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Mining is a high-risk activity due to its dangerous processes. Tin (Sn) is obtained from cassiterite ore and mining activities expose workers to the metal. Chronic exposure to Sn may cause pneumoconiosis, gastrointestinal and hematological effects, among others. This work aimed to assess the exposure of workers to tin in a cassiterite ore processing industry, using the speciation analysis in blood plasma. Twelve subjects donated the blood samples; six were occupationally exposed to Sn. Size exclusion chromatography separated proteins in blood plasma; a graphite furnace atomic absorption spectrometer determined total tin in the plasma and eluted fractions, while SDS-PAGE determined molecular masses of proteins. Tin levels in the workers’ plasma were four times higher than in the reference individuals. After fractionation, the metal only appeared in the total inclusion volume, not being possible to confirm the binding of tin to proteins, which certainly modifies their functions and impair workers’ health. Despite that, the work process needs to change since Sn levels in the workers’ plasma pointed to metal exposure. Further works are necessary to clarify whether the metal is free or bound to small proteins in blood plasma and understand the true impact of tin on workers’ health. RESUMO A mineração é uma atividade de alto risco devido aos seus processos perigosos. O estanho (Sn) é obtido do minério de cassiterita e as atividades da mineração expõem os trabalhadores ao metal. A exposição crônica ao Sn pode causar pneumoconiose, gastrointestinal e hematológica entre outros efeitos. Este trabalho avaliou a exposição de trabalhadores ao estanho em uma indústria de processamento de minério de cassiterita, utilizando a análise de especiação no plasma sanguíneo. Doze indivíduos doaram amostras de sangue, sendo seis expostos ocupacionalmente ao Sn. A SEC separou as proteínas do plasma sanguíneo, a GFAAS determinou a concentração total de estanho no plasma sanguíneo e frações eluídas, enquanto o SDS-PAGE determinou as massas moleculares das proteínas. O plasma dos trabalhadores apresentou níveis quatro vezes maiores do que os indivíduos de referência. Após fracionamento, Sn só apareceu no volume de inclusão, não sendo possível confirmar sua ligação às proteínas. Contudo, o processo de trabalho precisa mudar, pois os níveis de Sn no plasma dos trabalhadores apontam para exposição ao metal. Outros trabalhos são necessários para esclarecer se o metal está livre ou ligado a pequenas proteínas do plasma e entender o verdadeiro impacto do estanho na saúde dos trabalhadores.

Newly collected material from northern Namibia’s Otjihipa Mountains and west-central Angola allowed us to revisit the Afroedura bogerti Loveridge, 1944 group. The employment of additional gene markers, including nuclear markers, allowed us to identify two new species in the group and infer species boundaries and potential speciation events in Afroedura from southwestern Africa. The new Namibian material is recovered as a sister species to A. donveae, from which it differs mostly by the colour of the iris (copper versus black) and dorsal colouration. Material from the first elevational gradient of the escarpment in Benguela Province, Angola was found to be more closely related to A. bogerti than A. wulfhaackei. The differences between these two species are more subtle, although the new species exhibits higher mid-body scale rows (79.5 versus 74.8), different dorsal colouration and supranasal scales always in contact (versus 57% in contact).

This work describes the development of solid phase extraction methods for metal ions speciation with emphasis on chromium and arsenic, using Moringa oleifera seeds and their husks as bioadsorbents. Initially, characterization techniques including infrared spectroscopy, thermal analysis, scanning electron microscopy, energy dispersive spectroscopy and study of surface areas by theory adsorption multielement were used in physic chemical evaluation of husks and Moringa oleífera seeds. Subsequently, it is presented the development of flow system for extraction/preconcentration of Cr(III) and Cr(VI) species coupled to the spectrophotometry flame atomic absorption for determination of these species in food and environmental samples. The system is based on the selective retention of Cr(III) and Cr(VI) species in mini- columns filled with husks of the Moringa oleifera seeds. Chemical and flow variables were evaluated using the multivariate method. The retention of Cr(III) occurs in the approximately pH 7,0, and the Cr(VI) retention was approximately pH 1-2. The results of the optimized conditions, selected with the compromise between sensitivity and sample throughput were sample flow rate 4.5 mL min -1 , eluent flow rate of 4.0 mL min-1 ; eluent concentration of 0.01 mol L- 1 the HCl for Cr (III) desorption and 0.01 mol L-1 NaOH to Cr(VI) desorption. The detection limit was 1.9 mg L-1 for Cr (III) and 2.45 g L-1 for Cr (VI). The linear response range was from 5.73 to 1000 mg L- 1 for Cr ( III ) and 7.35 to 1000 mg L-1 for Cr ( VI ) . In order to validate the proposed method , it was applied to water and alcohol samples, as well as the analysis of standard certificate. The study carried out demonstrated the feasibility of using Moringa oleifera husks in flow systems for separation and pre- concentration of chromium species. At the end of the work presents the development of a method for selective extraction of arsenic inorganic species of and detection by Atomic Absorption Spectroscopy Graphite Furnace. The method is based on the selective retention of inorganic arsenic species using as the bioadsorbent Moringa oleifera seeds, the pH being variable to the separation process. At pH 7.0 this As (III )species is quantitatively retained by the seed while the adsorption of As( V) occurs to a lesser extent . The variables that affect the adsorption: mass and contact time were studied, having been found values of 1.0 g and 60 minutes as optimized values . The process of As (III) adsorption of the seeds was studied by starting the construction of adsorption isotherms. The method was applied to the speciation analysis of inorganic arsenic in water samples and evaluated the accuracy of the method based on the analysis of reference material. The values obtained showed high agreement with the actual values , demonstrating the efficiency of the proposed method. Nesse trabalho é descrito o desenvolvimento de métodos de extração em fase sólida para especiação de íons metálicos dando ênfase ao cromo e arsênio, utilizando as sementes de Moringa oleífera e suas cascas como bioadsorventes. Inicialmente, técnicas de caracterização incluindo espectrometria de infravermelho, análise termogravimétrica, microscopia eletrônica de varredura, espectroscopia de energia dispersiva e estudo de áreas superficiais pela teoria de adsorção multielementar foram utilizadas na avaliação físico-química das cascas e sementes integrais de Moringa oleífera. Posteriormente, é apresentado o desenvolvimento de um sistema de extração/pré-concentração em fluxo das espécies Cr(III) e Cr(VI) acoplado ao Espectrofotômetro de Absorção Atômica por Chama, para determinação destas espécies em amostras de interesse ambiental e alimentício. O sistema é baseado na retenção seletiva das espécies Cr(III) e Cr(VI) em mini-colunas preenchidas com cascas das sementes de Moringa oleífera. Variáveis químicas e de fluxo foram otimizadas utilizando o método multivariado. A retenção da espécie Cr(III) ocorre em pH 7,0 e a espécie Cr(VI) é retida em pH 1-2. Os resultados das condições otimizadas, selecionados com o compromisso entre a sensibilidade e a velocidade analítica, foram vazão da amostra 4,5 mL min-1; vazão do eluente 4,0 mL min-1; concentração do eluente 0,01 mol L-1 de HCl para dessorção de Cr(III) e 0,01 mol L-1 de NaOH para dessorção de Cr(VI). O limite de detecção foi de 1,9 μg L-1 para Cr (III) e 2,45 μg L-1 para Cr(VI). A faixa linear de trabalho foi 5,73 a 1000 μg L-1 para Cr(III) e 7,35 a 1000 μg L-1 para Cr(VI). A fim de validar o método proposto, o mesmo foi aplicado em amostras de água e bebidas alcoólicas, bem como na análise de padrão certificado. O estudo efetuado demonstrou a viabilidade do uso das cascas de sementes de Moringa oleífera em sistemas em fluxo para a separação e pré-concentração das espécies de cromo. Ao final do trabalho, é apresentado o desenvolvimento de um método para extração seletiva das espécies inorgânicas de arsênio e detecção por Espectroscopia de Absorção Atômica com Forno de Grafite. O método é baseado na retenção seletiva das espécies inorgânicas de arsênio utilizando como bioadsorvente as sementes integrais de Moringa oleífera, sendo o pH a variável determinante para o processo de separação. Em pH 7,0 a espécie As(III) é quantitativamente retida pelas sementes enquanto a adsorção de As(V) ocorre em menor extensão. As variáveis que afetam a adsorção: massa e tempo de agitação foram estudadas, tendo sido encontrados valores de 1,0 g e 60 minutos, respectivamente como valores otimizados. O processo de adsorção da espécie As(III) pelas sementes foi estudado à partir da construção de isotermas de adsorção. O método foi aplicado para análise de especiação de arsênio inorgânico em amostras de água e a exatidão do método avaliada à partir da análise de material de referência. Os valores encontrados apresentaram elevada concordância com os valores reais, evidenciando a eficiência do método proposto. Doutor em Química

Sciaenidae species (croakers and drums) are known for specializations in their sensory apparatus, such as otoliths and lateral line. Within this family, some Stelliferinae members remain taxonomically unresolved due to their cryptic aspects and low phenotypic disparities. Stellifer punctatissimus comprises a species complex putatively formed by three species on morphological grounds, but molecular data have indicated only two evolutionary lineages. Herein, we tested the hypothesis that this complex is composed of Stellifer gomezi (GM), S. menezesi (MN), and S. punctatissimus (PC), using the otolith shape and morphology to differentiate them. Seventy-seven sagittal otoliths (GM = 30, MN = 30, PC = 17) were photographed to outline the otolith contour by Elliptical Fourier descriptors. Ten otoliths for each group were used to detect shape variation in the sulcus acusticus through semilandmarks. Differences in otolith shape contour were recorded among the species by PERMANOVA (Pseudo-F = 4.02, df = 2, p < 0.001) and corroborated by the Linear Discriminant Analysis, which demonstrated three partially segregated groups with satisfactory re-classification rates. A larger sulcus acusticus (GM and MN), rounded projection (PC), and distinct rectangularity pattern were also recorded. Our results support the morphological hypothesis and thus contribute to narrowing the taxonomic gaps in Sciaenidae. Resumo As espécies de Sciaenidae (corvinas e pescadas) são conhecidas por especializações nos aparatos sensoriais, como otólitos e linha lateral. Nesta família, alguns membros de Stelliferinae permanecem com sua taxonomia não resolvida devido às características crípticas e baixas disparidades fenotípicas. Stellifer punctatissimus supostamente compreende um complexo formado por três espécies, mas os dados moleculares têm indicado apenas duas linhagens evolutivas. Aqui, testamos a hipótese de que esse complexo é composto por Stellifer gomezi (GM), S. menezesi (MN), e S. punctatissimus (PC), usando a forma e morfologia do otólito para diferenciá-las. Setenta e sete otólitos sagita (GM = 30, MN = 30, PC = 17) foram fotografados para delimitar o seu contorno pelos descritores Elípticos de Fourier. Dez otólitos, por grupo, foram usados para detectar a variação de forma no sulcus acusticus através dos semilandmarks. Foram registradas diferenças na forma do otólito entre as espécies através da PERMANOVA (Pseudo-F = 4,02, df = 2, p < 0,001) e pela análise discriminante linear, demonstrando três grupos parcialmente segregados com taxas de reclassificação satisfatórias. Também foram registrados um sulcus acusticus mais largo (GM e MN), projeção arredondada (PC) e padrões alométricos distintos no índice de retangularidade. Nossos resultados apoiam a hipótese morfológica; assim, contribuem na redução das lacunas taxonômicas em Sciaenidae.

The sustainable food valorization is capable to stimulate the local products consumption with quality and nutritional security. In this scenario, Unconventional Food Plants (UFPs) deserve attention representing an alternative for rural communities and contributing to the local and regional economy. This work aimed to add nutritional information, once it evaluates total Fe concentration, Fe-species (water soluble, acid soluble, and inorganic), proteins, and Fe- proteins distribution in beldroega (Portulaca oleracea L.), guasca (Galinsoga parviflora Cav.), ora-pro-nóbis (Pereskia aculeata Mill.), piracá (Vernonia scorpioides (Lam.) Pers.), and trapoeraba (Commelina benghalensis L.). Considering the Fe total concentration, the studied UPFs can be excellent Fe sources, when compared to foods of plant origin widely consumed and cultivated, detaching the guasca leaves (687±19 µg g-1). However, the guasca leaves showed low concentration of Fe associated to macromolecules and Fe soluble species (1.6±0.3 µg g-1). These results may justify the low bioavailability of Fe species. On the other hand, beldroega leaves presented the highest concentration of inorganic Fe (1.3±0.2 µg g-1). In the UFPs, there is high glutelins concentration when compared to the other protein groups, meaning that UFPs can be low-cost alternative to supplementing protein intake. Finally, for majority UFPs, except guasca leaves, Fe is mainly associated to albumins, being a good source of bioavailable Fe species. Resumo A valorização de alimentos sustentáveis é capaz de estimular o consumo de produtos locais com qualidade e segurança nutricional. Nesse cenário, as plantas alimentícias não convencionais (PANCs) merecem destaque, representando uma alternativa para as comunidades rurais e contribuindo para a economia local e regional. Este trabalho visa agregar informações nutricionais através da avaliação da concentração total de Fe, espécies de Fe (solúvel em água, solúvel em ácido e inorgânico) e proteínas, e da distribuição de Fe associado às proteínas em beldroega (Portulaca oleracea L.), guasca (Galinsoga parviflora), ora-pro-nóbis (Pereskia aculeata), piracá (Vernonia scorpioides) e trapoeraba (Commelina benghalensis L.). Considerando-se a concentração total de Fe, as PANCs podem ser uma excelente fonte de Fe, quando comparadas aos alimentos de origem vegetal comumente consumidos e cultivados, destacando-se as folhas de guasca (687±19 µg g-1). Entretanto, as folhas de guasca mostraram baixa concentração de Fe associado a macromoléculas (como proteínas) e espécies solúveis em água (1,6±0,3 µg g-1). Esses resultados podem justificar a baixa biodisponibilidade das espécies de Fe. Por outro lado, as folhas de beldroega apresentaram a maior concentração de Fe inorgânico (1,3±0,2 µg g-1). Nas PANCs, existe alta concentração de glutelínas, quando comparadas às concentrações dos outros grupos proteicos, significando que as PANCs podem ser uma alternativa de baixo custo para suplementar a ingestão de proteínas. Portanto, para a maioria das PANCs, exceto folhas de guasca, o Fe está principalmente associado às albuminas, sendo uma boa fonte de espécies de Fe biodisponível.

