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Introducción. La histoplasmosis localizada del sistema nervioso en una forma rara de presentación de esta micosis sistémica. Se puede manifestar clínicamente como una meningitis crónica, lesiones focales encefálicas o de la médula espinal, ataques cerebrovasculares y encefalitis. Caso clínico. Se presenta el caso de un niño inmunocompentente con histoplasmosis localizada del sistema nervioso central. Su cuadro clínico neurológico fue de evolución crónica y presentó varios déficits neurológicos focales. Las imágenes diagnósticas evidenciaron múltiples masas del tallo cerebral y de la médula espinal cervical. Las pruebas inmunológicas demostraron anticuerpos anti Histoplasma. El paciente mejoró con el tratamiento secuencial de anfotericina B y fluconazol. Conclusiones. A pesar de su rareza, la histoplasmosis del sistema nervioso debe estar en el diagnóstico diferencial de las masas múltiples del encéfalo y médula espinal en un paciente residente en área endémica, las pruebas inmunológicas son útiles como herramienta diagnóstica y el tratamiento antimicótico puede llevar a la curación.

This descriptive case study examined the development of a college outreach summer camp at a university in Texas. The camp aims to diminish the college knowledge and access divide that exists between first generation college-going, lower-income, and underrepresented students and their counterparts in the region in which the university is located. Drawing on one year of survey data, interviews with program personnel, program documents, and newspaper articles about the camp, this study highlights some of the camp’s early successes, as well as growing pains of starting such an effort to serve community needs.

Objetivo. Medir a través del análisis bibliométrico la productividad, la visibilidad y el impacto del Sistema Regional de Vacunas (SIREVA, un proyecto de la Organización Panamericana de la Salud) en sus dos componentes, la vigilancia por laboratorio y el desarrollo de vacunas. Métodos. Se recuperaron de Scopus las publicaciones correspondientes a vigilancia por laboratorio y desarrollo de vacunas con sus referencias y citas y se aplicó la herramienta para obtener los indicadores bibliométricos. Se utilizó VOSviewer® 1.6.13 para visualizar las redes de coautoría por país y autores, y para realizar un análisis de coocurrencia de términos incluidos en los títulos y resúmenes de las publicaciones. Resultados. Cumplieron los criterios establecidos para vigilancia por laboratorio y desarrollo de vacunas 173 y 128 publicaciones, respectivamente. Diez países de la Región fueron responsables de 90,8% de las publicaciones sobre vigilancia por laboratorio y 8 países de todas las publicaciones sobre desarrollo de vacunas. Las diez publicaciones más citadas sobre vigilancia por laboratorio y sobre desarrollo de vacunas estaban incluidas en 855 y 503 artículos, respectivamente; los principales autores se encontraban en Alemania, Australia, Bélgica, Brasil, China, Estados Unidos de América y el Reino Unido. La construcción y visualización de redes por coautorías de autores y países, y la coocurrencia de términos mostraron el trabajo en red y la colaboración intrarregional, así como permitieron hacer seguimiento a las diversas áreas de estudio y su evolución en el tiempo. Conclusiones. El análisis bibliométrico permitió documentar de manera objetiva la productividad y visibilidad del Sistema Regional de Vacunas para Streptococcus pneumoniae en la Región.

Se presenta un estudio interdisciplinario en la localidad arqueológica de Mishma y su entorno (bolsón de Fiambalá), enfocado en tratar de entender las variaciones ambientales durante el Holoceno tardío. Los objetivos son presentar los principales agentes formadores del paisaje físico y discutir el impacto que tuvo en las poblaciones productivas que habitaron esos espacios y su preservación en el tiempo. Se articula información de relevamientos en terreno, análisis de cartografía satelital e imágenes obtenidas por Drone, datos meteorológicos y el estudio de los depósitos. El análisis permite establecer que durante la ocupación prehispánica las condiciones ambientales eran distintas a las actuales en las cuales el agente eólico es uno de los principales modeladores del paisaje. El siglo XVI se interpreta como el periodo de cambio, previamente, la acción fluvial provocó la incisión del cauce principal del río Apocango relacionada con cambios en el nivel de base de la cuenca.

Abstract INTRODUCTION Cryptococcosis is the second most frequent cause of opportunistic infections in human immunodeficiency virus (HIV) patients in Colombia. We aimed to determine the prevalence of cryptococcosis in the Colombian department of Atlántico. METHODS An active search for cryptococcosis cases was conducted between 2015 and 2017 in health institutions by distributing surveys to clinicians and characterizing samples phenotypically and genotypically. RESULTS Thirty-eight cryptococcosis cases were identified (81.6% men, 76.3% HIV patients). The calculated annual prevalence was 5.08/1 million inhabitants. Cryptococcus neoformans var. grubii VNI was isolated in 34 cases. CONCLUSIONS These results provide the basis for passive surveillance of cryptococcosis.

Cryptococcosis, a potentially fatal mycosis, is caused by members of the Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes. In Latin America, cryptococcal meningitis is still an important health threat with a significant clinical burden. Analysis of publicly available molecular data from 5686 clinical, environmental, and veterinary cryptococcal isolates from member countries of the Latin American Cryptococcal Study Group showed that, as worldwide, C. neoformans molecular type VNI is the most common cause of cryptococcosis (76.01%) in HIV-infected people, followed by C. gattii molecular type VGII (12.37%), affecting mostly otherwise healthy hosts. These two molecular types also predominate in the environment (68.60% for VNI and 20.70% for VGII). Among the scarce number of veterinary cases, VGII is the predominant molecular type (73.68%). Multilocus sequence typing analysis showed that, in Latin America, the C. neoformans population is less diverse than the C. gattii population (D of 0.7104 vs. 0.9755). Analysis of antifungal susceptibility data showed the presence of non-wild-type VNI, VGI, VGII, and VGIII isolates in the region. Overall, the data presented herein summarize the progress that has been made towards the molecular epidemiology of cryptococcal isolates in Latin America, contributing to the characterization of the genetic diversity and antifungal susceptibility of these globally spreading pathogenic yeasts.

We used whole-genome sequence typing (WGST) to investigate an outbreak of Sarocladium kiliense bloodstream infections (BSI) associated with receipt of contaminated antinausea medication among oncology patients in Colombia and Chile during 2013–2014. Twenty-five outbreak isolates (18 from patients and 7 from medication vials) and 11 control isolates unrelated to this outbreak were subjected to WGST to elucidate a source of infection. All outbreak isolates were nearly indistinguishable (21,000 single-nucleotide polymorphisms were identified from unrelated control isolates, suggesting a point source for this outbreak. S. kiliense has been previously implicated in healthcare-related infections; however, the lack of available typing methods has precluded the ability to substantiate point sources. WGST for outbreak investigation caused by eukaryotic pathogens without reference genomes or existing genotyping methods enables accurate source identification to guide implementation of appropriate control and prevention measures.

Cryptococcosis is a life-threatening fungal infection caused by the encapsulated yeasts Cryptococcus neoformans and C. gattii, acquired from the environment. In Latin America, as occurring worldwide, C. neoformans causes more than 90% of the cases of cryptococcosis, affecting predominantly patients with HIV, while C. gattii generally affects otherwise healthy individuals. In this region, cryptococcal meningitis is the most common presentation, with amphotericin B and fluconazole being the antifungal drugs of choice. Avian droppings are the predominant environmental reservoir of C. neoformans, while C. gattii is associated with several arboreal species. Importantly, C. gattii has a high prevalence in Latin America and has been proposed to be the likely origin of some C. gattii populations in North America. Thus, in the recent years, significant progress has been made with the study of the basic biology and laboratory identification of cryptococcal strains, in understanding their ecology, population genetics, host-pathogen interactions, and the clinical epidemiology of this important mycosis in Latin America.

ABSTRACTINTRODUCTION:Cryptococcosis is an invasive disease acquired by inhalation of infectious propagules from the environment. Currently, compulsory notification of the spread of this disease is not required in Colombia. However, reporting of human immunodeficiency virus (HIV)/acquired immune deficiency syndrome cases to the National Surveillance System has suggested that there is a growing population at risk of contracting cryptococcosis. Few studies have described the occurrence of cryptococcosis in Colombia. Therefore, in this study, we examined the pathology of this disease in Atlántico, Colombia and determined the distributions of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in the environment.METHODS:Clinical samples/isolates were gathered from cases of cryptococcosis previously diagnosed at health institutions in Atlántico, and surveys were completed by clinicians. The environmental study considered 32 sampling points and three tree species, i.e., Quickstick ( Gliricidia sepium ), Almond ( Terminalia catappa ), and Pink trumpet ( Tabebuia rosea ). Environmental and clinical samples/isolates were analyzed for phenotypic and genotypic confirmation.RESULTS:From 1997-2014, 41 cases of cryptococcosis were reported. The mean patient age was 40.5 years (range: 18-63 years); 76% were men, and 78% were HIV positive. Isolation was possible in 38 cases ( C. neoformans , molecular type VNI in 37 cases and C. gattii , molecular type VGI in one case). In 2012-2014, 2,068 environmental samples were analyzed with a positivity of 0.4% ( C. neoformans , molecular type VNI) in Almond and Pink trumpet trees.CONCLUSIONS:Cryptococcus neoformans , molecular type VNI had a higher prevalence than C. gattii and was associated with human exposure and the pathogenesis of cryptococcosis in this geographical region.

