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131 results on '"Erauso, Gaël"'

2. Isolation and initial characterization of microorganisms from a shallow marine hydrothermal system, Vulcano (Italy)

Author

Galès Grégoire, Erauso Gaël, Canhiac Isabelle, Postec Anne, and Capasso Giorgio

Subjects
Environmental sciences, GE1-350
Abstract

Samples from Vulcano hydrothermal system were incubated at hot temperatures with various electron donors and acceptors in order to isolate and characterize strains belonging from this environment. Eighteen strains were isolated, from which three seemed to belong to new species according to their 16S rRNA sequence. These strains are under phenotypic and genotypic characterization. Cultivation of representative taxa from an environment helps understanding ecological functions of microbial groups in these environments. Although cultivation often fails to isolate all representative prokaryotic taxa, effort of cultivation still can achieve the recovery of poorly characterized microorganisms.

Published
2022
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5. The Complete Genome of the Crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2

Author

She, Qunxin, Singh, Rama K., Confalonieri, Fabrice, Zivanovic, Yvan, Allard, Ghislaine, Awayez, Mariana J., Clausen, Ib Groth, Curtis, Bruce A., De Moors, Anick, Erauso, Gael, Fletcher, Cynthia, Jong, Ineke Heikamp-de, Jeffries, Alex C., Kozera, Catherine J., Medina, Nadine, Peng, Xu, Thi-Ngoc, Hoa Phan, Redder, Peter, Schenk, Margaret E., Theriault, Cynthia, Tolstrup, Niels, Charlebois, Robert L., Doolittle, W. Ford, Duguet, Michel, Gaasterland, Terry, Garrett, Roger A., Ragan, Mark A., Sensen, Christoph W., and Van der Oost, John

Published
2001

9. Comparative Metagenomics Highlight a Widespread Pathway Involved in Catabolism of Phosphonates in Marine and Terrestrial Serpentinizing Ecosystems

Author

Frouin, Eléonore, Lecoeuvre, Aurélien, Armougom, Fabrice, Schrenk, Matthew, Erauso, Gaël, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

This first comparative metagenomic study of serpentinite-hosted environments provides an objective framework to understand the functioning of these peculiar ecosystems. We showed a taxonomic similarity between the PBHF and other terrestrial serpentinite-hosted ecosystems.

Published
2022
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16. Life in deep subsurface

Author

Galès Grégoire and Erauso Gaël

Subjects
Environmental sciences, GE1-350
Abstract

Life extends far deeper into the Earth's subsurface than presumed possible 30 years ago. In the past, it was assumed that life is a surface phenomenon, and that even “hardy prokaryotic types” are not capable of living deeper than tens of meters below the surface [1]. In the 1990s, it became apparent that genetically and metabolically diverse microbial communities existed under highly reducing conditions in the deep subsurface [2]. Today we know that life in the deep subsurface is ubiquitous and comprises a large proportion of the biomass on Earth [3]. Many questions concerning life in the deep remain unanswered. What is the lower depth limit of the deep biosphere? Which energy sources are fueling these communities? How are genetic diversity and functional activity linked to geochemical factors? What we know is that the deep subsurface is an extreme environment and that the microorganisms living here have developed numerous mechanisms to deal with high pressure and temperature, limited energy and nutrient availability, extreme acidity and alkalinity, metal toxicity, and radioactivity [4].