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais The study aimed to develop non-chromatographic methods for selenium speciation, organic and inorganic, using desorption methodology and inonização electrospray (DESI) and solid phase extraction (SPE), Moringa oleifera impregnated with thiosemicarbazide. For the studies of analysis with DESI source was used coupled to Mass Spectrometer, and evaluated the temperature of the capillary, the spray voltage, the solvent flow, and testing standards of the species studied: selenomethionine, selenomethylcistine, selenocysteine, selenite and selenate. The method was applied to Brazil-nut samples, cabbage, garlic and spinach. For speciation of selenium in SPE is used Moringa oleifera seeds impregnated with thiosemicarbazide were studied pH, concentration of reactants involved, the adsorption isotherm, adsorbent mass, contact time and optimizations with patterns of selenite and selenate. In addition, the physicochemical characterization of the material and the optimization of detection technique parameters were performed. The results obtained showed minimal detectable amount DESI in the picogram order; all species were detected in the samples except the spinach sample, which was not found selenometilcisteina. All organic species were confirmed by ion fragmentation when compared to standards. In studies of Moringa oleifera was selective removal of Se+4 with 0.25 g of the adsorbent mass, contact time of the adsorbent with the solution for 60 min, concentration of NaBH4 0.5% (w/v), HCl 1 0% (v/v) and pre-reducing L-cysteine was better. Observed was found that at pH = 3.5, the species Se+4 is retained by the seed, while the adsorption of Se+ 6 occurs to a lesser extent. The process of adsorption of the species Se+4 the seed impregnated with thiosemicarbazide was studied from the construction of adsorption isotherms, being adjustable to the models of Languimir and Freundluch. The results of the evaluated parameters are in accordance with the law, and the two methodologies can be employed in selenium speciation. Improvements are needed for quantification in the case of using DESI source for speciation and organic species in the case of SPE studies. O trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de métodos não cromatográficos para especiação de selênio, orgânico e inorgânico, utilizando metodologia de dessorção e inonização por electrospray (DESI) e extração em fase sólida (SPE), com Moringa oleifera impregnada com tiosemicarbazida. Para os estudos de análise com DESI, foi utilizada uma fonte acoplada a um Espectrômetro de Massas, sendo avaliada a temperatura do capilar, voltagem do spray, fluxo do solvente, e testes com padrões das espécies em estudo: selenometilonina, selenometilcistina, selenocisteina, selenito e selenato. O método foi aplicado em amostras de castanha-do-pará, couve, alho e espinafre. Para especiação de selênio com SPE, utilizaram-se sementes de Moringa oleifera impregnadas com tiosemicarbazida e foram estudados pH, concentração dos reagentes envolvidos, isoterma de adsorção, massa de adsorvente, tempo de contato e otimizações com padrões de selenito e selenato. Além disso, a caracterização físico-química do material e a otimização dos parâmetros da técnica de detecção foram realizados. Os resultados obtidos por DESI apresentaram quantidade mínima detectável na ordem de picograma; todas as espécies foram detectadas nas amostras, exceto na amostra de espinafre, onde não foi encontrado selenometilcisteina. Todas as espécies orgânicas foram confirmadas pela fragmentação do íon, quando comparadas aos padrões. Nos estudos com Moringa oleifera, houve remoção seletiva de Se+4 com massa do adsorvente de 0,25g, tempo de contato do adsorvente com a solução de 60 min, concentração do NaBH4 0,5% (m/v), HCl 1,0%(v/v), e o melhor pré-redutor foi L-cisteína. Observou-se que, em pH=3,5, a espécie Se+4 é retida pelas sementes, enquanto a adsorção de Se+6 ocorre em menor porcentagem. O processo de adsorção da espécie Se+4 pelas sementes impregnadas com tiosemicarbazida foi estudado a partir da construção de isotermas de adsorção, sendo ajustável aos modelos de Languimir e Freundluch. Os resultados obtidos dos parâmetros avaliados estão de acordo com a legislação, e as duas metodologias podem ser empregadas na especiação de selênio. Melhorias são necessárias para a quantificação no caso do uso da fonte DESI, e para a especiação de espécies orgânicas no caso dos estudos de SPE. Doutor em Química

Orientador: Prof. Dr. Bruno Lemos Batista Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Ciência e Tecnologia/Química, Santo André, 2021. O arsênio possui toxicidade elevada e pode ser transferido a alimentos através da absorção em solos contaminados. Sua toxicidade está associada à espécie química presente, que geralmente pode ser encontrada em 5 formas: arsenobetaína (AsB), ácido dimetilarsínico (DMA), ácido monometilarsônico (MMA), arsenato (As5+) e arsenito (As3+). As mais tóxicas são as inorgânicas (As5+ e As3+). O selênio auxilia no sistema imunológico devido à sua capacidade antioxidante. Dentre as espécies orgânicas mais tem-se: selenocisteínas (SeCys), selenometionina (SeMet) e selenometilcisteína (SeMC). As espécies inorgânicas são: selenito (Se4+) e selenato (Se6+). Em alimentos as formas mais comuns são as orgânicas (SeMet e SeCys). O As pode ser facilmente absorvido pelas raízes de arrozes sob cultivo alagado e atingir os grãos. O Se6+ pode atuar como antagonista na absorção de As devido à competitividade dos transportadores de sulfato devido à necessidade do As de ligar-se aos grupos tiol em aminoácidos. A especiação de Se é importante para entender os mecanismos de interação na co-exposição As e Se. Neste sentido o trabalho teve como objetivos avaliar o efeito em alguns parâmetros agronômicos bem como as espécies de As e Se formadas a partir da co-exposição dos elementos em cultivares de arrozes (Oryza sativa L.) Foi realizada a avaliação de 30 cultivares quanto à sua predileção por As, desta etapa foram selecionadas 7 cultivares. A Etapa II foi a avaliação da predileção para o Se, com seleção de EPAGRI 108 e BRS Pampa. A Etapa III foi a exposição e co-exposição das cultivares até a maturação dos grãos divididas em 6 grupos (n=5): controle, As5, Se5, As2,5+Se5, As5+Se5 e As10+Se5. A produtividade dos grãos e massa dos grãos foram os parâmetros mais significativos para a co-exposição As5+Se5 em relação às adições simples, de As5 e Se5. A especiação por HPLC-ICP-MS dos grãos indicou que a As-espécie predominante foi As3+. Na BRS Pampa mesmo com adições crescentes de As no solo, os valores de As3+ se mantiveram altos e constantes, demonstrando uma tolerância para As. Na EPAGRI 108 os valores de As3+ aumentaram de acordo com os incrementos de As, indicando uma sensibilidade para As sendo a cultivar EPAGRI 108 é mais segura para o consumo em relação a BRS Pampa quanto à absorção de As. Para o Se, a espécie predominante foi SeMet. Quando foi avaliada a interação entre as espécies de As e Se foi observado que na BRS Pampa a coexistência de Se não a afetou, entretanto para a cultivar EPAGRI 108 a presença de Se colaborou para o decréscimo da concentração de As3+ nos grãos. Foram realizadas análises dos solos de cultivo quanto à sua fertilidade e análises de As, Se, P, S e Fe em todas as partes da planta. Valores de TF solo/grãos para As se mantiveram constantes em ambas, porém para Se os valores de TF solo/grãos foram maiores para EPAGRI 108. A determinação das espécies de As e Se se mostraram eficientes e promissoras no entendimento do antagonismo entre os elementos em arrozes. Arsenic has high toxicity and can be transferred to food through absorption by contaminated soil. Its toxicity is associated with the chemical species present, which can generally be found in 5 forms: arsenobetaine (AsB), dimethylarsinic acid (DMA), monomethylarsonic acid (MMA), arsenate (As5+) and arsenite (As3+). The most toxic are the inorganic species (As5+ and As3+). Selenium is important to immune system due to its antioxidant capacity. Among the most organic species are: selenocysteine (SeCys), selenomethionine (SeMet) and selenomethylcysteine (SeMC). The inorganic species are selenite (Se4+) and selenate (Se6+). In food, the most common forms are organic (SeMet and SeCys). As can be easily absorbed by the roots of rice under flooded cultivation and reach the grains. Selenate can act as an antagonist in As uptake because of sulfate transporters due to the need for As to bind thiol groups on amino acids. Selenium speciation is important to understanding the interaction mechanisms in As and Se co-exposure. In this sense, the work aimed to evaluate the effect on agronomic parameters as well as As and Se species formed from the co-exposure of the elements in rice cultivars (Oryza sativa L.). Cultivar¿s prediction for As, from this stage 7 cultivars were selected. The second step was the assessment of predilection for Se, with selection of EPAGRI 108 and BRS Pampa. Third step was the exposure and co-exposure of cultivars until grain maturation, divided into 6 groups (n=5): control, As5, Se5, As2,5+Se5, As5+Se5 and As10+Se5. Grain yield and grain mass were the most significant parameters for As5+Se5 co-exposure compared to simple additions of As5 and Se5. The speciation by HPLC-ICP-MS of the grains indicated that the predominant As-species was As3+. In BRS Pampa, even with increasing additions of As in the soil, As3+ values remained high and constant, demonstrating a tolerance for As. In EPAGRI 108, As3+ values increased according to As increments, indicating a sensitivity to As being cultivar EPAGRI 108 is safer for consumption than BRS Pampa in terms of As absorption. For Se, the predominant species was SeMet. When the interaction between As and Se species was evaluated, it was observed that in BRS Pampa the coexistence of Se did not affect it, however, for the cultivar EPAGRI 108, the presence of Se contributed to the decrease in the concentration of As3+ in the grains. Analyzes of crop soils for fertility and analyzes of As, Se, P, S and Fe were carried out in all parts of the plant. TF values Soil/grain for As remained constant in both, but for Se the TF values soil/grain were higher for EPAGRI 108. The determination of As and Se species proved to be efficient and promising in understanding the antagonism between the elements in rice.

Orientadores: Clarisse Palma da Silva, Bárbara Simões Santos Leal Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: O estudo de mecanismos que geram novas espécies é considerado fundamental para as áreas de ecologia e evolução. A especiação é um processo contínuo em que o isolamento reprodutivo se estabelece, sendo de fundamental importância entender as origens das adaptações que contribuem para tal processo. Zonas híbridas são consideradas laboratórios naturais para o estudo da especiação e representam sistemas ideais para esses estudos. No presente trabalho, investigamos a diferenciação genômica entre as espécies que hibridizam na natureza Pitcairnia staminea (G.Lodd.) e P. albiflos (Herb.), ambas endêmicas de afloramentos rochosos localizados nas cidades do Rio de Janeiro e Niterói, sudeste do Brasil. Usando milhares de marcadores de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) genotipados através da técnica RAD-seq, estimamos o fluxo gênico interespecífico, bem como o tempo de divergência entre essas duas espécies e identificamos regiões genômicas candidatar a estarem sob seleção positiva que podem estar relacionadas ao isolamento reprodutivo. Ao contrastar diferentes cenários de especiação utilizando Approximate Bayesian Computation (ABC), encontramos evidências de divergência com redução gradual no fluxo gênico entre essas espécies ao longo do tempo. As estimativas dos parâmetros obtidos pelo ABC sugeriram que a população de P. albiflos tem um tamanho efetivo três vezes maior do que P. staminea e a divergência foi estimada como tendo ocorrido durante o Plioceno (4,7 Mya (CI = 1,3-8,5 Mya), permitindo que tais espécies acumulam diferenças em todo o genoma. Também detectamos um total de 17 dos 4.165 loci sob seleção positiva e com alta diferenciação genética (F ST > 0,85), 12 deles foram anotados e quatro genes candidatos foram identificados como envolvidos no isolamento reprodutivo. Quatro genes candidatos foram previamente associados à função de desenvolvimento do pólen, germinação e orientação do tubo polínico, estresse abiótico e aroma de flores para várias outras espécies de plantas, sugerindo uma interação entre barreiras extrínsecas e intrínsecas na evolução do isolamento reprodutivo entre tais espécies Abstract: The study of mechanisms that generate new species is considered fundamental for the broad areas of ecology and evolution. Speciation is a continuous process in which reproductive isolation is established, and it is of fundamental importance to understand the origins of the adaptations that contribute to this process. Hybrid zones are considered natural laboratories for the study of speciation and represent ideal systems for such studies. Here, we investigated genomic differentiation between the hybridizing species Pitcairnia staminea (G.Lodd.) and P. albiflos (Herb.), Using thousands of SNP genotyped through RAD-seq, we estimate effective population sizes, interspecific gene flow as well as time of divergence between these two sister species and identify candidate genomic regions for positive selection that may be related to the reproductive isolation. By contrasting different scenarios of speciation using Approximate Bayesian Computation (ABC), we found evidence of divergence with gradual reduction in gene flow between these species over time. The parameters estimations obtained by ABC suggested that P. albiflos population has a three time larger effective population size than P. staminea and the divergence was estimated to have occured in the Pliocene (4.7 Mya; CI = 1.3-8.5 Mya), allowing such species to accumulate genome-wide differences. We also detected a total of 17 out of 4,165 loci under positive selection with high genetic differentiation (F ST >0.85), 12 of them were annotated and four candidate genes were identified to be putatively involved in reproductive isolation. These four candidate genes were previously associated with the function of pollen development, pollinic tube germination and orientation, abiotic stress, and flower scent for several other plant species, suggesting an interplay between extrinsic and intrinsic barriers in the evolution of reproductive isolation between such species Mestrado Biologia Vegetal Mestra em Biologia Vegetal CNPQ 134011/2019-8

Orientadores: Marcus Aloizio Martinez de Aguiar, Flávia Maria Darcie Marquitti Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Compreender como a cooperação entre os indivíduos evoluiu é uma grande questão em Biologia Evolutiva: quando um indivíduo coopera com outro, ele aumenta a aptidão deste reduzindo a sua própria. Ainda assim, a cooperação é generalizada na natureza e também é uma grande força motriz da história natural e das trajetórias evolutivas dos organismos vivos. Neste projeto, desenvolvemos modelos teóricos para investigar as contribuições do uso de recursos, interações biológicas e genética para a evolução da cooperação e montagem e história evolutiva de comunidades. No capítulo 1, estendemos um modelo matemático publicado anteriormente para entender se a cooperação pode evoluir em um cenário de interação entre duas espécies com diferentes capacidades competitivas e comportamento cooperativo. Mostramos que as interações interespecíficas podem ser uma pressão seletiva fundamental para a evolução da cooperação em tal cenário; e que níveis adequados de cooperação entre indivíduos de diferentes populações são essenciais para manter níveis suficientes de recursos para a sobrevivência dessas populações em um ambiente. Nos capítulos 2 e 3, usamos simulações de computador para estudar a relação entre a diversificação de espécies, a estrutura das árvores filogenéticas e a evolução da cooperação. No capítulo 2, focamos na análise dos padrões de diversidade e composição fenotípica das comunidades geradas por nosso modelo. Embora alguns casos simulados pelo modelo não sejam capazes de prever a evolução de uma comunidade melhor do que um cenário sem seleção natural, as previsões sobre a evolução da cooperação são mais realistas nele do que naquele em que foi construído. No capítulo 3, nos concentramos em estudar a forma das árvores filogenéticas de comunidades simuladas. Mostramos que a inclusão de pressão seletiva não alterou as métricas filogenéticas significativamente em comparação a um modelo sem seleção natural. Ainda assim, nosso modelo foi capaz de prever, em muitos casos, a forma das filogenias empíricas, várias das quais continham espécies com comportamento cooperativo Abstract: Understanding how cooperation among individuals evolved is a great question in Evolutionary Biology: when one individual cooperates with another, it raises the fitness of the latter by reducing its own. Still, cooperation is widespread in nature, and is also a major force driving the natural history and evolutionary trajectories of living organisms. In this project, we developed theoretical models to investigate the contributions of resource use, biological interactions and genetics to the evolution of cooperation and assembly and evolutionary history of communities. In chapter 1, we extended a previously published mathematical model to understand if cooperation might evolve in a scenario of interaction between two species with different competitive capacities and cooperative behavior. We show that interspecific interactions might be a fundamental selective pressure to the evolution of cooperation in such a scenario; and that adequate levels of cooperation between individuals of different populations are essential for maintaining sufficient levels of resources to the survival of these populations in an environment. In chapters 2 and 3, we use computer simulations to study the relation between species diversification, the structure of phylogenetic trees and the evolution of cooperation. In chapter 2, we focused on the analysis of diversity patterns and phenotypic composition of communities generated by our model. Although some cases simulated by the model are not able to predict the evolution of a community better than a model without natural selection, predictions regarding the evolution of cooperation are more realistic in it than in the one it was built upon. In chapter 3, we focused on studying the shape of phylogenetic trees of simulated communities. We show that the inclusion of selective pressure did not alter phylogenetic metrics significantly in comparison to a model without natural selection. Still, our model was able to predict, in many instances, the shape of empirical phylogenies, several of which comprised species with cooperative behavior Doutorado Ecologia Doutor em Ecologia CAPES 0 FAPESP 2018/02769-3

