - ISPED), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Bordeaux [Bordeaux], Hôpital Cochin [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), ANRS CO13 HEPAVIH Study Group: F Roustant, P Platterier, I Kmiec, L Traore, S Lepuil, S Parlier, V Sicart-Payssan, E Bedel, S Anriamiandrisoa, C Pomes, M Mole, C Bolliot, P Catalan, M Mebarki, A Adda-Lievin, P Thilbaut, Y Ousidhoum, F Z Makhoukhi, O Braik, R Bayoud, C Gatey, M P Pietri, V Le Baut, R Ben Rayana, D Bornarel, C Chesnel, D Beniken, M Pauchard, S Akel, C Lions, A Ivanova, A-S Ritleg, C Debreux, L Chalal, J Zelie, H Hue, A Soria, M Cavellec, S Breau, A Joulie, P Fisher, S Gohier, D Croisier-Bertin, S Ogoudjobi, C Brochier, V Thoirain-Galvan, M Le Cam, M Chalouni, V Conte, L Dequae-Merchadou, M Desvallees, C Gilbert, S Gillet, R Knight, T Lemboub, L Michel, M Mora, C Protopopescu, P Roux, S Tezkratt, C Ramier, A Sow, M Bureau, P Trimoulet, J Izopet, L Serfaty, V Paradis, B Spire, Valantin, J Chas, O Zaegel-Faucher, K Barange, A Naqvi, E Rosenthal, A Bicart-See, O Bouchaud, A Gervais, C Lascoux-Combe, C Goujard, K Lacombe, C Duvivier, D Neau, P Morlat, F Bani-Sadr, L Meyer, F Boufassa, B Autran, A M Roque, C Solas, H Fontaine, D Costagliola, L Piroth, A Simon, D Zucman, F Boué, P Miailhes, E Billaud, H Aumaître, D Rey, G Peytavin, V Petrov-Sanchez, A Levier, R Usubillaga, B Terris, P Tremeaux, C Katlama, H Stitou, P Cacoub, S Nafissa, Y Benhamou, F Charlotte, S Fourati, I Poizot-Martin, O Zaegel, H Laroche, C Tamalet, P Callard, F Bendjaballah, C Amiel, C Le Pendeven, B Marchou, L Alric, S Metivier, J Selves, F Larroquette, V Rio, J Haudebourg, M C Saint-Paul, A De Monte, V Giordanengo, C Partouche, A Martin, M Ziol, Y Baazia, V Iwaka-Bande, A Gerber, M Uzan, D Garipuy, M J Ferro-Collados, J Selves, F Nicot, Y Yazdanpanah, H Adle-Biassette, G Alexandre, J M Molina, P Bertheau, M L Chaix, C Delaugerre, S Maylin, J Bottero, J Krause, P M Girard, D Wendum, P Cervera, J Adam, C Viala, D Vittecocq, Y Quertainmont, E Teicher, C Pallier, O Lortholary, C Rouzaud, J Lourenco, F Touam, C Louisin, V Avettand-Fenoel, E Gardiennet, A Mélard, A Ochoa, E Blanchard, S Castet-Lafarie, C Cazanave, D Malvy, M Dupon, H Dutronc, F Dauchy, L Lacaze-Buzy, A Desclaux, P Bioulac-Sage, S Reigadas, D Lacoste, F Bonnet, N Bernard, M Hessamfar, J F Paccalin, C Martell, M C Pertusa, M Vandenhende, P Mercié, D Malvy, T Pistone, M C Receveur, M Méchain, P Duffau, C Rivoisy, I Faure, S Caldato, P Bioulac-Sage, S Reigadas, P Bellecave, C Tumiotto, J L Pellegrin, J F Viallard, E Lazzaro, C Greib, P Bioulac-Sage, S Reigadas, C Majerholc, M Brollo, E Farfour, J Polo Devoto, I Kansau, V Chambrin, C Pignon, L Berroukeche, R Fior, V Martinez, M Favier, C Deback, Y Lévy, S Dominguez, J D Lelièvre, A S Lascaux, G Melica, F Raffi, C Allavena, V Reliquet, D Boutoille, C Biron, M Lefebvre, N Hall, S Bouchez, A Rodallec, L Le Guen, C Hemon, D Peyramond, C Chidiac, F Ader, F Biron, A Boibieux, L Cotte, T Ferry, T Perpoint, J Koffi, F Zoulim, F Bailly, P Lack, M Maynard, S Radenne, M Amiri, F Valour, J Koffi, F Zoulim, F Bailly, P Lack, M Maynard, S Radenne, C Augustin-Normand, C Scholtes, T T Le-Thi, P Chavanet, M Duong Van Huyen, M Buisson, A Waldner-Combernoux, S Mahy, A Salmon Rousseau, C Martins, S Galim, D Lambert, Y Nguyen, J L Berger, M Hentzien, V Brodard, M Partisani, M L Batard, C Cheneau, M Priester, C Bernard-Henry, E de Mautort, P Fischer, P Gantner, S Fafi-Kremer, Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], Statistics In System biology and Translational Medicine (SISTM), Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)- Bordeaux population health (BPH), and Malbec, Odile
Subjects: 0303 health sciences, Hepatology, business.industry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Human immunodeficiency virus (HIV), MEDLINE, Physical activity, medicine.disease_cause, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, Virology, Medicine, 030211 gastroenterology & hepatology, business, Eating behaviour, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Clinical psychology
Abstract: International audience; No abstract available
Published: 2021

11. First cases of Omicron in France are exhibiting mild symptoms, November 2021–January 2022

Author: Andrieu, A., Broustal, O., Chene, S., Chent, S., Fougère, E., Gbaguidi, G., Hamidouche, M., Lamy, A., Mano, Q., Mastrovito, B., Mercier, A., Modenesi, G., Picard, G., Prudhomme, J., Rapilly, F., Riondel, A., Rivière, M., Villegas Ramirez, B., Zhu-Soubise, A., Zurbaran, M., Amzert, A., Andreoletti, L., Bal, A., Beaurepere, R., Behillil, S., Belec, L., Bernard, C., Bocket, L., Bouri, L., Bourlet, T., Bressollette-Bodin, C., Brichler, S., Brugerolles, C., Cado, S., Calvez, V., Capron, N., Castelain, S., Castro-Alvarez, J., Chaix, M.-L., Charpentier, C., Che, D., Chillou, C., Colson, P., Coudene, P., Crinquette, A., De Rougemont, A., Delagrèverie, H., Delamare, C., Denecker-Berardino, T., Descamps, D., Desroches, M., Destras, G., Dos Santos, G., Ducancelle, A., Ducreux, S., Duret, T., Enouf, V., Fafi-Kremer, S., Felici, C., Fourati, S., Fournier, P.-E., Gaudy, C., Germain, H., Giordanengo, V., Gorge, O., Haim-Boukobza, S., Henquell, C., Holstein, A., Houhamdi, L., Izopet, J., Jacomo, V., Jacques, A., Jaffar-Bandjee, M.-C., Jimenez, M., Josset, L., Kemeny, S., Lafon, M.-E., Le Bars, A., Le Corguille, G., Lepiller, Q., Levasseur, A., Leveque, N., Lina, B., Madelaine, C., Malabat, C., Marque-Juillet, S., Martin-Dunavit, T., Mavingui, P., Merens, A., Messak, I., Morand-Joubert, L., Naudot, X., Neybecker, P., Pawlotsky, J.-M., Pilorge, L., Plantier, J.-C., Poggi, C., Pretet, M., Ragot, C., Raoul, H., Rogez, S., Roque-Afonso, A.-M., Roquebert, B., Rousset, D., Rozenberg, F., Sagot, C., Sahnoune, S., Salgado, D., Sand, O., Saudemont, C., Schvoerer, E., Simon-Loriere, E., Stephan, R., Sudour, J., Thibault, V., Tuaillon, E., Vabret, A., Vallee, E., Van Der Werf, S., Van Helden, J., Verdurme, L., Vignola, A., Wilkinson, D., Yazdanpanah, Y., Maisa, A., Spaccaferri, G., Fournier, L., Schaeffer, J., Deniau, J., Rolland, P., and Coignard, B.
Published: 2022
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12. No increased risk of Kaposi sarcoma relapse in patients with controlled HIV‐1 infection after switching protease inhibitor‐based antiretroviral therapy

Author: Lajaunie, Rébecca, Cuzin, Lise, Palich, Romain, Makinson, Alain, Bani-Sadr, Firouzé, Duvivier, Claudine, Arvieux, Cedric, Rey, David, Poizot-Martin, Isabelle, Delpierre, Cyril, Delobel, Pierre, Martin-Blondel, Guillaume, Chirouze, C., Drobacheff-Thiébaut, C., Foltzer, A., Bouiller, K., Hustache- Mathieu, L., Lepiller, Q., Bozon, F., Babre, O, Brunel, As., Muret, P., Chevalier, E., Jacomet, C., Laurichesse, H., Lesens, O., Vidal, M., Mrozek, N., Aumeran, C., Baud, O., Corbin, V., Goncalvez, E., Mirand, A, Brebion, A, Henquell, C, Lamaury, I., Fabre, I., Curlier, E., Ouissa, R., Herrmann-Storck, C., Tressieres, B., Receveur, Mc., Boulard, F., Daniel, C., Clavel, C., Roger, Pm., Markowicz, S., Chellum Rungen, N., Merrien, D., Perré, P., Guimard, T., Bollangier, O., Leautez, S., Morrier, M., Laine, L., Boucher, D., Point, P., Cotte, L., Ader, F., Becker, A., Boibieux, A., Brochier, C., Brunel-Dalmas, F., Cannesson, O., Chiarello, P., Chidiac, C., Degroodt, S., Ferry, T., Godinot, M., Livrozet, J.M., Makhloufi, D., Miailhes, P., Perpoint, T., Perry, M., Pouderoux, C., Roux, S., Triffault-Fillit, C., Valour, F., Charre, C., Icard, V., Tardy, J.C., Trabaud, M.A., Ravaux, I., Ménard, A., Belkhir, Ay., Colson, P., Dhiver, C., Madrid, A., Martin-Degioanni, M., Meddeb, L., Mokhtari, M., Motte, A., Raoux, A., Toméi, C., Tissot-Dupont, H., Poizot-Martin, I., Brégigeon, S., Zaegel-Faucher, O., Obry-Roguet, V., Laroche, H, Orticoni, M., Soavi, M.J., Ressiot, E., Ducassou, M.J., Jaquet, I., Galie, S., Colson, H., Ritleng, A.S., Ivanova, A., Debreux, C., Lions, C., Rojas-Rojas, T, Cabié, A., Abel, S., Bavay, J., Bigeard, B., Cabras, O., Cuzin, L., Dupin de Majoubert, R., Fagour, L., Guitteaud, K., Marquise, A., Najioullah, F., Pierre-François, S., Pasquier, J., Richard, P., Rome, K., Turmel, Jm, Varache, C., Atoui, N., Bistoquet, M., Delaporte, E, Le Moing, V., Makinson, A., Meftah, N., Merle de Boever, C., Montes, B., Montoya Ferrer, A., Tuaillon, E., Reynes, J., Lefèvre, B., Jeanmaire, E., Hénard, S., Frentiu, E., Charmillon, A., Legoff, A., Tissot, N., André, M., Boyer, L., Bouillon, Mp., Delestan, M., Goehringer, F., Bevilacqua, S., Rabaud, C., May, T., Raffi, F., Allavena, C., Aubry, O., Billaud, E., Biron, C., Bonnet, B., Bouchez, S., Boutoille, D., Brunet-Cartier, C., Deschanvres, C., Gaborit, B.J., Grégoire, A., Grégoire, M., Grossi, O., Guéry, R., Jovelin, T., Lefebvre, M., Le Turnier, P., Lecomte, R., Morineau, P., Reliquet, V., Sécher, S., Cavellec, M., Paredes, E., Soria, A., Ferré, V., André-Garnier, E., Rodallec, A., Pugliese, P., Breaud, S., Ceppi, C., Chirio, D., Cua, E., Dellamonica, P., Demonchy, E., de Monte, A., Durant, J., Etienne, C., Ferrando, S., Garraffo, R., Michelangeli, C., Mondain, V., Naqvi, A., Oran, N., Perbost, I., Carles, M., Klotz, C., Maka, A., Pradier, C., Prouvost-Keller, B., Risso, K., Rio, V., Rosenthal, E., Touitou, I., Wehrlen-Pugliese, S., Zouzou, G., Hocqueloux, L., Prazuck, T., Gubavu, C., Sève, A., Giaché, S., Rzepecki, V., Colin, M., Boulard, C., Thomas, G., Cheret, A., Goujard, C., Quertainmont, Y., Teicher, E., Lerolle, N., Jaureguiberry, S., Colarino, R., Deradji, O., Castro, A., Barrail-Tran, A., Yazdanpanah, Y., Landman, R., Joly, V., Ghosn, J., Rioux, C., Lariven, S., Gervais, A., Lescure, Fx., Matheron, S., Louni, F., Julia, Z., Le Gac, S., Charpentier, C., Descamps, D., Peytavin, G., Duvivier, C., Aguilar, C., Alby-Laurent, F., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G., Bossi, P., Cessot, G., Charlier, C., Consigny, P.H., Jidar, K., Lafont, E., Lanternier, F., Leporrier, J., Lortholary, O., Louisin, C., Lourenco, J., Parize, P., Pilmis, B., Rouzaud, C., Touam, F., Valantin, Ma., Tubiana, R., Agher, R., Seang, Sophie, Schneider, L., Palich, R., Blanc, C., Katlama, C., Bani-Sadr, F., Berger, Jl., N’guyen, Y., Lambert, D., Kmiec, I., Hentzien, M., Brunet, A., Romaru, J., Marty, H., Brodard, V., Arvieux, C., Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat-Delon, S., Chapplain, J.M., Benezit, F., Dupont, M., Poinot, M., Maillard, A., Pronier, C., Lemaitre, F., Morlat, C., Poisson-Vannier, M., Sinteff, Jp., Gagneux-Brunon, A., Botelho-Nevers, E., Frésard, A., Ronat, V., Lucht, F., Rey, D., Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M., Batard, Ml., Mélounou, C, Bernard-Henry, C., de Mautort, E., Fafi-Kremer, S., Delobel, P., Alvarez, M., Biezunski, N., Debard, A., Delpierre, C., Gaube, G., Lansalot, P., Lelièvre, L., Marcel, M., Martin-Blondel, G., Piffaut, M., Porte, L., Saune, K., Robineau, O., Ajana, F., Aïssi, E., Alcaraz, I., Alidjinou, E., Baclet, V., Bocket, L., Boucher, A., Digumber, M., Huleux, T., Lafon-Desmurs, B., Meybeck, A., Pradier, M., Tetart, M., Thill, P., Viget, N., Valette, M., Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU de la Martinique [Fort de France], Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Strasbourg, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse III Paul Sabatier - Faculté de médecine Purpan (UTPS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), And The Dat’AIDS study group: C Chirouze, C Drobacheff-Thiébaut, A Foltzer, K Bouiller, L Hustache-Mathieu, Q Lepiller, F Bozon, O Babre, A S Brunel, P Muret, E Chevalier, C Jacomet, H Laurichesse, O Lesens, M Vidal, N Mrozek, C Aumeran, O Baud, V Corbin, E Goncalvez, A Mirand, A Brebion, C Henquell, I Lamaury, I Fabre, E Curlier, R Ouissa, C Herrmann-Storck, B Tressieres, M C Receveur, F Boulard, C Daniel, C Clavel, P M Roger, S Markowicz, N Chellum Rungen, D Merrien, P Perré, T Guimard, O Bollangier, S Leautez, M Morrier, L Laine, D Boucher, P Point, L Cotte, F Ader, A Becker, A Boibieux, C Brochier, F Brunel-Dalmas, O Cannesson, P Chiarello, C Chidiac, S Degroodt, T Ferry, M Godinot, J M Livrozet, D Makhloufi, P Miailhes, T Perpoint, M Perry, C Pouderoux, S Roux, C Triffault-Fillit, F Valour, C Charre, V Icard, J C Tardy, M A Trabaud, I Ravaux, A Ménard, A Y Belkhir, P Colson, C Dhiver, A Madrid, M Martin-Degioanni, L Meddeb, M Mokhtari, A Motte, A Raoux, C Toméi, H Tissot-Dupont, I Poizot-Martin, S Brégigeon, O Zaegel-Faucher, V Obry-Roguet, H Laroche, M Orticoni, M J Soavi, E Ressiot, M J Ducassou, I Jaquet, S Galie, H Colson, A S Ritleng, A Ivanova, C Debreux, C Lions, T Rojas-Rojas, A Cabié, S Abel, J Bavay, B Bigeard, O Cabras, L Cuzin, R Dupin de Majoubert, L Fagour, K Guitteaud, A Marquise, F Najioullah, S Pierre-François, J Pasquier, P Richard, K Rome, J M Turmel, C Varache, N Atoui, M Bistoquet, E Delaporte, V Le Moing, A Makinson, N Meftah, C Merle de Boever, B Montes, A Montoya Ferrer, E Tuaillon, J Reynes, B Lefèvre, E Jeanmaire, S Hénard, E Frentiu, A Charmillon, A Legoff, N Tissot, M André, L Boyer, M P Bouillon, M Delestan, F Goehringer, S Bevilacqua, C Rabaud, T May, F Raffi, C Allavena, O Aubry, E Billaud, C Biron, B Bonnet, S Bouchez, D Boutoille, C Brunet-Cartier, C Deschanvres, B J Gaborit, A Grégoire, M Grégoire, O Grossi, R Guéry, T Jovelin, M Lefebvre, P Le Turnier, R Lecomte, P Morineau, V Reliquet, S Sécher, M Cavellec, E Paredes, A Soria, V Ferré, E André-Garnier, A Rodallec, P Pugliese, S Breaud, C Ceppi, D Chirio, E Cua, P Dellamonica, E Demonchy, A De Monte, J Durant, C Etienne, S Ferrando, R Garraffo, C Michelangeli, V Mondain, A Naqvi, N Oran, I Perbost, M Carles, C Klotz, A Maka, C Pradier, B Prouvost-Keller, K Risso, V Rio, E Rosenthal, I Touitou, S Wehrlen-Pugliese, G Zouzou, L Hocqueloux, T Prazuck, C Gubavu, A Sève, S Giaché, V Rzepecki, M Colin, C Boulard, G Thomas, A Cheret, C Goujard, Y Quertainmont, E Teicher, N Lerolle, S Jaureguiberry, R Colarino, O Deradji, A Castro, A Barrail-Tran, Y Yazdanpanah, R Landman, V Joly, J Ghosn, C Rioux, S Lariven, A Gervais, F X Lescure, S Matheron, F Louni, Z Julia, S Le Gac, C Charpentier, D Descamps, G Peytavin, C Duvivier, C Aguilar, F Alby-Laurent, K Amazzough, G Benabdelmoumen, P Bossi, G Cessot, C Charlier, P H Consigny, K Jidar, E Lafont, F Lanternier, J Leporrier, O Lortholary, C Louisin, J Lourenco, P Parize, B Pilmis, C Rouzaud, F Touam, M A Valantin, R Tubiana, R Agher, S Seang, L Schneider, R Palich, C Blanc, C Katlama, F Bani-Sadr, J L Berger, Y N'Guyen, D Lambert, I Kmiec, M Hentzien, A Brunet, J Romaru, H Marty, V Brodard, C Arvieux, P Tattevin, M Revest, F Souala, M Baldeyrou, S Patrat-Delon, J M Chapplain, F Benezit, M Dupont, M Poinot, A Maillard, C Pronier, F Lemaitre, C Morlat, M Poisson-Vannier, T Jovelin, J P Sinteff, A Gagneux-Brunon, E Botelho-Nevers, A Frésard, V Ronat, F Lucht, D Rey, P Fischer, M Partisani, C Cheneau, M Priester, M L Batard, C Mélounou, C Bernard-Henry, E de Mautort, S Fafi-Kremer, P Delobel, M Alvarez, N Biezunski, A Debard, C Delpierre, G Gaube, P Lansalot, L Lelièvre, M Marcel, G Martin-Blondel, M Piffaut, L Porte, K Saune, O Robineau, F Ajana, E Aïssi, I Alcaraz, E Alidjinou, V Baclet, L Bocket, A Boucher, M Digumber, T Huleux, B Lafon-Desmurs, A Meybeck, M Pradier, M Tetart, P Thill, N Viget, M Valette, Malbec, Odile, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Rennes (CHU Rennes), Laboratoire de Physique des Lasers (LPL), Université Paris 13 (UP13)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sorbonne Paris Nord, Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Institut des sciences de la santé publique [Marseille] (ISSPAM), European Infective Endocarditis Registry (Euro-Endo), EMERGEN consortium, Stratégies thérapeutiques contre l'infection VIH et les maladies virales associées [iPLesp] (THERAVIR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)
Subjects: medicine.medical_specialty, MESH: CD4 Lymphocyte Count, [SDV]Life Sciences [q-bio], antiretroviral therapy, Human immunodeficiency virus (HIV), protease inhibitors, HIV Infections, medicine.disease_cause, MESH: HIV-1, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), MESH: Neoplasm Recurrence, Local / complications, Internal medicine, medicine, Humans, HHV8, MESH: HIV Infections* / complications, MESH: Protease Inhibitors / adverse effects, Pharmacology (medical), Protease inhibitor (pharmacology), Sarcoma, Kaposi, Retrospective Studies, MESH: Humans, business.industry, Health Policy, Kaposi sarcoma, MESH: Retrospective Studies, Viral Load, MESH: HIV Infections* / drug therapy, medicine.disease, Antiretroviral therapy, switch, CD4 Lymphocyte Count, AIDS, [SDV] Life Sciences [q-bio], Regimen, Infectious Diseases, Increased risk, MESH: Sarcoma, Kaposi* / drug therapy, HIV-1, Sarcoma, Neoplasm Recurrence, Local, business, MESH: Viral Load, Viral load
Abstract: International audience; Objectives: Our aim was to assess if switching from a protease inhibitors (PI)-based regimen to a PI-free one is associated with an increased risk of Kaposi Sarcoma (KS) relapse among patients living with HIV (PLHIV) with history of KS and controlled HIV replication.Methods: In a retrospective analysis of the prospectively collected Dat'AIDS database we selected patients who both had a past KS history and a HIV-1 viral load below 200 copies/mL while being PI-treated. We searched for KS relapses while persistent virological success was maintained for at least 6 months, whether patients kept taking the PI, or switched to PI-free regimen.Results: Among the 216 patients with past KS event and a history of HIV-1 infection efficiently treated by a PI-based regimen, 148 patients (68.5%) later switched to a PI-sparing regimen. Their baseline characteristics were not different from non-switching patients. We described 7 cases of relapse (3.2% of the 216 patients). Five cases of relapse occurred in switching patients (3.4%). The remaining two relapses occurred in PI-treated patients (2.9%). At KS relapse, CD4 cell count was 459 cells/μL (range 225-560) for switching patients, compared with 362 and 136 cells/μL for the other two patients.Conclusions: In this large cohort of PLHIV with a history of KS and ART-controlled HIV replication, KS relapses were described in 3.2% of the patients, and were not more frequent when a PI-containing ART regimen has been switched to a PI-free regimen. Our results do not support a specific effect of PI on KS.
Published: 2022

