Search

Aim: Pseudomonas aeruginosa infections have become a major problem in the world and in our country. P. aeruginosa is often encountered as a nosocomial infection. Anatomical defects of the urinary tract or urinary tract interventional applications increases the development of P. aeruginosa infection. Urinary tract infection can also lead to the development of life-threatening sepsis. In this study, we investigated the change of antibiotic resistance profiles of P.aeruginosa strains isolated from hospitalized patients as a urinary tract infection by the years.Material and Methods: This study includes 103 P. aeruginosa strains isolated from hospitalized patients with urinary tract infection between the years 2008-2012. Identification and antibiotic susceptibility studies of the strains were performed by conventional methods and automated systems (Phoenix, BD, USA).Results: Maximum resistance was shown to ceftazidime (85.4%), and Piperacillin/Tazobactam (86.6%). Moderate resistance was observed against cefepime (46.7%) and levofloxacin (41.8%). However, least number of isolates showed resistance against carbapenems (20.4%). P. aeruginosa isolates from three urinary tract infection patients with similar resistance patterns were also isolated from their blood cultures.Therefore the isolates were evaluated as sepsis factors.Conclusion: This study showed that most P. aeruginosa strains causing urinary tract infections gain rapidly increasing resistance to the majority of antibiotics used in the treatment.Keywords: Urinary tract infections, Pseudomonas aeruginosa, Antibiotic resistance rates, Urosepsis, Amaç: Dünya’da ve ülkemizde Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonları önemli bir problem haline gelmiştir. P. aeruginosa çoğunlukla nozokomiyal enfeksiyon etkeni olarak karşımıza çıkmaktadır. Üriner sistemin anatomik defektleri veya üriner sisteme girişimsel uygulamalar P. aeruginosa enfeksiyonu gelişme riskini artırmaktadır. Üriner sistemin enfeksiyonları aynı zamanda hayatı tehdit eden ürosepsis tablosunun gelişmesine neden olabilmektedir. Bu çalışmada hastanede yatan hastalardan idrar yolu enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen P. aeruginosa suşlarının yıllara göre değişen antibiyotik direnç profilleri incelenmiştir.Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya 2008-2012 yılları arasında hastanede yatmakta olan hastalardan idrar yolu enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen 103 P. aeruginosa dahil edilmiştir. Suşların identifikasyon ve antibiyogram çalışmaları konvansiyonel yöntemler ve otomatize sistemle (Phoenix, BD, USA) gerçekleştirilmiştir.Bulgular: Çalışmalar sonucunda en yüksek direnç oranı seftazidim (%85,4) ve piperesilin/tazobaktama (%86,6) karşı tespit edilmiştir. Az sayıda izolatta karbapenem direnci (%20,4) saptanmıştır. Sefepim (%46,7) ve levofloksasin (%41,8) için orta düzey direnç saptanmıştır. Ayrıca üç hastada idrar yolu enfeksiyonu etkeni olarak saptanan P. aeruginosa izolatına benzer direnç paternine sahip izolatlar hastaların kan kültüründen de izole edilmiştir. Bu izolatlar ürosepsis etkeni olarak değerlendirilmiştir.Sonuçlar: P.aeruginosa izolatla­rının etken olduğu idrar yolu enfeksiyonların tedavisinde kullanılabilecek antibiyotiklerin büyük çoğunluğuna karşı direnç gelişiminin hızla arttığı görülmüştür.Anahtar Kelimeler: İdrar yolu enfeksiyonları, Pseudomonas aeruginosa, antibiyotik direnci, ürosepsis.

Amaç: Flaviviredea ailesinden bir virus olan Hepatit C virusu(HCV) akut hepatitlerin %20’si, kronik hepatitlerin % 70’inden sorumludur. HCV’nin genotip tayini tedavide ve klinik sürecin takibinde önemlidir. Çalışmamızda Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji laboratuarına kan örnekleri gönderilen 34 HCV RNA pozitif hastada genotip dağılımının saptanması amaçlanmıştır. Yöntem: Örneklerin genotiplendirilmesinde Geno Sen’s HCV Genotyping 1/2/3/4 Real Time PCR Reagents Kiti (Corbett Research, Australia) kullanılmıştır. Hastaların viral yükleri 34x103 ile 17x106 arasında bulunmuş olup viral yük ortalamaları ise 46x105 olarak saptanmıştır. Çalışılan 34 örnekten 31’i genotip 1, 3’ü genotip 4 olarak bulunmuştur. Sonuç: Sonuç olarak klinik sürecin takibi ve antiviral tedavi seçiminde genotip tayinin yol gösterici olması sebebiyle bu tip çalışmaların önemli olduğu düşünülmektedir