Nos meados do século XVIII, Carl von Linné, ou Carl Lineu (1707-1778), justamente conhecido como o pai da botânica, e os seus contemporâneos presumiam que todas as espécies haviam sido criadas por um ente superior e que a sua forma e o seu número eram constantes. «As espécies são tantas como as que foram criadas no início pelo Infinito», escreveu Lineu em 1758. Se o Criador era perfeito, então, além de definitiva, a estrutura e a função dos seres vivos eram perfeitas e as necessárias para um adequado e permanente (infinito) funcionamento da vida na Terra. Influenciados pela filosofia essencialista, ilustrada por Platão (428/427- -348/347 a. C.) na conhecida alegoria da caverna, Lineu e os demais naturalistas pré-darwinianos supunham que a descrição dos produtos da criação, i. e., a prática da sistemática biológica, tinha por fim último a identificação das propriedades essenciais atribuídas pelo Criador às coisas vivas. Uma propriedade essencial – uma essência – era entendida como um elemento básico, neste caso de um ser vivo, sem o qual ele não pode ser o que é. A essência seria a causa direta da sua perfeição e intemporalidade. As propriedades não essenciais eram meramente acidentais. Lisboa Capital Verde Europeia 2020 info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The estuaries are defined as the region of mixing fresh water from the river and sea water. They are characterized as dynamic ecosystems inserted in a complex hydrographic network. Among the estuaries, the Amazon River estuary stands out as one of the most important in the world. The present study aimed to carry out the complete speciation of nickel and cobalt in the Amazon estuary. Water samples were collected during the scientific expedition GEOTRACES M147 on board the research ship Meteor (Germany). A total of 106 samples were collected, which were subdivided into 2 groups: filtered (using 0.2 μm membranes) and unfiltered (>0.2 μm). The determination of Ni (II) and Co (II) was carried out simultaneously in the presence of dimethylglyoxime (DMG) 0.1 mol L-1 as complexing agent by adsorptive cathodic stripping voltammetry (AdCSV). During the study it was observed the formation of Ni complexes with DMG with high stability constant (log K >17), thus allowing the determination of “reactive” Ni bound to labile organic complexes (log K 23). The addition of dissolved (0.2 μm) species of Ni and Co was also observed, which were observed in high salinity samples (~ 30-35). Thus, it can be concluded that Ni and Co species enter the estuarine zone predominantly associated with particles (~70-90%), mainly related to the Amazon River region. Colloidal species (0.015-0.2 μm) of Ni were also observed in the mixing zone. However, most of the dissolved Ni is transported in the estuarine mixing zone as soluble species (0,2 μm). A determinação de Ni (II) e Co (II) foi realizada de forma simultânea na presença do complexante DMG 0,1 mol L-1 por voltametria adsortiva de redissolução catódica (AdCSV). Durante o estudo, observou-se a formação de complexos de Ni com a DMG com elevada constante de estabilidade (log K 17), permitindo assim a determinação de Ni “reativo” ligado a complexos orgânicos lábeis (log K

CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior A contaminação por arsênio em alimentos e na água potável tem despertado preocupação mundial devido aos efeitos tóxicos dessa substância ao organismo humano. No capítulo 2 este trabalho desenvolveu um método para determinação e especiação das formas inorgânicas e orgânicas de arsênio mais comumente presente em amostras de arroz: arsenato As(V), arsenito As(III), ácido monometilarsônico (MMA) e ácido dimetilarsínico (DMA), utilizando a técnica Cromatografia Líquida de Alta Eficiência Acoplada a Espectrometria de Fluorescência Atômica com Geração de Hidretos (HPLC-HG-AFS). A melhor resolução cromatográfica foi obtida em pH 6,2, fase móvel com concentração 20 mmol L-1 e fluxo 0,57 mL min-1, HCl 5,55 % v/v e NaBH4 0,90 % m/v. A veracidade do método foi confirmada por meio dos baixos valores obtidos de erro relativo quando aplicado em um material de referência certificado (NIST 1568b): As inorgânico total 6,63%, DMA 3,44%, MMA 0% e As total 0,53%. Em testes de recuperação o método proposto mostrou-se promissor como mostram as faixas de recuperação obtidas para as amostras de arroz A (100,8%) e H (102,1%). No capítulo 3 este trabalho apresentou um procedimento inédito para remoção das espécies As (III), As (V) e DMA de águas usando hidróxido duplo lamelar incorporado com nitroprussiato (HDL-NP). O material se mostrou seletivo para as espécies de arsênio em função do pH. Foi observado que em pH 2,00 todo o As (V) é adsorvido e parte do DMA (25%). Em pH 6,02 e 12,00 somente As (III) e As (V) são adsorvidos sendo maior o potencial para adsorção do As (V). Diante disso, foi feito o estudo das isotermas de adsorção para o As (V) no qual o modelo de Langmuir forneceu melhor ajuste em pH 2,00 e 6,02 (R² = 0,9996 e 0.9501) e o valor máximo da capacidade de adsorção (qmáx 77,63 e 18,84 mg g-1) foi próximo do valor experimental (76,9 e 18,0 mg g-1), respectivamente. Em pH 12,00 o modelo de Freundlich forneceu melhor ajuste (R² = 0,9912). Em relação à cinética observa-se que o processo de adsorção é favorável pois o tempo para remoção do As (V) usando HDL-NP é baixo (menor que 30 mintos). Arsenic contamination in food and potable water is of worldwide concern, due to the toxic effects of the substance in humans. Chapter 2 of this work describes the development of a method using high performance liquid chromatography coupled with hydride generation atomic fluorescence spectrometry (HPLC-HG-AFS) for the determination and speciation of the inorganic and organic forms of arsenic most commonly found in rice samples: arsenate (As(V)), arsenite (As(III)), monomethylarsonic acid (MMA), and dimethylarsinic acid (DMA). The best chromatographic resolution was obtained at pH 6.2, using a mobile phase concentration of 20 mmol L-1 and flow rate of 0.57 mL min-1, 5.55% v/v HCl, and 0.90% m/v NaBH4. The accuracy of the method was confirmed by the low relative error values obtained in analysis of a certified reference material (NIST 1568b): 6.63% total inorganic As, 3.44% DMA, 0% MMA, and 0.53% total As. The proposed method presented satisfactory recoveries of 100.8% and 102.1% for rice samples A and H, respectively. Chapter 3 describes a novel procedure for the removal of As(III), As(V), and DMA from water using a lamellar double hydroxide combined with nitroprusside (DLH-NP). The material was found to be selective for arsenic species, as a function of pH. At pH 2.00, all the As(V) was adsorbed, together with part of the DMA (25%). At pH 6.02 and pH 12.00, only As(III) and As(V) were adsorbed, with greater potential for the adsorption of As(V). For the adsorption of As(V) on LDH-NP at pH 2.00 and 6.02, the Langmuir model provided the best fit to the experimental data R² = 0.9996 and 0.9501, respectively. The maximum adsorption capacity (qmax) (77.63 and 18.84 mg g-1) are in agreement with the value obtained experimentally (76.9 and 18.0 mg g-1), respectively. At pH 12.00, the Freundlich model provided the best fits, with R² values of 0.9912. The kinetics of the process showed that the adsorption was favorable as the time for removing As (V) using LDH-NP is low (less than 30 minutes).

Submitted by Lucas Pellegrini Elias (lucas.elias@unesp.br) on 2020-07-17T03:49:29Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Lucas_Pellegrini_Elias_GMA_2020.pdf: 2276671 bytes, checksum: 6477b5ea8259a4900e1e6b89027506f8 (MD5) Rejected by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: - Agradecimento CAPES: a CAPES publicou uma portaria na qual determina como deve ser colocado o agradecimento. A frase deve estar no capítulo "Agradecimentos" e deve ser exatamente esta: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001”. Agradecemos a compreensão. on 2020-07-28T13:32:42Z (GMT) Submitted by Lucas Pellegrini Elias (lucas.elias@unesp.br) on 2020-07-28T15:21:42Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_GMA_2020_Lucas_Pellegrini_Elias.pdf: 2277047 bytes, checksum: 82525d9d48196b9f2deda399c40de270 (MD5) Approved for entry into archive by Ana Paula Santulo Custódio de Medeiros null (asantulo@rc.unesp.br) on 2020-07-29T12:20:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 elias_lp_me_rcla.pdf: 2256124 bytes, checksum: dcd929268e00495d8494a9dc996cca5e (MD5) Made available in DSpace on 2020-07-29T12:20:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 elias_lp_me_rcla.pdf: 2256124 bytes, checksum: dcd929268e00495d8494a9dc996cca5e (MD5) Previous issue date: 2020-07-14 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Distribuído de maneira heterogênea na Crosta, o arsênio (As) é um elemento biodisponível nos mais variados sistemas ambientais. Sob quatro estados de oxidação, é caracterizado por suas espécies orgânicas e inorgânicas (AsV e AsIII), sendo estas últimas as mais tóxicas. Considerado como não-essencial aos processos biológicos, também pode apresentar propriedades nocivas aos seres vivos quando expostos a altas concentrações, principalmente no que diz respeito às suas espécies inorgânicas. Apesar de sua presença no ambiente estar relacionada a processos naturais, tais como intemperismo, vulcanismo e atividades biológicas, a mobilização do arsênio também é resultante de ações antrópicas, como mineração, atividades industriais e agrícolas. A biotransformação desses compostos é regular, formando espécies voláteis que podem ser adsorvidas, lixiviadas, reduzidas etc. Diante desta problemática, torna-se fundamental o monitoramento deste elemento, sobretudo nos sistemas aquáticos. Portanto, o aprimoramento de métodos analíticos é essencial para a determinação, especiação e possível mitigação de seus impactos. Com isso, a técnica de Difusão em Filmes Finos por Gradiente de Concentração (DGT) surge como uma significativa ferramenta para a avaliação in situ de arsênio, selecionando e pré-concentrando o analito no sistema a ser monitorado. Permitindo a determinação das frações lábeis dos elementos em baixas concentrações, os dispositivos apontam características robustas para aplicação em diferentes ambientes, apresentando a vantagem de preservar as espécies sorvidas e permitindo amostragens por longos períodos. Em vista da contaminação de arsênio em diferentes áreas do Pantanal brasileiro, a aplicação da técnica se deu na sub-região da Nhecolândia (MS). Esta área é caracterizada por suas complexas características hidrológicas e hidroquímicas e pela presença natural desse elemento em suas águas. Determinações in situ foram realizadas, nas quais dispositivos foram imersos em três lagoas distintas para avaliar o comportamento biogeoquímico de arsênio e a sua biodisponibilidade no ambiente. Amostras foram coletadas de ambas as lagoas para a avaliação in lab do elemento em diferentes frações. Os resultados obtidos indicam a presença de suas espécies inorgânicas nas águas superficiais das lagoas, em diferentes concentrações. Heterogeneously distributed in the crust, arsenic (As) is a bioavailable element in various environmental systems. Under four oxidation states, it is characterized by its organic and inorganic species (AsV and AsIII), the latter being the most toxic. Considered as non-essential to biological processes, As can be one of the most harmful pollutants to living beings under high exposures, especially with regard to its inorganic species. Although its presence in the environment is related to natural processes, As mobilization is also the result of anthropic actions, such as industrial and agricultural activities and mining. The biotransformation of these compounds is regular, forming volatile species, which can be adsorbed, leached, reduced etc. In view of this problem, monitoring of this element is essential, especially in aquatic systems. Therefore, the improvement of analytical methods is crucial for the determination, speciation analysis and possible mitigation of impacts. Thus, the Diffusive Gradients in Thin films technique (DGT) emerges as a significant tool for the in situ assessment of As as well as for selecting and pre-concentrating the analyte in the system to be monitored. Allowing the determination of labile fractions of the analytes in low concentrations, the devices point out robust characteristics for application in different systems, presenting the advantage of preserving the adsorbed species and allowing sampling for long periods. In view of the arsenic contamination in different areas of the Brazilian Pantanal, DGT was applied in lakes of the Nhecolândia (MS) sub-region. This area is characterized by its complex hydrological and hydrochemical systems and by the natural presence of this element in its waters. In situ determinations were performed, in which DGT devices were immersed in three distinct lakes to assess the biogeochemical behavior of arsenic and bioavailability in the environment. Samples were collected from both lakes for in lab evaluation of the element in different fractions. The results obtained indicate the presence of their inorganic species in surface waters of the lakes, in different concentrations. CAPES: 001 FAPESP: 2016/14227-5

PROQUALI (UFJF) Os materiais particulados podem provir de fontes de origem natural ou artificial. Interferem na qualidade do ar, podendo prejudicar a visibilidade, afetar a dispersão e absorção da radiação solar, ocasionar a acidificação de nuvens e da chuva, além de poder gerar danos à saúde humana, como doenças respiratórias. O Arsênio está presente na natureza em diferentes formas químicas e, um dos meios de exposição humana a níveis elevados de arsênio inorgânico, ocorre através da inalação do ar contaminado. O Arsênio inorgânico é mais tóxico que as suas formas orgânicas, evidenciando a importância de monitorá-lo no material particulado atmosférico. Foi proposto um método de extração por ponto nuvem para especiação de arsênio inorgânico em amostras de material particulado atmosférico e detecção por espectrofotometria UV-Vis. Os parâmetros relacionados à extração por ponto nuvem foram otimizados de forma univariada (n = 2) e os melhores resultados obtidos foram: pH 1,5; 0,8 mmol L-1 de molibdato de amônio; 0,06 % v v-1 de Triton X-114; 0,05 mmol L-1 de tartarato de antimônio e potássio e 0,2 mmol L -1 de ácido ascórbico. A precisão para esse estudo se demonstrou adequada (RSD: 3-10%). Foi feito um estudo de interferência e o íon fosfato demonstrou-se o principal interferente. Avaliou-se o modelo de regressão linear na faixa de 0,04 – 0,12 mg L-1 , através da ANOVA à 95% de confiança. Não houve evidências de heterocedasticidade dos dados (Ccalculado = 0,3989 < Ctabelado = 0,6838) e de falta de normalidade (Wcalculado = 0,971 > Wtabelado = 0,874). Não se observou evidência de falta de ajuste para o modelo obtido (Fcalculado = 1,41 < Ftabelado (3,10) = 3,71) e, portanto, o mesmo pode ser usado para previsões. Os limites de detecção e quantificação instrumentais foram LOD = 0,012 mg L-1 e LOQ = 0,04 mg L-1 , respectivamente. A seletividade foi avaliada e o método demonstrou ser seletivo para As (V). A oxidação de As (III) a As (V) foi feita com KMnO4. Para a determinação dos teores de As nas amostras, estabeleceu-se um método de extração assistida por ultrassom, utilizando ácido clorídrico 6 mol L -1 . Os ensaios de adição e recuperação, em dois níveis (n = 3), mostraram valores insatisfatórios de recuperação para as amostras (44 – 49%). Foi feita a curva por adição de padrão, confirmando a existência de efeito de matriz. Suspeitou-se de interferência de fosfato, e foi feito, a tentativa de precipitação de fosfato de cálcio, sem sucesso. O método foi aplicado a uma amostra de material particulado atmosférico, e a quantificação feita por adição de padrão. Porém, os teores de As foram elevados e a sua quantificação na amostra não foi conclusiva. Particulate materials may come from natural or artificial sources. They interfere with air quality and may impair visibility, affect the dispersion and absorption of solar radiation, cause acidification of clouds and rain, and may cause damage to human health, such as respiratory diseases. Arsenic is present in nature in different chemical forms, and one of the means of human exposure to high levels of inorganic arsenic is through inhalation of contaminated air. Inorganic arsenic is more toxic than its organic forms, detaching the importance of monitoring it in atmospheric particulate matter. A cloud point extraction method was proposed for inorganic arsenic speciation in atmospheric particulate matter samples and detection by UVVis spectrophotometry. The parameters related to cloud point extraction were optimized (n = 2) and the best results obtained were: pH 1.5; 0.8 mmol L-1 ammonium molybdate; 0.06% v v1 of Triton X-114; 0.05 mmol L-1 of antimony potassium tartrate and 0.2 mmol L-1 of ascorbic acid. The accuracy for this study was shown to be adequate (RSD: 3-10%). A interference study was performed and the phosphate proved to be the main interferent. The linear regression model in the range of 0.04 - 0.12 mg L-1 was evaluated by the 95% confidence ANOVA. There was no evidence of heteroscedasticity of data (Ccalculated = 0.3989 < Ctabulated = 0.6838) and lack of normality (Wcalculated = 0.971 > Wtabulated = 0.874). There was no evidence of lack of fit for the obtained model (Fcalculated = 1.41 < Ftabulated (3;10) = 3.71) and therefore can be used for predictions. The limits of instrumental detection and quantification were LOD = 0.012 mg L-1 and LOQ = 0.04 mg L-1 , respectively. Selectivity was evaluated and the method proved to be selective for As (V). The oxidation of As (III) to As (V) was done with KMnO4. To determine the As levels in the samples, an ultrasound-assisted extraction method was established, using 6 mol L-1 hydrochloric acid. The addition to recovery tests, on two levels (n = 3), showed unsatisfactory recovery values for the samples (44 - 49%). The calibration was performed by standard addition method, confirming the existence of matrix effect. Phosphate interference was suspected, and an attempt was made to precipitate calcium phosphate, without success. The method was applied to a sample of atmospheric particulate matter, and quantification made by standard addition method. However, the levels of As were high and their quantification in the sample was not conclusive.

CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O lodo de esgoto é um subproduto gerado nas estações de tratamento de efluentes e tem sido utilizado como condicionador e fertilizante de solos. Entretanto, o lodo também pode apresentar contaminantes inorgânicos e orgânicos, por isso, o uso de técnicas como a fitorremediação tem sido uma alternativa econômica e ecológica para reaproveitar e descontaminar o lodo. Neste contexto, surge Catharanthus roseus (L.) G. Don que é uma planta ornamental e medicinal, mas que também apresenta tolerância a diferentes tipos de estresses ambientais. Dessa forma, a primeira parte deste trabalho teve como objetivo avaliar o potencial de C. roseus para fitorremediação de As, Ba, Cd, Cu, Cr, Ni, Pb, Se e Zn em substrato a base de lodo de esgoto. Para isso, foi avaliado os fatores de bioconcentação (FB) e translocação (FT), após o cultivo de C. roseus em lodo:vermiculita (70:30%) e em substrato comercial (100%) em vasos na casa de vegetação por 108 dias. Os resultados mostraram que C. roseus apresentou FB superior a 1 para Cd, Cu e Zn no lodo de esgoto, indicando que a planta foi fitoestabilizadora para estes metais. O FT foi superior a 1 para Ba, Cd, Cu, Ni, Se e Zn no tratamento controle, mostrando que para estes metais a planta foi fitoextratora. Portanto, pode-se afirmar que C. roseus é uma alternativa econômica e ecológica para a remediação de metais. Além disso, foi verificado o desenvolvimento morfológico superior da planta cultivada no tratamento com lodo. Apesar de C. roseus ter extraído menos de 11% do cromo nos substratos, é importante o estudo das espécies químicas desse metal no lodo. Isso se justifica pelo cromo ser comum em amostras de lodo e, por ser considerado carcinogênico e mutagênico para saúde humana quando se encontra no estado de oxidação (VI). Entretanto vale destacar que, são poucas as metodologias utilizadas para determinar essa espécie de cromo no lodo de esgoto. Por isso, a segunda parte do trabalho teve como objetivo otimizar e validar uma metodologia para extração e análise simultânea de Cr(III) e Cr(VI) por HPLC-ICP-MS/MS em amostras de lodo. A metodologia otimizada foi baseada na extração sólido-líquido assistida por microondas e na extração sólido-líquido convencional. Foram avaliados a composição da fase extratora, modo de homogeneização, tempo e temperatura, sendo os extratos analisados por absorção atômica. A especiação foi realizada em HPLC-ICP-MS/MS com o extrato obtido pelo método desenvolvido. A porcentagem de extração de cromo disponível foi comparada com o método EPA 1311. Os resultados mostram que a extração deve ocorrer usando fase extratora constituída por EDTA a 50 mmol L-1 em pH 9,5, sob agitação a 50 °C por 16 h. Essas condições permitiram atingir 82% de recuperação do cromo e desvio padrão relativo inferior a 10%. Na especiação por HPLC-ICP-MS/MS foi detectado apenas o Cr(III) e, foi verificado que a composição química do lodo promove a redução de Cr(VI) a Cr(III). O método de extração de cromo otimizado foi mais eficiente que o método de referência para determinação do cromo disponível em lodo de esgoto.

In this work, the direct determination methodology of glyphosate and aminomethylphosphonic acid (AMPA) by high performance liquid chromatography (HPLC) using inductively coupled plasma with triple quadrupole mass spectrometer (ICP-MS/MS) was compared with the conventional method using diode array detector (HPLC-DAD). Both methods were selective, but the chromatographic analysis using ICP-MS/MS as detector was four times faster than DAD. The methodology using ICP-MS/MS as detector was linear from 27 to 218 μg L-1, while by the conventional method it was 1 to 8 mg L-1. Detection limits of the glyphosate achieved with the HPLC-ICP-MS/MS and HPLC-DAD methods were 8.2 and 300 μg L-1, respectively. The direct determination using ICP-MS/MS as detector showed a lower number of stages in sample preparation because it did not need the derivatization step. Seven real samples were analyzed by HPLC-ICP-MS/MS and the results showed that these analytes were not detected. Neste trabalho, a metodologia de determinação direta de glifosato e aminometilfosfônico ácido (AMPA) por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC) usando acoplamento indutivo plasma com espectrômetro de massa triplo quadrupolo (ICP-MS/MS) foi comparado com o método convencional usando detector de arranjo de diodos (HPLC-DAD). Ambos os métodos foram seletivos, mas a análise cromatográfica usando ICP-MS/MS como detector foi quatro vezes mais rápida que DAD. A metodologia usando ICP-MS/MS como detector foi linear de 27 a 218 μg L-1, enquanto por pelo método convencional foi de 1 a 8 mg L-1. Limites de detecção do glifosato alcançados com os métodos HPLC-ICP-MS/MS e HPLC-DAD foram 8,2 e 300 μg L-1, respectivamente. O a determinação direta usando ICP-MS/MS como detector mostrou um número menor de estágios na amostra preparação, pois não precisou da etapa de derivatização. Sete amostras reais foram analisadas por HPLC-ICP-MS/MS e os resultados mostraram que esses analitos não foram detectados.

Tese de mestrado, Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020 Submitted by Teresa Boa (tdboa@fc.ul.pt) on 2021-05-18T14:05:55Z No. of bitstreams: 1 ulfc126301_tm_Beatriz_Portinha.pdf: 2183439 bytes, checksum: bd6e0deb30ea0b8af17d94b4352f130b (MD5) Made available in DSpace on 2021-05-18T14:06:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ulfc126301_tm_Beatriz_Portinha.pdf: 2183439 bytes, checksum: bd6e0deb30ea0b8af17d94b4352f130b (MD5) Previous issue date: 2020

Although geographic isolation has been shown to play a key role in promoting reproductive isolation, it is now believed that speciation can also happen in sympatry and with considerable gene flow. Here we present a model of sympatric speciation based on assortative mating that does not require a genetic threshold for reproduction, i.e., that does not directly associate genetic differences between individuals with reproductive incompatibilities. In the model individuals mate with the most similar partner in their pool of potential mates, irrespective of how dissimilar it might be. We show that assortativity alone can lead to the formation of clusters of genetically similar individuals. The absence of a minimal genetic similarity for mating implies the constant generation of hybrids and brings up the old problem of species definition. Here, we define species based on clustering of genetically similar individuals but allowing genetic flow among different species. We show that the results obtained with the present model are in good agreement with empirical data, in which different species can still reproduce and generate hybrids CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQ FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESP COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPES Fechado

The shape of a phylogenetic tree is defined by the sequence of speciation events, represented by its branching points, and extinctions, represented by branch interruptions. In a neutral scenario of parapatry and isolation by distance, species tend to branch off the original population one after the other, leading to highly unbalanced trees. In this case the degree of imbalance, measured by the normalized Sackin index, grows linearly with species richness. Here we claim that moderate values of imbalance for trees with large number of species can occur if the geographic distribution involves more than one deme (allopatry) and speciation is parapatric within demes. The combined values of balance (normalized Sackin index) and species richness provide an estimate of how many demes were involved in the process if it happened in such neutral scenario. We also show that the spatial division in demes moderately slows down the diversification process, portraying a neutral mechanism for structuring the branch length distribution of phylogenetic trees CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQ FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESP Fechado

Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini Tese (doutorado) – Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A Floresta de Araucária, subregião localizada no platô Sul da Mata Atlântica, sofreu ciclos de expansão e retração no passado. As expansões ocorreram nos períodos do último máximo glacial (LMG ~21.000 kya) e durante o holoceno (~6.000 kya) e as retrações ocorreram nos períodos mais quentes (interglaciais ~4.000 kya ou atualmente). Os anuros do grupo Proceratophrys bigibbosa possuem distribuição ao longo desse platô Sul, exceto uma das espécies, que ocorre em área de floresta semidecídua submontana da Mata Atlântica, adjacente à região Oeste da Floresta de Araucária. A coincidência da área de distribuição dessas espécies com Floresta de Araucária (AFO) sugere que a diversificação das espécies deste grupo P. bigibbosa possa ter sido influenciada pelos ciclos de expansão e retração da floresta. Para entender a diversificação do grupo em sua atual distribuição, obtivemos tecidos de 82 indivíduos de 42 localidades que cobrem a área de distribuição conhecida para o grupo P. bigibbosa. Testamos o monofiletismo das espécies realizando análises de Máxima Parcimônia e Inferência Bayesiana, usando sequências de DNA de fragmentos de três genes mitocondriais e três nucleares. Usando um fóssil descrito para a família Odontophrynidae, geramos uma árvore de espécies por coalescência calibrada através do pacote *BEAST2 implementado no BEAST2. Usando environmental principal component analysis (PCAs ambientais), exploramos o grau de similaridade ou divergência entre os nichos climáticos realizados pelas espécies atuais. Em todas as análises, P. palustris foi inferida como espécie irmã de P. brauni, compondo um clado irmão daquele composto por P. bigibbosa e uma espécie ainda não descrita (Proceratophrys sp.), que apresenta grandes distâncias genéticas em relação às outras espécies do grupo (entre 3,3% a 4,4% em relação ao gene ribossomal mitocondrial 16S). A espécie P. avelinoi na árvore de espécies inferida pelo StarBeast foi recuperada como irmã do clado formado por todas as demais espécies do grupo, arranjo que diferiu daquele encontrado nas outras análises, em que P. avelinoi foi inferida como espécie irmã de P. brauni + P. palustris. Segundo as estimativas de datação, os eventos de especiação no grupo P. bigibbosa foram mais antigos (11,71 a 2,4 Mya HPD = 95%) do que os ciclos de expansão e retração da Floresta de Araucária ocorridos no Quaternário. Entretanto, um evento possivelmente envolvido na diversificação das espécies desse grupo é a transgressão marítima ocorrida em torno de 15 a 8 Mya, que resultou na elevação dos rios da bacia do Uruguai. Esse aumento do rio teria separado três linhagens ancestrais do grupo: Linhagem Norte, acima do rio Uruguai (N); Linhagem Sul, abaixo do rio (S) e Linhagem Oeste, acima do Uruguai em uma área coberta por uma Floresta submontana (W). Já a origem de cada uma das espécies viventes pode ter sido influenciada por outras flutuações climáticas mais recentes anteriores ao Último Máximo Glacial (LMG), uma vez que seus nichos climáticos atuais parecem ser diferenciados entre as espécies irmãs como observamos em nossa análise de ePCA. Abstract: The Araucaria Forest, a subregion of Southern Atlantic Forest plateau, experienced cycles of expansion and retraction in the past. The expansions occurred during the last glacial maximum (LMG ~ 21,000 kya) and during the Holocene (~ 6,000 kya) periods and the retractions occurred in the warmer periods (interglacial ~ 4,000 kya or currently). The anurans of the Proceratophrys bigibbosa group are distributed along this southern plateau, except for one species, which occurs in an area of submontane semideciduous forest of the Atlantic Forest, adjacent to the western region of the Araucaria Forest. The coincidence of the distribution area of these species with Araucaria Forest (AFO) suggests that the species diversification of the P. bigibbosa group was influenced by the forest expansion and retraction cycles. To understand the diversification of the group in its current distribution, we obtained tissues of 82 individuals from 42 locations that cover the known distribution area for the P. bigibbosa group. We have tested species monophyly by performing Maximum Parsimony and Bayesian Inference analyses using DNA sequences from three mitochondrial and three nuclear gene fragments. Using a fossil described for the Odontophrynidae family, we generated a calibrated coalescence species tree through the * BEAST2 package implemented in BEAST2. Using envinronmental principal component analysis (environmental PCAs), we explored the degree of similarity or divergence between climate niches realized by current species. In all analyses, P. palustris was inferred as sister species of P. brauni, composing a sister clade of that composed of P. bigibbosa and an undescribed species (Proceratophrys sp.), which presents large genetic distances from other species (between 3.3% and 4.4% relative to the 16S mitochondrial ribosomal gene). The P. avelinoi species in the species tree inferred by StarBeast was recovered as sister of the clade formed by all the other species of the group, an arrangement that differed from that found in the other analyses, in which P. avelinoi was inferred as sister species of P. brauni + P. palustris. According to dating estimates, the speciation events in the P. bigibbosa group were older (11.71 to 2.4Mya HPD = 95%) than the Quaternary Araucaria Forest expansion and retraction cycles. However, an event possibly involved in the diversification of species in this group is the sea transgression that occurred around 15 to 8 Mya, which resulted in the uplift of the rivers of the Uruguay basin. This increase in the river would have separated three ancestral lineages in the group: North lineage, above the Uruguay River (N); South lineage, below the river (S) and West lineage, above Uruguay in an area covered by a submontane forest (W). Moreover, the origin of each living species may have been influenced by recent climate fluctuations before the Last Glagial Maximun (LGM), as their current climate niches could be differentiated in our ePCA analysis. Doutorado Biodiversidade Animal Doutora em Biologia Animal CAPES 88882.435383/2019-1; 8881.190403/2018-01