ABSTRACT Cryptococcosis is a potentially lethal disease of humans/animals caused by Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii. Distinction between the two species is based on phenotypic and genotypic characteristics. Recently, it was proposed that C. neoformans be divided into two species and C. gattii into five species based on a phylogenetic analysis of 115 isolates. While this proposal adds to the knowledge about the genetic diversity and population structure of cryptococcosis agents, the published genotypes of 2,606 strains have already revealed more genetic diversity than is encompassed by seven species. Naming every clade as a separate species at this juncture will lead to continuing nomenclatural instability. In the absence of biological differences between clades and no consensus about how DNA sequence alone can delineate a species, we recommend using “Cryptococcus neoformans species complex” and “C. gattii species complex” as a practical intermediate step, rather than creating more species. This strategy recognizes genetic diversity without creating confusion.

Cryptococcosis is reported in adults and is often acquired immune deficiency syndrome (AIDS)-associated; however, its frequency in children is low. Based on the National Survey on Cryptococcosis conducted in Colombia, an epidemiological and clinical analysis was performed on cases of the disease observed in children less than 16 years old between 1993-2010. We found 41 affected children (2.6% prevalence) from the 1,578 surveys received. The country mean annual incidence rate was 0.017 cases/100,000 children under 16 years, while in Norte de Santander the incidence rate was 0.122 cases/100,000 (p < 0.0001). The average age of infected children was 8.4 and 58.5% were male. In 46.3% of cases, a risk factor was not identified, while 24.4% had AIDS. The most frequent clinical manifestations were headache (78.1%), fever (68.8%), nausea and vomiting (65.6%), confusion (50%) and meningeal signs (37.5%). Meningitis was the most frequent clinical presentation (87.8%). Amphotericin B was given to 93.5% of patients as an initial treatment. Positive microbiological identification was accomplished by India ink (94.7%), latex in cerebrospinal fluid (100%) and culture (89.5%). Out of 34 isolates studied, Cryptococcus neoformans var. grubii (VNI 85.3%, VNII 8.8%) was isolated in 94.1% of cases and Cryptococcus gattii (VGII) was isolated in 5.9% of cases. These data are complemented by a literature review, which overall suggests that cryptococcosis in children is an unusual event worldwide.

The emerging pathogen Cryptococcus gattii causes life-threatening disease in immunocompetent and immunocompromised hosts. Of the four major molecular types (VGI-VGIV), the molecular type VGIII has recently emerged as cause of disease in otherwise healthy individuals, prompting a need to investigate its population genetic structure to understand if there are potential genotype-dependent characteristics in its epidemiology, environmental niche(s), host range and clinical features of disease. Multilocus sequence typing (MLST) of 122 clinical, environmental and veterinary C. gattii VGIII isolates from Australia, Colombia, Guatemala, Mexico, New Zealand, Paraguay, USA and Venezuela, and whole genome sequencing (WGS) of 60 isolates representing all established MLST types identified four divergent sub-populations. The majority of the isolates belong to two main clades, corresponding either to serotype B or C, indicating an ongoing species evolution. Both major clades included clinical, environmental and veterinary isolates. The C. gattii VGIII population was genetically highly diverse, with minor differences between countries, isolation source, serotype and mating type. Little to no recombination was found between the two major groups, serotype B and C, at the whole and mitochondrial genome level. C. gattii VGIII is widespread in the Americas, with sporadic cases occurring elsewhere, WGS revealed Mexico and USA as a likely origin of the serotype B VGIII population and Colombia as a possible origin of the serotype C VGIII population. Serotype B isolates are more virulent than serotype C isolates in a murine model of infection, causing predominantly pulmonary cryptococcosis. No specific link between genotype and virulence was observed. Antifungal susceptibility testing against six antifungal drugs revealed that serotype B isolates are more susceptible to azoles than serotype C isolates, highlighting the importance of strain typing to guide effective treatment to improve the disease outcome.

Cryptococcus neoformans and C. gattii are pathogenic basidiomycetous yeasts and the commonest cause of fungal infection of the central nervous system. Cryptococci are typically haploid but several inter-species, inter-varietal and intra-varietal hybrids have been reported. It has a bipolar mating system with sexual reproduction occurring normally between two individuals with opposite mating types, α and a. This study set out to characterize hybrid isolates within the C. neoformans/C. gattii species complex: seven unisexual mating intra-varietal VNI/VNII (αAAα) and six novel inter-varietal VNII/VNIV (aADα). The URA5-RFLP pattern for VNII/VNIV (aADα) differs from the VNIII (αADa) hybrids. Analysis of the allelic patterns of selected genes for AD hybrids showed 79% or more heterozygosis for the studied loci except for CBS132 (VNIII), which showed 50% of heterozygosity. MALDI-TOF MS was applied to hybrids belonging to different sero/mating type allelic patterns. All hybrid isolates were identified as belonging to the same hybrid group with identification scores ranging between 2.101 to 2.634. All hybrids were virulent when tested in the Galleria mellonella (wax moth) model, except for VNII/VNIV (aADα) hybrids. VNI/VGII hybrids were the most virulent hybrids. Hybrids recovered from larvae manifested a significant increase in capsule and total cell size and produced a low proportion (5-10%) of giant cells compared with the haploid control strains. All strains expressed the major virulence factors-capsule, melanin and phospholipase B-and grew well at 37°C. The minimal inhibitory concentration of nine drugs was measured by micro-broth dilution and compared with published data on haploid strains. MICs were similar amongst hybrids and haploid parental strains. This is the first study reporting natural same sex αAAα intra-varietal VNI/VNII hybrids and aADα inter-varietal VNII/VNIV hybrids.

Introducción. Desde 1997 se viene realizando un programa nacional de vigilancia sobre la criptococosisen Colombia. Se presentan los resultados correspondientes a los pacientes diagnosticados entre el2006 y el 2010. Objetivo. Analizar los datos obtenidos durante este periodo. Materiales y métodos. Análisis retrospectivo de las encuestas. Resultados. Durante los cinco años mencionados se recibieron 526 encuestas representativas del72 % de la división política colombiana. La mayoría de pacientes (76,6 %) eran hombres y 74,9 %estaban entre los 21 y los 50 años. El factor de riesgo prevalente fue la infección por VIH (83,5 %), y lacriptococosis definió el sida en 23 % de los casos. La incidencia anual promedio en la población generalfue de 2,4 por un millón de habitantes mientras que, en pacientes con sida, aumentó a 3,3 por 1.000.En 474 encuestas se informaron manifestaciones clínicas; las más frecuentes fueron: cefalea (84,5%), fiebre (63,4 %), náuseas y vómito (57,5 %), alteraciones mentales (46,3 %), signos meníngeos(33 %), tos (26,4 %) y alteraciones visuales (24,5 %). La neurocriptococosis se reportó en 81,8 % delos casos. El diagnóstico se hizo por examen directo, cultivo y antigenemia en 29,3 % de los casos.De 413 aislamientos recuperados, 95,6 % fueron C. neoformans var. grubii, 1 % C. neoformans var.neoformans, y 3,4 % C. gattii. En 71,6 % de los casos para el tratamiento se administró anfotericina By en 28 % se combinó con fluconazol. Conclusiones. La vigilancia pasiva continúa siendo un marcador centinela para la infección por VIH, yconstituye una aproximación sistemática al estudio de infecciones oportunistas en pacientes con sida,debido a que la criptococosis no es de notificación obligatoria en Colombia. doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v32i3.707

Introducción. Streptococcus pneumoniae es un agente comúnmente implicado en enfermedad invasora. Los macrólidos constituyen un tratamiento alternativo para las infecciones por S. pneumoniae resistente a los β-lactámicos. Sin embargo, la resistencia a macrólidos se ha incrementado a nivel mundial. Objetivo. Determinar la frecuencia de la resistencia a la eritromicina de S. pneumoniae en 15 años de vigilancia y caracterizar fenotípica y genotípicamente los aislamientos resistentes. Materiales y métodos. Se analizaron los datos demográficos de los pacientes, la sensibilidad antimicrobiana y los serotipos de los aislamientos resistentes a la eritromicina, recuperados entre 1994 y 2008. Se determinaron los fenotipos por la técnica del doble disco, y los genotipos, por PCR y PFGE. Todos los aislamientos se recuperaron de enfermedad invasiva y fueron proporcionados por los laboratorios nacionales de salud pública. Resultados. Se recuperaron 3.241 aislamientos invasores; 136 (4,2 %) presentaron resistencia a la eritromicina. La resistencia a la eritromicina se incrementó entre 1994-1996 y 2006-2008, de 2,4 % a 6,9 % en menores de 6 años y, de 3,3 % a 5,7 %, en adultos. Los serotipos más frecuentes fueron 6B (36,8 %), 14 (16,9 %) y 6A (17,6 %). El fenotipo constitutivo cMLSB se determinó en 87 aislamientos; 82 tenían el gen ermB. El fenotipo M se determinó en 46; 45 tenían el gen mefA, tres aislamientos expresaron fenotipo inducible (iMLSB) y un aislamiento presentaba el gen ermB. Por PFGE, se determinó que 50 aislamientos estaban relacionados con clones internacionales, de los cuales, 58 % eran España6B ST90, 26 % eran España9V ST156, 8 % eran Colombia23F-ST338 y 8 % eran España23F-ST81. Conclusiones. Se observó incremento en la resistencia a la eritromicina, relacionada principalmente con el mecanismo de metilación ribosómica y con el clon España6B-ST90 que ha circulado en Colombia desde 1994.