Published
2016
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17. Microbiology of shallow subsurface aquifer and carbonate rocks studied by culture-dependent and culture-independent methods. Preliminary results on an underground laboratory, the LSBB, Rustrel, France

Author

Galès Grégoire, Erauso Gaël, Cayol Jean-Luc, Navarro David, Boyer Daniel, and Micolau Gilles

Subjects
Environmental sciences, GE1-350
Abstract

We investigated the microbiology of a shallow subsurface site, the LSBB, located near Avignon. This site lies in carbonate rocks, belonging to the Urgonian facies. Rock, concrete and water samples were collected and directly transferred to the laboratory. Studies of microorganisms as pure cultures are the only way to get their real physiological properties. Nevertheless, microbiologists cannot cultivate and isolate the majority of microorganisms for several reasons, one being our lack of understanding of their minimal needs. Molecular studies, e.g. extraction and sequencing of the total nucleic acids present in an environment provide phylogenetic and metabolic information on uncultivated microorganisms. We performed aerobic and anaerobic culture with various electron acceptors and donors, searching for heterotrophic, methanogenic, sulphate- nitrate- and FeIII- reducing Prokaryotes. We also performed DNA extractions and PCR amplification of ribosomal RNA genes, to test if our protocols were adapted to this environment. Our results show that the LSBB galleries are colonized by a low diversity microbiote, with a strong influence of anthropogenic activities. Further studies will link the microorganisms biodiversity and the petrophysic properties of rocks.

Published
2016
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24. Hydrostatic Pressure Helps to Cultivate an Original Anaerobic Bacterium From the Atlantis Massif Subseafloor (IODP Expedition 357): Petrocella atlantisensis gen. nov. sp. nov.

Author

Quéméneur, Marianne, primary, Erauso, Gaël, additional, Frouin, Eléonore, additional, Zeghal, Emna, additional, Vandecasteele, Céline, additional, Ollivier, Bernard, additional, Tamburini, Christian, additional, Garel, Marc, additional, Ménez, Bénédicte, additional, and Postec, Anne, additional

Published
2019
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27. Metagenomic and PCR-Based Diversity Surveys of [FeFe]-Hydrogenases Combined with Isolation of Alkaliphilic Hydrogen-Producing Bacteria from the Serpentinite-Hosted Prony Hydrothermal Field, New Caledonia

Author

Mei, Nan, Postec, Anne, Monnin, Christophe, Pelletier, Bernard, Payri, Claude E., Benedicte MENEZ, Frouin, Eléonore, Ollivier, Bernard, Erauso, Gaël, Quéméneur, Marianne, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Géosciences Environnement Toulouse ( GET ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [Nouvelle-Calédonie] ), Institut de Physique du Globe de Paris ( IPGP ), Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université de la Réunion ( UR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)

Subjects
metagenomics, lcsh:QR1-502, serpentinization, [ SDV.MP.BAC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Microbiology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, lcsh:Microbiology, [FeFe]-hydrogenase, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hydrogen, microbial diversity, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hydrogen producers, Original Research, hydA genes
Abstract

International audience; High amounts of hydrogen are emitted in the serpentinite-hosted hydrothermal field of the Prony Bay (PHF, New Caledonia), where high-pH (∼11), low-temperature (

Published
2016
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28. Obligate sugar oxidation in Mesotoga spp., phylum Thermotogae , in the presence of either elemental sulfur or hydrogenotrophic sulfate‐reducers as electron acceptor

Author

Fadhlaoui, Khaled, primary, Ben Hania, Wagdi, additional, Armougom, Fabrice, additional, Bartoli, Manon, additional, Fardeau, Marie‐Laure, additional, Erauso, Gaël, additional, Brasseur, Gaël, additional, Aubert, Corinne, additional, Hamdi, Moktar, additional, Brochier‐Armanet, Céline, additional, Dolla, Alain, additional, and Ollivier, Bernard, additional

Published
2017
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29. Mineralizing Filamentous Bacteria from the Prony Bay Hydrothermal Field Give New Insights into the Functioning of Serpentinization-Based Subseafloor Ecosystems

Author

Pisapia, Céline, primary, Gérard, Emmanuelle, additional, Gérard, Martine, additional, Lecourt, Léna, additional, Lang, Susan Q., additional, Pelletier, Bernard, additional, Payri, Claude E., additional, Monnin, Christophe, additional, Guentas, Linda, additional, Postec, Anne, additional, Quéméneur, Marianne, additional, Erauso, Gaël, additional, and Ménez, Bénédicte, additional