13. Efficacy and safety of dolutegravir and rilpivirine dual therapy as a simplification strategy: a cohort study

Author: Gantner, P, Cuzin, L, Allavena, C, Cabie, A, Pugliese, P, Valantin, M‐A, Bani‐Sadr, F, Joly, V, Ferry, T, Poizot‐Martin, I, Garraffo, R, Peytavin, G, Fafi‐Kremer, S, Rey, D, Billaud, E., Biron, C., Bonnet, B., Bouchez, S., Boutoille, D., Brunet, C., Jovelin, T., Hall, N., Bernaud, C., Morineau, P., Reliquet, V., Aubry, O., Point, P., Besnier, M., Grossi, O., Lefebvre, M., Hüe, H., Cavellec, M., Soria, A., Pineau, S., André‐Garnier, E., Rodallec, A., Brégigeon, S., Faucher, O., Obry‐Roguet, V., Orticoni, M., Soavi, M. J., Luquet‐Besson, I., Ressiot, E., Pinot, I., Ducassou, M. J., Bertone, H., Gallie, S., Trijau, S., Ritleng, A. S., Ivanova, A., Guignard, M., Blanco‐Betancourt, C., Alvarez, M., Biezunski, N., Debard, A., Delobel, P., Delpierre, C., Fourcade, C., Marchou, B., Martin‐Blondel, G., Porte, L., Mularczyk, M., Garipuy, D., Saune, K., Lepain, I., Marcel, M., Puntis, E., Ceppi, C., Cua, E., Cottalorda, J., Dellamonica, P., Demonchy, E., Dunais, B., Durant, J., Etienne, C., Ferrando, S., Fuzibet, J. G., Risso, K., Mondain, V., Naqvi, A., Oran, N., Perbost, I., Pillet, S., Prouvost‐Keller, B., Pradier, C., Wehrlen‐Pugliese, S., Rosenthal, E., Sausse, S., Roger, P. M., Choisy, Ph., Vandame, S., Huleux, Th., Ajana, F., Alcaraz, I., Baclet, V., Huleux, T. H., Melliez, H., Viget, N., Valette, M., Aissi, E., Allienne, Ch., Meybeck, A., Riff, B., Agher, R., Katlama, C., Duvivier, C., Yazdanpanah, Y., Landman, R., Mackoumbou‐Nkouka, C., Louni, F., Julia, Z., Charpentier, C., Descamps, D., Cotte, L., Peyramond, D., Chidiac, C., Ader, F., Biron, F., Boibieux, A., Miailhes, P., Perpoint, T., Schlienger, I., Dahoud, F., Lippmann, J., Braun, E., Koffi, J., Longuet, C., Guéripel, V., Augustin‐Normand, C., Degroodt, S., Batard, M. L., Bernard‐Henry, C., Cheneau, C., de Mautort, E., Fischer, P., Partisani, M., Priester, M., Bani‐Sadr, F., Rouger, C., Berger, J. L., NʼGuyen, Y., Lambert, D., Kmiec, I., Hentzien, M., and Lebrun, D.
Published: 2017
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14. Évolution de l’immunité cellulaire et humorale anti-SARS-CoV-2 après 3 doses de vaccins chez des patients traités par rituximab

Author: Felten, R., primary, Gallais, F., additional, Schleiss, C., additional, Chatelus, E., additional, Javier, R.M., additional, Pijnenburg, L., additional, Sordet, C., additional, Sibilia, J., additional, Arnaud, L., additional, Fafi-Kremer, S., additional, and Gottenberg, J.E., additional
Published: 2021
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15. Direct, indirect and total effect of HIV coinfection on the risk of non-liver-related cancer in hepatitis C virus-infected patients treated by direct-acting antivirals: a mediation analysis: a mediation analysis

Author: Chalouni, M. (Mathieu), Pol, S. (Stanislas), Sogni, P. (Philippe), Fontaine, H. (Helene), Lacombe, K. (Karine), Lacombe, J. (Jean-Marc) M. (M), Esterle, L. (Laure), Dorival, C. (Céline), Bourlière, M. (Marc), Bani-Sadr, F. (Firouzé), de Ledinghen, V. (Victor), Zucman, D. (David), Larrey, D. (Dominique), Salmon, D. (Dominique), Carrat, F. (Fabrice), Wittkop, L. (Linda), Rey, D. (D), Partisani, M., Batard, M.L., Cheneau, C., Priester, M. (M), Bernard-Henry, C., De Mautort, E., Gantner, P. (Pierre), Fafi-Kremer, S. (Samira), Habersetzer, F. (Francois), Baumert, Thomas F., Doffoel, M. (Michel), Mutter, C. (Catherine), Simo-Noumbissie, P. (Pauline), and Razi, E. (Esma)
Subjects: Aucun
Abstract: OBJECTIVES: HIV-coinfected patients experience higher incidences of non-liver-related cancers than HCV-monoinfected patients. Chronic inflammation, immunosuppression, but also higher tobacco or alcohol consumption and metabolic dysregulation could explain this higher risk. We aimed to estimate the direct, indirect and total effects of HIV coinfection on the risk of non-liver-related cancers in HCV participants treated with direct-acting antivirals (DAAs). METHODS: Up to four HCV-monoinfected participants from the ANRS CO22 HEPATHER cohort were matched by age and sex to HIV/HCV-coinfected participants from the ANRS CO13 HEPAVIH cohort. Participants were followed from DAA initiation until the occurrence of a non-liver-related cancer. Counterfactual mediation analysis was carried out to estimate the direct (chronic inflammation and immunosuppression), indirect (tobacco and alcohol consumption and metabolic syndrome) and total effect of HIV coinfection on the risk of non-liver-related cancers. RESULTS: 548 HIV/HCV-coinfected and 2016 monoinfected participants were included. Overall, HIV coinfection was associated with a 3.7-fold [95% confidence interval (CI): 1.7-7.0] higher risk of non-liver-related cancers in HCV participants. This increased risk was explained by significant direct effect [hazard ratio (HR) = 3.4, 95% CI: 1.7-6.6] but not indirect effect (HR = 1.1, 95% CI: 0.8-1.5) of HIV coinfection. CONCLUSIONS: In HCV participants treated with DAAs, the direct effect of HIV coinfection, reflecting chronic inflammation and immunosuppression, was associated with a 3.7-fold higher risk of non-liver-related cancer. By contrast, the indirect effect of HIV coinfection, reflecting higher tobacco and alcohol consumption and metabolic dysregulation, was not significantly associated with the risk of non-liver-related cancers.
Published: 2021

16. No barrier to care, yet disparities in the HIV care continuum in France: a nationwide population study

Author: Cuzin, Lise, Allavena, Clotilde, Cotte, Laurent, Delpierre, Cyrille, Huleux, Thomas, Palich, Romain, Delobel, Pierre, Raffi, François, Cabié, André, Drobacheff-Thiébaut, C, Foltzer, A, Bouiller, K, Hustache- Mathieu, L, Chirouze, C, Lepiller, Q, Bozon, F, Babre, O, Brunel, L, Muret (Besançon), P, Laurichesse, H, LESENS, O, Vidal, M, Mrozek, N, Aumeran, C, Baud, O, Corbin, V, Letertre-Gibert, P, Casanova, S, Prouteau, J, Jacomet (Clermont Ferrand), C, Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Herrmann-Storck, C, Tressieres, B, Bonijoly, T, Receveur, M., Boulard, F, Daniel, C, Clavel (Guadeloupe), C, Merrien, D, Perré, P, Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Laine (La Roche sur Yon), L, Ader, F, Becker, A, Biron, F, Boibieux, A, FERRY, T, Miailhes, P, Perpoint, T, Roux, Stéphane, Triffault-Fillit, C, Degroodt, S, Brochier, C, Valour, F, Chidiac (Lyon), C, Ménard, A, Belkhir, A., Colson, P, Dhiver, C, Madrid, A, Martin-Degiovani, M, Meddeb, L, Mokhtari, M, Motte, A, Raoux, A, Ravaux, I, Tamalet, C, Toméi, C, Tissot Dupont, H, Brégigeon, S, Zaegel-Faucher, O, Obry-Roguet, V, Laroche, H, Orticoni, M, Soavi, M., de Lamarlière, P Geneau, Ressiot, E, Ducassou, M., Jaquet, I, Galie, S, Galinier, A, Martinet, P, Landon, M, Ritleng, A., Ivanova, A, Debreux, C, Lions, C, Poizot-Martin (Marseille Ste Marguerite), I, Bigeard, B, Cabras, O, Guitteaud, K, Illiaquer, M, Marquise, A, Pierre-François, S, Pasquier, J, Rome, K, Turmel, J., Varache, C, Cabié (Martinique), A, Atoui, N, Bistoquet, M, Delaporte, E, Le Moing, V, Makinson, A, Meftah, N, de Boever, C Merle, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Tuaillon, E, Reynes (Montpellier), J, André, M, Boyer, L, Bouillon, M., Delestan, M, Rabaud, C, May, T, Hoen (Nancy), B, Bernaud, C, Billaud, E, Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D, Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Gaborti, B, Hall, N, Jovelin, T, Morineau, P, Reliquet, V, Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A, Ferré, V, André-Garnier, E, Rodallec, A, Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O, Raffi (Nantes), F, Pugliese, P, Breaud, S, Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P, Demonchy, E, De Monte, A, Durant, J, Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V, Naqvi, A, Oran, N, Perbost, I, Pillet, S, Pradier, C, Prouvost-Keller, B, Risso, K, Rio, V, Roger, P., Rosenthal, E, Sausse, S, Touitou, I, Wehrlen-Pugliese, S, Zouzou (Nice), G, Hocqueloux, L, Prazuck, T, Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C, Thomas, G, Botelho-Nevers, E, Gagneux-Brunon, A, Frésard, A, Ronat, V, Lucht, F, Fischer, P, Partisani, M, Cheneau, C, Priester, M, Batard, M., Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S, Rey, D, Alvarez, M, Biezunski, N, Debard, A, Lansalot, P, Lelièvre, L, Martin-Blondel, G, Piffaut, M, Porte, L, Saune, K, Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Choisy, P, Lafon-Desmurs, B, Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M, Yazdanpanah, Y, Landman, R, Duvivier, C, Valantin, M., Agher, R, Katlama, C, Flandre, P, Lortholary, O, Avettand-Fenoel, V, Rouzioux, C, Consigny, P., Cessot, G, Touam, F, Usubillaga, R, Benhadj, K, Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital Gustave Dron, Tourcoing], Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (EA 3181) (CEF2P / CARCINO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Infectious and Tropical Diseases, Nantes University Hospital, Nantes, France., CIC 1413, INSERM, Nantes, France., Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]
Subjects: Male, Microbiology (medical), media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], Human immunodeficiency virus (HIV), HIV Infections, medicine.disease_cause, Men who have sex with men, MESH: Homosexuality, Male, Sexual and Gender Minorities, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, Humans, Pharmacology (medical), Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Homosexuality, Homosexuality, Male, Prospective cohort study, media_common, Pharmacology, 030505 public health, MESH: Humans, business.industry, MESH: HIV Infections, Continuity of Patient Care, Place of birth, Care Continuum, MESH: Male, MESH: Prospective Studies, 3. Good health, MESH: France, MESH: Sexual and Gender Minorities, MESH: Continuity of Patient Care, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Population study, Female, France, 0305 other medical science, business, Viral load, MESH: Female, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Demography
Abstract: Objectives Even in an ‘optimal’ health system, patients’ characteristics may have an impact on their care. We investigated whether age, gender and place of birth have an impact in the HIV care continuum in France, a country with a universal free healthcare system. Methods We estimated differences in the 5 year restricted mean percentage of person-time spent (i) in care, (ii) receiving ART and (iii) on ART and virally suppressed among 2432 (30.2%) women, 3925 MSM (48.7%) and 1709 men who have sex with women (MSW; 21.2%) entering care in the Dat’AIDS French prospective cohort between 1 January 2013 and 31 December 2017. Trial registration: Clinicaltrials.gov reference NCT02898987. Results Men and women spent 85.6% and 82.8% of person-time on ART and 69.9% and 65% suppressed, respectively. MSM, MSW and women spent 86.9%, 82.6% and 82.8% of person-time on ART and 72.5%, 63.7% and 65% suppressed, respectively. Patients born in France (47%) and patients born abroad spent 87.9% and 81.9% of person-time on ART and 74.6% and 62.9% suppressed, respectively. Young men born abroad were found to spend the smallest person-time with non-detectable viral load (53% for MSW and 58.1% for MSM). Conclusions Despite free access to care and universal ART in France, disparities remain in the HIV continuum care across age, country of birth and way of HIV acquisition. Clinical and public health interventions targeting specific patients’ conditions are needed.
Published: 2021

