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Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Agrobiología. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Maestría en Ciencias Biológicas Family agriculture is an agricultural system that is practiced in rural areas of the country. This is commonly practiced for self-consumption in family settings where all members participate as the work force. Family agriculture is a common practice in more than 90% of the farmland in Michoacan, where corn is the main agricultural crop. Fungal genres such as Aspergillus and Penicillium are frequently found in corn warehouses causing damage to the seeds integrity and probably, producing mycotoxins, such as ochratoxin A (OTA). As a consequence, the producers’ health can be affected and they can face serious economic losses. The aims of this study were to analyze the identity of the fungal species found in corn warehouses of producers practicing family agriculture, if the fungi affect the physical and physiological quality of the corn seeds, to determine contamination of the seeds by OTA and finally, to compare the common storage device of producers against a validated system by FAO. Fungi found in the location storage devices were from the genres Aspergillus, Fusarium and Penicillium, especially Aspergillus flavus and Fusarium verticilloides, which are fungal species known for being mycotoxigenic. The corn varieties here studied were resistant to fungal damage and had a high percentage of germination and vigor. OTA was present in all samples analyzed and the production of OTA by the fungal strains isolated from the corn samples was confirmed under laboratory conditions. The isolates that produced OTA in the culture media were: two from Aspergillus, one from Penicillium and one from Talaromyces. The validated storage device produced better results in terms of protecting the seeds from fungal damage and that they had higher percentage of germination and vigor; however, when the results were compared with the local storage devices, not significant statistical differences were found. Corn seeds from the local storage device contained a greater number of fungal species then the validated device. La agricultura familiar es un sistema agrícola practicado en zonas rurales del país, asociado al auto consumo de los productos agrícolas donde los miembros de la familia fungen como la principal fuerza de trabajo. En Michoacán este sistema se presenta en el 90% de los municipios, siendo el maíz el principal producto cultivado. Especies fúngicas pertenecientes a los géneros Aspergillus y Penicillium se presentan en los almacenes de maíz dañando los granos y contaminándolos con micotoxinas como la ocratoxina A (OTA), exponiendo la salud de los consumidores y provocando pérdidas económicas. Los objetivos de este estudio fueron: analizar la identidad de los hongos asociados a los almacenes de maíz de productores familiares del estado de Michoacán; conocer cómo afectan la calidad física y fisiológica de los granos almacenados, determinar la presencia de Ocratoxina A y comparar los sistemas de almacenamiento locales contra un sistema de almacenamiento validado internacionalmente. Los principales hongos encontrados en los almacenes pertenecen a los géneros Aspergillus, Fusarium y Penicillum; se encontró presencia de Aspergillus Flavus y Fusarium verticilloides, productores de micotoxinas. Las variedades de maíz utilizadas presentaron resistencia al daño y porcentajes de germinación y vigor altos. OTA se determinó en el 100% de las muestras analizadas y se logró confirmar la producción de OTA en condiciones de laboratorio por dos aislados de Aspergillus, uno de Penicillium y un aislado del genero Talaromyces. El sistema de almacenamiento validado obtuvo incidencias de hongos, daños y presencia de OTA menores, así como valores altos de germinación y vigor; sin embargo, las diferencias no fueron significativas estadísticamente. Los granos provenientes de almacenes locales tuvieron incidencias altas de hongos ocratoxigénicos, así como otras especies de importancia agronómica causantes de problemáticas en el almacenamiento y producción de micotoxinas.