Introducción. La histoplasmosis está caracterizada por variadas manifestaciones que van desde la afección subclínica a la enfermedad diseminada, y suele presentarse tanto en huéspedes inmunocompetentes como inmunosuprimidos. Como la enfermedad no es de notificación obligatoria en Colombia, se diseñó una encuesta para recolectar información de los casos diagnosticados en el país. Objetivo. El objetivo de este trabajo fue analizar los datos recolectados desde 1992 hasta 2008. Materiales y métodos. La encuesta incluyó datos demográficos, factores de riesgo, manifestaciones clínicas, estudios de imágenes, métodos diagnósticos y tratamiento antifúngico. Los pacientes se agruparon de acuerdo con los factores de riesgo y se compararon los correspondientes hallazgos. Resultados. Se examinaron 434 encuestas provenientes de 20 de los departamentos colombianos. La mayoría (96,1 %) correspondían a adultos, 77 % eran hombres con edad promedio de 38,4 años, y sólo 3,9 % eran niños o adolescentes. En los adultos, 70,5 % tenían sida y 7 % presentaban otra inmunosupresión. Las manifestaciones predominantes fueron fiebre (76,1 %), tos (54,8 %) y síntomas constitucionales (56,8 %). En las radiografías, las anormalidades fueron principalmente infiltrados (65,9 %) y nódulos (17,1 %). El diagnóstico se estableció por observación microscópica de H. capsulatum en 49,6 % casos, por cultivo en 58 % y por pruebas serológicas en 14,6 %. El tratamiento se informó sólo en 52,5 % casos. Conclusiones. Se demostró que la histoplasmosis es frecuente en Colombia, especialmente en grupos de riesgo como son los pacientes infectados con el VIH. El análisis de este número relevante de pacientes permitió establecer comparaciones válidas sobre aspectos de la histoplasmosis en nuestro país.

Cryptococcosis is a potentially fatal opportunistic mycosis that affects the lungs and central nervous system. It has been suggested that certain strains of C. neoformans/C. gattii may have the potential to be more virulent according to the molecular type. This study aims to investigate the association between virulence in the G. mellonella model and genotypic diversity of Colombian clinical and environmental isolates of C. neoformans/C. gattii. A total of 33 clinical and 12 environmental isolates were selected according to their geographical origin and sequence types (STs). Pathogenicity was determined using the G. mellonella model, and the cell and capsular size before and after inoculation was determined. For C. neoformans, virulence in G. mellonella revealed that death occurred on average on day 6 (p < 0.05) and that ST5C, 6C, 25C and 71C were the most virulent. In C. gattii, death occurred at 7.3 days (p < 0.05), and ST47C, 58C, 75A and 106C were the most virulent. Capsular size increased for both species after passage in G. mellonella. In conclusion, the pathogenicity of Cryptococcus strains in the G. mellonella invertebrate model is independent of molecular type or pathogenicity factor, even within the same ST, but it is possible to find variable degrees of pathogenicity.

The passive and voluntary surveillance of cryptococcosis in Colombia since 1997 has seen an increasing participating rate, revealing its importance to both in immunosuppressed and immunocompetent people. The present work details the national data gathered in 1997–2016, through a retrospective analysis of the information collected in the survey. From a total of 1974 cases reported, an overall incidence of 0.23 cases per 100,000 people was found. This incidence rose to 1.1 cases per 1000 people in the Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS) population. Cryptococcosis was most common in male young adults (26–40 years), with a male:female ratio of 3.9:1 in the general population and 5.4:1 in Human Immunodeficiency Virus (HIV) patients. Culture was the most common form of diagnosis in 96.3% of cases, recovering C. neoformans species in 87.5% and C. gattii in 3.1% of samples. VNI was the most prevalent (96.1%) molecular type, while VGII predominated in C. gattii isolates (54.3%). Early mortality was reported as the outcome in 47.5% of patients. Cryptococcosis remains an important opportunistic disease in Colombia and is gaining status as a primary pathogen in apparently immunocompetent patients. Our findings show the importance of including cryptococcosis as a notifiable disease, which will allow for improving opportune diagnosis and treatment, resulting in better patient outcomes.

Introducción. Las fluoroquinolonas son antibióticos de amplio espectro comúnmente utilizados en el manejo de infecciones. Objetivo. Determinar los patrones de resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos colombianos de Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, estafilococos coagulasa negativa y enterococos de centros hospitalarios colombianos, recolectados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se realizó la determinación de concentraciones inhibitorias mínimas frente a ciprofloxacino, moxifloxacino y gatifloxacino a 270 aislamientos clínicos de S. pneumoniae, 348 de S. aureus, 176 de estafilococos coagulasa negativa y 123 de enterococos. Para los aislamientos de S. aureus resistentes a la meticilina se determinó la concentración inhibitoria mínima frente a levofloxacino y para aislamientos de S. pneumoniae se realizó la prueba de difusión en agar con discos de ofloxacino y levofloxacino. Resultados. Doscientos sesenta y nueve (99,6%) aislamientos de S. pneumoniae fueron susceptibles a gatifloxacino y moxifloxacino; para levofloxacino y ofloxacino la resistencia fue del 1,5% y 8,9%, respectivamente. El 15,9% de S. pneumoniae tuvo una concentración inhibitoria mínima ³ ³³ ³³4 µg/ml frente a ciprofloxacino. Las prevalencias de resistencia para ciprofloxacino, gatifloxacino y moxifloxacino en los 348 aislamientos de S. aureus fueron 55,4%, 54,9% y 52,6%, y en S. aureus resistentes a meticilina, fueron 92,3%, 91,3% y 87,5% y 91,8% para levofloxacino. En estafilococos coagulasa negativa y enterococos susceptibles a vancomicina se observaron tasas de resistencia entre 25,6% y 31,8%. Todos los aislamientos de enterococos resistente a vancomicina fueron resistentes a los compuestos evaluados. Conclusión. Los aislamientos colombianos de S. pneumoniae mantienen susceptibilidad a las fluoroquinolonas de última generación. La resistencia a fluoroquinolonas es alta en S. aureus, especialmente en aislamientos resistentes a la meticilina (cercana al 100%).

Introducción. Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae y Neisseria meningitidis son los principales patógenos humanos causantes de meningitis. Objetivo. Se evaluaron los iniciadores omp2, lytA y crgA en el desarrollo de una reacción en cadena de la polimerasa múltiple, para la identificación simultánea de los tres principales microorganismos responsables de la meningitis bacteriana. Materiales y métodos. Se evaluaron en un formato de PCR múltiple los iniciadores para la proteína de membrana externa (omp2, 1.000 pb) de H. influenzae, la autolisina A (LytA, 395 pb) de S. pneumoniae y el gen regulador de contacto A (cgrA, 230 pb) de N. meningitidis y se determinó la sensibilidad y la especificidad de la técnica. Resultados. Se obtuvieron resultados reproducibles con una concentración de 50 nM de cada uno de los tres iniciadores y una temperatura de anillamiento de 57°C obteniendo una sensibilidad de 12,5 fg para H. influenzae y S. pnemoniae y de 3,12 fg para N. meningitidis. No se presentaron reacciones cruzadas con otros microorganismos causantes de meningitis o relacionados con los géneros. Conclusión. Los resultados de sensibilidad y especificidad sugieren que los iniciadores evaluados pueden ser utilizados para el desarrollo de una PCR en formato múltiple que permita la identificación de los tres principales patógenos causantes de meningitis.