17. L’immunosuppression et le défaut d’immunogénicité des vaccins à ARNm limitent la protection des patients transplantés vaccinés selon le schéma standard : plaidoyer pour une 3e dose

Author: Charmetant, X., primary, Espi, M., additional, Benotmane, I., additional, Ovize, A., additional, Fafi-Kremer, S., additional, Caillard, S., additional, and Thaunat, O., additional
Published: 2021
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18. Connaissances de 3 pathologies vectorielles à tique auprès de médecins

Author: Delage, R., primary, Hansmann, Y., additional, Biry, M., additional, Panaget, B., additional, Koebel, C., additional, Gallais, F., additional, Wendling, M., additional, Velay, A., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2021
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19. Switching to emtricitabine, tenofovir and rilpivirine as single tablet regimen in virologically suppressed HIV-1-infected patients: a cohort study*

Author: Gantner, P, Reinhart, S, Partisani, M, Baldeyrou, M, Batard, M-L, Bernard-Henry, C, Cheneau, C, de Mautort, E, Priester, M, Fafi-Kremer, S, Muret, P, and Rey, D
Published: 2015
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20. VIRO-01 - Intérêt du test de diagnostic des virus respiratoires par PCR multiplex.

Author: Martin, C., Kessler, R., Fafi Kremer, S., Lepiller, Q., Christmann, D., Argemi, X., Lefebvre, N., Douiri, N., Baldeyrou, M., and Hansmann, Y.
Published: 2016
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21. Kinetics of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Antibody Response and Serological Estimation of Time Since Infection

Author: Pelleau, S, Woudenberg, T, Rosado, J, Donnadieu, F, Garcia, L, Obadia, T, Gardais, S, Elgharbawy, Y, Velay, A, Gonzalez, M, Nizou, JY, Khelil, N, Zannis, K, Cockram, C, Merkling, SH, Meola, A, Kerneis, S, Terrier, B, de Seze, J, Planas, D, Schwartz, O, Dejardin, F, Petres, S, von Platen, C, Pellerin, SF, Arowas, L, de Facci, LP, Duffy, D, Cheallaigh, CN, Dunne, J, Conlon, N, Townsend, L, Duong, V, Auerswald, H, Pinaud, L, Tondeur, L, Backovic, M, Hoen, B, Fontanet, A, Mueller, I, Fafi-Kremer, S, Bruel, T, White, M, Pelleau, S, Woudenberg, T, Rosado, J, Donnadieu, F, Garcia, L, Obadia, T, Gardais, S, Elgharbawy, Y, Velay, A, Gonzalez, M, Nizou, JY, Khelil, N, Zannis, K, Cockram, C, Merkling, SH, Meola, A, Kerneis, S, Terrier, B, de Seze, J, Planas, D, Schwartz, O, Dejardin, F, Petres, S, von Platen, C, Pellerin, SF, Arowas, L, de Facci, LP, Duffy, D, Cheallaigh, CN, Dunne, J, Conlon, N, Townsend, L, Duong, V, Auerswald, H, Pinaud, L, Tondeur, L, Backovic, M, Hoen, B, Fontanet, A, Mueller, I, Fafi-Kremer, S, Bruel, T, and White, M
Abstract: BACKGROUND: Infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) induces a complex antibody response that varies by orders of magnitude between individuals and over time. METHODS: We developed a multiplex serological test for measuring antibodies to 5 SARS-CoV-2 antigens and the spike proteins of seasonal coronaviruses. We measured antibody responses in cohorts of hospitalized patients and healthcare workers followed for up to 11 months after symptoms. A mathematical model of antibody kinetics was used to quantify the duration of antibody responses. Antibody response data were used to train algorithms for estimating time since infection. RESULTS: One year after symptoms, we estimate that 36% (95% range, 11%-94%) of anti-Spike immunoglobulin G (IgG) remains, 31% (95% range, 9%-89%) anti-RBD IgG remains, and 7% (1%-31%) of anti-nucleocapsid IgG remains. The multiplex assay classified previous infections into time intervals of 0-3 months, 3-6 months, and 6-12 months. This method was validated using data from a seroprevalence survey in France, demonstrating that historical SARS-CoV-2 transmission can be reconstructed using samples from a single survey. CONCLUSIONS: In addition to diagnosing previous SARS-CoV-2 infection, multiplex serological assays can estimate the time since infection, which can be used to reconstruct past epidemics.
Published: 2021

22. Multiplex assays for the identification of serological signatures of SARS-CoV-2 infection: an antibody-based diagnostic and machine learning study

Author: Rosado, J, Pelleau, S, Cockram, C, Merkling, SH, Nekkab, N, Demeret, C, Meola, A, Kerneis, S, Terrier, B, Fafi-Kremer, S, de Seze, J, Bruel, T, Dejardin, F, Petres, S, Longley, R, Fontanet, A, Backovic, M, Mueller, I, White, MT, Rosado, J, Pelleau, S, Cockram, C, Merkling, SH, Nekkab, N, Demeret, C, Meola, A, Kerneis, S, Terrier, B, Fafi-Kremer, S, de Seze, J, Bruel, T, Dejardin, F, Petres, S, Longley, R, Fontanet, A, Backovic, M, Mueller, I, and White, MT
Abstract: BACKGROUND: Infection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) induces an antibody response targeting multiple antigens that changes over time. This study aims to take advantage of this complexity to develop more accurate serological diagnostics. METHODS: A multiplex serological assay was developed to measure IgG and IgM antibody responses to seven SARS-CoV-2 spike or nucleoprotein antigens, two antigens for the nucleoproteins of the 229E and NL63 seasonal coronaviruses, and three non-coronavirus antigens. Antibodies were measured in serum samples collected up to 39 days after symptom onset from 215 adults in four French hospitals (53 patients and 162 health-care workers) with quantitative RT-PCR-confirmed SARS-CoV-2 infection, and negative control serum samples collected from healthy adult blood donors before the start of the SARS-CoV-2 epidemic (335 samples from France, Thailand, and Peru). Machine learning classifiers were trained with the multiplex data to classify individuals with previous SARS-CoV-2 infection, with the best classification performance displayed by a random forests algorithm. A Bayesian mathematical model of antibody kinetics informed by prior information from other coronaviruses was used to estimate time-varying antibody responses and assess the sensitivity and classification performance of serological diagnostics during the first year following symptom onset. A statistical estimator is presented that can provide estimates of seroprevalence in very low-transmission settings. FINDINGS: IgG antibody responses to trimeric spike protein (Stri) identified individuals with previous SARS-CoV-2 infection with 91·6% (95% CI 87·5-94·5) sensitivity and 99·1% (97·4-99·7) specificity. Using a serological signature of IgG and IgM to multiple antigens, it was possible to identify infected individuals with 98·8% (96·5-99·6) sensitivity and 99·3% (97·6-99·8) specificity. Informed by existing data from other coronaviruses, we estimate th
Published: 2021

23. National sentinel surveillance of transmitted drug resistance in antiretroviral-naive chronically HIV-infected patients in France over a decade: 2001–2011

Author: Descamps, Diane, Assoumou, Lambert, Chaix, Marie-Laure, Chaillon, Antoine, Pakianather, Sophie, de Rougemont, Alexis, Storto, Alexandre, Dos Santos, Georges, Krivine, Anne, Delaugerre, Constance, Montes, Brigitte, Izopet, Jacques, Charpentier, Charlotte, Wirden, Marc, Maillard, Anne, Morand-Joubert, Laurence, Pallier, Coralie, Plantier, Jean-Christophe, Guinard, Jérôme, Tamalet, Catherine, Cottalorda, Jacqueline, Marcelin, Anne-Geneviève, Desbois, Delphine, Henquell, Cecile, Calvez, Vincent, Brun-Vézinet, Françoise, Masquelier, Bernard, Costagliola, Dominique, Lagier, E., Roussel, C., Le Guillou-Guillemette, H., Alloui, C., Bettinger, D., Anies, G., Reigadas, S., Bellecave, P., Pinson-Recordon, P., Fleury, H., Masquelier, B., Vallet, S., Leroux, M., Dina, J., Vabret, A., Poveda, J. D., Mirand, A., Henquell, C., Bouvier-Alias, M., Noel, C., De Rougemont, A., Dos Santos, G., Yerly, S., Gaille, C., Caveng, W., Chapalay, S., Calmy, A., Signori-Schmuck, A., Morand, P., Pallier, C., Bocket, L., Mouna, L., Ranger-Rogez, S., André, P., Tardy, J. C., Trabaud, M. A., Tamalet, C., Delamare, C., Montes, B., Schvoerer, E., André-Garnier, E., Férré, V., Cottalorda, J., Guigon, A., Guinard, J., Descamps, D., Charpentier, C., Peytavin, G., Brun-Vézinet, F., Haim-Boukobza, S., Roques, A. M., Soulié, C., Lambert-Niclot, S., Malet, I., Wirden, M., Fourati, S., Marcelin, A. G., Calvez, V., Flandre, P., Assoumou, L., Costagliola, D., Morand-Joubert, L., Delaugerre, C., Schneider, V., Amiel, C., Giraudeau, G., Maillard, A., Plantier, J. C., Fafi-Kremer, S., Schmitt, M. P., Raymond, S., Izopet, J., Chaillon, A., Barin, F., and Marque Juillet, S.
Published: 2013
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24. Microelimination or Not? The Changing Epidemiology of Human Immunodeficiency Virus-Hepatitis C Virus Coinfection in France 2012-2018