Amaç: Tüm dünyada yaygın bir zoonoza yol açan Toxoplasma gondii, çeşitli ülkelerde ve Türkiye’nin çeşitli bölgelerinde farklı oranlarda seropozitiviteye sahiptir. Bu çalışma ile Afyon yöresinde Toxoplasma’ya özgül antikorların yaygınlığını araştırmak amaçlanmıştır. Yöntem: Bir yıllık sürede ELISA yöntemi ile saptanmış Toxoplasma IgG ve IgM sonuçları değerlendirilmiştir. Bulgular: Toxoplasmosis şüpheli 305 hastanın 87’sinde (%28.52) IgG seropozitifliği, 2’sinde (%0.65) IgM seropozitifliği saptanmıştır. Sonuç: Sonuç olarak, Toxoplasma seroprevalansı birçok bölge ile uyumlu bulunmuştur, ancak daha sağlıklı sonuçlar için bölgede daha geniş epidemiyolojik çalışmaların yapılması gerekmektedir. Halk toxoplasmosis yönünden bilinçlendirilmeli ve bölgede bu enfeksiyonun epidemiyolojik özellikleri araştırılmalıdır

Pseudomonas aureginosa doğada çok yaygın olarak bulunur ve organik materyalin yeniden düzenlenmesinde, önemli rol oynar. Çoğu türler bitki ve hayvanlar için patojendir. P.aeruginosa fırsatçı patojen enfeksiyonlara neden olmaktadır. Sağlıklı kişilerde nadiren hastalığa sebep olur. Sağlıklı bireylerde perine, dış kulak yolu, aksilla, alt gastrointestinal sistem gibi nemli alanlarda kolonize olabilir. Mekanik ventilasyon altındaki erişkinler veya nötropenik hastalar, özellikle geniş spektrumlu antibiyotik tedavisi sırasında veya sonrasında P.aeruginosa?ya bağlı ventilatör kaynaklı veya diğer pnömoniler açısından büyük risk altındadırlar.Bu çalışmada, Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi hastanesinde yatmakta olan hastalardan izole edilen P.aeruginosa suşlarının antibiyotik duyarlılıklarının tespit edilmesi, PER, GES, KPC, VIM, IMP ve OXA gibi direnç enzimlerinin fenotipik ve genotipik olarak saptanması amaçlanmıştır. Çalışmaya alınan 195 P.aeruginosa örneğinin antibiyotik direnç oranları seftazidime %100, gentamisine %11,8, tobramisine %6,2, piperasilin %44,1, amikasine %8,7, aztroenama %60,5, sefepime %50,2, siprofloksasine %26,2, levofloksasine %31,3, imipeneme %48,2, meropeneme %47,2, tazobaktam-piperasiline %90,8 ve ofloksasine %47,2 şekilnde tespit edilmiştir. Çift disk indüksiyon yöntemi ile 195 suştan 174?inde indüklenebilir beta laktamaz tespit edilmiştir. Çift disk sinerji yöntemi ile taranan 195 örneğin 60?ında GSBL pozitifliği saptanmıştır. 52 suşta MBL E test ile metallo beta laktamaz enzimi fenotipik olarak tespit edilmiştir. Moleküler çalışmalar ve dizi analizlari sonucunda 5 izolatta OXA-10, 4 izolatta OXA-14, 4 izolatta VIM-2, 2 izolatta IMP-1, 26 izolotta GES-1 ve 87 izolatta ABC transporter permease geni saptanmıştır. PER ve KPC enzimlerine rastlanmamıştır. Antibiyotik direnci tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de ciddi bir sağlık sorunudur. Bu nedenle antibiyotik direnç mekanizmaları bilinmeli ve direnç gelişimi önlenmelidir. Beta laktamazların ve bu beta laktamazları kodlayan genleri taşıyan kökenlerin saptanması enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde kullanılacak antibiyotiklerin seçiminde, tedavinin takibinde, enfeksiyon hastalıklarının önlenmesinde ve enfeksiyon kontrol programlarının geliştirilmesinde yol gösterici olacaktır. Pseudomonas are widely distributed in nature and plays an important role in the regulation of organic material. Most species are pathogenic for plants and animals. P. aeruginosa causes opportunistic infection and rarely causes disease in healthy people. It may be colonized in healthy individuals with the perineum, the external auditory canal, axilla, sub-humid areas, such as the gastrointestinal tract. Neutropenic patients or adults under mechanical ventilation are at greater risk, especially, during or after treatment with broad spectrum antibiotics, P. aeruginosa due to ventilator associated pneumonia.In this study, we aimed to submit antibiotic susceptibilities of P. aeruginosa strains and was to determine phenotypic and genotypic resistance enzymes such as PER, GES, KPC, VIM, IMP and OXA in hospitalized patients at Afyon Kocatepe University School of Medicine.Antibiotic resistance rates in the study with 195 samples of P. aeruginosa ceftazidime 100%, gentamicin 11.8%, tobramicin 6.2%, piperacilin 44.1%, amikacin 8.7%, aztroenam 60.5%, cefepime 50.2%, ciprofloxacin 26.2%, levofloxacin 31.3%, imipenem 48.2%, meropenem 47.2%, tazobactam piperacillin 90.8% ve ofloxacin 47.2%. Inducible beta lactamase studied with double disk induction method and 174 strains were pozitive. 60 of 195 samples were positive for ESBL scanned by double-disk synergy test. Metallo beta lactamase enzymes were determinated by phenotypically MBL E test in 52 strains. OXA-10, OXA-14, VIM-2, IMP-1, GES-1 and ABC transporter permease gene were detected 5, 4, 4, 2, 26 and 87 samples respectively, by molecular methods and sequencing.Antibiotic resistance is a serious public health problem in our country, as well as all over the world. Therefore, the antibiotic resistance mechanisms should be known and prevent the development of resistance. Strains carrying genes encoding beta lactamases and detection of beta lactamases leads the selection of antibiotics used in the treatment of infectious diseases, treatment follow-up, the prevention of infectious diseases and the development of infection control programme. 86

