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International audience; Archaeology requires rigorous recording methods that are the basis of a scientific approach to the analysis of an archaeological site and for the construction of a suitable corpus. How should archaeological data be recorded? Which methods are available to perform it during the excavation and in the following laboratory analysis?This publication follows the 13th PhD day in archaeology centred around the debate and the discussion on these questions. Talks and posters covered both the different excavation methods and the archaeological data saving and registration, both in the laboratory and in the archaeological sites. The interventions highlighted the use of new technologies for recording field data and databases to homogenize past and recent archaeological documentation. The cases of study presented highlight the importance of sharing archaeological data and encourage to develop multidisciplinary and complementary approaches.; L’archéologie nécessite des méthodes d’enregistrement rigoureuses qui sont la base de l’approche scientifique de l’étude d’un site et de la construction d’un corpus. Comment doit-on enregistrer les données archéologiques ? Quelles sont les méthodes à notre disposition pour réaliser cette tâche sur le terrain et en laboratoire ?Cette publication fait suite à la 13e journée doctorale d’archéologie dont l’objectif était de débattre et de discuter autour de ces questions. Les communications et posters ont porté à la fois sur les différentes méthodes de fouilles et sur l’enregistrement des données, en laboratoire et sur le terrain, ainsi que sur leur partage. Les interventions ont mis en avant l’utilisation des nouvelles technologies pour l’enregistrement des données de terrain et de bases de données pour l’homogénéisation de la documentation de fouilles anciennes et récentes. Les cas d’étude présentés montrent également l’intérêt du partage de données en archéologie pour développer des approches pluridisciplinaires et complémentaires.

The program BIOPYR (2017-2018) aimed to study the fauna associated to box tree following the arrival of an invasive pest, Cydalima perspectalis Walker (Lepidoptera: Crambidae). For this an inventory, of insects which would take the box tree moth as a prey or as a host since its introduction in France, is currently in progress. For the parasite study, C. perspectalis moths, eggs, pupae samplings are regularly collected in five French departments of the Auvergne-Rhône-Alpes region, between May to September. This program is financed by this French ARA region. All collected insects are managed by the Biocontrol Laboratory at INRA Antibes and determined by entomologists. Thus, a current situation of the "box wood" system and its reaction to the attacks of boxwood pest are obtained with a possibility of studying its dynamic over the years. Finally, an attempt is made to rear potential parasitoids to evaluate their efficacy as a biological control agent. In 2017, five kind of predators (spider, bat, tit, wasp and syrphid flies) as well as lacewings, and ladybirds have been kept. Four hymenopterans and one diptera were investigated on pupae and caterpillars of the box tree moths. Despite C. perspectalis toxicity (because of box tree alkaloids concentration) indigenous species have parasited this new host and are able to realize their total life cycle on it., Dans le cadre du projet BIOPYR (2017-2018), financé par la DRAAF Auvergne-Rhône-Alpes, un des objectifs est d’étudier l’entomofaune associée au buis suite à l’arrivée d’un intrant invasif, Cydalima perspectalis Walker (Lepidoptera : Crambidae). Pour cela, un inventaire des auxiliaires, qui auraient spontanément parasité ou prédaté la pyrale du buis depuis son introduction en France, est réalisé. Pour ce qui est des parasites, des échantillons de larves, œufs et chrysalides de pyrale du buis sont régulièrement collectés dans cinq départements de la région Auvergne-Rhône-Alpes entre mai et septembre. Tous les insectes présents dans les boîtes de collecte et qui émergent de la pyrale sont récupérés par le laboratoire Biocontrôle INRA UEFM à Antibes puis déterminés grâce à l’appui d’entomologistes systématiciens. Ainsi, une situation actuelle du système « buis » et sa réaction face aux attaques de la pyrale du buis sont obtenues avec une possibilité d’étude de la dynamique au fil des ans. Enfin, une tentative d’élevage des parasitoïdes potentiels est amorcée en vue d’évaluer leur efficacité comme agent de lutte biologique. En 2017, cinq types de prédateurs ont été repérés (araignées, syrphidées, chauve-souris, mésanges, guêpe poliste) ainsi que des chrysopes et coccinelles. Quatre hyménoptères et un diptère, de la famille des Tachinidae, ont été inventoriés sur larves et chrysalides de la pyrale du buis. Malgré la toxicité de la pyrale du buis, due à l’accumulation des alcaloïdes dans les larves, des espèces indigènes s’adaptent déjà à ce nouvel hôte et sont capables de réaliser un cycle de développement complet dessus.

DEUG; The bacterium Pseudomonas syringae is a study model for managing and prediction of emergent diseases by plant pathogens, a major current challenge for agricultural research. Known as a pathogen for many crops and having reservoirs in non-agricultural habitats, P. syringae has become for 10 years an important pathogen, especially on the kiwifruit where it is responsible for bacterial canker very severe. Preliminary studies show that in addition to P. syringae pv. actinidiae, agent of this bacterial canker classified in the phylogroup 1, a distant phylogroupe (PG13) is also present in diseased kiwi trees. This phylogroup also contains strains of P. syringae from environmental substrates, considered non-pathogenic but their relationship with plants is little studied.The aim of my works is to characterize this phylogroup in order to know if it would be involved in the emergence and/ or the development of diseases. The observation of symptoms on kiwifruit, the study of dynamic growth on kiwifruit, the realization of host ranges and inhibition tests to phenolic compounds are the experiments I have effectuated during my internship to study the different parameters related to pathogenic character. For these experiments, we observed that strains of phylogroup 13 do not cause symptoms, but they have the capacity to lead an endophyte life. Strains of this phylogroup are particularly uniform and also all appear to stand more to phenolic compounds, unlike other phylogroups, a potential adaptation to endophyte life. Some hypotheses on the role of these bacteria are discussed.; La bactérie Pseudomonas syringae est un modèle d’étude pour la gestion et la prédiction de maladies émergentes par les agents pathogènes des plantes, actuel enjeu majeur pour la recherche agronomique. Connue comme pathogène de nombreuses cultures et ayant des réservoirs dans les habitats non- agricoles, P. syringae est devenue depuis 10 ans un pathogène important notamment chez le kiwi où elle est responsable de bactérioses très graves. Des études préliminaires montrent qu’en plus de l’agent de cette bactériose (P. syringae pv actinidiae), classé dans le phylogroupe 1 de P. syringae, un phylogroupe éloigné (PG13) est aussi présent dans les arbres de kiwi malades. Ce phylogroupe contient également des souches de P. syringae issues de substrats environnementaux, considérées comme non pathogènes mais peu étudiées dans leur relation avec les plantes. L’objectif de mon stage est de caractériser ce phylogroupe afin de savoir s’il peut être impliqué dans l’émergence et/ou le développement de maladies des plantes. L’observation de symptômes sur des plants de kiwi, l’étude de la dynamique de croissance sur kiwi, la réalisation de gammes d’hôtes et les tests d’inhibition par les composés phénoliques sont les expérimentations que j’ai menées au cours de mon stage pour étudier différents paramètres impliqués dans le caractère de pathogénicité. Par ces expérimentations, nous avons pu observer que les souches du phylogroupe 13 ne provoquent pas de symptômes mais qu’elles ont la capacité de mener une vie endophyte. Ce phylogroupe apparait particulièrement homogène comparés aux autres et se caractérise par des souches qui résistent toutes aux composés phénoliques, une adaptation potentielle à la vie endophyte. Des hypothèses sur le rôle de ces bactéries sont discutées.