Author: Pradat, Pierre, Chirouze, C, Drobacheff-Thiébaut, C, Foltzer, A, Bouiller, K, Hustache-Mathieu, L, Lepiller, Q, Bozon, F, Babre, O, Brunel, A, Muret, P, Chevalier, E, Jacomet, C, Laurichesse, H, LESENS, O, Vidal, M, Mrozek, N, Aumeran, C, Baud, O, Corbin, V, Goncalvez, E, Mirand, A, brebion, A, Henquell, C, Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Herrmann-Storck, C, Tressieres, B, Receveur, M, Boulard, F, Daniel, C, CLAVEL, C, Roger, P, Markowicz, S, Chellum Rungen, N, Merrien, D, Perré, P, Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Laine, L, Boucher, D, Point, P, Cotte, Laurent, Ader, F, Becker, A, Boibieux, A, Brochier, C, Brunel-Dalmas, F, Cannesson, O, Chiarello, P, Chidiac, C, Degroodt, S, FERRY, T, Godinot, M, Livrozet, J, Makhloufi, D, Miailhes, P, Perpoint, T, Perry, M, Pouderoux, C, Roux, Stéphane, Triffault-Fillit, C, Valour, F, Charre, C, Icard, V, Tardy, J, Trabaud, M, Ravaux, I, Ménard, A, Belkhir, A, Colson, P, Dhiver, C, Madrid, A, Martin-Degioanni, M, Meddeb, L, Mokhtari, M, Motte, A, Raoux, A, Toméi, C, Tissot-Dupont, H, Poizot-Martin, Isabelle, Brégigeon, S, Zaegel-Faucher, O, Obry-Roguet, V, Laroche, H, Orticoni, M, Soavi, M, Ressiot, E, Ducassou, M, Jaquet, I, Galie, S, Colson, H, Ritleng, A, Ivanova, A, Debreux, C, Lions, C, Rojas-Rojas, T, Cabié, André, Abel, S, Bavay, J, Bigeard, B, Cabras, O, Cuzin, L, Dupin de Majoubert, R, Fagour, L, Guitteaud, K, Marquise, A, Najioullah, F, Pierre-François, S, Pasquier, J, Richard, P, Rome, K, Turmel, J, Varache, C, Atoui, N, Bistoquet, M, Delaporte, E, Le Moing, V, Makinson, A, Meftah, N, Merle de Boever, C, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Tuaillon, E, Reynes, J, Lefèvre, B, Jeanmaire, E, Hénard, S, Frentiu, E, Charmillon, A, Legoff, A, Tissot, N, André, M, Boyer, L, Bouillon, M, Delestan, M, Goehringer, F, Bevilacqua, S, Rabaud, C, May, T, Raffi, F, Allavena, C, Aubry, O, Billaud, E, Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D, Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Gaborit, B, Grégoire, A, Grégoire, M, Grossi, O, Guéry, R, Lefebvre, Maeva, Le Turnier, P, Lecomte, R, Morineau, P, Reliquet, V, Sécher, S, Cavellec, M, Paredes, E, Soria, A, Ferré, V, André-Garnier, E, Rodallec, A, Pugliese, Pascal, Breaud, S, Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P, Demonchy, E, De Monte, A, Durant, J, Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V, Naqvi, A, Oran, N, Perbost, I, Carles, M, Klotz, C, Maka, A, Pradier, C, Prouvost-Keller, B, Risso, K, Rio, V, Rosenthal, E, Touitou, I, Wehrlen-Pugliese, S, Zouzou, G, Hocqueloux, Laurent, Prazuck, T, Gubavu, C, Sève, A, Giaché, S, Rzepecki, V, Colin, M, Boulard, C, Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E, Lerolle, N, Jaureguiberry, S, Colarino, R, Deradji, O, Castro, A, Barrail-Tran, A, Yazdanpanah, Y, Landman, R, Joly, V, Ghosn, J, Rioux, C, Lariven, S, gervais, a, Lescure, F, Matheron, S, Louni, F, Julia, Z, Le Gac, S, Charpentier, c, Descamps, D, Peytavin, G, Duvivier, C, Aguilar, C, Alby-Laurent, F, Amazzough, K, Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C, Consigny, P, Jidar, K, Lafont, E, Lanternier, F, Leporrier, J, Lortholary, O, Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P, Pilmis, B, Rouzaud, C, Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R, Agher, R, Seang, S, Schneider, L, PaLich, R, Blanc, C, Katlama, C, Bani-Sadr, Firouze, Berger, J, N’Guyen, Y, Lambert, D, Kmiec, I, Hentzien, M, Brunet, A, Romaru, J, Marty, H, Brodard, V, Arvieux, C, Tattevin, P, Revest, M, Souala, F, Baldeyrou, M, Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Benezit, F, Dupont, M, Poinot, M, MAILLARD, A, Pronier, C, Lemaitre, F, Morlat, C, Poisson-Vannier, M, Jovelin, T, Sinteff, J, Gagneux-Brunon, A, Botelho-Nevers, E, Frésard, A, Ronat, V, Lucht, F, Rey, David, Fischer, P, Partisani, M, Cheneau, C, Priester, M, Mélounou, C, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S, Delobel, P, Alvarez, M, Biezunski, N, Debard, A, Delpierre, C, Gaube, G, Lansalot, P, Lelièvre, L, Marcel, M, Martin-Blondel, G, Piffaut, M, Porte, L, Saune, K, Robineau, O, Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Alidjinou, E, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Digumber, M, Huleux, Thomas, Lafon-Desmurs, B, Meybeck, A, Pradier, M, Tetart, M, Thill, P, Viget, N, Valette, M, Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital universitaire Robert Debré [Reims], Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Aix Marseille Université (AMU), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital l'Archet, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Université des Antilles (UA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Dat’AIDS Study Group Besançon: C. Chirouze, C. Drobacheff-Thiébaut, A. Foltzer, K. Bouiller, L. Hustache- Mathieu, Q. Lepiller, F. Bozon, O. Babre, AS. Brunel, P. Muret, E. Chevalier. Clermont-Ferrand: C. Jacomet, H. Laurichesse, O. Lesens, M. Vidal, N. Mrozek, C. Aumeran, O. Baud, V. Corbin, E. Goncalvez, A Mirand, A brebion, C Henquell. Guadeloupe: I. Lamaury, I. Fabre, E. Curlier, R. Ouissa, C. Herrmann-Storck, B. Tressieres, MC. Receveur, F. Boulard, C. Daniel, C. Clavel, PM. Roger, S. Markowicz, N. Chellum Rungen. La Roche sur Yon: D. Merrien, P. Perré, T. Guimard, O. Bollangier, S. Leautez, M. Morrier, L. Laine, D. Boucher, P. Point. Lyon: L. Cotte, F. Ader, A. Becker, A. Boibieux, C. Brochier F, Brunel-Dalmas, O. Cannesson, P. Chiarello, C. Chidiac, S. Degroodt, T. Ferry, M. Godinot, J.M. Livrozet, D. Makhloufi, P. Miailhes, T. Perpoint, M. Perry, C. Pouderoux, S. Roux, C. Triffault-Fillit, F. Valour, C. Charre, V. Icard, J.C. Tardy, M.A. Trabaud. Marseille IHU Méditerrannée: I. Ravaux, A. Ménard, AY. Belkhir, P. Colson, C. Dhiver, A. Madrid, M. Martin-Degioanni, L. Meddeb, M. Mokhtari, A. Motte, A. Raoux, C. Toméi, H. Tissot-Dupont. Marseille Ste Marguerite: I. Poizot-Martin, S. Brégigeon, O. Zaegel-Faucher, V. Obry-Roguet, H Laroche, M. Orticoni, M.J. Soavi, E. Ressiot, M.J. Ducassou, I. Jaquet, S. Galie, H. Colson, A.S. Ritleng, A. Ivanova, C. Debreux, C. Lions, T Rojas-Rojas. Martinique: A. Cabié, S. Abel, J. Bavay, B. Bigeard, O. Cabras, L. Cuzin, R. Dupin de Majoubert, L. Fagour, K. Guitteaud, A. Marquise, F. Najioullah, S. Pierre-François, J. Pasquier, P. Richard, K. Rome, JM Turmel, C. Varache. Montpellier: N. Atoui, M. Bistoquet, E Delaporte, V. Le Moing, A. Makinson, N. Meftah, C. Merle de Boever, B. Montes, A. Montoya Ferrer, E. Tuaillon, J. Reynes. Nancy: B. Lefèvre, E. Jeanmaire, S. Hénard, E. Frentiu, A. Charmillon, A. Legoff, N. Tissot, M. André, L. Boyer, MP. Bouillon, M. Delestan, F. Goehringer, S. Bevilacqua, C. Rabaud, T. May. Nantes: F. Raffi, C. Allavena, O. Aubry, E. Billaud, C. Biron, B. Bonnet, S. Bouchez, D. Boutoille, C. Brunet-Cartier, C. Deschanvres, B.J. Gaborit, A. Grégoire, M. Grégoire, O. Grossi, R. Guéry, T. Jovelin, M. Lefebvre, P. Le Turnier, R. Lecomte, P. Morineau, V. Reliquet, S. Sécher, M. Cavellec, E. Paredes, A. Soria, V. Ferré, E. André-Garnier, A. Rodallec. Nice: P. Pugliese, S. Breaud, C. Ceppi, D. Chirio, E. Cua, P. Dellamonica, E. Demonchy, A. De Monte, J. Durant, C. Etienne, S. Ferrando, R. Garraffo, C. Michelangeli, V. Mondain, A. Naqvi, N. Oran, I. Perbost, M. Carles, C. Klotz, A. Maka, C. Pradier, B. Prouvost- Keller, K. Risso, V. Rio, E. Rosenthal, I. Touitou, S. Wehrlen-Pugliese, G. Zouzou. Orléans: L. Hocqueloux, T. Prazuck, C. Gubavu, A. Sève, S. Giaché, V. Rzepecki, M. Colin, C. Boulard, G. Thomas. Paris APHP Bicètre: A. Cheret, C. Goujard, Y. Quertainmont, E. Teicher, N. Lerolle, S. Jaureguiberry, R. Colarino, O. Deradji, A. Castro, A. Barrail-Tran. Paris APHP Bichat: Y. Yazdanpanah, R. Landman, V. Joly, J. Ghosn, C. Rioux, S. Lariven, A. Gervais, FX. Lescure, S. Matheron, F. Louni, Z. Julia, S. Le GAC, C. Charpentier, D. Descamps, G. Peytavin. Paris APHP Necker Pasteur: C. Duvivier, C. Aguilar, F. Alby-Laurent, K. Amazzough, G. Benabdelmoumen, P. Bossi, G. Cessot, C. Charlier, P.H. Consigny, K. Jidar, E. Lafont, F. Lanternier, J. Leporrier, O. Lortholary, C. Louisin, J. Lourenco, P. Parize, B. Pilmis, C. Rouzaud, F. Touam. Paris APHP Pitié Salpetrière: MA. Valantin, R. Tubiana, R. Agher, S. Seang, L. Schneider, R. PaLich, C. Blanc, C. Katlama. Reims: F. Bani-Sadr, JL. Berger, Y. N’Guyen, D. Lambert, I. Kmiec, M. Hentzien, A. Brunet, J. Romaru, H. Marty, V. Brodard. Rennes: C. Arvieux, P. Tattevin, M. Revest, F. Souala, M. Baldeyrou, S. Patrat-Delon, J.M. Chapplain, F. Benezit, M. Dupont, M. Poinot, A. Maillard, C. Pronier, F. Lemaitre, C. Morlat, M. Poisson-Vannier, T. Jovelin, JP. Sinteff. St Etienne: A. Gagneux-Brunon, E. Botelho-Nevers, A. Frésard, V. Ronat, F. Lucht. Strasbourg: D. Rey, P. Fischer, M. Partisani, C. Cheneau, M. Priester, C. Mélounou, C. Bernard-Henry, E. de Mautort, S. Fafi-Kremer. Toulouse: P. Delobel, M. Alvarez, N. Biezunski, A. Debard, C. Delpierre, G. Gaube, P. Lansalot, L. Lelièvre, M. Marcel, G. Martin-Blondel, M. Piffaut, L. Porte, K. Saune. Tourcoing: O. Robineau, F. Ajana, E. Aïssi, I. Alcaraz, E. Alidjinou, V. Baclet, L. Bocket, A. Boucher, M. Digumber, T. Huleux, B. Lafon-Desmurs, A. Meybeck, M. Pradier, M. Tetart, P. Thill, N. Viget, M. Valette., CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), and Malbec, Odile
Subjects: Microbiology (medical), Male, medicine.medical_specialty, Hepatitis C virus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, men having sex with men, HIV Infections, Hepacivirus, medicine.disease_cause, Antiviral Agents, Men who have sex with men, 03 medical and health sciences, Sexual and Gender Minorities, 0302 clinical medicine, Internal medicine, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Prospective Studies, Human Immunodeficiency virus, Homosexuality, Male, education, Retrospective Studies, Hepatitis, education.field_of_study, business.industry, Coinfection, Mortality rate, Incidence (epidemiology), microelimination, virus diseases, HIV, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, Hepatitis C, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, epidemiology, France, business
Abstract: Background The arrival of highly effective, well-tolerated, direct-acting antiviral agents (DAA) led to a dramatic decrease in hepatitis C virus (HCV) prevalence. Human immunodeficiency virus (HIV)-HCV–coinfected patients are deemed a priority population for HCV elimination, while a rise in recently acquired HCV infections in men who have sex with men (MSM) has been described. We describe the variations in HIV-HCV epidemiology in the French Dat’AIDS cohort. Methods This was a retrospective analysis of a prospective cohort of persons living with HIV (PLWH) from 2012 to 2018. We determined HCV prevalence, HCV incidence, proportion of viremic patients, treatment uptake, and mortality rate in the full cohort and by HIV risk factors. Results From 2012 to 2018, 50 861 PLWH with a known HCV status were followed up. During the period, HCV prevalence decreased from 15.4% to 13.5%. HCV prevalence among new HIV cases increased from 1.9% to 3.5% in MSM but remained stable in other groups. Recently acquired HCV incidence increased from 0.36/100 person-years to 1.25/100 person-years in MSM. The proportion of viremic patients decreased from 67.0% to 8.9%. MSM became the first group of viremic patients in 2018 (37.9%). Recently acquired hepatitis represented 59.2% of viremic MSM in 2018. DAA treatment uptake increased from 11.4% to 61.5%. More treatments were initiated in MSM in 2018 (41.2%) than in intravenous drug users (35.6%). In MSM, treatment at the acute phase represented 30.0% of treatments in 2018. Conclusions A major shift in HCV epidemiology was observed in PLWH in France from 2012 to 2018, leading to a unique situation in which the major group of HCV transmission in 2018 was MSM. Clinical Trials Registration. NCT02898987.
Published: 2020

25. Reaching the Second and Third Joint United Nations Programme on HIV/AIDS 90-90-90 Targets Is Accompanied by a Dramatic Reduction in Primary Human Immunodeficiency Virus (HIV) Infection and in Recent HIV Infections in a Large French Nationwide HIV Cohort

Author: Le Guillou, Adrien, Pugliese, Pascal, Raffi, Francois, Cuzin, Lise, Katlama, Christine, Allavena, Clotilde, Dramé, Moustapha, Cotte, Laurent, Bani-Sadr, Firouzé, Orticoni, M, Soavi, M, Luquet- Besson, I, Ressiot, E, Carta- Padovani, M, Ducassou, M, Bertone, H, Galie, S, Galinier, A., Monclar, M, Ritleng, A, Ivanova, A., Blanco-Betancourt, C, Lions, C., Poizot-Martin, I., Dhiver, C., Saadia Mokhtari, M, Ménard, A, Tissot Dupont, H., Tomei, C., Meddeb, L., Belkhir, A., Ravaux, I., Alvarez, M., Biezunski, N, Debard, A., Delpierre, C., Lansalot, P, Lelievre, L., Martin-Blondel, G., Piffaut, M, Porte, L., Saune, K, Delobel, P., Breaud, S., Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P., Demonchy, E, De Monte, A, Durant, J., Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V., Bernaud, C, Billaud, E., Biron, C, Bonnet, B., Bouchez, S, Boutoille, D., Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Gaborit, B., Hall, N., Le Turnier, P., Morineau, P, Reliquet, V., Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A., Ferre, V., André-Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C., Consigny, P, Danion, F., Dureault, A, Duvivier, C., Goesch, J, Guery, R., Henry, B, Jidar, K, Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R., Agher, R, Seang, S, Schneider, L, PaLich, R, Blanc, C., Cabié, André, Abel, S., Pierre-François, S, Pasquier, J., Guitteaud, K, Turmel, J, Illiaquer, M, Fischer, P, Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, M, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S., Rey, D., Chirouze, C., Gardiennet, Q, Berger, J., N’Guyen, Y, Lambert, D., Hentzien, M., Lebrun, D., Brunet, A, Kmiec, I, Brodard, V, Chidiac, C., Ferry, T., Ader, F., Biron, F., Boibieux, A., Miailhes, P., Perpoint, T., Schlienger, I, Lippmann, J, Braun, E, Koffi, J, Longuet, C., Guéripel, V, Augustin-Normand, C, Brochier, C, Degroodt, S, Atoui, N, Le Moing, V., Makinson, A., Meftah, N., de Boever, C Merle, Montes, B., Montoya Ferrer, A, Reynes, J., André, M, Boyer, L., Bouillon, M, Delestan, M, May, T., Hocqueloux, L, Prazuck, T., Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C., Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E., Lerolle, N., Deradji, O, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Rioux, C., Lariven, S, gervais, a, Lescure, F., Matheron, S., Louni, F, Godard, C, Julia, Z, Chansombat, M, Rahli, D, Mackoumbou-Nkouka, C, Charpentier, C., Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., Maillard, A., Pronier, C., Lemaître, F., Guennoun, C, Poisson-Vanier, M, Jovelin, T., Sinteff, J, Arvieux, C., Botelho-Nevers, E., Gagneux-Brunon, A., Frésard, A., Lucht, F., Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A., Choisy, P, Huleux, T., Lafon-Desmurs, B., Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M., Hoen, B., Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Schepers, K, Herrmann-Storck, C, Dournon, N, Merrien, D, Perré, P., Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Département de maladies infectieuses, Hospices Civils de Lyon (HCL), Neurobiologie, plasticité tissulaire et métabolisme énergétique (NPTME), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), DDSIS 76, Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare [Sezione di Roma 1] (INFN), Istituto Nazionale di Fisica Nucleare, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Laboratoire de Physique et Chimie Quantique [Tizi-Ouzou] (LPCQ ), Université Mouloud Mammeri [Tizi Ouzou] (UMMTO), Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Département Etude des Réacteurs (DER), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Weill Cornell Medicine [Qatar], Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Registre EPIMAD, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de Physique des Particules de Marseille (CPPM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Saint-Etienne, University Hospital and University Jean Monnet, Virologie et pathogenèse virale (VPV), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Tourcoing, CHU de Fort de France, Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Bicêtre-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Aix Marseille Université (AMU), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: cascade of care, primary HIV infection, Dat’AIDS cohort, TasP, 90-90-90 target, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Background - In late 2013, France was one of the first countries to recommend initiation of combination antiretroviral therapy (cART) irrespective of CD4 cell count. Methods - To assess the impact of achieving the second and third Joint United Nations Programme on HIV/AIDS 90-90-90 targets (ie, 90% of diagnosed people on sustained cART, and, of those, 90% virologically controlled) on human immunodeficiency virus (HIV) incidence, we conducted a longitudinal study to describe the epidemiology of primary HIV infection (PHI) and/or recent HIV infection (patients with CD4 cell count ≥500/mm3 at HIV diagnosis; (PRHI) between 2007 and 2017 in a large French multicenter cohort. To identify changes in trends in PHI and PRHI, we used single breakpoint linear segmented regression analysis. Results - During the study period, 61 822 patients were followed in the Dat'AIDS cohort; 2027 (10.0%) had PHI and 7314 (36.1%) had PRHI. The second and third targets were reached in 2014 and 2013, respectively. The median delay between HIV diagnosis and cART initiation decreased from 9.07 (interquartile range [IQR], 1.39-33.47) months in 2007 to 0.77 (IQR, 0.37-1.60) months in 2017. A decrease in PHI (-35.1%) and PRHI (-25.4%) was observed starting in 2013. The breakpoints for PHI and PRHI were 2012.6 (95% confidence interval [CI], 2010.8-2014.4) and 2013.1 (95% CI, 2011.3-2014.8), respectively. Conclusions - Our findings show that the achievements of 2 public health targets in France and the early initiation of cART were accompanied by a reduction of about one-third in PHI and PRHI between 2013 and 2017. Clinical trials registration - NCT02898987.
Published: 2020

