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L’étude de la diversité de la flore arvale et rudérale du centre INRA Antilles-Guyane avait pour objectif d’inventorier l’ensemble des espèces végétales présentes sur nos parcelles expérimentales. Cet inventaire, basé sur les travaux du botaniste Jacques Fournet, nous a permis d’identifier et caractériser cette flore, de classer les espèces en fonction de leurs caractéristiques agronomiques, écologiques, et médicinales et ainsi d’en prévoir l’évolution. En nous appuyant sur la méthode phytosociologique, nous avons découpé notre zone d’études en plusieurs parties à partir d’une cartographie des parcelles du centre. A l’aide de quadrats et de transects, nous avons procédé par comptage des espèces trouvées selon leur fréquence. 205 espèces, dont sept nouvelles pour la Guadeloupe, ont ainsi été inventoriées pour l’ensemble de la dition que nous avons ensuite classées en fonction de services ou de nuisibilités par rapport à l’environnement et aux agrosystèmes. Il nous reste maintenant à comprendre l’organisation des communautés végétales, les dynamiques d’association, et les éventuels liens (traits fonctionnels, allélopathie) entre les plantes cultivées sur place et les herbes de nos champs., The study of the weed flora of the French Antilles and Guyana agronomic research center, aimed at making an inventory of all the plant species that occur in our fields. With the help of the book of the botanist Jacques Fournet, we could identify, characterize, and classify this flora according to its agronomic, ecological and medicinal characteristics, and thus, to predict its ecological dynamics. Based on phytosociological methodology, using a field map of our research center, we divided our main study area in smaller sets. With quadrats and line transects, we assessed species frequency. We found 205 species, including 7 new ones for Guadeloupe, in the entire prospected zone. Afterwards, we classified them in terms of services or harmfulness, for environment and agrosystems. We now need to understand the organization of plant communities, weeds association dynamics, and others interactions (functional traits, allelopathy) between crops and weeds.

International audience; Questioning the nature of individuality has a long a rich history, both in philosophy and in biology. Because they differ in several features from the pervasive vertebrate-human model, plants have been considered as complicating the question. Here, the various plant species on which authors—whether biologists or philosophers—rely to build the picture of plant individuality are examined and tracked for their peculiarities, thus constituting an “herbiary” of plant individuality.The herbiary of plant individuality has as its members species exhibiting a diverse collection of traits and illustrating different questions related to plant individuality.This essay assesses the peculiarity of the features of these plants and the reality of their differences from animals. Because some plant features are supposed to pose a threat to individual genetic homogeneity, higher heterogeneity has been assumed for plants compared to animals.Moreover, individual plants are sometimes identified with communities. How does this supposed heterogeneity appear in particular species? Cultivated plants exhibit distinctive diversity, and their overrepresentation in the study of plant diversity might bias the way plant individuality is understood. Just as there is a vertebrate bias, there may also be a cultivated plant bias. Recent results bring plants much closer to animals in terms of cellular functioning, so plants might not be so different from animals with respect to their diversity, and consequently their individuality.

Invasive water primroses in France become a weed problem in meadows. International Conference on Ecological Sciences

L’extractivisme, mode d’exploitation archaïque fondé sur l’épuisement des ressources ou composante d’un développement équilibré de l’Amazonie, a fait l’objet de sentences extrêmes dans l’actuelle discussion sur les possibilités de mise en valeur de la forêt amazonienne. Cependant, si les enjeux écologiques de l’extractivisme sont au premier plan du débat, les caractéristiques bio-écologiques de la vingtaine de plantes exploitées et la variété des modes d’exploitation qui en découle sont rarem...

International audience; The sustainability of modern agriculture relies on strategies that can control the ability of pathogens to overcome chemicals or genetic resistances through natural selection. This evolutionary potential, which depends partly on effective population size (Ne), is greatly influenced by human activities. In this context, wild pathogen populations can provide valuable information for assessing the long-term risk associated with crop pests. In this study, we estimated the effective population size of the beet cyst nematode, Heterodera schachtii, by sampling 34 populations infecting the sea beet Beta vulgaris spp. maritima twice within a one-year period. Only 20 populations produced enough generations to analyze the variation in allele frequencies, with the remaining populations showing a high mortality rate of the host plant after only one year. The 20 analyzed populations showed surprisingly low effective population sizes, with most having Ne close to 85 individuals. We attribute these low values to the variation in population size through time, systematic inbreeding, and unbalanced sex- ratios. Our results suggest that H. schachtii has low evolutionary potential in natural environments. Pest control strategies in which populations on crops mimic wild populations may help prevent parasite adaptation to host resistance.