Introducción. En el complejo Cryptococcus neoformans se reconocen dos especies y cinco serotipos: C. neoformans (var. grubii, serotipo A; var. neoformans, serotipo D y un híbrido, serotipo AD) y C. gattii (serotipos B y C). La pareja sexual a y a es controlada por un solo locus, y la pareja sexual a es la más prevalente en los serotipos A y D, y es convencionalmente determinada mediante reacción en cadena de la polimerasa. Objetivo. Evaluar la habilidad de aislamientos colombianos de C. neoformans para aparearse in vitro con aislamientos control de la pareja sexual opuesta. Materiales y métodos. Treinta y tres aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii serotipo A, 4 de la var. neoformans serotipo D, todos pareja sexual a, y 16 aislamientos clínicos de C. gattii, 13 serotipo B (pareja sexual a) y 3 serotipo C (pareja sexual a ), se mezclaron, en agar jugo V8 modificado, con cepas control para determinar la pareja sexual in vitro. Resultados. Los estudios de apareamiento mostraron que 9 de 33 (27,3%) aislamientos serotipo A y 6 de 13 (46,2%) aislamientos serotipo B tuvieron la capacidad de aparearse con las cepas control. Todos los aislamientos del serotipo A que presentaron apareamiento eran pareja sexual a y los del serotipo B eran pareja sexual a. Microscópicamente se observaron conexiones en gancho, basidias y basidiosporas, estructuras que establecieron que se había realizado el proceso de apareamiento. Conclusión. Este acercamiento provee por primera vez la capacidad de que los aislamientos colombianos de C. neoformans se apareen in vitro con cepas control lo cual tiene importancia en el estudio de la diseminación del hongo.

Introducción. Con el fin de conocer la situación de la criptococosis en Colombia se ha llevado a cabo una encuesta nacional. El presente estudio analiza la información recogida de 1997 a 2005. Materiales y métodos. Se utilizó el formato de encuesta de la Confederación Europea de Micología Médica. Resultados. Se recibieron 931 encuestas de 76 centros. Se identificaron 891 (95,7%) casos de neurocriptococosis, 27 (2,9%) de formas pulmonares, cinco (0,5%) de lesiones cutáneas, dos (0,2%) de ganglionares, dos (0,2%) de úlceras orofaríngeas y un caso (0,1%) de cada una de las siguientes formas clínicas: peritonitis, lesión hepática, celulitis de los miembros inferiores e infección de las vías urinarias. El 82,7% fueron hombres con predominio de los adultos jóvenes. Sin embargo, se reportaron 25 (2,7%) niños. La infección por el virus de la inmunodeficiencia humana se encontró en el 78,1% de los casos. La incidencia promedio anual de criptococosis en la población general fue de 2,4 casos x106, pero en los pacientes con sida se elevó a 3,0 casos x 103. Las manifestaciones clínicas más frecuentes fueron: cefalea (85,2%), náuseas y vómito (59,1%), fiebre (59%), cambios mentales (46,2%) y signos meníngeos (33,4%). El examen directo de líquido cefalorraquídeo fue positivo en el 92,8% de los casos y el hongo se recuperó en el 90,3%. El antígeno capsular tuvo una positividad del 98,9% en el líquido cefalorraquídeo y del 93,7% en el suero. De 788 aislamientos remitidos, 95,9% fueron Cryptococcus neoformans var. grubii serotipo A, 0,3%, var. neoformans serotipo D, 3,3%, C. gattii serotipo B y 0,5%, C. gattii serotipo C. La mayoría de los pacientes fueron tratados inicialmente con anfotericina B. Conclusión: La criptococosis es una enfermedad cuya incidencia aumentó con la pandemia del VIH y constituye un marcador centinela de sida en Colombia.

Introducción. En Colombia, Salmonella Typhimurium es el segundo serotipo más frecuentemente aislado en muestras clínicas humanas después de S. Enteritidis, y representa el 28,2% (n = 468) de los 1.659 aislamientos recuperados en el programa de vigilancia por el laboratorio de enfermedad diarreica aguda liderado por el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud. Objetivo. Caracterizar molecularmente los aislamientos de S. Typhimurium que circulan en el país con el fin de establecer su perfil y determinar su relación genética. Materiales y métodos. En 468 aislamientos remitidos por 14 laboratorios de salud pública departamentales, recuperados entre enero de 1997 y diciembre de 2004, se determinó el perfil genómico por electroforesis de campo pulsado con la enzima de restricción XbaI según el protocolo de la Red PulseNet (CDC, Atlanta); el análisis de los geles se realizó con el programa Fingerprinting II. Resultados. Se obtuvieron 180 patrones electroforéticos. Los patrones prevalentes fueron COINJPX.X01.0062, encontrado en 101 aislamientos (21,3%), seguido por los patrones COINJPX.X01.0001 en 40 (8,4%), COINJPX.X01.0058 en 13 (3%), COINJPX.X01.0003 en 12 (2,5%), COINJPX.X01.0066 en 11 (2,3%) y COINJPX.X01.0108 en 6 (1,4%). COINJPX.X01.0001, fue el patrón predominante en Bogotá hasta 2002, reemplazado a nivel nacional por el COINJPX.X01.0062. El análisis de agrupamiento mostró tres grupos con similitudes genéticas entre 53% y 82%, lo que revela la heterogeneidad genética del serotipo. Conclusiones. El estudio permitió identificar patrones electroforéticos prevalentes, tener una base de datos nacional disponible para la comparación de los perfiles en tiempo real, detectar brotes y relacionar casos aparentemente aislados.

Introducción. Streptococcus pneumoniae es una las principales causas de morbilidad y mortalidad en niños y adultos en el mundo. Objetivo. Realizar un análisis de los datos de la vigilancia por el laboratorio de los aislamientos invasores de S. pneumoniae recuperados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se empleó la información de los aislamientos invasores de S. pneumoniae recibidos en el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud durante la vigilancia de meningitis bacteriana aguda e infección respiratoria aguda entre 1994 y 2004. Los aislamientos contaban con datos epidemiológicos, serotipo, patrones de susceptibilidad antimicrobiana y algunos con tipificación molecular. Resultados. Se analizaron los datos de 2.022 aislamientos procedentes de 120 hospitales de diferentes regiones del país, recuperados principalmente de hemocultivos (50,7%) y líquido cefalorraquídeo (42%). Los serotipos más importantes fueron el 14, 6B, 23F, 1, 5, 6A, 19F, 18C y 9V, los cuales corresponden al 83,6% en niños menores de 6 años, al 74,0% en el grupo de 6 a 14 años y al 61,4% en mayores de 14 años. El 29,8% de los aislamientos presentó susceptibilidad disminuida a la penicilina (SDP), 44,3% a trimetoprim-sulfametoxazol, 32,4% a tetraciclina, 8,2% a cloranfenicol, 3,8% a eritromicina; todos fueron sensibles a vancomicina y el 13% fue multirresistente. Se tipificaron 602 aislamientos con SDP, de los cuales 27 (4,5%) se relacionaron con el clon 1-España23F, 38 (6,3%) con el clon 2-España6B, 301 (50%) con el 3- España9V y 75 (12,5%) con el clon 26-Colombia23F, además, los 138 aislamientos con tipo capsular 5 se relacionaron con el clon 19-Colombia5. Conclusiones. Los resultados proporcionan información básica necesaria para el diseño e implementación de estrategias para la prevención de la enfermedad neumocócica en nuestro país.

Introducción. Streptococcus pneumoniae serotipo 5 es causa importante de enfermedad invasora en Colombia, donde se ha demostrado la circulación del clon 19-Colombia(5) susceptible a penicilina pero resistente a tetraciclina y a cloranfenicol. Objetivo. Establecer las relaciones genéticas de aislamientos invasores colombianos de S. pneumoniae serotipo 5 recuperados entre 1994 y 2004 con el clon 19-Colombia(5). Materiales y métodos. Se estudiaron 83 aislamientos que tenían datos de susceptibilidad a penicilina, vancomicina, ceftriaxona, eritromicina, trimetoprim sulfametoxazol, cloranfenicol y tetraciclina, de los cuales 29 fueron obtenidos de niños menores de cinco años. El patrón de restricción del ADN se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado, usando la enzima Sma I. La similitud genética entre los aislamientos y el clon se estableció según los criterios de Tenover y utilizando el programa Fingerprinting II. Resultados. Todos los aislamientos se relacionaron con el clon 19-Colombia5 y se agruparon en el patrón electroforético A con 17 subtipos. El patrón A se estableció en 32 aislamientos (38,6%), el A8 en 18 (21,7%) y el A5 en 10 (12%), los 15 patrones restantes agruparon los otros 23 aislamientos. Los 34 aislamientos resistentes a tetraciclina y cloranfenicol mostraron relación con los patrones electroforéticos A (n = 32), A16 (n = 1) y A28 (n = 1), caracterizados, al igual que el clon, por presentar una banda de 340 Kb. Conclusión. Estos resultados muestran la circulación continua en el país de aislamientos de S. pneumoniae serotipo 5 genéticamente relacionados con el clon 19-Colombia(5).