26. Brain MRI Findings in Severe COVID-19: A Retrospective Observational Study

Author: Kremer, S. (Stéphane), Boulay, C. (Clotilde), de Sèze, J. (Jérome), Ferré, J. (Jean-Christophe), Maamar, A. (Adel), Carsin-Nicol, B. (Béatrice), Collange, O. (Olivier), Bonneville, F. (Fabrice), Adam, G. (Gilles), Martin-Blondel, G. (Guillaume), Rafiq, M. (Marie), Geeraerts, T. (Thomas), Delamarre, L. (Louis), Grand, S. (Sylvie), Krainik, A. (Alexandre), Kremer, S. (Stephane), Alleg, M. (Manel), Anheim, M. (Mathieu), Anxionnat, R. (René), Ardellier, F. (François-Daniel), Baloglu, S. (Seyyid), Bapst, B. (Blanche), Benzakoun, J. (Joseph), Berge, J. (Jérome), Bolognini, F. (Federico), Bornet, G. (Grégoire), Boulouis, G. (Grégoire), Boutet, C. (Claire), Brisset, J. (Jean Christophe), Caillard-ohlmann, S. (Sophie), Carré, S. (Sophie), Comby, P. (Pierre-Olivier), Constans, J. (Jean Marc), David, J. (Jean-Stéphane), de Beaurepaire, I. (Isaure), De Seze, J. (Jerome), Desal, H. (Hubert), Edjlali-Goujon, M. (Myriam), Fabre, X. (Xavier), Fafi-Kremer, S. (Samira), Feuerstein, P. (Philippe), Henry Feugeas, M. (Marie-Cécile), Forestier, G. (Géraud), Gaudemer, A. (Augustin), Hansmann, Y. (Yves), Heintz, A. (Adrien), Boisrame, J. (Julie), Hemmert, C. (Céline), Hmeydia, G. (Ghazi), Jager, L. (Lavinia), Kazémi, A. (Apolline), Kerleroux, B. (Basile), Khalil, A. (Antoine), Lacalm, A. (Audrey), Lecler, A. (Augustin), Lecocq, C. (Claire), Lefebvre, N. (Nicolas), Lersy, F. (François), Matthieu, M. (Muriel), Megdiche, I. (Imen), Mertes, P. (Paul-michel), Messié, J. (Julien), Metanbou, S. (Serge), Meyer, N. (Nicolas), Meziani, F. (Ferhat), Mutschler, V. (Veronique), Nesser, P. (Patrick), Oesterlé, H. (Hélène), Ohana, M. (Mickaël), Oppenheim, C. (Catherine), Pyatigorskaya, N. (Nadya), Ricolfi, F. (Frédéric), Saleme, S. (Suzana), Schenck, M. (Maleka), Schmitt, E. (Emmanuelle), Schneider, F. (Francis), Sebag, N. (Nathan), Talla Mba, Y. (Yannick), Thouant, P. (Pierre), Willaume, T. (Thibault), Zhu, F. (François), Zorn, P. (Pierre-Emmanuel), Cotton, F. (François), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Réseau nanophotonique et optique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Radiologie [CHU de Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Toulouse [Toulouse], CHU Grenoble, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Centre hospitalier de Haguenau, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Nancy (CHU Nancy), CHU Henri Mondor, Institut de psychiatrie et neurosciences de Paris (IPNP - U1266 Inserm), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), CHU Bordeaux [Bordeaux], Hôpitaux Civils de Colmar, Hôpital Privé d'Antony, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Observatoire Français de la Sclérose En Plaques [Lyon] (OFSEP), Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Amiens-Picardie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier de Roanne (CH Roanne), CH de Roanne, Groupe hospitalier de la région de Mulhouse Sud-Alsace (GHRMSA), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Limoges, CHU Strasbourg, Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg, Université de Strasbourg (UNISTRA), Hôpital Marie-Madeleine [Forbach], CHU Lille, Hôpital de la Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), Nanomédecine Régénérative (NanoRegMed), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et Nanosciences Grand-Est (MNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Henri Mondor [Créteil], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ferré, Jean-Christophe, and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Sciences du Vivant [q-bio]/Neurosciences [q-bio.NC], Adolescent, Pneumonia, Viral, Gastroenterology, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Temporal lobe, White matter, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Betacoronavirus, Young Adult, 0302 clinical medicine, Cerebrospinal fluid, Internal medicine, Intensive care, medicine, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, 10. No inequality, Child, Pandemics, Fisher's exact test, Aged, Retrospective Studies, medicine.diagnostic_test, business.industry, SARS-CoV-2, [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, [SCCO.NEUR] Cognitive science/Neuroscience, Brain, COVID-19, Retrospective cohort study, Magnetic resonance imaging, Middle Aged, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, 3. Good health, Venous thrombosis, medicine.anatomical_structure, Neuroradiology, 030220 oncology & carcinogenesis, symbols, Female, business, Coronavirus Infections
Abstract: International audience; BackgroundBrain MRI parenchymal signal abnormalities have been associated with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2).PurposeTo describe the neuroimaging findings (excluding ischemic infarcts) in patients with severe coronavirus disease 2019 (COVID-19) infection.Materials and MethodsThis was a retrospective study of patients evaluated from March 23, 2020, to April 27, 2020, at 16 hospitals. Inclusion criteria were (a) positive nasopharyngeal or lower respiratory tract reverse transcriptase polymerase chain reaction assays, (b) severe COVID-19 infection defined as a requirement for hospitalization and oxygen therapy, (c) neurologic manifestations, and (d) abnormal brain MRI findings. Exclusion criteria were patients with missing or noncontributory data regarding brain MRI or brain MRI showing ischemic infarcts, cerebral venous thrombosis, or chronic lesions unrelated to the current event. Categorical data were compared using the Fisher exact test. Quantitative data were compared using the Student t test or Wilcoxon test. P < .05 represented a significant difference.ResultsThirty men (81%) and seven women (19%) met the inclusion criteria, with a mean age of 61 years ± 12 (standard deviation) (age range, 8–78 years). The most common neurologic manifestations were alteration of consciousness (27 of 37, 73%), abnormal wakefulness when sedation was stopped (15 of 37, 41%), confusion (12 of 37, 32%), and agitation (seven of 37, 19%). The most frequent MRI findings were signal abnormalities located in the medial temporal lobe in 16 of 37 patients (43%; 95% confidence interval [CI]: 27%, 59%), nonconfluent multifocal white matter hyperintense lesions seen with fluid-attenuated inversion recovery and diffusion-weighted sequences with variable enhancement, with associated hemorrhagic lesions in 11 of 37 patients (30%; 95% CI: 15%, 45%), and extensive and isolated white matter microhemorrhages in nine of 37 patients (24%; 95% CI: 10%, 38%). A majority of patients (20 of 37, 54%) had intracerebral hemorrhagic lesions with a more severe clinical presentation and a higher admission rate in intensive care units (20 of 20 patients [100%] vs 12 of 17 patients without hemorrhage [71%], P = .01) and development of the acute respiratory distress syndrome (20 of 20 patients [100%] vs 11 of 17 patients [65%], P = .005). Only one patient had SARS-CoV-2 RNA in the cerebrospinal fluid.ConclusionPatients with severe coronavirus disease 2019 and without ischemic infarcts had a wide range of neurologic manifestations that were associated with abnormal brain MRI scans. Eight distinctive neuroradiologic patterns were described.
Published: 2020

27. Kaposi sarcoma among people living with HIV in the French DAT'AIDS cohort between 2010 and 2015

Author: Obry-Roguet, Véronique, Duvivier, Claudine, Lions, Caroline, Huleux, Thomas, Jacomet, Christine, Ferry, Tristan, Cheret, Antoine, Allavena, Clotilde, Bani-Sadr, Firouzé, Palich, Romain, Cabié, André, Pugliese, Pascal, Delobel, Pierre, Lamaury, Isabelle, Hustache-Mathieu, Laurent, Bregigeon, Sylvie, Makinson, Alain, Rey, David, Poizot-Martin, Isabelle, Hustache‐Mathieu, Laurent, Drobacheff‐Thiébaut, C., Foltzer, A., Bouiller, K., Hustache‐ Mathieu, L., Chirouze, C., LEPILLER, Q., Bozon, F., Babre, O, Brunel, A.S., Muret, P., Laurichesse, H., Lesens, O., Vidal, M., Mrozek, N., Aumeran, C., Baud, O., Corbin, V., Letertre‐Gibert, P., Casanova, S., Prouteau, J., Fabre, I., Curlier, E., Ouissa, R., Herrmann‐Storck, C., Tressieres, B., Bonijoly, T., Receveur, M.C., Boulard, F., Daniel, C., Clavel, C., Merrien, D., Perré, P., Guimard, T., Bollangier, O., Leautez, S., Morrier, M., Laine, L., Ader, F., Becker, A., Biron, F., Boibieux, A., Cotte, L., Miailhes, P., Perpoint, T., Roux, S., Triffault‐Fillit, C., Degroodt, S., Brochier, C., Valour, F., Chidiac, C., Ménard, A., Belkhir, A.Y., Colson, P., Dhiver, C., Madrid, A., Martin‐Degioanni, M., Meddeb, L., Mokhtari, M., Motte, A., Raoux, A., Ravaux, I., Tamalet, C., Tomei, C., Tissot Dupont, H., Zaegel‐Faucher, O., Obry‐Roguet, Véronique, Laroche, H, Orticoni, M., Soavi, M.J., Geneau de Lamarlière, P, Ressiot, E, Ducassou, M.J., Jaquet, I., Galie, S., Galinier, A., Martinet, P., Landon, M., Ritleng, A.S., Ivanova, A., Debreux, C., Poizot‐Martin, I., Abel, S., Cabras, O., Cuzin, L., Guitteaud, K., Illiaquer, M., Pierre‐François, S., Osei, L., Pasquier, J., Rome, K., Sidani, E., Turmel, JM, Varache, C., Atoui, N., Bistoquet, M., Delaporte, E., Le Moing, V., Meftah, N., Merle de Boever, C., Montes, B., Montoya Ferrer, A., Tuaillon, E., Reynes, J., André, M., Boyer, L., Bouillon, MP., Delestan, M., Rabaud, C., May, T., Hoen, B., Bernaud, C., Billaud, E., Biron, C., Bonnet, B., Bouchez, S., Boutoille, D., Brunet‐Cartier, C., Deschanvres, C., Hall, N., Morineau, P., Reliquet, V., Sécher, S., Cavellec, M., Soria, A., Paredes, E., Ferre, V., André‐Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M., Grossi, O., Aubry, O., Raffi, F., Breaud, S., Ceppi, C., Chirio, D., Cua, E., Dellamonica, P., Demonchy, E., De Monte, A., Durant, J., Etienne, C., Ferrando, S., Garraffo, R., Michelangeli, C., Mondain, V., Naqvi, A., Oran, N., Perbost, I., Pillet, S., Pradier, C., Prouvost‐Keller, B., Risso, K., Rio, V., Roger, PM., Rosenthal, E., Sausse, S., Touitou, I., Wehrlen‐Pugliese, S., Zouzou, G., Hocqueloux, L., Prazuck, T., Gubavu, C., Sève, A., Maka, A., Boulard, C., Thomas, G., Lerolle, N., Landman, R., Joly, V., Ghosn, J., Rioux, C., Lariven, S., Gervais, A., Lescure, F.X., Matheron, S., Louni, F., Julia, Z., Mackoumbou‐Nkouka, C., Le Gac, S., Charpentier, C., Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G., Bossi, P., Cessot, G., Charlier, C., Consigny, P.H., Danion, F., Dureault, A., Goesch, J., Guery, R., Henry, B., Jidar, K., Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C., Lourenco, J., Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M.A., Tubiana, R., Agher, R, Seang, S., Schneider, L., Blanc, C., Katlama, C., Berger, J.L., N'guyen, Y., Lambert, D., Kmiec, I., Hentzien, M., Brunet, A., Brodard, V., Bani‐Sadr, Firouze, Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat‐Delon, S., Chapplain, J.M., Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., Maillard, A., Pronier, C., Lemaitre, F., Guennoun, C., Poisson‐Vanier, M., Jovelin, T., Sinteff, J.P., Arvieux, C., Botelho‐Nevers, E., Gagneux‐Brunon, A., Frésard, Anne, Ronat, V., Lucht, F., Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, ML, Bernard‐Henry, C, de Mautort, E, Fafi‐Kremer, S., Alvarez, M., Biezunski, N., Debard, A., Delpierre, C., Lansalot, P., Lelievre, L., Martin‐Blondel, G., Piffaut, M., Porte, L., Saune, K., Ajana, F., Aïssi, E., Alcaraz, I., Baclet, V., Bocket, L., Boucher, A., Choisy, P., Lafon‐Desmurs, B., Meybeck, A., Pradier, M., Robineau, O., Viget, N., Valette, M., Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Tourcoing, Département des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services des maladies infectieuses [CH Turcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Alliance for International medical Action (ALIMA), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire d'Ingénierie Circulation Transport (LICIT), Institut Français des Sciences et Technologies des Transports, de l'Aménagement et des Réseaux (IFSTTAR)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Université de Lyon, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU Besançon), Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Gabriel Montpied, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Gabriel Montpied (CHU), CHU Clermont-Ferrand, CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Montpellier Research in Management (MRM), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathologies Pulmonaires et Plasticité Cellulaire - UMR-S 1250 (P3CELL), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurobiologie, plasticité tissulaire et métabolisme énergétique (NPTME), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CECIL, Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre IRD de Montpellier (IRD), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Service de virologie [CHU Nantes], Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Public Health Department, Hôpital de l'Archet, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Infectious Diseases Department, Université Montpellier 1 (UM1), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Régional de recherche et de Formation à la prise en charge Clinique de Fann (CRCF), CHNU Fann, Registre EPIMAD, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Laboratoire d'aérologie (LA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), University Hospital and University Jean Monnet, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virologie et pathogenèse virale (VPV), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Département d'Hématologie Clinique [CHU Nantes] (Hôtel-Dieu), Hôtel-Dieu de Nantes-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Robert Debré, Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Dermatologie et Maladies infectieuses [Pointe-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre de Gestion du Risque Infectieux Nosocomial [Pointe-à-Pitre] (CGRIN), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Infectious and Tropical Diseases Department [Montpellier], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dat'AIDS study group: C Drobacheff-Thiébaut, A Foltzer, K Bouiller, C Chirouze, Q Lepiller, F Bozon, O Babre, A S Brunel, P Muret, H Laurichesse, O Lesens, M Vidal, N Mrozek, C Aumeran, O Baud, V Corbin, P Letertre-Gibert, S Casanova, J Prouteau, I Fabre, E Curlier, R Ouissa, C Herrmann-Storck, B Tressieres, T Bonijoly, M C Receveur, F Boulard, C Daniel, C Clavel, D Merrien, P Perré, T Guimard, O Bollangier, S Leautez, M Morrier, L Laine, F Ader, A Becker, F Biron, A Boibieux, L Cotte, P Miailhes, T Perpoint, S Roux, C Triffault-Fillit, S Degroodt, C Brochier, F Valour, C Chidiac, A Ménard, A Y Belkhir, P Colson, C Dhiver, A Madrid, M Martin-Degioanni, L Meddeb, M Mokhtari, A Motte, A Raoux, I Ravaux, C Tamalet, C Toméi, H Tissot Dupont, O Zaegel-Faucher, H Laroche, M Orticoni, M J Soavi, P Geneau de Lamarlière, E Ressiot, M J Ducassou, I Jaquet, S Galie, A Galinier, P Martinet, M Landon, A S Ritleng, A Ivanova, C Debreux, S Abel, O Cabras, L Cuzin, K Guitteaud, M Illiaquer, S Pierre-François, L Osei, J Pasquier, K Rome, E Sidani, J M Turmel, C Varache, N Atoui, M Bistoquet, E Delaporte, V Le Moing, N Meftah, C Merle de Boever, B Montes, A Montoya Ferrer, E Tuaillon, J Reynes, M André, L Boyer, M P Bouillon, M Delestan, C Rabaud, T May, B Hoen, C Bernaud, E Billaud, C Biron, B Bonnet, S Bouchez, D Boutoille, C Brunet-Cartier, C Deschanvres, N Hall, T Jovelin, P Morineau, V Reliquet, S Sécher, M Cavellec, A Soria, E Paredes, V Ferré, E André-Garnier, A Rodallec, M Lefebvre, O Grossi, O Aubry, F Raffi, S Breaud, C Ceppi, D Chirio, E Cua, P Dellamonica, E Demonchy, A De Monte, J Durant, C Etienne, S Ferrando, R Garraffo, C Michelangeli, V Mondain, A Naqvi, N Oran, I Perbost, S Pillet, C Pradier, B Prouvost-Keller, K Risso, V Rio, P M Roger, E Rosenthal, S Sausse, I Touitou, S Wehrlen-Pugliese, G Zouzou, L Hocqueloux, T Prazuck, C Gubavu, A Sève, A Maka, C Boulard, G Thomas, C Goujard, Y Quertainmont, E Teicher, N Lerolle, O Deradji, A Barrail-Tran, R Landman, V Joly, J Ghosn, C Rioux, S Lariven, A Gervais, F X Lescure, S Matheron, F Louni, Z Julia, C Mackoumbou-Nkouka, S Le Gac, C Charpentier, D Descamps, G Peytavin, Y Yazdanpanah, K Amazzough, G Benabdelmoumen, P Bossi, G Cessot, C Charlier, P H Consigny, F Danion, A Dureault, J Goesch, R Guery, B Henry, K Jidar, F Lanternier, P Loubet, O Lortholary, C Louisin, J Lourenco, P Parize, B Pilmis, F Touam, M A Valantin, R Tubiana, R Agher, S Seang, L Schneider, C Blanc, C Katlama, J L Berger, Y N'Guyen, D Lambert, I Kmiec, M Hentzien, A Brunet, V Brodard, P Tattevin, M Revest, F Souala, M Baldeyrou, S Patrat-Delon, J M Chapplain, F Benezit, M Dupont, M Poinot, A Maillard, C Pronier, F Lemaitre, C Guennoun, M Poisson-Vanier, T Jovelin, J P Sinteff, C Arvieux, E Botelho-Nevers, A Gagneux-Brunon, A Frésard, V Ronat, F Lucht, P Fischer, M Partisani, C Cheneau, M Priester, M L Batard, C Bernard-Henry, E de Mautort, S Fafi-Kremer, M Alvarez, N Biezunski, A Debard, C Delpierre, P Lansalot, L Lelièvre, G Martin-Blondel, M Piffaut, L Porte, K Saune, F Ajana, E Aïssi, I Alcaraz, V Baclet, L Bocket, A Boucher, P Choisy, B Lafon-Desmurs, A Meybeck, M Pradier, O Robineau, N Viget, M Valette., Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Institut Pasteur [Paris], Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Groupe Sup de Co Montpellier (GSCM) - Montpellier Business School-Université de Montpellier (UM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Météo France-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, and Dupuis, Christine
Subjects: 0301 basic medicine, Pediatrics, medicine.medical_specialty, MESH: Sarcoma, Kaposi* / epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, HIV Infections, Dermatology, Skin Infectiology, Venereology and Sexual Health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), medicine, Humans, MESH: HIV Infections* / complications, 030212 general & internal medicine, Sarcoma, Kaposi, Retrospective Studies, Response rate (survey), MESH: Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Herpesvirus 8, Human, Acquired Immunodeficiency Syndrome, MESH: Humans, business.industry, Kaposi sarcoma, HIV, Retrospective cohort study, MESH: Retrospective Studies, MESH: HIV Infections* / drug therapy, medicine.disease, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], medical dermatology, Regimen, Infectious Diseases, Clinical research, clinical research, Herpesvirus 8, Human, Cohort, oncology, Original Article, Sarcoma, business, Viral load, MESH: HIV Infections* / epidemiology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Background - Although antiretroviral therapy (ART) has reduced the risk of Kaposi sarcoma (KS), KS cases still occur in HIV-infected people. Objective - To describe all KS cases observed between 2010 and 2015 in a country with high ART coverage. Methods - Retrospective study using longitudinal data from 44 642 patients in the French Dat'AIDS multicenter cohort. Patients' characteristics were described at KS diagnosis according to ART exposure and to HIV-plasma viral load (HIV-pVL) (≤50 or >50) copies/mL. Results - Among the 209 KS cases diagnosed during the study period, 33.2% occurred in ART naïve patients, 17.3% in ART-experienced patients and 49.5% in patients on ART, of whom 23% for more than 6 months. Among these patients, 24 (11.5%) had HIV-pVL ≤50 cp/mL, and 16 (66%) were treated with a boosted-PI-based regimen. The distribution of KS localization did not differ by ART status nor by year of diagnosis. Limitations - Data on human herpesvirus 8, treatment modalities for KS and response rate were not collected. Conclusion - Half of KS cases observed in the study period occurred in patients not on ART, reflecting the persistence of late HIV diagnosis. Factors associated with KS in patients on ART with HIV-pVL ≤50 cp/mL remain to be explored.
Published: 2020