Published
2017
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30. Environmental microbiology as a mosaic of explored ecosystems and issues

Author

Faure, Denis, Bonin, Patricia, Duran, Robert, Amato, Pierre, Arsene-Ploetze, Florence, Auguet, J.C., Legrand, Bernard, Bertin, P.N., Bettarel, Y., Bigot-Clivot, A, Blot, N, BLOUIN, Manuel, Bormans, Myriam, Bouvy, M, Bruneel, O, Cébron, A, Christaki, U, Couée, Ivan, Cravo-Laureau, Cristiana, Danger, M, de Lorgeril, J, Desdevises, Y, Dessaux, Y, Destoumieux-Garzón, D, Duprat, E, Erauso, Gaël, Haichar, Feth El Zahar, Fouilland, E, Francez, Andre-Jean, Fromin, N, Geffard, Alain, Ghiglione, J.F., Grossi, Vincent, Guizien, K, Hubas, C, Huguet, A, Jardillier, L, Jouquet, P, Joux, F, Kaisermann, A, Kaltz, O, Lata, J.C., Lecerf, A, Leyval, C, Luis, Patricia, Masseret, E, Niboyet, A, Normand, Philippe, Plewniak, F, Poly, Franck, Prado, S, Quaiser, Achim, Ratet, P, Richaume, Agnès, Rolland, J.L., Rols, J.L., Rontani, JF, Rossi, F, Sablé, Sophie, Sivadon, P, Soudant, Philippe, Tamburini, C, Tribollet, Aline, Valiente Moro, C, Van Wambeke, France, Vandenkoornhuyse , Philippe, Vuilleumier, Stéphane, Vandenkoornhuyse, Philippe, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulon (UTLN), Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie des systèmes marins côtiers (Ecosym), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - 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Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Géologie de Lyon - Terre, Planètes, Environnement (LGL-TPE), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecogéochimie des environnements benthiques (LECOB), Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AgroParisTech, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), LIttoral ENvironnement et Sociétés (LIENSs), La Rochelle Université (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biogéochimie-Traceurs-Paléoclimat (BTP), Laboratoire d'Océanographie et du Climat : Expérimentations et Approches Numériques (LOCEAN), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Pierre et Marie Curie - 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Subjects
Health, Toxicology and Mutagenesis, Ecology (disciplines), Mosaic (geodemography), Biology, Microbial ecology, Environmental Chemistry, Animals, Humans, Ecosystem, 14. Life underwater, Phylogeny, Bacteria, Environmental microbiology, Ecology, Microbial ecosystems, ACL, Critical zone, General Medicine, 15. Life on land, biology.organism_classification, Pollution, Archaea, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, 13. Climate action, Viruses, Microbial Interactions, Environmental Pollutants, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, human activities
Abstract

International audience; Microbes are phylogenetically (Archaea, Bacteria, Eukarya, and viruses) and functionally diverse. They colonize highly varied environments and rapidly respond to and evolve as a response to local and global environmental changes, including those induced by pollutants resulting from human activities. This review exemplifies the Microbial Ecology EC2CO consortium’s efforts to explore the biology, ecology, diversity, and roles of microbes in aquatic and continental ecosystems.