Um método em fluxo foi desenvolvido para determinação de arsênio utilizando a técnica de Espectrometria de Absorção Atômica e Geração de Hidretos. Foi utilizado o sistema de zonas coalescentes. A amostra e o agente redutor (NaBFL) foram introduzidos em linhas de carregadores de ácido clorídrico e água desionizada, respectivamente. A arsina gerada foi separada da fase líquida no separador gás-líquido, usando N2 com gás de arraste, sendo transportado ao atomizador eletrotérmico. As condições experimentais otimizadas do sistema de fluxo e geração da arsina foram: bobina de reação de 50 cm, volume injetado de amostra e reagente de 250 pL concentração de NaBFL de 1,0% (m/v), concentração de HC1 de 1,0 mol L’1 , temperatura de atomização de 900°C, vazão de fluxo dos carregadores de 3.6 mL min’1 e vazão do gás de arraste 130 mL min'1 . Alguns elementos interferem na fase liquida e na fase gasosa na técnica de geração de hidretos. Os estudos mostram que Mn(ll), Pb(ll), Fe(lII), Cu(Il), Ni (II), Zn (II), Al (III) and Cd (II) causam uma redução no sinal analítico maior 10% (m/v). O efeito dos interferentes foi minimizado com o uso de uma mini-coluna contendo resina de troca catiônica (50 mg de Amberlite IRA-200), em linha O estudo dos ions da fase gasosa mostraram que Se(IV), Sn(II), Sb(III), Bi(III) e Te(IV) causam interferência no sinal analítico. Este efeito foi contornado com o uso de tiouréia como agente mascarante. Sob condições experimentais otimizadas; o limite de detecção, de acordo com a definição da IUPAC, foi de 0,35 ng mL’1 para As(III) e 0.52 ng mL’1 para As(V). O desvio padrão relativo foi de 2,3% para 0,1 mg L’1 As(lll) e 1,7% para 0,1 mg L’1 As(V) e a freqüência analítica de 120 amostras por hora. O método desenvolvido foi aplicado para a determinação de arsênio em amostras de águas (naturais e certificadas). A method was developed for determination of arsenic by Atomic Absorption Spectrometry - Hydride Generation in Flow Injection Analysis (FIA). The flow injection system was operated in the merging zones configuration, where sample and reagent are simultaneously injected into two carrier streams, HC1 and H2O, respectively. For separation of arsine a continuous gas-liquid separator was designed. The liquid phase flows to a free-running drain while the gaseous phase is purged by nitrogen into the atomization cell. The optimum conditions for the generation of arsine were established as: reaction coil of 50 cm, sample and reagent injected volume of 250 p.L, 1.0% (m/v) solution of sodium tetrahydroborate and 1.0 mol L’1 hydrochloric acid, cell temperature of 900°C, flow rates of 3.6 mL min’1 for hydrochloric acid and tetrahydroborate Solutions and a flow rate of 130 mL min-1 for the carrier gas (N2). Many elements cause interferences in this technique in gaseous and condensed phases. It was found that Mn(II), Pb(Il), Fe(IIl), Cu(II), Ni (II), Zn (II), Al (III) and Cd (II) caused signal reductions for arsenic of at least 10%. The interferences were reduced by using an on-line mini-column with 50 mg of the cation exchange resin Amberlite IRA-120. The interferences in the gaseous phase were caused by Se(IV), Sn(II), Sb(III), Bi(III) and Te (IV). To overcome these efíects, thioureia was used as masking agent. Under the optimum experimental conditions, the detection limit. defined as three times the standard deviation of the blank measurement, was found to be 0,35 ng mL’1 for As(lII) and 0,52 ng mL’1 for As(V). The relative standard deviation of 2,3% for 0,1 mg L’1 As(IIl) and 1,7% for 0,1 mg L’1 As(V) and a sampling rate of about 120 determinations per hour. The method was shown to be satisfactory for determination of traces arsenic in water samples (natural and certificate). Dissertação (Mestrado)

Submitted by Mateus Ribeiro Mota (mateusmota@hotmail.com) on 2019-10-19T13:39:18Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_MotaRM-2019_Arquivamento.pdf: 1270117 bytes, checksum: b111536703e031d703d95dd83d0f8920 (MD5) Rejected by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezado Matheus, O documento enviado para a coleção Campus Unesp Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Capa: Falta a cidade/estado de defesa ao final da página (antes do mês e ano) - Página de rosto: Falta cidade / estado de defesa e necessário excluir a palavra "mestrando" antes do seu nome - Agradecimentos: FAPESP - O apoio da Fundação deve ser mencionado de forma destacada, por meio da apresentação no campo “Agradecimentos” (Acknowledgement/Funding) do nome e do número do processo FAPESP que financiou a pesquisa, conforme o seguinte modelo: processo nº aaaa/nnnnn-d, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). - Para CAPES: A Portaria nº 206, de 04/09/2018 Dispõe sobre obrigatoriedade de citação da CAPES nos agradecimentos da seguinte forma: Art. 3º Deverão ser usadas as seguintes expressões, no idioma do trabalho: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001" - Para CNPq: Colocar o nome da Agência Financiadora por extenso, além da sigla e do número do processo. Maiores informações: http://ib.rc.unesp.br/Home/Biblioteca37/repositorio_fluxograma_unesp_rioclaro.jpg Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2019-10-24T18:04:02Z (GMT) Submitted by Mateus Ribeiro Mota (mateusmota@hotmail.com) on 2019-10-25T18:03:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_MotaRM-2019_Arquivamento.pdf: 1304216 bytes, checksum: 88ec8e094d4d376ffb03e6265ab6a19a (MD5) Approved for entry into archive by Adriana Ap. Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br) on 2019-10-25T19:43:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mota_mr_me_rcla.pdf: 1304216 bytes, checksum: 88ec8e094d4d376ffb03e6265ab6a19a (MD5) Made available in DSpace on 2019-10-25T19:43:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mota_mr_me_rcla.pdf: 1304216 bytes, checksum: 88ec8e094d4d376ffb03e6265ab6a19a (MD5) Previous issue date: 2019-08-21 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) A filogeografia surgiu como uma ponte entre várias disciplinas evolutivas, como a genética populacional, filogenia e biogeografia, estabelecendo ligações entre os estudos micro e macro evolutivos. A filogeografia tem sido cada vez mais utilizada para estudar a evolução de regiões com altos índices de diversidade, como a região Neotrópical. Os Neotrópicos apresentam uma grande variedade de biomas, incluindo a Floresta Atlântica, a segunda maior floresta tropical da América do Sul, contendo mais de 60% de todas as espécies terrestres do planeta. Um número crescente de estudos filogeográficos com espécies da Floresta Atlântica nos ajudado a entender os processos evolutivos que gradualmente formaram essa grande biodiversidade. Realizamos análises filogeográficas, avaliando padrões de estrutura e diversidade genética, tempo de divergência das linhagens e a demografia histórica do complexo de espécies Pitcairnia flammea (Bromeliaceae), grupo adaptado a inselbergs neotropicais naturalmente fragmentados, baseados em conjuntos de dados de microssatélites nucleares e sequências plastidiais. Nossos resultados mostraram baixa a moderada diversidade genética nuclear dentro de populações de P. flammea, e alta estrutura genética populacional, com poucos haplótipos de DNA plastidial compartilhados entre populações, indicando fluxo gênico limitado e baixa conectividade entre afloramentos rochosos. Não encontramos nenhuma estrutura filogeográfica clara, além de duas linhagens evolutivas que divergiram aproximadamente 2 Mya., sugerindo um papel importante das mudanças climáticas no início do Pleistoceno na diversificação do complexo de espécies de P. flammea. Além disso, não encontramos congruência direta entre divergência genética populacional e delimitação taxonômica. Este estudo vem apoiar o fato de que afloramentos rochosos são centros de diversidade de espécies e endemismo, por serem naturalmente isolados, contribuindo para a grande diversidade genética e morfológica observada atualmente nestas regiões. Em conjunto com estudos de genética de populações e filogeografia de outros organismos, as informações aqui geradas ajudam a esclarecer os processos complexos responsáveis pela origem e manutenção da biodiversidade dos Neotrópicos, especificamente da Floresta Atlântica. Phylogeography has emerged as a bridge between several evolutionary disciplines, such as population genetics, phylogeny and biogeography, establishing the link between micro and macroevolutionary studies. Phylogeography has been increasingly used to study the evolution of regions with high diversity indexes, such as the Neotropic region. The Neotropics presents a wide variety of biomes, including the Atlantic Rainforest, the second largest tropical rainforest in South America containing more than 60% of all terrestrial species on the planet. An increasing number of phylogeographic studies in Atlantic Rainforest species have helped us to understand the evolutionary process that gradually formed such great biodiversity. We performed phylogeographic analyses, assessing genetic structure patterns, timing of lineage divergence and historical demography of Pitcairnia flammea species complex (Bromeliaceae), which are adapted to naturally fragmented Neotropical inselbergs, based on nuclear microsatellites and plastid sequence data sets. Our results showed low to moderate nuclear genetic diversity within P. flammea populations, and high population genetic structure, with few plastid DNA haplotype shared among populations, indicating limited gene flow and low connectivity among rock outcrops. We found no clear phylogeographic structure, besides two evolutionary lineage which diverged approximately 2 Mya., suggesting an important role of early Pleistocene climatic changes in the diversification of P. flammea species complex. Additionally, we find no direct congruence between population genetic divergence and taxonomic delimitation. This study supports the fact that rocky outcrops are centers of species diversity and endemism, as they are naturally isolated, contributing to the great genetic and morphological diversity currently observed in these regions. In conjunction with studies of population genetics and phylogeography of other organisms, the information generated here helps to clarify the complex processes responsible for the origin and maintenance of Neotropic biodiversity, specifically the Atlantic Forest. FAPESP: 18/07596-0. CNPq: 475937/2013-9. CAPES: 001.

Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Arsenic is a toxic element with carcinogenic and mutagenic characteristics. However, its toxicity is associated with their species, because some present different toxicities. In this sense, speciation analysis is mandatory for understanding the availability of As and its effects in different organisms. The most common As species are inorganic [such as As(III) and As(V)] and organic [methylated derivatives, e.g. dimethylarsenic (DMA) and monomethylarsenic (MMA)]. Since speciation analysis requires that the species be preserved throughout the procedures involved in the analytical sequence, from the sample preparation up to the detection, several aspects should be carefully investigated to assure the species preservation. Sample preparation is one of the most critical steps during analysis, mainly taking into account the factors that may influence the species stability. In general, extraction methods are used for speciation analysis, since they show milder conditions regarding to the temperature and reagents concentration. These extraction procedures can be performed by conventional extraction (conductive heating and mechanical stirring), microwaveassisted extraction (MAE), ultrasonic-assisted extraction (UAE), among others. Although conventional extraction and MAE present widespread use, the application of ultrasound have not been well studied for As speciation analysis, which generates a gap in the literature about the effects of this type of energy on As species. In this work, a critical study was carried out evaluating the main factors that could influence the species stability and extraction efficiency. Considering the variety of As species in different types of matrices, samples of algae, rice and fish were chosen for this study, covering a high as possible number of As species. Some parameters such as type and concentration of extraction solution, time and temperature of extraction were evaluated for the extraction efficiency, while the concentration of the extraction solution and the addition of ions was used to evaluate the stability of As species. It was observed that the energy source used in the extraction method did not influence the stability of the species, as well the extraction efficiency. On the other hand, it was observed that the temperature and extraction time influenced the extraction efficiency, whereas the concentration of HNO3 as extraction solution, influenced the extraction efficiency, resulting in the conversion of the unknown As species (named UK1) present in the algae. After ions addition before extraction, it was observed that the addition of Fe3+ in algae provides the conversion of UK1 species into As(III) and As(V) and in rice provides the conversion of As(III) and DMA into As(V). In addition, the quantification of As species in the samples was performed using the optimized extraction conditions for each matrix without species conversion. The limit of quantification of the method was 0.06 μg g-1.. O arsênio é um elemento tóxico, com características carcinogênicas e mutagênicas. Contudo, a toxicidade desse elemento está associada às suas espécies, sendo que algumas delas possuem maior toxicidade que outras. Nesse sentido, a análise de especiação possui relevância para melhor compreensão acerca da disponibilidade de As e seus efeitos em diferentes organismos. As espécies mais comuns de As são as inorgânicas [principalmente As(III) e As(V)] e as orgânicas [derivados metilados, por exemplo dimetilarsênio (DMA) e monometil arsênio (MMA)]. Uma vez que a análise de especiação requer que as espécies sejam preservadas ao longo dos procedimentos envolvidos na sequência analítica, do preparo da amostra à etapa de quantificação, torna-se necessário o cuidado e investigação de fatores que possam influenciar nessa preservação. O preparo de amostra é uma das partes mais críticas nesse procedimento e, por esse motivo, recebe um destaque quando considerados os fatores que podem influenciar na estabilidade das espécies. Em geral, são utilizados métodos de extração para análise de especiação, pois possuem condições mais brandas quanto à temperatura e concentração de reagentes. Esses procedimentos de extração podem ser feitos por extração convencional (com aquecimento condutivo e agitação mecânica), por extração por assistida por micro-ondas (MAE), extração assistida por ultrassom (UAE), entre outros. Apesar dos dois primeiros serem bem difundidos e utilizados, a aplicação de ultrassom não é tão estudada para a análise de especiação de As, o que gera uma lacuna nos efeitos desse tipo de energia nas espécies de As. Nesse trabalho foi feito um estudo crítico sobre quais fatores que poderiam influenciar na estabilidade das espécies e na eficiência de extração e, quando possível, relacionando ambos fatores. Tendo em vista as diferentes espécies de As encontradas em diferentes tipos de matrizes, foram escolhidas para o desenvolvimento do estudo amostras de alga, arroz e peixe, visando abranger uma quantidade maior de espécies. Alguns parâmetros como tipo e concentração de solução extratora, tempo e temperatura de extração foram avaliados quanto à eficiência de extração, enquanto que a concentração da solução extratora e a adição de íons foi utilizada para a avaliação da estabilidade das espécies. Foi observado que a forma de aplicação de energia utilizada no método de extração não influenciou na estabilidade das espécies nem na eficiência de extração. Por outro lado, foi observado que a temperatura e o tempo de extração influenciaram na eficiência de extração, enquanto que a concentração de HNO3 como solução extratora, além de influenciar na eficiência de extração, acarretou na conversão da espécie desconhecida de As (UK1) presente na alga. Quanto a adição de íons, foi observada que a adição de Fe3+ provocou conversão da espécie UK1 da alga em As(III) e As(V) e a conversão de As(III) e DMA presente no arroz em As(V). Adicionalmente, foram feitas as quantificações das espécies de As presentes nas amostras utilizando a condição mais adequada para a extração das espécies em cada tipo de matriz sem que ocorresse conversão entre as espécies, limite de quantificação do método foi de 0,06 µg g-1 .

