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Teleost fish accumulate metals through different pathways and It is now well established that food plays a major role in this accumulation. Nevertheless, there is still lack of knowledge on the variability of metal trophic transfer in fish in connection with their life context. The present doctoral research aims at characterizing the influence of biological and environmental factors on the assimilation efficiency (AE) of essential and non-essential metals in fish. AE determination during a series of experiment under controlled condition reveals that biological factors, in particular the type of food ingested, play a predominant role in metal AE in fish while environmental factors (pH, temperature, salinity ...) seem to have a limited influence. All the work carried out during this thesis allows a better understanding of the trophic transfer of metals in fish and, thus bring new knowledge in the field of fish nutrition and ecotoxicology.; Les poissons téléostéens accumulent les métaux au travers de différentes voies et il est actuellement bien établi que la nourriture joue un rôle majeur sur cette accumulation. Néanmoins de nombreuses lacunes persistent sur la variabilité du transfert trophique des métaux chez les poissons en fonction de leur contexte de vie. La présente recherche doctorale vise à caractériser l’influence de facteurs biologiques et environnementaux sur l’efficacité d’assimilation (AE) de métaux essentiels et non-essentiels chez les poissons. La détermination des AEs lors d’une série d’expériences en milieu contrôlé révèle que les facteurs biologiques, et notamment le type de nourriture ingéré, jouent un rôle prépondérant sur l’AE des métaux chez les poissons alors que les facteurs environnementaux (pH, température, salinité…) semblent n’avoir qu’une influence plus limitée. L’ensemble des travaux réalisés lors de cette thèse permet une meilleure compréhension du transfert trophique des métaux chez les poissons, et apporte ainsi de nouvelles connaissances dans les domaines de la nutrition et de l’écotoxicologie.

L'analyse du polymorphisme des gènes de J'amylase chez Crassostrea gigas (Thunberg, 1793) a été établi sur deux générations dans le cadre du programme européen GENEPHYS (génétique et physiologie chez C.gigas). Après une amplification de l'ADN par PCR à partir de deux couples d'amorces qui sont spécifiques à chacun des deux gènes de l'amylase, une digestion par EcoRI de l'ADN amplifié suivie d'une électrophorése en gel d'agarose sont effectuées. Cette technique (RFLP) permet de déterminer le polymorphisme génétique des huîtres creuses. Une troisième génération a été réalisée afin d'obtenir quatre familles et d'en analyser le génotype. Ces familles ont été tout d'abord placées pendant cinq mois dans un milieu riche en nourriture, puis ensuite, chaque famille est séparée en deux lots, un lot restant dans le milieu riche tandis que l'autre est placé dans un milieu pauvre pour une durée de six semaines. Les génotypes obtenus pour les individus des quatre familles ont permis de trouver un nouvel allèle pour le gène B qui n'était pas amplifié par le couple d'amorce spécifique lors de la PCR à cause de la non fixation de l'amorce sens. De même, il a été démontré pour la première fois que les deux gènes de l'amylase sont portés par le même chromosome. D'un point de vue performances physiologiques et croissance, il a été démontré que deux génotypes particuliers présentent des résultats antagonistes selon les conditions trophiques. Ainsi le génotype 22 66' est le plus performant en milieu riche avec les meilleurs taux de croissance, d'ingestion et efficacité d'assimilation alors que le génotype 11 66 est le moins performant. Par contre en milieu pauvre, c'est ce dernier le plus performant alors que le génotype 22 66' n'est pas du tout adapté à ce milieu avec des performances médiocre.