International audience; Studying wild pathogen populations in natural ecosystems offers the opportunity to better understand the evolutionary dynamics of biotic diseases in crops and to enhance pest control strategies. We used simulations and genetic markers to investigate the spatial and temporal population genetic structure of wild populations of the beet cyst nematode Heterodera schachtii on a wild host plant species, the sea beet (Beta vulgaris spp. maritima), the wild ancestor of cultivated beets. Our analysis of the variation of eight microsatellite loci across four study sites showed that (i) wild H. schachtii populations displayed fine-scaled genetic structure with no evidence of substantial levels of gene flow beyond the scale of the host plant, and comparisons with simulations indicated that (ii) genetic drift substantially affected the residual signals of isolation-by-distance processes, leading to departures from migration–drift equilibrium. In contrast to what can be suspected for (crop) field populations, this showed that wild cyst nematodes have very low dispersal capabilities and are strongly disconnected from each other. Our results provide some key elements for designing pest control strategies , such as decreasing passive dispersal events to limit the spread of virulence among field nematode populations.

Adaptation of the water primroses Ludwigia grandiflora to terrestrial condition. International Conference on Ecological Sciences

International audience; There is evidence that multispecies swards can increase biomass productivity and provide number of ecosystem benefits. However, little is known regarding the possible interactions between forage species that can modulate positively or negatively the use of nutrients by ruminants. The objective of this study was to provide a better understanding of the associative effects between some forage species on intake and digestion parameters. Three sheep feeding experiments were conducted according to a repeated Latin square design using models of simple forage mixtures under the form of fresh forage or silage, and during which intake behaviour, DM digestibility, and methane emissions were measured. Synergies between cocksfoot silage and red clover silage, and between ryegrass and chicory, were observed on DM intake and eating rate, with optimums for the proportion 50:50. For the cocksfoot-red clover association, the synergy was also observed on daily intake of the digestible fraction that can reflect animal performances. No associative effect was observed on methane yield and the lowest emissions were observed for pure red clover and pure chicory

Au Cap d’Antibes, la Villa Thuret offre au visiteur des balades dans un jardin aux arbres rares originaires de pays à climat méditerranéen ou tempéré chaud. C’est aussi une unité expérimentale dédiée à l’étude de l’acclimatation des arbres, sujet de fort enjeu dans le contexte du changement climatique.[br/] [br/] Le 1er janvier 2012, le jardin botanique de la Villa Thuret est devenu une unité expérimentale dirigée par Catherine Ducatillion, ingénieur à l’Inra. Cette unité est dédiée à l’étude de l’acclimatation des arbres au climat méditerranéen, sujet de fort enjeu dans le contexte du changement climatique.

International audience

L'émergence d'une problématique scientifique en relation avec une demande sociétale

Plan de gestion 2011-2015 de la Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises. Synthèse du volet A. Enjeux et perspectives

Les traits fonctionnels végétaux ont été proposés comme un outil capable d’établir les axes majeurs de spécialisation de l’histoire de vie des plantes et de leur stratégie d’acquisition des ressources, définissant ainsi leur niche et leur stratégie fonctionnelles. Ces axes de spécialisation entre traits, établis selon des lois de ‘trade-off’, caractérisent ainsi l’adaptation d’une espèce à l’environnement local et expliquent également les différences de performance entre espèces. De plus, différents axes indépendants de spécialisation peuvent être utilisés par les espèces pour se différencier et coexister. Cependant, la manière dont chacun des axes est relativement utilisé pour ces processus est rarement étudiée, particulièrement pour une même diversité dans différentes conditions de gestion. Dans notre étude, 28 traits fonctionnels, reflétant la morphologie, la phénologie, la physiologie et la composition chimique de 13 espèces de graminées ont été mesurés au champ en monoculture dans des conditions de perturbation et de stress en nutriments faibles (3 coupes an-1, 360 kgN ha-1 an-1). Grâce à une analyse en composante principale (ACP), quatre axes majeurs de spécialisation ont été obtenus, réduisant les 28 dimensions issues des traits. Les coordonnées de chacune des espèces sur chacun des quatre axes de l’ACP ont ensuite été utilisées dans des régressions multiples pour expliquer leurs productivités en monoculture et leurs abondances en mélanges. Quatre conditions de gestion et trois mélanges de six espèces tirés au hasard dans le pool des 13 ont ainsi été testés. Les quatre premiers axes de l’ACP expliquent 76% de la variance. Le premier axe est un axe de stature opposant les espèces de haute stature aux espèces avec une forte surface spécifique racinaire. Le second axe est phénologique opposant les espèces précoces aux tardives avec une forte durée de vie des feuilles. Le troisième axe représente un compromis entre les capacités racinaires d’absorption NO3- / NH4+. Enfin, le quatrième axe représente un compromis entre espèces dispendieuses et conservatrices de l’azote. Ces axes de spécialisation expliquent de manière significative à la fois la productivité des espèces en monoculture et leurs abondances en mélange. La productivité en monoculture est principalement expliquée par l’axe de stature quelque soit la gestion. L’abondance des espèces est expliquée quant à elle par le trade-off NO3- / NH4+, l’axe stature puis l’axe acquisition / conservation de l’azote. La gestion modifiera la part de variance expliquée par chacun des axes. La part des axes trois et quatre augmentera avec le stress en nutriment