Submitted by Luis Fernando Segala (segala@unirp.edu.br) on 2019-04-20T13:10:20Z No. of bitstreams: 1 111 tese LFS.pdf: 1753936 bytes, checksum: db17c44824b7a9390af97cf59a396171 (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-04-22T16:11:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 segala_lf_dr_sjrp_par.pdf: 448050 bytes, checksum: e84b6f66fbd84515975db8418b8ae30f (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-22T16:11:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 segala_lf_dr_sjrp_par.pdf: 448050 bytes, checksum: e84b6f66fbd84515975db8418b8ae30f (MD5) Previous issue date: 2019-03-18 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A morfometria da asa e do edeago tem sido amplamente utilizada para estudar a evolução das espécies do gênero Drosophila pois são caracteres altamente sensíveis a variação genética e ambiental. No presente trabalho utilizamos esta técnica em um estudo populacional de Drosophila sturtevanti com ênfase em moscas procedentes de áreas de Mata Atlântica do Brasil e da Floresta Tropical Úmida da Costa Rica. Para isto utilizamos as asas e edeagos de machos destas populações e analisamos o nível de diferenciação quanto a estes marcadores discutindo sua associação com sua localização geográfica, a fitofisionomia do fragmento de mata, a umidade relativa média anual, a temperatura média anual e a área do fragmento de mata. Os resultados indicaram a existência de uma estruturação latitudinal tanto para o tamanho e a forma da asa como para a forma do edeago, além de correlação entre estas características e algumas variáveis ambientais. A diferenciação quanto à forma do edeago, entretanto, foi menos significativa que a diferenciação da forma e do tamanho da asa. A relação entre forma e tamanho das asas obtida foi divergente dos resultados encontrados para outras espécies de Drosophila, apresentando asas maiores e mais arredondadas nas populações da faixa latitudinal Sul 1 (PIR, AGU e RDI) e asas menores mais alongadas em uma população da faixa latitudinal Nordeste (CUR). As populações da Costa Rica (TIR e LSA) e as populações do Sul mostraram divergência significativa para os marcadores avaliados, entretanto, as populações da faixa latitudinal Sudeste (MAT, NGR, SDC, PIC e VIT) não apresentaram estruturas congruentes e foram melhor agrupadas por fitofisionomias. Os resultados apresentados refletem a diferenciação genética em curso nas populações de D. sturtevanti, sendo acentuada para as procedentes da América Central e as do Sul do Brasil, indicando a ocorrência de diferenciação populacional quanto aos marcadores estudados e que podem ser um reflexo da existência de novas espécies deste subgrupo, que já tinha sido sinalizado em estudos anteriores e também em estudos recentes do nosso laboratório com marcadores moleculares para estas mesmas populações. Wing and aedeagus morphometry have been widely used to study the evolution of species of the genus Drosophila because they are highly sensitive characters to genetic and environmental variation. In this present research we use this technique in a populational study of Drosophila sturtevanti with emphasis on flies coming from Atlantic Forest areas of Brazil and the Tropical Rainforest of Costa Rica. For that we use the wings and aedeagus of males of these populations and we analyzed the level of differentiation regarding these markers discussing their association with its geographic location, the phytophysiognomy of the forest fragment, the average annual relative humidity, the annual average temperature and the area of the forest fragment. The results indicated the existence of a latitudinal structure for both the size and shape of the wing and the shape of the adeagus, besides the correlation between these characteristics and some environmental variables. The differentiation in the form of aedeagus, however, was less significant than the differentiation of the shape and size of the wing. The relation obtained between the shape and size of the wings was divergent from the results found for other Drosophila species, presenting bigger and more rounded wings in the populations of South 1 latitude (PIR, AGU and RDI) and smaller and elongated wings in a population from the Northeast latitude range (CUR). The populations of Costa Rica (TIR and LSA) and the South population showed significant divergence for the markets evaluated, however, the populations of the Southeast latitudinal range (MAT, NGR, SDC, PIC and VIT) did not present congruent structures and were better grouped by phytophysiognomies. The present results reflect the genetic differentiation in course in D. Sturtevanti populations, being accentuated for those coming from Central America and those from Southern Brazil, indicating the occurrence of an differentiation in relation to markers studied and that may reflect the existence of new species of this subgroup, which had already been signaled in previous studies and in recent studies of our laboratory with molecular markers for these same populations.

A macroecologia, assim como outros campos da ecologia, tem sido historicamente uma disciplina terrestre. No entanto, a biodiversidade marinha pode conter características fundamentais para a nossa compreensão dos padrões globais de diversidade. Aqui, eu explorei essa possibilidade integrando conhecimento sobre o ambiente marinho com hipóteses e modelos verbais utlilizados para explicar variações geográficas na diversidade de espécies. Inicialmente, eu utilizei dados de produtividade marinha para avaliar o efeito de subsídios espaciais na diversidade de plantas insulares (capítulo 1). Esse estudo mostrou que, ao contrário da hipótese proposta, não existem evidências de que recursos alóctones influenciam a diversidade de ilhas pequenas. Posteriormente, eu realizei uma revisão conceitual dos principais mecanismos propostos para explicar o gradiente latitudinal de especiação sob uma perspectiva marinha (capítulo 2). Nessa revisão eu mostro que, ao contrário do sistema terrestre, cada mecanismo gera uma predição totalmente diferente para os oceanos. No entanto, é preciso também reconhecer e destacar as limitações que são inerentes aos dados de biodiversidade marinha, principalmente o viés amostral. Por isso, eu avaliei aqui nosso grau de conhecimento sobre a distribuição latitudinal de diferentes grupos taxonômicos (capítulo 3). Nesse estudo eu revelo a existência de um gradiente de ausência de espécies que é fortemente associado com baixo esforço amostral nos trópicos. Por fim, eu testei através de um modelo de simulação a eficiêcia do esforço amostral empírico em detectar acuradamente padrões de diversidade gerados em um oceano virtual (capítulo 4). O resultado mostrou que o gradiente de diversidade atualmente observado nos oceanos não difere do que é registrado ao aplicar a mesma amostragem em um simples modelo nulo. Com isso, eu concluo que a biodiversidade marinha apresenta, de fato, um potencial enorme para a compreensão de fenômenos macroecológicos. No entanto, existem ainda algumas lacunas geográficas e taxonômicas que precisam ser preenchidas para que esse conhecimento possa ser explorado em todo seu potencial. Macroecology, like other fields of ecology, has been historically a terrestrial discipline. However, marine biodiversity may contain key features for our understanding of global diversity patterns. Here, I explored this possibility by integrating knowledge about the marine environment with hypotheses and verbal models used to explain geographic variations in species diversity. Initially, I used marine productivity data to evaluate the effect of spatial subsidies on island plant diversity (Chapter 1). This study showed that, contrary to the proposed hypothesis, there is no evidence that allochthonous resources influence the diversity of small islands. Subsequently, I realized a conceptual review of the main mechanisms proposed to explain the latitudinal gradient of speciation under a marine perspective (chapter 2). In this review I show that, unlike the terrestrial system, each mechanism generates predictions totally different in the oceans. Nevertheless, it is also necessary to recognize and highlight the limitations that are inherent to marine biodiversity data, especially sample bias. Therefore, I evaluated here the state of our knowledge about the latitudinal distribution of different taxonomic groups (Chapter 3). In this study I reveal the existence of a species absence gradient that is strongly associated with low sampling effort in the tropics. Finally, I tested through a simulation model the efficiency of the empirical sample effort to accurately detect diversity patterns generated in a virtual ocean (Chapter 4). The result showed that the diversity gradient currently observed in the oceans does not differ from what is recorded after applying the same sampling effort in a simple null model. Therefore, I conclude that marine biodiversity may, indeed, be of great importance to understand macroecological patterns. However, there are still some geographic and taxonomic gaps that need to be addressed in order to explore this knowledge to its full potential.

Submitted by Marcelo Roman Jurado Castro (chelin-71087@hotmail.com) on 2019-04-02T17:08:00Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Marcelo_Roman_Jurado_Castro.pdf: 2497409 bytes, checksum: 868b970d3ca17b0673a9aeb2abd7b759 (MD5) Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) Como você recebeu financiamento da OEA, solicitamos constar o número do processo na folha de rosto e de aprovação e também nos agradecimentos. Problema 02) Solicitamos que troque o título BIBLIOGRAFIA e coloque o correto REFERÊNCIAS OBS:-Estamos encaminhando via e-mail o template/modelo das páginas pré-textuais para que você possa fazer as correções, sugerimos que siga este modelo pois ele contempla as normas da ABNT. Lembramos que o arquivo depositado no repositório deve ser igual ao impresso, o rigor com o padrão da Universidade se deve ao fato de que o seu trabalho passará a ser visível mundialmente. Agradecemos a compreensão. on 2019-04-02T18:43:54Z (GMT) Submitted by Marcelo Roman Jurado Castro (chelin-71087@hotmail.com) on 2019-04-03T01:37:37Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-Marcelo_Roman_Jurado_Castro.pdf: 2505426 bytes, checksum: 03d614ce2cedd9308281dcea74ceb8a4 (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-04-03T14:06:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 castro_mrj_me_sjrp_par.pdf: 907950 bytes, checksum: d0ea02e45b903e9a5da4d13d2ba09fd1 (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-03T14:06:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 castro_mrj_me_sjrp_par.pdf: 907950 bytes, checksum: d0ea02e45b903e9a5da4d13d2ba09fd1 (MD5) Previous issue date: 2019-02-22 Outra Os elementos de transposição (TEs) são sequências repetitivas amplamente distribuídas nos genomas que representam importantes fontes geradoras de variabilidade genética. As características genômicas derivadas de sua capacidade de transposição e de aumento do número de cópias são específicas para cada linhagem. Um fenômeno derivado dessa habilidade é o incremento repentino do número de cópias, denominado explosões de transposição, descrito em várias espécies para diversas famílias de TEs, dentre elas, a família Mariner (Transposon de DNA, Classe II) em Rhodnius prolixus. Foi sugerido que explosões de transposição da família Mariner contribuíram para o processo de especiação de R. prolixus. Esta peculiaridade motivou o estudo da composição do mobiloma em R. robustus, espécie irmã de R. prolixus, juntamente a reanotação dos TEs de R. prolixus, para comparação do mobiloma das duas espécies. Para isso, foram realizados sequenciamentos NGS (Next Generation Sequencing) dos genomas de dois tipos genéticos de R. robustus (II e III), montagem e anotação dos TEs utilizando a ferramenta dnaPipeTE. Da mesma forma, foram anotados os TEs de R. prolixus a partir das reads brutas do seu genoma montado. Os resultados mostraram alta semelhança na frequência de TEs nos três genomas (R. prolixus: 19%, R. robustus II: 23,5%, R. robustus III: 21,5%), constituídos principalmente de TEs de Classe II (~13,5%) da superfamília Tc1-Mariner (~5,6%) e de da Ordem LINE, da Classe I (~5,1%). A comparação dos três mobilomas revelou três características importantes para se entender a dinâmica evolutiva destes TEs: (i) compartilhamento de famílias que ocorrem tanto em alta como em baixa proporção entre genomas; (ii) compartilhamento de famílias que ocorrem em proporções dissimilares entre genomas, alta em um e baixa no outro, e (iii) não compartilhamento de determinadas famílias entre genomas. Identificou-se ainda sinais de explosões de transposição recentes da família Mariner em R. robustus II e III, indicando que esse fenômeno não foi exclusivo de R. prolixus, estando, portanto, não associado diretamente à especiação das duas espécies irmãs. Transposable elements (TEs) are widely distributed repetitive sequences in the genomes that represent important sources of genetic variability. The genomic characteristics derived from their capacity of transposition and increasing in copy number are specific to each lineage. A phenomenon derived from this ability is the sudden increase of one or several families of TEs, called bursts of transposition, described in several species for several families of TEs, among them the Mariner family (DNA Transposons, Class II) in Rhodnius prolixus. It has been suggested that transposition bursts of the Mariner family contributed to the speciation process of R. prolixus. This peculiarity motivated the study of the mobilome composition of R. robustus, together with its reannotation in R. prolixus, for comparison of the mobilome of the two species. In order to do this, we performed NGS (Next Generation Sequencing) sequencing of the genomes of two genetic types of R. robustus (II and III) and the assembly and annotation of the TEs using the pipeline dnaPipeTE. Likewise, the TEs of R. prolixus were annotated from the raw reads of its assembled genome. The results showed high similarity in the frequency of TEs in the three genomes (R. prolixus: 19%, R. robustus II: 23.5%, R. robustus III: 21.5%), consisting mainly of TEs from Class II (~13.5%) of the superfamily Tc1-Mariner (~5.6%) and of the LINE Order, Class I (~5.1%). The comparison of the three mobilomes revealed three important characteristics to understand the evolutionary dynamics of these TEs: (i) sharing of families that occur both in high and low proportion between genomes; (ii) sharing of families occurring in dissimilar proportions between genomes, high in one and low in the other, and (iii) non-sharing of a family between genomes. There are also signs of recent burst of transposition of the Mariner family in R. robustus II and III, indicating that this phenomenon was not exclusive to R. prolixus, therefore not directly associated with the speciation of the two sister species. OEA/GCUB: 001/2016

Agradecimentos: This work was partly supported by the Brazilian agencies: Capes, grant #302049/2015-0 (CNPq), and grants #2016/06054-3 São Paulo Research Foundation (FAPESP) and #2016/01343-7 (ICTP-SAIFR FAPESP). FMDM is supported by grant #2015/11985-3 (FAPESP), ABM is supported by grant #2014/10470-7 (FAPESP), LDF is supported by grant #2015/26989-4 (FAPESP), MFR is supported by grant #152885/2016-1 (CNPq). We are very grateful to Prof Rosemary Gillespie, Dr Eulalia Banguera-Hinestroza, Dr Hazel Byrne, Dr Alicia Álvarez, for the support on the data set of the Tetragnatha, Delphinidae, New World titi monkeys, and Caviomorph rodents Ctenomys trees, respectively. We thank Gustavo Burin, Laura Alencar, Nathália Caldeira, and Tiago Quental for the inspirational comments on the manuscript Abstract: Phylogenetic trees are representations of evolutionary relationships among species and contain signatures of the processes responsible for the speciation events they display. Inferring processes from tree properties, however, is challenging. To address this problem, we analyzed a spatially-explicit model of speciation where genome size and mating range can be controlled. We simulated parapatric and sympatric (narrow and wide mating range, respectively) radiations and constructed their phylogenetic trees, computing structural properties such as tree balance and speed of diversification. We showed that parapatric and sympatric speciation are well separated by these structural tree properties. Balanced trees with constant rates of diversification only originate in sympatry and genome size affected both the balance and the speed of diversification of the simulated trees. Comparison with empirical data showed that most of the evolutionary radiations considered to have developed in parapatry or sympatry are in good agreement with model predictions. Even though additional forces other than spatial restriction of gene flow, genome size, and genetic incompatibilities, do play a role in the evolution of species formation, the microevolutionary processes modeled here capture signatures of the diversification pattern of evolutionary radiations, regarding the symmetry and speed of diversification of lineages COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPES FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESP CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQ Aberto

Agradecimentos: We thank Eawag for hosting the workshop and the Swiss National Science Foundation for funding through International Exploratory Workshop "Interactions on Trees" (IZ32Z0_166422) to CM, BM and OS. BM was supported by SNF grant 31003A_153464. DS received funding from the Swedish Research Council (2015-04748) and from the Swedish Foundation for Strategic Research. SLN is funded by NSF DEB 1450653; LJH is funded by NSF DEB 1208912. FD is funded by ANR grant ANR-14-ACHN-0003-01. OS was supported by SNF grant 31003A_163338 Abstract: Species interactions lie at the heart of many theories of macroevolution, from adaptive radiation to the Red Queen. Although some theories describe the imprint that interactions will have over long timescales, we are still missing a comprehensive understanding of the effects of interactions on macroevolution. Current research shows strong evidence for the impact of interactions on macroevolutionary patterns of trait evolution and diversification, yet many macroevolutionary studies have only a tenuous relationship to ecological studies of interactions over shorter timescales. We review current research in this area, highlighting approaches that explicitly model species interactions and connect them to broad-scale macroevolutionary patterns. We also suggest that progress has been made by taking an integrative interdisciplinary look at individual clades. We focus on African cichlids as a case study of how this approach can be fruitful. Overall, although the evidence for species interactions shaping macroevolution is strong, further work using integrative and model-based approaches is needed to spur progress towards understanding the complex dynamics that structure communities over time and space Fechado