Published
2015
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31. Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from the Prony alkaline Hydrothermal Field in New Caledonia

Author

BES, Meline, Merrouch, Mériem, JOSEPH, Manon, QUEMENEUR, Marianne, Payri, Claude, Pelletier, Bernard, Ollivier, Bernard, FARDEAU, Marie-laure, Erauso, Gaël, POSTEC, Anne, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biocomplexité des écosystèmes coralliens de l'Indo-Pacifique (CoReUS2), Géoazur (GEOAZUR 7329), Université Côte d'Azur (UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut méditerranéen d'océanologie ( MIO ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Université de Toulon ( UTLN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biocomplexité des écosystèmes coralliens de l'Indo-Pacifique ( CoReUS2 ), Géoazur ( GEOAZUR ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, and COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])

Subjects
[ SDU.OCEAN ] Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere
Abstract

International audience; A novel anaerobic bacterium, strain ST07-YET, was isolated from a carbonate chimney of the Prony Hydrothermal Field (PHF) in New Caledonia. Cells were Gram-positive-staining, straight rods (0.7-0.8 x 3.0-5.0 µm). They were motile by the means of lateral flagella. Strain ST07-YET was mesophilic (optimum 35°C), moderately alkaliphilic and halotolerant (optimum pH 8.7 and 5 g l-1 NaCl). Elemental sulfur, sulfate, thiosulfate, sulfite, nitrate and nitrite were not used as terminal electron acceptors. Yeast extract, peptone, tryptone, casamino-acids, crotonate, pyruvate, galactose, maltose, sucrose, ribose, trehalose and glucose were used as carbon sources. Glucose fermentation led to acetate, H2 and CO2 formation. Arginine, serine, histidine, lysine, methionine and cysteine improved growth, but the Stickland reaction was negative for the combinations of amino acids tested. The major metabolic products from yeast extract fermentation were H2, acetate, butyrate, isobutyrate, isovalerate and propionate. The predominant cellular fatty acids were C16:0, C16:1 cis9, C14:0 and C16:1 cis7 (>5% of total fatty acids). The G+C content of the genomic DNA was 32.9 mol %. Phylogenetic analysis revealed that strain ST07-YET was most closely related to Clostridium sticklandii DSM 159T and Acetoanaerobium noterae NOT-3T (96.7% and 96.8% 16S rRNA gene sequence identity). On the basis of phylogenetic, chemotaxonomic and physiological properties, strain ST07-YET (= DSM 27512 = JCM 19400) is proposed as a novel species of the genus Acetoanaerobium, order Clostridiales, phylum Firmicutes, as Acetoanaerobium pronyense sp. nov..

Published
2015
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32. Production d’hydrogène dans les systèmes hydrothermaux hyperalcalins des ophiolites (Oman, Ligurie, Nouvelle Calédonie)

Author

Monnin, C., Chavagnac, V., Boulart, C., Ceuleneer, G., Hoareau, Guilhem, Ménez, B., Gérard, E., Gérard, M., Quéméneur, M., Erauso, Gaël, POSTEC, Anne, Guentas-dombrowski, L., Payri, C., Pelletier, B., Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire des Fluides Complexes et leurs Réservoirs (LFCR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-TOTAL FINA ELF, Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de minéralogie et de physique des milieux condensés (IMPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Géoazur (GEOAZUR 7329), Université Côte d'Azur (UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TOTAL FINA ELF-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-IPG PARIS-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])

Subjects
[PHYS.MECA.MEMA]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanics of materials [physics.class-ph], [SDU.STU.GP]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Geophysics [physics.geo-ph], [SPI.MECA.MEMA]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Mechanics of materials [physics.class-ph], [PHYS.COND.CM-MS]Physics [physics]/Condensed Matter [cond-mat]/Materials Science [cond-mat.mtrl-sci], [PHYS.MECA.GEME]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanical engineering [physics.class-ph], [SPI.MECA.MEFL]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph]
Abstract

ACT; International audience

Published
2014

33. Mesotoga infera sp. nov., a novel mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage in France

Author

Ben-Hamia, W, POSTEC, Anne, Aüllo, T, Ranchou-Peyruse, A, Erauso, Gaël, Brochier-Armanet, Céline, Hamdi, M, Ollivier, Bernard, Saint-Laurent, S, Magot, Michel, FARDEAU, Marie Laure, MEB, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSAT, Institut National des Sciences Appliquées et de Technologie [Tunis] (INSAT), Institut Pluridisciplinaire de Recherche sur l'Environnement et les Matériaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut pluridisciplinaire de recherche sur l'environnement et les matériaux (IPREM)