28. Multimorbidity in Elderly Persons According to the Year of Diagnosis of Human Immunodeficiency Virus Infection: A Cross-sectional Dat’AIDS Cohort Study

Author: Demontès, Marie, Eymard Duvernay, Sabrina, Allavena, Clotilde, Jovelin, Thomas, Reynes, Jacques, Hentzien, Maxime, Ravaux, Isabelle, Delobel, Pierre, Bregigeon, Sylvie, Rey, David, Ferry, Tristan, Gagneux-Brunon, Amandine, Robineau, Olivier, Pugliese, Pascal, Duvivier, Claudine, Cabié, André, Chirouze, Catherine, Jacomet, Christine, Lamaury, Isabelle, Merrien, Dominique, Hoen, Bruno, Hocqueloux, Laurent, Cheret, Antoine, Katlama, Christine, Arvieux, Cédric, Krolak-Salmon, Pierre, Makinson, Alain, Drobacheff-Thiébaut, C, Foltzer, A, Bouiller, K, Hustache- Mathieu, L, Chirouze, C, Lepiller, Q, Bozon, F, Babre, O, Brunel, S, Muret, P, Laurichesse, H, Lesens, O, Vidal, M, Mrozek, N, Aumeran, C, Baud, O, Corbin, V, Letertre-Gibert, P, Casanova, S, Prouteau, J, Jacomet, C, Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Herrmann-Storck, C, Tressieres, B, Bonijoly, T, Receveur, C, Boulard, F, Daniel, C, Clavel, C, Merrien, D, Perré, P, Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Laine, L, Ader, F, Becker, A, Biron, F, Boibieux, A, Cotte, L, Ferry, T, Miailhes, P, Perpoint, T, Roux, S, Triffault-Fillit, C, Degroodt, S, Brochier, C, Valour, F, Chidiac, C, Ménard, A, Belkhir, Y, Colson, P, Dhiver, C, Madrid, A, Martin-Degiovani, M, Meddeb, L, Mokhtari, M, Motte, A, Raoux, A, Ravaux, I, Tamalet, C, Toméi, C, Tissot Dupont, H, Brégigeon, S, Zaegel-Faucher, O, Obry-Roguet, V, Laroche, H, Orticoni, M, Soavi, J, Geneau de Lamarlière, P, Ressiot, E, Ducassou, J, Jaquet, I, Galie, S, Galinier, A, Martinet, P, Landon, M, Ritleng, S, Ivanova, A, Debreux, C, Lions, C, Poizot-Martin, I, Abel, S, Cabras, O, Cuzin, L, Guitteaud, K, Illiaquer, M, Pierre-François, S, Osei, L, Pasquier, J, Rome, K, Sidani, E, Turmel, M, Varache, C, Cabié, A, Atoui, N, Bistoquet, M, Delaporte, E, Le Moing, V, Makinson, A, Meftah, N, Merle de Boever, C, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Tuaillon, E, Reynes, J, André, M, Boyer, L, Bouillon, P, Delestan, M, Rabaud, C, May, T, Hoen, B, Allavena, C, Bernaud, C, Billaud, E, Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D, Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Hall, N, Jovelin, T, Morineau, P, Reliquet, V, Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A, Ferré, V, André-Garnier, E, Rodallec, A, Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O, Raffi, F, Pugliese, P, Breaud, S, Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P, Demonchy, E, de Monte, A, Durant, J, Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V, Naqvi, A, Oran, N, Perbost, I, Pillet, S, Pradier, C, Prouvost-Keller, B, Risso, K, Rio, V, Roger, P, Rosenthal, E, Sausse, S, Touitou, I, Wehrlen-Pugliese, S, Zouzou, G, Hocqueloux, L, Prazuck, T, Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C, Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E, Lerolle, N, Deradji, O, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Ghosn, J, Rioux, C, Lariven, S, Gervais, A, Lescure, F, Matheron, S, Louni, F, Julia, Z, Mackoumbou-Nkouka, C, Le Gac, S, Charpentier, C, Descamps, D, Peytavin, G, Yazdanpanah, Y, Amazzough, K, Avettand-Fenoël, V, Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C, Consigny, P, Danion, F, Dureault, A, Duvivier, C, Goesch, J, Guery, R, Henry, B, Jidar, K, Lanternier, F, Loubet, P, Lortholary, O, Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P, Pilmis, B, Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R, Agher, R, Seang, Sophie, Schneider, L, Palich, R, Blanc, C, Katlama, C, Berger, J, N’guyen, Y, Lambert, D, Kmiec, I, Hentzien, M, Brunet, A, Brodard, V, Bani-Sadr, F, Tattevin, P, Revest, M, Souala, F, Baldeyrou, M, Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Benezit, F, Dupont, M, Poinot, M, Maillard, A, Pronier, C, Lemaitre, F, Guennoun, C, Poisson-Vanier, M, Sinteff, J, Arvieux, C, Botelho-Nevers, E, Gagneux-Brunon, A, Frésard, A, Ronat, V, Lucht, F, Fischer, P, Partisani, M, Cheneau, C, Priester, M, Batard, L, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S, Rey, D, Alvarez, M, Biezunski, N, Debard, A, Delpierre, C, Lansalot, P, Lelièvre, L, Martin-Blondel, G, Piffaut, M, Porte, L, Saune, K, Delobel, P, Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Choisy, P, Huleux, T, Lafon-Desmurs, B, Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M, Hospices Civils de Lyon (HCL), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Nantes (UN), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU AMU), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Saint-Etienne, Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Service de Maladies Infectieuses [Nice], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Département des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre Hospitalier Compiègne-Noyon, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), Services des maladies infectieuses [CH Turcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Besançon (CHU Besançon), Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Gabriel Montpied, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), CCLIN Sud-Est – Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales Sud-Est, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales (SMIT), CHU de Treichville, Laboratoire Traitement et Communication de l'Information (LTCI), Télécom ParisTech-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Mécanique et Technologie (LMT), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre interrégional de référence Rhône-Alpes - Auvergne des infections ostéo-articulaires complexes, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Space Research Institute of the Russian Academy of Sciences (IKI), Russian Academy of Sciences [Moscow] (RAS), DDSIS 76, Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre IRD de Montpellier (IRD), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Océan du Large et Variabilité Climatique (OLVAC), Laboratoire d'études en Géophysique et océanographie spatiales (LEGOS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plant Biomechanics Group, Botanischer Garten, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Département Etude des Réacteurs (DER), CEA-Direction des Energies (ex-Direction de l'Energie Nucléaire) (CEA-DES (ex-DEN)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, Public Health Department, Hôpital de l'Archet, Institut de génétique humaine (IGH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infectious Diseases Department, Université Montpellier 1 (UM1), Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (EPOC), Observatoire aquitain des sciences de l'univers (OASU), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Régional de recherche et de Formation à la prise en charge Clinique de Fann (CRCF), CHNU Fann, Registre EPIMAD, CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Amiens-Picardie-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille, Sciences et Technologies, Laboratoire de Virologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de rhumatologie [Strasbourg], CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Pathogénie des infections systémiques (UMR_S 570), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], McGill University, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de Physique des Particules de Marseille (CPPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Aix Marseille Université (AMU), CHU Pontchaillou [Rennes], SEV, Groupe d'Etudes et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES), Service de virologie [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Saint-Etienne, University Hospital and University Jean Monnet, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Virologie et pathogenèse virale (VPV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, CHU de Fort de France, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université de Montpellier (UM), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION ), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP - U1043 INSERM - UMR5282 CNRS - UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Strasbourg, Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHD Vendee (La Roche Sur Yon), Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis (StaPath), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), Institut Pasteur [Paris] (IP), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre Hospitalier Départemental - Hôpital de La Roche-sur-Yon (CHD Vendée), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Médical de l'Institut Pasteur, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes], Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire Marseille, CHU Marseille, School of Civil and Environmental Engineering [Sydney], University of New South Wales [Sydney] (UNSW), Laboratoire d'Ingénierie Circulation Transport (LICIT UMR TE ), École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Université de Lyon-Université Gustave Eiffel, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), CHU de la Martinique [Fort de France], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Clermont-Ferrand, Stratégies thérapeutiques contre l'infection VIH et les maladies virales associées [iPLesp] (THERAVIR), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, multimorbidity, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, comorbidities, elderly, Cachexia, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Internal medicine, Diabetes mellitus, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Aged, 2. Zero hunger, Acquired Immunodeficiency Syndrome, business.industry, [SDV.MHEP.GEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Geriatry and gerontology, aging, virus diseases, HIV, medicine.disease, 030112 virology, Comorbidity, Obesity, CD4 Lymphocyte Count, 3. Good health, Cross-Sectional Studies, Infectious Diseases, Cohort, Coinfection, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Cohort study
Abstract: Background We assessed prevalence of multimorbidity (MM) according to year of human immunodeficiency virus (HIV) diagnosis in elderly people living with HIV (PLWH). Methods This was a cross-sectional study of MM in PLWH aged ≥70 years from the Dat’AIDS French multicenter cohort. MM was defined as at least 3 coexistent morbidities of high blood pressure, diabetes mellitus, osteoporosis, non-AIDS cancer, chronic renal failure, cardiovascular and cerebrovascular disease, obesity, undernutrition, or hypercholesterolemia. Logistic regression models evaluated the association between MM and calendar periods of HIV diagnosis (1983–1996, 1997–2006, and 2007–2018). The secondary analysis evaluated MM as a continuous outcome, and a sensitivity analysis excluded PLWH with nadir CD4 count Results Between January 2017 and September 2018, 2476 PLWH were included. Median age was 73 years, 75% were men, median CD4 count was 578 cells/μL, and 94% had controlled viremia. MM prevalence was 71%. HBP and hypercholesterolemia were the most prevalent comorbidities. After adjustment for age, gender, smoking status, hepatitis C and hepatitis B virus coinfection, group of exposure, nadir CD4 count, CD4:CD8 ratio, and last CD4 level, calendar period of diagnosis was not associated with MM (P = .169). MM was associated with older age, CD4/CD8 ratio Conclusions MM prevalence was high and increased with age, low CD4/CD8 ratio, and nadir CD4 count
Published: 2019

29. Impact of Covid-19 infection in high-risk coronary patients

Author: Carmona, A., primary, Marchandot, B., additional, Matsushita, K., additional, Curtiaud, A., additional, Elidrissi, A., additional, Trimaille, A., additional, Kibler, M., additional, Cardi, T., additional, Heger, J.O.E., additional, Hess, S., additional, Reydel, A., additional, Fafi-Kremer, S., additional, Schini-Kerth, V., additional, Jesel, L., additional, Ohlmann, P., additional, and Morel, O., additional
Published: 2021
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30. Cytokine release syndrome‐associated encephalopathy in patients with COVID‐19

Author: Perrin, P., primary, Collongues, N., additional, Baloglu, S., additional, Bedo, D., additional, Bassand, X., additional, Lavaux, T., additional, Gautier‐Vargas, G., additional, Keller, N., additional, Kremer, S., additional, Fafi‐Kremer, S., additional, Moulin, B., additional, Benotmane, I., additional, and Caillard, S., additional
Published: 2020
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31. Emergence du second foyer d’endémie d’encéphalite à tique en 2019

Author: Velay, A., primary, Janssen, C., additional, Gontard, L., additional, Chanzy, B., additional, Wendling, M., additional, Martinot, M., additional, Hansmann, Y., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2020
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32. Prédiction de la sévérité de la COVID-19 par les biomarqueurs du syndrome de relargage cytokinique au sein d’une population de transplantés rénaux

Author: Benotmane, I., primary, Perrin, P., additional, Gautier-Vargas, G., additional, Bassand, X., additional, Bedo, D., additional, Baldacini, C., additional, Sagnard, M., additional, Moulin, B., additional, Fafi-Kremer, S., additional, and Caillard, S., additional
Published: 2020
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33. Performance of genotypic algorithms for predicting tropism for HIV-1 CRF01_AE recombinant

Author: Soulie, C., Morand-Joubert, L., Cottalorda, J., Charpentier, C., Bellecave, P., Le Guen, L., Yerly, S., Montes, B., Fafi-Kremer, S., Dina, J., Avettand-Fenoel, V., Amiel, C., Roussel, C., Pallier, C., Zafilaza, K., Sayon, S., Signori-Schmuck, A., Mirand, A., Trabaud, M.A., Berger, S., Calvez, V., and Marcelin, A.G.
Published: 2018
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34. Safety study and therapeutic drug monitoring of the oral tablet formulation of posaconazole in patients with haematological malignancies