Orientador: Marcus Aloizio Martinez de Aguiar Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A impressionante diversidade observada na natureza nos faz pensar quais processos podem ser responsáveis por tamanha variedade. Responder esta questão foi o objetivo de muito biólogos evolutivos, que tentaram descobrir os processos olhando para os padrões que eles poderiam gerar. O desenvolvimento de modelos teóricos, em particular modelos baseados em indivíduo, é indispensável para lidar com esta questão, pois apenas com modelos podemos isolar processos específicos em um ambiente controlado, o que não é completamente possível em experimentos naturais, e em um tempo realizável. Nesta tese eu investiguei quais são os padrões gerados por um modelo de especiação baseado em indivíduo no qual apenas processos neutros e o espaço estão regulando a dinâmica populacional. A população evoluiu sob as influências combinadas de reprodução sexuada, mutação e dispersão. No primeiro capítulo, desenvolvemos um algoritmo que registra as relações de ancestralidade-descendência entre pares de indivíduos da comunidade final, e um algoritmo que registra os tempos exatos de especiação e extinção das espécies. Com ambas as informações foi possível construir genealogias e filogenias, a partir das quais padrões macroevolutivos foram obtidos, servindo como um referencial de evolução neutra. O segundo capítulo foi dedicado a usar esta nova informação filogenética do modelo para investigar se diferentes contextos geográficos de especiação (parapátrica e simpátrica) deixam assinaturas distintas nos padrões macroevolutivos de diversificação, como a simetria de árvores e a velocidade da diversificação. Os resultados das simulações foram comparados com dados empíricos de radiações evolutivas. O terceiro capítulo, por fim, incorporou barreiras espaciais ao modelo anterior, para buscar por possíveis assinaturas deixadas pela especiação alopátrica, com barreiras variando em tamanho e permitindo que indivíduos as cruzassem dependendo de seu tamanho. O modelo foi adaptado ao sistema particular dos macacos Platyrrhini, com o espaço modelado de modo a se ajustar à forma da América do Sul, e as barreiras representando os principais rios da região. O número de gerações foi adaptado a diferentes subfamílias e gêneros dos Platyrrhini, para examinar a "Riverine Hypothesis" com um enfoque de modelagem. Os resultados dos três capítulos mostraram que o espaço possui um papel fundamental na especiação quando processos neutros são os únicos a agir sob as populações, com o contexto geográfico da especiação deixando assinaturas nos padrões macroevolutivos emergentes. A incorporação de processos não neutros e a investigação do papel da extinção em moldar os padrões são possíveis passos seguintes para esta pesquisa Abstract: The impressive diversity observed in nature makes us wonder what processes could be responsible for so great variety. The answer to this question has been the goal of many evolutionary biologists, who have tried to discover the processes looking for the patterns they would generate. The development of theoretical models, particularly individual-based models, is imperative to address this question, as only with models we can isolate specific processes in a controled environment, something not completely possible in natural experiments, and in a feasible time. In this thesis I investigated what are the patterns generated by an individual-based model of speciation in which only neutral processes and the space are regulating the dynamics of the population. The population evolved under the combined influences of sexual reproduction, mutation and dispersal. In the first chapter, we developed an algorithm that records the ancestor-descendant relationships between each pair of individuals of the final community, and an algorithm which records the exact speciation and extinction times of species. With both information was possible to construct genealogies and phylogenies, from which macroevolutionary patterns could be derived, offering a neutral referential of evolution. The second chapter was dedicated to use this new phylogenetic information of the model to investigate if different geographical contexts of speciation (parapatric and sympatric) leave different signatures in the macroevolutionary patterns of diversification, like tree symmetry and the speed of diversification. The simulations results were compared with empirical data about evolutionary radiations. The third chapter, lastly, incorporated spatial barriers to the previous model with the goal of looking for possible signatures left by allopatric speciation, with barriers varying in sizes and allowing the crossing of individuals depending on the individual size. The model adapted to the particular system of Platyrrhini monkeys, with space modeled to fit the shape of South America, and spatial barriers representing the main rivers of the region. The number of generations was adapted to conform different subfamilies and genera of Platyrrhini monkeys, with the aim of examine the Riverine Hypothesis in a modeling approach. All results from the three chapters have showed that the space plays a fundamental role in speciation when neutral processes are the only acting upon populations, with the geographic context of speciation leaving signatures in the macroevolutionary patterns emerged. The incorporation of non neutral processes and the investigation of the role of extinction in shaping the patterns are possible next steps to this research Doutorado Ecologia Doutora em Ecologia CAPES

A especiação e fracionamento dos metais traço, da fase sólida à líquida dos sedimentos, controlam sua potencial disponibilidade e, assim, seu risco ecológico para os organismos. Portanto, para obter uma avaliação de risco mais abrangente, é necessário acoplar metodologias capazes de avaliar a mobilidade de metais no sedimento. Neste estudo, a técnica de Gradientes Difusivos de Fina Membrana (DGT) e métodos clássicos de extração química para estabelecer a biodisponibilidade de metais traço em sedimentos, juntamente com sensores voltamétricos de estado sólido, foram acoplados com o objetivo de avaliar a mobilidade e potencial disponibilidade de Cr, Cu, Ni, Pb, V e Zn em água intersticial e sedimentos de áreas de estaleiros do sudeste e sul do Brasil. As maiores concentrações de metais lábeis foram determinadas quando maior quantidade de embarcações foram reparadas e em estaleiros com um maior tempo de operação. Além disso, a distribuição dos metais na água intersticial e na fase sólida dos sedimentos (metais móveis) e as relações significativas entre os metais permitiram distinguir a contribuição dos componentes das tintas anti-incrustante e produtos derivados do petróleo. O fluxo difusivo de cada metal para a interface água-sedimento indicou que o CuDGT apresentou o maior fluxo difusivo (3,66E-03 mmol.m-2.d-1) no estaleiro com o maior tempo de operação. Portanto, um enriquecimento foi observado para Cu, Pb e Zn nos sedimentos e um possível risco ecológico de Effects Range Median para Apparent Effects Threshold para a biota aquática. Isto, independentemente das condições físico-químicas e hidrodinâmicas de cada ambiente. Finalmente, o acoplamento destas metodologias permitiu uma avaliação abrangente das propriedades geoquímicas do sedimento e a potencial biodisponibilidade e risco ecológico dos metais traço em sistemas estuarinos onde há entrada contínua e específica desses elementos. Assim como o uso da técnica de DGT no sedimento, pela primeira vez, em distintos sistemas estuarinos demonstrou seu potencial para ser aplicado em futuros programas de monitoramento. Speciation and partitioning of trace metals, from solid to solution phases of sediments, control their potential availability and thus, their potential ecological risk to organisms. Therefore, in order to obtain a broad evaluation of their risk, it is necessary to couple methodologies which are able to assess metal mobility in the sediment. In this study, the Diffusive Gradients in Thin Films (DGT) technique and classic chemical extraction methods of trace metal availability in sediments, together with solid-state voltammetric sensors, were coupled with the objective of assessing mobility and potential availability of Cr, Cu, Ni, Pb, V and Zn in sediment porewaters and sediments in southeastern and southern Brazilian shipyard areas. The highest labile metal concentrations were determined where great vessel repairs were carried out and in shipyards with the longest operating time. In addition, trace metals distribution in solution phase and solid phase of sediments (mobile metals) and significant relations among metals enabled to distinguish the contribution of antifouling paint components and petroleum products. The diffusive flux of every metal to the sediment-water interface indicated that CuDGT had the highest flux (3.66E-03 mmol.m-2.d-1) in the shipyard with the longest operating time. Therefore, enrichment was observed for Cu, Pb and Zn in sediments and a possible ecological risk of Effects Range Median to Apparent Effects Threshold for aquatic biota. This was observed regardless of the physicochemical and hydrodynamic conditions of each environment. Finally, coupling of these methodologies allowed a comprehensive evaluation of the geochemical properties of the sediment and the potential bioavailability and ecological risk of trace metals in estuarine systems where there is continuous and specific input of these elements. The use of the DGT technique in the sediment, for the first time, in distinct estuarine systems demonstrated its potential to be applied to future network programs.

Dissertação de mestrado em Geociências (área de especialização em Valorização de Recursos Geológicos), Por todo o mundo, a saúde de milhões de pessoas é ameaçada pela exposição a águas de consumo que ultrapassam o limite recomendado da concentração em arsénio de 10 μg/L. O presente estudo avalia a presença de arsénio nas águas superficiais e subterrâneas envolventes a uma zona mineira sujeita a recuperação ambiental em 2007. Para tal, foi estudada a zona mineira da Freixeda, situada em Portugal, na região de Trás-os-Montes, concelho de Mirandela, do Distrito de Bragança, englobada na Província metalogénica aurífera do NW da Península Ibérica. O contexto geológico onde a mina da Freixeda ocorre é, desde logo, propício à presença de metais e metaloides nas águas da região pelo decurso natural dos processos de interação água-rocha que continuam a ocorrer no meio subterrâneo. As galerias imersas e a presença de escombreiras, que apesar de impermeabilizadas aquando da recuperação ambiental, e que sofreram recentemente novos trabalhos de prospeção, afetam a qualidade das águas superficiais e subterrâneas. Nas águas superficiais é possível identificar uma evolução química espacial, ao longo da ribeira da Freixeda, que se traduz por um aumento em SO4 2-, Ca e Mg nas proximidades da influência da mina. Esta evolução dissipa-se progressivamente com o aumento da distância da mina, bem como, com o aumento do caudal depois da confluência com o rio Tua, onde predominam os iões Na e HCO3 -. A concentração de arsénio na água superficial e subterrânea varia bastante para uma gama de valor de pH compreendida entre 6 e 8, em que nas águas com valores de pH mais ácido, as concentrações de arsénio tendem a ser menores. A condutividade elétrica (CE) varia bastante nas águas superficiais (CE 64-651 μS/cm), diminuindo significativamente para cerca de 1/3, durante e após três meses dos períodos de chuva, enquanto que nas águas subterrâneas o valor é mais elevado (CE 200-800 μS/cm), sendo no aquífero profundo onde se registam os maiores valores (CE 749-800 μS/cm). Na região da mina da Freixeda, as maiores concentrações de arsénio encontram-se nas águas subterrâneas com um máximo registado de 1,434 mg/L, mas as águas superficiais também excedem os valores máximos legais admitidos para águas de consumo humano. Com base na especiação química do arsénio é possível verificar que o arsénio pentavalente predomina na maioria das águas, mas o arsénio trivalente tem maior expressão na relação com o arsénio total em períodos estivais e em ambientes redutores, ou pouco oxidantes. As condições ambientais mais favoráveis à ocorrência de concentrações elevadas de As nas águas subterrâneas da região em estudo são: valores de pH entre 6,6 e 7,4; ambiente redutor, ou pouco oxidante, concentração de flúor superior a 1,5 mg/L; e concentração elevada de Fe em solução. Para melhor entender a mobilidade do arsénio, uma monitorização regular nas águas relativa aos teores de arsénio e respetiva especiação, associada aos estudos já realizados, permitiriam investigar as interações entre a fase sólida do aquífero e as águas subterrâneas e superficiais, possibilitando uma previsão das mudanças hidrogeoquímicas no futuro, como por exemplo um aumento dos teores de arsénio trivalente, flúor e ferro em solução., Throughout the world, the health of millions of people is threatened by exposure to drinking water that exceeds the recommended limit of the concentration in arsenic (As) of 10 mg/L. The present study evaluates the presence of arsenic in surface and groundwaters surrounding a mining zone subject to environmental recovery in 2007. To this end, it was studied the mining zone of Freixeda, located in Portugal, in the region of Trás-os-Montes, municipality of Mirandela, in the district of Bragança, encomplaced in the gold Metalogenic Province of the NW of the Iberian Peninsula. The geological context where the Freixeda mine occurs is, as a result, favorable to the presence of metals and metalloids in the waters of the region through the natural course of the water-rock interaction processes that continue to occur in the underground environment. The galleries immersed and the presence of tailings, which despite being waterproofed during environmental recovery, and which recently suffered new prospecting work, affect the quality of surface and groundwater. In surface waters it is possible to identify a spatial chemical evolution along the Ribeira da Freixeda, which translates by an increase in SO4 2-, Ca and Mg in the vicinity of the influence of the mine. This evolution dissipates progressively with the increase of the distance to the mine, as well as, with the increase of the flow after the confluence with the River Tua, where the ions Na and HCO3 - predominate. The concentration of arsenic in surface and underground water varies considerably for a range of pH value between 6 and 8, in which in waters with more acidic pH values, arsenic concentrations tend to be smaller. The electrical conductivity (EC) varies widely in surface waters (EC 64-651 μS/cm), decreasing significantly to about 1/3, up to three months after the rainy season, while in the groundwater the value is higher (EC 200-800 μS/cm), being in the deep aquifer where the highest values (CE 749-800 μS/cm) were recorded. In the region of the Freixeda mine, the highest concentrations of arsenic are found in groundwater with a registered maximum of 1,434 mg/L, but surface waters also exceed the legal maximum values allowed for human consumption waters. Based on the chemical speciation of arsenic it is possible to verify that the pentavalent arsenic predominates in most waters, but trivalent arsenic has greater expression in the relationship with total arsenic in summer periods and in reduced environments, or low oxidizing conditions. The environmental conditions most favorable to the occurrence of high concentrations of As in the groundwater of the region under study are: pH values between 6,6 and 7,4; reducing environments, or low oxidizing conditions, fluoride concentration greater than 1,5 mg/L; and high concentration of Fe in solution. To better understand the mobility of arsenic, regular monitoring in waters related to arsenic content and its speciation, associated with the studies already carried out, would allow investigating the interactions between the solid phase of the aquifer and groundwater/surface waters, enabling a prediction of hydrogeochemical changes in the future, such as an increase in the levels of trivalent arsenic, fluoride and iron in solution.