Introducción. Cryptococcus gattii serotipo B ha sido asociado con diferentes especies de árboles en regiones tropicales y subtropicales. Este serotipo es el segundo de mayor importancia clínica en Colombia, pero no se había recuperado del ambiente en ninguno de los estudios realizados por nuestro grupo. Objetivo. Para establecer la presencia y distribución de las especies del complejo C. neoformans, especialmente del serotipo B, y determinar algunas características fenotípicas relacionadas con la virulencia de los aislamientos recuperados, se diseñó un muestreo de material vegetal en un bosque de piso térmico frío del departamento de Cundinamarca. Materiales y métodos. Durante febrero y marzo de 2003 se realizaron 4 muestreos en el bosque y se tomaron 167 muestras de detritos de eucaliptos y 28 muestras de otras especies de árboles, las cuales se procesaron empleando el método convencional de extracción y siembra en medio selectivo. Se determinó el tamaño celular y capsular en los filtrados, el crecimiento a 37°C, la virulencia en un modelo animal y la pareja sexual por PCR. Resultados. Se aisló C. gattii serotipo B de 46 muestras de eucaliptos (27,5%). El tamaño celular en el extracto estuvo entre 3,10 y 4,15 ?m y el tamaño capsular entre 0,30 y 0,46 ?m. Los 46 aislamientos crecieron a 37°C, pero ninguno de los dos aislamientos empleados causó la muerte de los animales inoculados durante los 70 días de observación. Todos los aislamientos fueron pareja sexual a. Conclusiones. Este estudio es el primer informe sobre el aislamiento de C. gattii, serotipo B, pareja sexual a, en Colombia a partir de detritos de eucaliptos.

lntroducción. Cryptococcus neoformans es un hongo ubicuo que está relacionado con infecciones oportunistas en pacientes inmunocomprometidos, especialmente los pacientes infectados con el virus de la inmunodeficiencia humana. C. neoformans posee una cápsula que contiene principalmente glucuronoxilomanana que actúa como factor de virulencia y es considerado como antígeno timo independiente tipo-2. Objetivos. Determinar la cinética de producción de las subclases de lgG específicas para la glucuronoxilomanana, medir los anticuerpos de reactividad cruzada contra el polisacárido de Streptococcus pneumoniae y determinar las subpoblaciones esplénicas de linfocitos en tres modelos de criptococosis en ratones con diferentes susceptibilidades a la infección. Materiales y métodos. Los anticuerpos fueron detectados por la técnica inmunoenzimática ELlSA después de la infección con C. neoformans en ratones moderadamente resistentes (Balb/c), resistentes (CBA/j) y susceptibles (C57BL/6). Las subpoblaciones de linfocitos B se determinaron por citometría de flujo. Resultados. Se observó la producción temprana de anticuerpos lgG que coincidía con una disminución en el número de unidades formadoras de colonias de C. neoformans en pulmón. Los anticuerpos de reactividad cruzada se detectaron en las tres cepas de ratones después de la infección; fueron mayores en la cepa susceptible C57BL/6, la cual mostró el porcentaje más alto de linfocitos B, CD5+ en el bazo. En contraste, los ratones CBA/J presentaron los mayores niveles de linfocitos B, CD43+. Conclusiones. Estos hallazgos sugieren que los anticuerpos lgG específicos para la glucuronoxilomanana están implicados en la protección del hospedero contra la infección por C. neoformans y podrían estar regulados por células CD43+. También sugiere que los anticuerpos de reactividad cruzada no poseen un papel relevante en el control de la infección.

El incremento de aislamientos de Streptococcus pneumoniae resistentes a la penicilina se favorece por la presión selectiva del antibiótico y la dispersión clonal. Como parte del programa de vigilancia molecular, por medio del uso de la electroforesis en campo pulsado (PFGE), se determinaron las relaciones genéticas de 190 aislamientos invasores de S. pneumoniae con susceptibilidad disminuida a la penicilina recuperados de niños colombianos menores de 5 años durante los años 2000-2003. Se identificaron 42 diferentes patrones electroforéticos; cuatro patrones agruparon el 76% de los aislamientos, los cuales se encontraron relacionados con los clones internacionales 1-España23F, 2-España6B, 3-España9V y 26-Colombia23F. Nuestros resultados indican que la diseminación de S. pneumoniae resistente a la penicilina es el resultado de la dispersión de clones internacionales, especialmente, del clon 3-España9V.

El género Cryptococcus comprende, al menos, 38 especies, pero sólo 3 se han informado como patógenas para el hombre y los animales: Cryptococcus laurentii, Cryptococcus albidus y Cryptococcus neoformans; esta última es la más frecuente. La infección se adquiere por la inhalación de los propágulos infectantes del medio ambiente. Los estudios del hábitat se han realizado con técnicas de extracción con soluciones tampón y cultivos en medios selectivos. El objetivo del trabajo fue evaluar varias técnicas de extracción del ADN de Cryptococcus spp. a partir de muestras ambientales. Como controles se emplearon aislamientos de C. neoformans, C. albidus, C. laurentii y Paracoccidiodes brasiliensis. Se emplearon vermiculitas, suelos contaminados en el laboratorio con 10 a 106 blastoconidias/g y muestras naturalmente colonizadas con C. neoformans. El ADN se extrajo con métodos físicos, químicos y con un estuche comercial, y se purificó usando bloques de agarosa y columnas de sílica. Para la amplificación con PCR se emplearon los iniciadores CN4-CN5 específicos para C. neoformans. Sólo el estuche comercial permitió extraer y purificar el ADN de las muestras de suelos contaminados hasta una concentración de 10 blastoconidias/g de suelo y de una de las muestras naturalmente colonizadas. Con este trabajo se logró la extracción y amplificación de ADN de Cryptococcus spp. a partir de muestras ambientales lo cual constituye una herramienta importante para delimitar las áreas ecológicas de C. neoformans en nuestro país.

La criptococosis es causada por las tres variedades de Cryptococcus neoformans, las cuales presentan diferencias fisiológicas y de virulencia, algunas de las cuales se han estudiado para reconocer aspectos de su biología. Este trabajo evaluó las características fenotípicas de aislamientos ambientales de las variedades grubii y gattii, con el fin de establecer diferencias asociadas con el ciclo de vida y la virulencia. Se estudiaron 28 aislamientos serotipo A y 31 serotipo C. Se evaluaron la morfología macroscópica y microscópica de blastoconidias cultivadas en agar Sabouraud y suelos, el crecimiento a 37 °C, la producción de 22 enzimas extracelulares, la frecuencia del fenómeno de fructificación haploide, la pareja sexual, el patrón de sensibilidad a toxinas asesinas (killer) y la virulencia en ratones Balb/c. No se observaron diferencias entre las dos variedades en la morfología macroscópica, la microscópica, ni en el crecimiento a 37 °C (p>0,05); sin embargo, se observó disminución del tamaño celular y capsular de blastoconidias cultivadas en suelo comparado con el tamaño en Sabouraud (p

En 1998 se inició en Colombia la inmunización de niños menores de un año de edad con la vacuna conjugada contra Haemophilus influenzae, serotipo b. En el 2000, el programa de vigilancia del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud informó una disminución de 40% de los casos de meningitis por este microorganismo, la cual se atribuyó a la vacunación. En este programa de vigilancia se utiliza de rutina la técnica estandarizada de aglutinación en lámina para la tipificación capsular de H. influenzae. El objetivo de este trabajo fue establecer la concordancia entre la prueba de aglutinación en lámina y la técnica de PCR. Se estudiaron con ambas técnicas 146 aislamientos clínicos invasores de H. influenzae, obtenidos de niños menores de 5 años, recolectados a partir de 1999 hasta 2002, identificados y serotipificados por el laboratorio de referencia como parte de la vigilancia de la meningitis bacteriana aguda y la infección respiratoria aguda. Nuestros resultados mostraron una correlación de 93% en la tipificación capsular de H. influenzae, serotipo b, y de 92% con respecto al resto de serotipos. La técnica de aglutinación en lámina realizada con un estricto control de calidad continúa siendo una herramienta sensible y específica para la serotipificación de H. influenzae.

La enfermedad invasora causada por Haemophilus influenzae, serotipo b, ha sido una de las mayores causas de morbilidad y mortalidad en la población infantil; afortunadamente, en algunos países con amplia cobertura de la vacuna conjugada esta situación ha cambiado. En 1994 se inició en el Grupo de Microbiología un programa de vigilancia de la susceptibilidad antimicrobiana y de los serotipos de aislamientos invasores de H. influenzae, remitidos por los hospitales y Laboratorios de Salud Pública del país como componente de los programas de vigilancia en red de infección respiratoria aguda y meningitis bacteriana aguda. El objetivo de este trabajo fue determinar la evolución de los serotipos y los patrones de susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos invasores de H. influenzae obtenidos de 1994 al 2002 y realizar un nuevo análisis sobre el impacto de la vacuna conjugada de H. influenzae, serotipo b, en Colombia. De 1994 a 2002 se han estudiado 683 aislamientos; 379 (55,5%) de pacientes del género masculino; 370 (54,2%) de menores de 1 año; 227 (33,2%) de 1 a 5 años; 19 (2,8%) de 6 a 14 años; 38 (5,6%) de mayores de 14 años, y de 29 (4,2%) no se tenía el dato de la edad; 493 (72,2%) fueron recuperados de pacientes con meningitis, 181 (26,5%) de neumonía y 9 (0,9%) de otras enfermedades. El 85,1% de los aislamientos fueron H. influenzae, serotipo b, 12,9% no capsulares y 2,0% de otros serotipos (10 a, 1 d, 1 e y 2 f). Del total de aislamientos, 12% fueron productores de beta-lactamasa; 13,9%, resistentes a ampicilina; 12,7%, a trimetoprim sulfametoxazol (SXT); 5,4%, a cloranfenicol, y 1% a cefuroxima; todos fueron sensibles a ceftriaxona. Durante este período se observó un incremento en la resistencia de los aislamientos a SXT (5% al 13%), pero la diferencia no fue estadísticamente significativa (p=0,1). Con la vigilancia se pudo determinar una disminución significativa de los casos de meningitis en los menores de 1 año y en el grupo de 1 a 5 años; antes de la introducción de la vacuna de Hib, se recibía un promedio anual de 43 y 23 aislamientos de cada uno de estos grupos y en el 2002 se recibieron 10 y 6, respectivamente (p