Author: Lemaitre, Florian, Le Guillou, Adrien, Pugliese, Pascal, Raffi, François, Cuzin, Lise, Katlama, Christine, Allavena, Clotilde, Dramé, Moustapha, Cotte, Laurent, Bani-Sadr, Firouzé, Orticoni, M, Soavi, M, Luquet- Besson, I, Ressiot, E, Carta- Padovani, M, Ducassou, M, Bertone, H, Galie, S, Galinier, A., Monclar, M, Ritleng, A, Ivanova, A., Blanco-Betancourt, C, Lions, C., Poizot-Martin, I., Dhiver, C, Saadia Mokhtari, M, Menard, A., Tissot Dupont, H, Toméi, C, Meddeb, L., Belkhir, A., Ravaux, I., Alvarez, M., Biezunski, N, Debard, A., Delpierre, C, Lansalot, P, Lelievre, L., Martin-Blondel, G., Piffaut, M, Porte, L., Saune, K, Delobel, P., Breaud, S., Ceppi, C, Chirio, D, Cua, E, Dellamonica, P., Demonchy, E, De Monte, A, Durant, J., Etienne, C, Ferrando, S, Garraffo, R, Michelangeli, C, Mondain, V., Bernaud, C, Billaud, E., Biron, C, Bonnet, B, Bouchez, S, Boutoille, D., Brunet-Cartier, C, Deschanvres, C, Gaborit, B., Hall, N, Le Turnier, P., Morineau, P, Reliquet, V., Sécher, S, Cavellec, M, Soria, A., Ferre, V., André-Garnier, E., Rodallec, A., Lefebvre, M, Grossi, O, Aubry, O., Amazzough, K., Benabdelmoumen, G, Bossi, P, Cessot, G, Charlier, C., Consigny, P, Danion, F., Dureault, A, Duvivier, C., Goesch, J, Guery, R., Henry, B., Jidar, K, Lanternier, F., Loubet, P., Lortholary, O., Louisin, C, Lourenco, J, Parize, P., Pilmis, B., Touam, F, Valantin, M, Tubiana, R., Agher, R, Seang, S, Schneider, L, PaLich, R, Blanc, C, Cabié, André, Abel, S., Pierre-François, S, Pasquier, J., Guitteaud, K, Turmel, J, Illiaquer, M, Fischer, P., Partisani, M., Cheneau, C., Priester, M, Batard, M, Bernard-Henry, C, de Mautort, E, Fafi-Kremer, S., Rey, D., Chirouze, C., Gardiennet, Q, Berger, J, N’Guyen, Y, Lambert, D., Hentzien, M., Lebrun, D., Brunet, A, Kmiec, I, Brodard, V, Chidiac, C., Ferry, T., Ader, F., Biron, F., Boibieux, A., Miailhes, P., Perpoint, T., Schlienger, I, Lippmann, J, Braun, E, Koffi, J, Longuet, C., Guéripel, V, Augustin-Normand, C, Brochier, C, Degroodt, S, Atoui, N, Le Moing, V., Makinson, A., Meftah, N., de Boever, C Merle, Montes, B, Montoya Ferrer, A, Reynes, J., Andre, M., Boyer, L, Bouillon, M, Delestan, M, May, T, Hocqueloux, L, Prazuck, T., Gubavu, C, Sève, A, Maka, A, Boulard, C., Thomas, G, Cheret, A, Goujard, C, Quertainmont, Y, Teicher, E., Lerolle, N., Deradji, O, Barrail-Tran, A, Landman, R, Joly, V, Rioux, C., Lariven, S, gervais, a, Lescure, F., Matheron, S., Louni, F, Godard, C, Julia, Z, Chansombat, M, Rahli, D, Mackoumbou-Nkouka, C, Charpentier, c, Descamps, D., Peytavin, G., Yazdanpanah, Y., Tattevin, P., Revest, M., Souala, F., Baldeyrou, M., Patrat-Delon, S, Chapplain, J, Bénézit, F., Dupont, M., Poinot, M., MAILLARD, A, Pronier, C., Guennoun, C, Poisson-Vanier, M, Jovelin, T., Sinteff, J, Arvieux, C, Botelho-Nevers, E., Gagneux-Brunon, A., Frésard, A., Lucht, F., Ajana, F, Aïssi, E, Alcaraz, I, Baclet, V, Bocket, L, Boucher, A, Choisy, P, Huleux, T., Lafon-Desmurs, B., Meybeck, A, Pradier, M, Robineau, O, Viget, N, Valette, M., Hoen, B., Lamaury, I, Fabre, I, Curlier, E, Ouissa, R, Schepers, K, Herrmann-Storck, C, Dournon, N, Merrien, D, Perré, P., Guimard, T, Bollangier, O, Leautez, S, Morrier, M, Boglione-Kerrien, C., Picard, S., Tron, C., Nimubona, S., Gangneux, J.-P., Lalanne, S., Lemaître, F., Bellissant, E., Verdier, M.-C., Petitcollin, A., Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Immunité et Infection, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), DDSIS 76, Institut national de recherche et de sécurité (Vandoeuvre lès Nancy) (INRS ( Vandoeuvre lès Nancy)), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION ), Laboratoire de Physique et Chimie Quantique, Université Mouloud Mamerri, Pôle des Maladies Infectieuses et Tropicales Clinique et Biologique, Fédération de Bactériologie-Hygiène-Virologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Département de Physique Nucléaire (ex SPhN) (DPHN), Institut de Recherches sur les lois Fondamentales de l'Univers (IRFU), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut des Matériaux, de Microélectronique et des Nanosciences de Provence (IM2NP), Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Etude des Réacteurs (DER), CEA-Direction de l'Energie Nucléaire (CEA-DEN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, CHU Nice [Cimiez], Hôpital Cimiez [Nice] (CHU), Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôtel-Dieu de Nantes, Service de virologie [CHU Nantes], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut des Sciences du Mouvement Etienne Jules Marey (ISM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses [CHU Pitié-Salêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Système membranaires, photobiologie, stress et détoxication (SMPSD), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Weill Cornell Medicine [Qatar], Institut Rayonnement Matière de Saclay (IRAMIS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Université Nice Sophia Antipolis (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], GEOMA, Université de Vigo, Universidate de Vigo, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Laboratoire d'aérologie (LA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service des Maladies Infectieuses, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon, France, parent, Pathogénie des Staphylocoques – Staphylococcal Pathogenesis, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hosp Civils Lyon, Serv Malad Infect, Lyon, France, Equipe 15, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Faculté des Mathématiques et des Sciences de la Matière, Université Kasdi Merbah Ouargla, Laboratoire de Géochimie Isotopique Environnementale (GIS) / Université de Nîmes (GIS), Université de Nîmes (UNIMES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU UCL Namur, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et tropicales, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacie de l'Hôpital Bichat, UMR CNRS 8179, Université de Lille, Sciences et Technologies-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Service de pneumologie, Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Unité des Rickettsies et pathogènes émergents (URPE), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Etienne, University Hospital and University Jean Monnet, Centre Hospitalier Tourcoing, CHU de Fort de France, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire de Génie des Procédés et Matériaux - EA 4038 (LGPM), CentraleSupélec, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Cancer Research, Posaconazole, Antifungal Agents, [SDV]Life Sciences [q-bio], Administration, Oral, Dat’AIDS cohort, Pharmacology, 030226 pharmacology & pharmacy, Gastroenterology, 0302 clinical medicine, MESH: Drug Monitoring, Medicine, Prospective Studies, Haematological malignancies, media_common, MESH: Aged, Hematology, MESH: Middle Aged, medicine.diagnostic_test, General Medicine, Middle Aged, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 90-90-90 target, 3. Good health, Posaconazole oral tablet, Oncology, Quartile, MESH: Young Adult, Hematologic Neoplasms, MESH: Administration, Oral, Female, Drug Monitoring, Antifungal prophylaxis, Safety, medicine.drug, Tablets, Drug, Adult, medicine.medical_specialty, media_common.quotation_subject, 030106 microbiology, Therapeutic drug monitoring, 03 medical and health sciences, Young Adult, Pharmacokinetics, Invasive fungal infections, Internal medicine, Pharmacovigilance, primary HIV infection, cascade of care, Humans, Aged, MESH: Humans, business.industry, MESH: Adult, TasP, Triazoles, MESH: Antifungal Agents, MESH: Prospective Studies, MESH: Male, MESH: Triazoles, MESH: Tablets, business, Liver function tests, MESH: Female, MESH: Hematologic Neoplasms
Abstract: International audience; PurposePosaconazole is a triazole antifungal widely used for prophylaxis of invasive fungal disease (IFI). Posaconazole tablets allow reaching higher plasma levels than the oral suspension, but safety data with this formulation in real life are scarce. This study aimed at evaluating the safety profile, the pharmacokinetic variability, and the concentration–toxicity relationship of posaconazole tablets in patients with haematological malignancies.MethodsSixty neutropenic patients treated with posaconazole tablets for prophylaxis of IFI were prospectively included in the study. Adverse drug reactions (ADR) were recorded and analyzed by the Regional Pharmacovigilance Centre to assess posaconazole implication. Blood samples were drawn once a week and plasma trough concentrations (C min) were assayed by LC–MS/MS. The rates of ADR by quartile of C min were compared.ResultsEighteen patients (30%) experienced at least one ADR attributed to posaconazole. Liver function test (LFT) abnormalities were encountered in 20% of patients and resulted in four (6.7%) treatment discontinuations. Posaconazole median (range) C min was 1.36 (< 0.1–3.44) µg/mL (inter-patient CV = 43.9%). During follow-up, 28.6% of patients had at least one concentration < 0.7 µg/mL, and 35.7% had at least one concentration > 2 µg/mL. Rates of ADR by quartile of C min were not different.ConclusionsPosaconazole was well tolerated; however, LFT abnormalities were frequent. ADR occurrence was not linked to posaconazole exposure. Because posaconazole concentrations were highly variable, TDM can be helpful to avoid underexposure to the drug and increase its efficacy in preventing IFI. Conversely, a large proportion of patients was overexposed and might have benefited of a dose reduction.
Published: 2018

35. An unusually high substitution rate in transplant-associated BK polyomavirus in vivo is further concentrated in HLA-C-bound viral peptides

Author: Domingo-Calap P, Schubert B, Joly M, Solis M, Untrau M, Carapito R, Georgel P, Caillard S, Fafi-Kremer S, Paul N, Kohlbacher O, González-Candelas F, and Bahram S
Subjects: viruses
Abstract: Infection with human BK polyomavirus, a small double-stranded DNA virus, potentially results in severe complications in immunocompromised patients. Here, we describe the in vivo variability and evolution of the BK polyomavirus by deep sequencing. Our data reveal the highest genomic evolutionary rate described in double-stranded DNA viruses, i.e., 10(-3)-10(-5) substitutions per nucleotide site per year. High mutation rates in viruses allow their escape from immune surveillance and adaptation to new hosts. By combining mutational landscapes across viral genomes with in silico prediction of viral peptides, we demonstrate the presence of significantly more coding substitutions within predicted cognate HLA-C-bound viral peptides than outside. This finding suggests a role for HLA-C in antiviral immunity, perhaps through the action of killer cell immunoglobulin-like receptors. The present study provides a comprehensive view of viral evolution and immune escape in a DNA virus.
Published: 2018

36. Torquetenovirus viremia for early prediction of graft rejection after kidney transplantation

Author: Solis, M., primary, Velay, A., additional, Gantner, P., additional, Bausson, J., additional, Filipputtu, A., additional, Freitag, R., additional, Moulin, B., additional, Caillard, S., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2019
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37. Épidémiologie des cas autochtones d’encéphalite à tiques en France : 2013–2018

Author: Velay, A., primary, Delagréverie, H., additional, Argemi, X., additional, Lohmann, C., additional, Kieffer, P., additional, Wendling, M., additional, Debriel, D., additional, Martinot, M., additional, Hansmann, Y., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2019
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38. Cytokine release syndrome‐associated encephalopathy in patients with COVID‐19.

Author: Perrin, P., Collongues, N., Baloglu, S., Bedo, D., Bassand, X., Lavaux, T., Gautier‐Vargas, G., Keller, N., Kremer, S., Fafi‐Kremer, S., Moulin, B., Benotmane, I., and Caillard, S.
Subjects: COVID-19, CYTOKINE release syndrome, INTRAVENOUS immunoglobulins, CHIMERIC antigen receptors, BRAIN diseases
Abstract: Background and purpose: Neurological manifestations in coronavirus disease (COVID)‐2019 may adversely affect clinical outcomes. Severe COVID‐19 and uremia are risk factors for neurological complications. However, the lack of insight into their pathogenesis, particularly with respect to the role of the cytokine release syndrome (CRS), is currently hampering effective therapeutic interventions. The aims of this study were to describe the neurological manifestations of patients with COVID‐19 and to gain pathophysiological insights with respect to CRS. Methods: In this longitudinal study, we performed extensive clinical, laboratory and imaging phenotyping in five patients admitted to our renal unit. Results: Neurological presentation included confusion, tremor, cerebellar ataxia, behavioral alterations, aphasia, pyramidal syndrome, coma, cranial nerve palsy, dysautonomia, and central hypothyroidism. Notably, neurological disturbances were accompanied by laboratory evidence of CRS. Severe acute respiratory syndrome coronavirus‐2 (SARS‐CoV‐2) was undetectable in the cerebrospinal fluid (CSF). Hyperalbuminorrachia and increased levels of the astroglial protein S100B were suggestive of blood−brain barrier (BBB) dysfunction. Brain magnetic resonance imaging findings comprised evidence of acute leukoencephalitis (n = 3, one of whom had a hemorrhagic form), cytotoxic edema mimicking ischaemic stroke (n = 1), or normal results (n = 2). Treatment with corticosteroids and/or intravenous immunoglobulins was attempted, resulting in rapid recovery from neurological disturbances in two cases. SARS‐CoV2 was undetectable in 88 of the 90 patients with COVID‐19 who underwent Reverse Transcription‐PCR testing of CSF. Conclusions: Patients with COVID‐19 can develop neurological manifestations that share clinical, laboratory and imaging similarities with those of chimeric antigen receptor T‐cell‐related encephalopathy. The pathophysiological underpinnings appear to involve CRS, endothelial activation, BBB dysfunction, and immune‐mediated mechanisms. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
Published: 2021
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39. Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma

Author: Soulie, Cathia, Descamps, Diane, Grudé, Maxime, Schneider, Véronique, Trabaud, Mary-Anne, Morand-Joubert, Laurence, Delaugerre, Constance, Montes, Brigitte, Barin, Francis, Ferre, Virginie, Raymond, Stéphanie, Jeulin, Hélène, Alloui, Chakib, Yerly, Sabine, Pallier, Coralie, Reigadas, Sandrine, Signori-Schmuck, Anne, Guigon, Aurélie, Fafi-Kremer, Samira, Haïm-Boukobza, Stéphanie, Mirand, Audrey, Maillard, Anne, Vallet, Sophie, Roussel, Catherine, Assoumou, Lambert, Calvez, Vincent, Flandre, Philippe, Marcelin, Anne-Geneviève, Lagier, E., Roussel, C., Le Guillou, H., Alloui, C., Bettinger, D., Pallier, C., Fleury, H., Reigadas, S., Bellecave, P., Recordon-Pinson, P., Payan, C., Vallet, S., Vabret, A., Henquell, C., Mirand, A., Bouvier-Alias, M., de Rougemont, A., Dos Santos, G., Morand, P., Signori-Schmuck, A., Bocket, L., Rogez, S., Andre, P., Tardy, J.C., Trabaud, M.A., Tamalet, C., Delamare, C., Montes, B., Schvoerer, E., Ferre, V., André-Garnier, E., Cottalorda, J., Guinard, J., Guiguon, A., Descamps, D., Brun-Vézinet, F., Charpentier, C., Visseaux, B., Peytavin, G., Krivine, A., Si-Mohamed, A., Avettand-Fenoel, V., Marcelin, A.G., Calvez, V., Lambert-Niclot, S., Soulié, C., Wirden, M., Morand-Joubert, L., Delaugerre, C., Chaix, M.L., Amiel, C., Schneider, V., Giraudeau, G., Brodard, V., Maillard, A., Plantier, J.C., Chaplain, C., Bourlet, T., Fafi-Kremer, S., Stoll-Keller, F., Schmitt, M.P., Barth, H., Yerly, S., Poggi, C., Izopet, J., Raymond, S., Barin, F., Chaillon, A., Marque-Juillet, S., Roque-Afonso, A.M., Haïm-Boukobza, S., Flandre, P., Grudé, M., Assoumou, L., Costagliola, D., Allegre, T., Schmit, J.L., Chennebault, J. M., Bouchaud, O., Magy-Bertrand, N., Delfraissy, J.F., Dupon, M., Morlat, P., Neau, D., Ansart, S., Jaffuel, S., Verdon, R., Jacomet, C., Lévy, Y., Dominguez, S., Chavanet, P., Piroth, L., Cabié, A., Leclercq, P., Ajana, F., Cheret, A., Weinbreck, P., Cotte, L., Poizot-Martin, I., Ravaud, I., Christian, B., Truchetet, F., Grandidier, M., Reynes, J., May, T., Goehringer, F., Raffi, F., Dellamonica, P., Prazuck, T., Hocqueloux, L., Yéni, P., Landman, R., Launay, O., Weiss, L., Viard, J.P., Katlama, C., Simon, A., Girard, P.M., Meynard, J.L., Molina, J.M., Pialoux, G., Hoen, B., Goeger-Sow, M.T., Lamaury, I., Beaucaire, G., Jaussaud, R., Rouger, C., Michelet, C., Borsa-Lebas, F., Caron, F., Khuong, M.A., Lucht, F., Rey, D., Calmy, A., Marchou, B., Gras, G., Greder-Belan, A., Vittecoq, D., and Teicher, E.
Subjects: virus diseases
Abstract: Objectives The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. Methods Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were >50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. Results On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P = 0.0455) and T215Y (P = 0.0455). Conclusions In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performed
Published: 2017

40. Prevalence of HIV-1 drug resistance in treated patients with viral load >50 copies/mL: a 2014 French nationwide study

Author: Assoumou, L., Charpentier, C., Recordon-Pinson, P., Grude, M., Pallier, C., Morand-Joubert, L., Fafi-Kremer, S., Krivine, A., Montes, B, Ferre, V., Bouvier-Alias, M., Plantier, C., Izopet, J., Trabaud, M., Yerly, S., Dufayard, J., Alloui, C., Courdavault, L., Le Guillou-Guillemette, H., Maillard, A., Amiel, C., Vabret, A., Roussel, C., Vallet, S., Guinard, J., Mirand, A., Beby-Defaux, A., Barin, F., Allardet-Servent, A., Ait-Namane, R., Wirden, M., Delaugerre, C., Calvez, V., Chaix, L., Descamps, D., Reigadas, S., Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuroimagerie cognitive (LCogn), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie (ERPCB), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), UR 0420 - Station de pathologie végétale, Laboratoire de pathologie forestière, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), CHU Orléans, CHU Clermont-Ferrand, Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de microbiologie [Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Service de Virologie [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Hôpital Cochin [AP-HP], CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Département de microbiologie [CHU Rouen], CHU Rouen, Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG), Hôpital l'Archet, Hôpital Avicenne [AP-HP], Centre Hospitalier Victor Dupouy, CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Tenon [AP-HP], CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Centre d'Etudes Lasers Intenses et Applications (CELIA), Université de Bordeaux (UB)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Bordeaux (UB), CHU Cochin [AP-HP], T1, Laboratoire Matériaux Optiques, Photonique et Systèmes (LMOPS), CentraleSupélec-Université de Lorraine (UL)-CentraleSupélec-Université de Lorraine (UL), CHU Tenon [APHP], Station de recherches sur la vache laitière, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Adult, Male, Genes, Viral, Genotype, Anti-HIV Agents, 030106 microbiology, HIV Infections, HIV Integrase, [SDV.MP.PRO]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Protistology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Drug Resistance, Multiple, Viral, HIV Protease, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Humans, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Treatment Failure, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Pharmacology, Sequence Analysis, DNA, Middle Aged, Viral Load, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, HIV Reverse Transcriptase, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, HIV-1, RNA, Viral, Reverse Transcriptase Inhibitors, Female, France, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Surveillance of HIV-1 resistance in treated patients with a detectable viral load (VL) is important to monitor, in order to assess the risk of spread of resistant viruses and to determine the proportion of patients who need new antiretroviral drugs with minimal cross-resistance.The HIV-1 protease and reverse transcriptase (RT) and integrase genes were sequenced in plasma samples from 782 consecutive patients on failing antiretroviral regimens, seen in 37 specialized centres in 2014. The genotyping results were interpreted using the ANRS v24 algorithm. Prevalence rates were compared with those obtained during a similar survey conducted in 2009.The protease and RT sequences were obtained in 566 patients, and the integrase sequence in 382 patients. Sequencing was successful in 60%, 78%, 78% and 87% of patients with VLs of 51-200, 201-500, 501-1000 and1000 copies/mL, respectively. Resistance to at least one antiretroviral drug was detected in 56.3% of samples. Respectively, 3.9%, 8.7%, 1.5% and 3.4% of patients harboured viruses that were resistant to any NRTI, NNRTI, PI and integrase inhibitor (INI). Resistance rates were lower in 2014 than in 2009. Resistance was detected in 48.5% of samples from patients with a VL between 51 and 200 copies/mL.In France in 2014, 90.0% of patients in AIDS care centres were receiving antiretroviral drugs and 12.0% of them had VLs50 copies/mL. Therefore, this study suggests that 6.7% of treated patients in France might transmit resistant strains. Resistance testing may be warranted in all treated patients with VL 50 copies/mL.
Published: 2017