Tese de mestrado, Biologia de Conservação, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019 Submitted by Cristina Manessiez (camanessiez@fc.ul.pt) on 2019-12-13T15:40:17Z No. of bitstreams: 1 ulfc125262_tm_Jorge_Alves.pdf: 2013885 bytes, checksum: 07421873e71ff57f476893aecf695560 (MD5) Made available in DSpace on 2019-12-13T15:40:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ulfc125262_tm_Jorge_Alves.pdf: 2013885 bytes, checksum: 07421873e71ff57f476893aecf695560 (MD5) Previous issue date: 2019

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Nesta tese é proposto um novo método de especiação química de arsênio em amostras de arroz, por meio da extração em fase sólida baseada em sal de amônio quaternário e in-situ (ISQAS-SPE). Apesar do grande número de publicações sobre especiação de arsênio empregando técnicas cromatográficas, este método visa contribuir para o estado da arte da especiação não-cromatográfica, que ainda é pouco explorada. Espécies de arsênio inorgânico após serem extraídas e pré-concentradas, foram determinadas na forma de As(III) por espectrometria de absorção atômica com geração de hidretos em um sistema de análise por injeção em fluxo com zonas coalescentes por multicomutação (FI-HG AAS). A espécie As(III) complexa seletivamente com agente APDC em pH 1,0 e extraído pelas micropartículas da fase sólida formada. O brometo de tetra-n-butilamônio (TBAB) foi empregado como Agente Transferidor de Fase e o ânion ClO4- como Agente Pareador Iônico, formando o perclorato de tetra-n-butilamônio como fase sólida extratora. Ensaios de caracterização revelaram partículas com dimensionamento micrométrico, sem uma fase definida e de alta área superficial. A extração do complexo As(PDC)3 ocorre por mecanismos de adsorção e interações hidrofóbicas. O procedimento ISQAS-SPE foi otimizado através de planejamentos fatoriais e metodologia de superfície de resposta empregando Planejamento Fatorial Composto com Ponto Central (CCD). Sob as condições ótimas de extração, as variáveis que influenciam no sistema de determinação FI-HG AAS foram otimizadas de forma univariada, do qual pode-se obter 88% de eficiência na recuperação de As(III). A determinação de arsênio inorgânico total foi possível mediante etapa de pré-redução com cloridrato de hidroxilamina 0,5% (m/v), da qual a concentração da espécie As(V) pode ser determinada por diferença. Estudos de interferência de concomitantes apontaram interferência significativa dos íons metálicos Cd(II) e Mn(II), característicos de interferência em fase líquida, dos quais podem ser minimizados pela adição do agente mascarante EDTA. Não foram observadas interferências significativas das espécies metiladas MMA e DMA. Verificou-se que é possível determinar seletivamente a espécie DMA na ausência de MMA a partir da solução sobrenadante por HG AAS empregando tampão acetato pH 5,0 e 0,4% (m/v) de NaBH4. O método apresenta potencialidade para determinação de baixas concentrações de arsênio, com fator de pré-concentração 17. Os limites de detecção e quantificação obtidos foram respectivamente de 0,040 e 0,12 µg L-1 para As total; e 0,46 e 1,5 µg L-1 para DMA, com precisão de 5,5% para As(III) 10,0 µg L-1. O método foi aplicado em material de referência certificado IRMM-804 Rice Flour obtendo 92% de exatidão. O método é simples e se mostra aplicável no monitoramento de arsênio em amostras de arroz dentro dos valores normatizados pelas legislações vigentes. In this work a new method for chemical speciation of arsenic in rice samples is proposed, by means of solid phase extraction in situ-based on quaternary ammonium salt and (ISQAS-SPE). Among a large number of publications on arsenic speciation using chromatographic techniques, this method aims to contribute to the state of the art of non-chromatographic speciation, which is still little explored. Inorganic arsenic species after extraction and preconcentration were determined as As (III) by atomic absorption spectrometry with hydride generation in a flow injection analysis system with coalescing zones by multicomputing (FI-HG AAS). The As (III) species selectively complexes with APDC agent at pH 1.0 and they are extracted by the microparticles of the formed solid phase. Tetra-n-butylammonium bromide (TBAB) was used as Phase Transfer Agent while the ClO4- anion was the Ionic Paretic Agent, forming tetra-n-butylammonium perchlorate as the extractive solid phase. Characterization assays revealed particles with micrometric scaling, without a defined morphology and high surface area. The extraction of As(PDC)3 complex occurs by adsorption mechanisms and hydrophobic interactions. The ISQAS-SPE procedure was optimized through factorial design and response surface methodology using Central Compound Design (CCD). Under optimal extraction conditions, the variables influencing the FI-HG AAS determination system were optimized in an univariate form, from which 88% of As (III) recovery efficiency can be obtained. The determination of total inorganic arsenic was possible by pre-reduction step with hydroxylamine hydrochloride 0.5% (m /v), of which the concentration of the As (V) species can be determined by difference. Concomitant interference studies have indicated significant interference of Cd(II) and Mn(II) metal ions, characteristic of interference in liquid phase, of which they can be minimized by the addition of EDTA as masking agent. On the other hand no significant interferences were observed in the methylated species MMA and DMA. It has been found that it is possible to selectively determine the DMA species in the absence of MMA from the HG AAS supernatant solution using acetate buffer pH 5.0 and 0.4% (m /v) NaBH4. The method has potential for the determination of low concentrations of arsenic, with a preconcentration factor of 17. The limits of detection and quantification obtained were respectively 0.040 and 0.12 μg L-1 for total As; and 0.46 and 1.5 μg L-1 for DMA, with an accuracy of 5.5% for As(III) 10.0 μg L-1. The method was applied in IRMM-804 Rice Flour certified reference material obtaining 92% accuracy. The method is simple and shown to be applicable to the monitoring of arsenic in rice samples within the values established by current legislation. Tese (Doutorado)

Submitted by BRUNA EMILIA ROMAN null (brunaemiliar@gmail.com) on 2018-03-21T13:20:58Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Finalizada.pdf: 5988806 bytes, checksum: e05874c60119092659b461ccf48a960f (MD5) Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) É necessário que o arquivo contendo a sua dissertação esteja no formato Portable Document Format (PDF) e NÃO esteja protegido, solicito que troque o arquivo pois este não está permitindo edição, o que nos impossibilita editar o arquivo parcial para inserir no repositório. Agradecemos a compreensão on 2018-03-21T18:57:49Z (GMT) Submitted by BRUNA EMILIA ROMAN null (brunaemiliar@gmail.com) on 2018-03-21T20:51:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Bruna_Emilia.pdf: 5815929 bytes, checksum: e6e853b8eca84f0f1a25cfe4e1ce8275 (MD5) Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) É necessário que o arquivo contendo a sua dissertação esteja no formato Portable Document Format (PDF) e NÃO esteja protegido, solicito que troque o arquivo pois este não está permitindo edição, o que nos impossibilita editar o arquivo parcial para inserir no repositório. Agradecemos a compreensão on 2018-03-22T18:47:25Z (GMT) Submitted by BRUNA EMILIA ROMAN null (brunaemiliar@gmail.com) on 2018-03-23T10:49:35Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-BrunaEmilia.pdf: 5986355 bytes, checksum: f8b7a367218d340ac9125b5671fbcfbb (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2018-03-26T20:52:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 roman_be_me_sjrp_par.pdf: 654859 bytes, checksum: e83265aca10a236b7e99ace8d75ec3d5 (MD5) Made available in DSpace on 2018-03-26T20:52:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 roman_be_me_sjrp_par.pdf: 654859 bytes, checksum: e83265aca10a236b7e99ace8d75ec3d5 (MD5) Previous issue date: 2018-03-05 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A reconstrução filogenética é fundamental para o entendimento de muitos fenômenos evolutivos. A obtenção de árvores filogenéticas a partir da utilização de marcadores moleculares distintos aliada à análise de caracteres morfológicos torna-se imprescindível, pois ambas informações são muitas vezes complementares, aumentando a robustez das análises. As espécies do grupo saltans de Drosophila são amplamente distribuídas nas Américas do Sul, Central e do Norte e as informações a respeito da filogenia do grupo presentes na literatura apresentam incongruências. Assim, o presente trabalho teve por objetivo reconstruir a filogenia para as espécies do grupo saltans, utilizando 16 das 21 espécies que o constituem. O estudo foi realizado a partir da análise de 48 caracteres morfológicos da terminália masculina por microscopia eletrônica de varredura, e marcadores moleculares baseado nas análises dos genes COI e COII. As análises filogenéticas foram realizadas utilizando os critérios de Máxima Parcimônia e Inferência Bayesiana. Uma árvore particionada foi realizada por meio do critério de Inferência Bayesiana para as três partições (morfológica, COI, COII). Os resultados obtidos indicaram o grupo saltans como monofilético. Em geral, as árvores suportaram as relações de parentesco das espécies dentro dos subgrupos sturtevanti e elliptica. O relacionamento do subgrupo sturtevanti foi estabelecido em dois clados irmãos, sendo um composto pelas espécies D. sturtevanti e D. sturt-like e outro por D. dacunhai e D. milleri. O subgrupo elliptica também foi recuperado em dois clados irmãos, um composto por D. emarginata e D. neoelliptica e outro por D. neosaltans. Politomias foram geradas no subgrupo saltans, mas destaca-se que a relação de parentesco entre as espécies irmãs D. austrosaltans e D. saltans e próxima a elas D. nigrosaltans foi bem suportada e corroborada com dados da literatura. Entretanto, o relacionamento entre a maioria das espécies do subgrupo saltans não foi resolvido, e uma das possíveis explicações poderia ser a recente divergência deste subgrupo. Phylogenetic reconstruction is fundamental to understand many evolutionary phenomena. The obtainment of phylogenetic trees using different molecular markers allied to the analysis of morphological characters becomes essential, due both information are often complementary, increasing the strength of the analyses. The species of Drosophila saltans group are widely distributed in South, Central and North America and the information concerning the group’s phylogeny available on the literature show incongruities. Therefore, the present work aims to reconstruct the phylogeny for this group, using 16 of the 21 species which constitute it. The study was carried out from the analysis of 48 morphological characters of the male Terminalia by Scanning Electron Microscopy, and molecular markers based on the analyses of COI and COII genes. The phylogenetic analyses were performed using the criteria of Maximum Parsimony and Bayesian Inference. A partitioned tree was performed using Bayesian Inference criterion for three partitions (morphological, COI and COII). The obtained results indicated the saltans group as monophyletic. The trees supported the relationship of the species within sturtevanti and elliptica subgroups. The relationship of sturtevanti subgroup was established in two sibling clades, the first one composed by D. sturtevanti and D. sturt-like and the other one by D. dacunhai and D. milleri. The elliptica subgroup was also recovered in two sibling clades, one composed by D. emarginata and D. neoelliptica and another by D. neosaltans. Politomies were generated in the saltans subgroup but we stand out that the relationship among D. austrosaltans, D. saltans and D. nigrosaltans was well-supported and corroborated with data from literature. However, the relationship among most species of the saltans subgroup was not resolved and one of the possible explanations could be the recent divergence of this subgroup.

Submitted by Eunice Novais (enovais@uepg.br) on 2018-04-24T17:27:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Jucimara Kulek de Andrade.pdf: 4583083 bytes, checksum: 9a03d4f30fb1122bb87feac6d618d7a1 (MD5) Made available in DSpace on 2018-04-24T17:27:14Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Jucimara Kulek de Andrade.pdf: 4583083 bytes, checksum: 9a03d4f30fb1122bb87feac6d618d7a1 (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O antimônio e o cromo são elementos presentes no ambiente de forma natural ou decorrente de atividades antrópicas. O comportamento, biodisponibilidade, toxicidade e transporte desses elementos são dependente das suas formas específicas, ou seja, sua especiação. Assim, é importante conhecer as diferentes espécies do elemento em um meio específico. O presente trabalho teve por objetivo implantar e validar em laboratório protocolos analíticos para o estudo da especiação de Sb e Cr em amostras de água mineral e natural, empregando técnicas de extração com detecção por espectrometria atômica. A especiação de Sb por extração por ponto nuvem envolveu a extração seletiva de Sb(III) em pH 2, com pirrolidina ditiocarbamato de amônio – APDC (complexante) em meio de surfactante (Triton X-114). A determinação do teor total de Sb foi realizada pelo mesmo procedimento, após redução do Sb(V) para Sb(III) usando L-cisteína. Um amplo estudo da presença de Sb(III) e Sb(V) em amostras brasileiras de água mineral envasadas em PET foi realizado. A concentração média de Sb(total) para 39 amostras recentemente envasadas foi de 4 ± 1,4 μg L-1, sendo que 70% das amostras estão dentro dos limites aceitáveis pela ANVISA (5,0 μg L-1). A espécie majoritária nas amostras foi o Sb(III) com 53 a 79% do teor total de Sb, sugerindo a migração do Sb2O3 do PET para a bebida. Um estudo foi conduzido com cinco marcas de água mineral envasada e analisadas durante seis meses. O teor de Sb(total) na água mineral aumentou de 2 a 27% após 6 meses de estocagem. Esses resultados indicam que ocorre a migração do Sb presente no PET para a bebida engarrafada. A migração do Sb do PET para água mineral foi avaliada sob diferentes condições de armazenamento (tempo, temperatura, exposição solar) usando a própria bebida como simulante e com simulantes alimentícios (água ultrapura e solução ácida). Nesses ensaios, observou-se um aumento de até 214% do teor de Sb quando a temperatura de armazenamento aumentou até 80ºC. Um aumento de 323% foi observado quando as amostras foram expostas por 7 dias à radiação solar e de até 600% com simulante ácido acético por 10 dias. Com relação à distribuição das espécies, a espécie que apresentou aumento mais significativo foi de Sb(III). A especiação de Cr por emulsificação assistida por ultrassom envolveu a extração seletiva do Cr(VI) e pré-concentração com tributilfosfato (TBP) (solvente extrator orgânico), em meio de HCl e NaCl. A dispersão da solução extratora foi realizada com banho ultrassônico em substituição a um solvente dispersor. A determinação do teor total de Cr(III) foi realizada pelo mesmo procedimento, após oxidação do Cr(III) para Cr(VI) usando KMnO4. Um estudo de especiação de Cr em amostras de água natural do Oeste, Centro-Oeste e Campos Gerais do Estado do Paraná, Brasil foi realizado. As concentrações totais de Cr foram inferiores a 1,0 μg L-1, portanto, compatíveis com águas não contaminadas. O Cr dissolvido foi a maior fração para as amostras, indicando que o Cr pode ter uma maior capacidade de mobilidade e possível biodisponibilidade nessas águas. Com relação a distribuição do Cr na fração dissolvida, a fração majoritária foi de Cr(VI). Esta é a espécie mais tóxica e forma mais esperada em águas naturais oxigenadas. A variabilidade nos resultados mostra a necessidade de monitoramento das concentrações totais desses elementos e sua especiação, nos ambientes aquáticos e águas engarrafadas, como forma avaliar sua toxicidade e garantir a segurança social e ambiental. Antimony and chromium are elements present in the environment naturally or due to anthropic activities. The behavior, bioavailability, toxicity and transport of these elements are dependent on their specific forms, i.e., their speciation. Thus, it is important to know the different species of this element in a specific medium. Thereby, this work proposes to implement and validate in laboratory analytical protocols for the study of Sb and Cr speciation in mineral and natural water, employing extraction technique with detection by atomic absorption. The Sb speciation by cloud point extraction involved the selective extraction of Sb(III) at pH 2, with ammonium pyrrolidinedithiocarbamate - APDC (complexing agent) in surfactant medium (Triton X-114). By the same procedure was performed the determination of the total Sb content, however after reduction of Sb (V) to Sb (III) using L-cysteine. This protocol made possible an extensive study of the presence of Sb(III) and Sb(V) in Brazilian samples of bottled mineral water with PET. The mean concentration of Sb (total) for 39 freshly packaged samples was 4 ± 1.4 μg L-1, and 70% of the samples were within the limits acceptable by ANVISA (5.0 μg L-1). The majority species in the samples was Sb(III) with 53 to 79% of the total Sb content, suggesting the migration of Sb2O3 from PET to the beverage. With five brands of bottled mineral water was conducted a study, with samples analyzed for six months. Sb(total) content in mineral water increased from 2 to 27% after 6 months of storage. These results indicate that migration of the Sb present in the PET to the bottled beverage occurs. The migration of Sb from PET to mineral water was evaluated under different storage conditions (time, temperature, sun exposure) using the beverage as simulant and with food simulants (ultrapure water and acid solution). In these tests, when storage temperature increased to 80 °C was observed an increase of up to 214% in Sb content. When samples were exposed for 7 days to solar radiation was observed an increase of up to 323% in Sb content and when packaging were maintained for 10 days with acetic acid simulant was observed an increase of up to 600%. Regarding the distribution of species, the species that presented the most significant increase was Sb(III). The Cr speciation by ultrasound emulsification microextraction involved the selective extraction of Cr (VI) and preconcentration with organic extractor solvent, tributylphosphate (TBP), in HCl and NaCl medium. . It was performed the dispersion of the extractive solution with an ultrasonic bath in place of a dispersing solvent. By the same procedure, the determination of the total Cr(III) content was performed, but after oxidation of Cr(III) to Cr(VI) using KMnO4. A Cr speciation study in samples of natural water from the West, Center-West and Campos Gerais from the State of Paraná, Brazil was carried out. The total concentrations of Cr were less than 1.0 μg L-1,therefore, these levels are compatible with uncontaminated water. Cr dissolved was the largest fraction for the samples, indicating that Cr may have a greater mobility capacity and possible bioavailability in these waters. Regarding the distribution of Cr in the dissolved fraction, the majority fraction was Cr(VI). This is the more toxic specie and more expected form in oxygenated natural waters. The variability in the results shows the need for monitoring of the total concentrations of theses elements and their speciation in aquatic environments and bottled waters, as a way to evaluate their toxicity and guarantee social and environmental security.