La resistencia de Streptococcus pneumoniae a la penicilina está asociada con la dispersión de ciertos clones internacionales. En Colombia, se ha establecido en la población infantil la presencia y circulación de los clones 1-España23F, 2-España6B, 3-España9V y 25-Colombia23F. El objetivo de este trabajo fue evaluar las relaciones clonales entre 80 aislamientos invasores de S. pneumoniae con susceptibilidad disminuida a la penicilina recuperados de pacientes adultos. El análisis genotípico incluyó la electroforesis en campo pulsado (PFGE) del ADN cromosómico digerido con la enzima Sma I, la restricción de los genes de las proteínas de unión a la penicilina (PBP) 1a, 2b y 2x y la distribución de las familias de la proteína de superficie A (PspA) por dotblot y PCR. Los resultados mostraron que 2,5% de los aislamientos estaban genéticamente relacionados con el clon 1-España23F, 10% con el clon 2-España6B y 37,5% con el clon 3- España9V. Además, 14% de los aislamientos de tipo capsular 23F y con resistencia intermedia a la penicilina se relacionaron con el clon 25-Colombia23F. Estos datos evidencian la circulación de clones internacionales, así como de un clon colombiano en la población adulta y señalan su importancia en la prevalencia de la resistencia a la penicilina en nuestro medio.

A network was established to acquire basic knowledge of Cryptococcus neoformans in IberoAmerican countries. To this effect, 340 clinical, veterinary, and environmental isolates from Argentina, Brazil, Chile, Colombia, Mexico, Peru, Venezuela, Guatemala, and Spain were typed by using M13 polymerase chain reaction-fingerprinting and orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5) gene restriction fragment length polymorphsm analysis with HhaI and Sau96I in a double digest. Both techniques grouped all isolates into eight previously established molecular types. The majority of the isolates, 68.2% (n=232), were VNI (var. grubii, serotype A), which accords with the fact that this variety causes most human cryptococcal infections worldwide. A smaller proportion, 5.6% (n=19), were VNII (var. grubii, serotype A); 4.1% (n=14), VNIII (AD hybrid), with 9 isolates having a polymorphism in the URA5 gene; 1.8% (n=6), VNIV (var. neoformans, serotype D); 3.5% (n=12), VGI; 6.2% (n=21), VGII; 9.1% (n=31), VGIII, and 1.5% (n=5) VGIV, with all four VG types containing var. gattii serotypes B and C isolates.

En 1997, nuestro laboratorio informó por primera vez el aislamiento de Cryptococcus neoformans var. gattii serotipo C asociado con detritus del árbol de almendro, Terminalia catappa. Este hallazgo ha llevado a realizar un seguimiento más detallado de la asociación plantahongo. Datos preliminares habían revelado que la supervivencia del hongo en plántulas de almendro ocurría hasta por 100 días. El propósito de este estudio fue establecer si bajo las mismas condiciones, C. neoformans var. gattii podría permanecer viable por un mayor período de tiempo. Se emplearon 83 plántulas de almendro, de 20 a 40 cm de altura, inoculados con C. neoformans var. gattii, serotipo C (INS-755). Se realizaron ensayos inoculando el tallo o el suelo en el que serían sembradas las plántulas. Las observaciones se realizaron por un período de hasta 12 meses. Como técnicas de procesamiento del material vegetal se emplearon las técnicas de hongos endófitos (tallos), maceración (raíz, hojas) y el estándar de suspensión (suelos). Adicionalmente, el hongo fue visualizado microscópicamente en el tejido vegetal con el empleo de azul de tripán y lactofenol. Se observó que C. neoformans var. gattii permanecía viable en la planta hasta por 12 meses posinoculación y que podía migrar desde el suelo hacía el tallo y viceversa, sin causar alteraciones macroscópicas ni microscópicas en la planta. Lo anterior sugiere una posible asociación ambiental entre el hospedero T. catappa y C. neoformans var. gattii.

La shigelosis es una enfermedad diarreica aguda (EDA) que causa alta morbimortalidad en países en vías de desarrollo. En 1997, el Grupo de Microbiología inició un programa en red con los Laboratorios de Salud Pública (LSP) del país para la vigilancia de los principales patógenos causantes de la EDA. Como actividad de este programa, en mayo de 2001, el LSP de Cundinamarca estudió e informó un brote de intoxicación alimentaria en una comunidad escolar en Madrid. El objetivo de este estudio fue caracterizar con técnicas fenotípicas y genotípicas los aislamientos recuperados en el brote, con el fin de establecer la relación clonal entre ellos. Se realizaron coprocultivos en 22 de 195 individuos afectados; los aislamientos se identificaron bioquímica y serológicamente y se determinó el patrón de susceptibilidad antimicrobiana a cloranfenicol, trimetoprim-sulfametoxasol (SXT), tetraciclina, cefotaxima, gentamicina, ampicilina y ciprofloxacina. Se realizó electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE) según la metodología descrita por los Centers for Disease Control and Prevention (CDC) de Atlanta, con el empleo de la enzima de restricción XbaI y se utilizó como cepa control Shigella sonnei CDC F2353 y como marcador de peso molecular el fago lambda. En 15 (68,2%) pacientes se identificó Shigella flexneri serotipo 6, biotipo Newcastle, con patrón de resistencia a cloranfenicol, SXT y tetraciclina. La PFGE reveló que 3 (20%) aislamientos fueron idénticos (distancia genética de 100%) y los 12 (80%) restantes estuvieron estrechamente relacionados (distancia genética de 86 a 100%). El sistema de vigilancia en red con los LSP permitió recuperar los aislamientos y los estudios fenotípicos y genotípicos permitieron establecer la relación clonal de los aislamientos involucrados en el brote.

ABSTRACT The emergence of distinct populations of Cryptococcus gattii in the temperate North American Pacific Northwest (PNW) was surprising, as this species was previously thought to be confined to tropical and semitropical regions. Beyond a new habitat niche, the dominant emergent population displayed increased virulence and caused primary pulmonary disease, as opposed to the predominantly neurologic disease seen previously elsewhere. Whole-genome sequencing was performed on 118 C. gattii isolates, including the PNW subtypes and the global diversity of molecular type VGII, to better ascertain the natural source and genomic adaptations leading to the emergence of infection in the PNW. Overall, the VGII population was highly diverse, demonstrating large numbers of mutational and recombinational events; however, the three dominant subtypes from the PNW were of low diversity and were completely clonal. Although strains of VGII were found on at least five continents, all genetic subpopulations were represented or were most closely related to strains from South America. The phylogenetic data are consistent with multiple dispersal events from South America to North America and elsewhere. Numerous gene content differences were identified between the emergent clones and other VGII lineages, including genes potentially related to habitat adaptation, virulence, and pathology. Evidence was also found for possible gene introgression from Cryptococcus neoformans var. grubii that is rarely seen in global C. gattii but that was present in all PNW populations. These findings provide greater understanding of C. gattii evolution in North America and support extensive evolution in, and dispersal from, South America. IMPORTANCE Cryptococcus gattii emerged in the temperate North American Pacific Northwest (PNW) in the late 1990s. Beyond a new environmental niche, these emergent populations displayed increased virulence and resulted in a different pattern of clinical disease. In particular, severe pulmonary infections predominated in contrast to presentation with neurologic disease as seen previously elsewhere. We employed population-level whole-genome sequencing and analysis to explore the genetic relationships and gene content of the PNW C. gattii populations. We provide evidence that the PNW strains originated from South America and identified numerous genes potentially related to habitat adaptation, virulence expression, and clinical presentation. Characterization of these genetic features may lead to improved diagnostics and therapies for such fungal infections. The data indicate that there were multiple recent introductions of C. gattii into the PNW. Public health vigilance is warranted for emergence in regions where C. gattii is not thought to be endemic.