Background: Understanding the mechanisms that control species genetic structure has always been a major objective in evolutionary studies. The association between genetic structure and species attributes has received special attention. As species attributes are highly taxonomically constrained, phylogenetically controlled methods are necessary to infer causal relationships. In plants, a previous study controlling for phylogenetic signal has demonstrated that Wright's F-ST, a measure of genetic differentiation among populations, is best predicted by the mating system (outcrossing, mixed-mating or selfing) and that plant traits such as perenniality and growth form have only an indirect influence on F-ST via their association with the mating system. The objective of this study is to further outline the determinants of plant genetic structure by distinguishing the effects of mating system on gene flow and on genetic drift. The association of biparental inbreeding and inbreeding depression with population genetic structure, mating system and plant traits are also investigated. Results: Based on data from 263 plant species for which estimates of F-ST, inbreeding (F-IS) and outcrossing rate (t(m)) are available, we confirm that mating system is the main influencing factor of F-ST. Moreover, using an alternative measure of F-ST unaffected by the impact of inbreeding on effective population size, we show that the influence of tm on F-ST is due to its impact on gene flow (reduced pollen flow under selfing) and on genetic drift (higher drift under selfing due to inbreeding). Plant traits, in particular perenniality, influence F-ST mostly via their effect on the mating system but also via their association with the magnitude of selection against inbred individuals: the mean inbreeding depression increases from short-lived herbaceous to long-lived herbaceous and then to woody species. The influence of perenniality on mating system does not seem to be related to differences in stature, as proposed earlier, but rather to differences in generation time. Conclusion: Plant traits correlated with generation time affect both inbreeding depression and mating system. These in turn modify genetic drift and gene flow and ultimately genetic structure., SCOPUS: ar.j, info:eu-repo/semantics/published

La biodiversité de Nouvelle-Calédonie menacée

SESSION 4 : Changements globaux; International audience

Invasions biologiques et traits d'histoire de vie. Variabilité, plasticité et adaptation. 2. Rencontres francophones

La déforestation des bas-fonds sahélo-soudaniens du Niger central est un phénomène relativement récent. Il est la conséquence de la synergie entre l'évolution de la société paysanne haoussa et les déséquilibres écologiques profonds et rapides liés aux derniers épisodes de sécheresse. Jusqu'au milieu du siècle, existaient des galeries forestières fournies, remarquables par leur exubérance et leur richesse spécifique. Il n'en subsiste actuellement que de rares lambeaux appartenant du point de vue phytosociologique à deux associations. La plus rare maintenant, à #Mitragyna inermis$ et #Anogeissus leiocarpus$, s'apparente aux formations arborées des régions soudaniennes, méridionales. La seconde, dominée par #Acacia nilotica nilotica$, est commune dans l'ensemble du Sahel. La cause majeure de cette déforestation est due à l'intégration de plus en plus profonde de ces zones inondées dans les systèmes de production, résultat de mutations amorcées dès les années cinquante. Le recul des cultes agraires devant l'islam a modifié les représentations culturelles des espaces. L'affaiblissement de l'autorité des chefs de lignage, des stratégies paysannes plus individuelles, le manque de terres sont autant de facteurs qui expliquent les défrichements massifs. Sur le plan de la diversité biologique, les nouvelles pratiques ne conduisent pas toujours à un appauvrissement mais entraînent localement une diversification certaine des flores et végétations anthropophiles et une réorganisation des éléments spontanés de la biodiversité. Cependant, l'instabilité accrue des milieux, due à l'augmentation du ruissellement et à l'accroissement des transports solides, est une menace qui pèse en permanance sur la pérennité des nouvelles biocénoses et des installations humaines. (Résumé d'auteur)

Les transitions avec l'agroforesterie sont progressives, c'est ce que souligne l'article. Des espèces à l'origine exploitées en forêt peuvent être insérées dans des sytèmes agroforestiers qui préservent une certaine biodiversité et répondent à une demande du marché beaucoup plus intense. (Résumé d'auteur)