Amaç: Tüm dünyada yaygın bir zoonoza yol açan Toxoplasma gondii, çeşitli ülkelerde ve Türkiye’nin çeşitli bölgelerinde farklı oranlarda seropozitiviteye sahiptir. Bu çalışma ile Afyon yöresinde Toxoplasma’ya özgül antikorların yaygınlığını araştırmak amaçlanmıştır. Yöntem: Bir yıllık sürede ELISA yöntemi ile saptanmış Toxoplasma IgG ve IgM sonuçları değerlendirilmiştir. Bulgular: Toxoplasmosis şüpheli 305 hastanın 87’sinde (%28.52) IgG seropozitifliği, 2’sinde (%0.65) IgM seropozitifliği saptanmıştır. Sonuç: Sonuç olarak, Toxoplasma seroprevalansı birçok bölge ile uyumlu bulunmuştur, ancak daha sağlıklı sonuçlar için bölgede daha geniş epidemiyolojik çalışmaların yapılması gerekmektedir. Halk toxoplasmosis yönünden bilinçlendirilmeli ve bölgede bu enfeksiyonun epidemiyolojik özellikleri araştırılmalıdır. Objective: Toxoplasma gondii, causing a worldwide zoonosis, shows different seropositivity rates in different countries, even in different regions of the same country. It was aimed to determine the prevalence of Toxoplasma antibodies in Afyon. Method: Toxoplasma IgG and IgM antibodies were evaluated by ELISA in serum of suspected patients collected for one year period. Results: Of the 305 patients 87 (28.52%) were Toxoplasma IgG seropositive and 2 (0.65%) Toxoplasma IgM seropositive. Conclusion: This study suggests that people should be warned and informed about toxoplasmosis. In addition, further studies should be performed to elucidate epidemiology of mentioned toxoplasmosis in this region.