Subjects
[SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract

DOI = 10.1099; Strain VNs100T, a novel mesophilic anaerobic rod-cocoid-shaped bacterium, having a sheath-like outer structure (toga) was isolated from a water sample collected in the area of underground gas storage. It was non-motile with cells Appearing singly (2-4 μm long x 1-2 μm wide), in pairs, or as long chains and stained Gram-negative. Strain VNs100T was heterotrophic, able to use arabinose, cellobiose, fructose, galactose, glucose, lactose, lactate, mannose, maltose, raffinose, ribose, sucrose and xylose as energy sources only in the presence of elemental sulfur as terminal electron acceptor. Acetate, CO2 and sulfide were the end-products of sugar metabolism. Hydrogen was not detected. Elemental sulfur, but not thiosulfate, sulfate and sulfite, were reduced into sulfide. It grew at temperatures between 30°C and 50°C (optimum 45°C), at pH between 6.2 and 7.9 (optimum 7.3-7.5) and at NaCl concentrations between 0 and 15 g.L-1 (optimum 2 g.L-1). The DNA G+C content was 47.5 mol%. The main cellular fatty acid was C16:0. Phylogenetic analysis of the small-subunit (SSU) ribosomal RNA (rRNA) gene sequence indicated that strain VNs100T had as its closest relatives 'Mesotoga sulfurireducens' (97.1 % similarity) and Mesotoga prima (similarity of 97.1 % and 97.7 % with each of its two genes respectively) within the order Thermotogales. Hybridization between strain VNS100T and 'Mesotoga sulfurireducens' and between strain VNS100T and Mesotoga prima is 12.9% and 20.6 %, respectively. Based on phenotypic, phylogenetic and taxonomic characteristics, strain VNs100T is proposed as a novel species of genus Mesotoga within the family Thermotogaceae, order Thermotogales. The name Mesotoga infera, sp. nov. is proposed. The type strain is VNs100T (= DSM 25546 = JCM 18154).

Published
2013

34. Distribution spatiale des communautés microbiennes du système hydrothermal alcalin de la baie de Prony, Nouvelle Calédonie

Author

Quemeneur, Marianne, Bes, Méline, Postec, Anne, Mei, Nan, Hamelin, Jérôme, Payri, Claude, Pelletier, Bernard, Ollivier, Bernard, Erauso, Gaël, ProdInra, Migration, Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Toulon (UTLN), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie]), Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM). FRA., Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2013

35. Obligate sugar oxidation in <italic>Mesotoga</italic> spp., phylum <italic>Thermotogae</italic>, in the presence of either elemental sulfur or hydrogenotrophic sulfate‐reducers as electron acceptor.

Author

Fadhlaoui, Khaled, Ben Hania, Wagdi, Armougom, Fabrice, Bartoli, Manon, Fardeau, Marie‐laure, Erauso, Gaël, Brasseur, Gaël, Aubert, Corinne, Hamdi, Moktar, Brochier‐armanet, Céline, Dolla, Alain, and Ollivier, Bernard

Subjects
GENETIC regulation, PHYSIOLOGICAL effects of glucose, HYDROGEN transfer reactions, PROKARYOTES -- Ultrastructure, SULFUR compounds, BACTERIA
Abstract