L'article compare les rendements énergétiques et économiques de la collecte des noix du Brésil et de la production de farine de manioc chez les Kolama du rio Solimoes. Malgré un bilan défavorable, la collecte des noix du Brésil perdure comme revenu complémentaire et pallie d'éventuels risques agricoles. (Résumé d'auteur)

Anthropophilic vegetation growing near human dwellings in north Cameroon reflect different degrees of local pastoral and agricultural activities. Pastoral villages with poorly diversified flora contrast with agricultural villages, often specializing in vegetable fanning, where species can be twice as diverse. Anthropophilic vegetation thus provides a good indication of different levels of pastoral/agricultural activities in rural Sudan-Sahel., La végétation anthropophile des établissements humains du Nord-Cameroun traduit différentes gradations dans les activités d'élevage et d'agriculture. Les villages de pasteurs, avec un cortège floristique peu diversifié s'opposent aux villages de cultivateurs, parfois spécialisés (maraîchage), dont la diversité des espèces peut aller du simple au double. La végétation anthropophile peut être considérée comme un bon indicateur des différents niveaux de la combinaison élevage/agriculture de la zone soudano-sahélienne., Lebourgeois Théodore, Seignobos Christian. Végétations anthropophiles des villages de pasteurs et d'agriculteurs (région du Diamaré, Nord-Cameroun). In: Journal d'agriculture traditionnelle et de botanique appliquée, 37ᵉ année, bulletin n°2,1995. pp. 93-113.

Much discussion currently centres on the role of extractivism in sustainable management practices for forest ecosystems, but is generally limited to Amazonian ecosystems and presents a global analysis of extractivism. After recalling the area covered by this activity and its importance in the various Brazilian ecosystems, the author study its impact on the biodiversity of the species and ecosystems affected. A wide variety of situations are examined, discouraging any tendency to generalise., De nombreuses discussions ont lieu à l'heure actuelle sur le rôle de l'extractivisme dans une mise en valeur non prédatrice des écosystèmes forestiers. Or, ces discussions se restreignent le plus souvent aux écosystèmes amazoniens et proposent une analyse globale de l'extractivisme. Après un rappel du champ couvert par cette activité et de son importance dans les différents écosystèmes brésiliens, les auteurs s'interrogent sur son impact sur la biodiversité des espèces et des écosystèmes touchés. Une grande variété de situations est mise en évidence mettant en garde contre tout discours généralisant., Emperaire Laure, Lescure Jean-Paul. Extractivisme et conservation de la biodiversité au Brésil. In: Journal d'agriculture traditionnelle et de botanique appliquée, 36ᵉ année, bulletin n°1,1994. pp. 173-186.

Souvent dénigré et présenté comme une activité archaïque et incapable d'évolution, l'extactivisme pourrait n'être aujourd'hui qu'un témoignage désuet de l'un des nombreux cycles économiques vécus par le Brésil. Mais les mouvements politiques des seringeiros, aux revendications relayées par diverses institutions et par une opinion publique sensibiliséé aux problèmes écologiques ont propulsé cette vieille activité au centre des débats sur la gestion de la forêt amazonienne. De 1990 à 1995, l'institut national de recherches en Amazonie (Inpa) et l'Institut français de recherche scientifique pour le développement en coopération (Orstom) ont mené un programme de recherches interdisciplinaires sur l'extractivisme en Amazonie centrale. Les principaux résultats de ces recherches sont exposés ici, sous la forme de courts articles. L'objectif de cette publication, destinée à un public non spécialiste, n'est pas de dresser un bilan exhaustif d'une activité aux multiples facettes mais de présenter des pistes de réflexion et de recherches. (Résumé d'auteur)

Nous présentons une méthode s'adressant plus particulièrement à des sélectionneurs d'espèces végétales qui veulent modéliser leurs observations dans le cadre des modèles linéaires multivariables à effets aléatoires et fixes. Cette méthode est basée sur une description par un schéma de la généalogie des plantes manipulées dans un protocole de sélection . Nous proposons des règles de construction du schéma et les illustrations sur un exemple. En utilisant une représentation de ce schéma à l'aide d'un graphe orienté, nous donnons une méthode pour construire le modèle statistique pour la valeur génétique des individus et énonçons les règles qui permettent de trouver les variance-covariances entre apparentés., We present a methodology addressed particularly to plant breeders who want to model their data by a linear multivariate mixed model. The first part of this methodology is the description of the genealogy for the plants used in the protocol of selection, by a diagram. We propose the rules for drawing the diagram and give an example. Using an oriented graph related to the diagram we present the second part of the methodology for constructing the statistical model for the individual genetic value and set forth a rule for finding the variance-covariances between related individuals.