Petrol tüketiminin önemli bir bölümü ulaşımda ve tarımda olmaktadır. Ülkemizdeki petrol üretimi sıfıra yakın olduğundan ihtiyaca cevap verememektedir. Ulaşımda ve tarımda kullanılan taşıtlarda tüketilen petrol kökenli yakıtlar yerine geçebilecek alternatif yakıtların bulunması, bilimsel ve ekonomik açıdan önemli olacaktır. Olası bir petrol krizinde, özellikle ekim ve hasat gibi mevsime bağlı olması gereken tarımsal aktivitenin aksamaması ve petrol açığımızın bir miktar azaltılması için dizel taşıtlarda kullanılan motorine alternatif bir yakıtın belirlenmesi çok önemlidir. Bu çalışmada, yeni nesil yakıt enjeksiyon sistemine sahip (common-rail) bir dizel taşıtında alternatif yakıt olarak ham pamuk yağı ve pamuk yağı metil esteri kullanılarak taşıt performansı üzerine etkisi deneysel olarak incelenecektir. Pamuk yağı metil esteri ile eurodizel % 2, 5, 10, 20 ve 100 olmak üzere farklı oranlarda karıştırılarak taşıt performansı üzerine etkileri araştırılacaktır. Taşıt performansını belirmek amacıyla taşıtı farklı vites durumlarında ve farklı devirlerde çalıştırılarak tekerlek gücü ve yakıt tüketimi ölçülerek tekerlek tahrik kuvveti hesaplanacaktır. Deneylerden önce taşıt, referans dizel yakıt ile test edilmiş ve elde edilen sonuçlar taşıtın alternatif yakıt deneylerinde referans oluşturmuştur. Her yakıt karışımı ile yapılan deneylerden elde edilen sonuçlar referans karakteristiklerle karşılaştırılmış ve sonuçlar grafiklerle sunulmuştur., A considerable amount of oil consumption is made in transportation and agriculture. Since oil production in our country is very near to zero, it cannot live up to the requirements. It will be scientifically and economically significant that alternative fuels be found in place of oil-based fuels consumed in vehicles used in transportation and agriculture. In a possible oil crisis, it is crucial that an alternative fuel instead of motorin used in diesel vehicles should be determined in order to reduce the oil deficiency to some extent and not to cease especially agricultural activities such as cultivation and harvest depending on the season. In this study, the effect of using new generation fuel injection system (common-rail) in a diesel vehicle as an alternative fuel by using crude cotton oil and cotton oil methyl ester on the performance of vehicle will be experimentally examined. By mixing cotton oil methyl ester and euro diesel in diverse proportions such as % 2, 5, 10, 20 and 100, the effects of this on the performance of vehicle will be searched. In order to establish the performance of vehicle, by running the vehicle in different clutch types and various rotations, Wheel moving power will be accounted through measuring Wheel power and fuel consumption. Before the experiments, the vehicle has been tested by a reference diesel fuel and the results obtained have been a reference for the alternative experiments of the vehicle. Each fuel mixture and the results obtained from the experiments have been compared with reference characteristics and the results have been presented in the graphics.

Amaç: Flaviviredea ailesinden bir virus olan Hepatit C virusu(HCV) akut hepatitlerin %20’si, kronik hepatitlerin % 70’inden sorumludur. HCV’nin genotip tayini tedavide ve klinik sürecin takibinde önemlidir. Çalışmamızda Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji laboratuarına kan örnekleri gönderilen 34 HCV RNA pozitif hastada genotip dağılımının saptanması amaçlanmıştır. Yöntem: Örneklerin genotiplendirilmesinde Geno Sen’s HCV Genotyping 1/2/3/4 Real Time PCR Reagents Kiti (Corbett Research, Australia) kullanılmıştır. Hastaların viral yükleri 34x103 ile 17x106 arasında bulunmuş olup viral yük ortalamaları ise 46x105 olarak saptanmıştır. Çalı- şılan 34 örnekten 31’i genotip 1, 3’ü genotip 4 olarak bulunmuştur. Sonuç: Sonuç olarak klinik sürecin takibi ve antiviral tedavi seçiminde genotip tayinin yol gösterici olması sebebiyle bu tip çalışmaların önemli olduğu düşünülmektedir. Objective: Hepatit C virus (HCV), which is a virus from the family Flaviviredea, is responsible for 20% of acute hepatitis and 70% of chronic hepatitis. Determination of HCV genotype is important in the treatment and the clinical follow-up process. In this study, we aimed to determine the genotype distribution of 34 HCV RNA positive patients whose sera were sent to Afyon Kocatepe University, Faculty of Medicine Microbiology laboratory. Method: Geno Sen’s HCV Genotyping 1/2/3/4 Real Time PCR Reagents Kit (Corbett Research, Australia) was used for genotype determination of those samples. Patients’ viral loads were found between 34x103-17x106 and mean viral load was 46x105. Thirty one samples, out of 34, were found genotype 1 while the other 3 samples were found genotype 4. Results: Consequently, this type of studies are considered to be crucial since genotype determination has a guiding role in clinical follow-up process and the selection of antiviral therapy.