Cryptococcosis due to Cryptococcus gattii is endemic in various parts of the world, affecting mostly immunocompetent patients. A national surveillance study of cryptococcosis, including demographical, clinical and microbiological data, has been ongoing since 1997 in Colombia, to provide insights into the epidemiology of this mycosis.From 1,209 surveys analyzed between 1997-2011, 45 cases caused by C. gattii were reported (prevalence 3.7%; annual incidence 0.07 cases/million inhabitants/year). Norte de Santander had the highest incidence (0.81 cases/million/year), representing 33.3% of all cases. The male: female ratio was 3.3∶1. Mean age at diagnosis was 41±16 years. No specific risk factors were identified in 91.1% of patients. HIV infection was reported in 6.7% of patients, autoimmune disease and steroids use in 2.2%. Clinical features included headache (80.5%), nausea/vomiting (56.1%) and neurological derangements (48.8%). Chest radiographs were taken in 21 (46.7%) cases, with abnormal findings in 7 (33.3%). Cranial CT scans were obtained in 15 (33.3%) cases, with abnormalities detected in 10 (66.7%). Treatment was well documented in 30 cases, with most receiving amphotericin B. Direct sample examination was positive in 97.7% cases. Antigen detection was positive for all CSF specimens and for 75% of serum samples. C. gattii was recovered from CSF (93.3%) and respiratory specimens (6.6%). Serotype was determined in 42 isolates; 36 isolates were serotype B (85.7%), while 6 were C (14.3%). The breakdowns of molecular types were VGII (55.6%), VGIII (31.1%) and VGI (13.3%). Among 44 strains, 16 MLST sequence types (ST) were identified, 11 of them newly reported.The results of this passive surveillance study demonstrate that cryptococcosis caused by C. gattii has a low prevalence in Colombia, with the exception of Norte de Santander. The predominance of molecular type VGII is of concern considering its association with high virulence and the potential to evolve into outbreaks.

Pneumococcal surface protein A (PspA) elicits protection in mice against fatal bacteremia and sepsis caused by genetically diverse pneumococci and protects against carriage and lung infection. We determined the PspA families of invasive isolates of Streptococcus pneumoniae recovered from Colombian children

Durante 1996-1997, se llevó a cabo en Cúcuta un estudio para determinar el hábitat de Cryptococcus neoforrnans var. gattii debido a que los casos clínicos ocasionados por esa variedad se presentan con alta frecuencia en dicha ciudad. A partir de 2 de 68 almendros (Terrninalia catappa) localizados y estudiados en la ciudad, se logró aislar C. neoformans var. gattii serotipo C. El objetivo del presente trabajo fue realizar un seguimiento de los dos almendros positivos, con el fin de evaluar el tiempo de permanencia del hongo en asocio con los detritos en diferentes épocas del año. Se tomaron muestras de los dos árboles durante 26 meses y de 9 almendros adicionales; las muestras se extrajeron con una solución tampón fosfato suplementada con antibióticos; el extracto se sembró en medios selectivos y se identificó la especie con base en la morfoloclía macro y microscópica y en pruebas bioauimicas. La determinación de la variedad y el sirotipo se realizó con el empleo de técnicas estandarizadas. Del total de 160 muestras de los dos almendros, 31 (1 9,3%) fueron positivas para C. neoformans var. gattiiserotipo Casi como una muestra de 1 de los 9 almendros adicionales. Estos hallazgos confirman que el almendro (Terrninalia catappa) puede tener algún papel como intermediaria para la var gattii y, además, que la variedad está presente en el área durante todo el año, ya que se logró recuperar en diferentes meses a lo largo de todo el estudio.

Con base en la información consignada en el herbario del Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional sobre la presencia de un Eucalyptus camaldulensis en un parque de Bogotá, se diseñó este estudio con el fin de establecer si existía alguna asociación entre los eucaliptos presentes en el parque y las especies de Cryptococcus. Se recolectaron mensualmente durante 2 años, muestras de madera de 19 Eucalyptus. Estas se extrajeron con una solución tampón fosfato con antibióticos y el extracto se sembró en medios selectivos. De las 426 muestras obtenidas, se recuperaron 17 aislamientos de especies de Cryptococcus: 14 C. laurentii. 2 C. neoformans var neoformans y 1 C. albidus. Se estableció la asociación del hongo con los eucaliptos; sin embargo, no se logró recuperar la variedad gattii.

Una enfermedad endémica es aquélla que se presenta constantemente en un área geográfica o en un grupo de población; la definición de endemia abarca, también, la prevalencia usual de una enfermedad en un área o grupo determinado. El objetivo de este estudio fue el establecer la endemicidad de la paracoccidioidomicosis en los 32 departamentos colombianos y asociarla con algunas de las caracteristicas geográficas correspondientes a estas áreas. Se realizó un estudio retrospectivo de 1949 a 1999, para el cual sirvieron como fuentes de información cuatro laboratorios de micología, dos servicios de patologia y, además, la literatura colombiana. Las principales variables consignadas fueron el año de diagnóstico y la procedencia de los pacientes. Se calcularon las tasas de incidencia por departamento con base en los censos de 1973, 1985, 1993 y en sus proyecciones para 1990 y 1995. La definición de áreas endémicas estuvo basada en la distribución de los casos por lugar y tiempo, usando como medidas estadísticas la media y los cuartiles. Estas medidas se aplicaron al total de casos diagnosticados por departamento y a su diagnóstico anual. Se analizaron 1.191 casos en un periodo de 50 años. Con base en el número total de casos diagnosticados por departamento, 9 de ellos se clasificaron como endémicos ya que informaron más de 32 casos por año; 8 correspondieron a la región andina y 1 a la Sierra Nevada de Santa Marta. Dieciocho departamentos se catalogaron como regiones de baja endemicidad (2-27 casos) y los 5 restantes, como no endémicos (1 caso). Entre 1980-1998 y con base en el diagnóstico anual de casos, se encontraron 8 departamentos que habían diagnosticado la enfermedad por periodos de 13 a 19 años, lo que permitió clasificarlos como endémicos; adicionalmente. 15 fueron considerados de baja endemicidad, con base en un período de diagnóstico de 2 a 12 años: los restantes 10 fueron clasificados como no endémicos por haber informado la entidad solamente en un 1 año. Ambos análisis coincidieron en catalogar 8 de los departamentos como endémicos. La incidencia nacional más alta se obtuvo en 1980 con 2,4 pacientes/1'000.000 habitantes. La tasa de incidencia de la enfermedad no constituyó un parámetro adecuado para la definición de endemicidad. Estos hallazgos corroboran que la distribución de la paracoccidioidomicosis en Colombia es heterogénea y, además. ofrecen una alternativa para determinar el hábitat del agente etiológico por medio de estudios de campo.

La Organización Mundial de la Salud (OMS) llegó a un consenso. en 1998, acerca de la metodologia general para el estudio de portadores de Streptococcus pneumoniae Esta metodología incluía un nuevo medio para el transporte y el almacenamiento de muestras nasofaringeas, compuesto portriptona, glucosa, glicerol y leche descremada, denominado STGG. Este medio fue evaluado oor nuestro laboratorio, en marzo de 1999. en un grupo de 15 niños menores de 5 años asistentes a una guarderia de Bogotá. Se les tomó una muestia nasofaringea que se colocó en el medio STGG y, posteriormente, se valoró el crecimiento de S. pneumoniae en cuatro momentos diferentes: 0, 5 , 10 y 30 días después de la toma de la muestra. La recuperación inicial de S. pneumoniae fue de 73% (11/15). En todas las 11 muestras de las que se obtuvo un crecimiento inicial, fue posible recuperar S. pneumoniae en los diferentes tiempos de observación, aún en las muestras con crecimiento en un solo cuadrante. En el tiempo 0 y a los 30 días, 7 de las 11 muestras presentaron un crecimiento de abundante a moderado. Con los datos obtenidos, se logró demostrar que el medio STGG es capaz de mantener, a largo plazo, la viabilidad de S. pneumoniae en muestras nasofaringeas de niños portadores de este microorganismo.

Streptococcus pneumoniae es el principal agente etiológico bacteriano de infección respiratoria aguda en niños. Esta bacteria coloniza la nasofaringe desde el momento del nacimiento, y el hombre se constituye, así, en el reseworio de la infección. La atención mundial se centra actualmente en la propagación de los aislamientos de S. pneumoniae resistentes a los antimicrobianos. El objetivo de este estudio fue el de establecer, mediante un seguimiento de seis meses, el porcentaje de colonización por Spneumoniae en un grupo de 20 niños menores de 2 años que asistían a una guardería, así como la distribución de los tipos capsulares de los aislamientos recuperados y los patrones de susceptibilidad antimicrobiana. Se obtuvieron 98 muestras nasofaríngeas con las que se estableció un porcentaje global de colonización por S. pneumoniae de 69%. Todos los niños fueron colonizados, por lo menos una vez durante el tiempo de estudio. Los serotipos más frecuentes fueron: 23F (41%), 19F (26%), 6A (10%) y 10A (6%) y la susceptibilidad disminuida a la penicilina (SDP) se estableció en 53%. La resistencia global al trimetoprimsulfametoxazol (TMS) fue de 68%, al cloranfenicol de 43% y a la eritromicina de 3%. Los porcentajes de resistencia presentaron variaciones durante los meses de estudio. El 42% de los aislamientos fue multirresistente y el patrón predominante fue la asociación penicilina, TMS y cloranfenicol. Los serotipos con SDP fueron 23F (72%), 19F (1 1%), 23A (8%), 6A (6%) y 15 (3%). En la guardería en estudio, los datos obtenidos señalan el alto porcentaje de circulación de aislamientos con resistencia antimicrobiana, lo que constituye un factor de riesgo para su diseminación en la comunidad; también destacan la importancia de implementar un sistema de vigilancia con portadores, lo que permite monitorizar la susceptibilidad antimicrobiana de este patógeno.