Summary: Mesotoga prima strain PhosAc3 is a mesophilic representative of the phylum Thermotogae comprising only fermentative bacteria so far. We show that while unable to ferment glucose, this bacterium is able to couple its oxidation to reduction of elemental sulfur. We demonstrate furthermore that M. prima strain PhosAc3 as well as M. prima strain MesG1 and Mesotoga infera are able to grow in syntrophic association with sulfate‐reducing bacteria (SRB) acting as hydrogen scavengers through interspecies hydrogen transfer. Hydrogen production was higher in M. prima strain PhosAc3 cells co‐cultured with SRB than in cells cultured alone in the presence of elemental sulfur. We propose that the efficient sugar‐oxidizing metabolism by M. prima strain PhosAc3 in syntrophic association with a hydrogenotrophic sulfate‐reducing bacterium can be extrapolated to all members of the Mesotoga genus. Genome comparison of Thermotogae members suggests that the metabolic difference between Mesotoga and Thermotoga species (sugar oxidation versus fermentation) is mainly due to the absence of the bifurcating [FeFe]‐hydrogenase in the former. Such an obligate oxidative process for using sugars, unusual within prokaryotes, is the first reported within the Thermotogae. It is hypothesized to be of primary ecological importance for growth of Mesotoga spp. in the environments that they inhabit. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Published
2018
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36. Microbial communities associated with alkaline hydrothermal systems of Prony Bay, New Caledonia

Author

Erauso, Gaël, Postec, Anne, Quemeneur, Marianne, Benaïssa, Fatma, Hamelin, Jérôme, Menez, Benedicte, Gérard, Emmanuelle, Gérard, Martine, Pelletier, Bernard, Payri, Claude, Fardeau, Marie-Laure, Ollivier, Bernard, Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement [Narbonne] (LBE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP (UMR_7154)), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de La Réunion (UR)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de Physique du Globe de Paris (IPGP), and Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-IPG PARIS-Université de La Réunion (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences
Abstract

International audience; A shallow submarine hydrothermal field comparable to that of Lost City (http://www.lostcity.washington.edu/) was discovered in Prony Bay in the south of New Caledonia (SW Pacific). Both Prony and Lost City are ultramafic hydrothermal systems driven by serpentinization reactions of water with mantle rocks resulting in warm, anoxic, highly alkaline fluids (up to pH 11) rich in calcium, dissolved hydrogen and methane but depleted in carbon oxides and metals. Thus they sharply contrast with the very hot, acidic metal rich fluids typical of sulfidic vents (“black smokers”) associated with magmatic heat. Like in Lost City, the Prony Hydrothermal Field (PHF) is characterized by large carbonate chimneys (up to 30 m in height) venting clear fluids, which temperature however do not exceed 40°C (while it can reach up to 90°C in LCHF). The main difference between the two sites is the geological setting: oceanic (800 m depth) on ultrabasic massif off the MAR for LCHF and a costal environment (0 to 50 m depth) on perodotite nappe in a tectonic active area for PHF. Here, we report the first investigation on the microbial communities inhabiting the carbonate chimneys in PHF, focusing on the inner parts, most alkaline and warmest. For spatio-temporal analyses, samples were collected (2005, 2010 and 2011), from different sections of chimneys (top to bottom, outer to inner), located in seven sites (1 to 5 km distant) at varied depths (0 to 47 m) in the Prony bay. The structure and diversity of microbial communities and functional groups were compared by fingerprinting (SSCP/DGGE) and sequences analyses of clone libraries of both 16S rRNA and functional genes for methanogenesis (mcrA), methanotrophy (pmoA), and sulfate-reduction (dsrAB). We found that overall microbial patterns varied little inside a given chimney but changed in time and dramatically differs from one site to another, likely due to variation in hydrothermal activity and local geological settings. In each site and chimney sample, the specific richness of bacteria was an order higher than of archaea, in agreement with previous studies on LCHF. Archaea were dominated by few phylotypes of Methanosarcinales, related to the ANME group 2 (responsible for anaerobic methane oxydation) Lost City Methanosarcinales (LCMS). Bacteria were mostly affiliated to Firmicutes, α-, β-, and δ-Proteobacteria. Uncultivated lineages(candidate divisions OP1 and OP7), Chloroflexi and deep branching phylotypes were also identified. Interestingly, many bacterial phylotypes were related to alkaliphiles (Desulfonatronum, Alkaliphilus) or, surprisingly, to thermophiles (Thermotagales, Thermus) of volcanic hydrothermal systems. The main metabolic groups were methylotrophs, sulphate-reducers, sulphide oxidizers for bacteria and methanogens or methanotrophs (ANME-related) for archaea indicating that microbial cycling of sulphur and methane must be the dominant biogeochemical processes in PHF as previously observed in LCHF. The overall functions occurring in this original microbial ecosystem resemble those reported for LCHF, meanwhile the microbial actors fulfilling these roles corresponds to unique phylotypes, endemic to PHF. These data provide an important initial microbiological description of a novel example of submarine alkaline hydrothermal ecosystem for meaningful comparison to the well-studied LCHF.