41. Épidémiologie et prévention de l’encéphalite à tique en 2017

Author: Velay, A., primary, Paz, M., additional, Cesbron, M., additional, Argemi, X., additional, Lohmann, C., additional, Kieffer, P., additional, de Briel, D., additional, Martinot, M., additional, Hansmann, Y., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2018
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42. Spread of HIV-DNA in CD4+ T-cells subsets depends on ART initiation timing

Author: Gantner, P., primary, Barnig, C., additional, Partisani Marialuisa, M., additional, Beck-Wirth, G., additional, Faller, J.-P., additional, Martinot, M., additional, Mosheni-Zadeh, M., additional, Cheneau, C., additional, Batard, M.-L., additional, Fischer, P., additional, Uring-Lambert, B., additional, Bahram, S., additional, Rey, D., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2017
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43. HIV-DNA, CD32a CD4+ T-cells and immune activation on successfull dolutegravir-based regimen

Author: Gantner, P., primary, Partisani, M., additional, Barnig, C., additional, Beck-Wirth, G., additional, Faller, J.P., additional, Artinot, M., additional, Mohseni-Zadeh, M., additional, Cheneau, C., additional, Batard, M.L., additional, Fuchs, A., additional, Fischer, P., additional, Bahram, S., additional, Rey, D., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2017
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44. Status, quality and specific needs of Zika virus (ZIKV) diagnostic capacity and capability in National Reference Laboratories for arboviruses in 30 EU/EEA countries, MAY 2016

Author: Mögling, R. (Ramona), Zeller, H. (Hervé), Revez, J. (J.), Koopmans D.V.M., M.P.G. (Marion), Reusken, C.B.E.M. (Chantal), Aberle, S.W. (Stephan), Esbroeck, M. (M.) van, Christova, I., Vilibic-Cavlek, T. (Tatjana), Richter, J. (Jan), Zelena, H. (Hana), Fomsgaard, A. (Anders), Jääskeläinen, A. (Anne), Brichler, S. (Segolene), Illiaquer, M. (Marina), Gonfrier, G. (Geraldine), Leparc-Goffart, I. (Isabelle), Poveda, J.-D. (Jean-Dominique), Hober, D. (D.), Fleury, H. (Hervé), Fafi-Kremer, S. (Samira), Foulongne, V. (V.), Henquell, C. (Cécile), Leveque, N. (Nicolas), Carles, M.J. (Marie Josee), Mansuy, J.M. (J. M.), Schmidt-Chanasit, J. (Jonas), Nitsche, A., Papa, A. (Anna), Mentis, A. (Andreas), Takacs, M. (Maria), Love, A. (Arthur), Connell, J. (Jeff), Venturi, G. (Giulietta), Storozenko, J. (Jelena), Griskevicius, A. (Algirdas), Opp, M. (Matthias), Barbara, C. (Christopher), Reimerink, J.H.J. (Johan), Dudman, S.G. (Susanne Gjeruldsen), Pancer, K. (Katarzyna), Alves, M.J. (M. João), Ceianu, C.S., Ticha, E. (Elena), Županc, T.A. (Tatjana Avšič), Sanchez-Seco, M.P. (Maria Paz), Tolfvenstam, T. (Thomas), Aarons, E., Mögling, R. (Ramona), Zeller, H. (Hervé), Revez, J. (J.), Koopmans D.V.M., M.P.G. (Marion), Reusken, C.B.E.M. (Chantal), Aberle, S.W. (Stephan), Esbroeck, M. (M.) van, Christova, I., Vilibic-Cavlek, T. (Tatjana), Richter, J. (Jan), Zelena, H. (Hana), Fomsgaard, A. (Anders), Jääskeläinen, A. (Anne), Brichler, S. (Segolene), Illiaquer, M. (Marina), Gonfrier, G. (Geraldine), Leparc-Goffart, I. (Isabelle), Poveda, J.-D. (Jean-Dominique), Hober, D. (D.), Fleury, H. (Hervé), Fafi-Kremer, S. (Samira), Foulongne, V. (V.), Henquell, C. (Cécile), Leveque, N. (Nicolas), Carles, M.J. (Marie Josee), Mansuy, J.M. (J. M.), Schmidt-Chanasit, J. (Jonas), Nitsche, A., Papa, A. (Anna), Mentis, A. (Andreas), Takacs, M. (Maria), Love, A. (Arthur), Connell, J. (Jeff), Venturi, G. (Giulietta), Storozenko, J. (Jelena), Griskevicius, A. (Algirdas), Opp, M. (Matthias), Barbara, C. (Christopher), Reimerink, J.H.J. (Johan), Dudman, S.G. (Susanne Gjeruldsen), Pancer, K. (Katarzyna), Alves, M.J. (M. João), Ceianu, C.S., Ticha, E. (Elena), Županc, T.A. (Tatjana Avšič), Sanchez-Seco, M.P. (Maria Paz), Tolfvenstam, T. (Thomas), and Aarons, E.
Abstract: With international travel, Zika virus (ZIKV) is introduced to Europe regularly. A country’s ability to robustly detect ZIKV introduction and local transmission is important to
Published: 2017
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45. Impact of Cytomegalovirus infection on the outcome of patients with cirrhosis: a preliminary study

Author: Faivre, M., primary, Cottet, V., additional, Bour, J.-B., additional, Richou, C., additional, Valmary-Degano, S., additional, Thiéfin, G., additional, Andreoletti, L., additional, Raabe, J.-J., additional, Barraud, H., additional, Schvoerer, E., additional, Malvé, B., additional, Habersetzer, F., additional, Fafi-Kremer, S., additional, Binquet, C., additional, Jouve, J.-L., additional, Bronowicki, J.-P., additional, Doffoel, M., additional, Hillon, P., additional, Herbein, G., additional, Monnet, E., additional, and Di Martino, V., additional
Published: 2017
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46. Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma

Author: Soulié, Cathia, Descamps, Diane, Ronique Schneider, Vé, Trabaud, Mary-Anne, Morand-Joubert, Laurence, Delaugerre, Constance, Montes, Brigitte, Barin, Francis, Ferré, Virginie, Maillard, Anne, Vallet, Sophie, Roussel, Catherine, Assoumou, Lambert, Calvez, Vincent, Flandre, Philippe, Ve, Anne-Geneviè, Jeulin, H., Guigon, A., Lagier, E., Le Guillou, H., Alloui, C., Bettinger, D., Pallier, C., Fleury, H., Reigadas, S., Bellecave, P., Recordon-Pinson, P., Payan, C., Vabret, A., Henquell, C., Mirand, A., Bouvier-Alias, M., de Rougemont, Alexis, dos Santos, G., Morand, P., Signori-Schmuck, A., Bocket, L., Rogez, S., Andre, P., Tardy, J., Tamalet, C., Delamare, C., Schvoerer, E., André-Garnier, E., Cottalorda, J., Guinard, J., Guiguon, A., Brun-Vezinet, F., Charpentier, C., Visseaux, B., Peytavin, G., Krivine, A., Si-Mohamed, A., Avettand-Fenoel, V., Marcelin, A.-G., Lambert-Niclot, S., Wirden, M., Chaix, M., Amiel, C., Schneider, V., Giraudeau, G., Brodard, V., Plantier, J., Chaplain, C., Bourlet, T., Fafi-Kremer, S., Stoll-Keller, F., Schmitt, M., Barth, H., Yerly, S., Poggi, C., Izopet, Jacques, Raymond, S., Chaillon, A., Marque-Juillet, S., Roque-Afonso, A., Haim-Boukobza, S., Grude, Maxime, Costagliola, D., Allegre, T., Schmit, J., Chennebault, J., Bouchaud, O., Magy-Bertrand, N., Delfraissy, J., Dupon, M., Morlat, P., Neau, D., Ansart, S., Jaffuel, S., Verdon, R., Jacomet, C., Levy, Y., Dominguez, S., Chavanet, P., Piroth, L., Cabié, A., Leclercq, P., Ajana, F., Cheret, A., Weinbreck, P., Cotte, L., Poizot-Martin, I., Ravaud, I., Christian, B., Truchetet, F., Grandidier, M., Reynes, J., May, T., Goehringer, F., Raffi, F., Dellamonica, P., Prazuck, T., Hocqueloux, L., Yeni, P., Landman, R., Launay, O., Weiss, L., Viard, J., Katlama, C., Simon, A., Girard, Pascal, Meynard, J., Molina, J., Pialoux, G., Hoen, B., Goeger-Sow, M., Lamaury, I., Beaucaire, G., Jaussaud, R., Rouger, C., Michelet, C., Borsa-Lebas, F., Caron, F., Khuong, M., Lucht, F., Rey, D., Calmy, A., Marchou, B., Gras, G., Greder-Belan, A., Vittecoq, D., Teicher, E., Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Virologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de bactériologie-virologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre national de référence du VIH INSERM U966, Université de Tours (UT), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service de bactériologie-virologie [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Modélisation mathématique, calcul scientifique (MMCS), Institut Camille Jordan [Villeurbanne] (ICJ), École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Virologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Neuroimagerie cognitive (LCogn), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Faculté de médecine et pharmacie, CHU Clermont-Ferrand, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), UFR des Sciences de Santé (Université de Bourgogne), Université de Bourgogne (UB), Centre National de Référence des virus entériques [CHU de Dijon] (CNR virus entériques), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte (UVHCI), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-European Molecular Biology Laboratory [Grenoble] (EMBL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Limoges, Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantique (LINA), Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes (UN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'électronique, optoélectronique et microsystèmes (LEOM), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôtel-Dieu de Nantes, Service de chirurgie pédiatrique [Hôpital Lapeyronie-Arnaud de Villeneuve], Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (CHU), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie (ERPCB), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Interactions et dynamique des environnements de surface (IDES), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Strasbourg], Interaction virus-hôte et maladies du foie, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Environment and Sustainable Development Programme, European Commission - DG Research and Innovation, Centre Hospitalier Intercommunal de Toulon - La Seyne-sur-Mer, Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Magnétisme et Diffusion Neutronique (MDN), Modélisation et Exploration des Matériaux (MEM), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre Hospitalier du Pays d'Aix, CHU Bordeaux [Bordeaux], Fédération des Maladies Infectieuses [Bordeaux], CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Service de médecine interne 2 et maladies infectieuses, Unité de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), CHU Dijon, Département d'infectiologie (CHU de Dijon), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Hôpital Arnaud de Villeneuve [CHRU Montpellier], Bell Labs (BELL), Lucent Technologies, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], CIC - Biotherapie - AP-HP (cochin - Pasteur), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut d’Electronique et des Systèmes (IES), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service de Médecine interne, Maladies Infectieuses et Immunologie Clinique [Reims], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 (IEMN), Centrale Lille-Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN)-Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambrésis (UVHC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF), CHU Saint-Etienne, CHU Strasbourg, Geneva University Hospital (HUG), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bicêtre], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, CHU Besançon, Université de Franche-Comté (UFC), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne (LUBEM), Université de Brest (UBO), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement - Clermont Auvergne (LMGE), Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Orléans, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Service de Virologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Service de microbiologie [Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), University of Applied Sciences Kaiserslautern, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), Hopital l'Archet, Centre d'Information et de Soins de I'Immunodéficience Humaine (CISIH). Hôpital l'Archet 1, Hôpital l'Archet, REseau national d'Investigation clinique en VACcinologie (REIVAC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de Gestion des Essais de Produits de Santé (CeNGEPS), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Estación Experimental de Pastos y Forrajes 'Indio Hatuey', Société Ragt 2N, Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), University Hospital and University Jean Monnet, Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Camille Jordan (ICJ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Tours, Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, European Molecular Biology Laboratory [Grenoble] (EMBL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-IFR10, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes (UN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Laboratoire de virologie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon, Université Grenoble Alpes (UGA), Station de recherches sur la vache laitière, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Hôpital Arnaud de Villeneuve, T2, Laboratoire Matériaux Optiques, Photonique et Systèmes (LMOPS), CentraleSupélec-Université de Lorraine (UL)-CentraleSupélec-Université de Lorraine (UL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520 (IEMN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Ecole Centrale de Lille-Université Polytechnique Hauts-de-France (UPHF)-Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN), and de ROUGEMONT, Alexis
Subjects: Male, Drug Resistance, HIV Infections, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Genotype, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Viral, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, ddc:616, 0303 health sciences, Mutation, medicine.diagnostic_test, Proteolytic enzymes, virus diseases, Pharmacology and Pharmaceutical Sciences, Viral Load, Middle Aged, 3. Good health, ANRS Resistance AC11 Group, Infectious Diseases, Medical Microbiology, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, HIV/AIDS, ARV, Female, Infection, Viral load, Microbiology (medical), Adult, Anti-HIV Agents, Antiretroviral Therapy, CSF, Microbial Sensitivity Tests, Biology, [SDV.MP.PRO]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Protistology, Microbiology, Virus, resistance, 03 medical and health sciences, Clinical Research, Drug Resistance, Viral, medicine, Genetics, Humans, Highly Active, Gene, Pharmacology, 030306 microbiology, Lumbar puncture, Neurosciences, HIV, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Reverse transcriptase, Immunology, HIV-1, Antimicrobial Resistance, Nervous System Diseases
Abstract: International audience; Objectives: The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. Methods: Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were .50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. Results: On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P ¼ 0.0455) and T215Y (P ¼0.0455). Conclusions: In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performed.
Published: 2015

47. Méningo-encéphalite à tiques chez l’enfant en France : à propos d’un cas

Author: Levy, M., primary, Abi-Warde, M.-T., additional, Rameau, A.-C., additional, Fafi-Kremer, S., additional, Hansmann, Y., additional, Fischbach, M., additional, and Higel, L., additional
Published: 2016
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48. Anti-BK virus neutralizing antibody titers before transplantation predict BK virus replication in kidney transplant recipients after transplantation

Author: Solis, M., primary, Velay, A., additional, Porcher, R., additional, Domingo-Calap, P., additional, Soulier, E., additional, Joly, M., additional, Meddeb, M., additional, Kack-Kack, W., additional, Moulin, B., additional, Bahram, S., additional, Stoll-Keller, F., additional, Barth, H., additional, Caillard, S., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2016
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49. Neutralizing antibodies and pathogenesis of hepatitis C virus infection

Author: Fafi-kremer, S. (Samira), Fauvelle, C. (Catherine), Felmlee, D. (Daniel) J. (J), Zeisel, M. (Mirjam) B. (B), Lepiller, Q. (Quentin), Fofana, I. (Isabel), Heydmann, L. (Laura), Keller, F. (Francoise), and Baumert, T. (Thomas) F. (F)
Subjects: viruses, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie
Abstract: Hepatitis C virus (HCV) infection is a major cause of chronic liver disease worldwide. The interplay between the virus and host innate and adaptive immune responses determines the outcome of infection. There is increasing evidence that host neutralizing responses play a relevant role in the resulting pathogenesis. Furthermore, viral evasion from host neutralizing antibodies has been revealed to be an important contributor in leading both to viral persistence in acute liver graft infection following liver transplantation, and to chronic viral infection. The development of novel model systems to study HCV entry and neutralization has allowed a detailed understanding of the molecular mechanisms of virus-host interactions during antibody-mediated neutralization. The understanding of these mechanisms will ultimately contribute to the development of novel antiviral preventive strategies for liver graft infection and an urgently needed vaccine. This review summarizes recent concepts of the role of neutralizing antibodies in viral clearance and protection, and highlights consequences of viral escape from neutralizing antibodies in the pathogenesis of HCV infection.
Published: 2012

50. Interlaboratory comparison of BK virus DNA load assays

Author: Solis, M., primary, Meddeb, M., additional, Sueur, C., additional, Domingo-Calap, P., additional, Soulier, E., additional, Chabaud, A., additional, Perrin, P., additional, Moulin, B., additional, Bahram, S., additional, Caillard, S., additional, Stoll-Keller, F., additional, and Fafi-Kremer, S., additional
Published: 2015
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