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Introdução: A cobertura vacinal contra influenza vem sendo monitorada para avaliar o acesso, a adesão à vacina e a carga de doença após a vacinação anual dos idosos no Brasil, no estado do Rio de Janeiro e na sua capital. Objetivo: Analisar a tendência da cobertura vacinal com a vacina contra influenza, desagregada para a capital fluminense, o estado do Rio de Janeiro e o Brasil, em um período de 12 anos. Métodos: Foram calculadas taxas de cobertura a partir dos dados secundários do Datasus com as coberturas vacinais para vacina contra influenza para o município do Rio de Janeiro, o estado do Rio de Janeiro e o Brasil no período de 1999 a 2010. Para tal, foi utilizada a técnica de regressão polinomial. Resultados: A análise da tendência das coberturas vacinais contra influenza mostrou decréscimo nos 3 níveis analisados. Observou-se que a capital mantém coberturas constantemente mais baixas que as estaduais, que por sua vez mimetizam o comportamento das coberturas vacinais nacionais. Conclusões: O resultado evidenciou queda no país, no estado do Rio de Janeiro e, principalmente, na capital fluminense, no período analisado. Muitos fatores podem ser associados a essa queda, destacando-se a qualidade do registro de doses, a imprecisão das estimativas de dados populacionais fornecidas pelo IBGE para grupos com mais de 60 anos e a heterogeneidade populacional crescente.