Published
2012

37. Microbial diversity in a submarine carbonate edifice from the serpentinizing hydrothermal system of the Prony Bay (New Caledonia) over a 6-year period

Author

Postec, Anne, primary, Quéméneur, Marianne, additional, Bes, Méline, additional, Mei, Nan, additional, Benaïssa, Fatma, additional, Payri, Claude, additional, Pelletier, Bernard, additional, Monnin, Christophe, additional, Guentas-Dombrowsky, Linda, additional, Ollivier, Bernard, additional, Gérard, Emmanuelle, additional, Pisapia, Céline, additional, Gérard, Martine, additional, Ménez, Bénédicte, additional, and Erauso, Gaël, additional

Published
2015
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38. Acetoanaerobium pronyense sp. nov., an anaerobic alkaliphilic bacterium isolated from a carbonate chimney of the Prony Hydrothermal Field (New Caledonia)

Author

Bes, Méline, primary, Merrouch, Mériem, additional, Joseph, Manon, additional, Quéméneur, Marianne, additional, Payri, Claude, additional, Pelletier, Bernard, additional, Ollivier, Bernard, additional, Fardeau, Marie-Laure, additional, Erauso, Gaël, additional, and Postec, Anne, additional

Published
2015
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39. Draft genome sequence of Mesotoga strain PhosAC3, a mesophilic member of the bacterial order Thermotogales, isolated from a digestor treating phosphogypsum in Tunisia

Author

Ben Hania, Wajdi, primary, Fadhlaoui, Khaled, additional, Brochier-Armanet, Céline, additional, Persillon, Cécile, additional, Postec, Anne, additional, Hamdi, Moktar, additional, Dolla, Alain, additional, Ollivier, Bernard, additional, Fardeau, Marie-Laure, additional, Le Mer, Jean, additional, and Erauso, Gaël, additional

Published
2015
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41. Deep-sea Thermococcales and their Genetic Elements: Plasmids and Viruses

Author

Prieur, Daniel, Erauso, Gaël, Flament, Didier, Gaillard, Mélusine, Geslin, Claire, Gonnet, Mathieu, Le Romancer, Marc, Lucas, Soizick, Forterre, Patrick, Laboratoire de microbiologie des environnements extrêmophiles (LM2E), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Moléculaire du Gène chez les Extrêmophiles (BMGE), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and Institut Pasteur [Paris]

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology
Abstract

ISBN 10: 0-12-521537-1 ; ISBN 13: 978-0-12-521537-4

Published
2006
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46. Mesotoga infera sp. nov., a mesophilic member of the order Thermotogales , isolated from an underground gas storage aquifer

Author

Ben Hania, Wajdi, primary, Postec, Anne, additional, Aüllo, Thomas, additional, Ranchou-Peyruse, Anthony, additional, Erauso, Gaël, additional, Brochier-Armanet, Céline, additional, Hamdi, Moktar, additional, Ollivier, Bernard, additional, Saint-Laurent, Stéphanie, additional, Magot, Michel, additional, and Fardeau, Marie-Laure, additional

Published
2013
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