Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física, BIOCOM-SC - Biologia Computacional i Sistemes Complexos, Grup de recerca Infecció i Immunitat al Pacient Pediàtric, Vall d’Hebron Institut de Recerca, López Codina, Daniel, Prats Soler, Clara, Vila Vidal, Albert, Universitat Politècnica de Catalunya. Departament de Física, BIOCOM-SC - Biologia Computacional i Sistemes Complexos, Grup de recerca Infecció i Immunitat al Pacient Pediàtric, Vall d’Hebron Institut de Recerca, López Codina, Daniel, Prats Soler, Clara, and Vila Vidal, Albert
Streptococcus pyogenes, also known as Group A ß-hemolytic streptococcus (EGA), is a bacterium that affects the skin and the oropharynx. It is transmitted through droplets and direct contact, mainly affecting children and can cause mild infections such as Scarlet Fever or some invasive ones like necrotizing fasciitis. Although its sensitivity to penicillin is known, an increase in invasive infections has been observed in recent years, especially after the SARS-CoV-2 pandemic. This is where the need to understand the new epidemiological dynamics that it presents arises to be able to anticipate potential epidemics of invasive infections and the correction of the current increasing transmission dynamics. In this project, carried out with the research group BIOCOM-SC at UPC and in collaboration with the research group "Infecció i Immunitat al pacient pediàtric" from "Vall d'Hebron", the aim is to understand the epidemiological dynamics of Scarlet Fever both in the long and short term. This is to determine the changes that have occurred in these dynamics due to the SARS-CoV-2 pandemic. To answer the questions suggested at the beginning of the project, it has been processed and analysed the daily data from the "Vigilància sindròmica d'infeccions a Atenció Primària" provided by the "Sistema d'Informació per a la Vigilància d'Infeccions a Catalunya" (SIVIC). Based on the obtained data, a set of graphs has been generated to examine the epidemiological dynamics in annual, quarterly, and weekly periods, with the aim of identifying possible patterns both in the long and short term. The obtained results indicate that the transmissibility of Scarlet Fever is related to school periods, during which there is an increase in diagnoses of this infection. From the results, it has also been confirmed that there has been an increase in diagnoses from 2022 compared to the period of time when we started having data, 2011, until 2019 where the COVID-19 pandemic started. Finally, it has been, El Streptococcus pyogenes, també conegut com a estreptococ ß-hemolític del grup A (EGA), és un bacteri que afecta la pell i l'orofaringe. És transmès per gotes i contacte directe afectant principalment a infants i pot causar infeccions lleus com escarlatina o algunes invasives com la fasciïtis necrosant. Tot i que es coneix la seva sensibilitat a la penicil·lina s'ha observat un increment en les infeccions invasives en els últims anys, especialment després de la pandèmia de la SARS-CoV-2. És d'aquí que sorgeix la necessitat de conèixer les noves dinàmiques epidemiològiques que presenta i així poder anticipar possibles epidèmies d'infeccions invasives i poder corregir la dinàmica d'augment de la transmissivitat actual. En aquest projecte, realitzat amb el grup de recerca de la UPC BIOCOM-SC i amb la col·laboració del grup de recerca Infecció i Immunitat al pacient pediàtric de la Vall d'Hebron, es vol comprendre la dinàmica epidemiològica de l'escarlatina tant a llarg termini com a curt termini per determinar quins han estat els canvis que s'han produït en aquesta dinàmica per la pandèmia del SARS-CoV-2. Per a respondre les preguntes plantejades a l'inici del projecte s'han tractat i analitzat les dades diàries de Vigilància sindròmica d'infeccions a Atenció Primària proporcionades pel Sistema d'Informació per a la Vigilància d'Infeccions a Catalunya (SIVIC). A partir d'aquesta informació, s'ha generat un conjunt de gràfics amb la finalitat d'examinar la dinàmica epidemiològica en períodes anuals, trimestrals i setmanals, amb l'objectiu d'identificar possibles patrons a llarg i curt termini. Els resultats obtinguts indiquen que la transmissivitat de l'escarlatina està lligada als períodes lectius que és quan es produeix un augment de diagnòstics d'aquesta infecció. A partir dels resultats també s'ha pogut confirmar que hi ha hagut un augment dels diagnòstics des de l'any 2022 en comparació amb el període des d'on es comencen a tenir dades, any 2011, fins al 2019 on c, Streptococcus pyogenes, también conocido como estreptococo ß-hemolítico del grupo A (EGA), es una bacteria que afecta la piel y la orofaringe. Es transmitida por gotas y contacto directo afectando principalmente a infantes y pudiendo causar infecciones leves como escarlatina o algunas invasivas como la fascitis necrosante. Aunque se conoce su sensibilidad a la penicilina se ha observado un incremento en las infecciones invasivas en los últimos años, especialmente después de la pandemia de SARS-CoV-2. Es de aquí que surge la necesidad de conocer las nuevas dinámicas epidemiológicas que presenta y así poder anticipar posibles epidemias de infecciones invasivas y corregir la dinámica actual de augmento en la transmisividad. En este proyecto, realizado con el grupo de investigación de la UPC BIOCOM-SC y con la colaboración del grupo de investigación "Immunitat al paciente pediàtric" de la Vall d'Hebron, se quiere comprender la dinámica epidemiológica de escarlatina a largo y corto plazo para determinar cuáles han sido los cambios que se han producido en esta dinámica por la pandemia de SARS-CoV-2. Para responder a las preguntas planteadas al inicio del proyecto se han tratado y analizado los datos diarios de "Vigilància sindròmica d'infeccions a Atenció Primària" proporcionados por el "Sistema d'Informació per a la Vigilància d'Infeccions a Catalunya" (SIVIC). A partir de esta información, se ha generado un conjunto de gráficos con el propósito de examinar la dinámica epidemiológica en periodos anuales, trimestrales y semanales, para identificar posibles patrones a largo y corto plazo. Los resultados obtenidos indican que la transmisividad de escarlatina está ligada a los periodos lectivos que es cuando se produce un augmento de los diagnósticos de esta infección. A partir de los resultados también se ha podido confirmar que ha habido un aumento de los diagnósticos des de el año 2022 en comparación con el periodo donde se empiezan a tener datos, año 2011, hasta el año 2, Objectius de Desenvolupament Sostenible::3 - Salut i Benestar