Las pruebas inmunológicas han sido ampliamente utilizadas como evidencia indirecta de infección micótica y tienen valor diagnóstico; algunas de estas pruebas pueden ser fácilmente adaptadas en los laboratorios con un bajo nivel de complejidad. El Laboratorio de Mitología del Grupo de Microbiología del lnstituto Nacional de Salud es centro de referencia para el diagnóstico de las micosis sistémicas en el país; por tal motivo y con el fin de establecer una red nacional, se seleccionaron cuatro laboratorios regionales y se entrenó personal en técnicas inmunológicas para realizar el diagnóstico de la histoplasmosis y de la paracoccidioidomicosis. Las técnicas empleadas fueron: inmunodifusión (ID) para histoplasmosis, paracoccidioidomicosis y aspergilosis; fijación de complemento (FC) para histoplasmosis y paracoccidioidomicosis y, aglutinación con partículas de látex para la antigenemia en la criptococosis. En un período de 7 años (1990 -1996), los laboratorios procesaron 6.841 muestras de suero correspondientes a 6.411 pacientes con diagnósticos compatibles con micosis sistémicas. Los cuatro laboratorios regionales analizaron 1.918 muestras (28%) y el centro de referencia, 4.923 (72%). La reactividad total fue de 13,5% (923/6.841), discriminada así: histoplasmosis, 42,5%; paracoccidioidomicosis, 33%; criptococosis, 21,2%, y aspergilosis, 3,3%. El número total de casos diagnosticados fue de 441: 155 histoplasmosis, 120 paracoccidioidomicosis, 138 criptococosis y 28 aspergilosis. El empleo de la ID en los centros regionales permitió el diagnóstico de 31% de los pacientes con histoplasmosis, de 41,6% de los pacientes con paracoccidioidomicosis y 53,6% de los pacientes con aspergilosis, lo cual indica que el diagnóstico precoz se puede realizar a nivel regional. La sensibilidad y la simplicidad de la prueba de ID constituye un excelente recurso para los laboratorios de baja complejidad, a nivel regional, que operan en áreas endémicas.

Los sueros de un estudio de inmunogenicidad de una vacuna oral de células enteras de Vibrio cholerae 01 más la subunidad B recombinante de la toxina (CEIsBr) fueron procesados para la determinación de anticuerpos antitoxina de cólera en placas de ELlSA de alta y de baja avidez. Los títulos de anticuerpos antitoxina, de la clase IgG, de los sueros prevacunales estuvieron incrementados de 5 a 7 veces, en las placas de alta avidez, comparados con los títulos obtenidos en las placas de baja avidez. Igualmente, los títulos de los sueros post vacunales fueron 3 veces superiores cuando se realizó la misma comparación de placas. Por consiguiente, la tasa de seroconversión medida en las placas de alta avidez fue de 39%, comparada con 68% al utilizar las placas de baja avidez. El suero control de alto título de anticuerpos no detectó el problema. Se sugiere utilizar placas de baja avidez al determinar anticuerpos contra la toxina de cólera por la técnica de ELISA.

A review of 12 histoplasmosis outbreaks that occurred in the Colombian Andean region, are presented. According to their location, 3 were detected in each of the following states: Tolima, Caldas and Antioquia and 1 each in Cundinamarca, Boyacá and Risaralda. In 9 of the outbreaks it was possible to trace the following activities which led to the infection: visits to bat-inhabited caves, removing debris incide a hollowed tree, demolition of an old house, use of contaminated lime for fertilization, handling chickenmanure fettilised soil and the severe pruning of coffee trees. Histoplasma capsulatum var. capsulatum was isolated from environmental samples in 5 of the 8 outbreaks where it was feasible to obtain material for culture and animal inoculation. It was found that 332 persons had been in contact with the various infectious sources, including the 11 index cases (2 outbreaks had the same index case). All of them were studied by means of immunological tests designed to detect antibodies; based on the findings of reactive tests, al1 the index cases and 140 (42%) of those exposed had antibodies indicative of infection by the fungus. The above cases reveal the importance of histoplasmosis in immunocompetent individuals who, for occupational or recreational reasons, are exposed to infectious aerosols generated when disturbing the natural habitat of H. capsulatum var. capsulatum.

La prueba vibriocida ha sido ampliamente usada para confirmar el diagnóstico clínico de cólera, para medir la inmunogenicidad de las posibles vacunas y como herramienta epidemiológica en estudios de la enfermedad en áreas endémicas y en brotes. A partir de marzo de 1991, Colombia se vió afectada por la primera epidemia de cólera en este siglo; por esta razón, para obtener información adicional sobre el alcance de la epidemia en nuestro medio se planeó la realización de un estudio descriptivo con métodos seroepidemiológicos. Se empleó la pruebavibriocida en micrométodo, con las cepas de Vibrio cholerae O1 El Tor lnaba y El Tor Ogawa, y se definió como resultado reactivo un titulo mayor o igual a 80 y como infección reciente un titulo mayor o igual a 640. La población estudiada estaba conformada por 73 pacientes con enfermedad diarreica aguda y por 4.577 consultantes por otras causas. Se procesaron 4.650 sueros de 5 de las 6 regiones del pais, afectadas por la epidemia, 1.520 obtenidas en 1991, 1.229 en 1992 y 1.901 en 1993. Del total, 21,5% fueron reactivas, 25% en 1991,21,4% en 1992 y 19% en 1993. El porcentaje de reactividad global en hombres fue de 24% y en mujeres, de 20%. No se encontraron diferencias en el porcentaje de reactividad según la distribución por edad. El porcentaje de infección reciente fue de 10%. En los pacientes con diagnóstico de cólera, la prevalencia de infección determinada por la reactividad en la prueba vibriocida fue de 68,5% y de infección reciente de 51%. El análisis de los resultados de las regiones pacifica y atlántica fue consistente con la evolución epidemiológica de los casos clínicos de cólera en esas regiones.

Over the past two decades, several fungal outbreaks have occurred, including the high-profile 'Vancouver Island' and 'Pacific Northwest' outbreaks, caused by Cryptococcus gattii, which has affected hundreds of otherwise healthy humans and animals. Over the same time period, C. gattii was the cause of several additional case clusters at localities outside of the tropical and subtropical climate zones where the species normally occurs. In every case, the causative agent belongs to a previously rare genotype of C. gattii called AFLP6/VGII, but the origin of the outbreak clades remains enigmatic. Here we used phylogenetic and recombination analyses, based on AFLP and multiple MLST datasets, and coalescence gene genealogy to demonstrate that these outbreaks have arisen from a highly-recombining C. gattii population in the native rainforest of Northern Brazil. Thus the modern virulent C. gattii AFLP6/VGII outbreak lineages derived from mating events in South America and then dispersed to temperate regions where they cause serious infections in humans and animals.

La vigilancia de la susceptibilidad antimicrobiana de los aislamientos de Neisseria qonorrhoeae es necesaria, debido a la capacidad de este patógeno para desarrollar resistencia por varios mecanismos, con las consecuentes fallas en el tratamiento. En un trabajo anterior, realizado en el Laboratorio de Microbiología del lnstituto Nacional de Salud, en el que se empleó la prueba de difusión de disco (Kirby-Bauer), se determinó en 43 aislamientos de N. gonorrhoeae no productores de beta-lactamasa, susceptibilidad intermedia a la penicilina en 42 y resistencia a la tetraciclina en 26. Por tal razón, se decidió establecer en todos los aislamientos de N. gonorrhoeae, remitidos al INS como parte del programa de red de ETS bacterianas, los niveles de resistencia a la penicilina y a la tetraciclina, expresados como la concentración inhibitoria mínima (CIM). De 100 aislamientos estudiados, 49 fueron no productores de beta-lactamasa (NPBL) y 51 productores (PBL). La CIM de la penicilina de los aislamientos NPBL fue menor o igual a 0,06 pg/mL (sensible) en 3; de 0,12-1 pg/mL (intermedia) en 41; y mayor o igual a 2 pg/mL en 5. La CIM de los aislamientos PBL señaló que 4 eran intermedios y 47 resistentes. La CIM de la tetraciclina fue menor o igual a 0,25 pg/mL (sensible) en 4, de 0,5 a pg/mL (intermedia) en 18 y mayor o igual a 2 pg/mL (resistente) en 78. Los datos destacan la importancia de mantener la vigilancia de la resistencia de N. gonorrhoeae a estos antimicrobianos para que, con base en ellos, se replanteen los esquemas de tratamiento.